#NEXUS
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TreeBASE (cc) 1994-2008

Study reference:
Jaruwattanaphan T., Matsumoto S., & Watano Y. 2013. Reconstructing Hybrid Speciation
Events in the Pteris cretica Group (Pteridaceae) in Japan and Adjacent Regions.
Systematic Botany, 38(1): 15-27.

TreeBASE Study URI:  http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S12816]

BEGIN TAXA;
        TITLE  Taxa;
        DIMENSIONS NTAX=37;
        TAXLABELS
            Pteris_cretica_var._albolineata_seq21
            Pteris_cretica_var._albolineata_seq22_
            Pteris_cretica_var._cretica_seq01
            Pteris_cretica_var._cretica_seq02
            Pteris_cretica_var._cretica_seq03
            Pteris_cretica_var._cretica_seq04
            Pteris_cretica_var._cretica_seq05
            Pteris_cretica_var._cretica_seq06
            Pteris_cretica_var._cretica_seq07
            Pteris_cretica_var._cretica_seq09
            Pteris_cretica_var._cretica_seq10
            Pteris_cretica_var._cretica_seq11
            Pteris_cretica_var._cretica_seq12
            Pteris_cretica_var._cretica_seq13
            Pteris_cretica_var._cretica_seq14
            Pteris_cretica_var._cretica_seq15
            Pteris_cretica_var._cretica_seq16
            Pteris_cretica_var._cretica_seq17
            Pteris_cretica_var._cretica_seq18
            Pteris_cretica_var._cretica_seq19
            Pteris_cretica_var._cretica_seq20
            Pteris_cretica_x__Pteris_kidoi_seq08
            Pteris_deltodon_seqD1
            Pteris_deltodon_seqD2
            Pteris_deltodon_seqD3
            Pteris_deltodon_seqD4
            Pteris_deltodon_seqD5
            Pteris_henryi_seqH
            Pteris_kidoi_seqK1
            Pteris_multifida_seqK2
            Pteris_multifida_seqM1
            Pteris_multifida_seqM2
            Pteris_ryukyuensis_seqR1
            Pteris_ryukyuensis_seqR2
            Pteris_ryukyuensis_seqR3
            Pteris_wallichiana_OUTGR
            Pteris_yamatensis_seqY
            ;
END;

BEGIN CHARACTERS;
[! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M13077]

	TITLE 'gapcP-indels';
	LINK TAXA = Taxa;
	DIMENSIONS NCHAR=13;
	FORMAT DATATYPE=Standard SYMBOLS= "0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 A B C D E F G H I J K L M N O P Q R S T U V W X Y Z" MISSING=? GAP= -;

MATRIX
Pteris_cretica_var._albolineata_seq21      1000000010000
Pteris_cretica_var._albolineata_seq22_     1000000010000
Pteris_cretica_var._cretica_seq01          1000000010000
Pteris_cretica_var._cretica_seq02          1000000010000
Pteris_cretica_var._cretica_seq03          1000000010000
Pteris_cretica_var._cretica_seq04          1000000010100
Pteris_cretica_var._cretica_seq05          1000000010000
Pteris_cretica_var._cretica_seq06          1000000010000
Pteris_cretica_var._cretica_seq07          10001?0010000
Pteris_cretica_var._cretica_seq09          10001?0010000
Pteris_cretica_var._cretica_seq10          10001?0010000
Pteris_cretica_var._cretica_seq11          10001?0010000
Pteris_cretica_var._cretica_seq12          10001?0010000
Pteris_cretica_var._cretica_seq13          1000000010000
Pteris_cretica_var._cretica_seq14          1000000010000
Pteris_cretica_var._cretica_seq15          1000000010000
Pteris_cretica_var._cretica_seq16          1000000010000
Pteris_cretica_var._cretica_seq17          1000000010000
Pteris_cretica_var._cretica_seq18          1010000010000
Pteris_cretica_var._cretica_seq19          1000000011000
Pteris_cretica_var._cretica_seq20          1000000010000
Pteris_cretica_x__Pteris_kidoi_seq08       10001?0010000
Pteris_deltodon_seqD1                      11?0000010000
Pteris_deltodon_seqD2                      11?0000010000
Pteris_deltodon_seqD3                      11?0000010000
Pteris_deltodon_seqD4                      11?0001010000
Pteris_deltodon_seqD5                      11?0001010000
Pteris_henryi_seqH                         1000000000000
Pteris_kidoi_seqK1                         1000000010000
Pteris_multifida_seqK2                     1000000010000
Pteris_multifida_seqM1                     1000000010000
Pteris_multifida_seqM2                     1000000010000
Pteris_ryukyuensis_seqR1                   0000000010000
Pteris_ryukyuensis_seqR2                   0000000010000
Pteris_ryukyuensis_seqR3                   0000000010000
Pteris_wallichiana_OUTGR                   10010101?0011
Pteris_yamatensis_seqY                     1000000000000
;
END;