#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on May 19, 2024; 3:52 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Orr R.J., Murray S.A., Stuken A., Rhodes L., & Jakobsen K.S. 2012. When Naked became Armored: An Eight-Gene Phylogeny Reveals Monophyletic Origin of Theca in Dinoflagellates. PLoS ONE, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S12493] BEGIN TAXA; TITLE Taxa; DIMENSIONS NTAX=43; TAXLABELS Adenoides_eludens Akashiwo_sanguinea Alexandrium_affine Alexandrium_fundyense Alexandrium_minutum Amphidinium_carterae Amphidinium_massarti Amphidinium_mootonorum Azadinium_spinosum Ceratium_longipes Ceratocorys_horrida Crypthecodinium_cohnii Cryptoperidiniopsis_brodyi Dinophysis_acuminata Eimeria_tenella Gambierdiscus_toxicus Gonyaulax_cochlea Gymnodinium_aureolum Gymnodinium_catenatum Hematodinium_sp Heterocapsa_triquetra Karenia_brevis Karlodinium_veneficum Lepidodinium_chlorophorum Lingulodinium_polyedrum Oxyrrhis_marina Perkinsus_marinus Pfiesteria_piscicida Polarella_glacialis Prorocentrum_donghaiense Prorocentrum_lima Prorocentrum_micans Prorocentrum_minimum Protoceratium_reticulatum Protodinium_simplex Pseudopfiesteria_shumwayae Pyrocystis_lunula Pyrocystis_noctiluca Scrippsiella_sweeneyae Scrippsiella_trochoideae Symbiodinium_c3 Symbiodinium_microadriaticum Toxoplasma_gondii ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M14218] TITLE S10_COB_mRNA; LINK TAXA = Taxa; DIMENSIONS NCHAR=1034; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Karenia_brevis 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Karlodinium_veneficum 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Lepidodinium_chlorophorum 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Lingulodinium_polyedrum 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Oxyrrhis_marina 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Perkinsus_marinus 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Polarella_glacialis 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Prorocentrum_donghaiense 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Prorocentrum_minimum 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Pseudopfiesteria_shumwayae 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Pyrocystis_lunula 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Pyrocystis_noctiluca 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Scrippsiella_sweeneyae 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Scrippsiella_trochoideae 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Symbiodinium_c3 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Symbiodinium_microadriaticum 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Toxoplasma_gondii 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