#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on May 20, 2024; 10:47 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Struck T., Purschke G., & Halanych K. 2005. A scaleless scale worm: Molecular evidence for the phylogenetic placement of Pisione remota (Pisionidae, Annelida). Marine Biology Research, 1. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S1407] BEGIN TAXA; TITLE COI_alone_Bayes; DIMENSIONS NTAX=19; TAXLABELS Anaitides_sp Aphrodita_negligens Aphrodita_sp Eumida_sp. Gattyana_ciliata Halsydna_brevisetosa Harmothoe_oculinarum Leanira_sp. Lepidonotus_squamatus Lepidonotus_sublevis Paralepidonotus_ampulliferus Paramphinome_jeffreysi Pholoe_sp. Pisione_remota Platynereis_dumerlii Sigalion_spinosa Sige_sp. Sthenalanella_uniformis Sthenelais_boa ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M1506] TITLE COI; LINK TAXA = COI_alone_Bayes; DIMENSIONS NCHAR=675; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Anaitides_sp -------------------------------------------------TTATTTTTGGTATTTGGTCTGGTTTATTAGGGACTTCTATAAGAATGTTAATTCGTGCAGAGTTGGGGCAGCCGGGTGCTTTATTAGGTAGGGATCAGTTGTATAATACTATTGTTACAGCTCACGCGTTTCTAATAATTTTTTTTTTGGTTATGCCTGTTATAATTGGAGGTTTTGGTAATTGGTTAGTTCCTCTTATGCTAGGAGCTCCTGATATGGCCTTTCCTCGTTTGAATAATATAAGGTTTTGATTGCTTCCACCTTCTTTGATTATGCTGTTAGGGTCAGCTCTTGTAGAACAAGGTGCTGGTACAGGGTGAACTGTTTATCCTCCCTTATCTAGTAATGTGGCGCATGCTGGGCCTTCTGTTGATTTTGCTATTTTTTCTTTGCATTTAGCAGGGGTGTCTTCTATTTTAGCTTCTATTAATTTTATTACTACTGCTATAAATATGCGTTCGTCTGGGTTACGGTTAGAGCGTGTTCCTTTATTTGTGTGGTCTGTTGGTATTACTGCATTATTGTTGTTGTTATCTTTGCCAGTTTTGGCAGGAGCGATTACTATATTATTGACTGATCGTAATTTAAATACTTCTTTTTTTGATCCTGCTGGTGGTGGGGATCC- Aphrodita_negligens --------------------------------------------ATATTTCATTTTTGGTACATGATCTGGTCTTCTAGGAACATCAATAAGCCTTCTTATTCGTGCTGAACTAGGACAACCAGGAGCATTACTAGGAAGAGATCAACTATATAATACAATCGTAACAGCCCACGCCTTCTTAATAATCTTTTTTCTTGTTATACCAGTATTAATTGGAGGGTTCGGAAATTGACTAATTCCACTTATATTAGGCGCTCCAGATATAGCCTTCCCTCGACTAAATAATATAAGATTCTGACTTCTGCCTCCATCCTTAATCTTACTACTTGCCTCGGCCTCGGTAGAAAAAGGTGTAGGAACAGGATGAACAGTATACCCTCCCCTCTCTTCAAATATTGCCCATGCTGGGCCTTCAGTAGACTTAGCTATCTTCTCACTTCACATCGCTGGAGCTTCCTCTATTCTTGGAGCACTAAATTTTATCACCACCGTAATTAATATACGCTGAAAAGGCTTACGATTAGAACGAGTCCCTTTATTTGTATGATCTGCAAAAATTACAGCAATCCTTCTTCTTCTCTCCCTTCCAGTTCTTGCTGGAGCAATCACTATATTATTAACAGATCGAAATCTAAATACTTCCTTTTTTGACCCATCAGGAGGAGGTGACCC- Aphrodita_sp ---------------TCTACAAATCATAAAGATAATGGTACCTTATATTTTATCTTTGGCACTTGATCAGGCCTACTTGGTACATCAATAAGCCTCCTTATTCGTGCTGAACTAGGACAACCAGGAGCATTATTAGGAAGTGACCAACTATACAATACAATCGTAACAGCCCACGCCTTCCTAATAATTTTCTTTCTTGTAATACCAGTATTAATTGGAGGATTCGGGAACTGATTAATCCCCCTTATGCTGGGTGCCCCAGACATAGCTTTTCCCCGATTAAATAACATAAGATTTTGACTTTTACCCCCCTCTTTAATTTTACTTCTTGCTTCAGCTGCAGTAGAAAAAGGTGTTGGGACAGGGTGAACAGTATACCCCCCATTATCTTCCAATATTGCACATGCGGGCCCATCAGTAGATCTAGCTATCTTCTCTCTCCACATCGCTGGGGCTTCATCTATCCTTGGGGCATTAAATTTTATTACTACTGTAATTAATATACGATGAAAAGGCTTACGCTTAGAACGAGTCCCCCTCTTTGTATGATCTGCGAAAATCACAGCTATCCTTCTTCTTCTCTCATTACCAGTTCTGGCGGGTGCCATCACTATATTATTAACTGACCGAAATCTAAACACTTCCTTTTTTGACCCCTCAGGGGGAGGAGACCC- Eumida_sp. ------------------------------------------------------TGTGGAATTTGATCAGGTTTATTAGGGACTTCTATAAGTATATTAATTCGGGCAGAGTTAGGCCAGCCTGGTGCTTTACTGGGAAGGGATCAGTTATATAACACAATTGTTACTGCTCACGCATTTTTAATAATTTTTTTTTTGGTTATGCCTGTTATAATTGGAGGATTTGGTAATTGGCTTGTTCCTTTAATATTAGGAGCTCCTGATATGGCTTTTCCGCGGTTGAATAATATGAGTTTTTGACTTTTGCCACCTTCTTTAATTATACTTTTGAGGTCTGCAGCAGTAGAGCAAGGGGCAGGAACTGGGTGAACTGTGTATCCTCCACTTTCTAGTAACATATCTCATGCTGGTCCTTCAGTTGATTTAGCTATTTTTTCTTTACATTTGGCCGGAGTTTCTTCAATTTTGGCTTCTATTAATTTTATTACTACTGCTATGAATATACGATCTAGGGGTCTTCGTTTAGAACGAGTTCCTTTATTTGTTTGGTCTGTAGGGATTACTGCTTTATTATTATTGTTGTCTTTACCTGTTCTTGCTGGAGCGATTACTATACTTTTAACAGATCGTAATTTAAATACTTCTTTTTTTGATCCTGCTGGAGGGGGGGATCC- Gattyana_ciliata ------------------------------------------------TTTTATTTTTGGTACTGATCAGGTCTTTTAGGAACTTCTATAAGACTCCTAATTCGTGCTGAACTTGGGCAGCCTGGATCTTTATTAGGCAGAGACCAATTATATAACACTATTGTTACCGCTCACGCTTTCTTAATAATTTTTTTTCTTGTAATACCTGTCCTTGTCGGAGGATTTGGGAATTGACTAATCCCCCTTATATTAGGAGCTCCTGATATAGCATTCCCACGATTAAATAATATAAGATTTTGATTATTACCCCCCTCTTTAATTCTTTTACTTTCTTCAAGAGCTGTAGAAAAAGGAGTTGGAACAGGTTGAACAGTTTACCCCCCACTCGCTTCTAATATCGCTCACGCTGGCCCTTCAGTTGATTTAGCTATTTTTTCACTACATATTGCAGGGGTTTCTTCTATTTTAGGGGCTCTTAATTTTATTACAACTGTTGTTAATATACGATATAAAGGCCTACGTCTTGAACGTGTCCCTCTTTTTGTATGAGCTGCTAAAATTACAGCTATTCTTTTACTTCTTTCCTTACCTGTTTTGGCTGGAGCTATTACCATATTATTAACAGACCGAAACCTTAATACCGCTTTCTTTGACCCTGCGGGGGGAGGGGATCT- Halsydna_brevisetosa -------------GGTCAACAAATCATAAAGATATTGGTACTCTATATTTTATTTTTGGAACTTGATCAGGTTTACTAGGCACGTCTATAAGTATACTTATCCGTGCCGAACTTGGTCAACCAGGATCTCTCTTAGGTAGAGACCAACTATATAACACTATTGTTACAGCCCACGCTTTTCTCATAATTTTCTTTTTAGTAATACCAGTATTAGTAGGAGGATTTGGTAACTGACTAATTCCTCTTATATTAGGAGCTCCTGATATGGCTTTCCCTCGTCTAAACAATATAAGATTTTGACTTCTCCCTCCATCCCTAATTCTTCTCCTTTCATCTAGCGCAGTTGAAAAAGGTGTAGGGACAGGGTGAACTGTATACCCTCCGTTGGCCAGAAATATTGCTCACGCTGGACCTTCAGTAGATTTAGCTATTTTTTCGCTTCATATTGCAGGGGTTTCATCTATTCTCGGTGCCCTAAATTTTATTACCACTGTTATAAATATACGCTACAAAGGCCTTCGTTTAGAACGCGTTCCTCTTTTCGTATGAGCAGCTAAAATTACAGCTATCCTCCTTCTTCTTTCACTGCCCGTCCTGGCAGGAGCTATTACTATACTTCTAACAGACCGTAACCTCAACACTGCTTTTTTTGATCCGGCAGGTGGGGGTGACCC- Harmothoe_oculinarum ----------------------------------------------------------------GATCAGGTCTTCTAGGAACCTCTATAAGACTCCTTATTCGAGCAGAACTTGGGCAACCTGGATCCCTTTTAGGAAGTGACCAACTATATAACACTATTGTAACCGCTCATGCTTTCTTAATAATCTTCTTCTTAGTAATACCAGTATTAGTTGGAGGTTTTGGAAACTGATTAATCCCCCTAATGCTAGGGGCTCCTGATATAGCATTCCCACGATTAAACAATATAAGATTCTGACTTCTGCCTCCCTCATTAATTCTTTTACTCTCCTCAAGGGCTGTAGAAAAAGGAGTTGGAACAGGATGAACTGTATACCCTCCATTAGCTTCTAATATCGCTCATGCTGGACCATCAGTTGACCTCGCAATTTTCTCTCTTCATATTGCAGGGGTATCCTCTATTCTAGGGGCACTAAACTTTATTACTACAGTAATTAATATACGATACAAAGGACTCCGCTTAGAACGTGTCCCTTTATTTGTATGAGCAGCTAAAATTACAGCTATCCTCTTATTACTGTCACTTCCTGTCTTAGCAGGAGCTATTACTATGCTACTAACTGACCGTAACTTAAACACAGCCTTTTTTGATCCTGCTGGAGGGGGAGATCC- Leanira_sp. ------------------------------------------------------TTTCGGAACTGATCCGGCCTTCTAGGTACCTCAATAAGACTCCTTATTCGAGCAGAACTAGGACAGCCCGGAGCCCTCCTCGGCAGAGACCAACTTTACAACACTATCGTAACCGCCCACGCTTTTCTTATAATTTTCTTCCTTGTCATGCCCATCCTAATTGGCGGATTCGGCAACTGACTAATCCCACTAATATTAGGAGCCCCCGACATAGCATTCCCACGCCTAAACAACATAAGATTCTGACTCCTACCGCCATCCCTAATCCTCCTTCTCTCCTCTAGGGCGGTAGAAAAAGGAGTTGGTACGGGCTGAACTGTTTACCCTCCCCTCGCTTCTAACATCGCCCACGCGGGCCCAAGTGTAGACCTAGCAATTTTCTCCCTCCATATCGCCGGAGTATCCTCCATTCTAGGATCCCTTAACTTCATCACAACAGTCATTAATATGCGCTACAAAGGACTTCGTCTGGAACGAGTCCCCCTATTTGTATGATCGGCAAAAATTACTACCATTCTTCTTCTTCTCAGTCTTCCTGTACTTGCCGGAGCCATTACAATACTCCTAACAGACCGGAATTTAAATACGGCCTTCTTTGACCCAGCGGGGGGAGGAGACCC- Lepidonotus_squamatus -------------------------------------------------TTATTTTCGGTACTTGATCGGGTCTTTTAGGCACTTCTATAAGACTCCTTATTCGTGCTGAGTTAGGACAACCAGGATCCTTATTAGGAAGAGATCAACTATATAACACCATTGTTACTGCCCATGCATTTCTTATAATTTTTTTTCTGGTAATACCTGTTCTAGTAGGAGGATTTGGTAACTGATTGATTCCATTAATGCTAGGGGCTCCTGATATAGCTTTCCCCCGTTTAAACAACATAAGATTTTGATTACTACCCCCTTCACTTATTTTATTACTTTCTTCTAGAGCAGTGGAAAAAGGGGTGGGAACAGGATGAACCGTTTACCCACCTTTATCCTCTAATATTGCTCATGCAGGGCCTTCAGTAGATTTAGCTATTTTTTCTTTACATATTGCTGGGGTTTCTTCTATTCTAGGAGCCCTTAACTTTATTACCACAGTAGTTAACATACGTTATAAAGGTTTACGACTTGAACGTGTTCCTTTATTTGTGTGATCGGCTAAAATTACTGCTATTCTCTTATTATTATCTTTACCTGTCTTAGCAGGGGCTATTACCATACTGCTAACTGACCGAAACTTAAACACTGCTTTCTTTGATCCTGCAGGAGGGGGGGACCC- Lepidonotus_sublevis -----------------------------------------------------TTTTTGGTACTGATCAGGTCTTTTAGGAACTTCTATAAGACTTCTAATTCGTGCTGAGCTAGGACAACCTGGATCCTTGCTTGGCAGAGACCAATTATATAATACTATTGTTACAGCTCACGCTTTTTTAATAATTTTTTTTCTTGTAATACCAGTCCTAGTAGGAGGATTTGGTAATTGATTAATTCCACTAATATTAGGTGCTCCTGATATAGCTTTTCCACGATTAAATAATATAAGATTTTGATTACTTCCCCCCTCACTAATTCTTTTACTCTCATCAAGAGCTGTAGAAAAAGGGGTGGGAACAGGATGGACAGTTTATCCGCCTCTTGCTTCTAATATTGCACATGCTGGGCCTTCCGTTGATCTAGCTATTTTTTCTCTTCATATTGCAGGGGTCTCTTCTATTTTAGGAGCCCTTAATTTTATTACTACAGTTGTTAATATACGATACAAAGGATTACGTTTAGAACGTGTTCCTCTTTTTGTATGAGCAGCTAAAATTACAGCAATTCTTTTATTACTTTCCTTACCAGTTCTAGCTGGGGCTATTACGATACTTTTAACTGACCGTAACCTAAATACCGCTTTCTTTGACCCTGCCGGTGGAGGGGATCC- Paralepidonotus_ampulliferus ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GGTCAACCTGGATCCTTATTAGGAAGAGACCAACTTTATAATACAATCGTGACCGCTCACGCTTTTCTTATAATCTTTTTTCTTGTAATACCAGTCCTAGTTGGTGGCTTCGGAAATTGATTAATTCCTTTAATACTAGGTGCACCGGATATAGCATTTCCTCGTTTAAATAATATAAGATTTTGACTCCTGCCCCCTTCTCTGATTCTTCTTCTTTCATCAAGAGCTGTAGAAAAAGGAGTAGGTACAGGCTGAACCGTTTACCCTCCTTTAGCTTCTAACATTGCTCATGCTGGCCCCTCCGTTGATCTAGCAATTTTTTCACTACATATTGCCGGTGTTTCTTCTATTCTTGGTGCTCTAAATTTTATCACAACTGTAATTAATATACGATACAAAGGACTTCGTCTAGAACGTGTTCCCTTATTTGTTTGAGCCGCAAAAATTACAGCTATTCTCCTTCTCC----------------------------------------------------------------------------------------------- Paramphinome_jeffreysi -------------GGTCAACAAATCATAAAGATATTGGCACCATATATATAATCTTCGGAGTTTGAGCAGGACTACTCGGAACCTCAATAAGGATTTTAATTCGCACAGAGCTCGGGCAGCCCGGAGCTTTTCTAGGAAGAGACCAACTTTACAATACCATCGTTACCGCCCACGCATTTCTTATAATCTTCTTTCTAGTAATACCTATAATAATTGGCGGATTTGGCAACTGACTGGTACCACTTATATTAGCGGCACCTGATATAGCATTTCCTCGACTAAATAATATAAGATTTTGACTACTTCCCCCCTCTCTAACACTACTTGTATTTTCAGCCGCAGTAGAAAAAGGGGCCGGAACAGGCTGAACCGTATACCCTCCATTATCCAGAAATCTCGCCCATGCCGGACCCTCCGTAGACCTGGCCATTTTCTCGTTACACCTGGCGGGAGTGTCATCAATTTTGGCCTCCTTAAACTTTATCACAACAACCATTAACATGCGAGTTGAAGGAATACAAATAGAACGGGTACCACTGTTTATTTGATCTATTCTAATTACAACTATTT{AT}ACTGTTACTATCCCTCCCCGT{AT}CTCGCC{CG}GAGCAATTACAATACTACTTACGGACCGAAACTTAAATACCGCGTTCTTCGACCCCGCAGGAGGAGGAGACCC- Pholoe_sp. ------------------------------------------------------TATGGAACCTGATCTGGTCTTATAGGCACATCTATAAGGATGCTTATTCGTGCTGAGTTAGGCCAACCTGGATCTTTATTAGGCAGAGACCAGCTATACAACACAATTGTAACGGCACATGCTTTTCTGATAATTTTCTTCTTGGTCATACCTATTCTTGTTGGAGGATTTGGTAACTGACTTATCCCTCTCATACTTGGTGCTCCTGATATGGCATTCCCTCGCCTAAACAACATAAGATTTTGATTACTACCTCCATCATTAATCCTTTTACTAAGATCAAGTGCAGTTGAAAAGGGGGTTGGAACAGGATGAACAGTATACCCCCCTCTAGCAGCAAATATCGCCCATGCTGGGCCCTCAGTTGACCTTGCTATTTTTTCTCTGCATATTGCAGGTGTTTCATCAATCTTAGGCGCATTAAACTTCATCACCACAGTTCTTAACATACGTTATAAAGGGCTACGCTTAGAACGAGTGCCTTTATTTGTATGGGCTGCCAAAGTAACTGCTATCCTACTACTTTTAAGACTCCCAGTATTAGCTGGTGCAATTACCATGTTACTAACAGATCGTAACTTAAACACTGCTTTTTTTGATCCTGCG--------------- Pisione_remota ---------------------------------------------TATTT?ATTTTCGGGACATGGTCAGGTCTTCTTGGCACTTCGATAAGCCTTTTAATTCGTGCTGAATTAGGTCAACCAGGCTCATTGTTAGGAAGAGACCAACTATATAACACTATTGTAACAGCCCACGCATTCCTTATAATTTTCTTTTTAGTTATACCAATTTTAGTAGGGGGATTTGGTAACTGACTAATCCCATTAATACTAGGAGCTCCTGACATGGCTTTCCCTCGTCTTAACAACATAAGATTTTGACTACTACCACCCTCCCTTATCCTTTTACTTTCATCTAGAGCCGTTGAAAAAGGAGTTGGAACCGGATGAACCGTTTACCCTCCTCTAGCCTCTAACATTGCTCATGCTGGACCATCAGTTGATTTAGCTATTTTTTCTCTTCACATTGCAGGTGTTTCTTCAATTCTAGGTGCCCTAAATTTTATCACCACTGTTATTAATATACGCTATAAGGGTTTACGCTTAGAACGTGTACCATTATTTGTCTGATCAGCCAAAATCACTGCAATTCTTTTACTTCTTTCGCTTCCAGTTCTAGCTGGGGCTATCACCATGCTTCTTACTGATCGTAATCTAAACACAGCATTTTTTGATCCTGCTGGAGGAGGAGACCC- Platynereis_dumerlii ATGCGCTGATTTTTTTCCACTAATCATAAAGATATTGGCACCTTATACTTCATTTTTGGTACTTGGTCGGGCCTCCTAGGAACCTCTATAAGCCTCTTAATCCGGGCTGAACTAGGTCAACCCGGATCGCTACTCGGGAGAGACCAACTATATAATACTATTGTTACAGCCCACGCATTCCTAATAATTTTTTTCTTAGTTATACCCGTAATAATCGGAGGGTTTGGCAATTGATTGGTGCCTTTAATATTAGGGGCCCCAGATATAGCATTCCCCCAATTAAATAACATAAGCTTCTGACTTCTTCCCCCCTCTCTGAGTCTTCTTCTTTCTAGGGCAGCAGTAGAAAAAGGAGTGGGTACCGGCTGAACAGTCTATCCTCCTTTATCCAGTAATATTGCTCATGCTGGCCCCTCAGTAGACCTGGCAATCTTTTCTCTTCACCTAGCGGGGGTGTCCTCTATTATAGGGGCCTTAAATTTTATTACCACAGTTATCAATATACGCTCAAAAGGACTAAAACTAGAACGTGTCCCTCTATTTGTATGATCTGTAGTAATTACAGCGGTTCTTCTA?TATTAAGGCTTCCAG?GTTAG?GGGTGCTATCACAATATTATTAACAGACCGAAACCTAAACACTGCGTTCTTTGATCCTGCTGGAGGGGGAGACCC- Sigalion_spinosa -----------------------------------------------ATTTATTTTTGGCACCTGATCCGGTTTATTAGGCACCTCTATAAGCCTTCTAATCCGAGCTGAGCTTGGACAACCAGGATCACTCCTTGGAAGAGATCAGCTCTACAACACAATTGTAACTGCCCACGCTTTCTTAATAATTTTTTTCCTCGTTATACCAATCTTAGTTGGGGGATTCGGAAATTGACTTATCCCCCTTATATTAGGAGCCCCCGACATGGCATTCCCACGTCTTAATAACATAAGATTCTGGCTACTGCCCCCCTCCCTTATCCTTCTTCTATCTTCAAGAGCTGTTGAAAAAGGAGTGGGAACAGGATGAACTGTATACCCCCCTCTGGCTTCTAATATCGCCCATGCTGGGCCTTCCGTTGACCTAGCAATTTTCTCCCTCCATATCGCTGGAGTCTCATCAATTTTAGGGGCCTTAAACTTCATCACCACCGTGATTAATATACGGTATAAAGGCCTACGACTCGAACGAGTTCCCCTTTTTGTTTGAGCCGCTAAAATTACTGCCATTCTTCTACTTCTATCACTGCCCGTATTAGCAGGAGCTATCACTATGCTTCTTACAGACCGTAACCTAAACACTGCTTTTTTCGATCCTGCCGGAGGGGCGACCCA- Sige_sp. ----------------------------------------------------------------GATCAGGTTTATTAGGGACTTCTATAAGAATATTAATTCGGGCAGAGTTAGGTCAGCCTGGTGCTTTATTGGGAAGGGATCAGTTATATAACACAATTGTTACTGCTCACGCATTTTTAATAATTTTTTTTTTAGTTATGCCTGTTATAATTGGAGGATTTGGTAATTGGCTTGTTCCTTTAATATTAGGAGCTCCTGATATGGCTTTTCCGCGGTTGAATAATATGAGTTTTTGACTTTTGCCACCTTCTTTAATTATACTTTTGAGGTCTGCAGCAGTAGAGCAAGGGGCAGGAACTGGGTGAACTGTGTATCCTCCACTTTCTAGTAATATATCTCATGCTGGTCCTTCAGTTGATTTAGCTATTTTTTCTTTACATTTGGCCGGAGTTTCTTCAATTTTGGCTTCTATTAATTTTATTACTACTGCTATGAATATACGATCTAGGGGTCTTCGTTTAGAACGAGTTCCTTTATTTGTTTGGTCTGTAGGGATTACTGCTTTATTATTATTGTTGTCTTTACCTGTTCTTGCTGGAGCGATTACTATACTTTTAACAGATCGTAATTTAAATACTTCTTTTTTTGATCCTGCTGGAGGGGGGGATC-- Sthenalanella_uniformis -------------------------------------------------------------------------------GAACCTCTATAAGGCTATTAATTCGAGCTGAACTTGGGCAACCAGGAGCTCTACTCGGAAGAGATCAGCTCTACAACACTATCGTGACTGCTCACGCTTTCTTGATAATTTTTTTTCTTGTTATACCCATTCTCATTGGAGGATTTGGAAATTGACTTATTCCCCTAATACTGGGGGCTCCTGACATGGCGTTTCCCCGCTTAAACAATATAAGATTTTGACTTCTCCCACCCTCCCTTATTCTTCTACTTTCATCAAGGCTTGTTGAAAAAGGGGTGGGAACGGGATGAACAGTTTATCCTCCTCTTGCCTCTAATATTGCCCATGCAGGACCATCTGTGGACCTTGCCATTTTCTCCCTCCACATCGCTGGGGTATCGTCTATTCTAGGCTCTCTAAATTTCATTACAACTGTAATCAACATACGATATAAGGGCCTTCGTCTTGAACGTGTGCCATTATTTGTGTGGGCCGCTAAAATTACAACTATCTTACTACTCCTAAGACTCCCAGTCCTAGCCGGTGCTATTACTATACTCCTAACCGACCGAAATTTAAATACAGCATTTTTTGACCCTGCGGGGGGTGGAGACCC- Sthenelais_boa ---------------------------------------------------TATTTCGGCACATGATCCGGTTTATTAGGCACATCAATAAGACTTCTTATTCGAGCAGAGTTAGGTCAGCCGGGCGCTCTGTTAGGTAGTGATCAACTATATAACACTATTGTCACAGCACATGCTTTTCTTATAATTTTCTTTTTAGTTATACCAATTCTAATTGGTGGGTTTGGCAATTGACTTATTCCACTAATATTAGGGGCTCCTGATATGGCTTTTCCTCGCCTTAATAATATAAGATTTTGATTACTTCCTCCTTCTCTTATTCTCCTTCTCTCCTCTAGCCTAGTTGAAAAAGGGGTTGGAACCGGATGAACCGTATACCCTCCTCTGGCATCTAATATTGCCCATGCAGGACCATCAGTAGACCTCGCAATTTTTTCACTTCATATTGCTGGTGTCTCTTCTATTCTTGGGGCCCTTAACTTTATTACAACCGTTGTCAATATACGATATAAAGGGCTGCGACTAGAGCGTGTACCTTTATTTGTTTGGGCCGCTAAAGTAACAACTATTCTTTTACTTCTTAGCCTTCCAGTGTTGGCCGGGGCAATCACAATGCTTCTTACCGACCGTAATCTAAATACGGCATTCTTTGATCCAGCTGGAGGTGGAGATCC- ; END; BEGIN SETS; CHARSET Excluded (CHARACTERS = COI) = 1-63; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = COI) = N: 1-675; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = COI) = N: 1-675; END;