#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on May 17, 2024; 8:09 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Meerow A., Francisco-ortega J., Kuhn D., & Schnell R. 2005. Phylogenetic Relationships and Biogeography within the Eurasian Clade of Amaryllidaceae Based on Plastid ndhF and nrDNA ITS Sequences: Lineage Sorting in a Reticulate Area?. Systematic Botany, null. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S1433] BEGIN TAXA; TITLE Eurasian_clade_combined; DIMENSIONS NTAX=34; TAXLABELS Acis_autumnalis Acis_nicaeensis Acis_tingitana Acis_trichophylla Cyrtanthus_herrei Galanthus_ikariae Galanthus_nivalis Galanthus_peshmenii Galanthus_plicatus_ssp._byzant Galanthus_plicatus_ssp._plicat Galanthus_reginae_olgae Galanthus_woronowii Hannonia_hesperidum Lapiedra_martinezii Leucojum_aestivum Lycoris_aurea Lycoris_radiata Lycoris_squamigera Narcissus_alcaracensis Narcissus_calcicola Narcissus_elegans Narcissus_nanus Narcissus_viridiflorus Pancratium_canariense Pancratium_tenuifolium Pancratium_zeylanicum Sternbergia_colchicifolia Sternbergia_greuteriana Sternbergia_lutea Sternbergia_lutea_angust Sternbergia_sicula Ungernia_flava Vagaria_ollivieri Worsleya_rayneri ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M1575] TITLE EurasianNDH&ITS; LINK TAXA = Eurasian_clade_combined; DIMENSIONS NCHAR=2744; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Acis_nicaeensis 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Acis_tingitana 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Galanthus_ikariae 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Galanthus_nivalis ?????????TGTT-ATAGGATTTGGACTTC-TGCTTATTCCGACAGCAACAAAAAATATTCGTCGTATGTGGACTTTT-CCAAGTGTTTTGATGCTAAGTATAGCTATGGTGTTTTCGGCCAATCTGTCTATTCAGCAAATAAATGGAAATTTTTTCTATCAATATCTATGGTCTTGGACTGTCAATAATGATTTTTCTTTAGAGTTCGGACACTTGATCGATCCACTTACTTCTATTATGTCCATATTAATTACTACTGTTGGAATCATGGTTCTTATTTATAGTGACAATTATATGTCTCACGATCAAGGATATTTGAGATTTTTTGCTTATATGAGTTTTTTTAATACTTCTATGTTGGGATTAGTTACTAGTTCCAATTTGATACAAATTTATATTTTTTGGGAACTTGTAGGAATGTGCTCGTATTTATTAATAGGTTTTTGGTTCACACGTCCAATTGCGGCAAGTGCTTGTCAAAAAGCTTTTGTAACCAATCGTATAGGGGATTTTGGTTTATTATTAGGAATTTTAGGACTTTATTGGATAACGGGTAGTTTAGAATTTCGGGATTTGTTCGGAATAGTTAATAACTTAGTTCGTAATAATGGAATGGATTCTTTATTTGCTACTCTGTGTGCTTCTTTTTTATTTGTCGGTGCAGTTGCTAAATCCGCACAATTCCCTCTTCACATATGGTTACCTGATGCTATGGAAGGACCTACTCCCATTTCAGCTCTTATACATGCTGCTACTATGGTAGCAGCGGGAATTTTTCTTGTAGCTCGGCTTCTTCCTCTTTTCACAGTCATACCTTACATAATGAATCTCATTTCTTTAATAGGCGTAATAACAGTACTATTTGGAGCCACTTTGGCTCTTGCTCAAAGAGACATTAAAAGAAGTTTAGCTTATTCTACAATGTCTCAATTGGGTTATATTATGTTAGCTCTGGGTATAGGTTCTTATCGAGCCGCTTTATTCCATTTGATCACCCATGCCTATTCGAAAGCTTTATTATTTTTGGGATCCGGATCCATTATTCATTCAATGGAACCCATTGTTGGATATTCACCAGATAAAAGTCAAAATATGGTTCTTATGGGGGGTTTAACAAAATATGTTCCAATTACAAGAATGACTTTTTTATTAGGTACGCTCTCTCTTTGTGGTATTCCACCTCTTGCTTGTTTTTGGTCCAAAGACGAAATTCTTAATGATAGTTGGTTGTATTCACCAATTTTCGCAATAATAGCTTCCTTCACAGCGGGATTAACCGCATTTTATATGTTTCGGATGTATTTACTTACTTTTGATGGACGTTTGCGAATTCATTTTCAAAATTACAGTAGCACTAAAAATACTTCGTTCTATTCAATATCCTTATGGGGAAAAGAAGTACCAAAAAAAATCAATAGAAATTTACTTTTATCAACAATGAATAATAAGGTCTCTTTTTTTTCAAAAGATATATATCGAATTGATGATAATGTAAGAAATAGAGTACGATACTTTAGTACTTACTTTAGAAATAAATACACTTGCACCTATCCTCACGAATCGGACAATACTATGTTATTTCCCCTGCTTGTATTAGGACTATTTACTTTATTCATTGGAGCAATTGGAATTCATTTTGACCGAGGAGTAATAGATTTGGATCTATTGTCGAAATGGATAACTCCGTACGCGGATTTTTTCCATCCAAATTCGAAGGATTCTTCGGATTGGTATGAGTTTTTGAAAAATGTAGTTTTTTCGGTAAGTATAGCCCTTTTCGGATTATTTGTAGCATCAATTTTATATGGATCCGTTTATTCATCTCTACAGAATTTGGGTTTAGTCAATTCATTTGTGAAGAAGAGCCCCAAGAGAATTTTCTTGGACCAAGTAAAAAATGGTATATACAATTGGTCATATAATCGTGGTTACATAGATATTTTTTATACTAAGATTTTTACTGCGGGTGTAAGAGGATTAGCTGAACTAATTAAGTTTTTTGATAGACATATAATTGATGGAATTACGAACGTGGTCGG???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Galanthus_peshmenii 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Galanthus_plicatus_ssp._byzant 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Galanthus_plicatus_ssp._plicat 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Galanthus_reginae_olgae 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Galanthus_woronowii 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Hannonia_hesperidum ????????????TAATAGGATTTGGACTTC-TGCTTATTCCGACAGCAACAAAAAATATTCATCGTATGTGGGCTTTT-CCAAGTGTTTTGATGCTAAGTATAGCTATGGTGTTTTCGGCCAATCTGTCTATTCAGCAAATAAATGGAAATTTTATCTATCAATATCTATGGTCTTGGACTGTCAATAATGATTTTTCTTTAGAGTTCGGACACTTGATCGATCCACTTACTTCTATTATGCCCATATTAATTACTACTGTTGGAATCATGGTTCTTATTTATAGTGACAATTATATGTCTCACGATCAAGGATATTTGAGATTTTTTGCTTATATGAGTTTTTTCAATACTTCTATGTTGGGATTAGTTACTAGTTCCAATTTGATACAAATTTATATTTTTTGGGAACTTGTAGGAATGTGTTCGTATTTATTAATAGGTTTTTGGTTCACACGTCCAATTGCGGCAAGTGCTTGTCAAAAAGCTTTTGTAACCAATCGTATAGGGGATTTTGGTTTATTATTAGGAATTTTAGGACTTTATTGGATAACTGGTAGTTTAGAATTTCGGGATTTGTTCGGAATAGTTAATGACTTAGTTCGTAATAATGGAATGGATTCTTTATTTGCTACTCTGTGTGCTTCTTTTTTATTTGTCGGTGCAGTTGCTAAATCCGCACAATTCCCTCTTCACATATGGTTACCTGATGCTATGGAAGGACCTACTCCCATTTCGGCTCTTATACATGCTGCTACTATGGTAGCAGCGGGAATTTTTCTTGTAGCTCGGCTTCTTCCTCTTTTCACAGTTATACCTTACATAATGAATCTCATTTCTTTAATAGGCGTAATAACAGTACTATTTGGAGCCACTTTGGCTCTTGCTCAAAGAGACATTAAAAGAAGTTTAGCTTATTCTACAATGTCTCAATTGGGTTATATTATGTTAGCTCTGGGTATAGGTTCTTATCGAGCCGCTTTATTCCATTTGATCACCCATGCCTATTCGAAAGCTTTATTGTTTTTGGGATCCGGATCCATTATTCATTCAATGGAACCCATTGT{GT}GGATATTCACCAGATAAAAGTCAAAATATGGTTCTTATGGGGGGTTTAACAAAATATGTTCCAATTACAAGAATTACTTTTTTATTAGGTACGCTCTCTCTTTGTGGTATTCCACCTCTTGCTTGTTTTTGGTCAAAAGACGAAATTCTTAATGATAGTTGGTTGTATTCACCAATTTTCGCAATAATAGCTTTCTTCACAGCAGGATTAACTGCATTTTATATGTTTCGGATGTATTTACTTACTTTTGATGGACGTTTGCGAATTCATTTTCAAAATTACAGTAGCACTCAAAATACTTCTTTCTATTCAATATCCTTATGGGGAAAAGAAGTGCCAAAAGCAGTCAATAGAAATTTACTTTTATCAACAATGAATAATAAGGTCTCTTTTTTTTCAAAAGATATATATCGAATTGATGATAATGTAAGAAATAGAGTACGATACTTTAGTACTTACTTTAGAAATAAATACACTTACACCTATCCTCACGAATCGGACAATACTATGTTATTTCCCCTGCTTGTATTGGTACTATTTACTTTATTCATTGGAGCAATCGGAATTAATTTTAACCGAGGAGTAATAGATTTTGATCTATTGTCGAAATGGTTAACTCCGTCCGCGGATTTTTTCCATCAAAATTCGAAGGATTCTTCGGATTGGTATGAGTTTTTGAAAAATGTAGTTTTTTCGGTAAGTATAGCCCTTTTTGGATTATTTGTAGCATCCGTTTTATATGGATCTGTTTATTCACCTCTACATAATTTGGGTTTAGTCAATTCATTTGTGAAGAAGAGTCCCAAGAGAATTCTCTTGGACCAAGTCAAAAATGGTATATACAATTGGTCATATAATCGTGGTTACATAGATATTTTTTATACTAAGATTTTTACTGTGGGTGTAAGAGGATTAGCTGAACTAATTCAGTTTTTTGATAGACATATAATTGATGGAATTACGAACGGGGTC???????????????????????????????????????????????TCGAGG-CCCGAACGGACGATCGCGAACCCGTAGAACACTCG-TGGGGTGCGGTAAGGGG-GCGGCGCCTG-CCT-TGCCCCC---GTCCCCCTCCTT--GGGTGCCCC--TGCCGTCG-CCGCCCTGCACGTCGTGCGGGACGAGCGG-CGGGAACAAAATTCGCGGCGCGGTACGCGCCAAGGAGCAGCCCCGTTC---GGGTGGCCGAGCGTGCGG-CGAGCGTAGCGTCGCAGCACGCGAT----GCGATCCTGGT--ACGTCCAACA-TGCACGACTCTCGGCAACGGATATCTTGGCTCCCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGA-GGCTATCCGGCCAAGGGCACGCCTGCCTGGGTGTCACGCCCAACGACGCTCCG-TTCGGCGG--CAGGTACCGACGCGGAGATTGGCTCCC-CGCGC----ATTGTTG-CACGGTGGGTCGAAGTGCGGGCCGTCGGTCGAGCTGTACGCGGCGAGCGGTGGATTTGACACGCACGTCGTCGTCGAAGTGTCCCG-GCTCGGGCGATGCACCGGAAGAACCCATGTCGAGGGGCCGCAAAGTCGAGCGCTCC-TCGGAA? Lapiedra_martinezii 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Leucojum_aestivum 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Lycoris_aurea 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Lycoris_radiata 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Lycoris_squamigera 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Narcissus_alcaracensis 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Narcissus_calcicola 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Narcissus_elegans 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Narcissus_nanus 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Narcissus_viridiflorus 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Pancratium_canariense 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Pancratium_tenuifolium 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Pancratium_zeylanicum 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