#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on May 15, 2024; 19:51 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Cuenca A., & Asmussen-lange C. 2007. Phylogeny of the palm tribe Chamaedoreeae (Arecaceae) based on plastid DNA sequences. Systematic Botany, null. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S1768] BEGIN TAXA; TITLE combined; DIMENSIONS NTAX=55; TAXLABELS Calamus_aruensis Caryota_mitis Ceroxylon_quinduenses Chamaedorea_adscendens Chamaedorea_allenii Chamaedorea_alternans Chamaedorea_brachypoda Chamaedorea_costaricana Chamaedorea_crucensis Chamaedorea_dammeriana Chamaedorea_elatior Chamaedorea_elegans Chamaedorea_ernestiaugustii Chamaedorea_fragrans Chamaedorea_geonomiformis Chamaedorea_glaucifolia Chamaedorea_hooperiana Chamaedorea_linearis Chamaedorea_metallica Chamaedorea_microspadix Chamaedorea_nationsiana Chamaedorea_oblongata Chamaedorea_pedunculata Chamaedorea_pinnatifrons Chamaedorea_plumosa Chamaedorea_pochutlensis Chamaedorea_sartorii Chamaedorea_seifrizii Chamaedorea_stolonifera Chamaedorea_tepejilote Chamaerops_humilis Cocos_nucifera Gaussia_attenuata Gaussia_gomezpompae Gaussia_maya Gaussia_princeps Gaussia_spirituana Geonoma_congesta Hyophorbe_amaricaulis Hyophorbe_indica Hyophorbe_lagenicaulis Hyophorbe_vaughanii Hyophorbe_verschaffeltii Hyospathe_macrorhachis Iriartea_deltoidea Linospadix_monostachya Manicaria_saccifera Nypa_fruticans Phytelephas_aequatorialis Podococcus_barteri Pseudophoenix_vinifera Roystonea_oleracea Synechanthus_fibrosus Synechanthus_warscewiczianus Wendlandiella_gracilis ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M1814] TITLE ndhF_gene_plastid; LINK TAXA = combined; DIMENSIONS NCHAR=954; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Chamaedorea_brachypoda ???ATGGTTCTTATGGGTGGTTTAACAAGATATGTTCCAATTACAAAAACTACTTTTTTATTAGGTACACTTTCTCTTTGTGGTATTCCACCTCTTGCTTGTTTTTGGTCCAAAGACGAAATTCTTAATGATAGTTGGTTATATTCACCAATTTTTGCAATAATACCTTTTTTCACAATAGGATTAACCGCATTTTATATGTTTCGGGTATATTTACTTACTTTTGATGGGTATTTACGCGTTTCTTTTCAAAATCACAGTAGCACTAAAAATAACTCGTTCTATTCAATATCTCTATGGGGAAAAGAAGCACCAAAAACAGTCAAGAAAAATTTACTTTTATCAACAATGAATAGTAAGGTCTACTTTTTTTCAAAAGATACATATCAAATTATTGATAATGATAAGATACGATACTTTAGTACTTACTTTGGAAATAAATATACTTCCATGTATCCTCACGAATCAGACAATACTATGCTATTTACTCTACTTGTATTGGTACTATTTACTTTGTTCGTTGGATCAATAGGAATTTCTTTTGAT------CAAGGAGTAATGGATTTTTATATATTATCGAAATGGTTAACCCCATCCCAAAATCTTTTCCATCAAAATTCGAATTATTCTGTGAATTGGAATTGGTATGAATTTTTTACAAATTCCATTTTTTCAGTAAGTATAGCCATTTTCGGATTATTCATAGCATATATTTTATATGGGTCTGTTTATTCATTTTTCCAGAATTTGGACTTAATCAATTCATTTGTAAAAGGGAGCCCTAAGAGAATTATCTTGGACCAAATAAAAAGTGTTATATACAATTGGTCATATAATCG{CT}GGTTACATAGATATTTTTTATACTAGAGTTTTAGTCATGGGTATAAGAGGAATAACCAAGCTAACTCAGTTTTTTGATAGACATATAATTGATGGAATTACAAATGGAGTT Chamaedorea_costaricana AATATGGTTCTTATGGGTGGTTTAACAAGATATGTTCCAATTACAAAAACTACTTTTTTATTAGGTACACTTTCTCTTTGTGGTATTCCACCTCTTGCTTGTTTTTGGTCCAAAGACGAAATTCTTAATGATAGTTGGTTATATTCACCAATTTTTGCAATAATACCTTTTTTCACAATAGGATTAACTGCATTTTATATGTTTCGGGTATATTTACTTACTTTTGATGGGTATTTACGCGTTTATTTTCAAAATCACAGTAGCACTAAAAATAACTCGTTCTATTCAATATCTCTATGGGGAAAAGAAGCACCAAAAACAGTCAAGAAAAATTTACTTTTATCAACAATGAATAGTAAGGTCTACTTTTTTTCAAAAGATACATATCAAATTATTGATAATGATAAGATACGATACTTTAGTACTTACTTTGGAAATAAATATACTTCCATGTATCCTCACGAATCAGACAATACTATGCTATTTACTCTACTTGTATTGGTACTATTTACTTTGTTCGTTGGATCAATAGGAATTTCTTTTGAT------CAAGGAGTAATGGATTTTGATATATTATCGAAATGGTTAACCCCATCCCAAAATCTTTTCCATCCAAATTCGAATTATTCTGTGAATTGG------TATGAATTTTTTACAAATTCCATTTTTTCAGTAAGTATAGCCATTTTCGGATTATTCATAGCATATATTTTATATGGGTCTGTTTATTCATTTTTCCAGAATTTGGACTTAATCAATTCATTTGTAAAAGGGAGCCCTAAGAGAATTATCTTGGACCAAATAAAAAGTGTTATATACAATTGGTCATATAATCGTGGTTACATAGATATTTTTTATACTAGAGTTTTAGTCATGGGTATAAGAGGAATAACCAAGCTAACTCAGTTTTTTGATAGACATATAATTGATGGAATTACAAATGGAGTT Chamaedorea_crucensis AATATGGTTCTTATGGGTGGTTTAACAAGATATGTTCCAATTACAAAAACTACTTTTTTATTAGGTACACTTTCTCTTTGTGGTATTCCACCTCTTGCTTGTTTTTGGTCCAAAGACGAAATTCTTAATGATAGTTGGTTATATTCACCAATTTTTGCAATAATACCTTTTTTCACAATAGGATTAACCGCATTTTATATGTTTCGGGTATATTTACTTACTTTTGATGGGTATTTACGCGTTTATTTTCAAAATCACAGTAGCACTAAAAATAACTCGTTCTATTCAATATCTCTATGGGGAAAAGAAGCACCAAAAACAGTCAAGAAAAATTTACTTTTATCAACAATGAATAGTAAGGTCTACTTTTTTTCAAAAGATACATATCAAATTATTGATAATGATAAGATACGATACTTTAGTACTTACTTTGGAAATAAATATACTTCCATGTATCCTCACGAATCAGACAATACTATGCTATTTACTCTACTTGTATTGGTACTATTTACTTTGTTCGTTGGATCAATAGGAATTTCTTTTGAT------CAAGGAGTAATGGATTTTGATATATTATCGAAATGGTTAACCCCATCCCAAAATCTTTTCCATCAAAATTCGAATTATTCTGTGAATTGG------TATGAATTTTTTACAAATTCCATTTTTTCAGTAAGTATAGCCATTTTCGGATTATTCATAGCATATATTTTATATGGGTCTGTTTATTCATTTTTCCAGAATTTGGACTTAATCAATTCATTTGTAAAAGGGAGCCCTAAGAGAATTATCTTGGACCAAATAAAAAGTGTTATATACAATTGGTCATATAATCGTGGTTACATAGATATTTTTTATACTAGAGTTTTAGTCATGGGTATAAGAGGAATAACCAAGCTAACTCAGTTTTTTGATAGACATATAATTGATGGAATTACAAATGGAGTT Chamaedorea_dammeriana AATATGGTTCTTATGGGTGGTTTAACAAGATATGTTCCAATTACAAAAACTACTTTTTTATTAGGTACACTTTCTCTTTGTGGTATTCCACCTCTTGCTTGTTTTTGGTCCAAAGACGAAATTCTTAATGATAGTTGGTTATATTCACCCATTTTTGCAATAATACCTTTTTTCACAATAGGATTAACCGCATTTTATATGTTTCGGGTATATTTACTTACTTTTGATGGGTATTTACGCGTTTATTTTCAAAATCACAGTAGCACTAAAAATAACTCGTTCTATTCAATATCTCTATGGGGAAAAGAAGCACCAAAAACAGTCAAGAAAGATTTACTTTTATCAACAATGAATAGTAAGGTCTACTTTTTTTCAAAAGATACATATCAAATTATTGATAATGATAAGATACGATACTTTAGTACTTACTTTGGAAATAAATATACTTCCATGTATCCTCACGAATCAGACAATACTATGCTATTTACTCTACTTGTATTGGTACTATTTACTTTGTTCGTTGGATCAATAGGAATTTATTTTGAT------CAAGGAGTAATGGATTTTGATATATTATCGAAATGGTTAACCCCATCCCAAAATCTTTTCCATCCAAATTCGAATTATTCTGTGAATTGG------TATGAATTTTTTACAAATTCCATTTTTTCAGTAAGTATAGCCATTTTCGGATTATTCATAGCATATATTTTATATGGGTCTGTTTATTCATTTTTCCAGAATTTGGACTTAATCAATTCATTTGTAAAAGGGAGCCCTAAGAGAATTATCTTGGACCAAATAAAAAGTGTTATATACAATTGGTCATATAATCGTGGTTACATAGATATTTTTTATACTAGAGTTTTAGTCATGGGTATAAGAGGAATAACCAAGCTAACTCAGTTTTTTGATAGACATATAATTGATGGAATTACAAATGGAGTT Chamaedorea_elatior ?????????????????TGGTTTAACAAGATATGTTCCAATTACAAAAACTACTTTTTTATTAGGTACACTTTCTCTTTGTGGTATTCCACCTCTTGCTTGTTTTTGGTCCAAAGACGAAATTCTTAATGATAGTTGGTTATATTCACCAATTTTTGCAATAATACCTTTTTTCACAATAGGATTAACCGCATTTTATATGTTTCGGGTATATTTACTTACTTTTGATGGGTATTTACGCGTTTATTTTCAAAATCACAGTAGCACTAAAAATAACTCGTTCTATTCAATATCTCTATGGGGAAAAGAAGCACCAAAAACAGTCAAGAAAAATTTACTTTTATCAACAATGAATAGTAAGGTCTACTTTTTTTCAAAAGATACATATCAAATTATTGCTAATGATAAGATACGATACTTTAGTACTTACTTTGGAAATAAATATACTTCCATGTATCCTCACGAATCAGACAATACTATGCTATTTACTCTACTTGTATTGGTACTATTTACTTTGTTCGTTGGATCAATAGGAATTTCTTTTGAT------CAAGGAGTAATGGATTTTGATATATTATCGAAATGGTTAACCCCATCCCAAAATCTTTTCCATCCAAATTCGAATTATTCTGTGAATTGG------TATGAATTTTTTACAAATTCCATTTTTTCAGTAAGTATAGCCATTTTCGGATTATTCATAGCATATATTTTATATGGGTCTGTTTATTCATTTTTCCAGAATTTGGACTTAATCAATTCATTTGTAAAAGGGAGCCCTAAGAGAATTATCTTGGACCAAATAAAAAGTGTTATATACAATTGGTCATATAATCGTGGTTACATAGATATTTTTTATACTAGAGTTTTAGTCATGGGTATAAGAGGAATAACCAAGCTAACTCA??????????????????????????????????????????? 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