CiteULike CiteULike
Delicious Delicious
Connotea Connotea

Matrix 1828 of Study 1773

About Citation title: "The molecular phylogeny of Rebutia (Cactaceae) and its allies demonstrates the influence of paleogeography on the evolution of South American mountain cacti".
About This study was previously identified under the legacy study ID S1744 (Status: Published).

Matrices

Title: Kak11jan-01

Description: Legacy TreeBASE Matrix ID = M3183

Rows

Taxon Label Row Segments Characters 1?–30
Weingartia cintiensis  (none) ------------------------ATAGCA
Sulcorebutia arenacea  (none) AAAATAAAATAAATGTCCGATAGCATAGCA
Cintia knizei CA01  (none) -----AAAATAAATGTCCGATAGCATAGCA
Cintia knizei CA13  (none) ---------TAAATGTCCGATAGCATAGCA
Sulcorebutia crispata CA106  (none) AAAATAAAATAAATGTCCGATAGCATAGCA
Sulcorebutia crispata CA09  (none) AAAATAAAATAAATGTCCGATAGCATAGCA
Sulcorebutia canigueralii CA27  (none) -----AAAATAAATGTCCGATAGC-TAGCA
Sulcorebutia canigueralii CA103  (none) AAAATAAAATAAATGTCCGATAGCATAGCA
Sulcorebutia canigueralii CA104  (none) AAAATAAAATAAATGTCCGATAGCATAGCA
Sulcorebutia spec. CA99  (none) AAAATAAAATAAATGTCCGATAGCATAGCA
Weingartia neocumingii subsp. pulquinensis  (none) AAAATAAAATAAATGTCCGATAGCATAGCA
Weingartia neocumingii var. longigibba  (none) AAAATAAAATAAATGTCCGATAGCATAGCA
Weingartia neocumingii var. neocumingii  (none) AAAATAAAATAAATGTCCGATAGCATAGCA
Weingartia buiningiana  (none) ---ATAAAATAAATGTCCGATAGCATAGCA
Weingartia neocumingii var. hediniana  (none) -----AAAATAAATGTCCGATAGCATAGCA
Sulcorebutia steinbachii CA28  (none) -----AAAATCAATGTCCGATAGCA-AGCA
Sulcorebutia steinbachii CA29  (none) AAAATAAAATCAATGTCCGATAGCATAGCA
Sulcorebutia mentosa  (none) -----AAAATCAATGTCCGATAGCATAGCA
Sulcorebutia cardenasiana  (none) AAAATAAAATAAATGTCCGATAGCATAGCA
Sulcorebutia purpurea  (none) ------------------------------
Echinopsis pentlandii  (none) -----AAAATAAATGTCCGATAGC-TAGCA
Echinopsis tiegeliana  (none) ----TAAAATAAATGTCCGATAGC-TAGCA
Echinopsis cinnabarina  (none) -----AAAATAAATGTCCGATAGC-TAGCA
Echinopsis huotii  (none) ------------------------------
Echinopsis ancistrophora subsp. arachnacantha  (none) -----AAAATAAATGTCCGATAGC-TAGCA
Echinopsis schickendantzii  (none) ---------TAAATGTCCG--AGCAAAGCA
Echinopsis mamillosa  (none) A{AT}AATAAAATAAATGTCC--TAGCATA
Matucana aurantiaca  (none) -----AAAATAAATGTCCGATAGCATAGCA
Oroya peruviana  (none) -------------------ATAGC{CG}TA
Oreocereus celsianus  (none) AAAATAAAATAAATGTCCGATAGCATAGCA
Cleistocactus strausii  (none) -----AAAATAAATGTCCGATAGCATAGCA
Echinopsis mirabilis  (none) AAAATAAAATAAATGTCCGATAGCATAGCA
Denmoza rhodacantha  (none) AAAATAAAATAAATGTCCGATAGCATAGCA
Austrocactus philippii  (none) ------------------------------
Haageocereus pacalaensis  (none) AAA-TAAAATAAATGTCCGATAGCATAGCA
Samaipaticereus corroanus  (none) AAAATAAAATAAATGTCCGATAGCATAGCA
Espostoa lanata  (none) AAAATAAAATAAATGTCCGATAGCATAGCA
Espostoa ritteri  (none) AAAATAAAATAAATGTCCGATAGCATAGCA
Espostoa guentheri  (none) AAAATAAAATAAATGTCCGATAGCATAGCA
Weingartia fidaiana  (none) AAAATAAAATAAATGTCCGATAGCATAGCA
Weingartia westii  (none) -----AAAATAAA{GT}GTCCGATAGCATA
Sulcorebutia tarijensis  (none) AAAATAAAATAAATGTCCGATAGCATAGCA
Sulcorebutia steinbachii CA107  (none) AAAATAAAATCAATGTCCGATAGCATAGCA
Gymnocalycium rauschii  (none) ---------------------AG-ATAGCA
Gymnocalycium leptanthum  (none) ---------GAAATGTCCGATAGCATAGCA
Gymnocalycium andreae subsp. carolinense  (none) ----------AAATGTCCGATAGCATAGCA
Gymnocalycium paraguayense  (none) ----------AAATGTCCGATAGCATAGCA
Gymnocalycium carminanthum  (none) -------------TGTCCGATAGCATAGCA
Gymnocalycium anisitsii subsp. anisitsii  (none) AAATCAAAGTAAATTTCCAAGAG{AG}ATG
Gymnocalycium schickendantzii  (none) ------------------------------
Gymnocalycium bruchii  (none) -------------------ATAGCATAGCA
Gymnocalycium pflanzii subsp. argentinense  (none) -----AAAATAAATTTCCAAGAG-{AC}T-
Gymnocalycium pflanzii subsp. pflanzii  (none) CAAAGAAAAGAAATTTCCAAGAGCAT-GTG
Rauhocereus riosaniensis  (none) ---------TAAATGTCCGATAGCATAGCA
Rebutia pseudodeminuta  (none) ------------------------------
Rebutia fiebrigii  (none) -----------------------------A
Rebutia deminuta  (none) -----AAAATAAATGTCCG-TAGCATAGCA
Rebutia pygmaea CA08  (none) --------------------TA{AT}CATA
Rebutia steinmannii  (none) ------------------------------
Rebutia pygmaea CA93  (none) ------------------------------
Rebutia einsteinii  (none) AAAATAAAATAAATGTCCGATAGCATAGCA
Rebutia padcayensis  (none) -----------------------CATAACA
Rebutia minuscula  (none) AAAATAAAATAAATGTCCGATAGCATAGCA
Echinopsis atacamensis subsp. pasacana  (none) AAAATAAAATAAATGTCCGATAGCATAGCA
Coleocephalocereus fluminensis  (none) ---------------------AGCATAGCA
Uebelmannia pectinifera subsp. flavispina  (none) AAAATAAAATAAATGTCCGATAGCATAGCA
Copiapoa laui  (none) AAAATAAAATAAATGTCCGATAG-----AA
Espostoopsis dybowskii  (none) -AAATAAAATAAATGTCCGATAGCATAGCA
Cipocereus minensis  (none) AAAATAAAATAAATGTCCGATAGCATAGCA
Cereus hildemannianus  (none) AAAATAAAATAAATGTCCGATAGCATAGCA
Stetsonia coryne  (none) AAAATAAAATAAATGTCCGATAGTATAGCA
Sulcorebutia spec. CA101  (none) AAAATAAAATAAATGTCCGATAGCATAGCA
Neoraimondia arequipensis subsp. roseiflora  (none) ------------------------------
Neoraimondia herzogiana  (none) ------------------------------
Eriosyce napina  (none) ------------------------------
Browningia candelaris  (none) -----AAAATAAATGTCCGATAGCATAGCA
Browningia hertlingiana  (none) AAAATAAAATAAATGTCCGATAGCATAGC-
Yavia cryptocarpa  (none) A-AATCAAATAAAAGTCCGATAGCATAGCA
Parodia microsperma  (none) ------------------------------
Parodia magnifica  (none) ------------------GATAGCATAGCA
Micranthocereus auriazureus  (none) ------------------------------
Arrojadoa rhodantha CA83  (none) ------------------------------
Arrojadoa rhodantha CA38  (none) ------------------------------
Coleocephalocereus goebelianus  (none) AAAATAAAATAAATGTCCGATAGCATAGCA
Discocactus zehntneri subsp. boomianus  (none) -----AAAATAAATGTCCGATAGCATAGCA
Melocactus oreas  (none) AAAATAAAATAAATGTCCGATAGCATAGCA
Neowerdermannia vorwerkii  (none) AAAATAAAATAAAAGTCCGATAGCATAGCA

Columns

None of the columns has a description.