#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 25, 2024; 7:44 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Boatwright J., Savolainen V., Wyk B., Schutte-vlok A., Forest F., & Bank M. 2007. Systematic position of the anomolous genus Cadia and the phylogeny of the tribe Podalyrieae (Fabaceae). Systematic Botany, null. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S1933] BEGIN TAXA; TITLE High_level; DIMENSIONS NTAX=198; TAXLABELS Acosmium_panamense Adenocarpus_viscosus Aenictophyton_reconditum Amphithalea_alba Amphithalea_axillaris Amphithalea_biovulata Amphithalea_ciliaris Amphithalea_cuneifolia Amphithalea_dahlgrenii Amphithalea_ericifolia Amphithalea_flava Amphithalea_fourcadei Amphithalea_imbricata Amphithalea_intermedia Amphithalea_michrantha Amphithalea_monticola Amphithalea_muirii Amphithalea_muraltioides Amphithalea_obtusiloba Amphithalea_oppositifolia Amphithalea_pageae Amphithalea_parvifolia Amphithalea_phylicoides Amphithalea_rostrata Amphithalea_speciosa Amphithalea_spinosa Amphithalea_stokoei Amphithalea_tomentosa Amphithalea_tortilis Amphithalea_villosa Amphithalea_violacea Amphithalea_virgata Amphithalea_vlokii Amphithalea_williamsonii Anagyris_foetida Anarthrophyllum_cumingii Aotus_carinata Aotus_cordifolia Argyrocytisus_battandieri Argyrolobium_harmsianum Argyrolobium_lunare Aspalathus_cordata Aspalathus_corrudifolia Baphia_madagascariensis Baptisia_australis Baptisia_tinctoria Bolusanthus_speciosus Bossiaea_lenticularis Bossiaea_lonophylla Brongniartia_alamosana Cadia_commersoniana Cadia_pedicellata Cadia_pubescens Cadia_purpurea Calicotome_villosa Calpurnia_aurea Calpurnia_glabrata Calpurnia_intrusa Calpurnia_sericea Calpurnia_sericea_x_woodii Calpurnia_woodii Chorizema_aciculare Chorizema_varium Crotalaria_capensis Crotalaria_pallida Cyclolobium_nutans Cyclopia_alopecuroides Cyclopia_alpina Cyclopia_aurescens Cyclopia_bolusii Cyclopia_burtonii Cyclopia_falcata Cyclopia_galioides Cyclopia_genistoides Cyclopia_glabra Cyclopia_intermedia Cyclopia_longifolia Cyclopia_maculata Cyclopia_meyeriana Cyclopia_plicata Cyclopia_pubescens Cyclopia_sessiliflora Cyclopia_subternata Cytisophyllum_sessilifolium Daviesia_mimosoides Dichilus_strictus Diplotropis_martiussii Ecinospartum_boissieri Erinacea_anthyllis Genista_teretifolia Genista_tournefortii Goodia_latifolia Goodia_medicaginea Heperolaburnum_platycarpum Hovea_elliptica Hypocalyptus_colutioides Hypocalyptus_oxalidifolius Hypocalyptus_sophoroides Isotropis_foliosa Isotropis_forrestii Jacksonia_alata Jacksonia_macrocalyx Laburnum_anagyroides Lebeckia_sessilifolia Lebeckia_wrightii Leptosema_daviesioides Liparia_angustifolia Liparia_bonaespei Liparia_boucheri Liparia_calycina Liparia_capitata Liparia_confusa Liparia_congesta Liparia_genistoides Liparia_hirsuta Liparia_latifolia Liparia_myrtifolia Liparia_parva Liparia_racemosa Liparia_rafnioides Liparia_splendens_comantha Liparia_splendens_splendens Liparia_striata Liparia_umbellifera Liparia_vestita Lotononis_alpina Lotononis_laxa Lupinus_arcticus Lupinus_polyphyllus Maackia_amurensis Melolobium_adenodes Melolobium_candicans Mirbelia_longifolia Mirbelia_specosa Muelleranthus_trifoliolatus Nemcia_plicata Oxylobium_cordifolium Pearsonia_grandifolia Pearsonia_sessilifolia Petteria_ramentacea Pickeringia_montana Piptanthus_tomentosus Podalyria_argentea Podalyria_biflora Podalyria_burchelli Podalyria_buxifolia Podalyria_calyptrata Podalyria_canescens Podalyria_cordata Podalyria_cuneifolia Podalyria_hirsuta Podalyria_intermedia Podalyria_lanceolata Podalyria_leipoldtii Podalyria_microphylla Podalyria_myrtillifolia Podalyria_oleaefolia Podalyria_orbicularis Podalyria_pearsonii Podalyria_rotundifolia Podalyria_sericea Podalyria_speciosa Podalyria_variabilis Podolobium_aciculiferum Poecilanthe_falcata Polhillia_pallens Pultenaea_pedunculata Pultenaea_stipularis Rafnia_alata Rafnia_vlokii Retama_monosperma Retama_sphaerocarpa Sophora_tetraphylla Sophora_toromiro Spartium_junceum Sphaerolobium_minus Sphaerolobium_nudiflorum Stauracanthus_genistoides_genistoides Stirtonanthus_chrysanthus Stirtonanthus_insignis Stirtonanthus_taylorianus Styphnolobium_japonicum Templetonia_retusa Thermopsis_divaricarpa Thermopsis_montana Ulex_densus Ulex_parviflorus Virgilia_divaricata Virgilia_oroboides_ferruginea Virgilia_oroboides_oroboides Xiphotheca_canescens Xiphotheca_cordifolia Xiphotheca_elliptica Xiphotheca_guthriei Xiphotheca_lanceolata Xiphotheca_phylicoides Xiphotheca_reflexa Xiphotheca_tecta ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M2948] TITLE 'HighLevel_ITS'; LINK TAXA = High_level; DIMENSIONS NCHAR=788; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Anarthrophyllum_cumingii ???????????????????????TCG-AAGCC-T-CAC--AAGCA-GTG-CGACCCGGCG-AATTTGTTTG-ACT--ACTCA-GGGGTGG-CT----AGAGGTGT--TCGG-CACCTC-GG-----TCCCC----CTCGTGTTGGGAGG-----CGCCCC---ACCCTGTGCGG----TCTCCTCCT-GGCCCAA-TAAC---AAAACCCCGGCG--CCGAACGCGCC---AAGGAAATC--GAAA-TCGTTT-AGTGCGCC-CCCGTCGGCCC-GGAGACGGTC-CCC-GTG-CGGGCG-GCG--TTGCGACACGCGT------ATCC???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????ATCGTTGCCCC---TGTGCCTT-GGCCACGT-GGT-------AGGCACCGA---GC--GGGGCGGATGTTGGCTTCCCGCGA-GCAAC---GTCTCACGGTTGGTTGAAAA-CTGAGTC-CGCGGTGG--AGGG---CGCCGTGAT-GGAA-GGTGGCTGAG-TAAAA-------TCTCGAGACCGATCGT-GCGTGGTCACCCC-CACCAGCTTTGCG-ACT-CTGTGACCCATGGG---GGTCTGTTGG-----CCGCCT-AAGA-CGGGAACCTCAGG??? Aotus_carinata ??????????????????????????????????????????????ATG-CGACCC-GCG-AATTTGTTTC-TCT--ACCGA-GGGCGGG-TC-CCCGGGG-CG--CCGGA-CGCCTC-GGTCGGGCCTCC----CTCGTGCCGGGAGG-----TGCTC----GCCCCGTGCGGG---CGCCATCCC-AGCACAT-CAAC----AACCCCCGGCG--CGGAATGCGTC---AAGGAACTC--GAAT-TTGTTA-AGCGCGCT-CCCGCGGACCC-GGAGACGGTG-ATC-CTG-CGGGG--GCG--TCGCGGCGCATGAAA----A{AC}AT-------AAAATGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTTG-CATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAA-CGCAAGTTGCGCCCAAA-GCCATTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACACATCGTTGCCCC---AACGCCAA-TGCCATCCCCAA-------GGGCATCGG---CC--GGGGCGGAAGTTGGCTTCCCGTGA-GCTCC---GCCTCGCGGTTAGTTGAAAA-TCGAGAC-CGTGGCGG--AGGG---CACCACGAT-TAATTGGTGGATGAG-TGCG--------TCTCGAGACCAGTCGT-GCGTG-CCCCTCC---ACCGGCGACGG-GCT-CCGTGACCCACGCG---TGTCCTCGCG-----ACACTC-TTAA-CGAGA-CCTCAGGTCA Aotus_cordifolia ??????????????????????????????????????????????GTG-CGACCC-GTG-AATTTGTTTC-TCT--ACCGAGGGGCAGGGCC--CCGGGG-TG--CTTGA-CGCCTC-GGG----CCTCC----CTCGTGCCGGGAGG-----TGCTC----GCCTCGTGCGGG---TGCCATCCC-AGCTTA---AAC---ACAACCCCGGCG--CGGAATGCGTC---AAGGAACTC--GAAT-TTGTTA-AGTGCGCT-CCCGTGGACCC-GGAGACGGTG-CTC-TGG-CGGGG--GCG--TCGCGGCGCATGAAA----ACAT-------AAAATGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTTG-CATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAA-CGCAAGTTGCGCCCGAA-GCCATTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGTGTCACACATCGTTGCCCC---AACCCCAA-TGCCGTCT-CAA-------GGGCATCGA---GC--GGGGCGAATGTTGGCTTCCCGTGA-GCATC---GCCTCGCGGTTAGTCGAAAA-TCGAGTC-CGTGGCGG--AGGG---CACCACGAT-TACTTGGTGGATGAG-TTCA--------TCTCGAGACCAGTCGT-GCGTG-CCTCTCT---TTCGTGAGCGG-GCT-CCGTGACCCATGCG---TGTCCTTGCG-----ACACTC-TTAA-CGAGA-CCTCAGGTCA Argyrocytisus_battandieri ???????????????????????TCG-AAGCC-T-CAC--AAGCA-GTG-CGACCCCGTG-AATTTGTTT?-ACT--ACTC?-GGGGTGG-CT----AGAGGTGT--TCGG-CACCTC-GG-----TCCCC----CTCGTGTCGGGAGG-----CGCCCC---ACCCTGCGTGG----TCTCCTCCT-GGCCCAA-TAAC---AAAACCCCGGCG--CCGAACGCGCC---AAGGAAAGT--GAAA-TCGTTT-AGTGCGCC-CCCGTCGGC?CCGGAGACGGTG-ACC-GTG-CGGGTG-GCG--TTGCGACACGCGT------ATCC--------GAA???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CATCGTTGCCCC---CGTGCCTT-GGCCACGT-GCT-------AGGCACCGA---GC--GGGGCGAATGTTGGCTTCCCGTGA-GCAGC---GTCTCACGGTTGGTTGAAAA-CTGAGTC-CGCGGTGG--AGGG---CGCCGTGAT-GGAT-GGTGGCTGAG-TTAAA-------GCTCGAGACCGATCGT-GCGTG-TCACCCC-CACCAG?TTTGCG-ACT-CTGTGACCCATGGG----GTCTGTTGG-----CCGCCT-AAGA-CGGGA??????????? Argyrolobium_harmsianum ????????????????????????CG-AAGCC-T-CAC--AAGCA-GTG-CGACCCCGTG-AATTTGTTTT-ACT--ACTCA-AGGGTGG-CT----TGAGGTGT--TCTG-CACCTC-GG-----TCCCC----CTCGTGTCGGGAGG-----CGCCCC---ACACTGCGCGG----TCTCCTCCT-GGCCCAAATAAC---AAAACCCCGGCG--CCGAACGCGCC---AAGGAAATT--GAAA-TCGTTT-AGTGCGCC-CCCGTCGGCCC-GGAGACGGTG-CCC-GTG-CGGGTG-GCG--TTGCGACACGCGT------ATCC--------GAAAGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTTG-CATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAA-CGCAAGTTGCGCCCGAA-GCCATTAGGCTGAGGGCACGCCTGCCTGGGTGTTGCACATCGTTGCCCC---TGTGCCTT-GGCCACGT-GCT-------AGGCATCGA---TC--GGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGA-GCAAC---GTCTCACGGTTGGTTGAAAA-TTGAGTC-CGCGGTGG--AGGG---CGCCGTGAT-GGAT-GGTGGTTGAG-TAAAA--------------------------------------------------G-CCT-CTGTGACCCATGGG---GGTCTGTTGG-----CCGCCT?????????????????????? Argyrolobium_lunare ???????????????????????TCG-AAGCC-T-CAC--AAGCA-GTG-CGACCCCGTG-AATTTGTTTG-ACT--ACTCA-GGGGTGG-CT----AGAGGTGT--TTGG-CACCTC-GG-----TCCCC----CTCGTGTCGGGAGG-----TGCCGC---ACCCTGCGCAG----TCTCCTCCT-GGCCCAA-TAAC---AAAACCCCGGCG--CCGAACGCGCC---AAGGAAATT--GAAA-TCGTTT-AGTTCGCC-CCCGTCGGCCC-GGAGACGGTG-CCC-GTG-CGGGCG-GTG--TTTCGACACGTGT------ATAC--------GAAAGACTCTCGGCAACGGATATCTTGGCTCTTG-CATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAA-CGCAAGTTGCGCCCGAA-GCCATTAGGTTGAGGGCATGCCTGCCTGGGTGTTGCACATCGTTGCCCC---TCTGCCTT-GGCCATGT-GCT-------AGGCACCGA---GC--GGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCAA-GCAAC---GTCTCGCGGTTGGTTGAAAA-CTGAGTC-CGCGGTGG--AGGG---CGCCGTGAT-GGAT-GGTGGCTGAGATAAA--------GCTCGAGATCGATCGT-GCGTG-TCACCCC-CACCAGCTTTGCG-ACT-CTGTGACCCATGGG---GGTCTGTTGG-----CCGCCT?????????????????????? Aspalathus_cordata ???????????????????????TCG-AAGCC-T--AC--AAACA-GTG-T-ACCC-GTG-AATTTGTTTG-ACC--ACTCA-GGGGTGG-CC----AGAGGTGT--TCTG-CTCCTC-GG-----CCCCC----CTCGTGTCGGGAGG-----CTGCCCCC-ACCTTGTGTGG----TCTCCTCCT-GGCCGAC-TAAC---AAAACCCCGGCG--CCGAACGCGCC---AAGGAAATC--GAAA-TCGTTT-AGTGCGCC-CCCGTCGGCCC-GGAGACGGTG-CTT-GTG-CGGGCG-GTG--CTGCGACACGCGC------ATCT--------GAAAGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTTG-CATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAA-CGCAAGTTGCGCCCGAA-GCCATTAGGCTGAGGGCACGTCTGCCTGGGTGTCGCCCATCGTTGCCCC---AGTGCCCT-GGCCTTGC-GCT-------AGGCACCGA---GC--GGGGCGAGTGCTGGCTTCCCGTGA-GCAAC---GCCTCGCGGTTGGTTGAAAT-ATGAGTC-CGTGGTGG--AGGG---CGCCGTGAT-GGAT-GGTGGTTGAG-TAAAA-------GCTCGAGACCGATCGT-GCGTG-TCACCCC-CACCGGCTTTGCG-ACT-CTACGGCCCATGAG---CGTCTTTTGG-----TCGCCC?????????????????????? Aspalathus_corrudifolia ???????????????????????????????????????????????????GACCC-GTG-AATTTGTTTG-ACC--ACTCA-GGGGTGG-CC----AGAGGTGT--TCGG-CTCCTC-GG-----TCCCC----CTCGTGTCGGGAGG-----CTGCCCCC-ACCTTGTGTGG----TCTCCTCCT-GGCCGAA-TAAC---AAAACCCCGGCG--CCGAACGCGCC---AAGGAAATC--GAAA-TCGTTT-AGTGCGCC-CCCGTCGGCCC-GGAGACGGTG-CTT-GTG-CGGGCG-GTG--CTGCGACACGCGC------ATCT--------GAAAGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTTG-CATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAA-CGCAAGTTGCGCCCGAA-GCCATTA-GCTGAGGGCACGCCTGCCTGGGTGTCGCCCATCGTTGCCCC---AGTGCCCT-GGCCTCGC-GCT-------AGGCACCGA---GC--GGGGCGAGTGCTGGCTTCCCGTGA-GCAAC---GCCTCACGGTTGGTTGAAAA-CTGAGTC-CGTGGTGG--AGGG---CGCCGTGAT-GGAT-GGTGGTTGAG-TAAAA-------GCTCGAGACCGATCGT-GCGTG-TCACCCC-CACCGGCCTTGCG-ACT-CTATGGCCCATGAG---CGTCTGTTGG-----TCGCCC?????????????????????? Baphia_madagascariensis ?????????????????ACATTGTCG-ATGCC-T-CAC--AACCT-GAG-CAACCC-GTG-AACCTGTTT--ACCTATTTTC-GGGGCGA-CTT----GGGGTGC--TTGGCCACCTC-AA-----CCGCC-----TCGTGTTAAAGGGGGG--CGCGC------CTTGTGCCG----TCTCCTCTTGAACCGAA-CA-C----AAACCCCGGCG--CTGGATGCGCC---AAGGAATTC--TAAC-GCGTTT-GCTGCGCC-CCCGTCGGCCC-GGATGCGGTG-CCC-GCG-CGGGTG-GTG--TCGTGACAAATGAAA----ATTC-------AGAATGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTTG-CATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAA-CGCAAGTTGCGCCCGAA-GCCATTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGTGTCACACATCGTTCCCCC---AATGCCAA-TGCCGCGA-------------GCACTGA---GC--GGGGTGAGAGTTGGCTTCCCGTGG-GC-AC--GGTCCCGCGGTTAGTCGAAAA-TCGAGTC-CGTGGCGG--AGCAC-ATGCCACGAC-ATAT-GGTGGTTGAGATAAGA-------GCTCGACGCCGGTCGT-GCGCT-TGTCTCC--GTCGAACCTGGG-CTC-TGCGACCCCGTGCA-----TCTTCTGA-----TCGCCC-ATAA-CGAGA-CTC-AG-TCA Baptisia_australis ???????????????????????TCG-AAGCC-T-AAC-GACGCA-GTG-CGACCC-GCG-AATTTGTTTG-ACT--ACTAA-GGGGTGG-CT----AGTGGTGT--TCGG-CACCTC-GG-----TCCCC---CATTGTGTC-AGAGG-----AGCCCG---TCCTTGCGCGG----TCTCCTCCT-GGCCTTA-TAAC---AAAACCCCGGCG--CCGAACGCGCC---AAGGAAATC--AATA-TTGTCT-AGTGCGTC-CCCGTTGGCACCGGAGACGGTG-CCG-CTG-CGGGTG-GCG--CTGTGACACGCAT------ATCC--------CAAAGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTTG-CATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCGTTGAA-CGCAAGTTGCGCCCGAA-GCCATCAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGTGTCGCACATCGTTGCCCC--AAATGCCTC-GGCCTTGT-GCC-------AGGCTTCGA---GC--GGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGA-GCTAT---GTCTCACGGTTGGTTGAAAA-TTGAGTC-CGTGGTGG--AGGG---TGCCGCGAT-GCAT-GGTGGTTGAG-TAAAA-------GCTCGAGATCGATCGT-GCGCG-TCACCCC-TATCGGATTTGGG-CCT-CTGTGACCCATGAG---CGCCTGTTGG-----ATGCCC?????????????????????? Baptisia_tinctoria ???????????????????????TCA-AAGCC-T-AAC--AAGCA-GTG-CGACCC-GCG-AATTTGTTTG-ACT--ACTAA-GGGGTGG-CT----AGAGGTGT--TCGG-CACCTC-GG-----TACCC---CATTGTGTC-AGATG-----AGCCCG---TCCTTGTGCGG----TCTCCTCCT-GGCCTTA-TAAC---AAAACCCCGGCG--CCGAATGCGCC---AAGGAAATC--AAGA-TTGTCT-AGTGCGTC-CCCGTTGGC-CCGGAGACGGTG-CCG-CTG-CGGGTG-GCG--TTGTGACACGCAT------CTCC--------CAA???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CATCGTTGCCCC---AATGCCTC-AGCCTTGT-GCT-------AGGCATCGA---GC--GGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGA-GCTAT---GTCTCGCGGTTGGTTGAAAA-TTGAGTC-CGTGGTGG--AGGG---TGCCGCGAT-GGCT-GGTGGTTGAG-TAAAA-------GCTCGAGATCGATCGT-GCGCG-TCACCCC-TATCGGATTTGGG-ACT-CTGTGACCCATGAG----CTCTGTTGG-----TCGCCC?????????????????????? Bolusanthus_speciosus ???????????????????????CCG-AAGCC-T-CACG--AGCA-GCG-CGACCC-GCG-AACTTGTTTG-ACC--ACTCA--GGGTGG-CC----GGAGGTGT--TCGG-CACCCC-GG-----CCCCC----CTCGCGTCGGGAGG-----CGGCCA--TCCCTCGTGCGGCC--TCCCCTCCC-GGCCGAA-TAAC---AAAACCCCGGCG--CTGGATGCGCC---AAGGAAATC--GAAA-TCGTTG-AGTGCGCC-CCCGTCGGCCC-GGAGACGGTG-CCC-GTG-CGGGCG-GCG--TCGCGACACACGCGT----ATCC--------AAAAGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTTG-CATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAA-CGCAAGTTGCGCCCGAA-GCCATTAGGCGGAGGGCACGCCTGCCTGGGTGTCGCGCATCGTTGCCCC---CACGCCTT-GGCCTCGT-GCT----AGG---CATCGA---GC--GGGGCGAACGCTGGCTTCCCGCGA-GCAAC---GTCTCACGGTTGGTTGGAAA-TCGAGTC-CGTGGCGG--GGGA---TGCCGCGAT-GGAT-GGTGGTTGAG-TCCGA-------GCTCGAGACCGATCGT-GCGGG-T????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Bossiaea_lenticularis ???????????????????ATTGTCG-ATGCC-T-CAC--AAGCA-ATG-TGCCAT-GTG-AATATGTTTT-TCT--AGCAAAGGGTTGG-C----TTGTGGTG--TTTAG-CACCTC-AAA----CCCAA----AACATGTTGGGAGG-----TGCTC----ACCTAGTGTGG----TCTCCTCCT-AGCAAAA-CA-C----AAACCCCGGCG--CTGAATGCGTC---AAGGAACTT--AAGT-TTGTTT-AGTGCACT-CCCGTACACCC-GAACATGGTG-CTT-ATG-CGGG---TTGTGTTGTGACAT--GAAA----TTAT-------AAAATGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTTG-CATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAA-CGCAAGTTGCGCCTGAA-GCCTTTAGGCTGAGGGCACGCCTGCCTGGGTGTCACACATCGTTACCCT---TACTCCAA-TGCCTTTT-GTT-------AGGTATGGA---GC--AGGGTAAAGGTTGGCTTCCCATGA-GCA--TTTGTCTCGTGGTTAGTTAAAAT-TTGAGTT-TATGATGG--AGGG---TATCACGAT-AAAT-GGTGGTTGAG-T-ATG-------CCTCGAGACCAATCGT-GTACA-TCTCTTA---ATTTCTTTATGTACT-CTATCACCCATGTG---TGTCTGATAG-----ATACCC-ATAA-CGAGA-CCTCAGGTCA Bossiaea_lonophylla ???????????????????ATTGTCG-ATGCC-T-CAC--AAGCA-ATG-TGCAAT-GCG-GATATGTTTT-TCT--AGGCGAGGGTTGG-T----CTGTGGTG--TTTAA-CACCCC-AACAA--CCAA-----AACATGTTGGGAGC-----TGCTC----ACCTAGTGTGG----TCTCCTCCT-AGCAAAA-CA-C----AAACCCCGGCG--CTGAATGCGTC---AAGGAACTT--AAAT-TTGTTT-AGCGCGCT-CCCGTACACCC-GAACACGGTG-CTT-GTG-CGGG---GTGTGTTGTGGCAT--GAAA----CTAT-------AAAATGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTTG-CATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAA-CGCAAGTTGCGCCTGAA-GCCTTTAGGCTGAGGGCACGCCTGCCTGGGTGTCACACATCGTTTCCCT---ATTTTCAA-CGCCTTTT-GTT-------AGGTATGGA---GG--AGGGTAAATGTTGGCTTCCCATGA-GCG--TCTGTCTCGTGGTTAGTTGAAAA-TTGAGTT-TAAGATGG--AGGG---TATCACGAT-AAAT-GGTGGTTGAG-TTATG-------CCTCGAGACCAATCGT-GTACA-TCTCTTA---ATTTCTTTG--TACT-CTGTCCCCCATGCG---TGTCCAATGG-----ATACCC-ATAA-CGAGA-CCTCAGGTCA Brongniartia_alamosana ??????????????????CATTGTCG-ATGCC-T-CAC--AAGCA-GTG-CGACTC-GCG-AATTTGTTTG-ACT--TGATT-GGGGCGGGC-----AGGGGTGC--TCGA-CACCTC-GG-----CCCCC----CCGGTGCTGGGAGG-----CGCTT----GCCTAGTGCGG----TCTCCTCCC-GGCAAA--CAAC----CAACCCCGGCG--CAGAATGCGCC---AAGGAACTA--GAAA-TCGTTC-GGTGCGCC-CCTGTCGGCCC-GGAGACGGTG-CCC-GCG-CGGGG--GCG--TTGCGACA--CGAA-----TTCC-------AAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCG-CATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAA-CGCAAGTTGCGCCCGAA-GCCATTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGTGTCGCACATCGTTGCCCC---ATTCCCGG-CGCCTGC------------GGGCACCGG---GC--GTGGCGAATGCTGGCTTCCCGGGA-GCACC---GTCTCGCGGTTGGCTGAAAG-TCGAGCC-CGTGGTGG--AGTG---CACCGCGAC-GGAT-GGTGGTTGAG-GGA---------ACTCGAGACCAGTCGC-GCGCG-TCGGCC---TCCCCGTCTCGG-ACT-CTGTGACCCACGAG---CGG-ATTCGG-----TCGCCC-ACAA-CGGGA-CCTCAGGTCA Cadia_commersoniana TGAACCTGCGG-AAGGATCATTGTCG-AAGCC-T-CAC--GAGCA-GAG-CGACCC-GCG-AATACGTTTG-ACT--ACTCG-GGGGCGG-CT----AGAGGCGTG-TTCCACACCTCTGG-----TCCCC----CTTGTGTCGGGAGG-----CGCCGCTGCA-CGGCCGTG-------TCGTCCT-GACCGAA-TAAC---AAAACCCCGGCG--CCGAACGCGCC---AAGGAAATC--GAAA-TCGTTT-AGTGCGCCACCCGTCGGCTC-GGGGACGGTG-CTC-GTG-CGGGTG-GTG--TCGCGACACTAGT????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 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Calicotome_villosa ???????????????????????TCG-AAGCC-T-CAC--AAGCA-GTG-CGACCCTGTG-AATTTGTTTG-ACT--ACTCG-GGGGTGG-CT----AGAGGTGT--TCGG-CACCAC-GG-----TCCCC----CTCTTGCCAGGAGG-----TGT-AC---ACCCTGTGTGA----TCCCCTCCT-GGCCAAA-TAAC---AAAACCCCGGCG--CCGAACGCGCC---AAGGAAAAT--GAAA-TCGTTT-AGTGCGCC-CCCGTCGGCTC-GGAGACGGTG-CCA-GTA-CGGGCG-GCG--TTGCGACACGCGT------ATCT--------GAA????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????ATCGTTGCCCC---AATGCCTT-GGCCACGT-GCT-------AGACATTGA---GT--GGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGA-GTATC---GTCTCACGGTTGGTTGAAAA-CTGAGTC-TGTGGTGG--AGGT---CGCCGTGAT-GGAT-GGTGGCTGAG-TTAAA-------GCTCGAGACCGATCGT-GCGTG-TGACCCC-CACCAGATTTGTG-ACT-CTGTGACCCATGGG----GTCTGTTGG-----CCGCCT-AAGA-CGGGA??????????? 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Diplotropis_martiussii ???????????????????????????????C-T-CAC--AAGCA-ACG-CGACTC-GTG-AATCTGTTTG-ACT--GCCTG-GGGGCGT-CA----GGGGGTGT--TCTG-CACCAT-GG---CCCCTCG----CTCGTGCTGGGAGG-----CACCC----GCCTCGCGCGG----ACTCCTCCT-GGCCGAG-CAACTTGAAAACCCCGGCG--CCGAATGCGCC---AAGGAAATC--GAAA-TCGTTT-AGCGCGCC-CACGTCGGCCC-GGAGACGGTG---------CGGGTG-GCG---CGTCGCGA----------ATCC-------AATATGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCG-CATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAA-CGCAAGTTGCGCCCGAA-GCCATTAGGCTGAGGGCACGCCTGCCTGGGTGTCGCACATTGTTGCCCC---AATGCCGG-TGCCTCGC-GCT---GAGGGGGCATCGA---GC--GGGGCGAGCGTTGGCTTCCCGTGA-GCGTC---GTCTCGCGGTTGGTTGAAAAATCGAGCC-CGTGGTGC--GGAGCG-CACCGCGAT-AGAC-GGTGGTTGAG-CAAAAA------GCTCGAGACCAGTCGT-GCGTG-TCAGCCC--ACCGACCTCGGG-ACT-CTGTTACCCACGAG---CGCCGATTGG---TCGCGCCC?????????????????????? 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Erinacea_anthyllis ???????????????????????TCG-AAGCC-T-CAC--AAGCA-ATG-CGACCCCGTG-AATTTGTTTA-ACT--ACTTA-GGGGTGG-CT----AGAGGTGT--TCGG-CACCTC-GG-----TCCCC----CTCATGTCGGGAGG-----TGCCTC---ACCCTACGTGG----TCTCCTCCT-GGCCCAA-TAAC---AAAACCCCGGCG--CCGAACGCGCC---AAGGAAATT--GAAA-TCGTTT-AGTGCGCC-CCCGTCGGCCC-GGAGACGGTCGCC--GTG-CGGGTG-GTG--TTGCGACACGCGT------ATCT--------TAA???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CATCGTTGCCCC---TGTGCCTT-TGCCACGC-GCT-------AGGCACCGA---GC--GGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGA-GCAGT---GTCTCACGGTTGGTTGAAAA-CTGAGTC-CGTGGTGG--AGGG---CGCCGTGAT-GGAT-GGTGGCTGAG-TTAAA-------GCTCGAGACCGATCGT-GCGTG-TCACCCC-CACCAGCTTTGCG-ACT-CTGTGACCCAAGGG----GTCTGTTGG-----CCTCCT-AAGA-CGGGA??????????? 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Genista_tournefortii ???????????????????????TCG-AAGCC-T-CAC--AAGCA-GTG-CAACCCAGTG-AATTTGTTTG-ACT--ACTCA-GGGGTGG-CT----ATAGATGT--TTGG--ACCTT-GG-----TCCCC----CTTGTGTCAGGAGT-----TGCCC----ACCTTGCGTGG----TCTCGTCCT-GGCCAAA-TAAC---AAAACCCCGGCG--CCGAACGCGCC---AAGGAAATT--GAAA-TCGTAT-AGTGCACC-CCCG-CGGCCC-GGAGACGGTG-CCC-GTG-CGGGTG-GTG--TTGCGACACGCGT------ATCT--------GAAAGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTTG-CATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAA-CGCAAGTTGCGCCCGAA-GCCATTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGTGTTGCACATCGTTGTCCC---TGTGACTT-GGCCACGT-GCT-------AGGCACCAA---GC--GGGGCGAATGTTGGCTTCCCGTGA-GCAAC---GTCTCACGGTTGGTTGAAAA-CTGAGTC-CGCGGTGG--AGGG---CACCGTGAT-GGAT-GGTGGCTGAG-TTAAG-------TCTCGAGACCGATCGT-GCGTG-TCACCCC-CACCAGCTTTGTG-ACT-CTGTGACCCATGGG---GGTCTGTT??????????????????????????????????? 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Lupinus_arcticus ???????????????????????TCG-AAGCC-T-CAC--AAGCA-GTG-CGACCCCGTG-AATTTGTTTT-ACT--ACTCA-GGGGTGG-CT----AGAGGTGT--TTGG-CACCTC-GG-----TCCCC----CTCGTGTCAGGAGG-----CGCCAC---ATCCTGTGCGG----TCTCCTCCT-GGCCTAA-TAAC---AAAACCCCGGCG--CCGAACGCGCC---AAGGAAATT--GAAA-TCGTTT-AGTTCGCC-CCCGTCGGCACCGGAGACGGTG-CTC-GTG-CGGGCG-GCG--TTGCGACACGCTT------ATCC--------TAAAGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTTG-CATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAA-CGCAAGTTGCGCCCGAA-GCCATTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGTGTTGCACATCGTTGCCCC---TGTGCCTT-GGCCACGT-GCC-------AGGCACCAA---GC--GGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGA-GCAAT---GTCTCACGGTTGGTTGAAAA-CTGAGTC-CGCGGTGG--AGGG---CGCCGTGAT-GGAT-GGTGGCTGAG-TTAAA-------GCTCGAGACCGATCGT-GCGTG-TCACCCC-CACCAGCTTTGCG-ACT-CTTTGACCCATGGG---GGTCTGTTGG-----CCTTCT?????????????????????? Lupinus_polyphyllus ???????????????????????TCG-AAGCC-T-CAC--AAGCA-GTG-CGACCCCGTG-AATTTGTTTT-ACT--ACTCA-GGGGTGG-CT----AGAGGTGT--TTGG-CACCTC-GG-----TCCCC----CTCGTGTCAGGAGG-----CGCCAC---ATCCTGTGCGG----TCTCCTCCT-GGCCTAA-TAAC---AAAACCCCGGCG--CCGAACGCGCC---AAGGAAATT--TAAA-TCGTTT-AGTTCGCC-CCCGTCGGCACCGGAGACGGTG-CTC-GTG-CGGGCG-GCG--TTGCGACACGCTT------ATCC--------TAAAGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTTG-CATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAA-CGCAAGTTGCGCCCGAA-GCCATTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGTGTTGCACATCGTTGCCCC---CGTGCCTT-GGCCACGT-GCC-------AGGCACCAA---GC--GGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGA-GCAAT---GTCTCACGGTTGGTTGAAAA-CTGAGTC-CGCGGTGG--AGGG---CGCCGTGAT-GGAT-GGTGGCTGAG-TTAAA-------GCTCGAGACCGATCGT-GCGTG-TCACCCC-CACCAGCTTTGCG-ACT-CTTTGACCCATGGG---GGTCTGTTGG-----CCTTCT?????????????????????? Maackia_amurensis ???????????????????????TCG-AAGCC-T-CACG-ATCCA-G-G-CGACCC-GCG-AATTTGTTTT-ACC--ACTC--GGGGCGG-CG----AGAGGCGT--TTCG-CGCCTC-GG-----TCCCC----CTAGTGTC-GGAGG-----CGCCCG---TTCTCGTGCGG----GCTCCTCTT-GGCCTAA-TAAC---AAAACCCCGGCG--TTGAATGCGCC---AAGGAAATC--GAGA-TCGTCT-AGTGCGCC-CCCGTCGGCCC-GGGGACGGTG-CTT-GTG-CGGGGG-ACG--TCGTGACA--CGCGT----ATCC---------AAA??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CACCGTTGCCCC---AATGCCCG-AGCCTCGT-GTC-------GGGCACCGA---GC--AGGGCGAATGTTGGCTTCCCGGGA-GCAAG---GTCTCACGGTTGGTTGAAAA-TTGAGCC-TGTGGTGG--AGGA---CGCCGCGAT-GGAC-GGTGGTTGAT-TTAAA-------TCTCGAGACCG-TTGT-GCGCG-TCACCCC-TACCGGATTTGGG-ACT-CTGTGACCCATGTG----AGCGGCCGG-----TCGCC??????????????????????? Melolobium_adenodes ???????????????????????TCG-AAGCC-T-CAC--GAGCA-GTG-CGACCC-GCG-AATTTGTTTG-ACT--ACTCA-GGGGTGG-CT----AGAGGTGT--TCGG-CACCTC-GG-----TCCCC----CTCGTGTCGGGAGG-----CGACCC---ACCCTGTGCGG----TCTCCTCCT-GGCCGAA-TAAC---AAAACCCCGGCG--CCGAACGCGCC---AAGGAAATC--GAGA-TCGTTT-AGTGCGCC-CCCGTCGGCCC-GGAGAAGGTG-GCC-GTG-CGGGCG-GCG--TTGCGACACGCTT------ATCC--------GGAAGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTTG-CATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAA-CGCAAGTTGCGCCCGAA-GCCATTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGTGTTGCACATCGTTGCCCT---AGTGCCTT-GGCCTCGC-GCT-------AGGCACCGA---GT--GTGGTGAATGTTGGCTTCCCGTGA-GCAAC---GTCTCACGGTTGGTTGAAAA-TTGAGTC-CGTGGTGG--AGGG---TGCCATGAT-AGAT-GGTGGCTGAG-TGAGTG--AAAAGCTCGAGACCGATCGT-GCGTG-TCACCCC-CACCGGCTTTGCG-ACT-CTGTGACCCATGGG---CGTCTGTTGG-----TCGCCC?????????????????????? Melolobium_candicans ???????????????????????TCG-AAGCC-T-CAC--GAGCA-GTG-CGACCC-GCG-AATTTGTTTG-ACT--ACTCA-AGGGTGG-CT----AGAGGTGT--TCGG-CACCTC-GG-----TCCCC----CTTGTGTCGGGAGG-----CAACCC---ACCCTGTGCGG----TCTTCTCCT-GGCCGAA-TAAC---AAAACCCCGGCG--CCGAACGCGCC---AAGGAAATC--GAGA-TCGTTT-AGTGCGCC-CCCGTCGGCCC-GGAGACGATG-GCC-GTG-CGGGCG-GCG--TTGCGACACGCTT------ATCC--------GAAAGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTTG-CATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAA-CGCAAGTTGCGCCCGAA-GCCATTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGTGTTGCACATCGTTGCCCT---AGTGCCTT-GGCCTCGC-GCT-------AGGCACCGA---GC--GTGGTGAATGTTGGCTTCCCGTGA-GCAAC---GTCTCACGGTTGGTTGAAAA-TTGAGTC-CGTGGTGG--AGGG---TGCCATGAT-AGAT-GGTGGCTGAG-TGAAAA------GCTCGAGACCGATCGT-GCGTG-TCACCCC-CACCGGCTTTGCG-ACT-CTGTGACCCATGGG---CGTCTGTTGG-----TCGCCC?????????????????????? Mirbelia_longifolia ??????????????????????????????????????????????GAT-TGACCC-GTG-AATTTGTTTC-TCT--TTCGG-GGGCAGG-CT---CGGGGGTG--CTCGA-CACCTC-GGA----CCTCC----CTCGTGTTGGAAGA-----CACTC----GCCCCGTGCGAG---TGCCATCCC-AGCTAAA-CA-C----AAACCCCGGCG--CGGAATGCGCC---AAGGAACTC--GAAT-TGGCTA-AGTGCGCT-CCCGCGGACCC-GGAGACGGTG-CTC-TTG-TGGGG--GCG--TCGCGATGCATGGAA----ATAT-------AAAATGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTTG-CATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAA-CGCAAGTTGCGCCCAAA-GCCATTAGGCTGAGGGCACGCCTGCCTGGGTGTCACACATCGTTGCCCC---AATGCCCA-TGCCATTT-CAC-----ATGGTCATGGA---GC--TGGGCGAATGTTGGCTTCCCGTGA-GCGCA---GCCTCGCGGTTAGTTGAAAA-TCGAGTC-CGTGGTGG--AGCG---TACCACGAT-TAATTGGTGGATGAG-TGAA--------TCTCGAGACCAATCGT-GTGTG-CAAATCT---GTCGCGAACGG-ACC-CGGTGACCCACGCG---TGTCGTTATG-----ACACCC-TTAA-CGAGA-CCTCAGGTCA Mirbelia_specosa ???????????????????ATTGACG-ATGCC-T-CAC--AAGCA-GTG-CGACCC-GTG-AATTTGTTTC-TCT--ACCGA-GGGCAGG-CT---CGGGGGTG--CTCGA-CACCTC-AAA----CCTCC----CTTGTGCCGGGAGG-----TGCTC----TCCCCGTGAGGG---TGCCATCCC-AGCTAAA-CA-C----AATCCCCGGCG--CGGAATGCGTC---AAGGAACTC--GAAT-TTGTTA-AGTGCGCT-CCCGCGGACCC-GGAGACGGTG-CTC-TTG-CGGGG--GCG--TCGCGATGCATGAAA----ATAC-------AAAATGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTTG-CATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAA-CGCAAGTTGCGCCCAAA-GCCGTTAGGCTGAGGGCACGCCTGCCTGGGTGTCACACATCGTTGCCCC---AATGCCAA-TGCCATTT-CAC------AGG-CATTGA---GC--GGGGCGAATGTTGGCTTCCCGTGA-GCGAT---GTCTCGCGGTTAGTTGAAAA-TTGAGCT-CGTGGTGG--AGGG---CACCGCGAT-TAATTGGTGGATGAG-TGTA--------TCTCGAGACCAATCGT-GCGTG-CCCCTCC---TCCGTGATCGG-GCT-TTGCGACCCATGCG---TGCCTTGAGG-----GCACCC-TTAA-CGAGA-CCTCAGGTCA Muelleranthus_trifoliolatus ????????????AAGGATCATTGTCG-ATGCC-T-TAA--AAGCA-GCT-TGACTT-GTG-AATTAGTTTA-TCC--ACTAA-GGGTTGTAT------G-GGTG--TTTAA-CACCTC-TA-----CCTCC----CTTGTGCTGGGAGG--TGCTTGCC-------TAGTGTGA----TCTCCTCCA-AGCAAAA----C---AAACCCCCGGCG--CTAAATGCGTC---AAGGAACTC--TAAC-TTGTCT-AGTGCGCT-CCGTTAGACCC-AGAAATGGTG-CTC-ACGATGGA--TGCG--TTGCGACACATGAAA----ATAT--------AAATGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTTG-CATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAA-CGCAAGTTGCGCCTGAA-GCCATTAGGCTGAAGGCACGCCTGCCTGGGTGTCACACATCGTTGCCCT---ATATTCATATGCCTTT--ACT------TAGGTATTTT---GT--GGGGTGAATGTTGGCTTCCCATGA-GCA--TTTGTCTCGTGGTTAGTTGAAAA-TTGAGTC-CATGGTGG--AGGA---TACCATGAT-ATAT-GGTGGTTGAG-TTAA--------CCTCGAGGCCAATCAT-AGGTG-TCTCTTT---GTTTGTTTGGA--CT-CTAT-ACCCATGTG---TGTCCTATAG-----ATACTC-ATAA-CGAGA-CCTCAGGTCA Nemcia_plicata ???????????????????ATTGTCG-ATGCC-T-CAC--AAGCA-GTG-CGACCC-GTG-AATTTGTTTC-TCT--ACCGG-GGGCAGG-AC---CGGGGGTG--CTCGG-CACCTC-AGG----CCTCC----CTTGTGCTGGGAGG-----CGCTC----GCCCCGTGCGGG---TGCGATCCC-AGCTAAA-CA-C----AATCCCCGGCG--CGGAATGCGCC---AAGGAACTC--GAAC-TTGTTA-AGCGCGCT-CCAGCGGACCC-GGAGACGGTG-CTC-TTG-CGGGG--GCG--ACGCGATGCATGGAA----ATAT-------AAAATGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTTG-CATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAA-CGCAAGTTGCGCCCGAA-GCCATTAGGCTGAGGGCACGCCTGCCTGGGTGTCACACATCGTTGCCCC---AACGCCAA-TGCCATTT-CAC-------GGGCATCGA---GC--GGGGCGAATGTTGGCTTCCCGTGA-GCACT---GCCTCGCGGTTAGTTGAAAA-TCGAGTC-CGTGGTGG--AGCG---CGCCACGGT-TAATTGGTGGATGAG-TGTA--------CCTCGAGACCAACCGT-GCGCG-CGCCTCC-CTACCGTGATCGG-GCT-CCGTGACCCACGCG---TGTCGTCATG-----ACACCC-TTAA-CGAGA-CCTCAGGTCA Oxylobium_cordifolium ???????????????????ATTGTCG-ATGCC-T-CAC--AAGAA-GTG-CGACCC-GTG-AACTTGTTTC-TCT--ACCGA-GGGTAGG-CT---CGGGGGTG--CTCGA-CACCTC-AGA----CCTCT----CTTGTGCCGGGAGG-----TGCTC----TCCTCGTGAGGG---TGCCATCCC-AGCTAA--CA-C----AAACCCCGGCG--CGGAATGCGTC---AAGGAACTC--GAAT-TTGTTA-AGTGCGCT-CCCGTGGACCC-GGAGACGGTG-CTC-TTG-CGGGG--GTG--TTGCGACGCATGAAA----ATAT-------AAAATGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTTG-CATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAA-CGCAAGTTGCGCCCAAA-GCCATTAGGCTGAGGGCACGCCTGCCTGGGTGTCACACATCGTTGCCCC---AATGCCAA-TGCCATTC-CAC-------GGGCATCGA---GC--GGGGCGAATGTTGGCTTCCCGTGA-GCATT---GCCTCGCGGTTAGTTGAAAA-TTGAGTC-TGTGGTGG--AGAA---CACCACGAT-TAATTGGTGGATGAG-TGTA--------TCTCGAGACCAATCGT-GCGTG-CCTCTCT---TCCGTTATCGG-GCT-TCGAGACCCATGCG---TGTCGTCACG-----ACACTC-TTAA-CGAGA-CCTCAGGTCA Pearsonia_grandifolia ???????????????????????CCG-AAGCC-T-CAC--AAGCA-GTG-CGACCT-GTG-AATTTGTTTG-ACA---CTTA-GGGGTGG-CT--------------------ACCTC-GG-----TCCCC----CTCGTGTCGGGAGG-----CTCCCCGC-ACCTTGTGTGG----TCTCCTCCT-GGCCGAT-TAAC---AAAACCCCGGCG--CCGAACGCGCC---AAGGAAATC--AAAA-TCGTTT-AGTGCACC-CCCGTCGGCCC-GGAGACGGTG-CTT-GTG-CGGGCT-GTG--TTGCGACACGCGT------ATCC--------GAAAGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTTG-CATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAA-CGCAAGTTGCGCCCGAA-GCCATTAGGCTGAGGGCACGCCTGC-TGGGTGTCGCCCATCGTTGCCCC---AGTGCCTT-GGCCTCGT-GCC------AAGGCACCGA---GC--GGGGCGAATGCTGGCTTCCCGTGA-GCAAT---GCCTCACGGTTGGTTGAAAA-CTGAGTA-CGTGGTGG--TGGG---TGCCGTGAT-GGAT-GGTGGATGAG-TAAAA-------GCTCGAGACCTATCGT-GCGTG-TCACCCC-CACCGGCTTTGCG-GCT-CTATGGCCCATGAG---CGTGTGTTGG-----TCGCCC?????????????????????? Pearsonia_sessilifolia ???????????????????????CCG-AAGCC-T-CAC--AAGCA-GTG-CGACCT-GTG-AATTTGTTTG-ACA--ACTTA-GGGGTGG-CT--------------------ACCTC-GG-----TCCCC----CTCGTGTCGGGAGG-----CTCCCCGC-ACCTTGTGTGG----TCTCCTCCT-GGCCGAA-TAAC---AAAACCCCGGCG--CCGAACGCGCC---AAGGAAAGC--AAAA-TCGTTT-AGTGCACC-CCCGTCGGCCC-GGAGACGGTG-CTT-GTG-CGGGCG-GTG--TTGCGACACGCGT------ATCC--------GAAAGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTTG-CATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAA-CGCAAGTTGCGCCCGAA-GCCATTAGGCTGAGGGCACGCCTGCCTGGGTGTCGCCCATCGTTGCCCC---AGTGCCTC-GGCCTCGT-GCT-------AGGCACCGA---TC--GGGGCGAATGCTGGCTTCCCGTGA-GCAAT---GCCTCACGGTTGGTTGAAAA-CTGAGTA-CGTGGTGG--AGGG---TGCCGTGAT-GGAT-GGTGGATGAG-TAAAA-------GCTCGAGACCTATCGT-GCGTG-TCACCCC-CACCGGCTTTGCG-ACT-CTATGGCCCATGAG---CGTGTGTTGG-----TCGCC??????????????????????? Petteria_ramentacea ???????????????????????TCG-AAGCC-T-CAC--AAGCA-GTG-CGACCCCGTG-AATTTGTTTG-ACT--ACTCA-GGGGTGG-CT----AGTGGTGT--TCGT-CACCTC-GG-----TCCCC----CTCATGTCGGGAGG-----CGCCCC---ACCCTGCGTGG----TCTCCTCCT-GGCCCAA-TAAC---AAAACCCCGGCG--CCGAACGCGCC---AAGGAAATT--GAAA-TCGTCT-AGTGCGCC-CTCGTCGGCCC-GGAGACGGTG-CCC-GTG-CTGGTG-GCG--TTGCGACACGTGT------ATCC--------GAA???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CATCGTTGCCCC---TGTGCCTT-GGCCATGT-GCT-------AGGCACCGA---GC--GGGGTGAATGTTGGCTTCCCGCGA-GCAAC---GTCTCACGGTTGGTTGAAAA-CTGAGTC-CGCGGTGG--AGGG---CGCCGTGAT-GGAT-GGTGGCTGAG-TTAAA-------GCTCGAGACTGATCGT-GCGTG-TCACCCC-CACCAGCTTTGCG-ACT-CTGTGACCCATGGG----GTCTGTTGG-----CCGCCT-AAGA-CGGGA??????????? Pickeringia_montana ???????????????????????TCG-ATGCC-T-TAC--AAGCA-ATA-CGACCC-GTG-AATTTGTTTG-ACT--ACTG--GGGC-GG-TT---CAGGG-TG--TTTAA-CACCTC-AA-----GCCCC----CT--TGTCGGGAGG-----CGACC----AACCCGTGTGG----TCTCCTTCT-GGCAAA--CAAC----AAACCCCGGCG--CCAAATGCGCC---AAGGAACTC--TAAA-TTGTTT-AGTGCGCT-CCCGTCGGCCC-GGAGACGGTG-CTC-GTG-CGGTGG-GCG--ATGCGACATATGTT-----ATCT-------AAAATGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTTG-CATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAA-CGCAAGTTGCGCCCGAA-GCCATTAGGTTGAGGGCACGCCTGCCTGGGTGTCACACATCGTTGCCCC---AATGCCAG-TGCCTC-TTGT--------AGG--TCCTGA-GC--GGGGCGAATGTTGGCTTCCCGTGA-GCCTC---GTCTTGCGGTTGGTCGAAAA-TTGAGTC-CATGGTGG--AGAG---CACCATGAT-AGAT-GGTGGTTGAG-TTAAA-------TCTCGAGACCAATCGC-GCGTG-TCTCTTC---GCTGGGTTAGG-GCT-TTGTGACCCAGGAG---CATCATATGA-----TCGCCC-ATAA-CGGGA-C????????? 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Retama_monosperma ???????????????????????TCG-AA-CC-T-CAA--AAGCA-GCG-TGACCCTGTG-AATTTGTTTG-AAT--ACTCA-GGGGTGG-CT----AGAGGTGT--TCTG-CATCTC-GG-----TCCCC----CTCGTGTCGGGAGG-----TGCCCCC--ACCTTGTGTGG----TCTCCTCCT-GGCCCAA-TAAC---AAAACCCCGGCG--CCGAACGCGCC---AAGGAAAAT--GAAA-TCGTTT-AGTACGCC-CCTGTCGGCCC-GGAGACGGTG-ACC-GTG-CGGGCG-GTG--TTGCGACACGTAT------ATCC--------TAAAGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTTG-CATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAA-CGCAAGTTGCGCCCGAA-GCCATTAGGCTGAGGGCACGCCTGCCTGGGTGTTGCACATCGTTGCCCC---TTTGCCTT-GGCCATGT-GCT-------AGGCATCGA---GC--GGGGCGAATGTTGGCTTCCCGTGA-GCAGC---GTCTCACGGTTGGTTCAAAA-CTGAGTC-CGCGGTGT--AGGG---CACCGTGAT-GGAT-GGTGGTTGAG-TTAAA-------GCTCGAGACCGATCGT-GCGTG-TCACCCC-CACCAGCTTTGCG-ACT--CGTGACCCATG???????????????????????????????????????????????? Retama_sphaerocarpa ???????????????????????TCG-AA-CC-T-CAC--AAGCA-GTG-TGACCCTGTG-AATTTGTTTG-ACT--ACTCAGGGGGTGG-AT----AGAGGTGT--TCGG-CATCTC-GG-----TCCCC----CTCGCGTCGGGAGG-----CGCCCCC--ACATTGTGAGG----TCTCCTCCT-GACCCAA-TAAC---AAAACCCCGGCG--CCGAACGCGCC---AAGGAAATT--GAAA-TCGTTT-AGTACGCC-CCCGTCGGCCC-GGAGACGGTG-ACC-GTG-CGGGCG-GCG--TTGCGACACGCGT------ATCC--------TAAAGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTTG-CATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAA-CGCAAGTTGCGCCCGAA-GCCATTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGTGTTGCACATCGTTGCCCC---TGTGCGTT-GGCCATGT-GCC-------AGGCACCGA---GC--GGGGCGAATGTTGGCTTCCCGTGA-GCAGC---GTCTCACGGTTGGTTGAAAA-CTGAGTC-CGCGGTGG--AGGG---CACCGTGAT-GGAT-GGTGGCTGAG-TTAAA-------GCTCGAGACCGATCGT-GCGTG-TCACCCC-CACCAGCTTTGGA-ATC--TGTGACCCATG???????????????????????????????????????????????? Sophora_tetraphylla ???????????????????????TCG-AATCC-T-CAC-AAAGAA-GTG-CGACCC-GTG-AATTTTGTTG-ACT--CCTCG-GGTGTGG-CTT----GAGGTGC--ATGG-CGCCTC-GG-----TCCCC----CTAGTGTTGGGAGG-----TGCCC----TCCTCGTGCGG----GCCCCTCCT-GGCCCAT-TAAC---AAAACCCCGGCG--CCGAATGCGCC---AAGGAAATC--GAGA-TTGTCT-AGCACGCC-CCCGTCGG-TC-GGAGACGATG-ACT-GTG-TGG-TG-GCG--TTGCGACACGTGT------ATCC--------AAAAGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTTG-CATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAA-CGCAAGTTGCGCCCGAA-GCCATTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGTGTCGCACATCGTTGCCCC---AATGCCTC-AGCCCTGTTGCT-------AGGCTTAGT--AAA--GGGGTGAATGTTGGCTTCCCGTGA-GCGAT---GCCTCACGGTTGGCTGAAAA-TTGAGTC-CGTGGTGG--AGTG---CGCCGCGAT-GGAT-GGTGGTTGAG-TAAAA-------GCTCGAGACCGATCGT-GTGTG-TCACCCC-TACCGGATTTGGG-ACT-CTTTGACCCATGAG---CGGCCGTTGG-----CTGCCC?????????????????????? Sophora_toromiro ???????????????????????TCG-AATCC-T-CAC-AAAGAA-GTG-CGACCC-GTG-AATTTGTTTG-ACT--CCTCG-GGTGTGG-CTT----GAGGTGC--ATGG-CGCCTC-GG-----TCCCC----CTAGTGTTGGGAGG-----TGCCC----TCCTCGTGCGG----GCCCCTCCT-GGCCCAT-TAAC---AAAACCCCGGCG--CCGAATGCGCC---AAGGAAATC--GAGA-TTGTCT-AGCACGCC-CCCGTCGGCTC-GGAGACGATG-ACT-GTG-TGG-TG-GCG--TTGCGACACGTGT------ATCC--------AAAAGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTTG-CATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAA-CGCAAGTTGCGCCCGAA-GCCATTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGTGTCGCACATCGTTGCCCC---AATGCCTC-AGCCCTGTTGCT-------AGGCTTAGT--AAA--GGGGTGAATGTTGGCTTCCCGTGA-GCGAT---GCCTCACGGTTGGCTGAAAA-TTGAGTC-CGTGGTGG--AGTG---CGCCGCGAT-GGAT-GGTGGTTGAG-TAAAA-------GCTCGAGACCGATCGT-GTGTG-TCACCCC-TACCGGATTTGGG-ACT-CTTTGACCCATGAG---CGGCCGTTGG-----CTGCCC?????????????????????? Spartium_junceum ???????????????????????TCG-AAGCC-T-TAA--AAGCA-GTG-CGACCTCGTG-AATTTGTTTG-ACT--ACTTA-GGGGTGA-CT----AGAGGTTT--TCGG-CACCTC-GG-----TCCCC----CTCGTGTCGGGAGG-----TAGCAC---ACCTTGTGTGG----TCTCCTCCG-GGCCCAA-TAAC---AAAACCCCGGCG--CCGAACGCGCC---AAGGATATT--GAAA-TCGTCT-AGTGCACC-CTCGTCAGCCC-GGAGACGGTG-CCT-GTG-CGGGTG-GTG--TTGCGACACGTGT------ATCC--------GAAAGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTTG-CATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAA-CGCAAGTTGCGCCCGAA-GCCATTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGTGTTGCACATCGTTGCCCC---TATGCCTT-AGCCACGT-GCT-------ATGCATTGA---TT--TGGGCGTATGTTGGCTTCCCGTGA-GCAGT---GTCTCACGGTTGGTTGAAAT-TTGAGTC-TGCGGTGG--AGGG---CGCCGTGAT-GGAT-GGTGGCTGAG-TTAAA-------GCTCGAGACCGATCGT-GCGTA-TCACCCC-CACCAGCTTTGTG-ACT-CTGTGACCCATGGG---GGTCTGTTGG-----CCCCTT?????????????????????? Sphaerolobium_minus ???????????????????ATTGTCA-ATGCC-T-CAC--AAGCA-GCT-AAACCC-GTG-AATGTGTTTT-TCT-ATTTAA--GGTTGG-TT----TGCAGTG--TTTAA-CATTGC-AA-----CCTCC----CTCATGCTGGGAGG--ATATGCTC----ACCTGGTGAGT----TCACCTCCT-AGCTAAAA---C---AAAACCCCGGCG--CTGAATGCGCC---AAGGAACCT---AAT-TTGTTC-AGTGCGCC-CCCGTAGACCC-GGAGACGGTG-CTT-TTG-CGGGTG-GCG--TTGTGACATGTGAAA----ATTT--------AAATGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTTG-CATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAA-CGCAAGTTGCGCCCGAA-GCCATTAGGCTAAGGGCACGCCTGCCTGGGTGTCACACATTGTTGCCCT---AA-GCCAA-T-CTGTGCAAAT------GGATTTGAGC---AT--AGGGTGAATGTTGGCTTCCCGTGA-GCATT---GCCTTGCGGTTAGTTGAAAA-TTTAGTC-CATGGTGG--AGTG---CACCATGAT--AGATGGTGGATGAG-TTTA--------TCTCGAGACCAATCAT-GTGTG-TCCCTCT--ATTGTATTTGGA-CTT-?CGTGACCCTCTTG---TGTCCATTGG-----ACACCC-ATCA-TGAGA-CCTCAGGTCA Sphaerolobium_nudiflorum ???????????????????ATTGTTG-ATGCC-T-CAC--AAGCA-GCG-TAACAT-GT--AATGTTATTCTACT--TAAGA----TTGG-TT----GGGCGTG--TTTAA-CACCAT-AA-----TCTCC----CTTGTGCCGGGAAG--ATATTCTC----ACGTTGTGGAC----TCTCCTCCC-AGCTAAA----C---AAAACCTCGACG--CTGAATGCGCC---AATGAACCT---AAT-TTGTTT-AGTGCGCC-CTCAGAGACCC-GAAGACGGTG-CTT-TTG-CCGGTG-GCA--TGTGGAATTGAAAAA----AATA-------AGA-TGACTCTCGGCAACAGATATCTCGGCTCATG-CACCGCTGAAGAA-TATAGCGAAATGCGATACTTCGTGTGAATTGCAGAATCTAGTGAACCATTGAGTCTTTGAA-CGCAGGTTGCGCCCGAA-GCCATTAGGATAAAGGCACGCCTACTTGGGTGTCACACATTGTTGCCCC---AA-GTCAA-T-CTGCACAACT------AGTTCTGTGC---AT--GGGGTGAATGTTGGCTTCCCGTGA-GCATC---GTCTTGCGGTTGGCTGAAAA-TTGAGTC-CATGGTGG--AGTG---TACCATGAT--ACATGGTGGTTGAG-TATA--------GCTCAAGACCAATCAT-GCCTA-TCTTTTT--GTTATGTTTGGA-TTT--TGTGACCCATGTG---TGTCTATCGG-----ACACCC-ATC--TGTGA-CCTCAAGTCA Stauracanthus_genistoides_genistoides ???????????????????????TCG-AAGCC-T-CAC--AAGCA-GTG-CGACCC-GTG-AATTTGTTTC-TCT--ACTCAAGGGGTGG-CT----AGAGGTGC--TCG--CACATC-GG-----CCCCC-----TCGTGTCGGGAGG-----TGCTCC---ACCTTGTGTGT----TGTCTTCCT-GGCCTAA-TAAC---AAAACCCCGGCG--CCGAACGCGCC---AAGGAAATT--GAAA-TCGTTT-AGTGCGCC-CCCGTCGGCCC-GGAGACGGTG-CCC-GTG-CTGGTG-GCG--TTGCGACACGCGA------ATCC???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????ATCGTTGCCCC---TGTGCCTT-GGCCACGT-GCT-------AGGCATCGA---GC--GGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGA-GCAGC---GTCTCACGGTTGGTTGAAAA-CTGAGTC-CGCGGTGG--AGGG---CACCGTGAT-GGAT-GGTGGCTGAG-TTAAT-------TCTCGAGACCGATCGT-GCGTG-TCACCCC-CACCAGCTTTGCG-ACT-CTGTGACCCATGGG---GGTCTGTTGA-----TCGCCT-AAGA-CGGGAACCTCAGG??? 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Thermopsis_montana ???????????????????????TCG-AAGCC-T-AAC-AATGCA-GTG-CGACCC-GCG-AATTTGTTTG-ACT--ACTAA-GGGGTGG-CT----AGAGGTGT--TCGG-CACCTC-GG-----TACCC---CATTGTGTC-AGAGG-----AGCCCG---TCCTTGTGTGG----TCTCCTCCT-GGCCTTA-TAAC---AAAACCCCGGCG--CCGAATGCGCC---AAGGAAATC--AAGA-TTGTCT-AGTGCGTC-CCCGTTGGCACCGGAGACGGTG-CCG-CTG-CGGGTG-GCG--TTGTGACACGCAT------ATCC--------CAAAGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTTG-CATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCGTTGAA-CGCAAGTTGCGCCCGAA-GCCATCAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGTGTCGCACATCGTTGCCCC--AAATGCCTC-AGCCTTGT-GCT-------AGGCTTCGA---GC--GGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGA-GCTAT---GTCTCACGGTTGGTTGAAAA-TTGAGTC-CGTGGTGG--AGGG---TGCCGCGAT-GCAT-GGTGGTTGAG-TAAAA-------GCTCGAGTTCGATCGT-GCGCG-TCACCCC-TATCGGATTTGGG-ACT-CTGTGACCCATGAG---CGTCTGTTGG-----GTGCCC?????????????????????? 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