CiteULike CiteULike
Delicious Delicious
Connotea Connotea

Matrix 3198 of Study 2062

About Citation title: "New World direct-developing frogs (Anura: Terrarana): Molecular phylogeny, classification, biogeography, and conservation".
About This study was previously identified under the legacy study ID S2061 (Status: Published).

Matrices

Title: Full 12s 16s

Description: Legacy TreeBASE Matrix ID = M3860

Rows

Taxon Label Row Segments Characters 1?–30
Caudiverbera caudiverbera  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pseudophryne bibroni  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pseudis paradoxa  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Rhinoderma darwinii  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Telmatobius verrucosus  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Melanophryniscus klappenbachi  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Odontophrynus achalensis  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimtantis jester  (none) TGGATCCTTAAAAA-TCCTTTAAGCACAC-
Pristimantis imitatrix  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis petrobardus  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Ischnocnema holti  (none) TGGGCCTTAAACC--CCCCCTGATCACAA-
Lynchius parkeri  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Lynchius nebulanastes  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis prolatus  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis sp. KU179221  (none) TGGATTCTGATAAA-TCCTTTAGACACAC-
Pristimantis crucifer  (none) NNNNNNNTTACCAA-CCCTTTAAACACAT-
Noblella lochites  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Craugastor sp. SBH268103  (none) TGAACCTTAACAGG-TCCTAAAAACACAA-
Craugastor sp. UTA51036  (none) CGGGCCGTAAAAAG-CCCTAAGAACACAA-
Psychrophrynella wettsteini  (none) CGAACCCTAAAAAG-TCCTAAAAACACAA-
Pristimantis albertus  (none) TAAATCCTAATAAA-TTTCTCAGACACAA-
Pristimantis dendrobatoides  (none) TGGGTCTTCAAAAG-CCCCCTAAACGCAT-
Pristimantis saltissimus  (none) TGGATCCTCAAAAA-TCCCTCAAACACAT-
Pristimantis marmoratus  (none) TGGATCCTCAAAAA-TCCCTCAAACACAC-
Strabomantis biporcatus  (none) TGAGCCCTAAAAAG-CTCTTTAAACATAA-
Pristimantis sp. LSUMZ16898  (none) TGAGTCCTCAAAAA-CTCTTCAAACACAT-
Phyzelaphryne miriame  (none) TCAGGACTAACCC--CCTTTTAAACACAA-
Craugastor crassidigitus  (none) CGGACCCTAAAAAG-CCCTAAAAACACAA-
Craugastor megacephalus  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Craugastor andi  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNTAAAAATACAA-
Pristimantis caryophyllaceus  (none) TGGACTCTCAATA--TCCTTTAAACACGC-
Craugastor loki  (none) TGGACCTTAAAACA-TCCTAAAAACACAA-
Craugastor stuarti  (none) TGGACTCTAATAAG-TCCTGAAAACATAA-
Craugastor melanostictus  (none) CGAGACCTAACA---CTCTAAAGACACAA-
Diasporus diastema  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Craugastor angelicus  (none) CGAGCCCTAAAAAG-CCCTAAAAACACAA-
Craugastor rugulosus  (none) CGGACCCTAAAAAG-CCCTAGAAACACAA-
Adelophryne gutturosa  (none) CGGA-CCTAAAAA--CCCTTTAAATATAA-
Pristimantis zeuctotylus  (none) TGGGCTTTTATAAG-CCCCTTAAACACAC-
Unknown anuran sp.  (none) CGAACCATGACAAG-TTCTTTAAACACAG-
Pristimantis inguinalis  (none) TGGATCCTCAAAAA-TCCCTTAAACACAC-
Craugastor berkenbuschii  (none) TGACCCCTCAAAG--TTCTAAAAACACAA-
Craugastor spatulatus  (none) TGAACTGTAATATAGTTCTAAAAACATAA-
Craugastor uno  (none) TGAACCTTAACAGG-TCCTAAAAACACAA-
Holoaden luederwaldti  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Eleutherodactylus jaumei  (none) TAGACCCTAGAAAA-TCTTTTAAACACAA-
Pristimantis eriphus  (none) TGGAGCCTCATAAC-TCCTTTAAGCATAT-
Pristimantis galdi  (none) TGGATTTTCATAAA-TCCCTTAAACACAT-
Craugastor rupinius  (none) CGGACCCTAAAAAG-CCCTGAAAACACAA-
Pristimantis diadematus  (none) TGAGTCCTCAAAAA-TTCTTCAGACACAA-
Lynchius flavomaculatus  (none) CGGGCCTTAAAA---CCCTTTAAACACAT-
Barycholos pulcher  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Oreobates cruralis  (none) CGGAGTCTCAATTTCTCCTTTAAACACAA-
Pristimantis simonsii  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Oreobates saxatilis  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTTAACA-GA-
Pristimantis ardalonychus  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Ischnocnema hoehnei  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimatnis malkini  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Eleutherodactlyus audanti  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAA-
Pristimantis sp. KU218210  (none) TGGGTTTTAGTAGA-TCCTTTAGACACAC-
Pristimantis cf rhabdolaemus  (none) TGAATTTTAACAAA-TTTCTTAGGCACAA-
Pristimantis cf mendax  (none) TGAATCTTCAAAA--TTCTTTAAACACAT-
Pristimantis sp. SBH266045  (none) TGAATCCTCAAAAA-TCCTTCAAACACAC-
Pristimantis minutulus  (none) TGAGTCCTTAAAAC-CTCTTCAAATACAC-
Pristimantis cruciocularis  (none) TGAATCCTCAAAAA-TCCTTCAAACACAC-
Eleutherodactylus bothroboans  (none) TAGACCATAAA-GG-TCTTTTAAACACAA-
Eleutherodactylus sommeri  (none) TGAACTGTAAAAAG-TTCTTTAAACATAA-
Eleutherodactylus schmidti  (none) CAGACCCTCAAAAG-TCTTTTAAACACAA-
Eleutherodactylus wetmorei  (none) TGAACTGTAAAAAG-TTCTTTAAACACAA-
Eleutherodactylus wightmanae  (none) CAGACCCTAAAAAG-TCTTCTAAACACAA-
Pristimantis terraebolivaris  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACACACAG-
Rana catesbeiana  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAA-
Ceratophrys cornuta  (none) NNNNNNNNNNNNNG-TCCTCTAAACACAA-
Cryptobatrachus sp.  (none) NNNNNNNNNNNNNG-GCCTCTAAACACAA-
Hyla chinensis  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAA-
Dendrobates sylvaticus  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAA-
Bufo melanostictus  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAA-
Centrolene prosoblepon  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Leptodactylus pentadactylus  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAACACAA-
Agalychnis callidryas  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Barycholos ternetzi  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Litoria caerulea  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Craugastor punctariolus  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Craugastor augusti  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Craugastor rhodopis  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Craugastor alfredi  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Craugastor podiciferus  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Craugastor sandersoni  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Craugastor bocourti  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Craugastor montanus  (none) NNNNNNNNNNNNNA-ATTCTAAAACACAA-
Craugastor longirostris  (none) TGGGCCCTTAAGAG-CCCTAAAAACACAA-
Craugastor daryi  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAACACAA-
Craugastor pygmaeus  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Craugastor fitzingeri  (none) NNNNNNNNNNNNNG-CCCTAAAAACACAA-
Brachycephalus ephippium  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTAACACAA-
Eleutherodactylus zeus  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Eleutherodactylus marnockii  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Eleutherodactylus thorectes  (none) TAGACCCTAAAAAG-TCTTTTAAACACAA-
Eleutherodactylus glaphycompus  (none) TAGACCCTAAAAAG-TCTTTTAAACACAA-
Eleutherodactylus caribe  (none) NNNNCCCTAAAAAG-TCTTTTAAACACAA-
Eleutherodactylus albipes  (none) TAGACTCTAAAGAG-CCTTTTAAACACAA-
Eleutherodactylus zugi  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Eleutherodactylus planirostris  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Eleutherodactylus cf varleyi  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Eleutherodactylus alcoae  (none) TAGACCCTAAAAAG-TCTTTTAAACACAA-
Eleutherodactylus leoncei  (none) CAGACCCTAAAGAGGTCTTTTAGACACAA-
Eleutherodactylus lentus  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Eleutherodactylus luteolus  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAACACAGA
Eleutherodactylus riparius  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAA-
Eleutherodactlyus gossei  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Eleutherodactylus griphus  (none) CAGGCCCCAAAAAGGCCTTTAAAACACAAA
Eleutherodactylus counouspeus  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Eleutherodactylus inoptatus  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTAAACACAA-
Eleutherodactylus richmondi  (none) CAGACTATAAAAAG-TCTTTTAAACACAA-
Eleutherodactylus unicolor  (none) CAGACCATAAAAAG-TCTTTTAAGCACAA-
Eleutherodactylus abbotti  (none) CAGACCATAAAAAG-TCTTTTAAACACAA-
Eleutherodactylus auriculatus  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATAA-
Eleutherodactylus lamprotes  (none) TGAACCCTAACTTA--TCCTTAAACACAA-
Eleutherodactylus leberi  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Eleutherodactylus martinicensis  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Eleutherodactylus cooki  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACACAA-
Holoaden bradei  (none) NNNNNNNNNNNNCC-CCACTAAAACACAA-
Oreobates quixensis  (none) NNNNNNATTTACCA-CCCTTTAAACACAA-
Phrynopus auriculatus  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Phrynopus bracki  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Psychrophrynella sp. KU173495  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Bryophryne cophites  (none) TGGATCCTAAGAAA-TTCTCTAAACACAA-
Strabomantis necerus  (none) NNNNNNNNNAAAAA-CTCCTTAAACACAA-
Strabomantis sulcatus  (none) NNNNNNNNNNNNNA-CTCTTTAAACATAA-
Strabomantis bufoniformis  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Strabomantis anomalus  (none) TGAGCCCCAAAAAG-CTCTTTAATCACAA-
Haddadus binotatus  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA-
Ischnocnema parva  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAGCACAA-
Ischnocnema juipoca  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Ischnocnema guentheri  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGCACAA-
Isodactylus elassodiscus  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Isodactylus dolops  (none) CGAGCTTTAGATAG-CTCAATCAACACAA-
Isodactylus brunneus  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA-
Isodactylus peraccai  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis pyrrhomerus  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis cruentus  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis "pluvicanorus"  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis luteolateralis  (none) CGAATCTTCAAAAA-TTCTTTAAACACAA-
Pristimantis appendiculatus  (none) CGGATCTTTATAAA-TCCTCTAGACACAT-
Pristimantis calcarulatus  (none) CGGATCCTTATAAA-TCCTTTAGGCACAC-
Pristimantis dissimulatus  (none) TGGA-TTTAATAAA-TCCTTTAGACACAC-
Pristimantis sagittulus  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis lanthanites  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-
Pristimantis cremnobates  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACACAC-
Pristimantis bipunctatus  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis walkeri  (none) CGAATCTTCAAAA--TTCTTTAAACACAA-
Pristimantis celator  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis rozei  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis peruvianus  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis fenestratus  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis festae  (none) NNNATTCTTAATAGATCTTGTAAACGCGT-
Pristimantis supernatis  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis chloronotus  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTAGGCATAC-
Pristimantis cryophilius  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis inusitatus  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis glandulosus  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis citriogaster  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis subsigillatus  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGA-CATAC-
Pristimantis altamazonicus  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis sp. AY326002  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis acerus  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis duellmani  (none) NNNNTTTTAATAAA-TCCTTTAAACGCAC-
Pristimantis ocreatus  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis rhabdolaemus  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis w-nigrum  (none) NNNNTTTTATTTAA-TCCTTTAAACACAC-
Pristimantis leoni  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis colomai  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis conspicillatus  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAACACAT-
Pristimantis stictogaster  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis chalceus  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis caprifer  (none) NNNNNNNTAATATG-TCCTTTAAACACAC-
Pristimantis parvillus  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis quinquagesimus  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis verecundus  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis aniptopalmatus  (none) NNNNNNNNNNNNAA-TTTTTTAGACACAA-
Pristimantis thymalopsoides  (none) NNNATTCTAATAGA-TTCTTTAAACACGC-
Pristimantis sp. SBH266049  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis skydmainos  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACACAC-
Pristimantis nyctophylax  (none) TGAGTTTTAATAAA-CCCTTTAAACATAC-
Pristimantis vertebralis  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis ridens  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis labiosus  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis thymelensis  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGAGCACAC-
Pristimantis shrevei  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis euphronides  (none) NNNNNNNNNNNNTA-TTCTTTAAACACAT-
Pristimantis bromeliaceus  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis pycnodermis  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis buckleyi  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis spinosus  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis urichi  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis ockendeni  (none) TGTGATCTCAAACCTCCCGTTAAACACAC-
Pristimantis orestes  (none) TGGACCCTCAAAAG-CCCTTTAAACACAC-
Pristimantis unistrigatus  (none) NNNNNNNNNNAAAA-CCCTTCAAACACAC-
Pristimantis rhodoplichus  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis simonbolivari  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis gentryi  (none) TGGATTTTGATAGA-TCCTTTAGACACAC-
Pristimantis truebae  (none) NNNNNNNTGATAGA-TCCTTTAGACACAC-
Pristimantis versicolor  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACATAC-
Pristimantis riveti  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis phoxocephalus  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis orcesi  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis lymani  (none) TGGACCCTAACAAG-TCCTTTAAACACAT-
Pristimantis latidiscus  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis devillei  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis curtipes  (none) TGGA-TTTGATAGA-TCCTTTAGACACAC-
Pristimantis condor  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis actites  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis toftae  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis lirellus  (none) TGAATCCTTAAAAA-TCCTTCAAATACAC-
Pristimantis schultei  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Pristimantis ceuthospilus  (none) NNNNNNNNNNNNNNNNNNCTCAAACACAT-

Columns

None of the columns has a description.