#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on May 22, 2024; 22:14 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Hackett S., Kimball R., Reddy S., Bowie R., Braun E., Braun M., Chojnowski J., Cox W., Han K., Harshman J., Huddleston C., Marks B., Miglia K., Moore W., Sheldon F., Steadman D., Witt C., & Yuri T. 2008. A Phylogenomic study of birds reveals their evolutionary history. Science, 20(588): 1763-1768. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S2108] BEGIN TAXA; TITLE TaxonLabelSet13794; DIMENSIONS NTAX=171; TAXLABELS Acanthisitta_chloris Aegotheles_insignis Aerodramus_vanikorensis Alcedo_leucogaster Alectura_lathami Alisterus_scapularis Alligator_mississippiensis Anas_platyrhynchos Anhinga_anhinga Anser_erythropus Anseranas_semipalmata Apteryx_australis Aramus_guarauna Ardea_herodias Arenaria_interpres Aythya_americana Balaeniceps_rex Batrachostomus_septimus Biziura_lobata Bombycilla_garrulus Brachypteracias_squamigera Bucco_macrodactylus Bucorvus_abyssinicus Burhinus_bistriatus Buteo_jamaicensis Cacatua_sulphurea Capito_niger Caprimulgus_longirostris Cariama_cristata Casuarius_casuarius Cathartes_aura Centropus_viridis Chalcopsitta_cardinalis Charadrius_vociferus Chauna_torquata Choriotis_kori Ciconia_ciconia Climacteris_erythrops Coccyzus_americanus Cochlearius_cochlearius Colibri_coruscans Colinus_cristatus Colius_colius Columba_livia Columbina_passerina Coracias_caudata Corvus_corone Corythaeola_cristata Coturnix_coturnix Coua_cristata Crax_alector Crotophaga_sulcirostris Crypturellus_soui Cuculus_canorus Daptrius_ater Dendrocolaptes_certhia Diomedea_nigripes Dromaius_novaehollandiae Dromas_ardeola Dryocopus_pileatus Eudocimus_albus Eudromia_elegans Eudyptula_minor Eupodotis_ruficrista Eurostopodus_macrotis Eurypyga_helias Falco_mexicanus Fregata_magnificens Fringilla_montifringilla Galbula_albirostris Gallus_gallus Gampsonyx_swainsonii Gavia_immer Gavialis_gangeticus Geococcyx_californianus Geotrygon_montana Grallaria_varia Grus_canadensis Haematopus_ostralegus Heliornis_fulica Hemiprocne_mystacea Herpetotheres_cachinnans Himantornis_haematopus Indicator_maculatus Jacana_jacana Larus_marinus Leptosomus_discolor Malacorhynchus_membranaceus Malurus_melanocephalus Megalaima_virens Megapodius_eremita Menura_novaehollandiae Merops_nubicus Mesitornis_unicolor Micrastur_semitorquatus Micropsitta_finschii Mionectes_macconnelli Momotus_momota Monias_benschi Morus_bassanus Nothoprocta_perdicaria Numida_meleagris Nyctibius_bracteatus Nyctibius_grandis Oceanites_oceanicus Oceanodroma_tethys Opisthocomus_hoazin Otidiphaps_nobilis Oxyura_jamaicensis Pandion_haliaetus Passer_montanus Pedionomus_torquatus Pelecanoides_urinatrix Pelecanus_occidentalis Phaenicophaeus_curvirostris Phaethon_lepturus Phaethon_rubricauda Phaethornis_griseogularis Phalacrocorax_carbo Pharomachrus_auriceps Phegornis_mitchellii Phodilus_badius Phoenicopterus_chilensis Phoeniculus_purpureus Picathartes_gymnocephalus Pipra_coronata Pitta_guajana Platycercus_elegans Ploceus_cucullatus Podargus_strigoides Podiceps_auritus Psittacula_alexandri Psittacus_erithacus Psophia_crepitans Pterocles_namaqua Puffinus_griseus Rallus_limicola Regulus_calendula Rhea_americana Rhynochetos_jubatus Rollulus_rouloul Rostratula_benghalensis Sagittarius_serpentarius Sapayoa_aenigma Sarcoramphus_papa Sarothrura_elegans Scopus_umbretta Scytalopus_magellanicus Smithornis_rufolateralis Speotyto_cunicularia Steatornis_caripensis Streptoprocne_zonaris Strix_occidentalis Struthio_camelus Sylvia_nana Syrrhaptes_paradoxus Tauraco_erythrolophus Thamnophilus_nigrocinereus Thinocorus_orbignyianus Tinamus_guttatus Tockus_camurus Todus_angustirostris Treron_vernans Trogon_personatus Turdus_falklandii Turnix_sylvatica Tyrannus_tyrannus Tyto_alba Upupa_epops Urocolius_indicus Vidua_chalybeata ; END; BEGIN CHARACTERS; [! 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Aerodramus_vanikorensis 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Alectura_lathami 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Anas_platyrhynchos 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Anser_erythropus 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Anseranas_semipalmata 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Apteryx_australis 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Aramus_guarauna 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Ardea_herodias 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Arenaria_interpres 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Aythya_americana 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Balaeniceps_rex 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Biziura_lobata 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Bombycilla_garrulus 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Brachypteracias_squamigera 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Bucco_macrodactylus 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Burhinus_bistriatus 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Buteo_jamaicensis 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Caprimulgus_longirostris 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Cariama_cristata 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Casuarius_casuarius 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Cathartes_aura 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Centropus_viridis 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Chalcopsitta_cardinalis 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Charadrius_vociferus 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Chauna_torquata 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Choriotis_kori 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Ciconia_ciconia 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Climacteris_erythrops 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Coccyzus_americanus 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Cochlearius_cochlearius 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Colibri_coruscans 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Colinus_cristatus 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Colius_colius 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Columba_livia 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Columbina_passerina 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Coracias_caudata 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Corvus_corone 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Corythaeola_cristata 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Coturnix_coturnix 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Dromas_ardeola 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Dryocopus_pileatus 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Eudocimus_albus 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Eudromia_elegans 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Eudyptula_minor 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Eupodotis_ruficrista 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Galbula_albirostris 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Gallus_gallus 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Gampsonyx_swainsonii 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Gavia_immer 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Gavialis_gangeticus 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Grallaria_varia 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Grus_canadensis 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Heliornis_fulica ACGACGCGACTGCCACCGATAACCTACACTGGGCGCTTCTCCCTGGAGCCCGCGCCCAACAGTAGCAACACCTTATGGCCAGAGCCCCTCTTCAGCCTTGTCAGTGGGCTGGTGGGCATGGCTAATGCACCTTCC---ACCTCTACGCCTTCATCGTCA---------CCA------TCCTCTTCCTCACAGAGCCCTCCTCTGAGCTGTTCCGTCCAAGCC---------AGTGAGAACAGTCCAATTTATTCAGCTGCACCAACTTTTCCCAATTCCACCTCTGACATTTTCCCTGAAGCGCAGACCCAGTCCTTTACCAAC---CCCTCTGGAGCCCCCATCCAGTATCCACCTCCAGCTTACCCGACTGCGAAAAACAACTTTCAGGTGCCAATGATCCCGGATTACCT{AG}TTCCCTCAGCAACAG---GGTGAGCTCAGTCTTGTTCCGGCTGATCAGAAGCCCTTTCCAGCCCTTGAGACCAGAGCACAGCAGCCTTCCCTCACACCACTTTCCACAATTAAAGCATTTGCTACTCAAACTGGCTCCCAAGAGTTGAAGACCCTCAACAGTAACTATCAGTCCCAGCTGATCAAGCCCAGCAGGATGAGGAAGTATCCAAATCGTCCCAGCAAGACCCCTCCTCATGAGCGCCCCTATGCCTGCCCAGTGGAGTC?TGTGACCGAAGGTTTTCACGGTCTGATGAG{CT}TAACACGGCACATCCGCATCCACACGGGACAGAAACCTTTCCAGTGCCGCATTTGCATGCGGAACTTCAGCAGGAGTGATCACTTGACTACGCACATCCGCACACATACAGGAGAGAAGCCATTTGCCTGTGACATTTGTGGCAGAAAGTTTGCCAGAAGTGATGAGAGGAAGAGACACACTAAAATCCATCTTAGGCAGAAGGACAAGAAAGTTGAAAAGGCAGCTCCGGTTTCAACTGCT---TCCCCAATTCCTGCCTACTCATCCTCTGTGACTACATCTTACCCTTCCTCCATCGCC---ACCTCTTACGCCTCACCAGTCCGCACAACATATTCCTCCCCTGCTCCTTCTTCCTATCCCTCTCCTGCACACACCACGTTCCCGTCTCCTTCTATAGCAACTACTTACCCTTCTGGCACGGCCACTTTTCAGACCCAAGTGGCCACCTCCTTCTCATCTCAAGGGGTCACCAACAATTTTAGTTCACAGGTGACCTCAGCACTTTCAGACATGACGTCCA?GATTTGCT-GA--------------GATTA-C-CTTCTGGAATGGGAAAATTCACCTTTTCCGATGGTATTATCA----GACACAGAGTCTCC----AGTTAG--TCCCAC--------AGCACCATAC--TTTGCAAGGCTATTTCAATTT-CTTT-AAACTTCAGCTGCCTGAAACAA-----CTGCCGTTT-AAGTTTT--CCATCTCTGTTGAATGAAT----TAATTTGCATGGACTGTGGATACAAGTTCAGTCTAATTTC--------------------CCCC-GTAAA----AAAT---AGTCTTTT-ATTAGGAAGAAA-GGACTTTTGATTAAGTATGTAGCTGATGTAAATTGTACATGTGCCATGGTTTTGCTTT-CCTTTAGG-TACTATTGATGT-GAACAA-------TCTTTGCATATCAATATTGCATTATTTGGAGTTTGCAGGGC----CATATTTTGTAAATGTTAATTCTATTTCAGTGAC-----AAAGCTGTAATAAGTTTCAAACGTCTTCGGGAACAGCACTT-ACT----GTATTT-GAGCATGTT-AGAGTGATGCT-ATGTAAA---TATTACG-TGAGGAGACA------CAT Hemiprocne_mystacea 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Herpetotheres_cachinnans ACGACGCGGCTGCCGCCCATAACCTACACCGGGCGCTTCTCCCTGGAGCCGGCCCCCAACAGCAGCAACACCTTATGGCCAGAGCCCCTCTTCAGCCTCGTCAGTGGGCTGGTGGGCATGGCTAACGCACCCCCC---ACCTCGACGCCTTCTTCATCGTCG------CCG------TCCTCCTCCGCGCAGAGTCCCCCTCTGAGCTGCTCTGTCCAAGCC---------AGCGAGAACAGCCCGATTTACTCAGCCGCACCGACTTTTCCCAATTCCAGCTCTGACATTTTCCCCGAACCGCAGGCCCAGTCCTTTCCCAAC---CCCTC{CT}GGAGCCCCCATCCAGTACCCACCTCCAGCTTACCC{AG}ACTGCTAAAACCAACTTTCAGGTGCCGATGATCCCGGATTATCTGTTCCCTCAGCAGCAG---GGTGAGCTCAGCCTTGTTCCGGC{CT}GACCAGAAGCCCTTCCCAGCCCTCGAGACCAGAGCACAGCAGCCTTCCCTCACGCCGCTGTCCACTATCAAGGCGTTCGCTACTCAGACTGGCTCCCAAGAGTTGAAGACCCTCAACACTAACTATCAGTCCCAGCTGATCAAGCCCAGCAGGATGAGGAAATACCCGAACCGTCCCAGCAAGACCCCTCCTCACGAGCGACCCTATGCCTGCCCGGTGGAGTC?????????????????????GTCCGACGAGCTAACGCGGCACATCCGCATCCACACGGGACAGAAACCTTTCCAGTGCCGCATCTGCATGCGGAACTTCAGCAGGAGCGACCACTTGACTACGCACATCCGCACGCACACGGGAGAGAAGCCATTTGCCTGTGACATTTGTGGCAGAAAGTTTGCCAGAAGTGACGAGAGGAAGAGACACACTAAAATCCACCTTAGGCAGAAGGACAAGAAGGTGGAAAAGGCAGCTCCCGTCTCGACTGCT---GCCCCCATTCCTGCCTACTCATCCTCTGTGACTACATCCTACCCTTCATCCATTGCC---ACCACTTACCCCTCACCAGTGCGCACAGTGTATTCCTCCCCTGCTCCCTCTTCCTACCCCTCCCCTGCA{CT}ACACCACGTTCCCGTCTCCCTC{CT}ATAGCGACCACTTACCCCTCTGGCACTGCCACTTTTCAGACCCAAGTGGCCACCTCCTTCTCATCTCCAGGGGA{CT}GCCAACAATTTCAGCTCACAGGTGACCTCAGCACTCTCAGACATGACGTCAGCGATTTGCT-GA--------------GATTA-C-CTTCTGGAACAGGAGACTTCACCCTTTCCATTGGTATTGTCA----GACACGGAGTCTCC----AATTAC--TCCCCC--------AACACCATAC--GTTGCAAGGCTATTTAACTTTTCTTT-AAACTTCAGCTGCCTGAAACAA-----CTGCCGTTT-AAGTTTT--CCACCTCTGTTGAATGACT----TAATTTGCATGGACTGTGGATATGAGTTCAGTATAATTTT--------------------CCCC-GTAAA----CAAT---AGTCTTTT-ATTAGGAAGAAA-GGACTTTTGATTAAGTATGTAGCTGATGTAAATTGTACATGTGCCATGGTTTTGCTTT-CCTTTAGG-TACTATTGATGT-GAAAAA-------TCTTTGCATATCCACGTTGTATTATTTGGAGTTTGCAGGGC----CATATTTTGTAAATGTTAATTCTATTTCAGTGAC-----AATGCTGTAATGAGTTTCAAACTTCTTTGGGAACAGCACTT-ACT----GTATTC-GAGCATGTT-AGAGTGATGCT-ATGTAAA---TATCACC-TGATGAGACA--CTCACAT Himantornis_haematopus ACGACGCGCCTGCCACCGATAACCTACACGGGGCGCTTTTCCCTAGAGCCCGCCCCCAACGGTAGCAACACCTTATGGCCAGAGCCCCTCTTCAGCCTTGTCAGTGGGCTGGTGGGCATGGCTAATGCACCTTCC---ACCTCTACGCCTTCATCATCG---------CCA------TCCTCTTCCTCACAGAGCCCTCCTCTGAGCTGTTCTGTCCAAGCC---------AGCGAGACCAGTCCAATTTATTCGGCTGCACCAACTTTTCCCAATTCCAGCTCTGACATTTTCCCTGAACCGCAGACCCAGTCCTTTCCCAAC---CCCTCTGGAGCCCCCATCCAGTATCCACCTCCAGCTTATCCGACTGCGAAAACTAACTTTCAGGTGCCAATGATCCCGGATTATTTGTTCCCTCAGCAACAG---GGTGAGCTCAGTCTTGTTCCAGCTGATCAGAAGCCCTTTCCAGCCCTTGAGACCAGAGCACAGCAGCCTTCCCTCACACCACTGTCCACAATTAAGGCATTTGCTACTCAGACTGGCTCCCAAGAGTTGAAGACCCTCAACAGTAACTATCAGTCGCAGCTGATCAAGCCCAGCAGGATGAGGAAATATCCAAACCGTCCCAGCAAGACCCCTCCTCATGAGCGCCCCTATGCCTGCCCAGTGGAGTCCTGTGACCGAAGGTTTTCACGGTCTGATGAGCTAACACGGCACATCCGCATCCACACGGGACAGAAACCTTTCCAGTGCCGCATTTGTATGCGGAACTTCAGCAGGAGTGACCACTTGACTACACATATCCGCACACATACAGGAGAGAAGCCATTTGCCTGTGACATTTGTGGCAGAAAGTTTGCCAGAAGTGATGAGAGGAAGAGACACACTAAGATCCACCTTAGGCAGAAGGACAAGAAAGTGGAAAAGGCAGCTCCAGTCTCAACTGCT---TCCCCAATTCCTGCCTACTCGTCCTCTGTGACTACATCCTACCCTTCCTCCATTGCC---ACCACTTACCCCTCTCCAGTGCGCACAGCATATTCCTCCCCTGCTCCTTCTTCCTATCCCTCCCCTGCACACACCACATTCCCATCTCCTTCTATAGCAACCACTTACCCTTCTGGCACTGCCACTTTTCAGACCCAAGTGGCCACCTCCTTCTCATCTCCAGGAGTCACCAACAATTTCAGCTCGCAGGTCACCTCTGCACTTAG??????????????????????????????????????????TTA-C-CTTCTGGA-TGGGAGAATTAATCTTTTCCATCG-TACTATCA----GACACAGAGTCTCC----AATTAC--TCCCAC--------AGCACCATAC--ATTGCAAGGCCATTTAATTTTTCCTT-AAACTTCAGCTGCCTGAAACAA-----CCGCTGTTT-AAGTTTT--CCACCTCTGTTGAATGAAT----TAATTTGCATGGACTGTGGCTACACGTTCAGTCTAACTTCCCTGCCCCATCCCCCCACCCCCCCGGTAAA----CAAT---AGTCTTTT-ATTAGGAAGAAA-GGACTTTT----AAGTATGTAGCTGATGTAAATTGTACATGTGCCATGGTTTTGCTTT-CCTTTAGG-TACTATTGATGT-GAACAA-------TCTTTGCATATCCATGTTGCATTATTTGGAGTTTGCAGGGC----CATATTTTGTAAATGTTAATTCTGTTTCAGTGAC-----AATGCTGTAATAAGTTTCAAACTTCTTTGGGAACAGCACTT-ACT----GTATTT-GAGCATGTT-AGAGTGATGCT-ATGTAAA---TATCACC-TGAGGAGACA--CTCACAT Indicator_maculatus 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Jacana_jacana 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Larus_marinus 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Leptosomus_discolor 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Malacorhynchus_membranaceus 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Malurus_melanocephalus ACGACGCGGTTGCCACCGATAACCTACACGGGGCGCTTCTCCTTAGAACCGGCCCCCAACAGCAGCAACCCCTTATGGCCAGAGCCCCTCTTCAGCCTCGTCAGTGGGCTGGTGGGCATGGCTAATGCACCTGCC---ACCTCTACGCCTACTTCATCATCA------CCG---------TCCTCCTCGCAGAGCTCCCCACTGAGCTGTTCTATCCAAGCC---------AGCGAGAACAGTCCAATTTATTCAGCTGCACCAACATTTCCCAATCCCAGCTCTGACATTTTTGCGGAACCCCAGACCCAGTCCTTCCCCAAC---CCCTCTGGAGCCCCCATCCAGTACCCACCTCCGGCTTATCCGACCGCTAAGACCAACTTTCAGGTGCCAATGATCCCGGATTACCTGTTCCCTCAGCAACAG---GGTGAGCTCAGTCTCGTTCCAGCTGATCAGAAGCCCTTTCCAGCCCTTGAGACCAGAGCACAGCAGCCTTCCCTCACGCCACTGTCCACTATTAAGGCATTTGCTACTCAGACTGGCTCCCAAGAGTTGAAGACCCTCAATGCTAATTATCAGTCCCAGCTGATCAAGCCCAGCAGGATGAGGAAATACCCAAATCGTCCCAGCAAGACACCTCCGCATGAGCGACCCTATGCCTGCCCAGTGGAGTCCTGTGACCGGAGATTTTCGCGATCCGACGAGCTTACACGGCACATACGCATTCACACGGGACAGAAACCTTTCCAGTGCCGCATTTGCATGCGGAATTTCAGCAGGAGCGACCACTTGACCACCCACATCCGCACGCACACGGGAGAGAAGCCATTTGCCTGTGACATTTGTGGCAGAAAGTTTGCCAGGAGCGATGAGAGGAAGAGGCACACTAAAATCCACCTTAGACAGAAGGACAAGAAAGTGGAAAAGGCAGCTCCAGTCTCGACCGCT---TCTCCAATTCCTGCCTATTCGTCCTCTGTGACTACATCCTACCCTTCCTCCGTTGCC---ACCACTTATCCCTCCCCGGTGCGCACAGCGTATTCTTCTCCCGCTCCCTCTTCCTATCCCTCCCCGGCGCACACCACGTTCCCATCCCCTTCTGTAGCGACCACTTATCCCTCTGGCACTGCCACTTTTCAGACCCAAGTGGCCACCTCCTTCTCGTCTCCGGGAGTCGCCAACAATTTCAGCTCGCAGGTGACCTCAGCACTTTCAGACATGAACTCAG???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Megalaima_virens 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Megapodius_eremita 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Menura_novaehollandiae ACGACGCGACTGCCACCGATAACCTACACGGGGCGCTTCTCCTTAGAGCCGGCCCCCAACAGCAGCAACACCTTATGGCCAGAGCCCCTCTTCAGCCTCGTCAGTGGGCTTGTGGGCATGGCTAATGCACCTGCC---ACCTCTACACCTACTTCATCATCA------CCA------TCCTCCTCCTCGCAGAGCTCCCCACTGAGCTGTTCTGTCCAAGCC---------AGCGAGAACAGTCCAATTTATTCAGCTGCACCAACGTTTCCCAATTCCAGCTCTGACATTTTCCCTGACTCCCAGCCCCAGTCCTTCCCCAAC---CCCTCTGGAGCCCCCATCCAGTATCCACCTCCAGCTTATCCGACTGCTAAAACCAACTTTCAGGTGCCAATGATCCCGGATTATTTGTTCCCTCAGCAACAG---GGTGAGCTCAGTCTTGTTCCAGCTGATCAGAAGCCCTTCCCAGCTCTTGAGACCAGAGCGCAGCAGCCTTCCCTCACGCCACTGTCCACTATTAAGGCGTTTGCTACTCAGACTGGCTCCCAAGAGTTGAAGACCCTCAACGCTAACTATCAGTCCCAGCTGATCAAGCCCAGCAGGATGAGGAAATACCCAAACCGTCCCAGCAAGACCCCCCCTCACGAGCGACCCTATGCCTGCCCGGTGGAGTCCTGTGACCGGAGGTTTTCACGATCTGATGAGCTAACGCGGCACATACGCATCCACACGGGACAGAAACCTTTCCAGTGCCGCATTTGCATGCGGAACTTCAGCAGGAGCGACCACTTGACTACGCACATCCGCACGCACACAGGAGAGAAGCCATTTGCCTGTGACATTTGTGGCAGAAAGTTTGCCAGAAGTGATGAGAGGAAGAGGCACACTAAAATCCACCTTAGGCAGAAGGACAAGAAAGTGGAAAAGGCGGCTCCAGTCTCAACTGCT---TCCCCAATTCCTGCCTATTCGTCCTCTGTGACTACGTCCTACCCT{GT}CCTCCATTGCC---ACCACTTATCCCTCGCCAGTGCGCACAGCGTATTCTTCTCCTGCTCCCTCTTCCTATCCCTCCCCTGCACACACCACATTCCCATCCCCTTCTATAGCAACCACTTATCCCTCTGGCACCGCCAATTTCCAGACCCAAGTGGCCACCTCCTTCTCATCTCCAGGAGTCACCAACAATTTCAGCTCACAGGTGACCTCAGCACTTTCAGACATGAACTCAG?GATCTGCT-GA--------------GACTA-C-CTTCTGGAACAGGAGAATTCACCTTTTCCATTGGTATTATCA----GACACGGAGTCTCC----AGTTAC--TCTCAC--------AACACCATAC--GTTGCAAGGCTATTTA------GTTT-AAACTTCAGCTGCCTGAAACAA-----CTGCTGCTT-AAGTTTT--CCACCTCTGTTGAATGACT----TAATTTGCATGGACTGTGGATATAAGTTCAATATAATTTT--------------------CCCC-GTAAA----CAAT---AGTCTTTT-ATTAGGAAGAAA-GGACTTTTGATTAAGTATCTAGCTGATGTAAATTGTACACGTGCCATGGTTTTGCTTT-CCTTTAGG-TACTGTTGATGTGGAAAAAAA-----TCTTTGCATATTCATATTGTATAATTTGGAGTTTGCAAGGC----CATATTT-GTAAATGTTAATTCTATTTCAGTGAC-----AATGCTATAATGCGTTTCAAACTTCTTTGGGAACAGCACTT-ACT----GTATTT-GAGCATGTT-AGAGTGA{CT}GCT-ATGTAAA---TATCACC-TGATGAGACA--CTCACAT Merops_nubicus ACGACACGACTGCCACCAATAACTTACACGGGGCGCTTCTCCCTAGAGCCAGCCCCCAACAGTAGCAACACCTTATGGCCAGAGCCCCTCTTCAGCCTTGTCAGTGGGCTGGTGGGCATGGCTAATGCACCTCCTCCCACCTCCGCGCCTTCTTCTTCATCA------CCG------TCTTCCTCCTCACAGAGCCCCCCTCTGAGCTGCTCTGTCCAAGCC---------AGTGAAAACAGTCCGATTTATTCGGCTGCACCAACCTTTCCCAATTCCAGCTCTGACATTTTCCCTGAACCACAGAGCCAGTCCTTTCCCAAC---CCCTCTGGAGCCCCCGTCCAGTACCCACCTCCAGCTTATCCGACTGCTAAAACCAACTTTCAGGTGCCAATGATCCCAGATTACCTGTTCCCTCAGCAACAG---GGTGAGCTCAGTCTTGTTCCGGCTGATCAGAAGCCCTTCCCAGCTCTTGAGACCAGAGCACAGCAGCCTTCCCTCACGCCACTGTCCACTATTAAGGCATTTGCTACTCAGACTGGCTCCCAAGAGTTGAAGACCCTCAACACCAACTATCAGTCCCAGCTGATCAAGCCCAGCAGGATGAGGAAGTACCCAAACCGTCCCAGCAAGACCCCTCCTCATGAGCGACCCTATGCCTGCCCAGTGGAGTCCTGTGACCGGAGGTTCTCGCGGTCTGATGAGCTCACGCGGCACATCCGCATCCACACGGGACAGAAACCTTTCCAGTGCCGCATTTGCATGCGGAACTTCAGCAGGAGCGACCACTTGACTACACACATCCGCACGCACACAGGAGAGAAGCCATTTGCCTGTGACATTTGTGGCAGAAAGTTTGCCAGAAGTGACGAGAGGAAGAGACACACGAAAATCCACCTTAGGCAGAAGGACAAGAAAGTGGAAAAGGCAGCTCCAGTCGCAACTGCT---TCCCCAGTTCCTGCCTACTCAGCCTCTGTGACTACATCCTACCCTTCCTCCATTGCT---ACCACTTACCCCTCGCCAGTGCGCACAGCGTATTCCTCCCCTGCTCCCTCTTCCTATCCCTCCCCTGCACACGCCACGTTCCCATCGCCTTCTATAGCAACCACTTACCCCTCAGGCACTGCCACTTTTCAGACCCAAGTGGCCACCTCCTTCTCATCCCCGGGGGTCACCAGCAATTTCAGCTCACAGGTGACCTCAGCACTTT????????????????GATTTGCT-GA--------------GATTA-C-CTTCTGGAACAGGAAAATTCACCTTTTCCATTGGTATTATCA----GACATGGAGTCTCT----AATTAC--TCCCCC--------AGCACTGTAT--GTTGCAAGGCTATTTAACTTTTCTTT-AAACTTCAGCTGCCTGAAACAA-----CTGCCATTT-AAGTTTT--CCACCTCTGTTGAATGACT----TGATTTGCATGGACTGTGGCTATAAGTTCAGTATAATTTT--------------------CCCC-GTAAA----CAAT---AGTCTTTT-ATTAGGAAGAAA-GGACTTTTGATTAAGTATGTAGCTGATGTAAATTGTACATGTGCCATGGTTTTGCTTT-CCTTTAGA-TACTATTGGTGTGGAAAA--------TCTTTGCATATCCATATTGTATTATTTGGAGTTTGCCGGGC----CATGTTTTGTAAATGTTAATTCTATTTCAGTGAC-----AATGATGTAATAAGTTTCAGACTTTTTTGG-AACAGCACTT-ACT----GTGTTT-GAGCATGTT-AGAGTGATGCT-ATGTAAA---TATCACC-TGATGAGACA--CTCACAC Mesitornis_unicolor ACGACGCGACTGCCGCCGATAACCTACACGGGGCGCTTCTCCCTAGAGCCGGCCCCCAGCAGCAGCAACACCTTATGGCCAGAACCCCTCTTCAGCCTCGTCAGTGGGCTGGTGGGCATGGCTAATGCACCTTCC---ACATCTACGCCCTCTTCATCATCA------CCA------TCCTCCTCGTCGCAGAGCCCCCCTCTGAGCTGTTCTGTCCAAGCC---------AGCGAGAACAGTCCAATTTATTCGGCTGCACCAACTTTTCCCAATTCCAGCTCTGATGTTTTCCCTGAACAGCAGACTCAGTCCTTTCCCAAC---CCCTCTGGAGCTCCCATCCAGTATCCACCTCCAGCTTATCCAACTGCTAAAACCAACTTTCAGGTGCCCATGATCCCGGATTACCTGTTCCCTCAGCAACAG---GGTGAGCTCAGTCTTGTTCCAGCTGATCAGAAGCCCTTCCCAGCCCTTGAGACCAGAGCACAGCAGCCTTCCCTCACTCCGCTGTCCACTATTAAGGCATTTGCTACTCAGACTGGCTCCCAAGAGTTGAAGACCCTCAACACTAACTATCAGTCCCAGCTGATCAAGCCCAGCAGGATGAGGAAATACCCAAACCGTCCCAGCAAGACCCCTCCTCACGAGCGACCCTATGCCTGCCCTGTGGAGTC?????????????????????GT{CT}TGACGAGCTAACACGGCATATCCGCATCCATACGGGACAGAAACCATTCCAGTGCCGCATTTGCATGCGGAACTTCAGCAGGAGTGACCACTTGACTACTCACATCCGCACGCACACAGGAGAGAAGCCATTTGCCTGTGACATTTGTGGCAGAAAGTTTGCCAGAAGTGATGAGAGGAAGAGACACACTAAAATCCACCTTAGGCAGAAGGACAAGAAAGTGGAAAAGGCAGCTCCGGTCTCAACTGCT---TCCCCAATTCCTGCCTATTCATCCCCTGCAGCTACATCCTACCCTTCCTCCATCACC---GCCACTTTCCCCTCACCAGTGCGCACAGTGTATTCCTCCCCTGCTCCCTCTTCCTATCCCTCCCCTGCACACACCACATTCCCATCTCCTTCTGTAGCAACCACCTACCCCTCTGGTGCTGCCACTTTTCCAACCCAAGTGGCCACCTCCTTCCCATCTCCAGGGGTCACCAACAATTTCAGCTCACAGGTGACCTCAGCACTTTCAGACATGACATCAGCGATTTGCT-GA--------------GGTTA-C-TCTCTAGAACAGGAGAATTCACCTTTTCCATTGGTACTATCA----GACATGGAGTCTCC----AATTAC--TCCCCT--------AGCACCATAC--GTTGCAAGGCTATTTAACTTTTCTTT-AAACTTCAGCTGCCTGAAACAA-----CTACTGTTT-AAGTTTT--CCACCTCTGTTGAATGACT----TAATTTGCATGGACTGTGGATATAAGTTCAGTATAATTTT--------------------CCCC-GTAAA----CAAT---AGTATTTT-ATTAGGCAGAAA-GGACTTTTGATT----GTGTAGCTGATGTAAATTGTACGTGTGCCATGGTTTTGCTTT-CATTTAGG-TACTATTGATGT-GAAAAA-------TCTTTGCATATCCATATTGTATTATTTGGAGTTTGCAGGGC----CATGTTTTGTAAATGTTAATTCTATTTCAGTGAC-----AATACTGTAAAGCGTTTCAAACTTCTTTGGGAACAGCACTT-ACT----GTATTT-GAGCATGTT-GGAGTGATGCT-ATGTAAA---TATCACC-TAATAAGACA--CTCACAT Micrastur_semitorquatus 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Micropsitta_finschii 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Mionectes_macconnelli 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Momotus_momota 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Monias_benschi 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Morus_bassanus 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Nothoprocta_perdicaria 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Numida_meleagris 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Nyctibius_bracteatus 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Nyctibius_grandis 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Oceanites_oceanicus 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Oceanodroma_tethys 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Opisthocomus_hoazin 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Otidiphaps_nobilis 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Oxyura_jamaicensis 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Pandion_haliaetus 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Passer_montanus 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Pedionomus_torquatus ACAACGCGACTGCCACCGATAACTTACACAGGGCGCTTCTCCCTCGAGCCAGCTCCCAACAGTGGCAACACCTTATGGCCAGAGCCCCTCTTCAGCCTCGTCAGTGGGCTGGTGGGCATGGCTAATGCACCTTCC---ACCTCTACACCTTCTTCATCTTCA------CCA------TCCTCCTCCTCGCAGAGCCCCACTCTGAGCTGTTCTGTCCAAGCCACCCAAGCCAGCGAGAACAGCCCAATTTATTCAGCTGCGCCAACTTTTCCCAATTCCAACTCTGATATTTTCCCTGAACCGCAGACCCAGTCCTTTTCCAAT---CCCTCTGGAGCCCCTATCCAGTATCCACCTCCAGCTTATCCGACTGCTAAAACCAACTTTCAGGTGCCAATGATCCCGGATTACCTGTTTCCTCAGCAACAG---GGTGAGCTCAGTCTTGTTCCGGCCGATCAGAAGCCCTTCCCTGCCCTCGAGACCAGAGCACAGCAGCCTTCCCTCACACCACTGTCCACTATTAAGGCGTTTGCTACTCAGACTGGCTCTCAGGAGCTGAAGGCTCTCAACACTAACTATCAGTCCCAGCTGATCAAGCCCAGCAGGATGAGGAAATACCCAAACCGTCCCAGCAAGACCCCTCCTCATGAGCGACCCTATGCTTGCCCTGTGGAGTCCTGTGACCGGAGGTTTTCACGGTCTGATGAGCTAACGCGGCACATCCGTATCCACACGGGACAGAAACCTTTCCAGTGCCGCATTTGCATGAGGAACTTCAGCAGGAGCGACCACTTGACTACACACATTCGCACGCACACAGGAGAGAAGCCATTCGCCTGTGACATTTGTGGCAGAAAGTTTGCCAGAAGCGATGAGAGGAAGAGACACACTAAAATCCACCTTAGGCAGAAGGACAAGAAAGTGGAAAAGGCAGCTCCAGCCTCAACTGCT---TCCCCCGTTCCTGCCTATTCATCCTCTGTGACGACATCCTACCCTTCCTCTATTGCC---ACCACTTACCCCTCGCCAGTGCGCACAGTGTATTCTTCCCCTGCTCCCTCTTCCTATCCATCCCCTGCACATACCACCTTCCCATCTCCTTCTATAGCAACCACTTACCCCTCTGGAACTGCCACTTTTCAGGCCCAAGTGGCCACCTCCTTCTCATCTCCAGGGGTCACCAACAATTTCAGCTCACAGGTGACCTCAACACTTTCAGACATGACATCGG??????????????????????????????????CTTCTGGAATGGGAGAACTCACCTTTTTGATTGGTAGTATCA----GACGTGGAGTCTCC----AGTTACCCTCCCCCCCCCCCC-AACACCATAC--ATTGCAAGGCTATTTAACTTTTCTTT-AAACTTCAGCTGCCTGAAACAA-----CTGCCATTTTAAGTTTT--ACACCTCTGTTGAATGACT----TAATTTGCATGGACTGTGGATATAAGTTCAGTATAACTTT--------------------CCCC-GTAAA----CAAT---AGTCTTTT-ATTAGGAAGAAA-GGACTTTTGATTAAGTATGTAGCTGATGTAAATTGTAC--GTGCCATGGTTTTGCTTT-CCTTTAGG-TATTATTGATGT-GACAAA-------TCTTTGCATATCCACATTGTATTATTTGGAGTTTGCAGGGC----CATATTTTGTAAATGTTAATCCTGTTTCAGTGAC-----AATGCTGTAATGAGTTTCAAACTTCTTTGGGAACAGCACTTAACT----GTATTT-GAGCATGTT-AGAGTGATGCT-ATGTAAA---TATCA?????????????????????? Pelecanoides_urinatrix 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Pelecanus_occidentalis 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Phaethon_lepturus 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Ploceus_cucullatus 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Podargus_strigoides 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Podiceps_auritus 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Psittacula_alexandri 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Psittacus_erithacus 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Psophia_crepitans ACGACGCGACTGCCACCGATAACCTATACGGGGCGCTTCTCCCTAGAGCCGGCCCCCAACAGTAGCAACACCTTATGGCCAGAGCCTCTCTTCAGCCT{CT}GTCAGTGGGCTGGTGGGCATGGCTAATGCACCTTCC---ACCTCCACGCCTTCTTCATCATCA------CCA------TCCTCCTCCTCACAGAGCCCCACTCTGAGCTGTTCTGTCCAAGCC---------AGCGAGAACAGTCCAATTTATTCGGCTGCACCAACTTTTCCCAATTCCAGCTCTGACATTTTCCCTGAACCGCAGACCCAGTCCTTTCCCAAC---CCCTCTGGAGCCCCCATCCAGTATCCACCTCCAGCTTATCCGACTGCAAAAACCAACTTTCAGGTGCCAATGATCCCGGATTACCTGTTCCCTCAGCAACAG---GGTGAGCTCAGCCTTGTTCCAGCTGATCAGAAGCCCTTTCCAGCCCTTGAGACCAGAGCACAGCAGCCTTCCCTCACACCGCTGTCCACTATTAAGGCGTTTGCTACTCAGACTGGCTCCCAGGAGTTGAAGACCCTCAACACTAACTATCAGTCCCAGCTGATCAAGCCCAGCAGGATGAGGAAATACCCAAACCGTCCCAGCAAGACCCCTCCTCACGAGCGACCCTATGCCTGCCCAGTGGAGTCCTGTGACCGAAGGTTTTCACGGTCTGATGAGCTAACGCGGCACATCCGTATCCACACGGGACAGAAACCTTTCCAGTGCCGCATTTGCATGCGGAACTTCAGCAGGAGTGACCACTTGACTACGCACATCCGCACACATACAGGAGAGAAGCCATTTGCCTGTGACATTTGTGGCAGAAAATTTGCCAGAAGTGATGAGAGGAAGAGACACACTAAAATCCACCTTAGGCAGAAGGACAAGAAAGTGGAAAAGGCAGCTTCGGTCTCAAGTGCT---TCCCCAATTCCTGCCTACTCATCCTCCGTGACTACATCCTACCCTTCCTCCATTGCA---ACCACTTACCCCTCACCGGTGCGCACAGTGTATTCCTCCCCTGCTCCCTCTTCCTATCCCTCCCCTGTACACACCACGTTCCCGTCTCCTTCTATAGCAACCACTTACCCCTCTGGCACTGCCACTTTTCAGACCCAAGTGGCCACCTCCTTCTCATCTCCAGGGGTCACCAACAATTTCAGCTCACAGGTGACTTCAGCGCTTTCAGACATGACGTCAG?GATTTGCTTGA--------------GATTA-C-CTTCTGGAACAGGAGAATTCACCTTTTCCATTGGTACTATCA----GACATGGAGTCTCC----AGTTAC--TCCCCC--------AACACCATAC--ATTGCAAGGCTATTTAACTTTTCTTT-AAACTTTAGCTGCCTGAAACAA-----CCGCGATTT-AAGTTTT--CCACCCCTGTTGAATGAAT----TAATTTGCATGGACTGTGGATATAAGTTCAGTATATTTTT--------------------CCCC-GTAAA----CAAT---AGCCTTTT-ATTAGGAAAAAA-GGACTTTTGATTAAGTATATAGCTGATGTAAATTGTACATGTGCCATGGTTTTGCTTT-CCTTTAGG-TACTATTGATGT-GAACAA-------TCTTTGCATATCCATATTGTATTATTTGGAGTTTGCAGGGC----CATATTTTGTAAATGTTAATTCTATTTCAGTGAC-----AATGCTGTAATGAGTTTCAAACTTCTTTGGGAACAGCACTT-ACT----GTATTT-GAGCATGTT-AGAGTGATGCT-ATGTAAA---TATCACC-TGATGAGACA--CTCACAT Pterocles_namaqua 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Puffinus_griseus 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Rallus_limicola 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Regulus_calendula 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Rhea_americana 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Rhynochetos_jubatus ACCACGCGACTGCCGCCGATAACCTACACGGGGCGCTTCTCCCTGGAGCCGGCCCCCAACAGCAGCAACGCCTTATGGCCAGAGCCGCTCTTCAGCCTGGTCAGCGGGCTGGTGGGCATGGCTAATGCACCGCCC---GCCTCCACGCCTTCGTCATCG---------CCA------TCCTCCTCAGCGCAGAGCACCCCTCCGAGCTGCTCTGCCCAAGCC---------GGCGAGAACAGCCCCATTTATTCGGCTGCACCAACTTTTCCCAATTCCAGCTCCGACATTTTCCCTGAACCGCAGACCCAGTCCTTTCCCAAC---CCTTCAGGACCCCCCATCCAGTATCCACCTCCAGCTTATCCGACTGCTAAAACCAACTTCCAGGTGCCAATGATCCCGGATTACCTGTTCCCTCAGCAACAG---GGTGAGCTCGGTCTGGTTCCCGCGGAGCAGAAGCCCTTCCCAGCCCTTGAGACCAGAGCGCAGCAGCCTTCCCTCACACCACTGTCCACTATCAAGGCGTTTGCAACTCAGACTGGCTCTCAGGAGCTGAAGACTCTCAACACGAGCTATCAGTCCCAGCTGATCAAGCCCAGCAGAATGAGGAAATACCCAAACCGGCCCAGCAAGACCCCCCCTCACGAGCGGCCCTACGCCTGCCCAGTGGAGTC?????????????????????GTCTGATGAGTTAACGCGGCACATCCGCATCCACACGGGACAGAAACCTTTCCAGTGCCGCATCTGCATGCGGAACTTCAGCAGGAGCGACCACTTGACTACACACATCCGCACGCACACGGGAGAGAAGCCATTTGCTTGTGACATTTGTGGCAGAAAGTTTGCGAGAAGTGATGAGAGGAAGAGACACACTAAAATCCACCTTAGGCAGAAGGACAAGAAGGTGGAAAAGGCAGCTCCGGTCTCAACTGCT---TCCCCAGTTCCTGCCTACTCGTCCTCTGTGACTACATCCTACCCTTCCTCCATCACC---ACTACTTACACCTCACCAGTGCGCACCGTGTACTCCTCCCCCGCTCCCTCTTCCTACCCCTCCCCTGCACACACCACATTCCCATCTCCTCCTATAGCAACCACTTACCCCTCCAGCACTGCCACTTTTCAGACCCAAGTGGCCACCTCCTTCCCATCCCCAGGGGTCACCAACAATTTCAGCTCACAGGTGACCTCAGCACTTTCAGACATGACATCCGC??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Rollulus_rouloul 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Rostratula_benghalensis 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Sagittarius_serpentarius ACGACGCGACTGCCACCGATAACCTACACGGGGCGCTTCTCCCTAGAGCCGGCCCCCAACAGTAGCAACACCTTATGGCCCGAGCCCCTCTTCAGCCTCGTCAGTGGGCTGGTGGGCATGGCTAATGCACCTCCC---ACCTCTACGCCTTCTTCATCATCG------CCA------TCCTCCTCCTCGCAGAGCCCCCCTCTGAGCTGTTCTGTCCAAGCC---------AGCGAGAACAGTCCAATTTATTCGGCTGCACCAACTTTTCCCAATTCCAGTTCTGACATTTTCCCTGAACCGCAGACCCAGTCCTTTCCCAAC---CCCTCTGGAGCCCCCATCCAGTATCCACCTCCAGCTTATCCTACTGCTAAAACCAACTTTCAGGTGCCAATGATCCCGGATTACCTGTTCCCTCAGCAACAG---GGTGAGCTCAGTCTTGTTCCGGCTGATCAGAAGCCCTTCCCAGCCCTTGAGACCAGAGCACAGCAGCCTTCCCTCACACCGCTGTCCACTATTAAGGCATTTGCTACTCAGACTGGCTCCCAGGAGTTGAAGACCCTCAACACTAACTATCAGTCCCAGCTGATCAAGCCCAGCAGGATGAGGAAATATCCAAACCGTCCCAGCAAGACCCCTCCTCATGAACGACCCTATGCCTGTCCAGTGGAGTCCTGTGACCGGAGGTTTTCTCGGTCCGATGAGCTAACGCGGCACATCCGCATCCACACGGGACAGAAACCGTTCCAGTGCCGCATTTGCATGCGGAACTTCAGCAGAAGTGACCACTTGACTACGCACATCCGCACACACACAGGAGAGAAACCATTTGCCTGTGACATTTGTGGCAGAAAGTTTGCCAGAAGTGATGAGAGGAAGAGACACACTAAAATCCACCTTAGGCAGAAGGACAAGAAAGTGGAAAAGGCAGCTCCGGTCTCAACTGCT---TCCCCAATTCCTGCCTACTCATCCTCTGTGACTACATCCTACCCTTCCTCCATTGCC---ACCACTTACCCCTCACCAGTGCGCACAGTGTATTCCTCCCCTGCTCCCTCTTCCTATCCCTCCCCTGCGCACACCACATTCCCATCTCCTTCTATAGCAACCACTTACTCCTCTGGCACTGCCACTTTTCAGACCCAAGTGGCCACCTCCTTCTCATCTCCAGGGGTCACCAACAATTTCAGCTCACAGGTGACCTCAGCACTTTCAGACATGACATCAG?GATTTGCT-GA--------------GATTA-C-CTTCTGGAACAGGAGATTTCACCTTTTCCACTGGTATTATCA----GACATGGAGTCTCC----AGTTAC--TCCCCCC-------AACGCCATAC--GTTGCAAGGCTATTTAACTTTTCTTT-AAACTTCAGCTGCCTGAAACAA-----CTGCCGTTT-AAGTTTT--CCACCTCTGTTGAATGACT----TAATTTGCATGGACTGTGGATATAAGTTCAGTATAATTTT--------------------CCCC-GTAAA----CAAT---AGTCTTTT-ATTAGGAAGAAA-GGACTTTTGATTAAGTATGTAGCTGATGTAAATTGTACATGTGCCATGGTTTTGCTTT-CCTTTATG-TACTATTGATGT-GAAAAA-------TCTTTGCATATCCATATTGTATTATTTGGAGTTTGCAGGGC----CATGTTTTGTAAATGTTAATTCTACTTCAGTGAC-----AATGCTGTAATGAGTTTCAGACTTTTTTGGGAACAGCACTT-ACT----GTATTT-GAGCATGTT-AGAGTGATGCT-ATGTAAA---TATCACC-CAATGAGACA--CTCACAT Sapayoa_aenigma ACGACGCGACTGCCACCGATAACCTACACGGGGCGCTTCTCTTTGGAGCCGGCCCCCAACAGCAGCAATACCTTATGGCCAGAGCCTCTCTTCAGCCTCGTCAGTGGGCTGGTGGGCATGGCCAATGCACCTCCC---ACCTCTACGCCTACTTCATCATCG------CCA------TCCTCCTCCTCGCAGAGCTCCCCACTGAGCTGTTCCGTCCAAGCC---------AGTGAGAACAGTCCAATTTATTCAGCTGCACCAACGTTTCCCAATTCCAGCTCTGACATTTTCCCTGAATCGCAGACCCAGTCCTTCCCCAAC---CCCTCTGGAGCCCCCATCCAGTATCCACCTCCAGCTTATCCGACTGCTAAAACCAACTTTCAGGTGCCAATGATCCCGGATTACCTGTTCCCTCAGCAACAG---GGTGAGCTCAGTCTTGTTCC{AG}GCTGATCAGAAGCCCTTCCCGGCGCTTGAGACCAGAGCACAGCAGCCTTCCCTCACGCCACTGTCCACTATTAAGGCATTTGCTACTCAGACTGGCTCCCAAGAGTTGAAGACCCTCAACACTAACTATCAGTCCCAGCTCATCAAGCCCAGCAGGATGAGGAAATACCCGAACCGTCCCAGCAAGACCCCTCCCCACGAGCGTCCCTATGCCTGCCCTGTGGAGTC?????????????????????ATCCGATGAGCTCACGCGGCACATCCGCATCCACACGGGACAGAAACCTTTCCAGTGCCGCATTTGCATGCGGAACTTCAGCAGGAGCGACCACTTGACGACACATATCCGCACACACACAGGGGAGAAGCCATTTGCCTGTGACATTTGCGGCAGAAAGTTTGCCAGAAGTGATGAGAGGAAGAGGCACACTAAAATCCACCTTAGGCAGAAGGACAAGAAAGTGGAAAAGGCAGCTCCAGTGTCCACTGCT---TCCCCAATTCCTGCCTATTCATCCTCTGTGACTACATCCTACCCTTCCTCCATCACC---ACCACTTACCCCTCGCCAGTGCGCACAGTGTATTCCTCTCCTGCTCCCTCTTCCTACCCCTCCCCTGCGCACACCACGTTCCCATCCCCTTCTATAGCAACCACTTACCCCTCTGGCACGGCCACTTTTCAGACCCAAGTGGCCACGTCCTTCTCATCTCCAGGGGTCACCAACAATTTCAGCTCGCAGGTGACCTCAGCACTTTCAGACATGAACTCGG?GATCTGCT-GA--------------GACGA-C-CTTCTGGAACAGGAGAATTCACCTTTTCCATTGGTATTATCA----GACATGGAGTCTCC----AGTTAC--TCCCCC--------AACACCATAC--GTTGCAAGGCTATTTAACTTTAGTTT-AAACTTCAGCTGCCTGAAACAA-----CTGCTGCTT-AAGTTTT--CCACCTCTGTTGAATGACT----TAATTTGCATGGACTGTGGATATAAGTTCAATATAATTTT--------------------CCCT-GTAAA----CAAT---AGTCTTTT-ATTAGGAAGAAA-GGACTTTTGATTAAGTATCTAGCTGATGTAAATTGTACATGTGCCATGGTTTTGCTTT-CCTTTAGG-TACTATTGATGT-GAAAAAAGA----TCTTTGCATATTCATATTGTATTATTTGGAGTTTGCAGGGC----CATATTTTGTAAATGTTAATTCTATTTCAGTGAC-----AATGCTATAATGCGTTTCAAACTTCTTTGGGAACAGCACTT-ACT----GTATTT-GAGCATGTT-AGAGTGATGCT-ATGTAAA---TATCACCCTGATGAGACA--CTCACAT Sarcoramphus_papa 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Sarothrura_elegans 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Scopus_umbretta 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Scytalopus_magellanicus 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Smithornis_rufolateralis 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Speotyto_cunicularia ????????????????CGATAACCTACACGGGGCGCTTCTCCCTAGAGCCGGCCCCCAACAGTAGCAACACCTTATGGCCAGAGCCCCTCTTCAGCCTCGTCAGTGGGCTGGTTGGCATGGCTAATGCACCCCCC---ACCTCTACACCTTCTTCATCGTCA------CCA------TCCTCCTCCTCGCAGAGCTCCCCTCTGAGCTGTTCTGTACAAGCC---------AGCGAGAACAGCCCAATCTATTCAGCTGCACCAACTTTTCCCAATTCCAGTTCTGACATTTTCCCCGAACCGCAGACCCAGTCCTTTCCCAAC---CCCTCTGGAGCCCCCATCCAATATCCACCTCCAGCTTATCCGACTGCTAAAACCAACTTTCAGGTGCCAATGATCCCGGATTACCTGTTCCCTCAGCAGCAG---GGTGAGCTCAGTCTTGTTCCAGCTGATCAGAAGCCCTTCCCAACCCTTGAGACGAGAGCACAGCAGCCTTCCCTCACGCCGCTGTCCACTATTAAGGCATTTGCTACTCAGACTGGCTCCCAAGAGTTGAAGACCCTCAACACTAATTATCAGTCCCAGCTCATCAAGCCCAGCAGGATGAGGAAATACCCAAACCGTCCCAGCAAGACCCCTCCTCACGAGCGACCCTATGCCTGCCCCGTGGAGTCCTGTGACCGGAGGTTTTCACGGTCTGATGAGCTAACGCGGCATATCCGCATCCACACGGGACAGAAACCTTTCCAGTGCCGCATTTGCATGCGGAACTTCAGCAGAAGCGACCACTTGACTACACACATCCGCACGCACACAGGAGAGAAGCCATTTGCCTGTGATATTTGTGGCAGAAAGTTTGCCAGAAGTGATGAGAGGAAGAGACACACAAAAATCCACCTTAGGCAGAAGGACAAGAAGGTGGAAAAGGCAGCTCCAGCTTCAACTGCT---TCCCCAGTTCCTGCCTACTCATCTTCTGTGACTACATCCTACCCTTCCTCCATTGCC---ACCACCTATCCCTCGCCAGTGCGCACAGTGTATTCCTCCCCTGCTCCCTCTTCCTACCCCTCCCCCGCGCACACCACATTCCCATCCCCTTCTATAGCAACCACTTACCCCTCTGGCACTGCCACTTTTCAGACCCAAGTGGCCACGTCCTTCTCATCTCCAGGGATCACCAACAATTTCAGCTCACAGGTGACCTCAGCACTTTCAGACATGACGTCAG?GATCTGCT-GA--------------GATTA-C-CTTCTGGAACAGGAGACTTCACCTTTTCCATTGGTATTACCA----GACGCGGAGTCTCC----GATTAC--TCCCCC--------AACACCATAC--GTTGCAAGGCTATTTAACTTTTCTTT-AAACTTCAGCTGCCTGAAACAA-----CTGCCGTTT-AAGTTTT--CCACCTCTGTTGAATGACT----TAATTTGCATGGACTGTGGATATAAGTTCTGTATAATTTT--------------------CCCC-GTAAA----CAAT---AGTCTTTT-ATTAGGAAGAAA-GGACTTTTGATTAAGTATGTAGCTGATGTAAATTGTACATGTGCCATGGTTTTGCTTT-CCTTTAGG-TACTATTGATGT-GAAAAA-------TCTTTGCATATCCATATTGTATTATTTGGAGTTTGCAGGGC----CATATTTTGTAAATGTTAATTCTATTTCAGTGAT-----AATGCTGTAATGAGTTTCAAACTTCTTTGGGAACAGCACTT-ACT----GTATTT-GAGCATGTT-AGAATGATGCT-ATGTAAA---TATCACT-CGATGAGACA--CTCACAT Steatornis_caripensis ??????CGGCTGCCACCGATAACCTACACGGGGCGCTTCTCCCTAGAGCCGGCCCCCAACAGCAGCAACACCTTATGGCCGGAGCCCCTCTTCAGCCTCGTCAGTGGGCTGGTGGGCATGGCTAACGCACCTCCC---ACCTCTACGCCTTCTTCATCGTCA------CCA---TCCTCCTCCTCCTCGCAGAGCCCGCCTCTGAGCTGTTCTGTCCAAGCC---------AGCGAGAGCAGTCCAATTTATTCGGCTGCACCAACTTTTCCCAATTCCAGCTCTGACATTTTCCCTGAAGCGCAGACCCAGTCCTTTCCCAAC---CCCTCTGGAGCTCCCATCCAGTATCCACCTCCAGCTTACCCGGCTGCTAAAACCAACTTTCAGGTGCCAATGATCCCGGATTACCTGTTCCCTCAGCAACAG---GGTGAGCTTGGTCTAGTTCCGCCTGATCAGAAGCCCTTCCCAGCCCTTGAGACGAGAGCACAGCAGCCTTCCCTCACGCCACTGTCCACTATTAAGGCATTTGCTACTCAGACTGGCTCCCAAGAGTTGAAGACCCTCAACACCAACTACCAGTCCCAGCTGATCAAGCCCAGCAGGATGAGGAAATACCCAAACCGTCCCAGTAAGACCCCTCCTCACGAACGACCCTATGCCTGCCCAGTGGAGTCCTGTGACCGGAGGTTTTCACGGTCCGACGAGCTAACGCGGCACATCCGCATCCACACGGGACAGAAACCTTTCCAGTGCCGCATTTGCATGCGGAACTTCAGCAGGAGCGATCACTTGACTACACACATCCGCACACACACAGGAGAGAAGCCATTTGCCTGTGACATTTGTGGCAGAAAGTTTGCCAGAAGCGACGAGAGGAAGAGACATACTAAAATCCACCTTAGGCAGAAGGACAAGAAAGTGGAAAAGGCAGCTCCGGTCTCAACTGCT---TCCCCAGTTCCTGCCTACTCATCCTCTGTAACTACATCCTACCCTTCCTCCATTGCC---ACCACTTACCCCTCACCAGTGCGCACAGTGTACTCCTCCCCCGCTCCCTCTTCCTACCCCTCCCCTGCACACACCACATTCCCATCTCCCTCTATAGCAACCACTTACCCCTCTGGCACTGCCACTTTTCAGACCCAAGTGGCCACCTCCTTCTCATCTCCAGGGGTCACCAACAATTTCAGCTCACAGGTGACCTCAGCACTTTCAGACATGACGTCAG?GATTTGCT-GA--------------GATTA-C-CTTCTGGAGCAGGAGAATTCACCTTTTCCATTGGTACTATCA----GGCATGGAGTCTCC----AGTTAC--TCCCCC---------ACACCATAT--GTTGCAAGGCTATTTAACTTTTCTTT-AAACTTCAGCTGCCTGAAACAA-----CTGCCGTTT-AAGTTTT--CCACCTCTGTTGAATGACT----TAATTTGCATGGACTGTGGATATAAGTTCAGTATAATTTT--------------------CCTC-GTAAA----CAAT---AGTCTTTT-ATCGAGAAGAAA-GGACTTTCGATTAAGTATGTAGCTGATGTAAATTGTACATGTGCCATGGTTTTGCTTT-CCTTTAGG-TACTATTGGCGT-GAAAAA-------TCTTTGCATATCCATATTGCATTATTTGGAGTTTGCAGGGC----CATATTTTGTAAATGTCGATTCTATTTCAGTGAC-----AATGCTGTAACGAGTTTCAAACTTATTTGGGAACAACACTT-ACT----GTATTT-GAGCATGTT-AGAGTGATGCT-ATGTAAA---TATCACC-TGATGAGACA----CAC?? Streptoprocne_zonaris 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Strix_occidentalis 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Struthio_camelus 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Syrrhaptes_paradoxus 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Tauraco_erythrolophus 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Thamnophilus_nigrocinereus 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Tinamus_guttatus 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Tockus_camurus 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Todus_angustirostris ACGACACGACTGCCGCCAATTACGTACACAGGACGCTTCTCTCTAGAGCCGGCCCCCAACAGTAGCAACACCTTATGGCCAGAGCCCCTCTTCAGCCTCGTCAGTGGGCTGGTGGGCATGGCTAATGCACCTCCC---ACCTCTACGCCTTCTTCATCAGCA------CCA------TCCTCCTCCTCGCAGAGCCCCTCTCTGAGCTGTTCTGTTCAAGCC---------AGCGAGAACAGTCCAATTTATTCAGCTGCACCAACTTTTCCCAATTCCAGCTCTGACATTTTCCCTGAACCACAGACCCAGTCCTTTCCCAAC---TCCTCTGGAACCTCTATCCAGTATCCACCACCAGCTTATCCGACTGCTAAAACCAACTTTCAGGTGCCAATGATCCCGGATTACCTGTTCCCTCAGCAACAG---GGTGAGCTCAGTCTTGTTCCAGCTGATCAGAAGCCCTTCCCAGCCCTGGAGAGCAGAGCACAGCAGCCTTCCCTCACGCCACTGTCCACTATTAAGGCGTTTGCTACTCAGACTGGTTCCCAGGAGTTGAAGACTCTCAACACTAACTATCAGTCCCAGCTGATCAAGCCCAGCAGAATGAGGAAATACCCAAACCGTCCCAGCAAGACCCCTCCTCATGAGCGACCCTATGCCTGCCCAGTGGAGTCATGTGACCGGAGATTCTCAAGGTCTGATGAGCTAACGCGGCACATCCGCATCCACACGGGACAGAAACCTTTCCAGTGCCGCATTTGCATGCGCAACTTCAGCAGGAGTGACCATCTGACCACGCACATCCGCACACACACAGGAGAGAAGCCATTTGCCTGTGACATTTGTGGCAGAAAGTTTGCCAGAAGCGATGAGAGGAAGAGACACACTAAAATCCACCTCAGGCAAAAGGACAAGAAAGTAGAAAAAGCAGCTTCGGTCTCAGCTGCT---TCTCCAGTTCCAGCCTATTCATCCTCTGTGACTACATCCTACCATTCCTCCAT{CT}GCC---ACCACTTACCCCTCACCAGTGCGCACAGTGTTTTCCTCCCCTGCTCCCTCTTCCTATCCCTCCCCTGCACATGCCACATTCCCATCCCCTTCTATAGCAACCACTTACCCCTCTGGCACTGCCACTTTTCAGAGCCAAGTGGCCACCTCCTTCTCATCGCCAGGGGTCACCAACAATTTCAGCTCACAGGTGTCCTCGGCACTTTCAGACATGACGTCAG?GATTTGTT-GA--------------GATTA-C-CTTCTCG{AT}ACAGGAAAATTCACCTTTTCCATTGGTAGTATCA----GACATGGAGTCTCC----AACTAC--TCCCCC--------AACACCATAC--GTTGCAAGGCTATTTAGCTTTTCTTT-AAACTTCAACTGCCTGAAACAA-----CTGTCATTT-AAGTTTT--CCACCTCTGTTGAATGACC----TAATTTGCATGGACTGTGGATATAAGTTCAGTATAATTTT--------------------CCCT-GTAAA----CAAT---AGCCTTTT-ATTAGGAAGAAA-GAACTTTTGATTAAGTATGTAGCTGATGTAAATTGTATGTGTGCCATGGTTTTGCTTT-CCTTTAGG-TACTATTGATGT-GAAAAA-------TCTTTGCATATCCATAATGTATTATTTGGAGTTTGCAGGGC----CATATTTTGTAAATGTTAATTCTATTCCGGTGAC-----AATGCTGTAATAAGTTTCAAACTTCTTTGAGAACAGCACTT-ACT----ATATTT-GAGCATGTT-AGAGCGATGCT-ATGTAAA---TATCACC-TGATGAGACA--CTCACAT Treron_vernans ???????????????CCGATAACCTACACGGGCCGCTTTTCCCTAGAGCCGGCCCCCAACAGCAGCAACACCCTGTGGCCAGAGCCCCTCTTCAGCCTCGTC{AG}GCGGGCTGGTGGGCATGGCCAACGCGCCTCCC---ATCTCTACACCTTCTTCATCATCA------CCA------TCCTCCTCCTCGCAGAGCCCCCCTCTGAGCTGCTCTGTCCAAGCC---------AGCGAGAACAGTCCAATTTATTCAGCTGCACCAACTTTCCCCGGTTCCAGCTCTGACATTTTCCCTGAACCGCAGACCCAGTCCTTTCCCACC---CCCTCTGGAGCCCCTATCCAGTATCCACCTCCAGCTTATCCGACTGCTAAAACCAACTTTCAGGTGCCAATGATCCCCGATTACCTGTTCCCTCAGCAACAG---GGGGAGCTCAGTCTTGTTCCGGCTGATCAGAAGCCCTTCCCAGCCCTGGAGACCAGAGCTCAGCAGCCTTCCCTCACGCCGCTGTCCACTATCAAGGCGTTTGCTACTCAGACTGGCTCCCAAGAGTTGAAGACCCTCAACGCTAACTATCAGTCCCAGCTGATCAAGCCCAGCAGGATGAGGAAATACCCAAACCGTCCCAGCAAGACCCCTCCTCACGAGCGACCCTATGCCTGCCCAGTGGAGTC?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TGA-C-CT-CCAGAACAGGAGAAGTCACCTCTACCATTGGTACTATCA----GACATGGAGTCTTC----AATTGC--TTCCCC--------AACACCAGAT--GTTGCAAGGCTGTTTAACTTTTCTTT-AAACTTCAGCTGCCTGAAACAA-----CTGCCATTT-AGGTTTA--CCACCTCTGTTGAATGACT----TAATTTGCATGGACTGTGGGTATAAGTTCAGTATAATTTT--------------------CCCC-GTAAA----CAAT---AGTCTTTT-ATTAGGAAGAAA-GGACTTTTGATTAAGTATGTAGCTGATGTAAATTGTACATGTGCCATGGTTTTGCTTT-CCTTTAGG-TACTATTGATGT-GAAAAA-------TCTTTGCATATCCATATTGTATTATTTGGAGTTTGCAGGGC----CATATTT-GTAAATGTTAATTCTATT-CAGTGAC-----AATGCCGTAATGAATTTCAAACTTCTTTGGGAACAGCACTT-ACT----GTATTT-GAGCATGTT-AGAGTGATGCT-ATGTAAA---TATCACC???????????????????? Trogon_personatus 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Turdus_falklandii 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Turnix_sylvatica 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Tyrannus_tyrannus 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Tyto_alba 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Urocolius_indicus 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