#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on May 22, 2024; 17:32 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Huang C., Sun R., Hu Y., Zeng L., Zhang N., Cai L., Zhang Q., Koch M.A., Al-shehbaz I.A., Edger P.P., Pires J.C., Tan D., Zhong Y., & Ma H. 2015. Resolution of Brassicaceae phylogeny using nuclear genes uncovers nested radiations and supports convergent morphological evolution. Molecular Biology and Evolution, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S18202] BEGIN TAXA; TITLE Taxa; DIMENSIONS NTAX=51; TAXLABELS Aethionema_grandiflorum Aethionema_subulatum Alliaria_petiolata Alyssopsis_mollis Alyssum_alyssoides Arabidopsis_lyrata Arabidopsis_thaliana Barbarea_vulgaris Berteroa_incana Boechera_canadensis Brassica_nigra Brassica_rapa Bunias_orientalis Cakile_maritima Calepina_irregularis Camelina_sativa Capsella_rubella Cardamine_pensylvanica Catolobus_pendulus Chorispora_bungeana Clausia_aprica Cleome_serrulata Cochlearia_pyrenaica Coincya_monensis Diptychocarpus_strictus Erysimum_cheiranthoides Erysimum_cheiri Eutrema_salsugineum Hesperis_matronalis Hirschfeldia_incana Iberis_gibraltarica Iberis_sempervirens Kernera_saxatilis Lepidium_campestre Lepidium_didymum Lobularia_maritima Lunaria_annua Murbeckiella_pinnatifida Noccaea_caerulescens Physaria_newberryi Raphanus_raphanistrum Rorippa_globosa Rorippa_indica Rorippa_sylvestris Schrenkiella_parvula Sinapis_alba Sisymbrium_officinale Smelowskia_tibetica Thlaspi_alliaceum Thlaspi_arvense Turritis_glabra ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M33267] TITLE Brassicaceae_432436_alignment; LINK TAXA = Taxa; DIMENSIONS NCHAR=1488; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Aethionema_subulatum 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Alyssopsis_mollis 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Alyssum_alyssoides 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Arabidopsis_thaliana 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Boechera_canadensis 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Brassica_nigra 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Brassica_rapa CACCTCCTCCTCTGGTTCTTCGCCGCAGCGACCGCAGTGAAGCTCCTCCTAATCCCGTCGTACAGAAGCACCGACTTCGAGGTCCACCGCAACTGGCTCGCGATCACACACTCTCTCCCTCTCTCCGAATGGTACTTCGACGAGACCAGCCAATGGACGCTCGACTACCCTCCTTTCTTCGCCTACTTCGAGCGCTTCCTCTCCTTCTTCGCTCGTCTCCTCGATCCCAAGATCGTGGATCTTCACAAAGGTCTCGATTACAGCGCAGACTCCGTCGTCTACTTCCAGCGCATCACCGTTATCTTCTCCGATCTCTCTCTCCTCCTCGGTGTTTACAGATTGACTCGAAAGGTTGAGACTTTGAAGCGGAACCTGATCTGTGTTCTGGTGGTTTGGTCTCCGGGGCTGTTGATGGTTGATCACGTTCATTTTCAGTACAATGGGTTCTTGCTTGGTTGGTTGTTGCTGTCGGTTTCGTTTCTGCAAGATGGGAGAGATCTGATTGGTGGGTTTCTCTTCGCTGTTGTGTTGTGTTTCAAGCATTTGTTCGCTGTCGCTGCTCCGGTTTACTTCGTTTATCTCCTTAGGCATTACTGCTGGGCCGGTTTAGCTACCGGTTTGCGACGGCTTGTGGCTCTTGGTTCGGTTGTTGTGGCGGTTTTCGCCGCAGCTTTTGGACCGTTTATATACAATGGACAGATACAGCAAGTGATAAGTAGAATGTTTCCTTTTGGGAGAGGGTTGTGTCATGCTTACTGGGCACCTAACTTTTGGGTTTTCTATATAATACTCGATAAAGGTCTTGCCTTTACGCTGCGGAAGCTCGGGTTCGACGTTCAGGTTCCTTCGGCTTCTTTCACTGGAGGTTTAGTTGGGGACTCTTCACCGTTTGCTGTTCTCCCTCAGATCACTCCATTGACAACGTTTGTGATGGTGTTACTTGCCATTACTCCGTGTCTGATCAAAGCTTGGAAGAAACCGCAACCCGGGCTTGTGGGTAGGTGGATTGCTTATGCATATACATGCGGGTTTTTGTTTGGATGGCATGTACATGAGAAAGCGTCGCTTCACTTCACTATCCCACTAGCAATTGTTGCAGTGCAGAGTTTAGAAGATGCTAAACACTACTTCTTGGTTTCCATAGTGTATTGCTACTCGCTCTTTCCACTCTTATATGAGCCGCAGGAGTATCCAATCAAAGTTCTGTTGCTGTTGTTGCACTCCATGGTAATGTGGCTAGGCTTTACGGCTCTATACTCTGACGAGAAGGCGAAGGAGAAGGAGGGTGGTGAAAGCAAGAGCAAGTTTGAGATTGGATGTATTGAGAAGGGTTACCTGATAGGTTTGGTTCTAGTAGAGATAGTGTCTCAGTTCTTGCATCCTTATTTTCTAGGTGACAGATATGCATTTATGCCTTTGATGTTGATCTCGACCTACTGTGCCGTTGGTATCATGTACTCTTGGATTTGGCAGCTTCTTAAGATCCTG Bunias_orientalis 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Cakile_maritima 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Calepina_irregularis 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Camelina_sativa 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Capsella_rubella 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Cardamine_pensylvanica CAGCTTCTGCTATGGTTCTTCGCCGTAGCCACCGCCGTGAAACTACTTCTCATCCCGTCATACAGAAGCACCGATTTCGAAGTCCACCGTAATTGGCTCGCTATCACACATTCTCTCCCACTCACGAAATGGTACTTCGACGAGACGAGTCAATGGACACTCGATTATCCTCCTTTCTTCGCCTACTTCGAACTATTCCTCTCAATTTTCGCGCGTCTCGTCGATCCAAAGATCGTAGATCTCCAATCAGGAATCGATTACAGCTCCGAATCTGTAATTTACTTCCAGCGAATCAGCGTGATCGTCTCGGATCTATGTCTTCTTTACGGTGTTTACAGATTGACTCGAAAATTGGAACCAATGAAGCGAAATCTAATCTGCGCATTGGTGATTTGGTCTCCGGGGCTATTGATGGTAGATCACATTCATTTTCAGTATAATGGATTTCTATTGGGTTGGTTATTGCTTTCGATTTCGTTTCTGCAAGATGGGAGAGATTTGTTGGGTGGATTTTTATTCGCTGTTCTTCTATGTTTTAAACATTTGTTCGCCGTCGCTGCTCCGGTTTACTTCGTTTATCTGCTCAGGCATTATTGCTGGTCCGGTTTAGTTATTGGTTTCCGAAGGCTTGTAACTATTGGTGCGGTGGTTGTGGCGGTTTTTGCTGTTGCTTATGGACCTTTTATCTACTATGGACAGATACAGCAAGTCATAAGTCGAATGTTTCCTTTTGGAAGAGGATTGTGCCACGCATACTGGGCACCTAATTTTTGGGTTTTCTATATAATACTTGACAAAGGGCTTGCCTTTTTGCTACGAAAGCTCGGGTTCGACATTCAGATTCCATCAGCTTCTTTCACCAGCGGGTTAGTTGGGGATTCGTCGCCTTTTGCAGTTCTCCCTGAGGTCACACCTTTGATGACATTTGCAATGGTATTACTTGCTATATCTCCATGTCTCATCAAAGCCTGGAAAAAACCACATCCTGGGCTTATTTCAAGATGGATAGCTTATGCATATACATGCGGTTTTCTGTTTGGATGGCACGTCCATGAGAAAGCATCACTTCACTTCACCATCCCACTTCCAATCGTTGCAGTTCAGAGTCTAGAAGATGCTAAACACTACTTTCTGGTGTCCATAGTTTCTTGCTATTCGCTCTTTCCACTCTTATACGAGCCGCAGGAATACCCGATCAAGGTTCTGTTGCTGTTATTGCACTCTATAGTAATGTGGCTCGCCTTTGCTGCTCAATATACAGACAATAAGGCTCAGAAGAAGGAGGCTGGTGAAATCAAGAGCAAGTTTAGGATTGGATGTTTTGAGAAGAGTTATCTAATGGGTTTGGTTATAGTAGAGATTGTATCTCAATTCTTACATCCGTATTTTCTTGGTGACAGATTACCTTTTTTGCCTTTAATGTTGATCTCGACATATTGTACCGTTGGTATTATGTACTCTTGGATTTGGCAGCTCCGGAGGATCCTG Catolobus_pendulus 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Clausia_aprica 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Cleome_serrulata 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Cochlearia_pyrenaica 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Coincya_monensis 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Diptychocarpus_strictus 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Erysimum_cheiranthoides 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Erysimum_cheiri 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Eutrema_salsugineum 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Hesperis_matronalis CGACTTCTGCTCTGGTTCTTCGCCGTAGCCACCGCCGTGAAACTCCTTCTCATACCGTCGTACAGAAGCACCGATTTCGAGGTCCACCGTAACTGGCTCGCCATCACTCACTCTCTCCCTCTCTCCAAATGGTACTTCGACGAGACCAGCCCATGGACACTCGATTATCCTCCCTTTTTCGCTTACTTCGAACGCTTCCTCTCGATTTTCGCGCGTCTCGTCGATCCCAAGATCGTAGATCTTCAATCAGGACTCAATTACAGCGCCGAATCTGTAATTTACTTCCAACGGATCAGCGTAATCGTCTCAGATCTATCTCTTCTCTACGGTGTTTACAGATTGACTCGAAAATTGGAACCGACTAAGCGAAATCTGATCTGCGCATTGGTGATTTGGTCTCCAGGGCTATTGATCGTAGATCACATTCATTTTCAGTATAATGGATTTCTACTCGGCTGGTTATTGCTTTCGATCTCGGTGCTGCAAGAAGGTAGAGATCTCTTGGGTGGGTTTCTATTCGCTGTTCTTCTATGCTTCAAACATTTGTTCGCCGTCGCTGCTCCGGTTTACTTCGTTTATCTCCTCAGGCATTATTGTTGGTCCGGTTTCGCTACCGGTTTCCGACGGCTTGTAACTATTGGTACGGTGGTTGTGGCGGTTTTTGCCGCCGCTTTTGGACCATTCATCTACCATGGACAGATACAGCAAGTTATAACTCGAATGTTTCCTTTTGGGAGAGGATTGTGCCATGCATACTGGGCACCTAACTTTTGGGTTTTCTATATAATACTAGACAAAGGTCTTGCCTTTTTACTACGAAAGCTCGGTTACGAAATTCAGATTCCTTCCGCTTCTTTCACTGGCGGTTTAGTTGGTGATTCTTCACCTTTCGCAGTTCTCCCTCAGATCACTCCATTGATCACATTTGCAATGGTATTACTCGCTGTAACACCGTGTCTCGTCAAGGCTTGGCGAAAACCACAGCCCGGGCTTGTTGCTAGATGGATAGCTTATGCATATACATGCGGGTTTCTATTTGGATGGCACGTCCACGAAAAAGCATCGCTTCACTTCACTATCCCGCTTGCAATCGTCGCAGTACAGAGCCTAGAAGATGCTAAACACTACTTTCTTGTTTCCATAGTTTCTTGCTATTCGCTTTTTCCACTCTTATACGAACCACAAGAGTACCCGATTAAGGTTCTGTTACTGTTATTACACTCCATGGTAATGTGGCTCGGCTTTACGGCTCAATACACAAACGATAAGGTTAAGAAGAAGAAGAATGGTGAAATCAAGAGTAAGTTTGTGATTGGATGTTTTGAGAAAAGCTATTTGATGGGTTTGGTTATAGTTGAGATTGTGTCTCAGTTCTTGCATCCGTATTTTCTAGGTGATAAATTTCAATTTATGCCTTTAATGTTGATCTCAACATATTGTGCATTTGGTATTATGTATTCTTGGATTTGGCAGCTCAAGAGGATCTTA Hirschfeldia_incana 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Iberis_gibraltarica 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Iberis_sempervirens 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Kernera_saxatilis 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Lepidium_campestre 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Lepidium_didymum 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Lobularia_maritima 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Lunaria_annua 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Murbeckiella_pinnatifida 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Noccaea_caerulescens 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Physaria_newberryi 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Raphanus_raphanistrum 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Rorippa_globosa 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Rorippa_indica 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Sisymbrium_officinale 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Smelowskia_tibetica 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Thlaspi_alliaceum 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Turritis_glabra 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