#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on May 17, 2024; 9:46 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Hudspeth D., Nadler S., & Hudspeth M. 2000. A COX2 molecular phylogeny of the Peronosporomycetes. Mycologia, 92(4): 674-684. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S616] BEGIN TAXA; TITLE cox2_nuc_ML; DIMENSIONS NTAX=18; TAXLABELS Achlya Aphanomyces Apodachlya Cyanidium Dictyuchus Hyphochytrium Lagenidium Leptolegnia Leptomitus Peronophythora Phytophthora Plectospira Prototheca Pythiopsis Pythium Saprolegnia Sapromyces Thraustotheca ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M3611] TITLE cox2_nuc; LINK TAXA = cox2_nuc_ML; DIMENSIONS NCHAR=581; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Achlya AGCTACACCAGTAATGGAAGGTATAATTAATTTTCATCATGATTTAGTTTTTTTTTTAGTATTAATTGTAATATTTGTTAGTTGGATTTTAGCTAGATGTATTTTTTTTTTTAATGAAAATACCAATAAAAAAGCTGAAACTTTTGTACACGGTACTGTTTTAGAAATCGTATGGACAATAACTCCAGCACTTATTTTAATTATTATAGCTATTCCCTCTTTTTCTTTATTATATGCTATGGATGAAGTAATTGATCCTGTTTTAACAGTAAAGGTAATAGGAAGTCAATGGTATTGGAGTTATGAATATTCAGATGCT---------GTTGAGGATTCTATTTTTTTCGATAGTTATATGATTTTAGATGAAGATTTAGATAAAGGACAATTCCGTCTATTAGAAGTAGATAATCGTGTAGTGGTGCCTACTAATACCCATGTACGTTTAATAGTTACAGCGACTGATGTATTACATTCTTGGGCTGTACCTTCTTTAGGAGTAAAATTAGATGCATGTCCAGGTAGATTAAATCAAACTTCTATTTTTATTAAACGTGAAGGTGTTTTTTATGGTCAAT Aphanomyces 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