#NEXUS
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TreeBASE (cc) 1994-2008

Study reference:
Lee J., & Lim Y. 2009. Cerrena aurantiopora sp. nov. (Polyporaceae) from East Asia.
Mycologia, 102(1): 211-216.

TreeBASE Study URI:  http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S10059]

BEGIN TAXA;
        TITLE  M4545;
        DIMENSIONS NTAX=12;
        TAXLABELS
            Cerrena_aurantiopora_FJ821531
            Cerrena_aurantiopora_FJ821532
            Cerrena_aurantiopora_FJ821533
            Cerrena_consors_FJ821527
            Cerrena_consors_FJ821528
            Cerrena_consors_FJ821529
            Cerrena_consors_FJ821530
            Cerrena_unicolor_FJ821534
            Cerrena_unicolor_FJ821535
            Cerrena_unicolor_FJ821536
            Cerrena_unicolor_FJ821537
            Pseudolagarobasidium_acaciicola_DQ517883
            ;
END;

BEGIN CHARACTERS;
[! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M4434]

	TITLE 'Fig 2(B)';
	LINK TAXA = M4545;
	DIMENSIONS NCHAR=559;
	FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -;

MATRIX
[                                                    10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220       230       240       250       260       270       280       290       300       310       320       330       340       350       360       370       380       390       400       410       420       430       440       450       460       470       480       490       500       510       520       530       540       550       560     ]
[                                                     .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .     ]
Cerrena_aurantiopora_FJ821531                GGCAGAGTTGTAGCTGGTCCTAATCGGACATGTGCACACTTTGTTCATTCCAATTCTCATATACCTCTGTGCACTTTTCATAGGTTTAATGTGGAAAAGGTCTCT--------GGCCTTGGAAATATTATCCTATGTATTT-ACAAACGCTTTAGTTTTAGAATGTCATCCGCGTATAACGCAATAAATACAACTTTCAGCAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCCCCTTGGTATTCCGAGGGGCATGCCTGTTTGAGTGTCATGGTATTCTCAATACCCTAAATCTTTGCGGATGAAGGTGTATTGGACTTGGAGGTTTTTGCAGGCACTATTACTTTGTCTGCTCCTCTTAAATACATTAGCAGAGATATTACTGCTACTCTCCAGTGTGATAATTGTCTACGCTGTTAGTAGTGCGGTATA-TAAACATCTATGCTTCTAATCGTCTTCGGACAACT--TTTGACATCTGACCT
Cerrena_aurantiopora_FJ821532                GGCAGAGTTGTAGCTGGTCCTAATCGGACATGTGCACACTTTGTTCATTCCAATTCTCATATACCTCTGTGCACTTTTCATAGGTTTAATGTGGAAAAGGTCTCT--------GGCCTTGGAAATATTATCCTATGTATTT-ACAAACGCTTTAGTTTTAGAATGTCATCCGCGTATAACGCAATAAATACAACTTTCAGCAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCCCCTTGGTATTCCGAGGGGCATGCCTGTTTGAGTGTCATGGTATTCTCAATACCCTAAATCTTTGCGGATGAAGGTGTATTGGACTTGGAGGTTTTTGCAGGCACTATTACTTTGTCTGCTCCTCTTAAATACATTAGCAGAGATATTACTGCTACTCTCCAGTGTGATAATTGTCTACGCTGTTAGTAGTGCGGTATA-TAAACATCTATGCTTCTAATCGTCTTCGGACAACT--TTTGACATCTGACCT
Cerrena_aurantiopora_FJ821533                GGCAGAGTTGTAGCTGGTCCTAATCGGACATGTGCACACTTTGTTCATTCCAATTCTCATATACCTCTGTGCACTTTTCATAGGTTTAATGTGGAAAAGGTCTCT--------GGCCTTGGAAATATTATCCTATGTATTT-ACAAACGCTTTAGTTTTAGAATGTCATCCGCGTATAACGCAATAAATACAACTTTCAGCAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCCCCTTGGTATTCCGAGGGGCATGCCTGTTTGAGTGTCATGGTATTCTCAATACCCTAAATCTTTGCGGATGAAGGTGTATTGGACTTGGAGGTTTTTGCAGGCACTATTACTTTGTCTGCTCCTCTTAAATACATTAGCAGAGATATTACTGCTACTCTCCAGTGTGATAATTGTCTACGCTGTTAGTAGTGCGGTATA-TAAACATCTATGCTTCTAATCGTCTTCGGACAACT--TTTGACATCTGACCT
Cerrena_consors_FJ821527                     GGCAGAGTTGTAGCTGGTCCTAATCGGACATGTGCACACTTTGTTCATTCCAATTCTCATACACCTCTGTGCACTTTTCATAGGTTTAATGTGGAAAAGGTCTCT--------GGCCTTGGAAATATTAGCCTATGTATTT-ACAAACGCTTTAGTTTTAGAATGTCAATCGCGTATAACGCAATAAATACAACTTTTAGCAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCCCCTTGGTATTCCGAGGGGCATGCCTGTTTGAGTGTCATGGTATTCTCAATACCCTAAATCTTTGCGGATGAGGGTGTATTGGACTTGGAGGTTTTTGCAGGCAATATTACTTTGTCGGCTCCTCTTAAATACATTAGCAGAGATATTACTGCTACTCTCCAGCGTGATAATTGTCTACGCTGTTAGTAGTGCGGTATA-TAAACATCTATGCTTCTAATCGTCTTCGGACAATT-CTTTGACATCTGACCT
Cerrena_consors_FJ821528                     GGCAGAGTTGTAGCTGGTCCTAATCGGACATGTGCACACTTTGTTCATTCCAATTCTCATACACCTCTGTGCACTTTTCATAGGTTTAATGTGGAAAAGGTCTCT--------GGCCTTGGAAATATTAGCCTATGTATTT-ACAAACGCTTTAGTTTTAGAATGTCAATCGCGTATAACGCAATAAATACAACTTTTAGCAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCCCCTTGGTATTCCGAGGGGCATGCCTGTTTGAGTGTCATGGTATTCTCAATACCCTAAATCTTTGCGGATGAGGGTGTATTGGACTTGGAGGTTTTTGCAGGCAATATTACTTTGTCGGCTCCTCTTAAATACATTAGCAGAGATATTACTGCTACTCTCCAGCGTGATAATTGTCTACGCTGTTAGTAGTGCGGTATA-TAAACATCTATGCTTCTAATCGTCTTCGGACAATT-CTTTGACATCTGACCT
Cerrena_consors_FJ821529                     GGCAGAGTTGTAGCTGGTCCTAATCGGACATGTGCACACTTTGTTCATTCCAATTCTCATACACCTCTGTGCACTTTTCATAGGTTTAATGTGGAAAAGGTCTCT--------GGCCTTGGAAATATTAGCCTATGTATTT-ACAAACGCTTTAGTTTTAGAATGTCAATCGCGTATAACGCAATAAATACAACTTTTAGCAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCCCCTTGGTATTCCGAGGGGCATGCCTGTTTGAGTGTCATGGTATTCTCAATACCCTAAATCTTTGCGGATGAGGGTGTATTGGACTTGGAGGTTTTTGCAGGCAATATTACTTTGTCGGCTCCTCTTAAATACATTAGCAGAGATATTACTGCTACTCTCCAGCGTGATAATTGTCTACGCTGTTAGTAGTGCGGTATA-TAAACATCTATGCTTCTAATCGTCTTCGGACAATT-CTTTGACATCTGACCT
Cerrena_consors_FJ821530                     GGCAGAGTTGTAGCTGGTCCTAATCGGACATGTGCACACTTTGTTCATTCCAATTCTCATACACCTCTGTGCACTTTTCATAGGTTTAATGTGGAAAAGGTCTCT--------GGCCTTGGAAATATTAGCCTATGTATTT-ACAAACGCTTTAGTTTTAGAATGTCAATCGCGTATAACGCAATAAATACAACTTTTAGCAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCCCCTTGGTATTCCGAGGGGCATGCCTGTTTGAGTGTCATGGTATTCTCAATACCCTAAATCTTTGCGGATGAGGGTGTATTGGACTTGGAGGTTTTTGCAGGCAATATTACTTTGTCGGCTCCTCTTAAATACATTAGCAGAGATATTACTGCTACTCTCCAGCGTGATAATTGTCTACGCTGCTAGTAGTGCGGTATA-TAAACATCTATGCTTCTAATCGTCTTCGGACAATT-CTTTGACATCTGACCT
Cerrena_unicolor_FJ821534                    GGCAGAGTTGTAGCTGGCCCCAATCGGGTATGTGCACACTTTGTTCATTCCA-TTCTCATACACCTCTGTGCACTTTTCATAGGTTTAGTTATGGATGAGGCACTTTTATAGTGTCTTGGAAGTGACTATCCTATGTATTTTACAAACGCTTCAGTTTTAGAATGTCATTCGCGTATAACGCAATAAATACAACTTTCAGCAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCCCCTTGGTATTCCGAGGGGCATGCCTGTTTGAGTGTCATGGTATTCTCAATACCCTAAATCTTTGCGGATGAGGGTGTATTGGATTTGGAGGTTTTTGCAGGCAATATT-CATTGTCAGCTCCTCTTAAATACATTAGCAGAGATATTACTGCTACTCTCCAGTGTGATAATTGTCTACACTGTTAGTAGTGCGGTATAATCAAAGTCTTTGCTTCTAATCGTCTTCGGACAATT-CTTTGACATCTGACCT
Cerrena_unicolor_FJ821535                    GGCAGAGTTGTAGCTGGCCCCAATCGGGTATGTGCACACTTTGTTCATTCCA-TTCTCATACACCTCTGTGCACTTTTCATAGGTTTAGTTATGGATGAGGCACTTTTATAGTGTCTTGGAAGTGACTATCCTATGTATTTTACAAACGCTTCAGTTTTAGAATGTCATTCGCGTATAACGCAATAAATACAACTTTCAGCAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCCCCTTGGTATTCCGAGGGGCATGCCTGTTTGAGTGTCATGGTATTCTCAATACCCTAAATCTTTGCGGATGAGGGTGTATTGGATTTGGAGGTTTTTGCAGGCAATATT-CATTGTCAGCTCCTCTTAAATACATTAGCAGAGATATTACTGCTACTCTCCAGTGTGATAATTGTCTACACTGTTAGTAGTGCGGTATAATCAAAGTCTTTGCTTCTAATCGTCTTCGGACAATT-CTTTGACATCTGACCT
Cerrena_unicolor_FJ821536                    GGCAGAGTTGTAGCTGGCCCCAATCGGGTATGTGCACACTTTGTTCATTCCA-TTCTCATACACCTCTGTGCACTTTTCATAGGTTTAGTTATGGATGAGGCACTTTTATAGTGTCTTGGAAGTGACTATCCTATGTATTTTACAAACGCTTCAGTTTTAGAATGTCATTAGCGTATAACGCAATAAATACAACTTTCAGCAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCCCCTTGGTATTCCGAGGGGCATGCCTGTTTGAGTGTCATGGTATTCTCAATACCCTAAATCTTTGCAGATGAGGGTGTATTGGATTTGGAGGTTTTTGCAGGCAATATT-CATTGTCAGCTCCTCTTAAATACATTAGCAGAGATATTACTGCTACTCTCCAGTGTGATAATTGTCTACACTGTTAGTAGTGCGGTATAATCAAAGTCTTTGCTTCTAATCGTCTTCGGACAATT-CTTTGACATCTGACCT
Cerrena_unicolor_FJ821537                    GGCAGAGTTGTAGCTGGCCCCAATCGGGTATGTGCACACTTTGTTCATTCCA-TTCTCATACACCTCTGTGCACTTTTCATAGGTTTAGTTATGGATGAGGCACTTTTATAGTGTCTTGGAAGTGACTATCCTATGTATTTTACAAACGCTTCAGTTTTAGAATGTCATTCGCGTATAACGCAATAAATACAACTTTCAGCAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCCCCTTGGTATTCCGAGGGGCATGCCTGTTTGAGTGTCATGGTATTCTCAATACCCTAAATCTTTGCGGATGAGGGTGTATTGGATTTGGAGGTTTTTGCAGGCAATATT-CATTGTCAGCTCCTCTTAAATACATTAGCAGAGATATTACTGCTACTCTCCAGTGTGATAATTGTCTACACTGTTAGTAGTGCGGTATAATCAAAGTCTTTGCTTCTAATCGTCTTCGGACAATT-CTTTGACATCTGACCT
Pseudolagarobasidium_acaciicola_DQ517883     GACAGGGTTGTTGCTGGCCCTTACTGGGCATGTGCACACTTTGTACATTCCAATTCT--TACACCTCTGTGCACTTTTCATAGATTTAGTGTGGAAG{AG}GATCTTTTT------GATCTTGGAAATGCTGGATCTGTGTTTTTACAAACGCTTTAGTATTAGAATGTCATCTGCGAATAACGCAATAAATACAACTTTCAGCAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCCCCTTGGTATTCCGAGGGGCATGCCTGTTTGAGTGTCATGGTATTCTCAATACCCTACATCTTTGCGGATGAAGGTGTATTGGATTTGGAGGTTTATGTTGGCTCTCTTGAGA-GTCAGCTCCTCTTAAATGTATTAGCAGAGATGTTACTGCTACTCTCCAGTGTGATAATTGTCTACACTGTTAGTAGTGCAGT{AG}AAAATTAAGTCTATGCTTCTAATCGTCTTCGGACAGTTT-TTTGACATCTGACCT
;
END;

BEGIN CODONS;
CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = 'Fig 2(B)') = 
		N: 1-559;
CODONPOSSET  CodonPositions (CHARACTERS = 'Fig 2(B)') = 
		N: 1-559;
END;