#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 20, 2024; 1:52 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Jaklitsch W.M. 2009. European species of Hypocrea Part I. Studies in Mycology, 63(1): 1-91. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S10085] BEGIN TAXA; TITLE M4599; DIMENSIONS NTAX=137; TAXLABELS Aphysiostroma_stercorarium Hypocrea_aeruginea Hypocrea_alcalifuscescens Hypocrea_alni Hypocrea_alutacea Hypocrea_americana Hypocrea_atrogelatinosa Hypocrea_atroviridis Hypocrea_aureoviridis Hypocrea_avellanea Hypocrea_brunneoviridis Hypocrea_candida Hypocrea_catoptron Hypocrea_ceracea Hypocrea_ceramica Hypocrea_chlorospora Hypocrea_chromosperma Hypocrea_cinereoflava Hypocrea_cinnamomea Hypocrea_citrina Hypocrea_costaricensis Hypocrea_crassa Hypocrea_cremea Hypocrea_crystalligena Hypocrea_cuneispora Hypocrea_dacrymycella Hypocrea_danica Hypocrea_decipiens Hypocrea_delicatula Hypocrea_dorotheae Hypocrea_epimyces Hypocrea_estonica Hypocrea_eucorticioides Hypocrea_flaviconidia Hypocrea_fomiticola Hypocrea_gelatinosa Hypocrea_jecorina Hypocrea_koningii Hypocrea_leucopus Hypocrea_lixii Hypocrea_longipilosa Hypocrea_lutea Hypocrea_megalocitrina Hypocrea_melanomagna Hypocrea_microcitrina Hypocrea_minutispora Hypocrea_moravica Hypocrea_neorufa Hypocrea_nigrovirens Hypocrea_novaezelandiae Hypocrea_nybergiana Hypocrea_ochroleuca Hypocrea_pachybasioides Hypocrea_parapilulifera Hypocrea_parepimyces Hypocrea_parestonica Hypocrea_parmastoi Hypocrea_petersenii Hypocrea_phyllostachydis Hypocrea_pilulifera Hypocrea_placentula Hypocrea_protopulvinata Hypocrea_pseudostraminea Hypocrea_psychrophila Hypocrea_pulvinata Hypocrea_rodmanii Hypocrea_rogersonii Hypocrea_rufa Hypocrea_schweinitzii Hypocrea_semiorbis Hypocrea_seppoi Hypocrea_sinuosa Hypocrea_sp.1 Hypocrea_sp.10 Hypocrea_sp.11 Hypocrea_sp.12 Hypocrea_sp.13 Hypocrea_sp.14 Hypocrea_sp.15 Hypocrea_sp.16 Hypocrea_sp.17 Hypocrea_sp.18 Hypocrea_sp.2 Hypocrea_sp.3 Hypocrea_sp.4 Hypocrea_sp.5 Hypocrea_sp.6 Hypocrea_sp.7 Hypocrea_sp.8 Hypocrea_sp.9 Hypocrea_spinulosa_CBS121272 Hypocrea_spinulosa_CBS121280 Hypocrea_spinulosa_CBS311.50 Hypocrea_stilbohypoxyli Hypocrea_straminea Hypocrea_strictipilosa Hypocrea_subalpina Hypocrea_sulawesensis Hypocrea_sulphurea Hypocrea_surrotunda Hypocrea_tawa Hypocrea_thailandica Hypocrea_thelephoricola Hypocrea_tremelloides Hypocrea_victoriensis Hypocrea_virens Hypocrea_virescentiflava Hypocrea_viridescens Hypocrea_voglmayrii Protocrea_farinosa Protocrea_pallida Trichoderma_aggressivum Trichoderma_arundinaceum Trichoderma_asperellum Trichoderma_austrokoningii Trichoderma_brevicompactum Trichoderma_cerinum Trichoderma_erinaceus Trichoderma_fertile Trichoderma_hamatum Trichoderma_helicum Trichoderma_intricatum Trichoderma_koningiopsis Trichoderma_longibrachiatum Trichoderma_oblongisporum Trichoderma_ovalisporum Trichoderma_paucisporum Trichoderma_protrudens Trichoderma_pubescens Trichoderma_rossicum Trichoderma_saturnisporum Trichoderma_scalesiae Trichoderma_spirale Trichoderma_strigosum Trichoderma_stromaticum Trichoderma_theobromicola Trichoderma_tomentosum ; END; BEGIN CHARACTERS; [! 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Trichoderma_hamatum ??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TGGGGTGACCAGAAGAAGGCAATGAGCTCGACTGCAGGTGTATCACAGGTGCTTAACCGTTACACTTTTGCCTCGACACTTTCTCATTTGCGTCGTACCAACACACCCATTGGAAGAGATGGTAAGCTGGCGAAGCCTCGACAGCTTCACAACACACATTGGGGTTTGGTGTGCCCAGCCGAGACCCCCGAAGGACAAGCTTGTGGTCTGGTCAAAAACTTGTCTCTGATGTGCTACGTCAGTGTCGGATCTCCTTCTGAGCCTTTGATCGAGTTTATGATCAATAGGGGTATGGAGGTTGTTGAGGAGTACGAACCACTGAGGTATCCCCATGCTACAAAGATCTTTGTGAATGGTGTCTGGGTTGGAATCCACCA-AGACCCCAAG-CATCTGGTAAACCAAGTTTTGGACACTCGTCGTAAATCCTATCTGCAGTACGAAGTCTCTCTGATCAGAGATATTCGTGACCAAGAATTCAAAATCTTCTCTGACGCCGGTCGTGTTATGCGTCCTGTCTTTACTGTACAGCAAGAAGATGACCCGGAAACGGGTATCAACAAGGGCCACTTGGTATTGACCAAGGACCTCGTCAACAGACTTGCCAAAGAGCAGGCTGAGCCTCCAGAAGACCCAAGCATGAAGCTTGGATGGGAGGGGTTAATTAGGGCTGGTGCGGTGGAATATCTCGACGCCGAGGAAGAAGAAACGGCTATGATTTGCATGACACCGGAGGATCTTGAACTTTATCGTCTTCAGAAGGCTGGTATTTCCACGGATGAAGACATGGGAGACGATCCAAACAAGCGTCTTAAGACCAAGACAAATCCGACAACTCACATGTACACGCATTGCGAGATTCACCCAAGTATGATCTTAGGTATCTGTGCTAGTATCATTCCTTTC??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????AGCTCATTGTTGCCATCAACAAGATGGACACTGCCAACTGGGCCGAGGCTCGTTACCTTGAGATCATCAAGGAGACCTCCAACTTCATCAAGAAGGTCGGCTTCAACCCCAAGACCGTTGCCTTTGTCCCCATCTCTGGCTTCAACGGTGACAACATGCTCCAGGCCTCCACCAACTGCCCCTGGTACAAGGGTTGGGAGAAGGAGACCAAG---GCTGG---CAAGTCCACCGGTAAGACCCTCCTCGAGGCCATTGACGCCATCGAGCCCCCCAAGCGTCCCACAGACAAGCCCCTCCGTCTGCCCCTTCAGGATGTCTACAAGATCGGTGGTATCGGAACAGTCCCTGTCGGCCGTATCGAGACTGGTATCCTCAAGCCCGGTATGGTCGTTACCTTCGCTCCTTCCAACGTCACCACTGAAGTCAAGTCCGTCGAGATGCACCACGAGCAGCTCGTTGAGGGTGTCCCCGGTGACAACGTTGGATTCAACGTCAAGAACGTCTCCGTCAAGGATATCCGCCGTGGTAACGTTGCCGGTGACTCCAAGAACGACCCCCCCATGGGTGCCGCTTCTTTCAACGCCCAGGTCATCGTCATGAACCACCCTGGCCAGGTCGGTGCCGGATACGCTCCC-GTCCTCGATTGCCACACTGCCCACATTGCCTGCAAGTTCTCTGAGCTCCTCGAGAAGATCGACCGC????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 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Trichoderma_theobromicola ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????AGACGATGTGTTGAGGGTAACCGCCACTTCAACCTTGCTGTTGGCATCAAGCCCGGCACGCTCTCCAACGGTTTGAAGTACTCACTCGCCACCGGAAACTGGGGTGACCAGAAAAAGGCAATGAGCTCGACCGCAGGTGTATCACAGGTGCTTAACCGTTACACTTTTGCTTCGACACTTTCACATTTGCGTCGTACCAACACACCCATCGGAAGAGATGGTAAGCTGGCGAAGCCTCGACAGCTTCACAATACACACTGGGGTTTGGTGTGCCCGGCCGAGACGCCTGAAGGACAAGCTTGTGGTCTGGTCAAAAACTTGTCTCTAATGTGCTACGTCAGTGTCGGATCTCCTTCTGAGCCTTTGATCGAGTTTATGATCAACAGAGGTATGGAGGTCGTTGAAGAGTACGAACCACTGAGATATCCCCATGCGACAAAGATCTTTGTGAATGGTGTCTGGGTTGGAATCCACCA-AGACCCCAAG-CATCTGGTGAACCAAGTCCTGGATACTCGTCGTAAATCCTATCTGCAGTACGAAGTCTCTCTGATCAGAGATATTCGTGACCAAGAATTCAAAATCTTCTCTGACGCCGGTCGTGTTATGCGTCCTGTCTTTACCGTACAGCAAGAAGATGACCCGGAAACGGGCATCAACAAGGGCCACCTGGTTTTGACCAAGGATCTCGTCAATAGACTGGCCAAAGAGCAGGCTGAGCCTCCGGAAGACCCAAGCATGAAGCTTGGATGGGAGGGGTTAATTAGGGCTGGTGCGGTGGAATATCTTGATGCCGAGGAAGAAGAAACGGCTATGATTTGCATGACACCGGAGGATCTTGAGCTTTATCGTCTTCAGAAGGCTGGTATTTCCACGGATGAAGACATGGGAGACGATCCAAACAAG??????????????????????????????----????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 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