#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on May 10, 2024; 13:04 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Warwick S., Mummenhoff K., Sauder C., Koch M., & Al-shehbaz I. 2010. Closing the gaps: Phylogenetic relationships in the Brassicaceae based on DNA sequence data of nuclear ribosomal ITS region. Plant Systematics and Evolution, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S10299] BEGIN TAXA; TITLE M5130; DIMENSIONS NTAX=186; TAXLABELS Aethionema_arabicum Aethionema_grandiflorum Alyssopsis_mollis Alyssopsis_trinervis Alyssum_montanum Ammosperma_cinerea Anastatica_hierochuntica Anchonium_billardieri Aphragmus_eschscholtzianus Aphragmus_hobsonii Aplanodes_doidgeana Arabis_alpina Arcyosperma_primulifolium Asperuginoides_axillaris Asta_schaffneri Asta_schaffneri_var._pringlei Aubrieta_deltoidea Baimashania_pulvinata Berteroa_incana Biscutella_didyma Biscutella_laevigata Bivonaea_lutea Boechera_retrofracta Boreava_aptera Boreava_orientalis Brassica_oleracea Braya_alpina Brayopsis_colombiana Brossardia_papyracea Bunias_erucago Bunias_orientalis Cakile_maritima Calepina_irregularis Callothlaspi_lilacinum Calymmatium_draboides Camelina_microcarpa Cardamine_pratensis Carinavalva_glauca Catenulina_hedysaroides Chalcanthus_renifolius Chamira_circaeoides Chartoloma_platycarpum Chaunanthus_acuminatus Chlorocrambe_hastata Chorispora_tenella Chrysochamela_velutina Cithareloma_lehmannii Clausia_aprica Cleome_lutea Cochlearia_megalosperma Coluteocarpus_vesicaria Conringia_clavata Crambe_maritima Cremolobus_chilensis Cymatocarpus_pilosissimus Cyphocardamum_aretioides Delpinophytum_patagonicum Descurainia_sophia Desideria_flabellata Didesmus_aegyptius Didesmus_bipinnatus Dielsiocharis_kotschyi Dipoma_iberideum Diptychocarpus_strictus Dontostemon_integrifolius Doupea_tortuosa Draba_aizoides Eigia_longistyla Elburzia_fenestrata Eremodraba_intricatissima Eremophyton_chevallieri Erysimum_capitatum Erysimum_cheiranthoides Eudema_nubigena_subsp_nubigena Eunomia_andersonii Eunomia_oppositifolia Eutrema_altaicum Eutrema_edwardsii Fezia_pterocarpa Foleyola_billotii Gagria_lobata Goldbachia_laevigata Halimolobos_lasiolobus Heldreichia_bupleurifolia Heliophila_arenaria Heliophila_subulata Henophyton_deserti Hesperidanthus_jaegeri Hesperidanthus_linearifolius Hesperidanthus_suffrutescens Hesperis_matronalis Hesperis_siberica Hirschfeldia_incana Hornungia_petraea Horwoodia_dicksoniae Iberis_amara Iberis_spathulata Idahoa_scapigera Iodanthus_pinnatifidus Ionopsidium_acaule Isatis_tinctoria Kernera_saxatilis Kotschyella_stenocarpa Lachnocapsa_spathulata Lachnoloma_lehmannii Leavenworthia_crassa Lepidium_latifolium Lepidostemon_glaricola Lithodraba_mendocinensis Lunaria_redeviva Malcolmia_triloba Mathewsia_foliosa Matthiola_incana Matthiola_sp. Megacarpaea_delavayi Megacarpaea_gracilis Megadenia_pygmaea Menonvillea_cuneata Microlepidium_pilosulum Moriera_spinosa Murbeckiella_huetii Myagrum_perfoliatum Nasturtiopsis_coronopifolia Nasturtium_officinale Neotorularia_torulosa Noccaea_fendleri Noccea_cochleariformis Noccidium_hastulatum Notothlaspi_australe Notothlaspi_rosulatum Ochthodium_aegyptiacum Octoceras_lehmannianum Oreophyton_falcatum Ornithocarpa_torulosa Pachypterygium_brevipes Parlatoria_rostrata Pegaeophyton_scapiflorum Peltaria_alliacea Peltariopsis_planisiliqua Pennellia_longifolia Petrocallis_pyrenaica Phaeonychium_jafrii Phlebolobium_maclovianum Phoenicaulis_cheiranthoides Physaria_didymocarpa Physocardamum_davisii Planodes_virginicum Pseuderucaria_teretifolia Pseudoarabidopsis_toxophylla Pseudofortuynia_esfandiarii Pseudosempervivum_aucheri Pseudovesicaria_digitata Pycnoplynthopsis_bhutanica Pyconplinthus_uniflora Rhizobotrya_alpina Ricotia_cretica Robeschia_schimperi Sameraria_nummularia Sandbergia_whitedii Sarcodraba_dusenii Schimpera_arabica Schizopetalon_walkeri Selenia_dissecta Shangrilaia_nana Sibaropsis_hammittii Sisymbrella_aspera Sisymbrium_altissimum Sisymbrium_septulatum Smelowskia_alba Smelowskia_jacutica Sobolewskia_caucasica Spryginia_winkleri Stubendorffia_gracilis Subularia_monticola Synthlipsis_greggii Tauscheria_lasiocarpa Tchihatchewia_isatidea Teesdalia_nudicaulis Thelypodium_laciniatum Thlaspi_arvense Tropidocarpum_gracile Vania_campylophylla Xerodraba_pectinata Yinshania_acutangula Yinshania_acutangula_sp_wilsonii Zuvanda_crenulata ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M4828] TITLE Brassicaceae_ITS; LINK TAXA = M5130; DIMENSIONS NCHAR=773; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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TCGATA-CCT-GTCCA-AAACAGAACGA-CCCGCGAACCAACGA-TCATCAC---TCGCGGTGGG--CC-GG-TTT--CTTAACT-GAT-CCCGT-GCT-TGCC-GGAT---CCGTGGTTT----CGCGTTCT-GTTCCAG-TCGGG---------AGCTC-------------TA--TC--TTG--ACT-GG--------TTCG---TGC--GC-GTAGCTTCCGGATAT--CACAAAACCC-CGG-CACGAAAAG-TGTCAAGGAACA-TGCAACAG---AACGGCCA--TCT-TTTTGCCTC---CCCGGAGACGGTGCGA--GTGCGG-ATGA-TGCGCTGTGAT--CT-AAAGTCTAAAA-CGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATG-CGATACTTGGTGTGAATTGCAG-AATCCCGTGAACCA--TCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCG-CCCCAAGCCTTC-TGGCCGAGGGCACGTCTG-CCTGGGTGTCACAAAT-CGTC-GTCCCCCC-------------AATCC-TT-T------ACGGATA-------------ATGG-GACGGA----AGCTGGTCT-CCCGTGTGTTACCGCACGCGG-TTGGCCAAAA-TCC-GAGCCAA-GGAT-GCCT----TGAGCGTT-CCGA-CA-TGCGGTGGTGA-GTTTAAC-AAGC--TGCTT--TATATG-TTGG--TCGTTCTT---GTC---CGAAAGCTCTT Desideria_flabellata 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TCG-TACCCT-GG----AAACAGAACAA-CCCGAGAACGA-TGAAACATCAC---TCCCGGCGGG--CC-GG-TCT--CTTAGCC-GAT-TCCAC-GCC-CGCC-GATT---CCGTGGTTA----TGCGAGTC-GACCCCG-TCCGG---------GATAT-------------CCG-TC--TCG--GTC-GG--------ATCT---CGC--GC-ATAGCTTCCGGATCT--CACAAAACCC-CGG-CACGAGAAG-TGTCAAGGAACA-TGCAACTA---AACAGCCT--GCT-TCC-GCCGA---CCCGGAGACGGTGTAT--GCGCGG-AAGC-CGTGCTGGAA---CT-AAAGTCTAAAA-CGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATG-CGATACTTGGTGTGAATTGCAG-AATCCCGTGAACCA--TCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCG-CCCCAAGCCTTC-TGGCCGAGGGCACGTCTG-CCTGGGTGTCACAAAT-CGTC-GTCCCCCC-------------CATCC-TC-CC-----GAGGATG--------------CCG-GACGGA----AGCTGGTCT-CCCGTGTGTTACCGCACGCGG-TTGGCCAAAA-TCC-GAGCAGA-GGAT-GCCA----CGAGCGTC-CCGA-CA-TGCGGTGGTGAATTT-ATT---CC--TCGTCA-TAA-TG-TCGG--TCGCTCGG---GTC---CGAAAGCTCTC Didesmus_bipinnatus 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TCGTCA-CCT-CTCCA-AAACAGAACAA-CCCGCGAACCACTGA-TCATCAC---TCTCGGTAAG--CT-GG-GTT--CTTAGCT-GAT-CCCGA-GCT-TGCC-GATT---CCGTGGTTT----CGTGTAGT-TTCCCTT-ATGGG-------------------------------------------------------TTA---TGC--GC-GTAGCTTCCGGATAT--CACAAAACCC-CGG-CACGAAAAG-TGTCAAGGAACA-TGCAACTA---AACAGCCT--GCC-TTC-GCCAC---CCTGGAGACGGGTTGT--GTGCGG-AAGC-TGTGCTGCAAT--AT-TAAGTCTATAA-CGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATG-CGATACTTGGTGTGAATTGCAG-AATCCCGTGAACCA--TCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCG-CCCCAAGCCTTC-TGGCCGAGGGCACGTCTG-CCTGGGTGTCACAAAA-CGTC-GTCCC----------------CATCC-TT-T------TCGGAGA--------------AAG-GACGGA----AGCTGGTCT-CCCGTGTGTTACCGCATGCGG-TTGGCCAAAA-TCC-GAGCTGA-GGAT-GCCT----TGAGCGTC-TCGA-CA-TGCGGTGGTGAAGTA-AAG---CC--TCGTAA-TAT-TG-TCGG--TCGTTTTA---GTC---TGAATGCTCTT Dipoma_iberideum 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TCG-TATCCT-GG----AAACAGAACAA-CCCGTGAACGA-TGAAACATCAC---TCCCGGTTGG--CC-GG-TTT--CTTAGCT-GAT-TCCGT-GCC-TGCC-GATT---CCGTGGTTA----TGCTTGTC-GTCCCCA-TCCAA---------GATTT-------------CTG-TC--TCG--GTT-GG--------ATCG---TCC--GC-ATAGCTTCCGGATAT--CACCAAACCC-CGG-CACGAAAAG-TGTCAAGGAACA-TGCAACTA---AACAGCCT--GCT-TTC-GCCAT---CCCGGAGACGGTGTGT--GTGCGG-AAGC-TGTGCTGCAA---CT-AAAGTCTAAAA-CGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATG-CGATACTTGGTGTGAATTGCAG-AATCCCGTGAACCA--TCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCG-CCCCAAGCCTTC-TGGCCGAGGGCA{CT}GTCTG-CCTGGGTGTCACAAAT-CGTC-GTCCCCC--------------CATCC-T--TC-----GAGGATG--------------TTG-GACGGA----AGCTGGTCT-CCCGTGTGTTACCGCACGCGG-TTGGCCAAAA-TCC-GAG{CT}TAA-GGAC-GCAA----GGAGCGTC-TCGA-CA-TGCGGTGGTGAATTC-AAA---CC--TCGTCA-TAC-CG-TCGG--TCGTTCCG---GTC---CGAAAGCTCTC Erysimum_capitatum TCGATA-CCT-GTCCA-AAACAGAACGA-CCCGTGAACTAACGA-TCACTAC---TCACGGTGAG--CC-GG-GTT--CTTAGTC-GAT-CCCGT-GCT-TGCC-GAAT---CCGTGGTTT----CGCATGTT-GTCCAGA-TCGAG---------AGTAA-------------AG--TT--TCG--GTC-TG--------GTCA---TAT--GC-GTTGCTTCCGGATAT--CACAAAACCA-CGG-CACGAAAAG-TGTCAAGGAACA-TATAACCG---AACAGCCT--GCA-TTC-GTCGA---CCCGGAGACGGTGTTT--GTGCGG-ATGT-TGTGCTGCGAT--CT-AAAGTCTAAAA-CGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATG-CGATACTTGGTGTGAATTGCAG-AATCCCGTGAACCA--TCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCG-CCCCAAGCCTTC-TGGCCGAGGGCACGTCTG-CCTGGGTGTCACAAAT-CGTC-GTCCCCCTCT----------TCATCC-AT-T------GCGGAGA--------------TGG-GACGGA----AACTGGTCT-CCCGTGTGTTACCGCACGCGG-TTGGCCAAAA-TTC-GAGCCAA-GGAT-GCTG----GGAGCGTC-CCGA-CA-TGCGGTGGTGAACTC-AAAA--CC----TTCA-TAC-CG-TCGA--TCGCTCAT---GTC---CGAAAGCTCTA Erysimum_cheiranthoides 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---------------------------------------------------C---TCTCGGCGAG--CC-GG-TTT--CTTAGCT-GAT-CTCGC-GCT-TGCC-GATT---CCGTGGTTT----CAAGTATC-GTCCCTT-TCAAG---------A-TTT-------------TA--TC--TCG--TTT-GG--------GTCA---TGC--TC-GTTGCTTCCGGATAT--CACCAAACCC-CGG-CACGAAAAG-TGTCAAGGAACA-TGCAACTA---AACAGCTT--GCG-TTC-GCCTA---CCCGGAGACGGTGTGT--GTGCGG-ACGT-TGTGCTGAAAT--AT-AAAGTCTAAAA-CGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATG-CGATACTTGGTGTGAATTGCAG-AATCCCGTGAACCA--TCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCG-CCCCAAGCCTTC-TGGCCGAGGGCACGTCTG-CCTGGGTGTCACAAAT-CGTC-GTCCCCC--------------CATCC-TC-TC-----GAGGATA--------------CGG-GACGGA----AGTTGGTCT-CCCGTGTGTTACCGCATGCGG-TTGGCCAAAA-TCC-GAGCAAA-GGAC-GCCG----GGAGCGTC-TCGA-CA-TGCGGTGGTGAATTC-AAT---TC--TCGTCA-GAT-TG-TCGG--CCGCTCCT---GTC---CGGAAGCTCTC Eutrema_edwardsii ---------------------------------------------------C---TCTCGGTGAG--CT-GG-TTT--CTTAGCT-GAT-CCTGT-GCT-TGCC-GATT---CCGTGGTTT----CGCGTATT-GTCCCTT-TCAAG---------A-TTT-------------TA--TC--TCG--GCT-TG--------GGCA---TGC--GC-GTTGCTTCCGGATAT--CACAAAACCC-CGG-CACGAAAAG-TGTCAAGGAACA-TGCAACTA---AACAGCTT--GCG-TTC-GCCTA---CCCGGAAACGGTGTGT--GTGCGG-ACGT-TGTGCTGCAAT--CT-AAAGTCTAAAA-CGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATG-CGATACTTGGTGTGAATTGCAG-AATCCCGTGAACCA--TCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCG-CCCTACGCCTTT-GGGCCGAGGGCACGTCTG-CCTGGGTGTCACAAAT-CGTC-GTCCCCC--------------CATCC-TC-TC-----GAGGATA--------------CGG-GACGGA----AGCTGGTCT-CCCGTGTGTTACCGCACGCGG-TTGGCCAAAA-TCC-GAGCAAA-GGAC-GCCG----GGAGCGTC-TCGA-CA-TGCGGTGGTGAATTC-AAT---TC--TCGTCA-AAT-TG-TCGG--TCGTTCCT---GTC---CGGAAGCTCTC Fezia_pterocarpa TCG-TATCCT-GG----AAACAGAACGA-CCCGAGAAC-TTTGAAACATCAC---TCTCGGCGGG--CC-GG-TTT--CTTAGCTTGAT-TCTG--GTC-TCGTCGATT---CTGTGGTTA----TGTGTCTT-GTTCCCA-GTTAA---------GAGTT-------------AAG-TC--TTT--GTT-GGG-------TCTT---TAC--GC-ATAGCTTCCGGATTT--CACAAAACCC-CGG-CACGAGAAG-TGTCAAGGAACA-TGCAACTA---AACAGCCT--GCT-TTC-GCCAA---CTCGGAGACGGTGCTT--GTGTGA-AAGT-CGTGCTGCAAT--AT-AAAGTCTAAAA-CGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATG-CGATACTTGGTGTGAATTGCAG-AATCCCGTGAACCA--TCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCG-CCCCAAGCCTTT-TGGCCGAGGGCACGTCTG-CCTGGGTGTCACAAAT-CGTC-GTCCC----------------CATCC-TA-TC--GATGAGGATT----------------G-GACGGA----AGTTGGTCT-CCCGTGTGTTACCGCACGCGG-TTGTCCAAAA-T{CT}T-GAGCTAA-GGAC-GCTA----GGAGCGTT-CCGA-CA-TGCGGTGGTGAATTC-AAG---CC--TCTTCA-TAT-CG-TCGG--TCGATCTG---GTC---TACAAGCTCTA Foleyola_billotii ---------------------------------------------------C---TCCCGGCGGG--CA-TG-TCT--CTTAGCC-GAT-CT-GT-GCC-TGCC-GGTT---CCGTGGTTA----TGCGTGCC-GTCCATG-TCTTG---------AGGCC------------TTTG-TC--TCG--ATC-TG--------GCCG---TCC--GC-GTAGCTTCCGGATTT--CACAAAACCC-CGG-CACGAAAAG-TGTCAAGGAAAA-CGCAACTA---AACAGCCT--GCT-TTC-GC-AT---CCCGGAGACGGTGTTT--GTGCGG-AAGC-TGTGCTGCGAT--AG-AAAGTCTAAAA-CGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATG-CGATACTTGGTGTGAATTGCAG-AATCCCGTGAACCA--TCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCG-CCCCAAGCCTTC-TGGCCGAGGGCACGTCTG-CCTGGGTGTCACAAAT-CGTC-GTCCCCC--------------CATCC-TC-TC-----GAGGATA--------------TGG--ACGGA----AGCTGGTCT-CCCGTGTGTTACCGCACGCGG-TTGGCCGAAA-TCC-GAGCCAA-GGAT-GCCA----TGAGCGTC-TTGA-CA-TGCGGTGGTGAATTA-AAA---AC--TCGTCA-TAC-TG-TCG---TCGCTCTG---GTC---CG-AAGCTCTC Gagria_lobata TCGAAA-CCT-GTCCA-AAACAGAACGA-CCTGAGAACAAACTA-TCATCAC---TCTCGGCGGA--CC-AG-TTT--CTTAGCT-GAT-CTTGT-GCC-CGCC-GATT---CCGTGGTTT----CGCGTAAG-GTCCTCA-CCAAG---------GTATA-----------ACTA--TC--TCG--GTT-GG--------ATCA---TGC--CC-GTAGCTTCCGGATAT--CACAAAACCC-CGG-CACGAAAAG-TGTCAAGGAACA-TGAAACTA---AACAGGCT--GCG-TTT-GCCAA---CCCGGAGACGGTGTTT--GCGTGG-ACGT-TGTTCTGCAAT--CT-AAAGTCTA-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------C-CGTC-GTCCCCC--------------AATCC-TC-T-----TAAGGATA--------------CGG-GACGGA----AGTTGGTCT-CCCGTGTGGTACCGAACGCGG-TTGGCCAAAA-TCT-GAGCTAT-GGAC-GCTA----GGAGCGTC-TTGA-CA-TGCGGTGGTGAATTC-AAA---CC--TCTTCA-TTT-TG-TTGG--TCGCTCTT---GTC---CGGAAGCTCTT Goldbachia_laevigata 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TCG-AA-CCTTGTTCT-AAACAGAATGA-CCCGTGAACTAACGA-TCATCAC---TCACGGTGGG--CC-GG-TTT--CCTAGTT-GAT-CCCGC-GCC-TGCC-TATT---CCGTGGTTT----CGTGGCTG-GTCC-CA-TTTCC---------AGAGT-------------TA--TC--TCTTGATT-GG--------GTCA---GGC--GC-GTGGCTTCCGGATAT--CACCAAACCC-CGG-CACGAAAAG-TGTCAAGGAACA-TACAACCA---AACAGCTA--GCATCTC-GCTGC---CCCGGAGACGGTGTG---CATTGG-ATGC-GACGCTGCAAA--CT-TAAGTCTA-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------T-CGTC-GTCCCCCA-------------CATCC-TT-C------GAGGATA--------------AGG-GACGGA----AGCTGGTCT-CCCGTGTGTTACCGCACGCGG-TTGGCCAAAA-TCC-GAGCAAA-GGAC-GCCA----GGAGCGTC-TCGA-CA-TGCGGTGGTGAAAAC-AAG---CC--TCGTCA-TAT-CG-TCGG--TCGTTCTT---GTC---CGGATGCTCTC Heliophila_arenaria TCAATA-CCT-GTCCA-AAACAGAACGA-CCCGAGAACAACCGA-TCATCAC---TCCCGGTGGG--CC-TT-TGT--CTTAACA-GAT-GATGT-GCC-CGCT-GGGT---CCGTGATCT----TGCGTATG-GTCCCAA-CCAAG---------AGTTT-------------TC--TC--TCG--GTA-TG--------GTCA---TGC--TC--AAGATCTCGGAAAT--CACAAAACCA-CGG-CACGAAAAG-TGTCAAGGAACA-TACAACTA---AACAGCTT--GCG-TCC-GACTC---CCCGGAGACGGTGTGT--GT-CGG-ATGC-TATGCTGCAAT--AT-AAAGTCTA-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------T-CGTC-GTCCCTT--------------CATCC-TA-T------TTGGATA--------------TTG-GACGGA----TGCTGGTCT-CCCGTGTGGTACCGCACGCGG-CTGGCCAAAA-TCC-GAGCTAA-GGAC-GCCT----GGAGCGTC-TCGA-CA-TGCGGTGGTGAATTA-AAG---CC--TCTTCA-TAT-CG-TCGA--ACGCTCCT---GTC---CGGAAGCTCAT Heliophila_subulata 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TCG-TATCCT-GT----AAACAGAACAA-CCCGAGAACGT-TGAAACATCAC---TCCCGGTGGG--CC-GG-TTT--CTTAGCT-GAT-TCTGT-GCT-TACC-GTTT---CCGTGGTTA----TGCGTTTG-TGCCTAA-CCAAG---------ATTCT--------------GG-TC--TCG--GTT-A---------GTTG---TGC--GC-ATAGCTTCCGGATTT--CACAAAACCC-CGG-CACGAAAAG-TGTCAAGGAACA-TGCAACAT---AACAGTCT--GCC-TTT-GCCAA---CCCGGAGACGGTGTTT--GTGCGA-ATGC-AGTGCTGGAAA--GT-AAAGTCTAAAA-CGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAA-CGTAGC--AAT------------------------------------------------------------------------TCCTTC-TGGCCGAGGGCACGTCTG-CCTGGGTGTCACAAAT-CGTC-GTCCCCC--------------CTTCC-TC-TC-----GAGGATG--------------CGG-GACGGA----AGCTGGTCT-CCCGTGTGTTACCGCACGCGG-TTGGCCAAAA-TCC-GAGCTAA-GGAC-GCCA----GGAGCGTT-CCGA-CA-TGCGGTGGTGTATTC-AAG---CC--TCTTCA-TAT-CG-TCGG--TCGTTTCG---GTC---TATAAGCTTTC Hesperidanthus_jaegeri 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TCGATA-CCT-GT----AAACAGAACGA-CCCGAGAACGA-TGAATCATCAC---TCTCGGTGGG--CC-GG-TTT--CTTAGCT-GAT-CCCGC-GCC-TGCC-GATT---C{CT}GTGGTTA----TGCGCAT{AT}-GTCCCCG-TCAAG---------ATTTT-------------TAA-TC--TTG--GCT-GG--------GTAG---TGT--GC-TTAGCTTCCGGATAT--CACAAAACCC-CGG-CACGAAAAG-TGTCAAGGAACA-TGCAACTA---AACAGCCT--GCG-TTC-GCTAA---CCCGGAAACGGTGTTT--ACGCGG-ACGC-TGTGCTGCAAT--AT-AAAGTCTAAAA-CGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATG-CGATACTTGGTGTGAATTGCAG-AATCCCGTGAACCA--TCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCG-CCCCAAGCCTTC-TGGCCGAGGGCACGTCTG-CCTGGGTGTCACAAAT-CGTC-GTCCCCC--------------CATCC-TC-TC-----GAGGATA--------------TGG-GACGGA----AGCTGGTCT-CCCGTGTGTTACCGCACGCGG-TTGGCCAAAA-TCC-GAGCTAA-GGAC-GCAA----GGAGCGTC-TCGA-CA-TGCGGTGGTGAATTC-AAG---CC--TCGTCA-TAA-CG-TCGG--TCGCTCCG---GTC---TGGAAGCTCTC Hesperis_matronalis 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TCGA{AT}A-CCT-GTTCA-AAACAGAACGA-CCCGAGAACAACCGA-TCATCAC---CATCGGTAGG--CC-GG-TTT--CTTAA{CT}C-GTT-TCCGT-GC{CT}-TACC-GGTT---CCGTGGTTA----TGCGTGTG-C{AT}CATCA-TCGAG---------TGTAA-----------TCATTACC--TTG--TTG-GT--------GTCA---TGC--GC-ATAGCTTCCGGATAT--CACAAAACC{AC}-CGG-CACGAAAAG-TGTCAAGGAACA-TGTAACTA---AACAGCCT--GCA-TCC-GTCAC---CCCGGATACGGTGTGT--GCGCGG-ATGC-GGTGCTGCGAT--AT-AAAGTCTAAAA-CGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATG-CGATACTTGGTGTGAATTGCAG-AATCCCGTGAACCA--TCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCG-CCCCAAGCCTTC-TGGCCGAGGGCACGTCTG-CCTGGGTGTCACTAAT-CGTC-GTCCCCC--------------CATCC-TC-T------AAGGAAA--------------CGG-GACGGA----AGCTGGTCT-CCCGTGTGATACCGCACGCGG-TTGGCCAAAA-TCC-GAGCAAG-GGAC-GCTA----GGATCGTC-TCGA-CA-TGCGGTGGAGAATTC-AAA---CT--TCGTCA-TAC-CG-TCGG--TCGATCCT---GTC---{CT}CGAAGCTCTA Idahoa_scapigera 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TCGAAT-CCT-GTCCA-AAACAGAAAGA-CCCGCGAACCAAAGA-TCATCAC---TCATGGTGGG--CC-GG-TTT--CTTAGAT-GAG-ATTGT-GTC-TGCC-TAAT---CCGTGGTTT----CGCGAACA-ATCTTTA-CCGGG---------AGTTC-------------TA--TC--TCT--GTTTGG--------GTTG---TGC--GC-GTTGCTTCCGGGTAT--CACAAAACCC-CGG-CACGAAAAG-TGTCAAGGAACA-TGCAAATG---AACAGCCA--GCC-TCT-GCCTT---CCCGGAGACGGTGTGT--GTGCGG-ATGC-TGCGCTGCGA{CT}--CT-AAAGTCTAAAA-CGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATG-CGATACTTGGTGTGAATTGCAG-AATCCCGTGAACCA--TCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCG-CCCCAAGCCTTC-TGGCCGAGGGCACGTCTG-CCTGGGTGTCACAAAT-CGTC-GTCCCTC-------------TCATCC-T--T--------GGATT--------------AGG-GACGGA----AGTTGGTCT-CCCGTGTGTTACCGCACGCGG-TTGGCCAAAA-TCC-GAGCTAA-GGAC-GCTG----AGAGCGTC-ATGA-CA-TGCGGTGGTGAACTA-AAG---CC--TCTTCG-TAT-CG-TCGG--TCGTTCTT---GTC---{CT}GGAAGCTCTC Ionopsidium_acaule TTGAAA-CCT-GTCCA-AAACAGAAGGA-CCAGAGAACAACCGATACATGAC---TCTCGGTAGG--CC-GG-ATC--ACGAACG-GTT-GTCGT-GCC-TACC-GGTT---CCGTGGTTTT---CATGTATG-GCCTCAA-TCAAG-----------TTT-------------CA-TTCA-TTG--GCGAGG--------TACA---TGC--AT-GTTTCTTCCGGATAT--CACAAAACCA-CGG-CACGAAAAG-TGTCAAGGAACA-TGCAACCG---AACAGCTT--GCA-TTC-GC-G----TC-AGAGATGG-TTGC--GTGCGA-ATGT-TT-GCTGCAAT--CT-AAAGTCTA-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------T-CGTC-GTCCACC--------------ATTCC-TC-TC-----AAGGGTC--------------TTG-GACGGA----AGCTGGTCT-CCCGTGTGTTACCGTACGCG--TTGGCCGAAAATCT-GAGCCAA-GGAC-GCCG----AGAGCGTC-TCGA-CA-TGCGGTGGTGAA-AC-AAG---CC---CGTCA-TAT-CG-TCGT--GCGCTCTT---GTC---CGAAAG-TCTC Isatis_tinctoria TCGATA-CCTTATC-GTAAACAGAACGA-CCCGCGAACGATTGA-TCATCAC---TCTCAGTGGG--CC-GG-TGT--CTTAGCT-GAT-TCCGT-GCC-CGCC-GATT---CCGTGGTTA----TGCGTGTG-GTCT-CAGCCAAG---------ATTCA-------------TA--TC--TCG--GTT-GG--------GTCA---TGC--GC-CTAGCTTACGGATAT--CACCAAACCC-CGG-CACGAAAAG-TGTCAAGGAACA-TGCAACTA---AACAGCCT--GTG-TTC-GCCTA---CCCGGAGACGGTGTTT--GCGTGG-ACGC-TGTGCTGCAAT--CT-AAAGTCTAAAA-CGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATG-CGATACTTGGTGTGAATTGCAG-AATCCCGTGAACCA--TCGAGTCTTTGGACGCAAGTTGCG-CCCTAAGCCTTC-TGGCCGAGGGCACGTCTG-CCTGGGTGTCACAAAT-CGTC-GTCCCCC--------------CATCC-TC-TC-----GAGGATA--------------GTG-GACGGA----AGCTGGTCT-CCCGTGTGTTACCGCACGCGG-TTGGCCAAAA-TCC-GAGCTAA-GGAC-GCAA----GGAGCGTC-CCGA-CA-TGCGGTGGTGAATTA-AAA---CC--TCGTCA-TAC-CG-TCGG--CCGTTCCT---GTC---CTAATGCTCTC Kernera_saxatilis 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TCGATA-CCT-GTCCA-AAACAGAACGA-CCCGAGAACGATTGA-TCATCAC---TCT{CG}GGCGGG--CC-GG-TTT--CCTAGC{CG}-GAT-TCTGT-GCC-CGCT-GATT---CTGTGGTTT----TGCGTATG-GTTCCCA-TTA-G---------ATTTT-------------TACATC--TTG--ATG-GG--------TCTA---TGC--GC-TTAGCT-ACGGAAATT-CACAAAACCC-CGG-CACGAAAAG-TGTCAAGGAACA-TGAAACTT---AACAGTCG--GTT-TCC-GCCTT---CCCGGAGAC{CG}GTGAGT--GTGCGG-ATGC-TGTGCTGCGAT--CT-AAAGTCTA-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------T-CGTC-GTCCCC---------------AATCC-TA-A------AAGGATA--------------CAG-GACGGA----AACTGGTCT-CCCGTGTGTTACCGTACGCGG-TTGGCCAAAA-TCC-GAGCTAA-GGAC-GTCG----GGAGCGTC-TTGA-CA-TGCGGTGGTGAATTC-AAG---CC--TCTTCA-TAC-TG-TTGA--ACGCTCCT---GTC---T-AAAGCTTTA Lachnocapsa_spathulata 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TCG-TACCCT-GG----AAACAGAACGA-CCCGAGAAC-ATTGAAACATCAC---TCTCGGCGGG--CC-AG-TTT--CTTAGAT-GAT-TCTGT-GTC-TGCC-GATTTTTCCGTGGTTA----TGTGTTTC-GCCCCCAGCTAAG---------ATTTC--------------A--TC--TCT--GTT-GG--------ATCG---TGC--GC-ATAGCTTCCGGATAT--CACAAAACCC-CGG-CACGAAAAG-TGTCAAGGAACA-TGCAACTA---AACAGTCT--GCG-TCC-GCCAA---CCCGGAGACGGTGTTT--GTGCGG-AAGC-TGTGCTGGAAA--TT-AA-GTCTAAAA-CGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATG-CGATACTTGGTGTGAATTGCAG-AATCCCGTGAACCA--TCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCG-CCCCAAGCCTTC-TGGCCGAGGGCACGTCTG-CCTGGGTGTCACAAAT-CGTC-GTCCCCC--------------CATCC-TC-TC-----GAGGATA--------------TGG-GACGGA----AGCTGGTCT-CCCGTGTGTTACCGCATGCGG-TTGGCCAAAA-TCT-GAGCTAA-GGAC-GTCA-----GAGCGTT-CCGA-CA-TGCGGTGGTGAACTC-AAG---TT--TCTTCA-GTC-TG-TC{CG}G--TCGTTTCG---GTC---TAAAAGCTTTT Nasturtium_officinale TCGAAA-CCT-GTCCA-AAACAGAACGA-CCCGCGAACCAAAGA-TCATCAC---TCACGGTGGG--CT-GG-TTT--CTT-GTC-GAG-ACCG--GCC-TGCT-GTAT---CCGTGGTTG----CACGAACA-ATCCTCA-CCCCA-------------------------------------G--CTT-GG--------ATTG---TGC--GT-GTTTCTTCCGGATTT--AACAAAACCA-CGG-CACGGAAAG-TGTCAAGGAACA-TGCAATTG---AACAGCCA--GCT-TTC-TACGC---CCCGGAGACGGTGTGT--GTGCGG-ATGC-TGTGCTGCGAT--AT-AAAGTC-AAAA-CGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATG-CGATACTTGGTGTGAATTGCAG-AATCCCGTGAATCA--TCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCG-CCCCAAGCCTTC-TGGCCGAGGGCACGTCTG-CCTGGGTGTCACGAAT-CGTC-GTCCCTC-------------ACATCC-T--T-------CGGATA-------------ATGG-GACGTA----AGCTGGTCT-CCCGTGTGTTACCGCACGCGG-CTGGCCAAAA-TCC-GAGCTAA-GGAC-GCCG----AGAGCGTT-ACGA-CA-TGCGGTGGAGAACAA-AAG---CC--TCTTCG-TAT-CG-TTGG--TCGCTCTT---GTC---TTGAAGCTCTC Neotorularia_torulosa 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TCGATA-CCT-GTCCA-AAACAGAACGA-CCCGAGAACGATTAA-TCATCAC---TCTCGGCGGG--CC-GG-TTT--CTTAGCC-GAC-TCTGT-GCC-CGCC-GATT---CCGTGGTTT----TGCGAGTG-GTTC-TA-TCGAG---------ATTTT-------------TAA-TC--CCG--ATT-GG--------GCTA---TGA--GC-TTAGCTTTCGGAAATT-CACAAAACCC-CGG-CACGAAAAG-TGTCAAGGAACA-TGCAACTA---AACAGCCT--GCT-TCC-GCCGC---CCCGGAAACGGTGAGT--GTGCGGTGTGC-TGTGCTGCGAT--CT-AAAGTCTAAAA-CGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATG-CGATACTTGGTGTGAATTGCAG-AATCCCGTGAACCA--TCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCG-CCCTAAGCCTTC-TGGCCGAGGGCACGTCTG-CCTGGGTGTCACAAAT-CGTC-GTCCCC---------------AATCC-TC-T------AAGGATA--------------GAG-GACGGA----AACTGGTCT-CCCGTGTGTTACCGTACGCGG-TTGGCCAAAA-TCC-GAGCTAA-GGAC-GCCT----GGAGCGTC-TCGA-CA-TGCGGTGGTGAATTG-AAA---CC--TCTTGA-TAT-TG-TTGA--ACGCTCCT---GTC---CG-AAGCT-AA Noccidium_hastulatum 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CCGATA-CCT-GTCCA-AAACAGAACGA-CCCGCGAACCAACGA-TCACCAC---TCGCGGTGGG--CC-GG-TT---CTTAGCC-GAT-CATGT-GCC-CACC-GGAT---CCGTGGTTT----CGCGTAAC-AACCTGA-TTGGG---------ATCTT-------------TA--TC--TCG--GTC-TG--------GTCG---TGC--GC-GTTGCTTCCGGATAT--CACAAAACCA-CGG-CACGAAAAG-TGTCAAGGAACA-TGCAACCG---AACAGCTA--GCA-TTC-GCCTC---CCCGGAGACGGTGTGT--GCGCGG-ATGT-TGAGCTGTGAT--AT-AAAGTCTAAAA-CGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATG-CGATACTTGGTGTGAATTGCAG-AATCCCGTGAACCA--TCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCG-CCATAAGCCTTC-TGGCCGAGGGCACGTCTG-CCTGGGTGTCACAAAT-CGTC-GTCCCCCC------------TCATCC-TT-T------GCGGATT--------------CGG-GACGGA----AATTGGTCT-CCCGTGTGTTACCGCACGCGG-TTGTCCTAAA-TCT-TAGCCTA-GGAC-GCCG----GGAGCGTC-TCGA-CA-TGCGGTGGTGAACTT-GAT---CCATTCT-CA-TAT-CG-TCGG--CCGCTCCT---GTC---CAGAAGCTCTA Ornithocarpa_torulosa 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TCGATA-CCT-GTCCA-AAACAGAACGA-CCCGTGAACGATCGA-TCATCAC---TCTCGGTGGG--CC-AA-TTT--CTTAGC{GT}-GAT-CTTGT-GCC-CGCC-GATT---CCGTGGTTT----CGCGTAAG-GTCCCAA-CCAAG---------GTATA-----------ACTA--TC--TCG--GTT-GG--------ATCA---TGC--GC-TTAGCTTCCGGTTAT--CACAAAACCC-CGG-CACGAAAAG-TGTCAAGGAACA-TGAAACTA---AACAGCCT--GCG-TTC-GCGGA---CCCGGAGACGGTGTCT--GCGCGG-ACGT-TGTGCTGCAAT--CT-AAAGTCTAAAA-CGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATG-CGATACTTGGTGTGAATTGCAG-AATCCCGTGAACCA--TCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCG-CCCCAAGCCTTC-TGGCCGAGGGCACGTCTG-CCTGGGTGTCACAAAT-CGTC-GTTCCCC--------------AATCC-TT-TT-----GAGGATA--------------TGG-GACGGA----AGCTGGTCT-CCCGTGTTGTACCGAACGCGG-TTGGCCAAAA-TCC-GAGCTAA-GGAC-GCCA----AGAGCGTC-TTGA-CA-TGCGGTGGTGAATTA-AAG---CC--TCTTCA-TTT-TG-TCGG--TCGCTCTT---GTC---CGGAAGCTCTT Pegaeophyton_scapiflorum TCGATA-CCT-GTCCA-AAACAGAACGA-CCCGAGAACGATTAA-TCATCAC---TCTCGGTGAG--CT-GG-TTT--CTTA{AG}CA-GAT-TCCGT-GCT-TGCC-GATT---CCGTGGTTT----CACGTATC-GTCCCTT-TCAAG---------ATTT--------------TA--TC--TTG--CCT-GG--------GTCA---TGC--GT-GTTGCTTCCGGATAT--CACAAAACCC-CGG-CACGAAAAG-TGTCAAGGAACA-TGCAACTA---AACAGCTT--GCG-TTC-GCCT{AGT}---CCCGGAGACGGTGTGT--GTGCGG-ACGT-TGTGCTGCAAT--CT-AAAGTCTAAAA-CGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATG-CGATACTTGGTGTGAATTGCAG-AATCCCGTGAACCA--TCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCG-CCCCAAGCCTTC-TGGCCGAGGGCACGTCTG-CCTGGGTGTCACAAAT-CGTC-GTCCCCC--------------CATCC-TC-T-----CGAGGATA--------------CGG-GACGGA----AGCTGGTCT-CCCGTGTGTTACCGCA{CT}GCGG-TTGGCCAAAA-TCCTGAGCAAA-GGAC-GCCG----GGAGCGTC-TCGA-CA-TGCGGTGGTGAATTC-AGT---TC--TCGTCA-AAT--G-TCGG--TCGCTCCT---GTC---CGGAAGCTCTC Peltaria_alliacea TCGAAT-CCT-GTTCA-AAACAGAACGA-CCCGAGAACAATCGA-TCATTAC---TCTCGGCTGG--CC-GG-TTT--CTTAGTT-GAT-CCCGT-GCC-TTCC-GATT---CCGTGGTTT----TGCGTATG-GTTC--------------------------------------------------TT-GG--------ATCT---TGC--GC-AAAGCTTCCGGATAT--CACCAAACCC-CGG-CACGAAAAG-TGTCAAGGAACA-TGCAATTG---AATAGCCT--GCG-GTC-GCCAA---CCCGGAGACGGTGTTT--GTGCGG-ACGT-TGTGCTGTAAT--CT-AAAGTCTAAAA-CGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATG-CGATACTTGGTGTGAATTGCAG-AATCCCGTGAACCA--TCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCG-CCCTAAGCCTTC-TGGCCGAGGGCACGTCTG-CCTGGGTGTCACAAAT-CGTC-GTCCCCAC-------------CATCC-TC-TT-----AAGGATA--------------TGG-GACGGA----AGCTGGTCT-CCCGTGTTTTACCGAATGCGG-TTGGCCAAAA-TCC-GAGCAAA-GGAC-GCCA----GGAGCGTC-TCGA-CA-TGCGGTGGTGAATTC-AAG---CC--TCTTCA-TTT-TG-TCGG--TCGCTC-T---GTC---TGGAAGCTCT- Peltariopsis_planisiliqua 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TCGAAA-CCT-GTCCA--AACAGAACGA-CCAGCGAACAAACGA-TCATCAC---TTGCGGCGGG--CC-GG-TTT--CATAGCT-GAT-CCCGC-GCC-TGCC-GATT---CCGTGGTTA----TGCGTATT-GTCTCCA-AGAAG---------AGTTC-------------CG--TC--TCC--ATT-GG--------ATCA---TAC--GC-TTAGCTTCCGGATAT--CACAAAACCC-CGG-CACGAAAAG-TGTCAAGGAACA-TGAAACTA---AACAGCTT--GCA-TTC-GTCGC---CCCGGAGACGGTGTGT--GTGCGG-ATGC-TCAGCTGCGAT--CT-AATGTCTAAAA-CGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATG-CGATACTTGGTGTGAATTGCAG-AATCCCGTGAACCA--TCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCG-CCCCAAGCCTTC-GGGCCGAGGGCACGTCTG-CCTGGGTGTCACAAAT-CGTC-GTCCCCC--------------CATCC-TC-T-------TGGATA--------------AGG-GACGGA----AGTTGGTCT-CCCGTGTGATACCGCATGCGG-TTGGCCAAAA-TCC-GAGCTTA-GGAC-GTCA----GGAGCGTC-TCGA-CA-TGCGGTGGTGAA----AAG---CC--CCTTC--TATACG-TCGG--TCGATCCT---GTC---CATAAGCTCTC Phlebolobium_maclovianum TCGATA-CCT-GT----AAACAGAACGA-CCCGAGAACAA-TGAATCATCAC---TCTCGGTGGG--CC-GG-TTT--CTTAGCT-GAT-CCCGC-GCC-TACC-GATT---CCGTGGTTA----TGCGCATG-GTCCCCG-TCAAG---------ATTTT-------------TAA-TC--TCG--GCT-GG--------GTAG---TGT--GC-CTAGCTTCCGGATAT--CACAAAACCC-CGG-CACGAAAAG-TGTCAAGGAACA-TGCAACTA---AACAGCCT--GCG-TTC-GCCAA---CCCGGAGACGGTGTTT--ACGCGG-ACGC-TGTGCTGCAAA-TAT-AAAGTCTAAAA-CGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATG-CGATACTTGGTGTGAATTGCAG-AATCCCGTGAACCA--TCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCG-CCCCAAGCCTTC-TGGCCGAGGGCACGTCTG-CCTGGGTGTCACAAAT-CGTC-GTCCCCC--------------CATCC-TC-T-----CGAGGATA--------------TGG-GACGGA----AGCTGGTCT-CCCGTGTGTTACCGCACGCGG-TTGGCCAAAA-TCC-GAGCTAA-GGAC-GCAA----GGAGCGTC-TCGA-CA-TGCGGTGGTGAATTT-AAG---CC--TCGTCA-TAT-CG-TCGG--TCCCTCCG---GTC---CGGAAGCTCTC Phoenicaulis_cheiranthoides TCGATA-CCT-GTCCA-AAACAGAACGA-CCCGCGAACCAACGA-TCACCAC---TCGCGGTGGG--CC-GG-TTT--CTTAACC-GAT-CCCTT-GCC-CTCC-GGAT---CCGTGGTTT----CGCGTACC-GTCCCGA-TCGGG---------AGCTC-------------AA--TC--TCG--GTC-TG--------GTCG---TGC--GC-GTTGCTTCCGGATAT--CACCAAACCC-CGG-CACGAAAAG-TGTCAAGGAACA-TGCAACCG---AACGGCCG--GCG-TTC-GCCTC---CCCGGAGACGGTGTGT--GCGCGG-ATGC-TGAGCTGCGAT--CT-AAAGTCTAAAA-CGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGGATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATG-CGATACTTGGTGTGAATTGCAG-AATCCCGTGAACCA--TCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCG-CCCCAAGCCTT{CT}-TGGCCGAGGGCACGT{CT}TG-CCTGGGTGTCACAAAT-CGTC-GTCCCCCC------------TCATCC-TC-T------AAGGATT--------------CGG-GACGGA----AGCTGGTCT-CCCGTGTGTTACCGCACGCGG-TTGGCCAAAA-TCC-GAGCCAA-GGAC-GCAG----GGAGCGTC-CCGA-CA-TGCGGTGGTGAACTC-GAT---CCACTTT-CA-TAT-CG-TCGG--CCGCTCCT---GTC---CGGAGGCTCTA Physaria_didymocarpa 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TCGATA-CCT-GTCCA-AAACAGAACGA-CCCGCGAACAAACGA-TCATCAC---TTCCGGCGAG--CC-GG-TTT--CTTAGCT-GAC-CCCGT-GCC-CGCT-GGAT---CCGTGGCTC----TGCGCTCTGCTCATGA-ACGAG---------A-TTCA------------CG--TCT-TCG--ATC-TA--------GC-TC--TGC--GC-TTTGCTTCCGGAATT--CACAAAACCC-CGG-CACGAAAAG-TGTCAAGGAACA-TGCAACAA--AAACAGCTCT-GCA-TCC-GCGGC---CCCGGAGACGGTGTGT--TTGTGT-ATGC-TTAGCTGCCAAAA-TCAAAGTCTAAAA-CGACTCTCGACAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATG-CGATACTTGGTGTGAATTGCAG-AATCCCGTGAACCA--TCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCG-CCCCAAGCCTTC-TGGCCGAGGGCACGTCTG-CCTGGGTGTCACAAAT-CGTC-GTCCCCCC-------------TATCC-TT-T------GAGGATG-------------GCCG-GACGGA----AGCTGGTCT-CCCGTGTGTTACCGCACGCGG-TTGACCTAAA-TCT-GAGCCAA-GGAC-GCCG----GGAGCGTC-TCGA-CA-TGCGGTGGTGAAAAC-AAG---CC--TCCTAA-TAT-CG-TTGG--TTGCTCCA---GTC---CGGAAGCTCTA Planodes_virginicum TCGATA-CCT-GTCCA-AAACAGAACGA-CCTGCGAACCAAAGA-TCATCAC---TCACGGTGGG--CC-AG-TTT--CTTAGCT-GAG-ATTGT-GCC-TGCC-GAAT---CCGTGGTTT----CGCGAACA-ATTCTTA-CTTGG---------AGTC--------------TA--TC--CTT--GTTTGG--------GTTG---TGC--GT-GTTGCTTCCGGATAT--CACAAAACCC-CGG-CACGAAAAG-TGTCAAGGAACA-TGCAAATG---AACAGTCT--GCC-TTC-GCCTC---CCCGGAGACGGTGTGT--GTGTGA-ATGC-TG-GCTGCGAT--AT-AAAGTCTAAAA-CGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATG-CGATACTTGGTGTGAATTGCAG-AATCCCGTGAACCA--TCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCG-CCCCAAGCCTTC-TGGCTGAGGGCACGTCTG-CCTGGGTGTCACAAAT-CGTC-GTCCCAC-------------TCATCC-T--TA-----GTGGATT--------------TGG-GACGGA----AGCTGGTCT-CCCGTGTGTTACCGCACGCGG-TTGGCCGAAA-TCC-GAGCTAA-GGAC-GCCA----AGAGTGTC-ACGA-CA-TGCGGTGGTGAACTA-AAG---CC--CCTTCG-TAT-AG-TCGG--TCATTCTT---GTC---CGGAAGCTCTT Pseuderucaria_teretifolia TCG-TACCCT-GG----AAACAGAACA-ACCCGTGAACGA-TGAAACATCAC---TCTCGGCGGG--CC-GG-TCT--CTTAACC-GAT-TCCGT-GCC-CGCC-GATT---CCGTGGTTA----TGCGAGTT-AACCCCGGTCGGG---------ATATC-------------TG--TC--TCG--GTC-GG--------ATCT---CG{CG}--GC-ATAGCTTCCGGATTT--CACAAAACCC-CGG-CACGAAAAG-TGTCAAGGAACA-TGCAACTG---AACAGCCT--GCT-TCC-GCCGA---CCCGGAGACGGTGTAT--GCGCGG-AAGC-TGTGCTGGAA---CT-AAAGTCTAAAA-CGACTCTCGGCAACGGATATCTCGG-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ATCC-TC-CC-----GAGGATG--------------CCG-GACGGA----AGCTGGTCT-CCCGTGTGTTACCGCACGCGG-TTGGCCAAAA-TCC-GAGCAAA-GGAT-GCCA----CGAGCGTC-TCGA-CA-TGCGGTGGTGAATTT-ATT---CC--TCGTCA-TAA-TG-TCGG--TCGCTCGG---GTC---CGAAAGCTTTC Pseudoarabidopsis_toxophylla 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-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AA-TC--TCG--GTT-GG--------ATCA---TGC--GC-CTAGCTTCCGGATAT--CACAAAACCC-CGG-CACGAAAAG-TGTCAAGGAACA-TGCAACAA--AAACAGCCT--GCG-TTC-GCCTA---CCCGGAGACGGTGTGT--GCGTGG-ACGC-TGTGCTGCAAT--AT-AAAGTCTAAAA-CGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATG-CGATACTTGGTGTGAATTGCAG-AATCCCGTGAACCA--TCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCG-CCCCAAGCCTTC-TGGCCGAGGGCACGTCTG-CCTGGGTGTCACAAAT-CGTC-GTCCCCC--------------CATCC-TC-TC-----GAGGATA--------------CAG-GACGGA----AGCTGGTCT-CCCGTGTGTTACCGCACGCGG-TTGGCCAAAA-TCC-GAGCAAA-GGAT-GCAA----GGAGCGTC-CCGA-CA-TGCGGTGGTGAATTC-AAG---CC--TCGTCA-TAT-CG-TCGG--TCGCTCTT---GTC---CGGAAGCTCTA Pseudosempervivum_aucheri 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TCAAAA-CCT-GTCCA-AAACAGAACGA-CCTGAGAACGATCTA-TCATCAC---TCTCGGTGGG--CC-AG-TTT--CTTAGCT-GAT-TTTGT-GCC-TGCC-GATT---CCGTGGTTT----CGTGTAAG-GTCCACA-CCAAG---------GTATA-----------ACTA--TC--TCG--GTT-GG--------ATCG---TGC--CC-GTAGCTTCCGGATAT--CACAAAACCC-CGG-CATGAAAAG-TGTCAAGGAACA-TGAAACTA---AACAGCCT--GCG-TTC-GCCGA---CCCGGAGACGGTGTTT--GCGCGG-ACGT-TGTGCTGCAAT--CT-AAAGTCTAAAA-CGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATG-CGATACTTGGTGTGAATTGCAG-AATCCCGTGAACCA--TCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCG-CCCCAAGCCTTC-TGGCCGAGGGCACGTCTG-CCTGGGTGTCACAAAT-CGTC-GTCCCCCC-------------AATTC-TC-TT-----GAGGATA--------------TGG-GACGGACGGAAGCTGGTCT-CCCGTGTGGTACCGAACGCGG-TTGGCCAAAA-TCC-GAGCTAC-GGAC-GCCA----AGAGCGTC-TCGA-CA-TGCGGTGGTGAATTC-AAG---CC--TCTTCA-TTT-TG-TTGG--TCGCTCTT---GTC---CGGAAGCTCTT Pycnoplynthopsis_bhutanica 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TCGATA-CCT-GTCCA--AACAGAATGA-CCCGAGAACGATTGA-TCATCAC---TCTCGGCGGG--CC-GG-TTT--CTTAGCC-GAT-TCCGT-GCC-CGCT-GATT---CCGTGGTTT----TGCGTATG-GCTCCAA-TCAAATCAAGATTTATTTT-------------GA--AC--TTG--GTT-GG--------GT-G---TGC--GC-TTAGCTTACGGAAATT-CACAAAACCC-CGG-CACGAAAAG-TGTCAAGGAAAA-TGCAACTA---AACAGCCT--GCG-CCC-GCCTC---CCCGGAGACGGTGTGT--GTGCGG-ATGC-AGTGCTGCAAT--CT-AAAGTCTAAAA-CGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAA-CGTAGCGAAATG-CGATACTTGGTGTGAATTGCAG-AATCCCGTGAACCA--TCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCG-CCCTAAGCCTTC-TGGCCGAGGGCACGTCTG-CCTGGGTGTCACAAAT-CGTC-GTCCCCC--------------CTTCC-TCGT------TTGGACA--------------AGG-GACGGA----AACTGGTCT-CCCGTGTGTTACCGCACGCGG-TTGACCAAAA-TCT-GAGCCAA-GGAC-GCCT----ATAGCGTC-TCGA-CA-TGCGGTGGTGAATTA-AAG---CC--TCGTCA-TAT-TG-TTGA--ACGCTATT---GTC---CGGACGCTTTA ; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = Brassicaceae_ITS) = N: 1-773; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = Brassicaceae_ITS) = N: 1-773; END;