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TreeBASE (cc) 1994-2008

Study reference:
Kadereit J., Lauterbach M., Kandziora M., Spillmann J., & Nyffeler R. 2019. Dual
colonization of European high altitude areas from Asia by Callianthemum C.A. Mey.
(Ranunculaceae). Plant Systematics and Evolution, .

TreeBASE Study URI:  http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S24321]

BEGIN TAXA;
        TITLE  Taxa;
        DIMENSIONS NTAX=30;
        TAXLABELS
            Callianthemum_alatavicum_1
            Callianthemum_alatavicum_2
            Callianthemum_alatavicum_3
            Callianthemum_anemonoides_1
            Callianthemum_anemonoides_2
            Callianthemum_angustifolium_1
            Callianthemum_coriandrifolium_1
            Callianthemum_coriandrifolium_10
            Callianthemum_coriandrifolium_11
            Callianthemum_coriandrifolium_2
            Callianthemum_coriandrifolium_3
            Callianthemum_coriandrifolium_4
            Callianthemum_coriandrifolium_5
            Callianthemum_coriandrifolium_6
            Callianthemum_coriandrifolium_7
            Callianthemum_coriandrifolium_8
            Callianthemum_coriandrifolium_9
            Callianthemum_farreri_1
            Callianthemum_hondoense_1
            Callianthemum_isopyroides_1
            Callianthemum_kernerianum_1
            Callianthemum_kernerianum_2
            Callianthemum_kirigishiense_1
            Callianthemum_pimpinelloides_1
            Callianthemum_sachalinense_1
            Callianthemum_sajanense_1
            Callianthemum_sajanense_2
            Callianthemum_sajanense_3
            Callianthemum_sajanense_4
            Callianthemum_taipaicum_1
            ;
END;

BEGIN CHARACTERS;
[! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M49991]

	TITLE 'Callianthemum trnV-ndhC alignment';
	LINK TAXA = Taxa;
	DIMENSIONS NCHAR=1128;
	FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -;

MATRIX
[                                            10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220       230       240       250       260       270       280       290       300       310       320       330       340       350       360       370       380       390       400       410       420       430       440       450       460       470       480       490       500       510       520       530       540       550       560       570       580       590       600       610       620       630       640       650       660       670       680       690       700       710       720       730       740       750       760       770       780       790       800       810       820       830       840       850       860       870       880       890       900       910       920       930       940       950       960       970       980       990       1000       1010       1020       1030       1040       1050       1060       1070       1080       1090       1100       1110       1120        ]
[                                             .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .        ]
Callianthemum_alatavicum_1           TTAACATTATTTGTATTTTGTACTTGTACATAGTATAGTTTTTTATTTCTATTATTTGTTGTTTGTAGCTGTCCGGTTGGTTGCTCCATTGAAATAGAATCATTCCCGCATTCTCGCTCACGGGGATCATTCGGAACATGAAACTC-AAAAAATGCGTTTCAATGGAACCCATCGACATTTTAAAAATTTCGGATAAACAAACCCACTCTTTTCATTAATTTTCGTGGGTAGACAAATTTTTTCCTGTTTTCCTACCCATGATCAACGAGTTAGTGATACTACCTTTGTTTGGTATACCTAAAGAAAAGTCCATTTTTGAAGTAAAAATCATATCATGACATGAGCCCGGCTAATAGACTCAAACCCAATTTCTTATCATTCAACATTTTAATTCTACTGATGCTGATTTCACTTTATGCAAGAAGATTGAGGTGGGGATCCGTTTGAACTTAGACGAGTTAGGAATCCCCCAACTTATCCACTTTTTTTGTGGAAGAACAACCCGAAATCATTGTTTCAGAGAGAATGAATTGATCCTAAATACATAATTGGGTTATAGGAAACTATGCGTTGTTATATGCAAGTGTAAGGACTCCTCGCGATTCAACACATCGAATCCAATCTATTAAGTCTCGTACAGTGAGAGATAATAAAATAAATAGGTCAATGCACTCTGTTTTCATATCTAATCAATAGAAGAAATAATATTCTACCCGGATCTTAATGATAAATAACGACATTGAATTATATTTTTTCATATAATGAATGTATTTTATTTAAGACTAATACAAAACAATAAATTTTGTATTCTTGAAAATTAGAACTTCGAAACGAAATAAAAAAAAAAATT-ATTGTTTTTTTTTTTAATGCCTTTTCTTTAGAGAGAACCCGAGGCCCGGAGAAAGAGAGAGTTTTCTTTGTAGACGAGCATGATATGTCGTCTATACCATAGCGAAATTGAAAATCAAATCGAAGTAAG-------TGTAAATAAAATAGTATTTTGATTCGACGAATCTTGAAACGAGACATGGCCCAAGTCAAAAAACTAGGCGGTTCGATCAAATTGGTATTTCGACTAAATAGTTATGGATGAATTCACAATTACAATTCGAATCGACTAAT
Callianthemum_alatavicum_2           TTAACATTATTTGTATTTTGTACTTGTACATAGTATAGTTTTTTATTTCTATTATTTGTTGTTTGTAGCTGTCCGGTTGGTTGCTCCATTGAAATAGAATCATTCCCGCATTCTCGCTCACGGGGATCATTCGGAACATGAAACTC-AAAAAATGCGTTTCAATGGAACCCATCGACATTTTAAAAATTTCGGATAAACAAACCCACTCTTTTCATTCATTTTCGTGGGTAGACAAATTTTTTCCTGTTTTCCTACCCATGATCAACGAGTTAGTGATACTACCTTTGTTTGGTATACCTAAAGAAAAGTCCATTTTTGAAGTAAAAATCATATCATGACATGAGCCCGGCTAATAGACTCAAACCCAATTTCTTATCATTCAACATTTTAATTCTACTGATGCTGATTTCACTTTATGCAAGAAGATTGAGGTGGGGATCCGTTTGAACTTAGACGAGTTAGGAATCCCCCAACTTATCCACTTTTTTTGTGGAAGAACAACCCGAAATCATTGTTTCAGAGAGAATGAATTGATCCTAAATACATAATTGGGTTATAGGAAACTATGCGTTGTTATATGCAAGTGTAAGGACTCCTCGCGATTCAACACATCGAATCCAATCTATTAAGTCTCGTACAGTGAGAGATAATAAAATAAATAGGTCAATGCACTCTGTTTTCATATCTAATCAATAGAAGAAATAATATTCTACCCGGATCTTAATGATAAATAACGACATTGAATTATATTTTTTCATATAATGAATGTATTTTATTTAAGACTAATACAAAACAATAAATTTTGTATTCTTGAAAATTAGAACTTCGAAACGAAATAAAAAAAAAAATT-ATTGTTTTTTTTTTTAATGCCTTTTCTTTAGAGAGAACCCGAGGCCCGGAGAAAGAGAGAGTTTTCTTTGTAGACGAGCATGATATGTCGTCTATACCATAGCGAAATTGAAAATCAAATCGAAGTAAG-------TGTAAATAAAATAGTATTTTGATTCGACGAATCTTGAAACGAGACATGGCCCAAGTCAAAAAACTAGGCGGTTCGATCAAATTGGTATTTCGACTAAATAGTTATGGATGAATTCACAATTACAATTCGAATCGACTAAT
Callianthemum_alatavicum_3           TTAACATTATTTGTATTTTGTACTTGTACATAGTATAGTTTTTTATTTCTATTATTTGTTGTTTGTAGCTGTCCGGTTGGTTGCTCCATTGAAATAGAATCATTCCCGCATTCTCGCTCACGGGGATCATTCGGAACATGAAACTC-AAAAAATGCGTTTCAATGGAACCCATCGACATTTTAAAAATTTCGGATAAACAAACCCACTCTTTTCATTAATTTTCGTGGGTAGACAAATTTTTTCCTGTTTTCCTACCCATGATCAACGAGTTAGTGATACTACCTTTGTTTGGTATACCTAAAGAAAAGTCCATTTTTGAAGTAAAAATCATATCATGACATGAGCCCGGCTAATAGACTCAAACCCAATTTCTTATCATTCAACATTTTAATTCTACTGATGCTGATTTCACTTTATGCAAGAAGATTGAGGTGGGGATCCGTTTGAACTTAGACGAGTTAGGAATCCCCCAACTTATCCACTTTTTTTGTGGAAGAACAACCCGAAATCATTGTTTCAGAGAGAATGAATTGATCCTAAATACATAATTGGGTTATAGGAAACTATGCGTTGTTATATGCAAGTGTAAGGACTCCTCGCGATTCAACACATCGAATCCAATCTATTAAGTCTCGTACAGTGAGAGATAATAAAATAAATAGGTCAATGCACTCTGTTTTCATATCTAATCAATAGAAGAAATAATATTCTACCCGGATCTTAATGATAAATAACGACATTGAATTATATTTTTTCATATAATGAATGTATTTTATTTAAGACTAATACAAAACAATAAATTTTGTATTCTTGAAAATTAGAACTTCGAAACGAAATAAAAAAAAAAATT-ATTGTTTTTTTTTTTAATGCCTTTTCTTTAGAGAGAACCCGAGGCCCGGAGAAAGAGAGAGTTTTCTTTGTAGACGAGCATGATATGTCGTCTATACCATAGCGAAATTGAAAATCAAATCGAAGTAAG-------TGTAAATAAAATAGTATTTTGATTCGACGAATCTTGAAACGAGACATGGCCCAAGTCAAAAAACTAGGCGGTTCGATCAAATTGGTATTTCGACTAAATAGTTATGGATGAATTCACAATTACAATTCGAATCGACTAAT
Callianthemum_anemonoides_1          TTAACATTATTTGTATTTTGTACTTGTACATAGTATAGTTTTTTATTTCTATTATTTGTTGTTTGTAGCTGTCCGGTTGGTTGCTCCATTGAAATAGAATCATTCCCGCATTCTCGCTCACGGGGATCATTCGGAACATGAAACTCAAAAAAATGCGTTTCAACGGAACCCATCGACATTTTAAAAATTTCGGATAAACAAACCCACTCTTTTCATTAATTTTCGTGGGTAGACAAA-TTTTTCCTGTTTTCCTACCCATGATCAACGAGTTAGTGATACTACCTTTGTTTGGTATACCTAAAGAAAAGTCAATTTTTGAAGTAAAAATCATATCATGACATGAGCCCGGCTAATAGACTCAAACCCAATTTCTTATCATTCAACATTTGAATTCTACTGATGCTGATTTCACTTTATGCAAGAAGATTGAGGTGGGGATCCGTTTGAACTTAGACGAGTTAGGAATCCCCCGACTTATCCACTTTTTTTGTGGAAGAACAACCCGAAATCATTGTTTCAGAGAGAATGAATTGATCCTAAATACATAATTGGGTTATAGGAAACTATGCGTTGTTATATGCAAGTGTAAGGACTCCTCGCGATTCAACACATCGAATCCAATCTATTAAGTCTCGTACAGTGAGAGATAATAAAATAAATAGGTCAATGCACTCTGTTTTCATATCTAATCAATAGAAGAAATAATATTCTACCCGGATCTTAATGATAAATAACGACATTGAATTCTATTTTTTCATATAATGAATGTATTTTATTTAAGACTAATACAAAACAATAAATTTTGTATTCTTGAAAATTATAACTTCGAAACGAAATAAAAAAACAATAA--TTTTTTTTTTATTTAATGCCTTTTCTTTAGAGAGAACCCGAGGCCCGGAGAAAGAGAGAGTTTTCTTTGTAGACGAGCATGATATGTCGTCTATACCATAGCGAAATTGAAAATCAAATCGAAGTAAGTGTAAATTGTAAATCAAATAGTATTTTGATTCGACGAATCTTGAAACGAGACATGGCCCAAGTCAAAAAACTAGGCGGTTCGATCAAATTGGTATTTCGACTAAATAGTTATGGATGAATTCACAATTACAATTCGAATCGACTAAT
Callianthemum_anemonoides_2          TTAACATTATTTGTATTTTGTACTTGTACATAGTATAGTTTTTTATTTCTATTATTTGTTGTTTGTAGCTGTCCGGTTGGTTGCTCCATTGAAATAGAATCATTCCCGCATTCTCGCTCACGGGGATCATTCGGAACATGAAACTCAAAAAAATGCGTTTCAACGGAACCCATCGACATTTTAAAAATTTCGGATAAACAAACCCACTCTTTTCATTAATTTTCGTGGGTAGACAAA-TTTTTCCTGTTTTCCTACCCATGATCAACGAGTTAGTGATACTACCTTTGTTTGGTATACCTAAAGAAAAGTCAATTTTTGAAGTAAAAATCATATCATGACATGAGCCCGGCTAATAGACTCAAACCCAATTTCTTATCATTCAACATTTGAATTCTACTGATGCTGATTTCACTTTATGCAAGAAGATTGAGGTGGGGATCCGTTTGAACTTAGACGAGTTAGGAATCCCCCGACTTATCCACTTTTTTTGTGGAAGAACAACCCGAAATCATTGTTTCAGAGAGAATGAATTGATCCTAAATACATAATTGGGTTATAGGAAACTATGCGTTGTTATATGCAAGTGTAAGGACTCCTCGCGATTCAACACATCGAATCCAATCTATTAAGTCTCGTACAGTGAGAGATAATAAAATAAATAGGTCAATGCACTCTGTTTTCATATCTAATCAATAGAAGAAATAATATTCTACCCGGATCTTAATGATAAATAACGACATTGAATTCTATTTTTTCATATAATGAATGTATTTTATTTAAGACTAATACAAAACAATAAATTTTGTATTCTTGAAAATTATAACTTCGAAACGAAATAAAAAAACAATAA--TTTTTTTTTTATTTAATGCCTTTTCTTTAGAGAGAACCCGAGGCCCGGAGAAAGAGAGAGTTTTCTTTGTAGACGAGCATGATATGTCGTCTATACCATAGCGAAATTGAAAATCAAATCGAAGTAAGTGTAAATTGTAAATCAAATAGTATTTTGATTCGACGAATCTTGAAACGAGACATGGCCCAAGTCAAAAAACTAGGCGGTTCGATCAAATTGGTATTTCGACTAAATAGTTATGGATGAATTCACAATTACAATTCGAATCGACTAAT
Callianthemum_angustifolium_1        TTAACATTATTTGTATTTTGTACTTGTACATAGTATAGTTTTTTATTTCTATTATTTGTTGTTTGTAGCTGTCCGGTTGGTTGCTCCATTGAAATAGAATCATTCCCGCATTCTCGCTCACGGGGATCATTCGGAACATGAAACTCAAAAAAATGCGTTTCAACGGAACCCATCGACATTTTAAAAATTTCGGATAAACAAACCCACTCTTTTCATTAATTTTCGTGGGTAGACAAA-TTTTTCCTGTTTTCCTACCCATGATCAACGAGTTAGTGATACTACCTTTGTTTGGTATACCTAAAGAAAAGTCAATTTTTGAAGTAAAAATCATATCATGACATGAGCCCGGCTAATAGACTCAAACCCAATTTCTTATCATTCAACATTTGAATTCTACTGATGCTGATTTCACTTTATGCAAGAAGATTGAGGTGGGGATCCGTTTGAACTTAGACGAGTTAGGAATCCCCCGACTTATCCACTTTTTTTGTGGAAGAACAACCCGAAATCATTGTTTCAGAGAGAATGAATTGATCCTAAATACATAATTGGGTTATAGGAAACTATGCGTTGTTATATGCAAGTGTAAGGACTCCTCGCGATTCAACACATCGAATCCAATCTATTAAGTCTCGTACAGTGAGAGATAATAAAATAAATAGGTCAATGCACTCTGTTTTCATATCTAATCAATAGAAGAAATAATATTCTACCCGGATCTTAATGATAAATAACGACATTGAATTCTATTTTTTCATATAATGAATGTATTTTATTTAAGACTAATACAAAACAATAAATTTTGTATTCTTGAAAATTTTAACTTCGAAACGAAATAAAAAAACAATAA--TTTTTTTTTTATTTAATGCCTTTTCTTTAGAGAGAACCCGAGGCCCGGAGAAAGAGAGAGTTTTCTTTGTAGACGAGCATGATATGTCGTCTATACCATAGCGAAATTGAAAATCAAATCGAAGTAAGTGTAAATTGTAAATCAAATAGTATTTTGATTCGACGAATCTTGAAACGAGACATGGCCCAAGTCAAAAAACTAGGCGGTTCGATCAAATTGGTATTTCGACTAAATAGTTATGGATGAATTCACAATTACAATTCGAATCGACTAAT
Callianthemum_coriandrifolium_1      TTAACATTATTTGTATTTTGTACTTGTACATAGTATAGTTTTTTATTTCTATTATTTGTTGTTTGTAGCTGTCCGGTTGGTTGCTCCATTGAAATAGAATCATTCCCGCATTCTCGCTCACGGGGATCATTCGGAACATGAAACTCAAAAAAATGCGTTTCAACGGAACCCATCGACATTTTAAAAATTTCGGATAAACAAACCCACTCTTTTCATTAATTTTCGTGGGTAGACAAA-TTTTTCCTGTTTTCCTACCCATGATCAACGAGTTAGTGATACTACCTTTGTTTGGTATACCTAAAGAAAAGTCAATTTTTGAAGTAAAAATCATATCATGACATGAGCCCGGCTAATAGACTCAAACCCAATTTCTTATCATTCAACATTTGAATTCTACTGATGCTGATTTCACTTTATGCAAGAAGATTGAGGTGGGGATCCGTTTGAACTTAGACGAGTTAGGAATCCCCCGACTTATCCACTTTTTTTGTGGAAGAACAACCCGAAATCATTGTTTCAGAGAGAATGAATTGATCCTAAATACATAATTGGGTTATAGGAAACTATGCGTTGTTATATGCAAGTGTAAGGACTCCTCGCGATTCAACACATCGAATCCAATCTATTAAGTCTCGTACAGTGAGAGATAATAAAATAAATAGGTCAATGCACTCTGTTTTCATATCTAATCAATAGAAGAAATAATATTCTACCCGGATCTTAATGATAAATAACGACATTGAATTCTATTTTTTCATATAATGAATGTATTTTATTTAAGACTAATACAAAACAATAAATTTTGTATTCTTGAAAATTTTAACTTCGAAACGAAATAAAAAAACAATAA--TTTTTTTTTTATTTAATGCCTTTTCTTTAGAGAGAACCCGAGGCCCGGAGAAAGAGAGAGTTTTCTTTGTAGACGAGCATGATATGTCGTCTATACCATAGCGAAATTGAAAATCAAATCGAAGTAAG-------TGTAAATCAAATAGTATTTTGATTCGACGAATCTTGAAACGAGACATGGCCCAAGTCAAAAAACTAGGCGGTTCGATCAAATTGGTATTTCGACTAAATAGTTATGGATGAATTCACAATTACAATTCGAATCGACTAAT
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