#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on May 23, 2024; 10:01 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Delfini C., Acosta J.M., Souza V.C., & Zuloaga F.O. 2020. Molecular Phylogeny of Axonopus (Poaceae, Panicoideae, Paspaleae): Monophyly, Synapomorphies, and Taxonomic Implications for Infrageneric Classification and Species Complexes. Annals of the Missouri Botanical Garden, 105(4): 459-480. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S26628] BEGIN TAXA; TITLE Taxa; DIMENSIONS NTAX=51; TAXLABELS Anthaenantiopsis_rojasiana Axonopus_anceps Axonopus_andinus Axonopus_apricus Axonopus_arcuatus Axonopus_argentinus Axonopus_aureus Axonopus_brasiliensis Axonopus_bryoides Axonopus_canescens Axonopus_capillaris Axonopus_centralis Axonopus_chrysoblepharis Axonopus_comans Axonopus_compressus Axonopus_conduplicatus Axonopus_cuatrecasasii Axonopus_eminens Axonopus_fastigiatus Axonopus_fissifolius Axonopus_flabelliformis Axonopus_furcatus Axonopus_herzogii Axonopus_hirsutus Axonopus_hydrolithicus Axonopus_kuhlmannii Axonopus_laxiflorus Axonopus_leptostachyus Axonopus_marginatus Axonopus_mathewsii Axonopus_micay Axonopus_monticola Axonopus_obtusifolius Axonopus_pellitus Axonopus_pennellii Axonopus_poiophyllus Axonopus_polystachyus Axonopus_pressus Axonopus_purpusii Axonopus_scoparius Axonopus_senescens Axonopus_siccus Axonopus_singularis Axonopus_suffultus Axonopus_tenuis Ichnanthus_calvescens Ocellochloa_stolonifera Paspalum_acuminatum Paspalum_notatum Steinchisma_laxum Streptostachys_asperifolia ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M55222] TITLE 'Axonopus BI matrix (nucleo)'; LINK TAXA = Taxa; DIMENSIONS NCHAR=1061; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Anthaenantiopsis_rojasiana ?AAGGTTTCCGTAGG?TGAACCTGCGGAAGGATCATTGTCGTGACCCTTAAA?CAAAATAGACC?GTGAATGTGTCATCTATCTCGCTAGACTTTGGTCTGGCTTTGGCTCCCG?ACCTTCCAC?TTAGAGGG???GAGGG??????GCCACAACAGAACCC???ACGGCGCC?GAAGG?CGT??????CAAGGAAAACTAATATTG???????CTTTGCGA??GGGCAAAGGCTGGCT??TGCTGGCCTAA?CCCCAAGCAGCGATTATTTATTAATCAACACGACTCTCGGCAA?CGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCAAAATGCGATACCTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGCGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAGGCCTTCTGG?CTGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACGCCAAAAGACACTCCCA?ACCCATCCTAGGGGCGGGATGTGGAGTTTGGCCTCCCGTGACATTGAGCACGGTAGGCCGAAG?TCTTGGCTGCCGGCATATCTTGCTGGGCACCGCACATGGTGGGCGACATCAAGTTGT?TCTCGGTGCAGCGCCCCAGCAAGTAGTTGGCATAATGGCATGAAGGACCCA??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Axonopus_anceps ?AAGGTTTCCGTAGG?TGAACCTGAGGAAGGATCATTGTCGTGACCCTTAAA?CAAAAGCGACC?GCGAACTTGTCACCCATACCGCTGGGCTTTGGTCCAGCAATGGCCCCTG?TGCTGCGACCTCGGAGCG???GAGGG??????GCCACAACAG???AACCTAGGGCGCC?GTAGG?CGT??????CAAGGAACACATATATTG???????CCTTGTGAG?GGGTGAGGGCTGGCC??TGCTAGCCTAA?CCCCGAGCAGCGATGATTCATGAATCCACACGACTCTCGGCAA?CGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCAAAATGCGATACCTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGCGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAGGCCTTCGGG?CCGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACGCCATTAGACACTCCCCT?CCCACCATAGGTAGGGGACGTGGAGTCTGGCCTCTCGTGCCGTAGGGCGCGGTGGGCTGAAG?TCTAGGCTGCCGGCGTATCTTGCCGGGCGCCGCACGTGGTGGGCGACTTCTAGCATA?CCTCGGTGCAGCGCCTTGGCACGTAGCCAGCGTACCGGCCGAAAGGACCCA??CGAC?TGCCGGCGCCT?GTGTCCCTT?CAA?TCGTT?AGCCGTTGCGCC?CGACC{AC}TATTAAGA??GTGCTTGC?GTGCTGCTACCA?GTCATACTGGAAGTTGCATTCGCTACAAGTTGTGTTCGTCGTGCTTGAC????CTAGGGCTTTGCATGTCGAC??TTGAAAGCGTTCACGGCGTTGCCTCGTGTAGCTAGCTGTCTAGGCTGCTGTCACCAAGGACACCTTTGTGGACGCTGTTGGTCTCGGATGCGGCATA?CG??AAAAAAGGCCGAT?GGTGCTT??CGGCGCCCCGTGCCTA?GCAAAGAT?TGTCCGAACGG??AAA?AA?CGACAGCTGGCCTGGCTGATGCCTTGTGCAG?ATGCTGGTGCT???????????????????????????????????????????????? Axonopus_andinus ?AAGGTTTCCGTAGG?TGAACCTGCGGAAGGATCATTGTCGTGACCCTTAAA?CAAAATAGACCCGCGAATGTGTCACCCATGCCACTGGGCTTCGGTCCAGCTATGGCCCCTG?ACCTTCGACCCTGGAGCT???AAGGG??????GCCACAA?CA??GAACCTAGGGCGCC?GTAGG?CGT??????CAAGGAACACATATATTG???????CCTTGTGAG?GGGCGAGGGCTGGCC??TGCTAGCCCAA?CCCCGAGCAGCGATGATTTATGAATCCACACGACTCTCGGCAA?CGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCAAAATGCGATACCTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGCGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAGGCCTTCGGG?CCGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACGCCAAAAGACACTCCCCT?CCCGCCATAGGTAGGGGACGTGGAGTCTGGCCCCTCGTGCCGCAGGGCACGGTGGGCCGAAG?TCTAGGCTGCTGGCGTATCTTGCCGGGTGCCGCACGTGGTGGGCGACTTGTAGCATA?CCTCGGTGTAGCCCCTCGGCACGTAGCCAGCGTCCCG????AAATGACCCA???????????????????????????????????????GGCTGTTGCGCCTTGACCCTAT?AAGA??GTGCTTGC?GTGCTGCTACCA?GTCACACTGGAAGTTGCATTCGCTACAAGTTGCGTTTGTCGTGCTTGCC????ATACGGCTTTGCACGTCGAC??TTGAAAGCGTTCATGGCGTTGCCTCGTGTAGGTAGCCGTCTAGGCTGCTATCACCAAGGACACCTT?GTGGACGCTCATGGTCTCGGATGCGGCATA?CG??AAAAA?GGCCGAT?GGTGCTT??TGGCGCCCCGTGCCTA?GCAAAGAT?TGTCCAATCGG??AAA?AAACGACAGCTGGCCTAGCTGATGCCTTGTGCGG?AGGCTTGTGCTGGCTCGTCGAC?GAGGACGTGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAG??? Axonopus_apricus ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CGAC?TGACGGCGCTT?GTGTCCCTT?CAA?CTTTT?GGCTGTTGTGCCT?GACCGCATTATGA??GTGCTTGC?GTGTTGCTACCA?GTCGTACTGGAAGTTGCATTCGACACAGGTT{AG}CGTTCGTCGTTCACGCC????TTTGGGCGCTGCACGTCGAC??ATGAAAGCATTCACAGCGTTGCCTCGTGTAGCTAGCCGCCTAGGCTGCTTTCACCAAGGACACCTT?GTGGATGCCATTGGTCTCGGATGCGGCTTA?CT??AAAAA?GGTCGAT?GGTGCTT??CGGCGCCGCGTGCCTA?GCAAAGAT?TGTCCAGTCGG??AAAA?AACGACAGCAGGCCTAGCTGATGCCTTGTGTAG?AGGCTTGAGCCTGCTCGTCGAT?GAGGACGTGCTACCTGGTTGA?CCTGCCAGTA???? 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Axonopus_argentinus ?AAGGTTTCCGTAGG?TGAACCTGCGGAAGGATCATTGTCGTGACCCTTAAAACAAAACAGACCG?CGAACGTGTCACCCATGTCGCTGAACTTCGGTCCAGCTTTGGCCCCTT?TCCCCCTACT?TGGAGGT???AAGGG??????GCC?CAA?CA??GAACCTAGGGCGCC?GTAGG?CGT??????CAAGGAAA?CATATATTG???????CCTTGCG?C?GGGTGAGGGCTGGC???TGC?AGTCTAA?CCCCGA?CAACGATGAATCTTTAATCCACACGACTCTCGGCAA?CGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCAAAATGCGATACCTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGCGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAGGCCTTCGGG?CCGAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCCAATAGACACTCCCCT?CCCACCATATGTAGGGGACGTGGAGTCTGGCCTCTCGTGCCGCAGGGCGCGGTGGGCCGAAG?TCTAGGCTGCCGGCGTATCTTGCCGAGCGCCGCACGTGGTGGGCGACTTCTAGCAAA?CCTCGGTGCAGCGCCTCGGCATGTAGCCAGCGTATTGGCCGAAAGGACCCA???????????????????????????????????????GGCTATTGTTCCT?GACCGCATTATGA??GTGCTTGC?GTGTTGCTACCA?GTTGTACTGGAAGTTGCAATCGACACGGGTAGCGTTCGTCGTTCACGCC????CTTCGGCGCTGCACGTCGAC??ATGAAAACATTCACAGCGTTGCCTCGTGTAGCTAGCCGCCTAGGCGGCTTTCACCAAGGACACCTT?GTGGATGCCATTGGTCTTGGATGCGGCTTA?CT??AAAAA?GGTCGAT?GGTGCTT??CGGCGCCGCGTGCCTA?GAAAAAAT?GGCCCAGCCGA??AAAA?A?CAACAGCGGGCCTAGCTAAGGCTTTGGGTAG?AGCCTTGAGCTTGCTCGTCAAT?AAGGACGTGCTACCGGGTTGACCCGGCCAGTAG??? 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Axonopus_herzogii ?????????????GG???A??CTGCGGA?GGATCATTGTCGTGACCCTTAAAACAAAACTGACCG?CGAACGTGTCACCCATGTCGCTGAACTTCGGTCCAGCTACGGCACCTT?TCCCCCTTCT?TGGAGGT???AAGGG???????CCACAA?CA??GAACCTAGGGCGCC?GTAGG?CGT??????CAAGGAACACATGTATTG???????CCTTGTGAC?GGGTGAGGGCTGGCC??TGCCAGTCTAA?CCCTGAGCAGCGATGATTCATTAATCCACACGACTCTCGGCAA?CGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCAAAATGCGATACCTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGCGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAGGCCTTCGGG?CCGAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCCAATAGACACTCCCCT?CCCACCATATGTAGGGGACGTGGAGTCTGGCCTCTCATGCCTCAGGGCACGGTGGGCTGAAG?TCTAGGCTGCCGGCGTATCTTGCCGAGCGCCGCACGTGGTGGGCGACTTCTAGCAAA?CCTCGGTGCAGTGCCTCGGCATGTAGCCAGCGTATTGGCCGAAAGGACCCA??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 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