CiteULike CiteULike
Delicious Delicious
Connotea Connotea

Matrix 667 of Study 1290

About Citation title: "A Phylogeny of the Monocots, as Inferred from rbcL and atpA Sequence Variation".
About This study was previously identified under the legacy study ID S951 (Status: Published).

Matrices

Title: Combined, informative only

Description: Legacy TreeBASE Matrix ID = M1575

Rows

Taxon Label Row Segments Characters 1?–30
Acanthochlamys  (none) ATCAGGAGGATTTATA?CGGCGTAAGTG{A
Acorus calamus  (none) AGCAGGGTGCCAGACTGTGGCGTAATTGCA
Acorus gramineus  (none) AG?????TTCCAGACTGTGGCGTAATTTCA
Acorus tatarinowii  (none) AGCAGGGTGCCAGACTGTGGCGTAATTTCA
Alisma  (none) AG????ATA{AC}TTTATAAGGACTTTAAT
Caldesia  (none) AG???????????????GGACTTTAATGCG
Sagittaria  (none) AG??GGATGATTTATAAGCACTCTACTGCG
Alstroemeria  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Amborella  (none) AA??GGATGATTTATAGCGGCGTGATTGCG
Anarthria  (none) AACTGGATGATTTATAGGGGCGTGATTGCG
Annona  (none) AA????ATGATTTATAGCGGCGTGAGTGTG
Anthericum  (none) AA???????ATTTACAGCGGCGTAAATGCG
Arisaema  (none) TTCAGGATGATTTATAGCG{AG}CGTAAGT
Gymnostachys  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTGATTTCG
Orontium  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTGAGTGCG
Symplocarpus  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTGAGTGCG
Calamus  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Euterpe  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Nypa  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Phoenix  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Phytelephas  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Plectocomia  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Trithrinax  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Aristolochia  (none) AA??GGATGATTTATAGCGGCGTGATTGCG
Asarum  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTGATTGCG
Saruma  (none) AACAGAATGATTTATAGCGGCGTGATTGCG
Astelia  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Neoastelia  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Austrobaileya  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTGAGTGCG
Epimedium  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTGAGTGCG
Mahonia  (none) AA???????ATTTATAGCGGCGTGAGTGCG
Blandfordia  (none) AA?AGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Alania  (none) AA?AGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Borya  (none) AA?AGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Ananas  (none) AG?AGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Brocchinia  (none) AG??GGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Catopsis  (none) AGCAGGATGATTTATAGCGGAGTAAGTGCG
Hechtia  (none) AGCAGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Puya  (none) AG??GGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Tillandsia  (none) AG?AGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Burmannia  (none) AACCGGATGATTTATA?CGGCGTAAGTG{A
Thismia  (none) TA?AGGATGATTTATAGCGGAGTAAGTGCG
Butomus  (none) AG?AGGATGATTTATAGGGGCGCGAATTCG
Calochortus  (none) AA???????????????CGGCGTAAGTGCG
Calycanthus  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTGAGTGCG
Chimonanthus  (none) AA?????????TTATAGCGGCGTGAGTGCG
Idiospermum  (none) AA??????GATTTATAGCGGCGTGAGTGCG
Campynema  (none) ?ACAG?ATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Canna  (none) ATCAGGATGATTTATAGCGGCGTAATTGCG
Ceratophyllum  (none) AA?????TGATATATAGCGGCGTGAGTGTG
Cercidiphyllum  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTGATTGCG
Chloranthus  (none) AA?AGGATGATTTATAGCGGCGTGAGTGCG
Hedyosmum  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTGAGTGCG
Burchardia  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Schelhammera  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Wurmbea  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGACAGTGCG
Callisia  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Cochliostema  (none) AA?AGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Commelina  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTAATTGCG
Dichorisandra  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Murdannia  (none) AACCGGATGGCTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Palisota  (none) ?ACAGGATGATTTATGGCGGCGTAAGTGCG
Arachnitis  (none) TA????????TTTATAGCGGCGTGAGTGCG
Costus  (none) AT???????ATTTATAGCGGCGTAATTGCG
Dimerocostus  (none) AT?????????TTATAGCGGCGTAATTGCG
Monocostus  (none) AT???????????????????GTAATTGCG
Tapeinochilos  (none) AT?????????????????????AATTGCG
Carludovica  (none) ATCAGAATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Chorigyne  (none) ATGAGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Cyclanthus  (none) ATCAGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Sphaeradenia  (none) ATGAGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Cymodocea  (none) AA????????????????????????TGTG
Carex  (none) AG?AGGATGATTTATAGCGGCGGTAGCGCG
Baxteria  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Calectasia  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Dasypogon  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Kingia  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGAGTAAGTGCG
Dioscorea  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTAATTGCG
Tamus  (none) AA??????????????????CGTAATTGCG
Doryanthes  (none) AA??GGATGATTTATAGCGGAGTAAGTGCG
Ecdeiocolea  (none) AACAGGATGATTTTTAGCTGCGTAAGTGCG
Eriocaulon  (none) AGCAGGATGATTTATAGCGGCGTCAGTACG
Lachnocaulon  (none) AG????????TTTATAGCGGCGTCAGTGCG
Syngonanthus  (none) AG???????ATTTATAGCGGCGTCAGTGCG
Tonina  (none) AGCAGGATGATTTATAGCGGCGTCAGTGCG
Eupomatia  (none) AA?AGGATGATTTATAGCGGCGTGAGTGCG
Flagellaria  (none) AACAGGGTGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Anigozanthos  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTAATTGCG
Haemodorum  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTAATTGCG
Xiphidium  (none) ????GGATGATTTATAGCGGCGTAATTGCG
Hanguana  (none) AACAGGATGATTTATA?CGGCGTGTGTG{A
Heliconia  (none) ATCAGGATGATTTATAGCGGCGTAATTGCG
Dianella  (none) AACAGGATGATTTATAACGGCGTAAGTGCG
Geitonoplesium  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTAAATGCG
Hemerocallis  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Xeronema  (none) AACAGGATGATT?ATA?CGGCGTA{AT}GT
Gyrocarpus  (none) AGCAGGATGATTTATAGCGGCGTGAGTGCG
Trithuria  (none) ??????????????????????????????
Ottelia  (none) AG???????????????????GTGAATTCG
Curculigo  (none) AACCGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Hypoxis  (none) AACCGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Illicium  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGAGATTGCG
Neomarica  (none) AA??????GATTTCTAGCGGCGTAA?TGCG
Sisyrinchium  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Ixiolirion  (none) TA?AGGATGATTTAT?GCGGCGTAATTGCG
Johnsonia  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Joinvillea  (none) AA?AGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Juncus  (none) AG??GGATGATTTATAGTGGCGAAAGTGCG
Luzula  (none) AG??GGATGATTTATAGTGGCGAAAGCGCG
Prionium  (none) AG????ATGATTTATAGGGGCGTAATTGCG
Triglochin  (none) AGCAGGATGATTTATAAGGGCGTAACTGCG
Lactoris  (none) AA?AGAATACTTTATAGCGGCGTGATTGCG
Akebia  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTGATTGCG
Stauntonia  (none) AA??GGATGATTTATAGCGGCGTGATTGCG
Neolitsea  (none) AA?AGGATGATTTATAGCGGCGT?AGT{CT
Clintonia  (none) AA????????TTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Lilium  (none) AA????????????????????????????
Arthropodium  (none) AACAGGATGATTTATAGCGACGTAAGTGCG
Eustrephus  (none) AACAGGATGATTTATAGCGACGTAAGTTCG
Sowerbaea  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTAATTGCG
Thysanotus  (none) AACAGGATGATTTATAGCGACGTAAGTGCG
Orchidantha  (none) ATCATCCTGATTTATAGCGGCGTAAATGCG
Luzuriaga  (none) AA?????????????AGCGGCGTAAGTGCG
Liriodendron  (none) AACAG{AG}ATGATTTATAGCGGCGTGAGT
Magnolia  (none) AA?????TGATATATAGCGGCGTGAGTGCG
Michelia  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTGAGTGCG
Calathea  (none) ?TCAGGATGATTTATAGCGGCGTAATTGCG
Maranta  (none) ?TCAGGATGATTTATAGCGGCGTAATTGCG
Mayaca  (none) AACAGGATGATTTATAGGGGCGGAAGTGCG
Amianthium  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Chamaelirium  (none) AACAGGATGATTTATA?CGGCGTAATTGCG
Veratrum  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Atherosperma  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTGAGTGCG
Doryphora  (none) AACAGAATGATTTATAGCGGCGTGAGTGCG
Musa  (none) ATCAGGATTATTTATAGCGTCGTTAGTGCT
Myristica  (none) AA??????GATTTATAGCGGCGTGAGTGCG
Aletris  (none) AA??GGATGATTTATAGCGGCGTGAGTGCG
Narthecium  (none) AACAGGATGATTTATA?CGGCGTGA?TGAG
Nelumbo  (none) AA??GGATGATTTATAGCGGCGTGATTGCG
Nuphar  (none) AA?AGAATAATTTATAGCGGCGCGATTGCG
Nymphaea  (none) ?ACCGGATGATTTATAGCGGCGCGAGTGCG
Victoria  (none) ?A???????????????CGGCGCGAGTGCG
Calopogon  (none) AA??GGATGATTTTTAGCGGCGTAAGTGCG
Cypripedium  (none) AA?AGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTTCG
Epipactis  (none) AACAGGATGATTTTTAGCGGCGTAA{GT}T
Isotria  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTAATTGCG
Neuwiedia  (none) TA??GGATGATTTATAGCGGCGTAATTTCG
Freycinetia  (none) ATCAGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Pandanus  (none) ATCAGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Petermannia  (none) AA??GGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Japonolirion  (none) AA?AGGATGATTTATAGCGGCGT?AGTGCG
Petrosavia  (none) AACAGGATGATTTATA?CGGCGTGAGTGCG
Helmholtzia  (none) AA??GGATGATTTATAGCGGCGTAAATGCG
Philydrella  (none) AA???????ATTTATAGCGGCGTAAATGCG
Philydrum  (none) AA?AGGATGATTTATAGCGGCGTAAATGCG
Philesia  (none) AA?????????TTATAGCGGCGTAAGTGCG
Macropiper  (none) AA??GGATGATTTATAGCGGCGTGATTGCG
Peperomia  (none) AA?AGGATGATTTATAGCGGCGTGATTGCG
Piper  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTGATTGCG
Platanus  (none) AA???????ATTTATAGCGGCGTGATTGCG
Anomochloa  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Bambusa  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Oryza  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Pharus  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Streptochaeta  (none) AA??GGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Eichhornia azurea  (none) AACAGGGTGATTTATAGCGGCGAAAGTGCG
Eichhornia paniculata  (none) AA???GATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Heteranthera  (none) AA??????????????????????AGTGCG
Hydrothrix  (none) AA?AGGAG?ATTTATAGCGGCTTAAGTGCG
Monochoria  (none) AA??????????????????????AGTGCG
Pontederia  (none) AA????????????????????????????
Potamogeton  (none) AGCAGGATGATTTATAGCGGCGTAATTGCG
Cephalostemon  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Epidryos  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Kunhardtia  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Rapatea  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Schoenocephalium  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Spathanthus  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Stegolepis  (none) AA?AGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Baloskion  (none) AA?AGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Elegia  (none) AA??????????TATAGCGGCGTAAGTGCG
Lepyrodia  (none) ????GGATGATTTATAGCG?CGTAAGTGC?
Thamnochortus  (none) AA?AGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Houttuynia  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTGATTGCG
Saururus  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTGATTGCG
Scheuchzeria  (none) AG????????????????????????TGCG
Schisandra  (none) AACAGAATGATTTATAGCGGCGTGATTGCG
Ripogonum  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTATTTGCG
Smilax  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Croomia  (none) ATCAGAATGATTTATAGCGGAGTAAGTGCG
Stemona  (none) AT???????ATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Ravenala  (none) ATCAGGATGATTTATAGCGGCGTAATTGCG
Strelitzia  (none) ATCAGGATGATTTATAGCGGCGTAATTGCG
Tacca  (none) AA??GGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Tecophilaea  (none) AA?AGGATGATTTATA?CGGCGTAAGTGCG
Thurnia  (none) AGCAGGATGATTTATAGGGGCGTAATTGCG
Pleea  (none) AACAGGATGATTTATC?CGGCGTGAGTGCG
Tofieldia  (none) AA??????????????????????AGTGCG
Avetra  (none) AA????????????TAGCGGCGTAAGTGCG
Trichopus  (none) ?????????????????????GTAAGTGCG
Trillium  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Lacandonia  (none) ATCATCCTGATTTATAGTGGCGTGAGTGCG
Sciaphila  (none) AT??GGATGATTTATAGCGGAGTAATTGCG
Triuris  (none) AT????CTGATTTATAGTGGCGTAAGTGCG
Sparganium  (none) AGCAGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Typha  (none) AGCAGGATGATTTATAGCGGCGTAATTGCG
Barbaceniopsis  (none) AT????????????TAGCGGCGTAAGTGCG
Talbotia  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTAAGTGCG
Drimys  (none) AA?AGGATGATTTATAGCGGCGTGATTGCG
Tasmannia  (none) AA?????TGATTTATAGCGGCGTGATTGCG
Xanthorrhoea  (none) AACAGGATGATTTATAGCGGCGTAATTGCG
Abolboda  (none) ??CAGGATGATTTCTAGGGACGAGAGTGCG
Aratitiyopea  (none) AA?????TGATTTATAGCCGAGTGAGTGCG
Orectanthe  (none) AA???GATGATTTATGGCCGAGTGAGTGCG
Xyris bicephala  (none) AA??GGATGATTTATAG{GT}GGCGTGAGT
Xyris jupicai  (none) AA???????ATTTATAGGGGCGTGAGTGCG
Alpinia  (none) ATCAGGATGATTTATAGCGGCGTAATTGCG
Globba  (none) AT?????????????AGCGGCGTAATTGCG

Columns

None of the columns has a description.