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TreeBASE (cc) 1994-2008

Study reference:
Nesnidal M., Helmkampf M., Bruchhaus I., & Hausdorf B. 2010. Compositional Heterogeneity
and Phylogenomic Inference of  Metazoan Relationships. Molecular Biology
and Evolution, 27(6): 1-10.

TreeBASE Study URI:  http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S10436]

BEGIN TAXA;
        TITLE  Taxa;
        DIMENSIONS NTAX=36;
        TAXLABELS
            Acropora_millepora
            Alcyonidium_diaphanum
            Apis_mellifera
            Aplysia_californica
            Arenicola_marina
            Argopecten_irradians
            Ascaris_suum
            Barentsia_elongata
            Bugula_neritina
            Capitella_sp.
            Cerebratulus_lacteus
            Crassostrea_gigas
            Daphnia_pulex
            Euprymna_scolopes
            Flaccisagitta_enflata
            Flustra_foliacea
            Homarus_americanus
            Homo_sapiens
            Hypsibius_dujardini
            Idiosepius_paradoxus
            Lineus_viridis
            Lumbricus_rubellus
            Nematostella_vectensis
            Novocrania_anomala
            Pedicellina_cernua
            Philodina_roseola
            Phoronis_ijimai
            Phoronis_muelleri
            Priapulus_caudatus
            Sipunculus_nudus
            Spadella_cephaloptera
            Strongylocentrotus_purpuratus
            Takifugu_rubripes
            Terebratalia_transversa
            Tubulipora_sp.
            Xiphinema_index
            ;
END;

BEGIN CHARACTERS;
[! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M7126]

	TITLE '36Taxa_11544AA';
	LINK TAXA = Taxa;
	DIMENSIONS NCHAR=11544;
	FORMAT DATATYPE=Protein SYMBOLS= "A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y" MISSING=? GAP= -;

MATRIX
[                                         10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220       230       240       250       260       270       280       290       300       310       320       330       340       350       360       370       380       390       400       410       420       430       440       450       460       470       480       490       500       510       520       530       540       550       560       570       580       590       600       610       620       630       640       650       660       670       680       690       700       710       720       730       740       750       760       770       780       790       800       810       820       830       840       850       860       870       880       890       900       910       920       930       940       950       960      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Acropora_millepora                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Alcyonidium_diaphanum             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Apis_mellifera                    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Aplysia_californica               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Arenicola_marina                  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Ascaris_suum                      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Barentsia_elongata                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Daphnia_pulex                     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Euprymna_scolopes                 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Homo_sapiens                      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Hypsibius_dujardini               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Idiosepius_paradoxus              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Nematostella_vectensis            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Novocrania_anomala                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Philodina_roseola                 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Phoronis_ijimai                   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Priapulus_caudatus                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Spadella_cephaloptera             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Strongylocentrotus_purpuratus     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Terebratalia_transversa           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