CiteULike CiteULike
Delicious Delicious
Connotea Connotea

Matrix 7803 of Study 11225

About Citation title: "Phylogenetic Relationships of Asclepias (Apocynaceae) Inferred from Non-coding Chloroplast DNA Sequences".
About Study name: "Phylogenetic Relationships of Asclepias (Apocynaceae) Inferred from Non-coding Chloroplast DNA Sequences".
About This study is part of submission 11215 (Status: Published).

Matrices

Title: Asclepias DNA

Description: rpl16, trnC-rpoB, trnS-G/trn G combined

Rows

Taxon Label Row Segments Characters 1?–30
Cynanchum ligulatum  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACTATAG
Pergularia daemia  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Kanahia laniflora  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Calotropis procera  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Glossostelma carsonii  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Pachycarpus lineolatus  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Xysmalobium fraternum  (none) GGATTCAAATAGACCAGCCCAACACCATAG
Xysmalobium undulatum  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Gomphocarpus fruticosus ssp. fruticosus  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Gomphocarpus fruticosus ssp. rostratus  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Gomphocarpus cancellatus  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Stenostelma corniculatum  (none) --------------------------ATAG
Trachycalymma pseudofimbriatum  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Trachycalymma buchwaldii  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAA
Stathmostelma gigantiflorum  (none) GGATTCAAAAAG{AC}CCAGCCCAACACCA
Schizoglossum alpestre  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Margaretta rosea  (none) ------------------------------
Asclepias aurea  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAATACCATAG
Asclepias gibba  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias macropus  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias praemorsa  (none) -------AAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias randii  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias multicaulis  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias densiflora  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias cutleri  (none) GGATTCAAAAAGACCAACCCAACACCATAG
Asclepias leptopus  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias subulata  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias subulata x Asclepias albicans  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias masonii  (none) GGATTCAAAAAAACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias albicans  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias subaphylla  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias emoryi  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias oenotheroides  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias nyctaginifolia  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias aff. standleyi  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias standleyi  (none) G{GT}ATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCA
Asclepias arenaria  (none) GGATTCAAAAAGTCCAGCCCAACACCATAG
Asclepias prostrata  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias engelmanniana  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAATACCATAG
Asclepias stenophylla  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias hirtella  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias longifolia  (none) GGATTCAAAAAG{AG}CCAGCCCAACACCA
Asclepias viridiflora  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias scaposa  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias solanoana  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias californica ssp. californica  (none) GGATTCAAAAAGTCCAGCCCAAC{AG}CCA
Asclepias californica ssp. greenei  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias vestita ssp. parishii  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias vestita ssp. vestita  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias erosa  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias cryptoceras ssp. davisii  (none) G{GT}ATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCA
Asclepias cryptoceras ssp. cryptoceras  (none) GGATTCAAAAAG{AT}CCAGCCCAACACCA
Asclepias humistrata  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias cordifolia  (none) GGATTCAAAAAGTCCAGCCCAAC{AG}CCA
Asclepias linaria  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias atroviolacea  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias mcvaughii  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias hypoleuca  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias melantha  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias rosea  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias quinquedentata  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias schaffneri  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias nummularia  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias lemmonii  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias otarioides  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias ovata  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias notha  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias sp. nov. cf. notha  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias sp. nov. cf. pringlei  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias vinosa  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias virletii  (none) GGATTCAAAAAG{AT}CCAGCCCAACACCA
Asclepias scheryi JAL  (none) --------------CAGCCCAACACCATAG
Asclepias scheryi MICH  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias similis NL  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias similis QRO  (none) -----------GACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias zanthodacryon  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias fournieri  (none) GGATTCAAAAAGTCTAGCCCAACGCCATAG
Asclepias brachystephana  (none) GAATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias pellucida  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias auriculata  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias jorgeana  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias pringlei  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias aff. pringlei  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias circinalis  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias puberula  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias pratensis  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias macrotis  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCC-AACACCATAG
Asclepias coulteri  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCC-AACACCATAG
Asclepias elegantula  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias jaliscana  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias candida  (none) GGATTCAAAAAGACCAACCCAACACCATAG
Asclepias boliviensis  (none) GGATTCAAAAAGACCAACCCAACACCATAG
Asclepias mellodora  (none) GGATTCAAAAAGACCAACCCAACACCATAG
Asclepias barjoniifolia  (none) GGATTCAAAAAGACCAACCCAACACCATAG
Asclepias flava  (none) GGATTCAAAAAGACCAACCCAACACCATAG
Asclepias nivea  (none) GGATTCAAAAAGACCAACCCAACACCATAG
Asclepias curassavica  (none) GGATTCAAAAAGTCCAACCCAACACCATAG
Asclepias fascicularis  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias verticillata  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias pumila  (none) GGATTCA{AT}AAAGACCAGCCCAACACCA
Asclepias subverticillata NL  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias subverticillata NM  (none) ------------------CCAACACCATAG
Asclepias texana  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias perennis  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias incarnata ssp. incarnata  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias linearis  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAAC{AT}CCA
Asclepias incarnata ssp. pulchra  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias mexicana  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias angustifolia  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias gentryi  (none) {AG}GATTCAAAATG{AT}CCAG{CT}CCA
Asclepias woodsoniana  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias amplexicaulis  (none) GGATTCAAAAAGACTAGCCCAACACCATAG
Asclepias lanceolata  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias latifolia  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias speciosa NM  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAAC{AT}CCA
Asclepias speciosa CA  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias ovalifolia  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias variegata  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias hallii  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias curtissii  (none) -----------GACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias purpurascens  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias meadii  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias exaltata  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias quadrifolia  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias syriaca  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias tuberosa ssp. rolfsii  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAATACCATAG
Asclepias tuberosa ssp. interior KS  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias tuberosa ssp. interior MS  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias obovata  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias michauxii  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias sullivantii  (none) GGATTCAAACAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias tomentosa  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias connivens  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias welshii  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias macrosperma  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias involucrata  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias labriformis  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias asperula ssp. capricornu  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias asperula ssp. asperula  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias viridis  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias eriocarpa  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias ruthiae  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias uncialis  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias sanjuanensis  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias glaucescens  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias elata  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias aff. glaucescens  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias mirifica  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias lynchiana  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias macroura  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias feayi  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias cinerea  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias viridula  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias pedicellata  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG
Asclepias rubra  (none) GGATTCAAAAAGACCAGCCCAACACCATAG

Columns

None of the columns has a description.