#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 19, 2024; 8:59 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Jordan S., Simon C., & Polhemus D. 2003. Molecular systematics and adaptive radiation of Hawaii's endemic damselfly genus Megalagrion (Odonata: Coenagrionidae). Systematic Biology, 52(1): 89-109. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S1004] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=68; TAXLABELS Agriocnemis_exsudans Argia_johanella Argia_sedula Drosophila_yakuba Enallagma_geminatum Ischnura_aurora Ischnura_heterosticta Megalagrion_adytum_A1 Megalagrion_adytum_A2 Megalagrion_blackburni_B28 Megalagrion_blackburni_B33 Megalagrion_blackburni_B6 Megalagrion_calliphya_C14 Megalagrion_calliphya_C2 Megalagrion_calliphya_c30 Megalagrion_eudytum_E1 Megalagrion_eudytum_E8 Megalagrion_hawaiiense_Hw1 Megalagrion_hawaiiense_Hw2 Megalagrion_hawaiiense_Hw29 Megalagrion_hawaiiense_Hw40 Megalagrion_hawaiiense_Hw59 Megalagrion_hawaiiense_Hw81 Megalagrion_heterogamias_Ht1 Megalagrion_heterogamias_Ht22 Megalagrion_kauaiense_Ka1 Megalagrion_kauaiense_Ka2 Megalagrion_koelense_KL94 Megalagrion_koelense_Kl10 Megalagrion_koelense_Kl25 Megalagrion_koelense_Kl5 Megalagrion_koelense_Kl50 Megalagrion_koelense_Kl6 Megalagrion_leptodemas_L1 Megalagrion_leptodemas_L2 Megalagrion_mauka Megalagrion_nesiotes_Ns3 Megalagrion_nesiotes_Ns4 Megalagrion_nigrohamatum_nigrohamatum_Nh1 Megalagrion_nigrohamatum_nigrohamatum_Nh4 Megalagrion_nigrohamatum_nigrolineatum Megalagrion_oahuense_Oa4 Megalagrion_oahuense_Oa7 Megalagrion_oceanicum_Oc1 Megalagrion_oceanicum_Oc2 Megalagrion_oresitrophum_Op3 Megalagrion_oresitrophum_Op9 Megalagrion_orobates_OB2 Megalagrion_orobates_OB3 Megalagrion_orobates_Ob1 Megalagrion_pacificum_Pc14 Megalagrion_pacificum_Pc21 Megalagrion_pacificum_Pc8 Megalagrion_paludicola_Pa1 Megalagrion_paludicola_Pa2 Megalagrion_sp_nov_Ka4 Megalagrion_vagabundum_V1 Megalagrion_vagabundum_V3 Megalagrion_xanthomelas_X10 Megalagrion_xanthomelas_X108 Megalagrion_xanthomelas_X111 Megalagrion_xanthomelas_X22 Megalagrion_xanthomelas_X54 Megalagrion_xanthomelas_X74 Megalagrion_xanthomelas_X81 Pseudagrion_civicum Pseudagrion_pacificum Pseudagrion_palauense ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M571] TITLE All_Data; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=2333; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=n GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1750 1760 1770 1780 1790 1800 1810 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Ischnura_heterosticta 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Megalagrion_calliphya_C2 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; END; BEGIN SETS; CHARSET COII (CHARACTERS = All_Data) = 1-666; CHARSET tRNA (CHARACTERS = All_Data) = 667-816; CHARSET EF1 (CHARACTERS = All_Data) = 1288-2326; CHARSET intron1 (CHARACTERS = All_Data) = 1326-1419; CHARSET A8 (CHARACTERS = All_Data) = 817-971; CHARSET intron2 (CHARACTERS = All_Data) = 1849-1966; CHARSET A6 (CHARACTERS = All_Data) = 972-1287; CHARSET mtDNA (CHARACTERS = All_Data) = 1-1287; CHARSET intron3 (CHARACTERS = All_Data) = 2243-2330; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = All_Data) = N: 667-816, 1: 1-666\3 817-972\3 975-1289\3, 2: 2-667\3 818-973\3 976-1287\3, 3: 3-668\3 819-971\3 974-1288\3; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = All_Data) = N: 667-816, 1: 1-666\3 817-972\3 975-1289\3, 2: 2-667\3 818-973\3 976-1287\3, 3: 3-668\3 819-971\3 974-1288\3; END; BEGIN TREES; TITLE Tb6509; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Megalagrion_pacificum_Pc8, 2 Megalagrion_paludicola_Pa1, 3 Megalagrion_paludicola_Pa2, 4 Megalagrion_sp_nov_Ka4, 5 Megalagrion_vagabundum_V1, 6 Megalagrion_vagabundum_V3, 7 Megalagrion_xanthomelas_X10, 8 Megalagrion_xanthomelas_X108, 9 Megalagrion_xanthomelas_X111, 10 Megalagrion_xanthomelas_X22, 11 Megalagrion_xanthomelas_X54, 12 Megalagrion_xanthomelas_X74, 13 Megalagrion_xanthomelas_X81, 14 Pseudagrion_civicum, 15 Pseudagrion_pacificum, 16 Pseudagrion_palauense, 17 Megalagrion_pacificum_Pc21, 18 Megalagrion_pacificum_Pc14, 19 Megalagrion_orobates_OB3, 20 Megalagrion_orobates_OB2, 21 Megalagrion_orobates_Ob1, 22 Megalagrion_oresitrophum_Op9, 23 Megalagrion_oresitrophum_Op3, 24 Megalagrion_oceanicum_Oc2, 25 Megalagrion_oceanicum_Oc1, 26 Megalagrion_oahuense_Oa7, 27 Megalagrion_oahuense_Oa4, 28 Megalagrion_nigrohamatum_nigrolineatum, 29 Megalagrion_nigrohamatum_nigrohamatum_Nh4, 30 Megalagrion_nigrohamatum_nigrohamatum_Nh1, 31 Megalagrion_nesiotes_Ns4, 32 Megalagrion_nesiotes_Ns3, 33 Megalagrion_mauka, 34 Megalagrion_leptodemas_L2, 35 Megalagrion_leptodemas_L1, 36 Megalagrion_koelense_KL94, 37 Megalagrion_koelense_Kl6, 38 Megalagrion_koelense_Kl50, 39 Megalagrion_koelense_Kl5, 40 Megalagrion_koelense_Kl25, 41 Megalagrion_koelense_Kl10, 42 Megalagrion_kauaiense_Ka2, 43 Megalagrion_kauaiense_Ka1, 44 Megalagrion_heterogamias_Ht22, 45 Megalagrion_heterogamias_Ht1, 46 Megalagrion_hawaiiense_Hw81, 47 Megalagrion_hawaiiense_Hw59, 48 Megalagrion_hawaiiense_Hw40, 49 Megalagrion_hawaiiense_Hw29, 50 Megalagrion_hawaiiense_Hw2, 51 Megalagrion_hawaiiense_Hw1, 52 Megalagrion_eudytum_E8, 53 Megalagrion_eudytum_E1, 54 Megalagrion_calliphya_c30, 55 Megalagrion_calliphya_C2, 56 Megalagrion_calliphya_C14, 57 Megalagrion_blackburni_B6, 58 Megalagrion_blackburni_B33, 59 Megalagrion_blackburni_B28, 60 Megalagrion_adytum_A2, 61 Megalagrion_adytum_A1, 62 Ischnura_heterosticta, 63 Ischnura_aurora, 64 Enallagma_geminatum, 65 Drosophila_yakuba, 66 Argia_sedula, 67 Argia_johanella, 68 Agriocnemis_exsudans; TREE Fig._3 = [&R] (((((((((61,53),4),5),(48,(33,2))),(32,27)),((((51,49),46),50),47)),(((57,25),45),(43,(((41,38),36),40)))),((18,1),((7,10),13))),(((55,35),22),((30,28),(21,20)))); END; BEGIN TREES; TITLE Tb6511; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Megalagrion_pacificum_Pc8, 2 Megalagrion_paludicola_Pa1, 3 Megalagrion_paludicola_Pa2, 4 Megalagrion_sp_nov_Ka4, 5 Megalagrion_vagabundum_V1, 6 Megalagrion_vagabundum_V3, 7 Megalagrion_xanthomelas_X10, 8 Megalagrion_xanthomelas_X108, 9 Megalagrion_xanthomelas_X111, 10 Megalagrion_xanthomelas_X22, 11 Megalagrion_xanthomelas_X54, 12 Megalagrion_xanthomelas_X74, 13 Megalagrion_xanthomelas_X81, 14 Pseudagrion_civicum, 15 Pseudagrion_pacificum, 16 Pseudagrion_palauense, 17 Megalagrion_pacificum_Pc21, 18 Megalagrion_pacificum_Pc14, 19 Megalagrion_orobates_OB3, 20 Megalagrion_orobates_OB2, 21 Megalagrion_orobates_Ob1, 22 Megalagrion_oresitrophum_Op9, 23 Megalagrion_oresitrophum_Op3, 24 Megalagrion_oceanicum_Oc2, 25 Megalagrion_oceanicum_Oc1, 26 Megalagrion_oahuense_Oa7, 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Megalagrion_hawaiiense_Hw29, 50 Megalagrion_hawaiiense_Hw2, 51 Megalagrion_hawaiiense_Hw1, 52 Megalagrion_eudytum_E8, 53 Megalagrion_eudytum_E1, 54 Megalagrion_calliphya_c30, 55 Megalagrion_calliphya_C2, 56 Megalagrion_calliphya_C14, 57 Megalagrion_blackburni_B6, 58 Megalagrion_blackburni_B33, 59 Megalagrion_blackburni_B28, 60 Megalagrion_adytum_A2, 61 Megalagrion_adytum_A1, 62 Ischnura_heterosticta, 63 Ischnura_aurora, 64 Enallagma_geminatum, 65 Drosophila_yakuba, 66 Argia_sedula, 67 Argia_johanella, 68 Agriocnemis_exsudans; TREE Figs._4_5 = [&R] (((((((((((61,53),4),(52,5)),(48,(33,2))),(32,27)),((((51,49),46),50),47)),(((41,38),36),40)),((57,25),45)),43),(((18,1),(7,10)),(17,13))),(((55,35),22),((30,28),(21,20)))); END;