#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 20, 2024; 1:22 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Zhang L., & He H. 2010. Polystichum speluncicola sp. nov. (sect. Haplopolystichum, Dryopteridaceae) based on morphological, palynological, and molecular evidence with reference to the non-monophyly of Cyrtogonellum. Systematic Botany, 35(1): 13-19. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S10051] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=41; TAXLABELS Cyrtogonellum_caducum_AY736350 Cyrtogonellum_falcilobum_DQ202409 Cyrtogonellum_fraxinellum_AY736349 Cyrtogonellum_inaequalis_AY736351 Cyrtogonellum_xichouense_EU106595 Cyrtomidictyum_lepidocau_DQ150392 Cyrtomidictyum_lepidocau_EF177266 Cyrtomium_balansae_DQ202411 Cyrtomium_caryotideum_EF177267 Cyrtomium_falcatum_EF177268 Cyrtomium_hookerianum_DQ202414 Cyrtomium_macrophyllum_EU106596 Cyrtomium_uniseriale_DQ202415 Cyrtomium_urophyllum_DQ202416 Polystichum_acutidens_DQ202419 Polystichum_attenuatum_DQ150396 Polystichum_auriculum_DQ150397 Polystichum_christii_DQ150399 Polystichum_chunii_DQ202421 Polystichum_craspedosorum_DQ202422 Polystichum_craspedosorum_EF177288 Polystichum_deltodon_DQ202424 Polystichum_deltodon_EF177289 Polystichum_dielsii_DQ150400 Polystichum_erosum_DQ150403 Polystichum_erosum_DQ202425 Polystichum_formosanum_EF177307 Polystichum_lonchitis_AY736354 Polystichum_longipaleatum_AY736353 Polystichum_makinoi_DQ202431 Polystichum_nepalense_DQ202433 Polystichum_obliquum_EF177284 Polystichum_omeiense_DQ202434 Polystichum_speluncicola Polystichum_stenophyllum_EF177296 Polystichum_subacutidens_AY534749 Polystichum_subacutidens_DQ150418 Polystichum_subacutidens_DQ514518 Polystichum_thomsonii_EU106597 Polystichum_tripteron_EF177298 Polystichum_yuanum_DQ150421 ; END; BEGIN CHARACTERS; [! 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TCCCTCTATCCCCAACGAGACAATTTAGTTAACCCATTTTCAGGTTGTTTGGATCCACATAATTTGTTCAGAAACAAAATATGGAAACCACTTCAATCTATTTTCCGTGTA---GTCTTTCGAAAACGATTTGCAAGTGAGCCATTCAGGCTTTTAATATGCATGAATGGCTCAACCTAGTCCCCCCC----ATAATTTATTGGCTACAA-----GCAATATTGTATTAAACATATCGAGAAAAGCGAGATCAACGATTTGA----CAACGATTTGACTAGGTAAAAAACTAGAGTTGAGAAATATACTTAACTGATT-----TCTAGTTAACTTTTATCCGTAAATAAGTTGGCCGAGATAGCCGAGGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGAGGAC?GAAA0131410 Polystichum_thomsonii_EU106597 TCCCTCTATCCCCAQCGQFQ{CGT}AQTTTQFTTAACCCATTTTCAGGTTGTTTGAATCCACATAATTTGTTCAGAAACAAAATACGGAAACCACTTCAACCCCTTTTCTGTGTA---GTCTTTTGAAAACGATTTGCAAGTGAGCCATTCAGGCTTTTAATATGCATGAATGGCTCAACCTAGTCCCCCC-----ATAATTTATCGGCTACAG-----GCGATATTGTATTAAACATATTGATAAAAGCGAGATCAACGATTTGA---------------CTAGGTAAAAAACTAGAGTTGAGAAATATACTTAACTGATT-----TCTAGTTAACTTTTATCCGTAAATGAGTTGGCCGAGATAGCCGAGGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAG??????????0121110 Polystichum_tripteron_EF177298 ???????????????????????????GTTAACCCATTTTCAGGTTGTTTGGATCCACATAATTTGTTCAGAAACAAAATATGGAAACCACTTCAATCTATTTTCCGTATA---GTTTTTCGAAAACGATTTGCAAGTGAGCCATTCAGGCTTTTAATATGCATGAATGGCTCAACCTAGCCCCCCCC----ATAATTTATTGGCTACAA-----GCGATATTGTATTAAACATATCGATAAAAGCGAGATCAACGATTTGA---------------CTAGGTAAGAAAATAGAGTTGAAAAACACATTTAACCGATT-----TCTAGTTAACTTTTATCCGTAAATAAGTTGGCCGAGATAGCCGAGGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGAAAAAAAAAA0131110 Polystichum_yuanum_DQ150421 TCCCTCTATCCCCAACGAGACAATTTAGTTAATCCATTTTCAGGTTGTTTGGATCCACATATTTTGTTCAGAAACAAAAAATGGAAACCACTTCAATCTATTTTCCGTGTA---GTCTTTCGAAAACGATTTGCAAGTGAGCCATTCAGGCTTTTAATATGCATGAATGGCTCAACCTAGTCCCCCCC----ATAATTTATTGGCTACAA-----GCGATATTGTATTAAACATATCGATAAAAGCGAGATCAACGATTTGA---------------------------CTAGAGTTGAGAAATATACTTAACTGATT-----TCTAGTTAACTTTTATCCGTAAATAAGTTGGCCGAGATAGCCGAGGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGAGG???????0131510 ; END; BEGIN SETS; CHARSET ind_pos_319_to_323 (CHARACTERS = 'Polystichum & Cyrtogonellum, trnL-F') = 405; CHARSET ind_pos_342_to_342 (CHARACTERS = 'Polystichum & Cyrtogonellum, trnL-F') = 406; CHARSET ind_pos_187_to_193 (CHARACTERS = 'Polystichum & Cyrtogonellum, trnL-F') = 402; CHARSET ind_pos_263_to_289 (CHARACTERS = 'Polystichum & Cyrtogonellum, trnL-F') = 404; CHARSET ind_pos_112_to_114 (CHARACTERS = 'Polystichum & Cyrtogonellum, trnL-F') = 401; CHARSET ind_pos_211_to_215 (CHARACTERS = 'Polystichum & Cyrtogonellum, trnL-F') = 403; CHARSET ind_pos_105_to_106 (CHARACTERS = 'Polystichum & Cyrtogonellum, trnL-F') = 400; END; BEGIN TREES; TITLE Tb10547; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Polystichum_acutidens_DQ202419, 2 Polystichum_attenuatum_DQ150396, 3 Polystichum_auriculum_DQ150397, 4 Polystichum_christii_DQ150399, 5 Polystichum_chunii_DQ202421, 6 Polystichum_craspedosorum_DQ202422, 7 Polystichum_craspedosorum_EF177288, 8 Polystichum_deltodon_DQ202424, 9 Polystichum_deltodon_EF177289, 10 Polystichum_dielsii_DQ150400, 11 Polystichum_erosum_DQ150403, 12 Polystichum_erosum_DQ202425, 13 Polystichum_formosanum_EF177307, 14 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Fig._3 = [&R] ((((((((((1,(3,4)),(29,32)),(20,((22,23),24),27,((35,37),36))),19),((((8,10),9),(13,26)),18)),(28,(30,31))),(33,34)),((6,7),((11,12),25))),((((((2,5),15),21),16),14),17)),(((38,40),39),41)); END;