#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 24, 2024; 0:51 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Wolsan M., & Sato J. 2010. Effects of data incompleteness on the relative performance of parsimony and Bayesian approaches in a supermatrix phylogenetic reconstruction of Mustelidae and Procyonidae (Carnivora). Cladistics, 26: 168-194. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S10069] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=52; TAXLABELS Aonyx_capensis Aonyx_cinerea Arctonyx_collaris Bassaricyon_alleni Bassaricyon_gabbii Bassariscus_astutus Bassariscus_sumichrasti Eira_barbara Enhydra_lutris Galictis_vittata Gulo_gulo Hydrictis_maculicollis Ictonyx_striatus Lontra_canadensis Lontra_felina Lontra_longicaudis Lutra_lutra Martes_americana Martes_flavigula Martes_foina Martes_martes Martes_melampus Martes_pennanti Martes_zibellina Meles_anakuma Meles_leucurus Meles_meles Melogale_moschata Mustela_altaica Mustela_erminea Mustela_eversmanii Mustela_frenata Mustela_furo Mustela_itatsi Mustela_kathiah Mustela_lutreola Mustela_nigripes Mustela_nivalis Mustela_nudipes Mustela_putorius Mustela_sibirica Mustela_strigidorsa Nasua_narica Nasua_nasua Neovison_vison Poecilogale_albinucha Potos_flavus Procyon_cancrivorus Procyon_lotor Pteronura_brasilliensis Taxidea_taxus Vormela_peregusna ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M4286] TITLE Wolsan_Sato_B; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=9625; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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ATGACCAACATTCGCAAAGCCCATCCATTAGCCAAGATCATCAACAGCTCGTTCATCGACCTACCTGCACCATCAAACATCTCAGCATGATGAAACTTCGGATCCTTACTCGGAGTCTGCCTGATCCTTCAGATTCTTACAGGTTTATTTTTAGCCATACACTACACCCCGGACACAACTACAGCTTTCTCATCGGTCACACATATCTGCCGAGACGTCAACTACGGCTGAATCATCCGGTACATACACGCAAACGGAGCCTCCATATTCTTTATCTGCCTGTTCCTACACGTAGGGCGCGGCCTATACTACGGATCCTACATATTCCCCGAAACATGAAACATTGGTATTATCTTATTATTCACAACTATAGCAACAGCATTCATAGGTTACGTCTTACCATGAGGGCAAATATCCTTCTGAGGCGCAACCGTAATCACTAACTTGCTATCAGCCGTCCCATACATCGGAACTGATCTCGTAGAATGAATCTGAGGGGGATTCTCAGTAGACAAAGCCACCCTAACACGATTCTTCGCCTTCCACTTTATTCTACCATTTATTATCTTAGCCCTAGCAGCAATCCACCTCCTATTCCTCCACGAAACAGGATCCAACAACCCCTCCGGAATCCCATCCGACTCTGACAAAATCCCATTCCATCCCTACTACACCATCAAAGACATCCTGGGCGCCCTATCCCTAGCCCTAGTACTAATAATACTGGTACTATTCTCCCCAGACCTACTAGGAGACCCAGACAACTACACCCCTGCCAACCCACTCAGTACACCACCCCATATCAAACCCGAATGATACTTCCTGTTTGCATATGCAATCCTGCGATCCATCCCCAACAAACTAGGAGGAGTACTAGCCCTGATCTTATCCATCCTAATCTTGGCCATCATCCCACTGCTACATACCTCAAAACAACGAGGCATGATGTTCCGCCCACTAAGCCAATGCTTGTTCTGACTACTAGTAGCCGACCTTCTCACCTTAACCTGAATCGGCGGCCAACCAGTAGAACACCCATTCATTACCATCGGCCAACTAGCCTCAATCCTTTACTTTATGCTCCTCCTAGTTCTCATACCTATCGCCAGCATCATTGAGAATAACCTATTAAAATGAAGA????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????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Aonyx_cinerea 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Bassariscus_sumichrasti 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Eira_barbara 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Enhydra_lutris 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Galictis_vittata 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Gulo_gulo 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Ictonyx_striatus 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Lontra_longicaudis 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Lutra_lutra 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Martes_americana 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Martes_zibellina 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Meles_anakuma 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Meles_meles 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Mustela_itatsi 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Mustela_kathiah 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Mustela_lutreola 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Mustela_nivalis 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Mustela_nudipes 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Mustela_putorius 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Mustela_sibirica 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Potos_flavus 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Procyon_cancrivorus 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Procyon_lotor 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Pteronura_brasilliensis 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Taxidea_taxus ATGACCAACATTCGCAAAACTCACCCATTAGCTAAAATTATCAACAATTCATTTATCGATTTACCCGCACCGTCAAATATCTCAACATGATGAAACTTCGGCTCCCTACTTGGAGTCTGCCTAATCATCCAAATCCTCACAGGACTATTTCTAGCCATACACTACACATCGGATACAACCACAGCTTTCTCATCAGTAACCCACATCTGTCGAGACGTAAACTATGGCTGAATTATCCGATATATACATGCCAACGGGGCTTCCATATTCTTTATCTGCCTGTTCCTACACGTAGGACGAGGCCTATACTATGGTTCTTATATATTTCCCGAAACATGAAACATTGGCATTATCCTATTACTAACAGTTATAGCAACTGCATTCATAGGTTACGTTTTACCATGAGGACAAATATCATTCTGAGGTGCAACCGTAATCACCAACCTACTATCAGCCATCCCATATATCGGAACTAACCTTGTAGAATGAATTTGAGGAGGCTTCTCAGTAGACAAAGCCACCCTAACACGATTCTTCGCCTTCCACTTCATCCTACCATTCATCATTTTAGCACTAGCAGCCATTCACCTACTATTCCTCCATGAAACAGGATCCAACAACCCTTCAGGAATCCCCTCTAACTCAGACAAAATCCCATTCCACCCATACTATACAATCAAAGACATCCTAGGAGCCCTACTTATAGCACTCCTACTAATAGTACTAGTATTATTCTCACCCGATTTGCTAGGAGACCCAGACAATTACACACCCGCCAATCCACTCAGCACGCCACCCCATATCAAACCCGAATGATACTTCCTATTTGCATACGCAATCCTACGATCCATCCCCAACAAGCTAGGAGGAGTACTAGCCCTATTATTTTCCATCCTAATTTTAGCCATCATCCCACTTCTCCACACCTCCAAACAACGAAGCATAATATTCCGTCCATTAAGCCAATGCATATTCTGACTACTAGTAGCCGATCTTCTCATTCTAACATGAATTGGCGGCCAACCAGTAGAACACCCATACATCACTATTGGCCAACTAGCCTCAATCCTCTACTTCACAATCCTCCTAGCCCTAATACCAACAATCAGCATTATCGAAAACAACCTATTAAAATGAAGA??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????AATTCCAAAATAATCTGCCAGAGGACTACTAGCAATAGCCTAAAACTCAAAGGACTTGGCGGTGCTTTATATCCCTCTAGAGGAGCCTGTTCTATAA?TCGATAAACCCCGATAAACCTCACCACTTCTAGCTAAACCAGTTTATATACCGCCATCGTCAGCAAACCCTCAAA??AGGAAGAAAAGTAAGCACAATAATATAAAAAAGTTAGGTCAAGGTGTAACCAATGAAGTGGGAAGAAATGGGCTACATTTTCTAGACACGAAAGTTTATATGAAACCTACAAACTAAAGGTGGATTTAGTAGTAAATTAAGAATAGAGAGCTTAATTGAATAGGGCCATGAAGCACGCACACACCGCCCGTCACCCTCCTCAATCAC?GCAAGAGGAGATAAGTCGTCAACAAGGTAAGCACACTGGAAAGTGCGCTTGGATAAACAAAACATTACAGTATAGGAGATAGAAATTTT?ACTTGGAGCTATAGAGAGAGTACCGTAAGGGGCGGATGATAGCTAA??TTCAAAGCAATAAACAGCAAAGATAACCCCTTATACCTTTTGCATAATGAGCTAGCTAGA?ACAATTTAGCTAAGAGGCCTTAAGCTAAAAAC?CCCGAAACCAGACGAGCTACCTACGAACAATCCACA?GGGATGCACTCATCTATGTCGCAAAATAGTGAGAAGATTCATAGGTAGAGGTGAAAAGCCAAACGACCCTGGTGATAGCTGGTTGCCCAGAATAGAATTTCAGTTCAACTTTAAATTTACGTAAATTTAAAATATAGTCTATCAAGGTACAGCTTTTTAGAAGGACTCAACCTTACTTACAGAGTAAAA?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CAAAGTGTAGCTTAACTAAAGCGTCTGGCTTACACCCAGAGGATCTCATG?TCACTTTGA????????????????????????????????????????????????????????????????????ACCATCAGAATTTCTCTGCTGGAAACAATGAGAACAGCATTGAGGCCCACGTAGGAATACATGGAGAAGCCAACCTGGATTTCCTCAACATTCCTTTGACAATTCCTGAAATGACTCTACCTTACACAACACTCACAACTCCCCAGGTGAAAGATTTCTCCCTTTGGGAAAAAACAGGCTTAAAGGATTTCTTGAAGACAACAAAGCAATCATTTGATTTAAGTGTAAAGGCTCAGTATAAGAAAAACAAAGACAAGCACATCATCCCAATTCCTTTTTATGCAAAAGATTTCCAGGTATTGAGTACCTCAAATGATATTTTCATTCCAGCCATGGGCAATATTACCTATGACTTTTCCTTTAAGTCAGGCATCATCACACTGAATACCAATGTTGGACTGTATAACCAGTCAGATATTGTTGCTCATTTCCTAACTTCCTCTTCTTCTGTCACTGATGCTCTGCAGTACAAATTAGAGGGCACCTCAAGTTTGACGAGGAAAAGAGGCTTGAAGCTAGCCACAGCTTTGTCTCTGAGTAGTAAATTTGTGGAAGGAAATCATGACAGTACTATTAGTTTGACCAAGAAAAACATGGAGGCATCAGTGACAACATCTGCAGAAGTCCAAACTCCTATTTTGAGGATGAATTTCAAGCAAGAACTTAATGGAAATACCAAGTCGAAGCCTACTGTCTCTTCATCCATTGAATTAATGTATGATCTCAATTC???????????????TACTGCTACAGGAACAATCAACCACAAACTCAACTTAGAGAGCCTCACCTCTTACTTTTCCATTGAGTCATCTACCAAAGGAGATATCAAGGGCTCAGTACTTTCAATAGAATATTCAGGAACTATTG{AT}CAGCGAGGC{CT}AGCGCTTACTTGAATTCCAAGAGTACTCGGTCTTCAGTGAAGCTGCAAGGGGCTTCCAAAGTTGATGGTATCTGGAACCCATCAGCTTTCTCGAGAACCTAGCGGGTGTCCTTAAGGACTTGCACTCCACTTACATTGTCAGTACTGTTATGTTGTCTTCCGAAGTCTCAAATCATGTTGAGCAGTT???GCAGAAAGATATCCAGGAATATGTTAGCATCCTTACTGATGCAGATGGAAAAGGGAAAGAGAAGATTGCAGAGCTTTCTACCAGTGCTCAGGAAAAAATTAAAAGCTGGGCCACTGCAATGAAGGAAATCATTTCTGATTACCATCAACAGTTCAGATATAAACTACAAGATTTTTCAGACCAACTCTTAAAGACAGAATGAATGTAGAAAAGGCTGAATTCTGTAATAAAAGCAAACAGCCTGCCTTAGCAAGGAGCCAACAGAGCAGATGGGCCGAAAGTAAGGAAACATGTACCGATAAGCAGACTCCCAGCACAGAGAGAAAGGTACTTCTGAAAGTCGATCCCCTGTGTGGGAGAAGAGAACCGAAGAAGCAGAAACCTCCATGCTCTGACAGTCCTAGAGATTCCCAAGATGTTCCTTGGATAACACTGAATAGCAGCATACAGAAAGTGAACGAGTGGTTTTCCAGAAGCGATGAAATGTTGACTTCCGATGA???CTCACAGGATGGGGGGTCTGAATCGAAGACCGAAGTAGCTGGTGCAGTAGAAGTTCCAAATGAAGTACATGTATGTTCCACTTCTTCTGAGAAAATAGACTTAATGGCCAGCGAGTCTCAGGATGCTTTGATACGTGAAAGCGAAAGAGTCCACACCAAGTCAGTAGAGAGTAACATCGAAGATAAAATATTTGGGAAGACCTACCGGAGGAAGGCAAGCCTCCTTAATGTGAGCCACATGAGCGAAGATCTGGTTATAGGAGCATGTGCCATAGAACCTCAGACAACGCAAGCCCATCCCCTCACGAGTAAAGCAAAGCGTAAAAGGAGAACTACAGCAGGCCTTCATCCTGAGGATTTTATCAAGAGAGTAGATTTGGCCGTCGTTCCAAAGGCTCCTGAAAAGCTAGTTGAGGGAACCGACCAAATCGAGCGAAGTGGTCACGTGACGAATATTAGAAATAATGGTCCTGAGGATGAAATAAAAGGTGATTATGTTCAGACTGAGAAAAATGCTAACCCAACAGAATCCCTGGAAAAAGAATCTGCTCTCAGAAGCAGAGCTGAACCGATAAGCAGCAGCATAAGCAATATGGAACTGGAATTAAATAGCTCCGGCTCGAAAGCCCTTAGGAAGAACAGGCTGCGGAGGAAGTCCTCCACCAGGCATGGCTGTGTGCTTGAATTCGTAGTCAGTCGAAATCCAAGCCCGCCTGCTCACAGCGAACTACAGAGCCCATGTGCTGACCACCGGGGTGCAGAGCTCCTTGAACGACCCTCGCCTTGTCATCTCCTATGAGCCCAGCACCCTTGAGGCTCCCCGGCAAGCTCCAGCCCTCACCAACCTCACTCAAGAGGAACTGCTTGCCCACTTGCAGAAGGGCATCCGCCACGAGGTTCTGGAGGGCAATGTGGGCTACTTGCGTGTGGATGACATCCCAGGCCAGGAGGTGGTGAGCAAGCTGGGGGGCTTCCTTGTGGCCAGC{AG}TCTGGAGGAAGCTCATGGGCACTTCCGCCTTGGTGCTAGACCTCCGACACTGCACTGGGGGCCACATTTCTGGTATCCCCTACTTCATCTCCTACCTGCACCCAGGGAACACAGTCCTGCACGTGGATACCATCTACGACCGCCCCTCTAATACGACCACTGAGATCTGGACCCTGCCCCAGGTCCTGGGAGAAAGGTACAGTGCGGACAAGGATGTGGTGGTCCTCACCAGTGGCCACACGGGAGGCGTGGCTGAGGACATCACTTACATCCTCAAACAGATGCGCAGGGCCATTGTGGTGGGCGAGCGGACTGGGGGGGGTGCCCTGGACCTCCAGAAGCTAAGGATAGGCCAGTCCGACTTCTTCCTCACTGTGCCTGTGTCCAGGTCTCTAGGGCCCTTGGGAGGGGGCAGCCAGACCTGGGAGGGCAGCGGGGTGCTGCCCTGTGTGGGGACACCAGCGGAGCAAGCCCTCGAGAAAGCCCTGGCCATCCTCACTTTGCGCCGGGCCCTGCCTGGAGTGGTGCGGCGCCTGCAGGGGGCGCTGCAGGCCTACTACACGCTGGTGGACCGCGTGCCCACCCTGCTGCACCACCTGGCCAACATGGACTTCTCTGCGGTGGTCTCCGAGGAGGACCTGGTCGCGAAGCTCAACGCAGGTCTGCAGACTGCGTCTGAAGACCCCAGGCTCCTGGTGCGGGCAGTCAGGCCCAAGGAAACCTCTTCTGGGCCCGAGGTTGGAGAGGACGACCCTCCGGAGGTGGTCCCCACGGTGCCCGACAATGAGGCTGCCCGGCGAGCCCTAGTGGGCGCTATGTTCCAGGTGTCCGTGCTGCCCGGCAACGTGGGCTACCTCCGCTTTGACAGCTTTGCCAATGCCTCGGTGCTGGAGTCGTTGAGCCCCTACATCGTGCATCAGGTGTGGGGGCCTCTGCATGAGAGCCCAAGACCTGGATGACTACCTGACGGGCCCCTTCACCGTCGTGGTGAAGGAGTCTTGCGACGGAATGGGAGACGTGAGCGAGAAGCACGGGAGCGGGCCCGCAGTTCCAGAAAAGGCAGTTCGGTTTTCGTTCACGGTCATGAAAATTATGATAGCACATGGCTCAGAAAGCGTGAAGGTGTTTGAAGAA?TCAAACCCAACTCCGAGCTGTGTTGTAAGCCCCTGTGTCTCATGCTGGCGGATGAGTCCGACCACGAGACCCTGACGGCCATCCTGAGCCCTCTCATTGCTGAGAGGGAGGCCATGAAGAGCAGCCAATTAATGCTTGAGATGGGAGGCATCCTTCGGAGTTTCAAGTTCATCTTCAGGGGCACCGGCTACGATGAGAAACTCGTCCGGGAAGTCGAAGGCCTCGAGGCTTCTGGCTCAGTCTACATTTGTACCCTTTGCGACGCCACCCGCCTAGAAGCATCTCAAAATCTTGTCTTCCACTCCATCACCAGAAGCCACGCTGAGAACCTGGAGCGCTATGAGGTCTGGCGTTCTAACCCATACCACGAGTCCGTGGAAGAGCTGCGGGATCGGGTGAAAGGGGTCTCATCGAAACCTTTCATCGAGACGGTCCCTTCCATAGATGCGCTCCACTGTGACATTGGCAATGCAGCTGAGTTCTACAAGATTTTCCAGCTAGAGATAGGGGAGGTGTATAAGAATCCCAATGCCTCCAAAGAGGAAAGGAAAAGATGGCAGGCTATGTTGGACAAACATCTCCGGAAGAAGATGAGCCTGAAACCCATCATGAGGATGAATGGCAACTTTGCCAGGAAGCTCATGACCAAAGAGACAGTTGAAGCAGTCTGTGAGTTAATTCCCTCTGAGGAGAGGCACGAAGCTCTGAGGGAGCTGATGGACCTTTACCTTAAGATGAAGCCTGTGTGGCGGTCATCGTGTCCTGCCAAAGAGTGCCCAGAATCTCTCTGCCAGTATAGCTTCAATTCACAGCGTTTTGCTGAGCTCCTCTCTACCAAGTTCAAGTATAGATATGAGGGCAAAATCACCAATTATTTTCACAAAACCCTGGCACATGGTGCCCCCCACGGAAGGCCCTGTCGGCTCTACCACCCCGTATGTGGAGGACACTCCTGAGCCGCCCCTCCACGACTTCCACTGCAGCCGGCTTCTGGACCTGGTTTTCCTGCTAGACGGCTCCTCCAAGCTGTCTGAGAGCGAGTTCGAAGTGCTGAAGGTCTTCGTGGTGGGCATGATGGAGCATCTGCACATCTCCCAGAAGCGCATCCGCGTGGCTGTGGTGGAGTACCATGACGGCTCCCACGCCTACATTGAGCTCCGGGACCGGAAGCGGCCCTCGGAGCTGCGGCGCATCGCCAGCCAAGTGAGGTACGTGGGCAGCGAGGTGGCCTCCACCAGCGAGGTCCTCAAGTACACACTGTTCCAGATCTTCGGCAAGATTGACCGCCCTGAAGCATCCCGTATCGTCCTGCTCCTCACGGCCAGCCAGGAGCCCCCAAGGCTGGCCCGCAATTTGGTCCGCTACGTGCAGGGCCTGAAGAAGAAGAAAGTCATCATGATCCCCGTGGGCATCGGGCCCCACGCCAACCTCAAGCAGATCCGCAACATTGAGAAGCAGGCCCCCGAGAACAAGGCCTTTGTGCTCAGCGGTGTGGACGAGCTGGAGCAGCGGAGGGATGAGATTATCAGCTACCTCTGTGACCTGGCCCCTGAAGCACCCGGTCCTACCCAGCAGCCCCCTGTGTTGCCAGTCACTGTGGGTCCGGAGCTCTTGGGGGTCCCATCGTCGGGACCCAGAAGGAACTCCATGGTTCTGGATGTGGTGTTCGTCCTGGAAGGCTCAGACAAAATTGGAGAGGCCAACTTCAACAAGAGCAGGGACTTCATAGAGGAGGTGATCCGACGGATGGATGTGGGCCAGGACGGCATCCATGTCACGGTGCTGCAGTACTCCTACACCGTGGCCGTGGAATACACCTTCAGCGAAGCCCAGTCCAAGGGTGAGGTCCTGCAGCATGTGCGGGAGATCCGATTCCGGGGCGGCAACAGGACCAACACTGGGCTGGCCCTGCAGTACCTATCTGAGCACAGTTTCTCCGTCAGCCAGGGGGACCGGGAGCAGGTCCCTAACCTGGTCTACATGGTCACGGGAAACCCCGCCTCTGATGAGATCAAGCGGATGCCTGGAGACATCCAGGTGGTGCCCATTGGAGTGGGCCCTCACGCCGAGGTGCAGGAGCTGGAGA Vormela_peregusna ATGACCAACATTCGCAAAACCCACCCACTAACTAAAATTATCAACAACTCATTTATCGACCTACCCGCACCATCAAACATCTCTGCATGATGAAATTTTGGATCCCTTCTCGGAATCTGCCTGATCCTTCAAATCCTTACAGGTTTATTTCTAGCCATACACTATACATCAGACACAACCACAGCCTTTTCATCAGTAACTCATATCTGCCGAGACGTTAATTATGGCTGAATCATCCGATACACACACGCAAATGGAGCCTCCATATTCTTCATTTGCCTATTCCTACATGTAGGACGAGGCCTATATTATGGATCTTATATATTCCCAGAAACATGAAACATCGGTATTATCCTATTATTCACAGTAATAGCAACAGCATTCATAGGTTACGTCTTACCATGAGGACAAATATCCTTTTGAGGTGCAACCGTAATCACCAACCTTTTATCAGCCATCCCATACATCGGAACTAGCCTTGTAGAATGAATCTGAGGGGGCTTTTCAGTAGACAAAGCCACCCTAACACGATTCTTCGCCTTCCACTTTATCCTTCCATTCATCATTTTAGCACTAGCAGCAATCCACCTTTTATTCCTCCACGAAACAGGCTCTAATAACCCTTCAGGAATCCCATCCAACTCCGACAAGATCCCATTCCACCCCTACTACACCATTAAAGACATCCTAGGAGCTCTATTCCTAATTATTACATTAATAACACTAGTACTATTCTCACCAGACCTATTAGGAGACCCAGACAACTACATCCCCGCCAACCCACTCAACACACCACCCCATATTAAACCCGAATGATACTTCCTCTTCGCATACGCTATCTTACGATCGATCCCCAATAAACTAGGAGGAGTACTAGCCTTGATCCTCTCCATCCTAGTACTAGCCATCATTCCCTTACTTCACACTTCAAAACAACGCAGCATGATATTCCGCCCTCTAAGCCAATGCCTATTCTGACTACTAGTAGCAGACCTCCTCACCCTAACCTGAATCGGCGGCCAACCAGTAGAATACCCATTCATTATTATTGGCCAACTAGCCTCAATCCTTTACTTCATAATCCTCTTAATCTTCATACCAATCATCAGCATCGCCGAAAATAACTTATTAAAATGAAGA????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????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; END; BEGIN SETS; CHARSET tRNA.asp (CHARACTERS = Wolsan_Sato_B) = 2892-2959; CHARSET IRBP (CHARACTERS = Wolsan_Sato_B) = 6152-7339; CHARSET tRNA.gly (CHARACTERS = Wolsan_Sato_B) = 3030-3099; CHARSET tRNA.arg (CHARACTERS = Wolsan_Sato_B) = 3521-3588; CHARSET tRNA.his (CHARACTERS = Wolsan_Sato_B) = 3100-3168; CHARSET APOB26 (CHARACTERS = Wolsan_Sato_B) = 3841-4803; CHARSET tRNA.trp (CHARACTERS = Wolsan_Sato_B) = 3773-3840; CHARSET 12SrRNA (CHARACTERS = Wolsan_Sato_B) = 1614-2491; CHARSET APOB29 (CHARACTERS = Wolsan_Sato_B) = 4804-5102; CHARSET Cytb (CHARACTERS = Wolsan_Sato_B) = 1-1140; CHARSET tRNA.leu2 (CHARACTERS = Wolsan_Sato_B) = 3382-3451; CHARSET tRNA.ser2 (CHARACTERS = Wolsan_Sato_B) = 3589-3650; CHARSET tRNA.ile (CHARACTERS = Wolsan_Sato_B) = 3169-3238; CHARSET CR (CHARACTERS = Wolsan_Sato_B) = 1141-1613; CHARSET tRNA.thr (CHARACTERS = Wolsan_Sato_B) = 3651-3712; CHARSET 16SrRNA (CHARACTERS = Wolsan_Sato_B) = 2492-2891; CHARSET RAG1 (CHARACTERS = Wolsan_Sato_B) = 7340-8434; CHARSET tRNA.leu1 (CHARACTERS = Wolsan_Sato_B) = 3307-3381; CHARSET tRNA.val (CHARACTERS = Wolsan_Sato_B) = 3713-3772; CHARSET tRNA.phe (CHARACTERS = Wolsan_Sato_B) = 2960-3029; CHARSET vWF (CHARACTERS = Wolsan_Sato_B) = 8435-9625; CHARSET tRNA.lys (CHARACTERS = Wolsan_Sato_B) = 3239-3306; CHARSET BRCA1 (CHARACTERS = Wolsan_Sato_B) = 5103-6151; CHARSET tRNA.met (CHARACTERS = Wolsan_Sato_B) = 3452-3520; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = Wolsan_Sato_B) = N: 1-9625; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = Wolsan_Sato_B) = N: 1-9625; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M4705] TITLE Wolsan_Sato_A; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=9753; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Enhydra_lutris 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Lontra_canadensis 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Lontra_felina 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Lontra_longicaudis 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Lutra_lutra 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Martes_americana 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Martes_martes 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Martes_melampus 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Martes_zibellina 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Meles_anakuma 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Meles_leucurus 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Meles_meles 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Melogale_moschata 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Mustela_altaica 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Mustela_erminea 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Mustela_eversmanii 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Mustela_frenata 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Mustela_lutreola 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Mustela_nudipes 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Mustela_putorius 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Mustela_sibirica 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Mustela_strigidorsa 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Nasua_narica 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Nasua_nasua 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Procyon_cancrivorus 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Procyon_lotor 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Taxidea_taxus 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Vormela_peregusna 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TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M4424] TITLE Wolsan_Sato_C; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=8587; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Bassariscus_sumichrasti 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Eira_barbara 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Enhydra_lutris 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Galictis_vittata 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Gulo_gulo 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Ictonyx_striatus 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Lontra_canadensis 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Lontra_felina 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Lontra_longicaudis 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Lutra_lutra 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Martes_americana 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Martes_martes 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Martes_melampus 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Martes_zibellina 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Meles_anakuma 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Meles_leucurus 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Meles_meles 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Melogale_moschata 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Mustela_altaica 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Mustela_erminea 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Mustela_lutreola 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Mustela_putorius 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Mustela_sibirica 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Mustela_strigidorsa 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Nasua_narica 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Procyon_cancrivorus 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Procyon_lotor 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; END; BEGIN SETS; CHARSET CanSINE (CHARACTERS = Wolsan_Sato_C) = 1557-1671; CHARSET TBG (CHARACTERS = Wolsan_Sato_C) = 3948-4389; CHARSET FES (CHARACTERS = Wolsan_Sato_C) = 2059-2504; CHARSET Mel8 (CHARACTERS = Wolsan_Sato_C) = 3794-3947; CHARSET COL10A1 (CHARACTERS = Wolsan_Sato_C) = 6795-7120; CHARSET MC1R_promotor (CHARACTERS = Wolsan_Sato_C) = 444-685; CHARSET FGB.i7 (CHARACTERS = Wolsan_Sato_C) = 4953-5563; CHARSET ADORA (CHARACTERS = Wolsan_Sato_C) = 5871-6246; CHARSET TR.CanSINE (CHARACTERS = Wolsan_Sato_C) = 686-1556; CHARSET RAG2 (CHARACTERS = Wolsan_Sato_C) = 7408-7875; CHARSET EPM2B (CHARACTERS = Wolsan_Sato_C) = 3425-3793; CHARSET BDNF (CHARACTERS = Wolsan_Sato_C) = 6247-6794; CHARSET PNOC (CHARACTERS = Wolsan_Sato_C) = 7121-7407; CHARSET CHRNA1 (CHARACTERS = Wolsan_Sato_C) = 1672-2058; CHARSET GHR (CHARACTERS = Wolsan_Sato_C) = 2505-3140; CHARSET WT1 (CHARACTERS = Wolsan_Sato_C) = 7876-8587; CHARSET RHO (CHARACTERS = Wolsan_Sato_C) = 3141-3424; CHARSET MC1R_exon (CHARACTERS = Wolsan_Sato_C) = 1-443; CHARSET FGB.i4 (CHARACTERS = Wolsan_Sato_C) = 4390-4952; CHARSET DRD4 (CHARACTERS = Wolsan_Sato_C) = 5564-5870; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = Wolsan_Sato_C) = N: 1-8587; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = Wolsan_Sato_C) = N: 1-8587; END; BEGIN TREES; TITLE Tb10575; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Aonyx_capensis, 2 Aonyx_cinerea, 3 Enhydra_lutris, 4 Hydrictis_maculicollis, 5 Lontra_canadensis, 6 Lontra_felina, 7 Lontra_longicaudis, 8 Lutra_lutra, 9 Pteronura_brasilliensis, 10 Arctonyx_collaris, 11 Eira_barbara, 12 Galictis_vittata, 13 Gulo_gulo, 14 Ictonyx_striatus, 15 Martes_americana, 16 Martes_flavigula, 17 Martes_foina, 18 Martes_martes, 19 Martes_melampus, 20 Martes_pennanti, 21 Martes_zibellina, 22 Meles_anakuma, 23 Meles_leucurus, 24 Meles_meles, 25 Melogale_moschata, 26 Mustela_altaica, 27 Mustela_erminea, 28 Mustela_eversmanii, 29 Mustela_frenata, 30 Mustela_itatsi, 31 Mustela_kathiah, 32 Mustela_lutreola, 33 Mustela_nigripes, 34 Mustela_nivalis, 35 Mustela_nudipes, 36 Mustela_putorius, 37 Mustela_furo, 38 Mustela_sibirica, 39 Mustela_strigidorsa, 40 Neovison_vison, 41 Poecilogale_albinucha, 42 Taxidea_taxus, 43 Vormela_peregusna, 44 Bassaricyon_alleni, 45 Bassaricyon_gabbii, 46 Bassariscus_astutus, 47 Bassariscus_sumichrasti, 48 Nasua_narica, 49 Nasua_nasua, 50 Potos_flavus, 51 Procyon_cancrivorus, 52 Procyon_lotor; TREE Fig._2b = [&R] (((((((((((((((((36,37),28),32),33),38),30),(26,34)),27),31),(35,39)),(29,40)),(((((((1,2),8),4),3),((6,7),5)),9),(((14,41),43),12))),25),((((((((18,21),19),15),17),16),13),20),11)),(((22,23),24),10)),42),((((44,45),(48,49)),((46,47),(51,52))),50)); END; BEGIN TREES; TITLE Tb10574; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Aonyx_capensis, 2 Aonyx_cinerea, 3 Enhydra_lutris, 4 Hydrictis_maculicollis, 5 Lontra_canadensis, 6 Lontra_felina, 7 Lontra_longicaudis, 8 Lutra_lutra, 9 Pteronura_brasilliensis, 10 Arctonyx_collaris, 11 Eira_barbara, 12 Galictis_vittata, 13 Gulo_gulo, 14 Ictonyx_striatus, 15 Martes_americana, 16 Martes_flavigula, 17 Martes_foina, 18 Martes_martes, 19 Martes_melampus, 20 Martes_pennanti, 21 Martes_zibellina, 22 Meles_anakuma, 23 Meles_leucurus, 24 Meles_meles, 25 Melogale_moschata, 26 Mustela_altaica, 27 Mustela_erminea, 28 Mustela_eversmanii, 29 Mustela_frenata, 30 Mustela_itatsi, 31 Mustela_kathiah, 32 Mustela_lutreola, 33 Mustela_nigripes, 34 Mustela_nivalis, 35 Mustela_nudipes, 36 Mustela_putorius, 37 Mustela_furo, 38 Mustela_sibirica, 39 Mustela_strigidorsa, 40 Neovison_vison, 41 Poecilogale_albinucha, 42 Taxidea_taxus, 43 Vormela_peregusna, 44 Bassaricyon_alleni, 45 Bassaricyon_gabbii, 46 Bassariscus_astutus, 47 Bassariscus_sumichrasti, 48 Nasua_narica, 49 Nasua_nasua, 50 Potos_flavus, 51 Procyon_cancrivorus, 52 Procyon_lotor; TREE Fig._2a = [&R] (((((((((((((((36,37),28),32),33,38),30),(26,34)),27),31),((35,39),(29,40))),(((((1,2),8),4,3),((6,7),5),9),(((14,43),41),12))),25),(((((18,21),(19,15)),17),(16,13)),(20,11))),(((22,23),24),10)),42),((((44,45),(48,49)),((46,47),(51,52))),50)); END;