#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on March 28, 2024; 9:22 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Barley A., Spinks P., Thomson R.C., & Shaffer H. 2010. Fourteen nuclear genes provide phylogenetic resolution for difficult nodes in the turtle tree of life. Molecular Phylogenetics and Evolution, 55(3): 1189-1194. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S10164] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=21; TAXLABELS Alligator_mississippiensis Batagur_trivittata Carettochelys_insculpta Chelonia_mydas Chelydra_serpentina Chrysemys_picta Dermochelys_coriacea Dogania_subplana Emys_marmorata Gallus_gallus Kinosternon_flavescens Macrochelys_temminckii Manouria_emys Mauremys_reevesii Pelodiscus_sinensis Pelomedusa_subrufa Platysternon_megacephalum Psammobates_pardalis Rhinoclemmys_annulata Sternotherus_odoratus Testudo_graeca ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M4239] TITLE Concatenated_Dataset; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=10648; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Chelydra_serpentina 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Emys_marmorata 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Pelodiscus_sinensis 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Platysternon_megacephalum 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Testudo_graeca 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Emys_marmorata, 11 Kinosternon_flavescens, 12 Manouria_emys, 13 Mauremys_reevesii, 14 Macrochelys_temminckii, 15 Platysternon_megacephalum, 16 Psammobates_pardalis, 17 Pelodiscus_sinensis, 18 Pelomedusa_subrufa, 19 Rhinoclemmys_annulata, 20 Sternotherus_odoratus, 21 Testudo_graeca; TREE P26s4_Gene_Tree = [&R] (18,(((((3,13,19),(12,16,21)),15),(6,10)),((5,8),((7,14),(11,20)))),(4,17)); TREE NB22519_Gene_Tree = [&R] (9,(((((((3,19),13),(12,(16,21))),(6,10),15),((7,14),(11,20))),(5,8)),4),17); TREE HNFL_Gene_Tree = [&R] (2,(((((((3,19),13),(12,(16,21))),((6,10),15)),((5,8),((7,14),(11,20)))),4),18)); TREE TB1_Gene_Tree = [&R] (9,(((((3,(12,(16,21))),13,19),((6,10),15)),((5,8),((7,14),(11,20)))),4),17); TREE AIING_Gene_Tree = [&R] (1,2,((((((3,(13,19)),(12,(16,21))),((6,10),15)),((5,8),((7,14),(11,20)))),(4,(9,17))),18)); TREE HMGB2_Gene_Tree = [&R] (18,((((3,13,19),(12,16,21)),((6,10),15)),((5,8),((7,14),(11,20)))),(4,(9,17))); TREE ZFHX1B_Gene_Tree = [&R] 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