#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on March 29, 2024; 1:52 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Schenk J., & Hufford L. 2010. Effects of Substitution Models on Divergence Time Estimates: Simulations and an Empirical Study of Model Uncertainty Using Cornales. Systematic Botany, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S10280] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=102; TAXLABELS Actinidia_chinensis Alangium_kurzii Altingia_excelsa Altingia_obovata Aosa_rostrata Aosa_rupestris Arbutus_canariensis Blumenbachia_latifolia Broussaisia_arguta Buxus_excisa Cajophora_macrocarpa Cardiandra_formosana Carpenteria_californica Cassiope_mertensiana Cercidiphyllum_japonicum Cevallia_sinuata Chichicaste_grandis Chrysosplenium_alternifolium Cornus_canadensis Cornus_chinensis Cornus_florida Cornus_hongkongensis Cornus_macrophylla Cornus_unalaschkensis Cyrilla_racemiflora Davidia_involucrata Decumaria_barbara Deinanthe_bifida Deutzia_rubens Dichroa_febrifuga Diospyros_virginiana Diplopanax_stachyanthus Enkianthus_campanulatus Eucnide_urens Exbucklandia_populnea Fendlera_rupicola Fendlerella_utahensis Fouquieria_diguetii Fuertesia_domingensis Gronovia_scandens Grubbia_tomentosa Gunnera_tinctoria Hamamelis_virginiana Huidobria_chilensis Huidobria_fruticosa Hydrangea_anomala Hydrangea_aspera Hydrangea_involucrata Hydrangea_macrophylla Hydrangea_paniculata Hydrangea_quercifolia Hydrostachy_multifida Jamesia_americana Kirengeshoma_koreana Kissenia_capensis Klaprothia_fasciculata Liquidambar_acalycina Liquidambar_orientalis Loasa_acanthifolia Loasa_filicifolia Loasa_heterophylla Loasa_lateritia Loasa_malesherbioides Marcgravia_sp. Mentzelia_adhaerens Mentzelia_albescens Mentzelia_albicaulis Mentzelia_arborescens Mentzelia_dispersa Mentzelia_fendleriana Mentzelia_involucrata Mentzelia_laevicaulis Mentzelia_torreyi Myriophyllum_dicoccum Myriophyllum_heterophyllum Mytilaria_laosensis Nasa_urens Nyssa_sp. Paeonia_veitchii Petalonyx_thurberi Philadelphus_caucausicus Phyllodoce_nipponica Pileostegia_viburnoides Plakothira_parviflora Platanus_orientalis Platycrater_arguta Presliophytum_arequipensis Pyrola_rotundifolia Rhododendron_macrophyllum Rhodoleia_championii Ribes_aureum Roridula_gorgonias Sarracenia_purpurea Saxifraga_lyallii Schismocarpus_pachypus Schizophragma_hydrangeoides Scyphanthus_elegans Styphelia_tubiflora Sullivantia_oregana Symplocos_bogotensis Trochodendron_aralioides Xylopodia_klaprothioides ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M4885] TITLE matK_cpDNA; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=1319; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Carpenteria_californica 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Cassiope_mertensiana 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Cercidiphyllum_japonicum 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Cevallia_sinuata 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Chichicaste_grandis AGGAATTCAAAAGATATTTCGAACTAAATAGATATCAGCAACACAACTTCCTATAT-CCACTTATCTTCCAGGAGTATATTGCCGCACTTGCTCATGATCATGGTTTAAATA------GATCTATTTTGTT---------GGAAAATGCA---GGTTATGAC------AATAAATTCAGCTTACTAAGTGTAAAACG------------TTTAATTACTGGAATGTATCAACAGAATCATTTGATTATTTCCGCTAATGATTCTAACCAA---AATAAATTTTTGGGGCACAACAAAAATTTTTATTTTAAAA------TGATATCAGAGGGATTTGCAGTCATTGTGGAAATTCCGTTTTCTTTACGATTAAGATCTTCCCTAGAAGGG---AAAGAGATAGTAAAA---------------------TCTCAGAATTTACAATCAATTCATTCAATATTTCCTTTTTTAGAGGACAAATTATTACATTTAAATTATGTGTTAGATATACTAATACCCTATCCCATCCATCTGGAAATCTTGGTTCAAACTCTTCGTCACTGGGTAAAAGATGCCTCTTCTTTGCATTTATTACGGTTCTTTCTACACGAGTATCGTAA------TTGGACTAGTCTTATTACT---------CCCCAAAAATCCCGTTCCTCTTTTTCAAAAAGAAAT------CAAAGATTATTCTTGTTCCTATATAATTCTCATGTATGTGAATACGAATCCATCTTCATCTTTCTACTTACCCAGTCTTCTCATTTACGATCAACATCTTCTGGAGCCCTTCTTGAACGAATATATTTCTATGGAAAAATAGAACAT------AGTGTAGAA-GTCTTTGCTAAGG------ATTTTCAGTCT---ATCCTATGTTTGCTCAAGGATCCTTTCATACATTATCTTAGGTATCAAGGAAAATCAATTCTAGCTTCAAAAGGGACGTCCCTTTTGATCAATAAATGGAAATATTACCTTGTCAA-TTGCTGGCAATGTCATTTTTACGTGTGGTCTCAATCAAGAAGGATCTATAT---AAACCAATTAGCCAATCATTCCCTCGACTTTCTGGGCTATCTTTCAAGTGTGCGACTAAACCCCTCAATGGTACGGAGTCAAATGCTAGAAAATTCATTTCTAATAGATAATGCTATTAAGAAGTTCGATACTATAGTTCCAATTATTCCTTTGATTGGATCAGTGGCTAAAGCAAAATTTTGTAACGTATTAGGGCATCCC-ATTAGTAAGCCGG--TCTGGGCTGATTTATCAGACTCTGATATTATTGACCGG Chrysosplenium_alternifolium 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Cornus_canadensis 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Cornus_chinensis 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Cornus_florida AGGAATTCCAAAGATATTTAGAACTAGCTAAATCTCGGCAACACGATTTCCTATAT-CCACTTATCTTTCAGGAGTATATTTATACACTTGCTCATGATCGTGGTTTAAATA------GGTCGATTTTGCC---------GGAAAATGCA---GATTATGAC------AATAAATCCAGCTTACTAATTGTAAAACG------------TTTAATTACTCGAATGTATCAACAGAATCATTTGCTTATTTCCGCTAATGATTCGAACCAA---AATCCATTTTGGGGGCACAACAAGAATTTGTATTTTCAAA------TGATATCGGAGGGATTTGCAGTCATTGTCGAAATTCCATTTTCTCTACGATTAATATCTTCCCTCGAAGGG---AAAGAGATAGTAAAA---------------------TCTCAGAATTTACGATCAATTCATTCAATATTTCCTTTTTTAGAGGACACATTTTTACATTTAAATTATGTGTTAGATATACGAATACCCTATCCCGTCCATCTGGAAATCTTGGTTCAAATTCTTCGTTACTGGGTAAAAGATGCCTCTTCTTTGCATTTATTACGGTTCTTTCTACACGAGTATCGTAATCGTAATTGGAATAATTTGATTACT---------CCAAATAAACTCAGTTCCTCTTTTTCAAAAACAAAT------CGAAGATTATTCTTGTTCCTATATAATTCTCATGTATGTGAATACGAATCCATTTTTCTCTTTTTCCGTAACCAATCTTCTCACTTACGATCAACATCTTTTGGAGCCCTTCTTGAACGAATATATTTCTATGGAAAAATAGAACAT------CGTGTAGAA-GTCTTTGCTAAGG------ATTTTCGGG???TTATCCTATGGTTGTTCAAGGATCCTTTCATACATTATGTTAGGTATCAAGGAAAATCAATTCTGGCTGCAAAGGGGACGCCTCTTTTGATGAATAAATGGAAATATTACTTTGTCAA-TTTCTGGAAATGTCATTTTTACGTGTGGTATCAACCAGTAACAATCTATAT---AAACCAATTATCCAATTATTCCCTCGACTTTCTGGGATATCTTTCAAACGTGCGCCCAAACCCCGCAATGGTACGGAGTCAAATGCTAGTAAATTCGTTTCTAATAGATAATGCGATTAAAAAGTTCGATACCATAGTTCCCATTATTCCTCTGATTGGATCATTAGCTAAAGCGAAATTTTGTAATGTCTTAGGGCACCCA-ATTAGTAAGCCGG--TATGGGCCGATTTATCAGATTCTGATATTATTGACCGA Cornus_hongkongensis 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Cornus_macrophylla 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Cornus_unalaschkensis 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Cyrilla_racemiflora 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Davidia_involucrata 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Decumaria_barbara 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Deinanthe_bifida 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Deutzia_rubens 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Diospyros_virginiana 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Diplopanax_stachyanthus AGGAATTCCAAAAATATTTAGAACTAGATAGATCTCAGCAACACGACTTCCTATAT-CCACTTATCTTTCAGGAATATATTTATGCATTTGCTCATGATTATGGTTTAAATA------GATCGATTTTATT---------GGAAAATCCA---GGTTATGAC------AATAAATATAGCTTACTAATTGTAAAGCG------------TTTAATTACTCGAATGTATCAACAGAATCATTTGATTATTTCCGCTAATGATTCTAACCAA---AATCAAATTTTTGGGCACAACAAGAATTTTTATTCTCAAA------TGATATCAGAGGGATTTGCAGTCATTGTGGAAATTCCATTTTCTCTACGATTAATATCTTCCCTAGAAAGG---AAAGAGATAGTAAAA---------------------TCTCATAATTTACGATCAATTCATTCAATATTTCCCTTTTTAGAGGACAAATTCTTACATTTAAATTATGTGTTAGATATACTAATACCCCCTCCCGTCCATCTGGAAATCTTGGGTCAAACTCTTCGTTACTGGGTAAAAGATGCCTCTCCTTTGCATTTATTACGGTTCTTTCTACACGAGTATCGTAA------TTGGAATAGTCTTATTACT---------CCAAAGAAACCCGGTTCCTCTTTTTCAAAAAGAAAT------CAAAGATTATTCTTGTTCCTATATAATTCTCATGTATATGAATACGAATCTATTTTCGTCTTTCTCCGTAACCAATCTTCTCATTTACGATCAACATCTTCTGGAGACCTTCTTGAACGAATATATTTCTATGAAAAAATAGAACAT------CGTATAGAA-GTCTTTGCTAAGG------GTTTTCAGGCT---ATCCTATGGTTGTTCAAGGATCCTAACATACATTATGTTAGGTATCAAGGAAAATCAATTCTGGCTTCAAAAGGGACGTCTCTTTTGATGAATAAATGGAAGTATTACCTTGTCAA-TTTCTGGCAATGGCATTTTTACGTGTGGTCTCAACCAGGAAAGATCTCTAT---AAACCAATTATCCAATCATTCCCTCGACTTTATGGGCTATCTTTCAAGTGTGCGACTAAACCCCTCAATGGTACGGAGTCAAATGCTAGAAAATTCATTTTTAATAGATAATGCTATTAAGAACTTCGATACCACAGTTCCAATTATCCCTCTGATCGGATCATTGACTAAAGCGAAATTTTGTAACGTATTAGGGAATCCC-ATTAGTAAGCCGG--TCTGGGCTGATTTGTCAGATTCTGATATTATTGACCGA Enkianthus_campanulatus 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Eucnide_urens 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Fendlera_rupicola 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Fendlerella_utahensis 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Fouquieria_diguetii 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Fuertesia_domingensis 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Gronovia_scandens 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Grubbia_tomentosa 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Gunnera_tinctoria 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Hamamelis_virginiana 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Huidobria_chilensis 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Huidobria_fruticosa 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Hydrangea_anomala AGGAATTCAAAAGATATTTCGAACTAGATAGATATCAACAACACGACTTCCTATAT-CCACTTATCTTTCAGGAGTATATTTATGCACTTGCTCATGATCATGATTTAAATA------GATCTATTTTGTT---------GGAAAATGCA---GGTTATGAC------AATAAATCCAGCTTACTAATTGTAAAACG------------TTTAATTACTCGAATGTATCAACAGAATCATTTTCTTATTTCCGTTAATGATTCCAACCAA---AATCAATTTTTGGGACACAACAAGAATTTTTCTTATCAAA------TGATATCAGAGGGATTTTCAGTCATTGTGGAAATTCCATTTTCTTTACGATTAATATCTTCCCTAGAAGGG---AAAGAGATAGTAAAA---------------------TCTCATAATTTACGATCAATTCATTCAATATTTCCTTTTTTAGAGGACAAATTCTTACATTTAAATTATGTGTTAGATATACTAATACCCTATCCCATCCATCTGGAAATCTTGGTTCAAACTCTTCGTCACTCGGTAAAAGATGCCTCTTCTTTGCATTTATTACGGTTCTTTCTACACGAGTATCGTAA------TTTGAATAGTCTTATTACT---------CCAAAAAAAACCAGTTTCTCTTTTTCAAAAAGAACT------GAAAGATTATTCTTGTTCCTATATAATTCTCATGTATGTGAATACGAATCCATCTTCGTCTTTCTCCGTAACCAATCTTCTCATTTACGATCAACATCTTCTGGAGCCCTTCTTGAACGAATCTATTTCTATGGAAAAATAGAACAT------CGTGTAGAA-GTTTTTGCTAAAG------ATTTTCAGGCT---ATGCTATGGTTGTTCAAGGATCCTTTCATACATTATGTTAGGTATCAAGGAAAATCAATTCTAGCTTCAAAAGGGACGTCTCTTTTGATGAATAAATGGAAATATTACCTTGTAAA-TTGCTGGCAATGTCATTTTTACGTGTGGTCTCAACCAAGAAGTATCTATAT---AAACCAATTATCCAATCATTCCCTCGACTTTCTGGGCTATCTTTCAAGTGTACGACTAAACCCCTCAATGGTGCGGAGTCAAATGCTAGAAAATTCATATCTAATAGATAATGCTATTAAGAAGTTCGATACCATAATTCCAATTATTCCTCTGATTGGATCATTGGCTAAAGCGAAATTTTGTTACGTATTAGGGCATCCC-ATTAGTAAGCCGG--TCTGGGCTGATTTATCAGACTCTGATATTATTGACCGA Hydrangea_aspera 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Hydrangea_involucrata 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Hydrangea_macrophylla AGGAATTCAAAAGATATTTCGAACTAGATAGATATCATCAACACGACTTCCTATAT-CCACTTATCTTTCAGGAGTATATTTATGCACTTGCTCATGATCATGGTTTAAATA------GATCTATTTTGTT---------GGAAAATGCG---GGTTATGAC------AATAAATCCAGCTTACTAATTGTAAAACG------------TTTAATTACTCGAATGTATGAACAGAATCATTTTCTTATTTCCGTTAATGATTCCAACCAA---AATCAATTTTTGGGACACAACAAGAATTTGTCTTATCAAA------TGATATCAGAGGGATTTTCAGTCATTGTGGAAATTCCATTTTCTTTACGATTAATATCTTCCCTAGAAGGG---AAAGAGATAGTCAAA---------------------TCTCATAATTTACGATCAATTCATTCAATATTTCCTTTTTTAGAGGAAAAATTCTTACATTTAAATTATGTGTTAGATATACTAATACCCTATCCCATCCATCTGGAAATCTTGGTTCAAAC-CTTCGTCACTGGGTAAAAGATGCCTCTTCTTTGCATTTATTACGGTTCTTTCTACACGAGTATCGTAA------TTGGAATAGTCTTATTACT---------CCAAAAAAAACCAGTTTCTTTTTTTCAAAAAGAAAT------GAAAGATTATTCTTGTTCCTATATAATTCTCATGTATGTGAATACGAATCCATCTTCGTCTTTCTCCGTAACCAATCTTCTCATTTACGATCAACATCTTCTGGAGCCCTTCTTGAACGAATCTATTTCTATGGAAAAATAGAACAT------CATGTAGAA-GTTTTTGCTAAAG------ATTTTCAGGCT---ATGCTATGGTTGTTCAAGGATCCTTTCATACATTATGTTAGGTATCAAGGAAAATCAATTCTAGCTTCAAAAGGGACGTCTCTTTTGATGAATAAATGGAAATATTACCTTGTAAA-TTGCTGGCAATGTCATTTTTACGTGTGGTCTCAACCAAGAAGTATCTATAT---AAACCAATTATCCAATCATTCCCTCCACTTTCTGGGCTATCTTTCAAGTGTGCGACTAAACCCCTCAATGGTTCGGAGTCAGATGCTAGAAAATTCATATCTAATAGATAATGCTATTAAGAAGTTCGATACCATAGTTCCAATTATTCCTCTGATTGGATCATTGGCTAAAGCGAAATTTTGTAACGTATTAGGGCATCCC-ATTAGTAAGCCGG--TCTGGGCTGATTTATCCGACTCTGATATTATTGACCGA Hydrangea_paniculata 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Hydrangea_quercifolia 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Hydrostachy_multifida 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Jamesia_americana 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Kirengeshoma_koreana 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Kissenia_capensis 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Klaprothia_fasciculata 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Liquidambar_acalycina 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Liquidambar_orientalis 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Loasa_acanthifolia 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Loasa_filicifolia 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Loasa_heterophylla 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Loasa_lateritia 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Loasa_malesherbioides 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Marcgravia_sp. 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Mentzelia_adhaerens 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Mentzelia_albescens 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Mentzelia_albicaulis 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Mentzelia_arborescens 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Mentzelia_dispersa 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Mentzelia_fendleriana 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Mentzelia_involucrata 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Mentzelia_laevicaulis 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Mentzelia_torreyi 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Myriophyllum_dicoccum 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Myriophyllum_heterophyllum 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Mytilaria_laosensis AGGAATTTCAAGGATATTTAGAACTAGATAAATCTCGGCAACATTATTTCCTATAT-CCACTTATCTTTCAGGAGTATATTTATGCACTTGCTCATGATCATGGTTTAAATA------GATCGATTTTGTT---------GGAAAATGTA---GGTTATGAC------AATAAATCCAGTTCACTAATTGTGAAACG------------TTTAATTATTCGAATGTATCAACAGAATCATTTGATTATTTCCGCTAATGATTCTAACCAA---AATCCATTTTTGGGGCACAACAAGAATTTGTATTCTCAAA------TGATATCAGAGGGATTTGCAGTCATTGTGGAAATTCCATTTTCCCTACGATTAGTGTCTTCCCTAGAAGGG---AAAGAAATAGTACAA---------------------TCTCATAATTTACGATCAATTCATTCAATATTTCCTTTTTTAGAGGACAGATTTTTACATTTAAATTCTGTGTCAGATATACTAATACCTCATCCCATCCATCTGGAAATATTGGTTCAAACCCTTCGCTACTGGGTGAAAGATGCCTCTTCTTTGCATTTATTACGATTCTTTTTCTACGAGTATCATAA------TTGGAATAGTCTTATTACT---------CCAAAGAAATCCATTTCTATTTTTTCAAAAAAGAAT------CAAAGATTATTCTTGTTCCTATATAATTCTCATGTATGTGAATATGAATCCATCTTCGTTTTTCTCCGTAACCAATCTTCTCATTTACGATCAACATCTTCTGGAGCTCTTCTTGAGCGAATATATTTCTATGGAAAAATAAAACAT------CTTGTAGAA-GTCTTTGCTAATG------ATTTTCAGGCC---ACCTTATGGTTGTTCAAGGATCCTTTCATGCATTATGTTAGGTATCAAGGAAAATCAATTCTGGCTTCAAAAGGGCTGCCTCTTCTGATGAATAAATGGAAATATTACCTTGTCAA-TTTCTGGCAATGTTATTTTTACGTGTGGTCTCAACCAGGAAGGATTTATAT---AAACCAATTATCCAATCATTCCCTTGACTTTCTGGGCTATCTTTCGAGTGTGGGACTAAATCCTTCAGTGGTACGGAGTCAAATGCTAGAAAATTCATTTCTAATAGATAATGCTATTAAGAAGTTCGATATCATAGTTCCAATTATTCCTATAATTGGATCATTTGCTAAAGCGAAATTTTGTAACGTATTAGGGCATCCC-ATTAGTAAGCCGG--CCCGGGCCGATTCATCCGATTCTGAGATTATCGACCGA 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Paeonia_veitchii 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Petalonyx_thurberi 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Pileostegia_viburnoides 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Plakothira_parviflora 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Platanus_orientalis 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Platycrater_arguta 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Presliophytum_arequipensis 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Pyrola_rotundifolia 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Rhododendron_macrophyllum 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Rhodoleia_championii 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Ribes_aureum 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Roridula_gorgonias 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Sarracenia_purpurea 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Saxifraga_lyallii 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Schismocarpus_pachypus 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Schizophragma_hydrangeoides 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Scyphanthus_elegans AGGAATTCCAAAGATATTTCGAACTAAATAGATATCAGCAACACAACTTCCTATAT-CCACTTATCTTTCAGGAGTATATTGCCGCACTTGCTCATGATCATGGGTTAAATA------GATCCATTTTTTT---------TGAAAATGCA---GGTTATGAC------AATAAATTCAGCTTACTAAGTGTAAAACG------------TTTAATTACTCGAATGTATCAACAGAATCATTTGATTATTTCCGCTACTGATTCTAACCAA---AATAAGTTTTTGGGGCACAACAAAAATTTGTATTCTCAAA------TGATATCAGAGGGATTTGCAGTCATTGTGGAAATTCCGTTTTCTTTACAATTAAGATCTTCCCTAGAAGGG---AAAGAGATAGTAAAA---------------------TCTCAGAATTTACAATCAATTCATTCAATATTTCCTTTTT-AGAAGATAAATTCGTACATTTAAATTATGTGTTAGATATACTAATACCCTATCCCATCCATCTGGAAATCTTGGTTCAAACTTTTCGTCACTGGGTAAAAGATGCCTCTTCTTTGCATTTATTACGGTTCTTTCTACACGAGTATCGTAA------TTGGAATAGTCTTATTACT---------CCAAAAAAATCCCGTGCCTCTTTTTCAAAAAGAAAT------CAAAGATTATTCTTGTTCCTATATAATTCTCATATATGTGAATACGAATCCATCTTCAGCTTTCTACTTACCCAATCTTCTCATTTACGATCAACATCTTCTGGAGCCCTTCTTGAACGAATATATTTCTATGGAAAAATAGAACAT------AGTGTAGAA-GTCTTTGCTAAGG------ATTTTCAGTCT---ATCCTATGTTTGCTCAAGGATCCTTTCATCCATTATCTTAGGTATCAAGGAAAATCAATGCTAGCTTCAAAAGGGACGTCTCTTTTGATGAATAAATGGAAATATTACCTTGTCAA-TTGCTGGCAATGTCATTTTTACGTGTGGTCTCAATCAAGAAGGATCTATAT---AAACCAATTATCCAATCATTCCCTCGACTTTCTGGGCTATCTTTCAAGTGTACGACTAAATCCCTCAATGATACGGAGTCAAATGCTAGAAAATTCATTTCTAATAGATAATGCTATTAAGAAGTTCGATACTATAGTTCCAATTATTCCTTTGATTGGATCATTGGCTAAAGCAAAATTTTGTAACGTATTAGGGCATCCC-ATTAGTAAGCCGG--CCTGGGCGGATTTATCAGACTCGGATATTATTGACCGG Styphelia_tubiflora ---------------------AACTAGATAGATCTCAGCAACATGACTTTATATAT-CCACTTCTCTTTCAGGAGTATATTTATGCACTTGCTCATGATCGCGATTTCAATA------GATCCATTTTGTT---------TGAAAGTGTG---GGTTATGAC------AAGAAATCTAGCTTTCTAATTGTGAAACGTTTAATAACTCGTTTAATTAGTCAAATGTATCAACAGAATCATTTGGATA------CTAATGATTCGAATCAT---AAAAAATTTTTGGGGTACAATACAAATTTTTATTCTCAAA------GGATATTCGAAGGATTTGCGGTCGTTGTGGAAATTCCTTTTTATCTACGATTCCGATCTTTTCTAGCAGGA---AAAGAAAGAATCAAA---------------------TCTCATAATTTACGATCACTTCATTCAATATTTCCGTTTTTAGAGGACAAATTTTTACATTTAACTTATTTGTTAGACATACAAATACCTCACCCCATTCATCTGGAAATCTTGATTCAAACTCTTCGCTACTGGGTAAAAGATCCCTCTTCTTTGCATTTATTACGATTTTTTCTCCACGAGTATCCTAA------TTGGAATAGTCTGATTACT---------CCAAAGAAATCTAGTTTTTCTTTTTCAAAAAAAAAT------CAAAGATTCTTCTTCTTCCTATATAATTTTTATGTATGTGAATACGAATCTATCTTCGTTTTTCTCCGCAACCAATCATCTCATTTATGTTCAATATCTTCTGAAACCTTTCTAGAACGAATCTCATTCTATAAAAAAATAAAA--T----------TAGAA-GTCTTTACTAAAG------ATTT---GA-----A----ATGGGTGTTCAAAGATCCTTTCCTGCATTATGTTAGGTATCGAGGAAAATCTATTTTGGCTTCAAAAGATTCGTCTCTTTTGATGAATAAATGGAAATATTACCTTGTCAA-TTTTTTGGAATGTTATTTTTACATGCGGTCTCAATCAAGAAGGATCCATAT---AAAGCGATTATCCAAGAATACCCTCGACTTTATGGGCTATCTTTCCAATGTGCGATTCAAAACTTCAATGGTACGTAGTCAAATGATAGAAAATTCATTTCTAATAGAGAATGCTAGTAAGAAGTTCGATACTCTAGTTCCAATTACTCCAACGATTGTATCATTGTCTAAAGCGAAATTTTGTAACGTCTTAGGACATCCT-ATGAGTAAGCCAG--TCTGGGCCGATTTATCGGATTCTGATATTATTGATCGA Sullivantia_oregana GGGAATTTCAAGGATATTTAGAACTCGATAAATTTCGGCAACATCACTTCCTATAT-CCACTTATCTTTCAGGAGTATATTTATGCACTTGCTCATGATCATGTTTTAAATA------GATCCATTTTGTT---------GGATAATTTT---GGTTATGAC------AATAAATCCAGTTCAATAATTGTGAAACG------------TTTAATTACTCGAATGGGTCAACAGAATCATTTGCTTATTTCTGCTAATTATTCGAACAAA---AATAAATTTTTGGGGCATAACAAGAATTTCGATTCTCAAA------TGATATCAGAGGGATTTGCAGTTATTGTGGAAATTCCATTTTCCCTAAGATTAGTATCTTCCTTAGAAAGG---AAAGAAATAGTAAAA---------------------TCTCATAATTTACGATCAATTCATTCAATATTTCCTTTTTTAGAAGACAATTTTTTACATTTAAATTATGTGTCAGATATACTAATACCCCACCCCATCCATCTGGAAATATTGGTTCAAACTCTTCGCTACTGGGTGAAAGATGCCTCTTCGTTGCATTTATTACGATTCTTTCTCTATGAGTATCAGAG------TTGGAATAGTCTTATTACCCCAA---CTCCAAAGAAATCCATTTCCATTGTTTCACAAAGGAAT------CAAAGATTATTCTTGTTTTTATATAATTCTTATGTATGTGAATACGAATCCACCTTCATTTTTCTTTGGAACCAATCTTCTCATTTACAATCAACATCTTATGGAACTCTTTTTGAGCGAATATATTTCTATGGAAAAATAAAACAT------CTTGTAGAA-GTCTTTTCTAATG------ATTTTCCGACC---GCCCCATGGTTGTTCAAAGATCCGTTCATGCATTATATTAGGTATCAAGGAAAATCAATTCTGGCATCAAAAGGTACGCCCCTTCTGCTGAATAAATGGAAATATTACCTTGTAAA-TTTCTGGCAATGTCATTATTACGTATGGTCTCAATCAGGAAGGATCCATAT---AAACCAATTATCTAATCATTCCCTCGACTTTCTGGGCTATCTTTCGAGTGTGCGACTAAATCCTTCAGTGGTGCGGAATCAAATGCTAGAAAATTCATTTATAATAGATAATGCTATTAAGAAGTTCGATATCATAGTTCCAATTCTTCCTCTAATTAGATCATTGGCTAAAGCTAAATTTTGTAACGTAGTAGGGGATCCA-ATTAGTAAGCCGT--CCTGGGCCGAATCATCAGATTCTGATATTATTGACAGA Symplocos_bogotensis AGAAATTCAAAATATATTTAGAACTAGATAGATCTCAGCAATACGACTTTGTATAT-CCACTTATCTTTCAGGAGTATATTTATGCACTTGCTCATGATCATA---------------GATCGATTTTGTT---------GGAAAATCCA---GGTTATGAC------AATAAATCCAGCTTACTAATTGTGAAACGTTTAATTACTCATTTAATTACTCAAATGTATCAACAGAATCCTTTTTTTTTTTCTGCTAATGATTCTAACCAA---AATCCATTTTTGGGGCACAACACGAATTTTTATTCTCAAA------TGATATTCGAAGGATTTGCAGTCGTTGTGGAAATTCCACTTTCTCTACGATTAATATCTTCCCTAAAGGGG---AAAGAAGTAGTAAAA---------------------TCTCATAATTTACGATCAATTCATTCAATATTTCCTTTTTTAGAGGACAAAATATCACATTTAATTTATGTGTTAGATATACTAATACCTCACCCCATCCATTTGGAAATCTTGGTTCAAACTCTTCGCTGCTGGGTAAAAGATGCCCTTTCTTTGCATTTATTACGATTCTTTCTCCACGAGTATCGTAA------TTGGAATAGTCTTATTACT---------CCAAAGAAATCTACTTTTTCTTTTTCAAAAAAAAAT------CAAAGATTATTCTTCTTCCTATATAATTCTCATGTATGTGAATACGAATCTATCTTCGTTTTTCTCCGCAACCAATCTTCTCATTTACGATTAATATCTTCTGGAATTTTTCTTGAACGAATATATTTCTATGTAAAAATAGAATAT------TTTGTAGAA-GTATTTACTAAGG------ATTTTCGGGCC---ATTCTATGGTTGTTCAAGGATCCTTTCATGCATTATGTTAGGTATCAAGGAAAATCCCTTTTGGTTTCAAAAGGGACGTTTCTTTTGATGAAGAAATGGAAATATTACTTTGTCAA-TTTCTGGCAATGTTATTTTTACATGTGGTCTCAACCAGGAAGGATCCATAT---AAACCAATTATCCAATCATTCCCTCGACTTTCTGGGCTATCTTTCAAGTGTGCGACTAAACCCTTCAATGGTACGGAGTCAACTGCTAGAAAATGCATTTCTAATAGGAAATGCTATTAAAAAGTTCGATACCCTAGTTCCAATTATTCCTCTGATCGGATCATTGTCTAAAGCGAAATTTTGTAACGTGTTAGGACATCCC-ATTAGTAAGCCAG--TCTGGGCCGATTTATCAGATTCTGATATTATTGACCGA Trochodendron_aralioides GGGAATTAGAAGGATATTTCGAAATAGATAGATCTCGGCAACAAGACTTTCTATAT-CCACTTCTTTTTCAGGAGTATATTTATGCACTTGCTCATGATCATGGTTTAAATA------GATCGGTTCTTTACGAACCCATGGAAAATTTA---GGTTATGAC------AATAAATCCAGTTCACTAATTGTGAAACG------------TTTAATTACTCGAATGTATCAACAGAATTATTTGATTATTTCGGTTAATGATTTTAGCCAA---AATCAATTTGTTGGGCACAACTATAATTTTGATTATCAAA------TGATATCAGAGGGGTTTGCAGTCATTGTGGAAATTCCATTCTCGTTACGATTAGTATCTTCCCTAGGAGGA---AAAGAAATAGCAAAA---------------------TCTCATAATTTACGATCAATTCATTCAATATTTCCTTTTTTAGAGGACAAATTATCACATTTAAATTATGTGGCAGATATACTAATACCCCACCCCATCCATCTGGAAATCTTGATTCAAACCCTTCGCTGCTGGGTACAAGATGCCCCGTCTTTGCATTTATTGCGATTCTTTCTCCACGAGTATTGTAA------TTGGAATAGTCTTATTACT---------CCAAAGAGATCCATTTCCCTTTTTTCAAAAAGGAAT------CAAAGATTCTTTTTTTTCCTATATAGTTCTCATGTATCTGAATGCGAATCAATATTCGTTTTTCTCCGTAAACAATCTTCTTATTTACGATCAACATCTTTTGGCGCCCTTCTTGAGCGAACACATTTTTATGGAAAAATAGAAC-TA-----CTTGTCGTA-GTGTTTCGCAATT------ATTTTCAGGCC---ATTCTATGGTTGTTCAAAGATCCTTTCATACATTATGTCAGATATCAAGGAAAATCTATTCTGTCTTCAAAGGGGACTCCTCTTCTGATGAATAAATGGAAATATTACCTTGTCAA-TTTCTGGCAATGTAATTTTAACTTGTGGTCTCAACCGGGTAGGATTCATAT---AAAGCAATTATCCAATAATTCCCTCGATTTTCTGGGCTATCTTTCAAGTGTACGACTAAATCCTTCAGTGGTAAGGAGTCAAATGATAGAAAATGCATTTCTAATAGATAGTACTAGCAAGAAGTTTGATACCATAGTCCCAATTAGTCCTCTGATTGGATCTTTGGCT{AT}AAGCGAAATTTTGTA-CGTATCAGGGCATCCCCATTAGTAAGCCGG--TACGGGCCGATTCATCAGATTCTGATATTATCGACCGA Xylopodia_klaprothioides 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; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = matK_cpDNA) = N: 1-1319; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = matK_cpDNA) = N: 1-1319; END; BEGIN TREES; TITLE Tb11335; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Actinidia_chinensis, 2 Alangium_kurzii, 3 Altingia_excelsa, 4 Altingia_obovata, 5 Aosa_rostrata, 6 Aosa_rupestris, 7 Arbutus_canariensis, 8 Blumenbachia_latifolia, 9 Broussaisia_arguta, 10 Buxus_excisa, 11 Cajophora_macrocarpa, 12 Cardiandra_formosana, 13 Carpenteria_californica, 14 Cassiope_mertensiana, 15 Cercidiphyllum_japonicum, 16 Cevallia_sinuata, 17 Chichicaste_grandis, 18 Chrysosplenium_alternifolium, 19 Cornus_canadensis, 20 Cornus_chinensis, 21 Cornus_florida, 22 Cornus_hongkongensis, 23 Cornus_macrophylla, 24 Cornus_unalaschkensis, 25 Cyrilla_racemiflora, 26 Davidia_involucrata, 27 Decumaria_barbara, 28 Deinanthe_bifida, 29 Deutzia_rubens, 30 Dichroa_febrifuga, 31 Diospyros_virginiana, 32 Diplopanax_stachyanthus, 33 Enkianthus_campanulatus, 34 Eucnide_urens, 35 Exbucklandia_populnea, 36 Fendlera_rupicola, 37 Fendlerella_utahensis, 38 Fouquieria_diguetii, 39 Fuertesia_domingensis, 40 Gronovia_scandens, 41 Grubbia_tomentosa, 42 Gunnera_tinctoria, 43 Hamamelis_virginiana, 44 Huidobria_chilensis, 45 Huidobria_fruticosa, 46 Hydrangea_anomala, 47 Hydrangea_aspera, 48 Hydrangea_involucrata, 49 Hydrangea_macrophylla, 50 Hydrostachy_multifida, 51 Hydrangea_paniculata, 52 Hydrangea_quercifolia, 53 Jamesia_americana, 54 Kirengeshoma_koreana, 55 Kissenia_capensis, 56 Klaprothia_fasciculata, 57 Liquidambar_acalycina, 58 Liquidambar_orientalis, 59 Loasa_acanthifolia, 60 Loasa_filicifolia, 61 Loasa_heterophylla, 62 Loasa_lateritia, 63 Loasa_malesherbioides, 64 Marcgravia_sp., 65 Mentzelia_adhaerens, 66 Mentzelia_albescens, 67 Mentzelia_albicaulis, 68 Mentzelia_arborescens, 69 Mentzelia_dispersa, 70 Mentzelia_fendleriana, 71 Mentzelia_involucrata, 72 Mentzelia_laevicaulis, 73 Mentzelia_torreyi, 74 Myriophyllum_heterophyllum, 75 Myriophyllum_dicoccum, 76 Mytilaria_laosensis, 77 Nasa_urens, 78 Nyssa_sp., 79 Paeonia_veitchii, 80 Petalonyx_thurberi, 81 Philadelphus_caucausicus, 82 Phyllodoce_nipponica, 83 Pileostegia_viburnoides, 84 Plakothira_parviflora, 85 Platycrater_arguta, 86 Platanus_orientalis, 87 Presliophytum_arequipensis, 88 Pyrola_rotundifolia, 89 Rhodoleia_championii, 90 Rhododendron_macrophyllum, 91 Ribes_aureum, 92 Roridula_gorgonias, 93 Sarracenia_purpurea, 94 Saxifraga_lyallii, 95 Schizophragma_hydrangeoides, 96 Schismocarpus_pachypus, 97 Scyphanthus_elegans, 98 Styphelia_tubiflora, 99 Sullivantia_oregana, 100 Symplocos_bogotensis, 101 Trochodendron_aralioides, 102 Xylopodia_klaprothioides; TREE Fig._1 = [&R] ((((((((((1,92),93),((((7,((14,(82,90)),98)),88),33),25)),100),38),31),64),((((2,(((19,24),(21,22)),(20,23))),41),((((((((((5,17),6),((((8,61),((11,((60,97),62)),59)),(63,87)),77)),(44,(55,((56,84),102)))),45),(((16,(39,40)),80),((((65,70),68),(((66,72),71),(67,69))),73))),96),34),(((((9,(30,49)),((((27,83),95),52),(46,((47,85),48)),51)),(12,28)),(((13,81),37),(29,54))),(36,53))),((26,32),78))),50)),(((((3,(4,57)),58),(15,((35,89),(43,76)))),((((18,94),99),91),(74,75))),79)),((10,(86,101)),42)); END;