#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 19, 2024; 12:25 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Bailey C., Hughes C., & Harris S. 2004. Using RAPDS to develop DNA sequence loci for species level phylogeny reconstruction: an example from Leucaena (Fabaceae). Systematic Botany, 29(1): 4-14. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S1034] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=14; TAXLABELS Leucaena_collinsii_ssp._collinsi Leucaena_collinsii_ssp._zacapana Leucaena_cuspidata Leucaena_esculenta Leucaena_greggii Leucaena_lanceolata_ssp._sousae Leucaena_lempirana Leucaena_macrophylla_var._macrop Leucaena_matudae Leucaena_multicapitula Leucaena_pueblana Leucaena_pulverulenta Leucaena_retusa Leucaena_salvadorensis ; END; BEGIN TAXA; TITLE Taxa2; DIMENSIONS NTAX=15; TAXLABELS Leucaena_collinsii_ssp._collinsi Leucaena_collinsii_ssp._zacapana Leucaena_cuspidata Leucaena_esculenta Leucaena_greggii Leucaena_lanceolata_var._sousae Leucaena_lempirana Leucaena_macrophylla_ssp.__macro Leucaena_matudae Leucaena_multicapitula Leucaena_pueblana_a Leucaena_pueblana_b Leucaena_pulverulenta Leucaena_retusa Leucaena_salvadorensis ; END; BEGIN TAXA; TITLE Taxa3; DIMENSIONS NTAX=15; TAXLABELS Desmanthus_fruticosus Leucaena_collinsii_ssp._collinsi Leucaena_collinsii_ssp._zacapana Leucaena_cuspidata Leucaena_esculenta Leucaena_greggii Leucaena_lanceolata_var._sousae Leucaena_lempirana Leucaena_macrophylla_ssp._macrop Leucaena_matudae Leucaena_multicapitula Leucaena_pueblana Leucaena_pulverulenta Leucaena_retusa Leucaena_salvadorensis ; END; BEGIN TAXA; TITLE Taxa4; DIMENSIONS NTAX=15; TAXLABELS Desmanthus_fruticosus Leucaena_collinsii_ssp._collinsi Leucaena_collinsii_ssp._zacapana Leucaena_cuspidata Leucaena_esculenta Leucaena_greggii Leucaena_lanceolata_var._lanceol Leucaena_lempirana Leucaena_macrophylla_ssp._macrop Leucaena_matudae Leucaena_multicapitula Leucaena_pueblana Leucaena_pulverulenta_2_4_6 Leucaena_retusa Leucaena_salvadorensis ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M632] TITLE a9; LINK TAXA = Taxa2; DIMENSIONS NCHAR=1242; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Leucaena_matudae 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Leucaena_multicapitula 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TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M629] TITLE 23L; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=838; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M631] TITLE cpDNA; LINK TAXA = Taxa4; DIMENSIONS NCHAR=134; FORMAT DATATYPE=Standard SYMBOLS= "0 1" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 ] [ . . . . . . . . . . . . . ] Desmanthus_fruticosus 001???10000000000000???????0000100100001000000010?????????????????000110011??000000??0000001???00000010000000011???????????110???????? 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