#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 26, 2024; 13:31 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Martin F.N. 2010. Mitochondrial haplotype analysis as a tool for differentiating isolates of Verticillium dahliae. Phytopathology, 100. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S10602] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=31; TAXLABELS 'Verticillium albo-atrum' Verticillium_dahliae_Ca63 Verticillium_dahliae_Cf40 Verticillium_dahliae_Cf45 Verticillium_dahliae_Cs80 Verticillium_dahliae_Cv79 Verticillium_dahliae_Cv85 Verticillium_dahliae_DQ351941 Verticillium_dahliae_Fca21 Verticillium_dahliae_Fca29 Verticillium_dahliae_GH101 Verticillium_dahliae_Le88 Verticillium_dahliae_Ls17 Verticillium_dahliae_Ls331 Verticillium_dahliae_Ls7 Verticillium_dahliae_MP89 Verticillium_dahliae_SM113 Verticillium_dahliae_St91 Verticillium_dahliae_V137I Verticillium_dahliae_V310I Verticillium_dahliae_V364I Verticillium_dahliae_V396I Verticillium_dahliae_V403I Verticillium_dahliae_V537I Verticillium_dahliae_V539I Verticillium_dahliae_V548I Verticillium_dahliae_V661I Verticillium_dahliae_V717I Verticillium_dahliae_V792I Verticillium_dahliae_V800I Verticillium_dahliae_V854I ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M5770] TITLE Verticillium_dahliae_mtDNA_sequences; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=3598; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] 'Verticillium albo-atrum' 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Verticillium_dahliae_Ca63 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Verticillium_dahliae_Cf40 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Verticillium_dahliae_Cf45 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Verticillium_dahliae_GH101 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Verticillium_dahliae_Le88 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Verticillium_dahliae_Ls17 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Verticillium_dahliae_Ls331 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Verticillium_dahliae_Ls7 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Verticillium_dahliae_MP89 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Verticillium_dahliae_V310I 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Verticillium_dahliae_V537I 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Verticillium_dahliae_V717I 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; END; BEGIN TREES; TITLE Verticillium_mt_TB; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Verticillium_dahliae_GH101, 2 Verticillium_dahliae_V137I, 3 Verticillium_dahliae_V403I, 4 Verticillium_dahliae_V854I, 5 Verticillium_dahliae_V661I, 6 Verticillium_dahliae_V537I, 7 Verticillium_dahliae_Fca21, 8 Verticillium_dahliae_Fca29, 9 Verticillium_dahliae_Cv79, 10 Verticillium_dahliae_Cv85, 11 Verticillium_dahliae_Cs80, 12 Verticillium_dahliae_Ls331, 13 Verticillium_dahliae_V548I, 14 Verticillium_dahliae_V717I, 15 Verticillium_dahliae_V364I, 16 Verticillium_dahliae_V800I, 17 Verticillium_dahliae_V396I, 18 Verticillium_dahliae_V539I, 19 Verticillium_dahliae_Cf40, 20 Verticillium_dahliae_Cf45, 21 Verticillium_dahliae_Ls7, 22 Verticillium_dahliae_Ls17, 23 Verticillium_dahliae_Ca63, 24 Verticillium_dahliae_SM113, 25 Verticillium_dahliae_Le88, 26 Verticillium_dahliae_V310I, 27 Verticillium_dahliae_V792I, 28 Verticillium_dahliae_MP89, 29 Verticillium_dahliae_St91, 30 Verticillium_dahliae_DQ351941, 31 'Verticillium albo-atrum'; TREE PAUP_1 = [&R] (31:100.0,((1:100.0,2:100.0,3:100.0,4:100.0,5:100.0,6:100.0):97.951363,(7:100.0,8:100.0,9:100.0,10:100.0,11:100.0,12:100.0,13:100.0,14:100.0,15:100.0,16:100.0,21:100.0,25:100.0,(26:100.0,27:100.0):54.530552):54.464409,24:100.0,29:100.0):60.904804,(((17:100.0,22:100.0):54.950848,19:100.0,20:100.0,23:100.0,28:100.0,30:100.0):81.769699,18:100.0):75.3144); END;