#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on March 28, 2024; 20:24 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Yu L., Luan P., Jin W., Ryder O.A., Chemnick L., Davis H., & Zhang Y. 2010. Phylogenetic Utility of Nuclear Introns in Interfamilial Relationships of Caniformia (Order Carnivora). Systematic Biology, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S10901] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=16; TAXLABELS Ailuropoda_melanoleuca Ailurus_fulgens Arctonyx_collaris Callorhinus_ursinus Canis_lupus Canis_lupus_familiaris Martes_flavigula Mephitis_mephitis Mustela_kathiah Odobenus_rosmarus Phoca_vitulina Potos_flavus Procyon_lotor Ursus_arctos Ursus_thibetanus Zalophus_californianus ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M6768] TITLE 'combined-nogap'; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=16459; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Ailuropoda_melanoleuca AGCCGCATGAGTGAGCGGCAGCTGGCTCTCTGGAATCCGGTATGCCCCTCCCAGCCTTTCCATTGGCTTACACTTGAGTTTCTGGGCAGGTCCTTGGTTGGGTAAATGGATTATAGGATCCTTAGTGTAGTTTTCTGAACCCCTACTGGTCTTGACGTTCTCATCCTCACTGGAGACTTATTCTAAATGTATTATAAAATGCATTCTTAATAGTCTCAAGTAGTCTATGTTGACTAGGTTTTTAAAAAGAAAGTATGAAGAACCAGTGTTTGGGACTTGGGAAACAAGTTCTTAACTTTATTTTATGATCAAATATTTAAATCAAAATAGTCATGTTCAGGAAAATGTTAAGAGTAGCATAAGAAAAAATAACAAAACTGAATATACGGTATGATCTCAGTGTGTGTGTTGGAAGTAGACAAAAACGGTCATTGTTTTGCCACCCACCGGGCTGTGGGATTATGGAATATGGGATGATAGTCTTTCTGTAGTGTATATTTACAATAAGAAAAATTTCTTTGGTACCTGCCTGGCTCAGAGTGTGTGACTCTTGATCTCAGGGTCATGAGTTCAAGCCCTGCATTGGGCATGGAGCCTACTTTAAATAAACAAAGGAGAAGGGCTTTCTCATCTTTGTCATGGAATCACACTGATAACAGTTTTCAGTGGGTTGGGAAATTGGTATTTACTGTATGAATATTATATGTGCATTGTTCAACCTTCATTATTTTAGGAGATTGCTCACATAATTAGGGATAAAAGAATGATTCACCTTGTGAAAATATATATTTGTATTTTTTTAGAAAAATATGCAGGAACCAATCGCTCTTCATGAAATGGACACTAGCAATGGGGTG?????????????????????????TGCCACCCCCCTTTCCCAGGTGGGCACCAGACGGCCAGGAGGGTGGGTCGCTTAGTCAGCCCAGACTCAACAGGGCTCAGGAGCAAGGCTGATGCATTGACATTTCCAAGGGAGGCTCTGGGAGAGACCCGCCCCACTGTCTGCACCTCTGGGAAGTCCCGCTCTGGTCTAACTTGAATCTCTCCAGCAAGACTGCCCTTGGTCAGTGGAATTCCCAGCTGGCCAGGAGAAAGGCAGCCTCCTGCCCTTTCTCCCTGTCCTGTCTCAGTGCAGACAGGGAAGGTGCTGCCCGCTGACTCACAGGCTGATATCAGGCTCATCCTAGCCATTCCTCTGCCTTTGCTCAGGATTCTTTACAGGAGGTGGCTGGTCACACCTGGGTTCCTGCTTTCAGCGGGTGTCACCATTGCCCTTGTCCCTGTCCGACAGAGGAATCATTTGAATCCCTTCCCCCAGTTCTGCGGGCCTGCGGGCCCAGGTTGTCATCCTAAAGTGTTATCTTAGGGAAGTCACTTGCCTTCTCTGGGCCTCGGCTTCCCCATGCCCTTCCCACTCCCCATCTCCAAGTTTAAGTCATTTAAATCACAAAGGATCCAAGGAATGTTGTGGCTGGCATCCAAGTGAAGCAAGAGGGCCAAGTTGGGGTCACTGAAGAACTTCCCAGGTAGCAGTTGGTATGTGGAGAGGTCTTAAGAAGTTATAGTTTGACTTTCAGTGAGGGCTGGGCGTGTGTGTGTTTGGAGAATTCGGGACACCTGACTTCTGAGGACCTGGCCCTCTCGTCTTCTCTGGTCTTGGTTCCACTTCTCTTCTCTTCCCTCCCCCCAGGATGTACGCA?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TGTATCAGGTATGTTGGGACAGGCACATGGTATTTGTTCTCAGGGGTTAATTTTCTTTAAAGATATTTTAGGGTTTGTGGGTATACGTTCTCTGTCACAGCCAGCTCTGTCATTGTTTTTGTGTTTCAACAAAACCTTATTTACAAAAACGACTTGTTCTCGGAAAATTTAGTGAATGAGCATTTAAAGATTAAAGTGTGTTTCATTTTATTGTGGCTTTATTATCAAGCACATGTTAATAAAAATTAAGAATTTTTGGAATATGGTAAGGGACTAAAATGGGACCCAAAGTGATTCTAAGTGTTAATTTGGTCTTATGGGTGAGAATTTGAGAGTTCAGTAAAGCAGTTTTGCAGTTTAATTTATCCATTGTTACCAGCTTTATAATTTTCATTAAAAAATTAGCCTTCTATCACTGAGTCTTGATGTTCCATCTTCAGGAAGAAGAGAGCCATAAATTTCCTTTGTGGCTTGTAATTAGTTGGTATTGATTTAACTGTGATGAGTCTTAATAGCTTCAGTATCAGTGCAGCATTTAATGGCCACAGGTATTGCTACAAATATTGTAATATGAATGTTGAGTCATTATAAAGACTCCTCTCAGCATAAAATTTTTATCAAAGTAAGCATAAAATGCTTGAGTGTATATGACAGGGAGGATGAGACTGTTTAGAATATTACAGACAAAAGTACCACCTACTGATTTTCTTTGGTGTATTCCCTTCATCCTAAATTCTGAAGAATTTTTAATTTCTCTAGGAACATGTTAATGCATCTACCCTGATATAATTACTGATAGTCATATCTTTCCTTTAGTAACT??????????????????????????TCCAAAGACAAGAAAGTGAGAGTAATCGATCCTAGAAAACAAGAGAAGTATGCTTAGGACAAAACCCCCTGTCTTTGTAGCACTCCTGGTCAGCGGAGCCTCACCGTGAGTCCGCAGAGCCTTGTACAGGCTTCTGCCTCCATCCTTCAGAGCTGTGCATTCCAGCACTTACACAATCTTATCTCTCGCCTGGTGACCATTTTTAAGAAACAAATTCTCATCAGTTCACCAGAGTCCTTGAGAAGTCTAGATCAGCTAACCTAAACAGTTAACTGCATTCCTGGCTTAGTGATTGATCCCTGCCCCTTCTGCAACCATCGTCAGAGTACCTCACAGAGAAGCCATAGGTTCTCTTCAGCTCAGTGGCGGTTTCTGCCACTCAAGGCCTCACCAGATGGGCATTTGGAACTGGAGCTGGGGTCTTGCATCAGGCCTGCTCTCATATGCCTCTCTCTGGGAGTGCTGGTTCTTTGGCAGTTTTACTTCAGAGTTGGGTAGCGGTCATGACTAGGGCTTACTGAGCACTGAGGACTTCCTGCACAAAGTGCTTTCTCCACTAGAATCTTCTATTAGTGCACTCTCAATGAGGAGATTAAGGAACTGAACTAGACTTCCTTCTGTCCAGTGAATTTGGTAGAAACCATACAGGTTATCCTCTTGAGAAACAGACATCTGGCAGTCCTTTCATGTTTTATTTTTGCAGAACATGGACTTGGGTTGGCAGCAGGGCATGGTAGGCTTTTGAGTTAACTCTTGGCATTCTTGCTAACTAGCTGAGGGACCTTGGCCAGATTACATAGTCTCTTTGTTTTCTCATCTTGGGAGGAGACACGTGTGCACGCCTGGGAATCTGAGTGGGTTGAATTCAGGTATGAGCCCCCCTTTTTTGCAGTTTGAATATCCTGTTGTTCTTGGTCCCCCAGGAGAAGGAGAAAGCACATGAAGGAGCAAGACCAATGAGAGCCATCTTTCTGGCTGACGGGAATGTCTTTACCACTG???????????????????????????????????????????????????????????????AGCATTACGGCCAGTGGTCTGGGGGGAAACATCATGTAAGTGGTAACTTCACACAAGTGAATGTGGGTATTTAGTCACTTAGAGGGGATTATCTCTTTTGTCATGTATCTCTGACTCCTAGACCTAAAAGCCTGTCAGGAGAACTCTGGTAGCATTTAATCTATCTGGCCTCAGGTTCTCATTTATGTATGTAATTACACTGGATGGTTTCTAAAGTCAGTGTCTCCAGGCTGTAATATTTGTCTATTCTGTGGATTGGTGTTCTCCAGGGCCACTTTTATTCTCTGCATTTTCACAGTGAGCTATAGTGAAAGTACCCAAAGTTTATTTGGTTGACTGCCAAAGCTTTGTGTGTGTGTAAACATTGGAAGAAGAATCTGTTTGAATGCCATTGGTGTAATTAGTTTTGCATTTATATTCGGTGTCAAAGACTTGGCAGGAAGTATTGCTGTTGGTGGTTCGGAATACTCTGGAATATTACTGTCCCTGCTCAACTTCATACCCCAGCTAGTTAGCTGACAAGGGAGACAGAAGTTCAAAGTTTGAAGAACTTGAAGTCAGCAGGTTGTAGAATAATAAAAAGCAATCATGGAAGGACTTTGGGTATCATAAAATTGAAGTGGGGAACATAGCAAGGAAAGCTTGTTTTCAGTGGTAGGGGATACAAAGGCAGACAAGCAGAATCTTTGTCCATCAAGTAGCTCAGACTGCCTGAAGGGTTACTGTAAAAAACAATTTTTTAGGAGGCATGGGAGGGCTTTGGAAATGTTTTATTTACTTTATAGAGACCTCACATATATGCTTTGCTTCATCATTGATATATGTTATCTAAAGTTTTGTAATTAAAGCAGATGGTGCACATAATTGAACAACTGTTATTTTTATTGTCTATTGTGATCTTGTGGTTGAAAAAAATTCTAAGGTAATATAAATGTGAATTGCATGTGGACCACACTTTATGACATCATTAATGC????????????????????????????????????????????GAAGATTTAAGGAGTTTAACCAACTTTTTTGGATTTTGCACTGAAACTTTTGTTTTGGCTGTCAATATTTTAGATAGATTCTTGGCTCTTATGAAGGTATTTAATCATTTTTGTATATACATCTTCTATTTCTAAACCTAGCGCCCAGCACAGTGACTAGCATACAAGGGTTCGATAAATGTTTGACAAGTGAATGTAATTATGTCACTGCAAAGAAACATTTTGTGATCTTCAGTGCCAGAGTGAGAGACTACAGAATTAACTGTGT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Ailurus_fulgens 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Callorhinus_ursinus 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Canis_lupus 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Canis_lupus_familiaris AGCCGCATGAGTGAGCGGCAGCTGGCTCTCTGGAATCCGGTATGCCCCTCCCAGCCTTTCCACAGGCTTACACTTGAGTTTCTGAGCAGGTCTTTGGGTGGGTAGGTAGATTATAGGATTCTTAGTGTAGTTTTCTGAACTCCTGCTTGACTTGACACTCTCGTCGTCACTGGAGACTTACTTTAAATGTATTAGAAAATGCATTCTTGATACTCTCAAATACTCTGTGTTGACTGTAATTTTTAAAAGACTGCACGAAGAACCAGTGTTTGGGACTTGGGAAACAAGTTCTGAACTTTGTATTATGATCAAATGTTAAAGTCACAATAGTCACGCTTAGGAATATGTTGAGAATAGCATAAGAAAAAATAACAAAACTGAATATATGGTATGATCTGTGTGTGTGTGTGGTAAGTAGACCAAAACGGTCATTGTTTTGCCATCCACTGGACTGTGGGATTATGGAATATGGGATGGTAGTCTTTCTGTAGTGTATTTTTATAATAAGAAAGATTTCTTTGGTTTCTCCCTGGCTCAGAGTACATGGCTCTTGGTCTCAGGCTCATAAATTCAACCCCTGCATTGGGTGTGGAGCCTATTTTAAATACATAAAGGAGAAGAGCTGTCTCATTTTTGTCATGGAATCACACTGATGATAGTTTTCAATGGGTTGGAAAATTGGTATTTACTGTATAAGTATTATATATGCATTGTTCAACCTTCATTATTCTAGGAAATTGCTCCCATAATTATGTATGAAAGAATGATTCATCTTGTAAATATATTTTTTTGTATTTTTTTAGAAAAATATGCAGGAACCAATCGCTCTTCATGAAATGGACACTAGCAATGGGGTGGACTTCTGGGACTTCTGCCTCGGCGTGCCACCCCCTTTTCCCAGGTGGGCACCAGACGGCCAGGAGGGTGGGTCGCTTTGTCAACCCGGACTCAGCAGGGCTCAGGAGCAAGGCTGATGCATTGACATTTCCAAGGGAGACTCTGAGAGAGGCCCGCCCCCCTGTCTGTGCCTCTGGGAAGTCCTGCTCTGGTCTAACTTGAATCCCTCCAGCAAGATTGCCCTGGGTCGGTGGGATTCCCAGCTGGCCAGGAGGAAGGCACCCTTCTGCCCTTTCTCCCAGTCCAGTCTCCTTGCAGACAGGGAAGGTGCTGCCCGCTGACTCAGAGGCTAATATCAGGCTCTTCTTAGCCATTCCTCTGCCTTTGCTCAGGATTCTCTACTGGAGGTGGCTGGTCACACCTGGGTTCCTGCCTTCAGCCCATGTCACCATAGCCCTTGTCCCTGTCGCATAGAGGAATCATTTGAATCCCTTCCCGCGGTTCTGTGGGCCTGCGGGCCTGGGTTGTCACCTCAAAGGGTTATCTTAGGGGAGTCACTTGCCTTCTCTGGGCCTCGGCTTCCCCAGGCCCCTCTCACTCCTCATCTCCAAGTTTAAGTCATTTAAATGGCAAGGGATCCAAGGAATGTTGTGGCTGGCATCCAGGTGGAGCAGGAGGGCCAAGTTGGGGTCAGTGAAGAACTTCCCAGGGAGCAGTTGGTATGTGGAGAGGTCTTAAGAAGTGATAGTTTGACTTTCAGTGAGAGCTGGGAGTGTGTGTGTGTGGAGGATTCAGGACACCTGACTTCTGAGGACCTGGCCATCTCATCGTCTCTGGTCCTGGTCCCACTTCTCTTCTCTTCCCTCCCACCAGGATGTACACATGGGAGTCGCATCTATCCAGTCTTGGGAACCTACTGGGACAACTGCACCAATGCATGGAGCAGGAGATGCCAAACCCATACCCACTGTATCAGGTATGTCGGGACTGACACATGATATTTGTTCTCAGAGGTAGTTTTTTTTTAAAGGTATTTTAGGCATCGTGGGCATATGGTTTCTGTAACAGCCAACTCTGCCTTTGTTTTTATGTTTCAACAAAGCCTTATATATAAAAGTGACCCATTCTCGGAAAATTTAGTGAATGAGAATTTAAAAGTTAAAGTATGCTTCATTTTATTATAGCTTTATTATCAAGCACATGTTAATAAAAATTAAGAATTTTTGGAATGTGGCAAGGGACTAAAATGGGAACCAAAATGATTCTATGTGTTAATTTGGTGTAATGGGTGAAAATTTGAGAGTTCAGTAAAGCAATTTTGAAGTTTAATTTGTCCATCGTTATCAGCTTTATAATTTTCAGTAAAAAATCAACCTTCTATCATTGAGTCTTGATGTTCCATCCTCAGGAAGAAGAGAGCCATAAATTTCCTTTGTGGTTTATAATTAGTGGTTATTGATCTAACTGTGAGGAGTCTTAATAGCTTCAATATCAATGCAGCATTTAATGGCCACAGGTATTGCTACAAATATCGTAATATAAATGTTGAGTCATTATAAAGACTCCTATCAGCATAAAATTTATATCAAAGTAAGCATAAAATGCTTGAGTTTATATGACAGGAAGGATGAGACCATTTAGAATGTGACAAACGAAAGCACCACCTATTAATTTTCTTTGGTGTATTCCTTTCATCCTAAACACTGAAGAATTTTTAATTTTTATAAGAACATGTTAATGCATCTACCCTTTTATAATTACTGGTAGTCATATATTTCATTTAATAACTTTCAGTTCTGCTACAGGTTTGATAGATCCAAAGACAAGAAAGTGAGAGTAATCGATCCTAGAAAACAAGAGAAGTATGCTTAGGACAAGTGCCTCCATCTCTGTAGCACCCCTGGTCAGTGGAGCCTCACCACGAATCCACAGAGCCTTGTACAAGTTTCTGCCTCCACCCTTCAGAGTTGTGCATTCCAGCATTGACATAGCCTTCTCTCTCACTTGGTGACCATTTTTAAGAAACAAATTTTTATCAGTTCACTGGAGTCTTCATGAAACCTAGATCAGCTAATCTAAACAGTTAATTGCAATCCTGGCTTAGTGATTGATCCCTGTCCCTTCTGTAACCATCATCAGAGCACCTCACAGAGATGCCACCGGCTCTCTTCAGCTCAGTGCCAGTTCCTGCCACCCACAGCCTCACCAGACAGGCATTTGGGACTTGAGCTGGGGTCTTGCATCAGCCCTGCTCTCATTTACCTTTCTCTGGGAGTGCTGATTCTTGGACAGTATTACTTAAGAGTTGGATAGTGGTTGTGGCTAGTGCTTCTCAAGCACCGAGGACTCCCTTCACAAAGTGCTTTCTCCACTAGAACCTTCTGCTTGTGCACTCTCAGTAGAGAGATTAAGGAACTGAACCATACAGCCTTCTGTACAATGAAATTGGTAGAAACTGAACAGGTTATCTTCCTGAGAAGCAGACATCTGGCAGTCCTTTCATGTTTTCTTTTTGCAGAACATGGGCATGGGTTGGCAGCAGGGCATAGTAGGCTTTTGAGTCATCAACTGGCATTCTTACTAACTAGCTGAGGGACCTTGGCCAAATTACATAGTGTCTCTGGTTTCTCATCTTCAGAGGAGACACACACGCATACCTGGTAATCTGAATGGGTTAAATTCAGGTATGAGCCCTCCTTTCTTGCAGTTTGAATATCCTATTGTTCTTGATCTCCCAGGAGAAGGAGAAAGCACACGAAGGAGCAAGACCCATGAGAGCCATCTTTCTGGCTGATGGGAATGTCTTTACCACTGGTTTCAGCCGCATGAGTGAGCGGCAGTTCTGAAAAGCCTGTGATGAACTGGTGGAAGAAATGGAGCATTATGGCCAGTGGTCTGGGGGCAAGCATCATGTAAGTTGTAATTTCACACAGGTGTATGTGGGTATTTAGAGAATTAGAGGGGATTATCTGTTTTGTCCTGTATCTCTGACTCCTAGACCTAAAAGGCTGTCAGGGGAACTCTGGTAGCATTTAATCTATCTGGTCTCATTTTCTCATTTACGTATATAATTACACTGGATGGTTTCCACAGTCGGTTTCTCCAGGCTGCAATATGTGTCTATTTTGTGGATTGGTCTTCTCCAGGGCCACTTTTATTCTCTGCACTTTCACAGTGAGCTATAGTGAAAGTACCCAAAGTTTATCTGGTTGACTGCCAAAGTTTTGTGTGTTTGTAAACTTTGGAAGAAAAATCTGTTTGAATGCCATTGGTGTAATTAGTTTTGTATTTATATTCAGTGTCAAAGACTTGGCAGGAAGTATTGCTGTTGGTGGTTCGGAATACTCTGGAATATTACTGCCTCTGCTCAACTTCATACCCCAGCTAGTTATCTGACCAGAGAGACGGAAGTTCAAAGTATGAAGAACGTGAAGTCAGCAGCTTGTAGGATGATAAAAAGCAATCATGGAAGGACTTTGGGTATCATAAAATTAAAGTGGGGAACATAGCAGGGAAAGCTTGTTGTCGGTGGTAGGGGATCCAAAGGCAGACAAGCAGAATCTTTGTCCATTGGGTAGCAAAGATTGCCTGAAGGGTTACTGTAAAAAACAATTTTTCAGGAGGCACAGGAAGGCTTTGGCGATGTTTTATTTACTTTATAGAGAGCTAACATGTACATTTTGTTTCATCATTGATACATGTTATCTAAAGTTTTGCAACTAAAGCAGATGGTACACATAATTGAACAACTGTTACTTTTATGGTCTATTATGATCTTGCGGTTGAAAAAAATTCCAAGGTAATATAAATGTGAATTGCATGTGGACCACACTTTATGACATCATTAATGCTGTTTCTAGGATAGCCGTATATCTGGTGGTTATGAAAATGTCCCGAAGATTTAAGGAGTTTAACCAACTTTTTTGGGTCTTGCACTGAGACTTTTGTCTTGGCTGTCAATATTCTGGACAGATTCTTGGCTCTTATGAAGGTATTTAAACATTTTTGTGTATGCATCTTTTATTTTTAAACCTAGTGCCCAGCACAGTGCCTGACATACAAGGGTTTGAGAAATGTTGGACAACTGAAAGGAACTATGTCATTACACAGAAACATTTTGTGATCTTTAGTGCCAGATTAAGAGACTACAGAATTAACTGTGT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Martes_flavigula 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Mephitis_mephitis 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Mustela_kathiah 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Phoca_vitulina 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Potos_flavus 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Procyon_lotor 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Ursus_arctos 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Ursus_thibetanus AGCCGCATGAGTGAGCGGCAGCTGGCTCTCTGGAACCCGGTATGCCCCTCGCAGCCTTTCCATTGGCTTACACTTGAGTTTCTGAGCAGGTCCTTGGGTGGGTAAATGGATTATAGGATTCTTAGTGTAGTTTTCTGAACCCCTACTGGTCTTGACATTCTCATCCTCACTGGAGACTTATTCTAAATGTATTATAAAATGCATTCTTAATACTCTCAAGTAGTCTATGTTGACTAGGTTTTTAAAAAGAAAGTATGAAGAACCAGTGTTTGGGACTTGGGAAACAAGTTCTGAACTTTATTTTATGATCAAATGTTTAAATCAAAATAGTCATGTTTAGGAAAATGTTAAGAGTAGCATAAGAAAAAATAACAAAACTGAATATACGCTATGATCTCAGTGTGTGTGTGGGAAGTAGACAAAAATGGTCATTGTTTTGCCACCCACCGGGCTGTGGGATTATGGAATATGGGATGATAGTCTTTCTGTAATGTATATTTACAATAAGAAAAATTTCTTTGGTGCCTGCCTGGCTCAGAGTGTGTGACTCTTGATCTCAGGGTCATGAGTTCAAGCCCTGCATTGGGCATGGAGCCTACTTTAAATAAACAAAGGAGAAGGGCTTTCTTATCTTCATCATGGAATCACACTGATAGCAGTTTTCAGTGGGTTGGGAAATTGGTATTTACTGTATGAGTGTTATATGTGCATTGTTCAACCTTCATTATTCTAGGAGATTGCTCACATAATTAGGGATAAAAGAATGATTCACCTTGTGAAAATATATATTTGTATTTTTTTAGAAAAATATGCAGGAACCAATCGCTCTTCATGAAATGGACACTAGCAATGGGGTGGACTTCTGGGACTTCTGCCTCGGCGTGCCACCCCCCTTTCCCAGGTGGGCACCAGACGGCCAAGAGGGTGGGTCGTTTAGTCAGCCCAGACTCAGCAGGGCTCAGAAGCAAGGCTGATGCATTGACATTTCCAAGGGAGGCTCTGGGAGAGACCCGCCCCACTGTCTGCACCTCTGGGAAGTCCCGCTCTGGTCTAACTTGAATCTCTCCAGCAAGACTGTCCTCGGTCAGTGGGATTCCCAGCTGGCCAGGAGAAAGGCAGCCTCCTGCCCTTTCTCCCAGTCCTGTCTCAATGCAGACAGGGAAGGTGCTGCCCGCTGACTCACAGGCTGATATCAGGCTCATCTTAGCCATTCCTCTGCCTTTGCTCAGGATTCTTTACGGGAGGTGGCTGGTCACGCCTGGGTTCCTGCTTTCAGCCGGTGTCACCATTGCCCTTGTCCCTGTCCGACAGAGGAATCATTTGAATCCCTTCCCCCAGTTCTGCAGGCCTACGGGCCTGGGTTGTCATCCCAAAGTGTTATCTTACGGAAGTCACTTGCCTTCTCTGGGCCTCGGCTTCCCCATGCCCCTTCCACTCCCCATCTCCAAGTTTAAGTCATTTAAATGGCAAAGGATCCAGGGAATGTTGTGGCTGGCGTCCAAGTGAAGCAAGAGGGCCAAGTTGGGGTCACTGAAGAACTTCCCAGGTAGCAGTTGGTATGTGGAGAGGACTTAAGAAGTTATAGTTTGACTTTCAGTGAGGGCTGGGCGTGTGTGTGTTTGGAGAATTCGGGACACCTGACTTCTGAGGACCTGGCCCTCTCGTCTTCTCTGGTCTTGGTTCCACTTCTCTTCTCTTCCCTCCCCCCAGGATGTACGCATGGGACTCGCATCTATCCAGTCTTGGGAACCTACTGGGACAACTG????????????????????????????????????????????????GTATGTTGGGACAGGCACATGATATTTGTTCTCAGGGGTTGTTTTTCTTTAAAGATATTTTACATTTTGTGGGTATACGTTCTCTGTCACAGCCAGCTCTGTCATTGTTTTTGTGTTTCAACAAAACCTTATTTACAAAAACGACCTGTTCTCGGAAAATTTAGTGAATGAGCATTTAAAGATTAAAGTGTGTTTCATTTTATTGTGGCTTTATTATCAAGCACATGTTAATAAAAATTAAGAATTTTTGGAATATGGTAAGGGACTAAAATGGGACCCAAAGTGATTCTAAGTGTTAATTTGGTCTTATGGGTGAGAATTTGAGAGTTCAGTAAAGCAGTTTTGAAGTTTAATTTGTCCATTGTTACCAGCTTTATAATTTTCTTTAAAAAATCAGCCTTCTATCACTGAGTCTTGATGTTCCATCCTCAGGAAGAAGAGAGCCATAAATTTCCTTTGTGGCTTGTAATTAGTTGTTATTGATTTAACTGTGATGAGTCTTAATAGCTTCAGTATCAGTGCAGCATTTAATGGCCACAGGTATTGCTGCAAATATTGTAATATGAATGTTGAGTCATTATAAAGACTCCTCTCAGCATAAAATTTTTATCAAAGTAAGCATAAAATGCTTGAGTGTATATGACAGGGAGGATGAGACTGTTTAGAATATTACAGACAAAAGCACCACCTACTGATTTTCTTTGGTGTATTCCCTTCATCCTGAATTCTTAAGAATTTTTAATTTCTCTAGGAACATGTTAATGCATCTACCCTGATATAATTACTGATAGTCATATCTTTCCTTTAATAACT??????????????????????????TCCAAAGACAAGAAAGTGAGAGTAATCGATCCTAGGAAACAAGAGAAGTATGCTTAGGACAAAAGCCCCTGTCTTTGTAGCACTCCTGGTCAGTGGAGCCTCACGGTGACTCCGCAGAGCCTTGTACAGGCTTCTGCCTCCACCCTTCAGAGCTGTGCATTCCAGCACTTACACAATCTTATCTCTCACTTGGTGACCATTTTTAAGAAACAAATTCTCATCAGTTCACCAGAGTCCTTGAGAAGTCTAGATCAGCTAACCTAAACAGTTAACTGTATTCCTGGCTTAGTGACTGATCCCTGCCCCTTCTGCAACCATCGTCAGAGTACCTCACAGAGAAGCCGTAGGTTCTCTTCAGCTCAGTGGCGGTTTCTGCCACTCAAGGCCTCACCAGATGGGCATTTGGAGCTGGAGCTGGGGTCTTGCATCAGCCCTGCTCTCACATGCCTCTCTCTGGGGGTGCTGGTTCTTTGGCAGTTTTACTTCAGAGTTGAGTAGCGGTCATGACTAGTGCTTATTGAGCACTGGGGACTTCCTGCACAAAGTGCTTTCAACACTAGAATCTTCTATTAGTGCACTCTCAATGAGGAAATTAAGGAACTGAACTAGACTTCCTTCTGTCCAGTGAATTTGGTAGAAACCATACAGGTTATCCTCTTGAGAAACAGACATCTGGCAGTCCTTTCATGTTTTATTTTTGCAGAGCATGGACTTGGGTTGGCAGCAGGACATGGTAGGCTTTTGAGTTAACTCCTGGCATTCTTGCTACCTAGCTGAGGGACCTTGGCCAGATTACATTGTCTCTTTGTTTTCTCATCTTGGGAGGAGACACGTGTGCACACCTGGTAATTTGAATGGGTTGGATTCAGGTATGAGCCCCCCTTTTTTGCAGTTTGAATATCCTATTGTTCTTGGTCCCCCAGGAGAAGGAGAAAGCACATGAAGGAGCAAGACCCATGAGAGCCATCTTTCTGGCTGACGGAAATGTCTTTACCACTGGTTTCAGCCGCATGAGTGAGCGGCAGTTCTGAAAAGCCTGTGATGAATTGGTGGAAGAAATGGAGCATTACGGCCAGTGGTCTGGGGGGAAACATCATGTAAGTGGTAATTTCACACAAGTGAATGTGGATATTTAGTCACTTAGAGGGGATTATCTCTTTTGTCATGTATCTCTGACTCCTAGACCTAAAAGGCTGTCAGGAGAACTCTGGTAGTATTTAATCTATCTGGCCTCAGGTTCTCATTTATGTATGTAATTACACTGGATGGTTTCTAAAGTCAGTGTCTCCAGGCTGTAATATTTGTCTATTCTGTGGATTGGTCTTCTCCAGGGCCACTTGTATTCTCTGCATTTTCACAGTGAGCTATAGTGAAAGGACCCAAAGTTTATTTGGTTGACTGCCAAAGCTTTGTGTGTGTGTAAACATTGGAAGAAGAATCTGTTTGAATGCCATTGGTGTAATTAGTTTTGCATTTATATTCGGTGTCAAAGACTTGGCAGGAAGTATTGCTGTTGGTGGTTCGGAATACTCTGGAATATTACTGTCTCTGCTCAACTTCATACCCCAGCTAGTTAGCTGACAAGAGAGACAGAAGTTCAAAGTTTGAAGAACTTGAAGTCAGCAAGTTGTAGAATAATAAAAAGCAATCATGGAAGGACTTTGGTTATCATAAAATTGAAGTGGGGAACATAGCAAGGAAAGCTTGTTTTCAGTGGTAGGGGATACAAAGGCAGACAAGCAGAATCTTTGTCCGTCAAGTAGCTCAGACTGCCTGAAGGGTTACTGTAAAAAACAATTTTTTAGGAGGCATGGGAGGGCTTTGGAAATATTTTATTTACTTTATAGAGACCTCACATATATGCTTTGCTTCATCATTGATATATGTTATCTAAAGTTTTGTAATTAAAGCAGATGGTGCACATAATTGAACAACTGTTATTTTTGTTGTCTGTTGTGATCTTGTGGTTGAAAAAAATTCTAAGGTAATATAAATGTGAATTGCATGTGGACCACACTTTATGACATCATGAATGCTGTTTCTAGGATAGCCGTATATCTGGTGGTTATGAAAATGTCCCGAAGATTTAAGGAGTTTAACCAACTTTTTTGGATCTTGCACTGAAACTTTTGTCTTGGCTGTCAATATTTTAGATAGATTCTTGGCTCTTATGAAGGTATTTAATCATTTTTGTATATGCATCTTCTATTTCTAAACCTAGTGCCCAGCACAGTGCCTGGCATACAAGGGTTCGATAAATGTTTGACAAGTGAATGTAATTATGTCATTGCATAGAAACATTTTGTGATCTTCAGTGCCAGAGTGAGAGACTACAGAATTAACTGTGT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Zalophus_californianus AGCCGCATGAGTGAGCGGCAGCTGGCTCTCTGGAATCCGGTACGCCCCTCCCAGCCTTTCCACTGGCTTACACTTGAGTTTCTGAGCAGGTCTTTGGGTGGGTAAATGTATTAAAGGATTCTTAGTGTAGTTTTCTGAACTCTTGCTGGTCTTGACGTTCTTACCCTCACTGGAGACTTATTTTAAATGTATTACAAAATGCATTCTTGATACTCTCAAGTAGTCTGTGTTGACTACGTTTTTAAAAAGAATGCACAAAGAACTAGTGTTTAGGACTTGGGAAACAAGTTCTGAACTTTATTTCATGATCAAATGTTTAAATCAAAATAGTCATGCTTAGGAAGATGTTGAGAATAGCATAAGAAAAAATAACAAAACTGAATATATGGTATGATCTCAACCTGTGTGTGGGAAGTAGACAAAAGCGGTCATTGTTTTGCCACCCACTGGACTGTGGGATTATGGGATATGGGATGATAGTCTTTCTGTAATGTATATTTACAATAAGAAACATTTCTTTGGCGCCTGCCTGGCTCAGAGTGTGTGACTCTTGATCTCAGGGTCATGAGTTCAAACCCTGCATTGAGCGTGGAGCCTACTTTAAATAAACAAAGGGGAAGGGCTGTCTCATCTTTGTCATGGAATCACAGTGATGACAGTTTTCATTGGTTCAGAAAATTGGTATTTACTGTATGAATATTATATGTGCATTGTTCAACTTTCATTACTCTAGGAAATTGCTCACATAATTAGGGATAAAAGAATGATTCACCTTGTAAAAATATATATTTGTATTTTTTTAGAAAAATATGCAGGAACCAATCGCTCTTCATGAAATGGACACTAGCAATGGGGTGGACTTCTGGGACTTCTGCCTCGGCGTGCCACCCCCCTTCCCCAGGTGGGCACCAGACGGCCAGGAGGGTGGGTCGCTTTGTCAGCCCAGACCCAGCGGGGCTCAGGAGCAAGGCTGATGCACTGACATTTCCAGGGGAGGCTCTGGGAGAGACCCGCCCCACGGTCTGTGCCTCTGGGAAGTCCCGCTCTGGTCTAACCTGAATCTTTCCAGCAAGACTGTCCTTGATCAGTGGGATTCCCAGCTGGCCAGGAGAAAGGCAGCCTCCTGCCCTTTCTCCCAGTCCTGTCTCCATGCAGACCAGGAAGGCGCTGCCCGCTGACTCACAGGCTGATATCAGGCTCATCTCAGCCATTCCTCTGCCTTTGCTCACGATTCTTTACCGGAGGTGGCGCGTCACACCTGGGTTTCTGCTTTCAGCCCGTGTCACCATTGCCCTTGTCCCTGTCCCATACAGGAATCATTTGAATCCCTTCCCCCAGTTCTGTGGGCCTGTGGGCCTTGGTTGTCATCCCAAAGTGTTATCTTAGGGGAGTCACTTGCCTTCTCTGGGCCTCGGCTTCCCCATGCCCCTCCCACTCCCCATCTCCAAGTTTAAGTCATTTAAATAGCAAAGGCTCCAAGGAATGTTGTGGCTGGCATCCAAGTGAAACAAGAGGGCCAAGCTGGGGTCACTGAAGAACTTCCCAGGTAGCAATTGGTATGTGGAGAGGTCTTAAGTAGTTATAGTTTGACTTTCAGTGAGGGTTCAGCGTGTGTGTGTTTGGAGGATTCGGGACACCTGACTTCTGAGGACCTGGCCCTCTCATCGTCTCTGGTCCTGGTTCCACTTCTCTTCTCTTCCCTGCCCCCAGGATGTACGCATGGGAGTCGCATCTATCCGGTCTTGGGAACCTACTGGGACAACTGCACCAATGCATGGAGCAGGAGATGCCAAACCCATACCGACTGTATCAGGTATGTTGGGACAGGCACATGATATTTGTTCCTAGGGGTTGTTTTTCTTGAAAGGTATTTTAGGCTTTGTGGGCATACATTCTCTGTCACAGCCAGCTCTGCCATTGTTTTTGTGTTTCAACGAAACCTTATTTACAAAAACGACACGTTCTCGGAAAATTTAGTGAATGAGAATTTAAAGATTAAAGTGTGTTTCATTTTATTATAGCTTTCTTATCAAGCACATGTTAATAAAAATTAAGAATTTCTGGACTGTGGTAAAGGACTAAAATGGGAACCAAAGTGATTCTAAGTGTTAATTTGCTATTATGGGCGAGAATTTGAGAGTTCAGTAAAGCAATTTTGAAGTTGAATTTGTCCATTGTTACCAGCTTTATAATTTTCAGTAAAAAATCAGCCTTCTGTCACTGAGTCTTGATGTTCCATCCTCAGGAAGAAGAGAGCCATAAATTTCCTTTGTGGCTTGTAATTAGTTGTTATTGATTTAACTGTGATGAGTCTTAATAGCTTCAGTATCAATGCAGCGTTTAATGGCCACAGGTATTGCTACAAATACTGTAATATAAATGTTGAGTCATTATAAAGACTCCTATCAGCATAAAATTTTTATCAAAGTAAGCATAAAATGCTTGAGTGTATATGACAGGAAGGATGAGACCATTTAGAATATTACAAACGAAAGCACAACCTCTTCATTTTCTTTGCTACCTTCCCTTCACCCTAAATACTGAAGAATTTTTAATTTCTTTAGGAACATGTTAATGCATCTACCCTGATACAATGACTGATAGTTGTATCTTTCCTTTAATAACTTTCAGTTCTGCTACAGGTTTGATAGATCCAAAGACAAGAAAGTGAGAGTAATCGATCCTAGGAAACAAGAGAAGTATGCTTAGGACAAAACGCCCCATCTTTGTAGCACCCCTGGTCAGTGGAGCCTCACCGTGAATCTGCAGAGCCTCGTACAGGCTTCTGCCTCCACTCTTCAGAGTTGTGCATTCCAGCATTTACACAGTCTTATCTCTCACTTGGGGACCATTTATAAGAAATGAATTTTCATCAATTCACTAGAGTCCTTGAGAAGTCTAGATCAGCTAACCTAAACTGTTAACTGCATTCCTGGCTTAGTGATTGATCCCTGCCTCTTCTGCAGCCATCATCAGAGTACCTCACAGAGATGCCACAGGTTCTCTTCAGTTCCATGTCAGTTTCTGCCGCTCAAGGCCTCACCAGATGGGCATTTGGGACTTGAGCTGGGGTCTTGCATCAGCCCCGCTCTCATTTGCCTTTCTCTGGGAGTGCTGGTTTTTCGGCAGGTCTGCTTAAGAGTTGGGTAGCGATCGTGACTGGTGCCTATTGAGCACTGGGGACTTCCTGCGCAGAGGGCTTTCTCCACTAGAACCTTCAACTAGTGCACTCTCAATGAAGAGATTAAGGAACTGAACTAGACTTCCTCCTGTCCAATGAATTTGGTAGAAACCGTACAGGTTATCCTCTTGAGAAACAGACATCTGGCAGTCCTTTCGTGTTTTATTTTTGCAGAGCATGGACTTGGATTGGCAGTAGGGCATGGTAGGCTTTTGAGTCAACTCCTGGCATTCTTGCTAAATAGCTAAGGGACCTTGGCCAAATTACACAGTCTCTTTGTTTTCTCATTTTGGGAGGAGACACACACGCACGTCTGGTAATCTGGATGGGTTGGATTCAGGTATGAGCCCCCCTTTATTGTAGTTTGAATATCCTATGATTCTTGGTCCCCCAGGAAAAGGAGAAAGCACATGAAGGAGCAAGACCTATGAGAGCCATCTTTCTGGCTGATGGGAATGTCTTTACCACTGGTTTCAGCCGCATGAGTGAGCGGCAG????????????????????????????????????????ATTATGGCCAGTGGTCTGGGGGGAAACATCATGTAAGTGGTAATTTCACACAAGTGTATGTGGGTATTTAGACAATTAAAGGGGATTATCTGTTTTGTCATGCATCTCTGACTCCTAAACCTAAAAGGCTGTTAGGAGCACTCTGGTAGCATTTAATCTGTCTGGCCTCAGGTTCTCATTTATGTATGTAATTACACTGGATGGTTTCTAAAGTCAGTGTCTCCACGCTGTAATACATGTCTATTCTGTGGATTGGTCTTCTCCAGGGCCACTTTTATTCTCTGCATTTTCACAGTGAGCTATAGTGAAAGTACCCAAAGTTTATCTGGTTGACTGCCAAAGCTGTGTGTGTGTGTAAACATTGGAAGAAAAATCTGTTTGAATGCCATTGGTGTAATTAGTTTTGCATTTATATTCAGTTTCAAAAACTTGGCAGGAAGTATTGCTGTTGGTGGTTCGGAATACTCTGGAATATTACTGTCTCTGCTCAATTTCATACCCCAGCTAGTTAGCTGACCAGAGAGACAGAAGTTCAAAGTATGAAGAACTTGAAGTCAGCAGGTTGTAGGATCATAAAAAGCAATCATGGAAGGACTTTGGGTATCATAAAATTCAAGTGGGGAACATAGCAGGGAAAGCTTGTTTTCAGTGGTAGGGGATCCAAAGGCAGACAAGCAGAATCTTTGTCCGTCAAGTAGCTAAGACTGCCTGAAGGGTTACTGTAAAACACAATTTTTTAGGAGGAATGGGAGGGCTTTGGAAATGTTTTATTTACTTTATAGAGACCTCACATATATACTTTGCTGCATTATTGATACATGTTATCTAAAGTTTTGCAATTAAAGCAGATGGTATACATAATTGAACAACTGTTATTTTTATTGTCTATTATGA?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GAAGATTTAAGGAGTTTAACCAACTTTTTTGGATCTTGCACTGAAACTTTTGTCCTGGCTGTCAATATTTTAGATAGATTCTTGGCTCTTATGAAGGTATGTAATCATTTTTGTATATGCATCTTTTATTTCTAAACCTAGTGCCCAGCACGGTGCCTAACATACAAGGGTTAGATAAATGTTTGACAAGTGAATGTAATTATGTCACTACATATAAACATTTTGTGATTTTCAGTGCCAGAGTGAGAGACTACAGAATTAACTGTGT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AGCCGCATGAGTGAGCGGCAGCTGGCTCTCTGGAATCCGGTATGCCCC-TCCCAGCCTTTCCATTGGCTTACACTTGAGCTTTCTCTCTTTTCTGGGCAGGTCCTTGGTTGGGTAAATGGATTATAGGATCCTTAGTGTAGTTTTCTGAACCCCTACTGGTCTTAAATTGGATGTGACGTTCTCATCCTCACTGGAGACTTATTCTAAATGTATTATAAAAATGCATTCTTAATAGTCTCAAGTAGTCTATGTTGACTAGGTTTTTTAAAAAGAAAGTATGAAGAAGCCAGTGTTTGGGACTTGGGAAACAAGTTCTTAACTTTATTTTATGAAGAATATGATCAAATATTTAAATCAAAATAGTCATGTTCAGGAAAATGTTAAGAGTAGCATAAGAAAAAAATAACAAAACTGAATATACGGTATGATCTCAGTGTGTGTGTT--GGAAGTAGACAAAAACGGTCATTGTTTTTGCCACCCACCGGGCTGTGGGATTATGGAATATGGGATGATGTTTATAGTCTTTCTGTAACTTTAACAAAGAGTGTATATTTACAATAAGAAAAATTTCTTTTAAAAGAGAAAATAGGGTACCTGCCTGGCTCAGTCAGTAGTGTGTGACTCTTGATCTCAGGGTCATGAGTTCAAGCCCTGCATTGGGCATGGAGCCTACTTTAAATAAATACATTTGAAAAAAGTCACAAAGGAGAAGGGCTGTCTTTCTCATCTTTGTCATGGAATCACACTGATATGTACATTGATGAGGTTTTCAAACTGACAGTTTTCAGTGGGTTGGGAAA--------------------TTGGTATTTACGTGTATGAATATTATATGTGCATTGTTCAACCTTTCATTATTTTAGGAGATTGCTCACATAATTAGGGATAAAAGAATGATTCACCTTGTGAAAAAGTGTGTGT----------ATATATATTTGTATTTTTTTAGAAAAATATGCAGGAACCAATCGCTCTTCATGAAATGGACACTAGCAATGGGGTG?????????????????????????TGCCACCCCCCTTTCCC-CCATCCAAGGTGGGCACCAGACGGCCAGGAGGGTGGGTCGCTTAGTCAGCCCCAGACTCAACAGGGCTCAGGAGCAAGGCTGATGCATTGACATTTCCAAGGGAGGCTTTGTAGAATCTGGGAGAGACCCTGCCCCACTGTCTGCACCTCTGGGAAGTCCCGCTCTGGTCTAACTTGAATCTCTCCAGCAAGACTGAAAAAGAGAAGACCCTTGGTCAGTGGAATTCCCAGCTGGCCCAGGAGAAAGGCAGCCTCCTGCCCTTTCTCCCTGTCCTGTCTCAGTGCCAGACAGGGAAGGTGCTGGCCCCGCCCGCTGACTCACCCGCAGGCTGATAAAGCCCTCAGTCAGGCTCATCCTAGCCATTCCTCTGCCTTTGCTCAGGATTCTCTTACAGGAGGTGGCTGGTCACACCTGGG--------GCGAATCTGTTCCTGCTTTCAGCGGGTGTCACCAT-GTTTCCC-TGCCCTTGTCCCTGTCCGACAGAGGAATCATTTGAATCCCTTCCCCCAGTTCTGCGGGCCTGCGGG--------------CCCAGGTTGTCATCCTAAAGTGCTGTGTTATCTTAGGGAAGTCACTTGCCTTCTCTGGGCCTCGGCTTCCCCATGCCCTTCCCACTCCCCATCTCCAAGTTTCAAGTCATTTAAATCACAAAGGATCCAAGGAATGTTGTGGCTGGCATCCAAGTGAAGCAAGAGGGATCCAAGTTGGGGTCACTGAAGAACTTCCCAGGTAGCAGTTGGTATGTGGAGAGGTCTTAAGAAGTTATAGTTTGACTTTAGTTTCAGTGAGGGCTGGGCC-------------GTGTGTGTGTTTGGGAGAATTCGGGACACCTGACTTCTGAGGACCTGGCCCTCTCAGCCCGTCTTCTCTGGTCTTGGTTCCACTTCTCTTCT---CTTCCCTCCCCCCAGGATGTACGCA??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TGTATCAGGTATGTTGGGACAGGCACATGGTATTTGTTCTCAGGGGTTAGTAACTATTTTCTTTAAAGAAC--GTTGGTAAATATTTTAGGGTTTGTGGGTATACGTTCTCTGTCACAGCCAGCTCTGTCATTGTTGCATGGAAACAGCCACAGACTATACATAAATAAATGCCTGTTTGTGTTTCAACAAAACCTTATTTACAAAAAC----AGCAGTTCAGGTTTGGCCTGTAGGACGTCATTCACCAGCCTCTGATAAAAGCGGACTTGTTCTCGTGGGGAAAATTTAGTGAATGAGCATTTA-----AAGATTAAAGTGTGTTTCATTTTATTGTGGCTTTATTATCAAGCACATGGTGTATTAATAAAAATTAAGAATTTTTGGAATATGGTAAGGGACTAGGAAATGGGACCCAAAGATGTGATTCTAAGTGTTAATTTGGTCTTATGGGGAATACTCTGAGAATTTGAGAGAATAATCTTTCAGTAAAGCAGTTTTGCAGTTTAATATTATCCATTGTTATCCAGATTATAAAATTTTTAATAGGTAAATAGAGACCAGCTTTATAATTTTCATT-AAAAAAATTAGCCTTCTATCACTGAGTCATTTGATGTTCCATCTTCAGGAAGGAAGAGAGCCATAAATTTCCTTTTGTGGCTTGTAATTAGTTGGTATTGATTTAACTGAAATGACATATGATGAGTCTTAATAGCTTCAGTATCAGTGCAGCATTGTAATGGCCACAGGTATTGCTACAAATATTGTAATATGATGAATGTTGAGTCATTATAAAGACTCCTCT--CAGCATAAAATTGAACATTTTTTTTATCAAAGTAAGCATAAAATGCTTGAGTGTATATGACAGGTGCATGGGAGGATGAGACTGTTTAGAATATTACAGACAAAAGTACCACCTACTGATTTTCTTGTTGGTGTATTCCCTTCATCCTAAATTCTGAAGAATTTTTAATTTCTCTAGGAACATGTTAATGCATCTACCCTGATATAATTACTGATAGTCATATCTTTCC--TGATTAGTTCTTTCTCTTTTAGTAACTTGCTAGGATT-CTC????????????????????????????????TCCAAAGACAAGAAAGTGAGAGTAATCGATCCTAGAAAACAAGAGATTGTTGCTGTGAGTATGCTTAGGACAAAACCCCCTGTCTTTGTAGCACTTCAGTGAGTGTGAACTTTGCTTGTGAAGGCAGGCTGTAGAGGCCT-GCTCCTGGTCAGCGGAGCCTCATTGTATGCAGATGCTGGACCGTGAGTCCGCAGAGCCTTGTACAGGCTTCTGCCTCCCAGCCATCCTTCAGAGCTGTGCATTCCAGCACTTACACAAATCTTATCTCTCGCCTGGTGACCATTTTTCACAAAGAAACAAAGTTCTCATCAGTTCACCAGAGTCCTTGAGAATTTACAAGTCTAGATCAGCTAACCTAAACAGTTAACTGCATTCCTGGCTTAGTGATTGATCCCTGCCCCTTCCTGCAACCATCGTCAGAGTACCTCACAGAGAAGCCATAGGTTGTCTCTTCAGCTCAGTGGCTTGGTTTCTGCCACTCAGAATAGGCCTCACCAGGTCACCCATCATGACAGAAGATGGGCATTTGGAACTGGAGCTGGGGTTGAAACGGTAGGTGCTGGATCCCAGAATGTCTTGCATCAGGCCTGCTCTCTGGTCCT-CATATGCCTCTCTCTGGGATGTGCTGGTTCTTTGGCAGTTTTACTTCTTCAGAGTTGGGTAGCGGTCATGACTAGGGCTTACTGAGCACTGAGGACTTCCTGCACAAAGTGCTTTCTCCACTAGAATCTTCCAGGGTTCACTATTAGTGCACTCTCAATGAGGAGATTAAGGAAGGGGTTAACTGAACTAGACTTCCTTCTGTCCAGTGAATTTGGTAGAAACCATAGGGTATATCCAACTTTCAGGTTATCCTCTTGAGAAACAGACATCTGGCAGAGTCCTTTCATGTTTTTTATTTTTGCAGAACATGGACTTGGGTTGGCAGCAGGGCATGGTAAAGGATTGAGGCTTTTGAGTTAACTCTTGGCATTCCTGCTTGCTAACTAGCTGAGGGACCTTGGCCAGATTACATAGTCTCTTTGTTTTCTCATCTTGGGAGGAGACACACACACACACGTGTGCACGCCTGGGAATCTGAATGGCATGGGGCGTGGGTTGAATTCAGTGTATGAGCCCCCCCACTCACCTCACCCCACCCCACCTCACCTTTTTTGCAGTTTGAATATAATATGCCTGTTGTTCTTGGTCCCCCAGGAGAAGGAGAAAGCACATGAAGGAGCAAGACCAATGAGAGCCATCTTTCTGGCTGACGGGAATGTCTTTACCACTG????????????????????????????????????????????????????????????????AGCATTACGGCCAGTGGTCTGGGGGGAAACATCATGTAAGTGGTAACTTCACACAA-----------GTGAATGTGGGTTAGAAGCAGGGGTAGATTATTTAGTCAC-TTAGAGGGGATTTATCTCTTTTGTCATGTATCTCTGACTCCTAGACCTAA---------------AAGCCTGTCAGGAGAACTCTGGTAGCATTTAATCTATCTGGCCTCAGGTTCTCATTTATGTATGTAATTACACTGGATGGTTTCTAAAAGTCAGTGTCTCCAGGCTGGAATGGTAAGGTAATATTTGTCTATTTATTCTGTGGTATTGGTGTTCTCCAGGGCCACTTTTTATTCTCTGCATTTTCACAGTGAGCTATAGTGAAAGTACCAAGACAAAGTTTATTTGGTTGACTGCCAAAGCTTTGTGTGTGTGTAAACATTGGAAGAAGGA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Ailurus_fulgens 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Callorhinus_ursinus 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Canis_lupus 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Canis_lupus_familiaris AGCCGCATGAGTGAGCGGCAGCTGGCTCTCTGGAATCCGGTATGCCCCTTCCCAGCCTTTCCACAGGCTTACACTTGAGCTTTCTCTCTTTTCTGAGCAGGTCTTTGGGTGGGTAGGTAGATTATAGGATTCTTAGTGTAGTTTTCTGAACTCCTGCTTGACTTGAATTGGATGTGACACTCTCGTCGTCACTGGAGACTTACTTTAAATGTATTAGAAAAATGCATTCTTGATACTCTCAAATACTCTGTGTTGACTGTATATTTTTAAAAGACTGCACGAAGAAGCCAGTGTTTGGGACTTGGGAAACAAGTTCTGAACTTTGTATTATAAAGAATATGATCAAATGTTAAAGTCACAATAGTCACGCTTAGGAATATGTTGAGAATAGCATAAGTAAAAAATAACAAAACTGAATATATGGTATGATCTGTGTGTGTGTGTGTGGTAAGTAGACCAAAACGGTCATTGTTTTTGCCATCCACTGGACTGTGGGATTATGGAATATGGGATGGTTTTTATAGTCTTTCTGTAACTTTAACAAAGAGTGTATTTTTATAATAAGAAAGATTTCTTTAAAAAAAGAAAATAAGGTTTCTCCCTGGCTCAGTTGGTAGTACATGGCTCTTGGTCTCAGGCTCATAAATTCAACCCCTGCATTGGGTGTGGAGCCTATTTTAAATACATAAGTTTAAACAAAATCATAAAGGAGAAGAG----CTGTCTCATTTTTGTCATGGAATCACACTGATGTATACATTGATGAGGTTGTCAAATTGATAGTTTTCAATGGGTTGGAAAATTGATATTTACATGTATGAATTGGTATTTACTTGTATAAGTATTATATATGCATTGTTCAACCTTTCATTATTCTAGGAAATTGCTCCCATAATTATGTATGAAAGAATGATTCATCTTGTAAATGTGTGTGTATATGCAAATATATATTTTTTTGTATTTTTTTAGAAAAATATGCAGGAACCAATCGCTCTTCATGAAATGGACACTAGCAATGGGGTGGACTTCTGGGACTTCTGCCTCGGCGTGCCACCCCCTTTTCCCCCCATCCAAGGTGGGCACCAGACGGCCAGGAGGGTGGGTCGCTTTGTCAACC-CGGACTCAGCAGGGCTCAGGAGCAAGGCTGATGCATTGACATTTCCAAGGGAGACTTTGTAGACTCTGAGAGAGGCCCTGCCCCCCTGTCTGTGCCTCTGGGAAGTCCTGCTCTGGTCTAACTTGAATCCCTCCAGCAAGATTGAAAAAGAGAAGACCCTGGGTCGGTGGGATTCCCAGCTGGCTCAGGAGGAAGGCACCCTTCTGCCCTTTCTCCCAGTCCAGTCTCCTTGCCAGACAGGGAAGGTGCTGGCCCCGCCCGCTGACTCACCTGGAGGCTAATAAAGGCTTCAGTCAGGCTCTTCTTAGCCATTCCTCTGCCTTTGCTCAGGATTCT-CTACTGGAGGTGGCTGGTCACACCTGGGAGATGAGGATGAATCTGTTCCTGCCTTCAGCCCATGTCACCATCTTTTCCCCAGCCCTTGTCCCTGTCGCATAGAGGAATCATTTGAATCCCTTCCCGCGGTTCTGTGGGCCTGCGGGTTAGAGACTGGATACCTGGGTTGTCACCTCAAAGGGCCGTGTTATCTTAGGGGAGTCACTTGCCTTCTCTGGGCCTCGGCTTCCCCAGGCCCCTCTCACTCCTCATCTCCAAGTTTCAAGTCATTTAAATGGCAAGGGATCCAAGGAATGTTGTGGCTGGCATCCAGGTGGAGCAGGAGGGATCCAAGTTGGGGTCAGTGAAGAACTTCCCAGGGAGCAGTTGGTATGTGGAGAGGTCTTAAGAAGTGATAGTTTGACTTTAGTTTCAGTGAGAGCTGGGACATGCGTGGTGTGTGTGTGTGTGTGTAGGAGGATTCAGGACACCTGACTTCTGAGGACCTGGCCATCTCAGCCTATCGTCTCTGGTCCTGGTCCCACTTCTCTTCTCCTCTTCCCTCCCACCAGGATGTACACATGGGAGTCGCATCTATCCAGTCTTGGGAACCTACTGGGACAACTGCACCAATGCATGGAGCAGGAGATGCCAAACCCATACCCACTTGTATCAGGTATGTCGGGACTGACACATGATATTTGTTCTCAGAGGTAGGTAACCTTTTTTTTTAAAGGACCGGTTAGTAAATATTTTAGGCATCGTGGGCATATGGTTTCTGTAACAGCCAACTCTGCCTTTGTTGCATGAAAACAGCCGTAGACTATATATAAATAAATGAC--TTTATGTTTCAACAAAGCCTTATATATAAAAGTGGAGAGCAGTTCAAATTTGGCCTGTGGGACATAATTCGCCAGCCTCTTCTAAGAGCTGACCCATTCTCTT--GGAAAATTTAGTGAATGAGAATTTACTTTAAAAGTTAAAGTATGCTTCATTTTATTATAGCTTTATTATCAAGCACATGGTATATTAATAAAAATTAAGAATTTTTGGAATGTGGCAAGGGACTAAGAAATGGGAACCAAAAATGTGATTCTATGTGTTAATTTGGTGTAATGGGGAATACTCTGAAAATTTGAGAGAATAATCTTTCAGTAAAGCAATTTTGAAGTTTAATTTTGTCCATCGTTACCCAGATTATAAAATTTCTAATAGGTAGATAGAGATCAGCTTTATAATTTTCAGTT-AAAAAATCAACCTTCTATCATTGAGTCATTTGATGTTCCATCCTCAGGAAGAAAGAGAGCCATAAATTTCCTTTTGTGGTTTATAATTAGTGGTTATTGATCTAACTGAAACGACATATGAGGAGTCTTAATAGCTTCAATATCAATGCAGCATTGTAATGGCCACAGGTATTGCTACAAATATCGTAATATGATAAATGTTGAGTCATTATAAAGACTCCTATCACAGCATAAAATT-AGCATTTTATATATCAAAGTAAGCATAAAATGCTTGAGTTTATATGACAGGTGCATGGAAGGATGAGACCATTTAGAATGTGACAAACGAAAGCACCACCTATTAATTTTCTTTTTGGTGTATTCCTTTCATCCTAAACACTGAAGAATTTTTAATTTTTATAAGAACATGTTAATGCATCTACCCTTTTATAATTACTGGTAGTCATATATTTCATGTGGT---TTTTTTCTCTTTTAATAACTCGCTAGGACTTCTTTATCATTTCAGTTCTGCTACAGGTTTGATAGATCCAAAGACAAGAAAGTGAGAGTAATCGATCCTAGAAAACAAGAGATCGTTGCTGTAAGTATGCTTAGGACAAGTGCCTCCATCTCTGTAGCACTTCAGTGAGTGTGAACTTTGCTTGTTAAGGC-----------------TCCCTGGTCAGTGGAGCCTCGTTGTGTGCAGACAGCAGACCACGAATCCACAGAGCCTTGTACAAGTTTCTGCCTCCCAGCCACCCTTCAGAGTTGTGCATTCCAGCATTGACATGAGCCTTCTCTCTCACTTGGTGACCATTTTTCACAAAGAAACAAAGTTTTTATCAGTTCACTGGAGTCTTCATGAATTTACAAACCTAGATCAGCTAATCTAAACAGTTAATTGCAATCCTGGCTTAGTGATTGATCCCTGTCCCTTCCTGTAACCATCATCAGAGCACCTCACAGAGATGCCACCGGCTATCTCTTCAGCTCAGTGCCTTAGTTCCTGCCACCCAAACTCAGCCTCACCAGGTCACCCAGCATGACAGAAGACAGGCATTTGGGACTTGAGCTGGGGTTGAAACGGCAGATGCTGGATCCCAGGATGTCTTGCATCAGCCCTGCTCTGTGGTCCTGCATTTACCTTTCTCTGGGATGTGCTGATTCTTGGACAGTATTACTTCTTAAGAGTTGGATAGTGGTTGTGGCTAGTGCTTCTCAAGCACCGAGGACTCCCTTCACAAAGTGCTTTCTCCACTAGAACCTTCTAGGGCTCACTGCTTGTGCACTCTCAGTAGAGAGATTAAGGAAAGGGTT-ACTGAACCATACAGCCTTCTGTACAATGAAATTGGTAGAAACTGAAGGGTATATCCAACTTTCAGGTTATCTTCCTGAGAAGCAGACATCTGGCAGAGTCCTTTCATG--TTTTCTTTTTGCAGAACATGGGCATGGGTTGGCAGCAGGGCATAGTGAAGGAGTGAGGCTTTTGAGTCATCAACTGGCATTTCTGCTTACTAACTAGCTGAGGGACCTTGGCCAAATTACATAGTGTCTCTGGTTTCTCATCTTCAGAGGAGACAAACACACACACACACGCATACCTGGTAATCTGAAAGACATGGGGCATGGGTTAAATTCAGTGTATGAGCCCTC-------------------------CATCTTTCTTGCAGTTTGAATATAATATTCCTATTGTTCTTGATCTCCCAGGAGAAGGAGAAAGCACACGAAGGAGCAAGACCCATGAGAGCCATCTTTCTGGCTGATGGGAATGTCTTTACCACTGGTTTCAGCCGCATGAGTGAGCGGCAGTTCTGAAAAAGCCTGTGATGAACTGGTGGAAGAAATGGAGCATTATGGCCAGTGGTCTGGGGGCAAGCATCATGTAAGTTGTAATTTCACACAGAGAACTGTAATGTGTATGTGGGATAGGAGCAGGGATAGA-TATTTAGAGAATTTAGAGGGGATTTATCTGTTTTGTCCTGTATCTCTGACTCCTAGACCTAACTACAGGGACTAGCCAAGGCTGTCAGGGGAACTCTGGTAGCATTTAATCTATCTGGTCTCATTTTCTCATTTACGTATATAATTACACTGGATGGTTTCCACAGGTCGGTTTCTCCAGGCT-GAATGGTAAGGCAATATGTGTCCATTTATTTTGTGGTATTGGTCTTCTCCAGGGCCACTTTTTATTCTCTGCACTTTCACAGTGAGCTATAGTGAAAGTACCAAGACAAAGTTTATCTGGTTGACTGCCAAAGTTTTGTGTGTTTGTAAACTTTGGAAGAAGAA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Martes_flavigula 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Mephitis_mephitis 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Mustela_kathiah 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Phoca_vitulina 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Procyon_lotor 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Ursus_arctos 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Ursus_thibetanus 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Zalophus_californianus 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Callorhinus_ursinus 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Phoca_vitulina 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Procyon_lotor 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Ursus_arctos 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Ursus_thibetanus 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Zalophus_californianus 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; END; BEGIN TREES; TITLE 'combined-nogap-bayes'; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Canis_lupus_familiaris, 2 Canis_lupus, 3 Ailuropoda_melanoleuca, 4 Ursus_thibetanus, 5 Ursus_arctos, 6 Arctonyx_collaris, 7 Martes_flavigula, 8 Mustela_kathiah, 9 Potos_flavus, 10 Procyon_lotor, 11 Ailurus_fulgens, 12 Mephitis_mephitis, 13 Phoca_vitulina, 14 Odobenus_rosmarus, 15 Zalophus_californianus, 16 Callorhinus_ursinus; TREE Bayesian_tree_from_combined_22_introns_data_with_no_gap = [&R] (1:0.001174,2:0.001238,((3:0.015085,(4:0.003229,5:0.002081)1.00:0.010183)1.00:0.0323,((12:0.068853,(11:0.046968,((8:0.020515,(6:0.026374,7:0.031663)0.75:0.001929)1.00:0.030891,(9:0.024419,10:0.039197)1.00:0.010865)1.00:0.00365)1.00:0.003077)1.00:0.008843,(13:0.016806,(14:0.012424,(15:0.001517,16:0.001598)1.00:0.008535)1.00:0.010689)1.00:0.0189)0.61:0.001911)1.00:0.090791); END; BEGIN TREES; TITLE 'combined-allgap-ML'; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Canis_lupus_familiaris, 2 Canis_lupus, 3 Ailuropoda_melanoleuca, 4 Ursus_thibetanus, 5 Ursus_arctos, 6 Arctonyx_collaris, 7 Martes_flavigula, 8 Mustela_kathiah, 9 Potos_flavus, 10 Procyon_lotor, 11 Ailurus_fulgens, 12 Mephitis_mephitis, 13 Phoca_vitulina, 14 Odobenus_rosmarus, 15 Zalophus_californianus, 16 Callorhinus_ursinus; TREE ML_tree_from_combined_22_introns_data_with_all_gap = [&U] (((1:0.090436,(7:0.05481,((2:0.031344,(3:0.038089,4:0.025373)70:0.002359)100:0.039048,(5:0.336008,6:0.028978)100:0.012596)100:0.004686)100:0.003761)100:0.01119,((8:0.016364,(9:0.002583,10:0.003957)100:0.011916)100:0.039278,(11:0.018779,(12:0.01629,(13:0.001282,14:0.002134)100:0.010634)100:0.012299)100:0.021871)68:0.001951)100:0.052995,(15:0.001846,16:0.00151)100:0.052995); END; BEGIN TREES; TITLE 'combined-nogap-ML'; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Canis_lupus_familiaris, 2 Canis_lupus, 3 Ailuropoda_melanoleuca, 4 Ursus_thibetanus, 5 Ursus_arctos, 6 Arctonyx_collaris, 7 Martes_flavigula, 8 Mustela_kathiah, 9 Potos_flavus, 10 Procyon_lotor, 11 Ailurus_fulgens, 12 Mephitis_mephitis, 13 Phoca_vitulina, 14 Odobenus_rosmarus, 15 Zalophus_californianus, 16 Callorhinus_ursinus; TREE ML_tree_from_combined_22_introns_data_with_no_gap = [&U] (((1:0.078312,(2:0.052693,((3:0.093959,4:0.027742)100:0.01155,(5:0.029308,(6:0.02318,7:0.035558)41:0.002236)100:0.034544)100:0.004063)100:0.003454)100:0.009369,((10:0.016522,(8:0.002214,9:0.003678)100:0.01124)100:0.037045,(11:0.018561,(12:0.015163,(13:0.001498,14:0.001718)100:0.009289)100:0.011795)100:0.02072)43:0.001438)100:0.051105,(15:0.00131,16:0.001313)100:0.051105); END; BEGIN TREES; TITLE 'combined-halfgap-ML'; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Canis_lupus_familiaris, 2 Canis_lupus, 3 Ailuropoda_melanoleuca, 4 Ursus_thibetanus, 5 Ursus_arctos, 6 Arctonyx_collaris, 7 Martes_flavigula, 8 Mustela_kathiah, 9 Potos_flavus, 10 Procyon_lotor, 11 Ailurus_fulgens, 12 Mephitis_mephitis, 13 Phoca_vitulina, 14 Odobenus_rosmarus, 15 Zalophus_californianus, 16 Callorhinus_ursinus; TREE ML_tree_from_combined_22_introns_data_with_half_gap = [&U] (((1:0.090886,(7:0.055448,((2:0.147639,3:0.028911)100:0.012399,(4:0.031757,(5:0.025984,6:0.038533)73:0.00265)100:0.039317)100:0.004603)99:0.003755)100:0.01097,((8:0.018944,(9:0.016083,(10:0.001307,11:0.00212)100:0.01083)100:0.012526)100:0.022162,(14:0.016618,(12:0.00406,13:0.002558)100:0.0121)100:0.03882)66:0.001837)100:0.053449,(15:0.001921,16:0.001433)100:0.053449); END; BEGIN TREES; TITLE 'combined-halfgap-bayes'; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Canis_lupus_familiaris, 2 Canis_lupus, 3 Ailuropoda_melanoleuca, 4 Ursus_thibetanus, 5 Ursus_arctos, 6 Arctonyx_collaris, 7 Martes_flavigula, 8 Mustela_kathiah, 9 Potos_flavus, 10 Procyon_lotor, 11 Ailurus_fulgens, 12 Mephitis_mephitis, 13 Phoca_vitulina, 14 Odobenus_rosmarus, 15 Zalophus_californianus, 16 Callorhinus_ursinus; TREE Bayesian_tree_from_combined_22_introns_data_with_half_gap = [&R] 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(1:0.001417,2:0.001727,(((3:0.01541,(4:0.003586,5:0.002381)1.00:0.011073)1.00:0.036011,(6:0.01772,(7:0.01412,(8:0.001328,9:0.001984)1.00:0.010082)1.00:0.011682)1.00:0.020426)0.54:0.001623,(16:0.080028,(15:0.05055,((10:0.02912,(11:0.023465,12:0.035179)0.98:0.002013)1.00:0.035908,(13:0.026066,14:0.043504)1.00:0.012373)1.00:0.004275)1.00:0.003264)1.00:0.011349)1.00:0.096993); END;