#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on March 29, 2024; 15:03 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Ruhfel B.R., Bittrich V., Bove C., Gustafsson M., Philbrick C., Rutishauser R., Xi Z., & Davis C. 2011. Phylogeny of the Clusioid Clade (Malpighiales): Evidence From the Plastid and Mitochondrial Genomes. American Journal of Botany, 98(2): 306-325. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S10995] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=222; TAXLABELS Acharia_tragodes_EF135500 Acridocarpus_natalitius_AF344525 Allanblackia_232br Apinagia_longifolia_158br Apinagia_riedelii_156br Archytaea_multiflora_559cd Averrhoa_carambola_FJ670048 Balanops_vieillardi_EF135505 Bonnetia_ahogadoi_560cd Bonnetia_cubensis_381br Bonnetia_paniculata1_open53br Bonnetia_roraimae_BLANK Bonnetia_sessilis_EF135509 Bonnetia_steyermarkii_BLANK Bonnetia_stricta_83br Bonnetia_tepuiensis_BLANK Bruguiera_gymnorhiza_EF135511 Calophyllum_biflorum_78br Calophyllum_brasiliense_1cn Calophyllum_castaneum_76br Calophyllum_confertum_74br Calophyllum_goniocarpum_31cn Calophyllum_griseum_65br Calophyllum_inophyllum_66br Calophyllum_lanigerum_73br Calophyllum_longifolium_421br Calophyllum_soulattri_257cd Calophyllum_teysmannii_77br Calophyllum_verticillatum_498br Calophyllum_vexans_33cn Caraipa_densifolia_39cn Caraipa_grandifolia_37cn 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Bonnetia_cubensis_381br 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Bonnetia_paniculata1_open53br 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Bonnetia_stricta_83br 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Calophyllum_verticillatum_498br 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Caraipa_grandifolia_37cn 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Cratoxylum_formosum_FJ670022 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Cyrillopsis_paraensis_FJ670024 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Djinga_felicis_356br 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Endodesmia_calophylloides_FJ670005 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Garcinia_eugenifolia_416br 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Hypericum_aegypticum_460au 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Hypericum_androsaemum_466au 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Hypericum_annulatum_467au 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Hypericum_canariense_462au 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Hypericum_garrettii_463au 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Hypericum_grandifolium_458au 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Hypericum_tetrapterum_465au 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Mammea_sessiliflora_23cn 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Monostylis_capillacea_159br 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Ochrocarpos_madagascariensis_352br 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Phyllanthus_epiphyllanthus_EF135581 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Zeylanidium_subulatum_307br 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Apinagia_longifolia_158br 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Calophyllum_lanigerum_73br 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Calophyllum_longifolium_421br 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Calophyllum_teysmannii_77br 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Calophyllum_verticillatum_498br 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Centroplacus_glaucinus_FJ670002 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Clusia_loretensis_154au 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Dalzellia_zeylanica_313br 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Dystovomita_paniculata_495br 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Endodesmia_calophylloides_FJ670005 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Garcinia_eugenifolia_416br 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Hanseniella_heterophylla_AB104562 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Hypericum_aegypticum_460au 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Hypericum_androsaemum_466au 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Hypericum_ellipticum_81br 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Hypericum_garrettii_463au 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Hypericum_grandifolium_458au 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Hypericum_linarifolium_464au 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Indotristicha_ramosissima_312br 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Kayea_oblongifolia_42br 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Ledermanniella_bowlingii_479br 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Monostylis_capillacea_159br 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Ochrocarpos_madagascariensis_352br 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Phyllanthus_epiphyllanthus_EF135581 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Rheedia_edulis_1401 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Ricinus_communis_EF135590 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Thornea_calcicola_402br 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Tovomita_calophyllophylla_231au 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Vismia_baccifera_47br 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Zeylanidium_lichenoides_AB048828 CTGGTGTCAGATGGGTTATTCCCTTACCCCATTCATCTAGAAAAATTGATTCAAATCCTTCGTTACTGGTTAAAAGATCCATCTTCTTTACATTTTTTACGATTCTTTTTTCACGAGTATTGGAATTGGAACCATCCCTTTTTT---------------------------------------GAAAAAATA------AATTTCCGATTATTTGTGTTCTTA------TATAATTCTTATGTATATGAATACGAATCCATTTTTTTTTTTATTCGTCGCCAATTCTTTCATTTACCATCAAAACCTTTTCGGTTTTTTTTTGAAAGACTTTATTTCTATGGAAAAGTAGAGAAT------TTTACAGAG---GTTTTTAAT---------------------------------------AGAGGTTCTCCTATTACTTTAGGGTTGTTTAAAGACCCGAATACGCAT---------TATATTCGCTATCAAGAAAAATTCTTTTTTGCTTATAGG------GGTATGCCTCTTTTAATGAACAAGTGGAAATACTACTTTGTTACTTTATTTCAAAATCATTTTGATGTCTGGTTTCAACCAGACAAGATACATATCAATCCATTATAT---------------AAGCATTCA------------------TTCCACTGTGTTGGTTATCTTTTA------AGTTTAAAACGGAATCCTTCAGTGATACGAAGTCAAATGCTACTAAATGCATTTAGTATAGAG------AATACTATGAAGAAAATGGATATACTAGTTCCAATTATTCTCATGATTGACTCATTATCCAAAATGAAATTTTGTAATAAAATAGGTCATCCCGTTAGCAAACTGACTTGGATC---GATTCGTTGGATTCAGATATTATTGACCAATTTGTGCGTCTATGCAATAAGATTTCATATTATTATAGTGGATCTTCAAAAAAAAAAGATTTGTATCAAATACATTATATACTTCGATTTGCTTGTTTAAAAACCTTGGCTCGGAAACACAAAACCTCGGTCCGTGCTTTTTTTAAAAAA------CGAAGTTCATCCTTTTTA------GAAGAATTATTT------------------------------------------------------------CTA---GAAGACCAG---------------------------------------------------------------ATTTCTTCTTTGATCCTTATAAGA------TCCTCATTTAGATCGTCAGATCGATCTAAGCAATCT------AAAGTTCGGGTTTGGTATTTGGAT------ATTATT------------------------------------------------------TCTATTAATGATCTAATC------AATCAT---------GAATAA?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????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Zeylanidium_subulatum_307br AGGGTGTCAGATGGGTTATTCCCTTACCCCATTCATCTAGAAAAATTGATTCAAATCCTTCGTTACTGGTTAAAAGATCCATCTTCTTTACATTTTTTACGATTCTTTTTTCACGAGTATTGGAATTGGAACCATCCCTTTTTT---------------------------------------GAAAAAAGA------AATCTACGATTATTTGTGTTCTTA------TATAATTCTTATGTATATGAATACGAATCCATTTTTTTTTTTATTCGTCGCCAATTCTTTCATTTACCATCAAAACCTTTTCGGTTTTTTTTTGAAAGACTTTATTTCTATGGAAAAGTAGAGAAT------TTTACAGAG---GTTTTTAGT---------------------------------------AAGGGTTCCCCCATTACTTTAGAGTTGTTCAAAGACCCGAATATGCAT---------TATATTCGCTATCAAGGAAAATTCTTTTTTGCTTATAGG------GGTATGCCTCTTTTAATAAACAAGTGGAAATACTACTCTGTTACTTTATTTCAAAATCATTTTGATGTCTGGTTTCAACCAGACAAGATACATATCAATCCATTATAT---------------AAGCATTCA------------------TTTCATTGTGTTGGTTATCTTTTC------AGTTTAAAAAGGAATCCTTCAGTAATACGAAGTCAAATGCTACTAAATGCGTTTAGTATAGAA------AATACTATGAAGAAAATGGATCTACTAGTTCCGATTATTCTCATGATTGACTCATTATCCAAAATGAGATTTTGTAATAAAATAGGTCATCCCGTTAGCAAACCGACCTGGATC---GATTCGTTGGATTCAGATATTATTGACCGATTTGTGCGTCTATGCAATAAGATTTCATATTATTATAGTGGATCCTCAAAAAAAAAAGATTTGTATCAAATACATTATATACTTCGATTTGCTTGTTTAAAAACCTTGGCTCGTAAACACAAAACCTCGGTCCGTGCTTTTTTTAAAAAA------CTGGGTTCATCCTTTTTA------GAAGAATTATTT------------------------------------------------------------CTA---GAGGACCCG---------------------------------------------------------------ATTTCTTCTTTGATCCTTATAAGA------TCCTCATCCAGATCGTCAGATCGATCTAATCAATCT------AAAGTTCGGGTTTGGTATTTGGAT------ATTATT------------------------------------------------------TCTATTAATGATCTAATC------AATCAT---------GAATAA????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????ACTTTATTTACTTACTTTTGAAGGACATTTCAATTATAATTTTCAAAATTATAACGGAAAAACCAATACTTTTTTTTATTCAATTTCATTATGGGGT------AAAGAAAACAAA------------------------------------------------------------------------------------------------------CTTTTTCCAATCAAAACAAATAAAAGT------CATAATAATCTAAAATATTGT---GTTCGTCATTTT------GTTAATATTAATGTTTTTCCTAGTAAAACATTTTTT------TCCTATCCTTATGAATCGGACAATACAATGTTATTTCCAATGATTTTTTTGGTATTATTTACTTTATTTATTGGAGTTATAGGAATCTCTTTT------AATCAATTCAATCTA------------TTTAGTGAATTAAATATATTACATAAACTTTGTATTCCTTCTTTAAATCATTTGATTAAGGAT---------------------TCCGTAGATTTTTTTGAATTTTTAAGAGAGTCCACTTTTTCAGTTTTTATAGCTTTTTTTGGAATATTTATAGCATGCTTTTTATATAATCCTCCTTATTCCTCT------------TTTCAAAATTTTAATTTATGTAATTCTTTTCCTAAAAAAACTTCTACTCGAAATTTTTCAGACAGGCTGGGAAATCTTATATATAATTGGTCTTTTAATCGTGGATATATAGATATGTTGTATAAAAAATATTATACTCCTGACTATGAAACCAAGGATACTGATATCTTGGCAGCATTTCGAGTAACTCCTCAACCGGGAGTTCCACCTGAGGAAGCAGGAGCTGCGGTAGCTGCGGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGTGTGGACTGATGGATTGACCAGTCTTGATCGTTATAAAGGACGATGCTATCACATTGAACCTGTTGCTGGAGAAGAAAATCAATATATTGCTTATGTAGCTTATCCTTTAGATCTTTTTGAAGAAGGTTCTGTTACTAACATGTTTACTTCCATCGTAGGTAACGTATTTGGATTTAAAGCCCTACGTGCTCTACGTCTAGAGGATTTGCGAATTCCTACTGCGTATGTTAAAACTTTTCAAGGACCGCCTCACGGAATTCAAGTTGAAAGAGATAAATTGAACAAGTATGGCCGTCCCCTATTAGGCTGTACTATTAAACCTAAGTTGGGGTTATCTGCTAAGAATTATGGTAGAGCGGTTTATGAATGTCTTCGTGGTGGGCTTGATTTTACGAAGGATGATGAGAATGTGAATTCGCAACCATTTATGCGATGGAGAGATCGATTTTTATTTTGTGCTGAAGCACTTTATAAAGCACAGGCCGAAACTGGTGAAATCAAAGGTCATTATTTGAATGCTACTGCCGGTACATGCGAAGAAATGATGAAAAGAGCTATTTTTGCCAGAGAATTGGGAGTTCCGATCGTAATGCATGACTACTTAACAGGAGGTTTCACTGCAAATACCACATTATCTCATTATTGCCGAGATAATGGTTTACTTCTGCACATTCACCGTGCAATGCATGCAGTTATTGATAGACAAAAAAACCATGGTATTCACTTTCGTGTACTAGCTAAAGCATTACGCATGTCTGGTGGCGATCATATTCACTCTGGTACAGTTGTAGGTAAACTGGAAGGAGAAAGAGAGATTACTTTAGGATTTGTTGATTTACTAAGGGATGATTTTATTGAAAAAGATCGAAGCCGAGGTATTTATTTCACTCAAGATTGGGTCTCTATGCCGGGTGTTTTACCTGTGGCTTCAGGGGGTATTCATGTTTGGCATATGCCGGCTTTAACTGAGATCTTTGGAGATGATTCCGTACTCCAATTCGGTGGAGGAACCTTAGGACATCCTTGGGGAAATGCACCTGGTGCTGTAGCTAATCGAGTAGCTCTAGAAGCATGTGTTCAAGCTCGTAATGAAGGACGTGATCTTGCTCGTGAGGGTAATGAAGTAATTCGTGAAGCGTGTAAATGGAGTCCTGAACTAAACGATCCAGAGTTTCCAGACACATCGCACTTCCACTCGGGTGGAGGCTGCCACTCCGTCCTAAGACGGATTAAAGAAGAGTGGGGAACCTCTCCCTGGTTTTTAGAATTCAACATC---TGGAATAGTTTTCACACCATCGACCGATATCGACTCATCTCAATCTTGTTGGAAGAGATCGACGATCCC---TTTTTTTTCTTGTTCACCATTCTTCAATCATTTTCCGCCGAACGACTC------AACGAAGATGAGAAGGGCCCC------------GTCTCACACAGTGTACTACTATCGGTCCTACCAGACAAGATCTACCTACATAAGCTCGATCAGGAGATAGGGAGGATCCAACAGACGTACGAAATTCCAATTGTTGAGATAATCAGATCGTTTCTATTAAGGACAGTTCGTATT---------GATGACCAAGATAATTCTGGAGAA------------------CCCAAAGGCAACAGAGCTCTCATTGTG---------------------------------AAGAGCATCCAACGCAAAGCGGACTTT---CCCTTCGTTTTT------------------------TTCCCCACA---AGCACCCCACGGCTCAGGGGAGACCAGAAA------ACGCCTTTAGTTTTCCCACCTTCGTGGGCACTTGCAGCCTTCCTTAGCAAGCTCTCGAGCCTCCTTTGC---------------------------GTGATCCCGAAGGCCGAATTCTATGGTGGAGAACACTGG---TTTCATAATTGGATCATGAGAAAAAATATGTTGGATTGCACAAAAAAGGGCCTGCTGATAGAGCAGGGCGGGGAGGCGATACTAGTTATTATCATGTCAGAGAGACTCTTTTTAAGA------------AAAAAAGAA------------------------------------------------------AAAGATCTTTCTTACGCGCGATATGCCAACGACTTACTACTGGGAATATACGGTGCCATAGAGTATTTCATAGAAATACAAAAACGTATCGACCAA---TTCCTACAATTCGGCCTTTTCTTTTTTTTAGGCTTGGCAGGATCAACAACAATAGCTGCATGGAGTACAGTAGAATTCCTCGGTACGGTCATTCGGGTGGTTCCT---------CCG---AGAACTACTCCCATACAATTATTTAGAAAGCAGGAGAAGCGTCTACGG------TGCCGTATCCATAGAATTTAT------TTTAACCGT---------------------------------TATAAGAGTCTCTCGATCTTCGAGCTGACGAAGGGGATG---AGCGAAAGAGGCAGTCTACTGGACGGGGAAAAACTA------GCGGAG---CCCTTTTTTACAGCTGGAGTCAGAAGT------------------------------------------------------------------CCCCAAGTGAGCCTATTATGG------------------GAGACCGTCAAGCACATCTGGCTAGGA------------------TCAAGTTGGATG---------TATAGCTCAGGTCAGAGCAACACGCCATCGGACCTTCAACAGGTACTCTCCAAG---AACATGAGTGTTAGTAAGTTGTCATTGCATACTCCCGCGGGTCAGAAG------------------GCT---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AAGGGGGAAGGAGGAATACACTGGGTGGGC------TGCTGT---GAATTTCCCATACAGATAAAGGCGCCTATCAAAAAGGTACTCCGAAGGCTTCGAGATCGAGGTCTAATTAGTAGAATAAAA------CCCTGGCCAAGCCACGTGGCCTGCTTTTCGAGCGTCAACGACGAATACATCGTCAATTGGTCAGCGGGCATCGCGAGAAAGATTCTGTTC ; END; BEGIN TREES; TITLE expanded_majority_rule_ml_figs_1_and_2; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Archytaea_multiflora_559cd, 2 Ploiarium_alternifolium_FJ669999, 3 Bonnetia_ahogadoi_560cd, 4 Bonnetia_cubensis_381br, 5 Bonnetia_paniculata1_open53br, 6 Bonnetia_roraimae_BLANK, 7 Bonnetia_sessilis_EF135509, 8 Bonnetia_steyermarkii_BLANK, 9 Bonnetia_stricta_83br, 10 Bonnetia_tepuiensis_BLANK, 11 Chrysochlamys_allenii_469br, 12 Chrysochlamys_eclipes_6de, 13 Chrysochlamys_grandifolia_BLANK, 14 Chrysochlamys_silvicola_493br, 15 Chrysochlamys_skutchii_484br, 16 Clusia_clusioides_BLANK, 17 Clusia_fructiangusta_175au, 18 Clusia_gracilis_62br, 19 Clusia_gundlachii_EF135520, 20 Clusia_lanceolata_5cn, 21 Clusia_major_68au, 22 Clusia_pallida_153au, 23 Clusia_rosea_GCT, 24 Clusia_loretensis_154au, 25 Clusia_viscida_165au, 26 Clusia_cf_flavidaHavetiopsis_167au, 27 Quapoya_peruviana_168au, 28 Dystovomita_brasiliensis_BLANK, 29 Dystovomita_paniculata_495br, 30 Tovomita_sp_220au, 31 Tovomita_calophyllophylla_231au, 32 Tovomita_longifolia_482br, 33 Tovomita_weddeliana_178au, 34 Tovomitopsis_saldanhae_475br, 35 Allanblackia_232br, 36 Garcinia_aff_afzelii_462br, 37 Garcinia_conrauana_Blank, 38 Garcinia_cowa_102br, 39 Garcinia_eugenifolia_416br, 40 Garcinia_hessii_EF135543, 41 Garcinia_hombroniana_97br, 42 Garcinia_livingstonei_BLANK, 43 Garcinia_mangostana_GGT, 44 Garcinia_mannii_391br, 45 Garcinia_nervosa_41br, 46 Garcinia_penangiana_68br, 47 Garcinia_rostrata_460br, 48 Garcinia_scortechinii_417br, 49 Garcinia_spicata_cn06, 50 Garcinia_staudtii_389br, 51 Garcinia_urophylla_461br, 52 Ochrocarpos_madagascariensis_352br, 53 Ochrocarpos_tsaratananae_237br, 54 Pentaphalangium_latissimum_FJ670008, 55 Rheedia_edulis_1401, 56 Rheedia_macrophylla_BLANK, 57 Tripetalum_cymosum_316br, 58 Lorostemon_coelhoi_1420au, 59 Montrouziera_cauliflora_FJ670007, 60 Montrouziera_sphaeroidea_511au, 61 Moronobea_coccinea_510au, 62 Pentadesma_butyracea_388br, 63 Platonia_insignis_433au, 64 Symphonia_fasciculata_265br, 65 Symphonia_globulifera_61br, 66 Calophyllum_biflorum_78br, 67 Calophyllum_brasiliense_1cn, 68 Calophyllum_castaneum_76br, 69 Calophyllum_confertum_74br, 70 Calophyllum_goniocarpum_31cn, 71 Calophyllum_griseum_65br, 72 Calophyllum_inophyllum_66br, 73 Calophyllum_lanigerum_73br, 74 Calophyllum_longifolium_421br, 75 Calophyllum_soulattri_257cd, 76 Calophyllum_teysmannii_77br, 77 Calophyllum_verticillatum_498br, 78 Calophyllum_vexans_33cn, 79 Caraipa_densifolia_39cn, 80 Caraipa_grandifolia_37cn, 81 Caraipa_savannarum_15cn, 82 Caraipa_tereticaulis_47cn, 83 Clusiella_isthmensis_2657cn59, 84 Endodesmia_calophylloides_FJ670005, 85 Haploclathra_cordata_40cn, 86 Haploclathra_paniculata_41cn, 87 Kayea_sp._281br, 88 Kayea_elmeri_64br, 89 Kayea_hexapetala_69br, 90 Kayea_oblongifolia_42br, 91 Kayea_stylosa_27cn, 92 Kielmeyera_lathrophyton_20cn, 93 Kielmeyera_petiolaris_57cn, 94 Mahurea_exstipulata_45cn, 95 Mammea_africana_235br, 96 Mammea_americana_3cn, 97 Mammea_furfuracea_396br, 98 Mammea_sessiliflora_23cn, 99 Mammea_siamensis_FJ670006, 100 Mammea_sp_112br, 101 Mammea_touriga_384br, 102 Mammea_zeereae_397br, 103 Marila_laxiflora_16246cn26, 104 Marila_tomentosa_16215cn25, 105 Mesua_ferrea_95br, 106 Poeciloneuron_indicum_50cn, 107 Cratoxylum_arborescens_71br, 108 Cratoxylum_cochinchinense_1357cd, 109 Cratoxylum_formosum_63br, 110 Cratoxylum_formosum_FJ670022, 111 Cratoxylum_glaucum_38br, 112 Eliea_articulata_FJ670023, 113 Hypericum_aegypticum_460au, 114 Hypericum_androsaemum_466au, 115 Hypericum_annulatum_467au, 116 Hypericum_canariense_462au, 117 Hypericum_ellipticum_81br, 118 Hypericum_elodes_469au, 119 Hypericum_empetrifolium_216cd, 120 Hypericum_garrettii_463au, 121 Hypericum_grandifolium_458au, 122 Hypericum_hircinum_461au, 123 Hypericum_irazuense_BLANK, 124 Hypericum_kalmianum_ACGT, 125 Hypericum_linarifolium_464au, 126 Hypericum_mutilum_80br, 127 Hypericum_perforatum_AGCT, 128 Hypericum_tetrapterum_465au, 129 Santomasia_steyermarkii_BLANK, 130 Thornea_calcicola_402br, 131 Triadenum_fraseri_GTAT, 132 Triadenum_japonicum_135br, 133 Triadenum_walteri_1053kw, 134 Harungana_madagascariensis_435br, 135 Psorospermum_427br, 136 Psorospermum_androsaemifolium_431br, 137 Psorospermum_febrifugum_433br, 138 Psorospermum_glaberrimum_575au, 139 Vismia_sp_EF135601, 140 Vismia_baccifera_47br, 141 Vismia_billbergiana_487br, 142 Vismia_ferruginea_CGTT, 143 Vismia_sp_84br, 144 Vismia_guineensis_424br, 145 Vismia_rubescens_BLANK, 146 Apinagia_longifolia_158br, 147 Apinagia_riedelii_156br, 148 Castelnavia_monandra_157br, 149 Ceratolacis_pedunculatum_405br, 150 Cladopus_japonicus_309br, 151 Cladopus_queenslandicus_372br, 152 Diamantina_lombardii_329br, 153 Dicraeanthus_zehnderi_355br, 154 Djinga_felicis_356br, 155 Endocaulos_mangorense_AB038191, 156 Griffithiella_hookeriana_319br, 157 Hanseniella_heterophylla_AB104562, 158 Hydrobryum_japonicum_308br, 159 Inversodicraea_cf_annithomae_361br, 160 Inversodicraea_cf_bosii_477br, 161 Inversodicraea_cristata_362br, 162 Ledermanniella_bifurcata_478br, 163 Ledermanniella_bowlingii_479br, 164 Ledermanniella_letouzeyi_480br, 165 Ledermanniella_linearifolia_BLANK, 166 Ledermanniella_pusilla_364br, 167 Leiothylax_quangensis_FM877842, 168 Letestuella_tisserantii_358br, 169 Macropodiella_heteromorpha_359br, 170 Marathrum_foeniculaceum_155br, 171 Monandriella_linearifolia_476br, 172 Monostylis_capillacea_159br, 173 Mourera_cf_aspera_161br, 174 Mourera_fluviatilis_AB038200, 175 Oserya_coulteriana_163br, 176 Paracladopus_chanthaburiensis_310br, 177 Podostemum_ceratophyllum_CGTT, 178 Podostemum_scaturiginum_367br, 179 Polypleurum_stylosum_311br, 180 Rhyncholacis_sp_EF135564, 181 Stonesia_ghoguei_FM877841, 182 Thawatchaia_trilobata_AB104563, 183 Thelethylax_minutiflora_AB038196, 184 Vanroyenella_plumosa_AB048378, 185 Weddellina_squamulosa_154br, 186 Zeylanidium_lichenoides_AB048828, 187 Zeylanidium_subulatum_307br, 188 Dalzellia_zeylanica_313br, 189 Indodalzellia_gracilis_AB450015, 190 Indotristicha_ramosissima_312br, 191 Terniopsis_brevis_314br, 192 Terniopsis_malayana_AB048827, 193 Terniopsis_sessilis_AB048377, 194 Tristicha_trifaria_160br, 195 Acharia_tragodes_EF135500, 196 Acridocarpus_natalitius_AF344525, 197 Averrhoa_carambola_FJ670048, 198 Balanops_vieillardi_EF135505, 199 Bruguiera_gymnorhiza_EF135511, 200 Caryocar_glabrum_EF135515, 201 Celastrus_orbiculatus_EF135517, 202 Centroplacus_glaucinus_FJ670002, 203 Chrysobalanus_icaco_EF135519, 204 Ctenolophon_englerianus_EF135524, 205 Cyrillopsis_paraensis_FJ670024, 206 Elatine_triandra_EF135532, 207 Goupia_glabra_EF135544, 208 Humiria_balsamifera_EF135549, 209 Hybanthus_concolor_EF135550, 210 Irvingia_malayana_EF135553, 211 Lacistema_aggregatum_FJ670025, 212 Lophopyxis_maingayi_EF135560, 213 Ochna_multiflora_EF135572, 214 Panda_oleosa_FJ670032, 215 Paropsia_madagascariensis_EF135576, 216 Pera_bicolor_EF135578, 217 Phyllanthus_epiphyllanthus_EF135581, 218 Podocalyx_loranthoides_EF135583, 219 Populus_maximowiczii_EF135587, 220 Putranjiva_roxburghii_EF135530, 221 Reinwardtia_indica_AB048380, 222 Ricinus_communis_EF135590; TREE 'Figs. 1-2' = [&R] (215,((((214,221):1.0,(206,196):1.0,(203,198):1.0,(197,201):1.0,(218,217):1.0,(205,199):1.0,(212,220):1.0,(((((((((102,99):1.0,100):1.0,(98,97):1.0,(95,96):1.0,101):1.0,(((90,89):1.0,(87,88):1.0):1.0,91):1.0,106):1.0,(((70,75):1.0,((69,66):1.0,76):1.0,((67,74):1.0,77):1.0,(68,73):1.0,72,78,71):1.0,105):1.0):1.0,((((((82,79):1.0,(80,81):1.0):1.0,(85,86):1.0):1.0,(93,92):1.0):1.0,94):1.0,((104,103):1.0,83):1.0):1.0):1.0,84):1.0,(((((((177,178):1.0,(155,183):1.0,((187,179):1.0,(((151,150):1.0,176):1.0,((182,157):1.0,158):1.0):1.0,(186,156):1.0):1.0,(((((((168,181):1.0,162):1.0,(167,169):1.0):1.0,((((165,166):1.0,154):1.0,(153,164):1.0):1.0,163):1.0):1.0,((161,159):1.0,160):1.0):1.0,171):1.0,149):1.0):1.0,((173,174):1.0,((((((170,184):1.0,175):1.0,(146,147):1.0):1.0,148):1.0,180):1.0,172):1.0):1.0):1.0,152):1.0,185):1.0,((((188,190):1.0,189):1.0,194):1.0,((191,192):1.0,193):1.0):1.0):1.0,(((((110,108):1.0,109):1.0,(111,107):1.0):1.0,112):1.0,((((((136,137):1.0,138):1.0,144):1.0,135):1.0,((145,134):1.0,((143,139):1.0,((140,142):1.0,141):1.0):1.0):1.0):1.0,(((((((127,128):1.0,125):1.0,115):1.0,119):1.0,120):1.0,(((121,122):1.0,114):1.0,116):1.0):1.0,(((133,131):1.0,132):1.0,(118,113):1.0,((123,117):1.0,(124,126):1.0):1.0,130,129):1.0):1.0):1.0):1.0):1.0):1.0,(((((54,57):1.0,((((41,46):1.0,43):1.0,38):1.0,(48,51):1.0):1.0):1.0,(36,44):1.0,(39,47):1.0,((((((59,60):1.0,63):1.0,61):1.0,58):1.0,62):1.0,(64,65):1.0):1.0,(53,52):1.0,((45,49):1.0,(((42,40):1.0,56):1.0,50,55):1.0,35,37):1.0):1.0,(((((((13,15):1.0,(11,14):1.0):1.0,12):1.0,((((25,23):1.0,21):1.0,(17,22):1.0,18,16,26,20,19,27,24):1.0,33):1.0):1.0,((30,31):1.0,(28,32):1.0):1.0):1.0,34):1.0,29):1.0):1.0,((2,1):1.0,((((7,5):1.0,((9,4):1.0,10):1.0):1.0,3,8):1.0,6):1.0):1.0):1.0):1.0,(216,222):1.0,210,213,204,202,208,200):1.0,(211,219):1.0):1.0,(209,207):1.0):1.0,195); END; BEGIN TREES; TITLE reduced_majority_rule_ML_figs_3_and_4; LINK TAXA = Taxa2; TRANSLATE 1 Archytaea_multiflora_559cd, 2 Ploiarium_alternifolium_FJ669999, 3 Bonnetia_cubensis_381br, 4 Bonnetia_paniculata1_open53br, 5 Bonnetia_sessilis_EF135509, 6 Bonnetia_stricta_83br, 7 Chrysochlamys_allenii_469br, 8 Chrysochlamys_eclipes_6de, 9 Clusia_fructiangusta_175au, 10 Clusia_gracilis_62br, 11 Clusia_gundlachii_EF135520, 12 Clusia_lanceolata_5cn, 13 Clusia_major_68au, 14 Clusia_pallida_153au, 15 Clusia_loretensis_154au, 16 Clusia_viscida_165au, 17 Clusia_cf_flavidaHavetiopsis_167au, 18 Quapoya_peruviana_168au, 19 Dystovomita_paniculata_495br, 20 Tovomita_sp_220au, 21 Tovomita_calophyllophylla_231au, 22 Tovomita_longifolia_482br, 23 Tovomita_weddeliana_178au, 24 Allanblackia_232br, 25 Garcinia_aff_afzelii_462br, 26 Garcinia_cowa_102br, 27 Garcinia_eugenifolia_416br, 28 Garcinia_hombroniana_97br, 29 Garcinia_nervosa_41br, 30 Garcinia_penangiana_68br, 31 Garcinia_rostrata_460br, 32 Garcinia_scortechinii_417br, 33 Garcinia_spicata_cn06, 34 Garcinia_staudtii_389br, 35 Garcinia_urophylla_461br, 36 Ochrocarpos_madagascariensis_352br, 37 Ochrocarpos_tsaratananae_237br, 38 Pentaphalangium_latissimum_FJ670008, 39 Tripetalum_cymosum_316br, 40 Lorostemon_coelhoi_1420au, 41 Montrouziera_cauliflora_FJ670007, 42 Montrouziera_sphaeroidea_511au, 43 Moronobea_coccinea_510au, 44 Pentadesma_butyracea_388br, 45 Platonia_insignis_433au, 46 Symphonia_fasciculata_265br, 47 Symphonia_globulifera_61br, 48 Calophyllum_biflorum_78br, 49 Calophyllum_castaneum_76br, 50 Calophyllum_confertum_74br, 51 Calophyllum_goniocarpum_31cn, 52 Calophyllum_griseum_65br, 53 Calophyllum_inophyllum_66br, 54 Calophyllum_lanigerum_73br, 55 Calophyllum_longifolium_421br, 56 Calophyllum_soulattri_257cd, 57 Calophyllum_teysmannii_77br, 58 Calophyllum_verticillatum_498br, 59 Calophyllum_vexans_33cn, 60 Caraipa_densifolia_39cn, 61 Caraipa_grandifolia_37cn, 62 Caraipa_savannarum_15cn, 63 Caraipa_tereticaulis_47cn, 64 Clusiella_isthmensis_2657cn59, 65 Endodesmia_calophylloides_FJ670005, 66 Haploclathra_cordata_40cn, 67 Haploclathra_paniculata_41cn, 68 Kayea_sp._281br, 69 Kayea_hexapetala_69br, 70 Kayea_oblongifolia_42br, 71 Kayea_stylosa_27cn, 72 Kielmeyera_lathrophyton_20cn, 73 Kielmeyera_petiolaris_57cn, 74 Mahurea_exstipulata_45cn, 75 Mammea_africana_235br, 76 Mammea_americana_3cn, 77 Mammea_furfuracea_396br, 78 Mammea_sessiliflora_23cn, 79 Mammea_siamensis_FJ670006, 80 Mammea_touriga_384br, 81 Mammea_zeereae_397br, 82 Marila_tomentosa_16215cn25, 83 Mesua_ferrea_95br, 84 Poeciloneuron_indicum_50cn, 85 Cratoxylum_arborescens_71br, 86 Cratoxylum_cochinchinense_1357cd, 87 Cratoxylum_formosum_63br, 88 Cratoxylum_formosum_FJ670022, 89 Cratoxylum_glaucum_38br, 90 Eliea_articulata_FJ670023, 91 Hypericum_aegypticum_460au, 92 Hypericum_androsaemum_466au, 93 Hypericum_annulatum_467au, 94 Hypericum_canariense_462au, 95 Hypericum_empetrifolium_216cd, 96 Hypericum_garrettii_463au, 97 Hypericum_grandifolium_458au, 98 Hypericum_hircinum_461au, 99 Hypericum_linarifolium_464au, 100 Hypericum_tetrapterum_465au, 101 Triadenum_fraseri_GTAT, 102 Triadenum_japonicum_135br, 103 Triadenum_walteri_1053kw, 104 Harungana_madagascariensis_435br, 105 Psorospermum_febrifugum_433br, 106 Psorospermum_glaberrimum_575au, 107 Vismia_sp_EF135601, 108 Vismia_baccifera_47br, 109 Vismia_billbergiana_487br, 110 Vismia_ferruginea_CGTT, 111 Apinagia_longifolia_158br, 112 Apinagia_riedelii_156br, 113 Castelnavia_monandra_157br, 114 Cladopus_japonicus_309br, 115 Dicraeanthus_zehnderi_355br, 116 Djinga_felicis_356br, 117 Inversodicraea_cf_annithomae_361br, 118 Inversodicraea_cf_bosii_477br, 119 Inversodicraea_cristata_362br, 120 Ledermanniella_bifurcata_478br, 121 Ledermanniella_bowlingii_479br, 122 Ledermanniella_letouzeyi_480br, 123 Ledermanniella_pusilla_364br, 124 Letestuella_tisserantii_358br, 125 Macropodiella_heteromorpha_359br, 126 Marathrum_foeniculaceum_155br, 127 Monandriella_linearifolia_476br, 128 Monostylis_capillacea_159br, 129 Mourera_cf_aspera_161br, 130 Oserya_coulteriana_163br, 131 Paracladopus_chanthaburiensis_310br, 132 Podostemum_ceratophyllum_CGTT, 133 Polypleurum_stylosum_311br, 134 Rhyncholacis_sp_EF135564, 135 Stonesia_ghoguei_FM877841, 136 Weddellina_squamulosa_154br, 137 Zeylanidium_subulatum_307br, 138 Dalzellia_zeylanica_313br, 139 Indotristicha_ramosissima_312br, 140 Terniopsis_brevis_314br, 141 Tristicha_trifaria_160br, 142 Acharia_tragodes_EF135500, 143 Acridocarpus_natalitius_AF344525, 144 Averrhoa_carambola_FJ670048, 145 Balanops_vieillardi_EF135505, 146 Bruguiera_gymnorhiza_EF135511, 147 Caryocar_glabrum_EF135515, 148 Celastrus_orbiculatus_EF135517, 149 Centroplacus_glaucinus_FJ670002, 150 Chrysobalanus_icaco_EF135519, 151 Ctenolophon_englerianus_EF135524, 152 Cyrillopsis_paraensis_FJ670024, 153 Elatine_triandra_EF135532, 154 Goupia_glabra_EF135544, 155 Humiria_balsamifera_EF135549, 156 Hybanthus_concolor_EF135550, 157 Irvingia_malayana_EF135553, 158 Lacistema_aggregatum_FJ670025, 159 Lophopyxis_maingayi_EF135560, 160 Ochna_multiflora_EF135572, 161 Panda_oleosa_FJ670032, 162 Paropsia_madagascariensis_EF135576, 163 Pera_bicolor_EF135578, 164 Phyllanthus_epiphyllanthus_EF135581, 165 Podocalyx_loranthoides_EF135583, 166 Populus_maximowiczii_EF135587, 167 Putranjiva_roxburghii_EF135530, 168 Reinwardtia_indica_AB048380, 169 Ricinus_communis_EF135590; TREE 'Figs. 3-4' = [&R] (151,(167,159):1.0,(164,165):1.0,(169,163):1.0,((166,158):1.0,((142,162):1.0,(154,156):1.0):1.0):1.0,(145,150):1.0,(143,153):1.0,((((((7,8):1.0,(((13,16):1.0,(9,14):1.0,12,18,11,10,15,17):1.0,23):1.0):1.0,((20,21):1.0,22):1.0,19):1.0,(((39,38):1.0,(((30,28):1.0,26):1.0,(32,35):1.0):1.0):1.0,(36,37):1.0,(27,31):1.0,(((29,33):1.0,34):1.0,24):1.0,((((((41,42):1.0,45):1.0,43):1.0,40):1.0,44):1.0,(46,47):1.0):1.0,25):1.0):1.0,(((6,3):1.0,(5,4):1.0):1.0,(2,1):1.0):1.0):1.0,(((((((((110,108):1.0,109):1.0,107):1.0,104):1.0,(106,105):1.0):1.0,(((((98,97):1.0,92):1.0,94):1.0,((((100,99):1.0,93):1.0,95):1.0,96):1.0):1.0,(((103,101):1.0,102):1.0,91):1.0):1.0):1.0,((((88,86):1.0,87):1.0,(85,89):1.0):1.0,90):1.0):1.0,(((((((((126,130):1.0,(112,111):1.0):1.0,113):1.0,134):1.0,128):1.0,129):1.0,(((((119,117):1.0,118):1.0,((((123,116):1.0,(122,115):1.0):1.0,121):1.0,(((124,135):1.0,120):1.0,125):1.0):1.0):1.0,127):1.0,(((137,133):1.0,(131,114):1.0):1.0,132):1.0):1.0):1.0,136):1.0,(((138,139):1.0,141):1.0,140):1.0):1.0):1.0,((((((55,58):1.0,(56,51):1.0,(49,54):1.0,((50,48):1.0,57):1.0,53,52,59):1.0,83):1.0,((((69,70):1.0,68):1.0,71):1.0,((81,79):1.0,(75,76):1.0,(77,78):1.0,80):1.0,84):1.0):1.0,((((72,73):1.0,((66,67):1.0,((63,60):1.0,(61,62):1.0):1.0):1.0):1.0,74):1.0,(64,82):1.0):1.0):1.0,65):1.0):1.0):1.0,(161,168):1.0,(144,148):1.0,149,155,146,152,157,160,147); END;