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TreeBASE (cc) 1994-2008

Study reference:
Wielstra B., & Arntzen J. 2011. Unraveling the rapid radiation of crested newts (Triturus
cristatus superspecies) using complete mitogenomic sequences. BMC Evolutionary
Biology, 11: 162.

TreeBASE Study URI:  http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S11081]

BEGIN TAXA;
        TITLE  Taxa1;
        DIMENSIONS NTAX=10;
        TAXLABELS
            Calotriton_asper_EU880307
            Triturus_carnifex_ZMA9108_405
            Triturus_cristatus_ZMA7802_594
            Triturus_dobrogicus_ZMA9103_880
            Triturus_karelinii_Central_2103
            Triturus_karelinii_East_2412
            Triturus_karelinii_West_2360
            Triturus_macedonicus_2104
            Triturus_marmoratus_ZMA9095_518
            Triturus_pygmaeus_ZMA7677_282
            ;
END;

BEGIN CHARACTERS;
[! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M7316]

	TITLE Full_mtDNA_Triturus;
	LINK TAXA = Taxa1;
	DIMENSIONS NCHAR=15420;
	FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -;

MATRIX
[                                           10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220       230       240       250       260       270       280       290       300       310       320       330       340       350       360       370       380       390       400       410       420       430       440       450       460       470       480       490       500       510       520       530       540       550       560       570       580       590       600       610       620       630       640       650       660       670       680       690       700       710       720       730       740       750       760       770       780       790       800       810       820       830       840       850       860       870       880       890       900       910       920       930       940       950       960    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Calotriton_asper_EU880307           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Triturus_macedonicus_2104           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Triturus_pygmaeus_ZMA7677_282       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;
END;

BEGIN TREES;
      TITLE Full_mtDNA_Triturus;
      LINK TAXA = Taxa1;
         TRANSLATE
            1    Calotriton_asper_EU880307,
            2    Triturus_marmoratus_ZMA9095_518,
            3    Triturus_pygmaeus_ZMA7677_282,
            4    Triturus_cristatus_ZMA7802_594,
            5    Triturus_carnifex_ZMA9108_405,
            6    Triturus_macedonicus_2104,
            7    Triturus_dobrogicus_ZMA9103_880,
            8    Triturus_karelinii_East_2412,
            9    Triturus_karelinii_Central_2103,
            10   Triturus_karelinii_West_2360;
      TREE MB = [&R] (1:0.24893,(((4:0.040458,7:0.038724)0.95:0.002228,(5:0.021133,6:0.02399)1.00:0.015581)1.00:0.005368,(8:0.036199,(9:0.026279,10:0.02148)1.00:0.010036)1.00:0.008246)1.00:0.077652,(2:0.023393,3:0.023548)1.00:0.08636);



END;