#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on March 29, 2024; 7:29 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Weimin Y., Giblin-davis R., Braasch H., Morris K., & Thomas W. 2004. Phylogenetic relationships among Bursaphelenchus species (Nematoda: Parasitaphelenchidae) inferred from nuclear ribosomal and mitochondrial DNA sequence. Molecular Phylogenetics and Evolution, null. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S1109] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=37; TAXLABELS Aphelenchoides_besseyi Bursaphelenchus_abietinus Bursaphelenchus_abruptus Bursaphelenchus_borealis Bursaphelenchus_cocophilus_140_CR Bursaphelenchus_cocophilus_144_HOD Bursaphelenchus_eggersi Bursaphelenchus_fraudulentus_148_HUN Bursaphelenchus_fraudulentus_150_Krasnojarsk_RU Bursaphelenchus_fraudulentus_151_Zusmarshausen_DE Bursaphelenchus_fungivorus_153_Dresden_DE Bursaphelenchus_hellenicus Bursaphelenchus_hofmanni Bursaphelenchus_hylobianum Bursaphelenchus_mucronatus_163_JP Bursaphelenchus_mucronatus_164_Hanestad_NOR Bursaphelenchus_mucronatus_165_FN Bursaphelenchus_mucronatus_166_DE Bursaphelenchus_mucronatus_167_Gruenberg_DE Bursaphelenchus_mucronatus_168_Zusmarshausen_DE Bursaphelenchus_paracorneolus Bursaphelenchus_poligraphi Bursaphelenchus_seani_174_California_USA Bursaphelenchus_seani_175_California_USA Bursaphelenchus_seani_176_California_USA Bursaphelenchus_sexdentati_177_GR Bursaphelenchus_sexdentati_178_DE Bursaphelenchus_sexdentati_179_GR Bursaphelenchus_sexdentati_180_IT Bursaphelenchus_sp._ex_Carpophilus_humeralis Bursaphelenchus_sp._ex_Halictidae Bursaphelenchus_sp._ex_Rhynchophorus_palmarum Bursaphelenchus_tusciae Bursaphelenchus_xylophilus_185_CAN Bursaphelenchus_xylophilus_186_JP Bursaphelenchus_xylophilus_187_New_Brunswick_CAN Bursaphelenchus_xylophilus_188_Quebec_CAN ; END; BEGIN TAXA; TITLE Taxa2; DIMENSIONS NTAX=27; TAXLABELS Aphelenchoides_besseyi Bursaphelenchus_abietinus Bursaphelenchus_abruptus Bursaphelenchus_borealis Bursaphelenchus_cocophilus Bursaphelenchus_eggersi Bursaphelenchus_fraudulentus_150_Krasnojarsk_RU Bursaphelenchus_fraudulentus_151_Zusmarshausen_DE Bursaphelenchus_fungivorus Bursaphelenchus_hellenicus Bursaphelenchus_hofmanni Bursaphelenchus_hylobianum Bursaphelenchus_mucronatus_163_JP Bursaphelenchus_mucronatus_165_FN Bursaphelenchus_mucronatus_167_Gruenberg_DE Bursaphelenchus_mucronatus_168_Zusmarshausen_DE Bursaphelenchus_paracorneolus Bursaphelenchus_poligraphi Bursaphelenchus_seani_175_California_USA Bursaphelenchus_seani_176_California_USA Bursaphelenchus_sexdentati_179_GR Bursaphelenchus_sexdentati_180_IT Bursaphelenchus_sp._ex_Carpophilus_humeralis Bursaphelenchus_sp._ex_Halictidae Bursaphelenchus_sp._ex_Rhynchophorus_palmarum Bursaphelenchus_tusciae Bursaphelenchus_xylophilus ; END; BEGIN TAXA; TITLE Taxa3; DIMENSIONS NTAX=5; 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TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M782] TITLE Sexdentati_COI; LINK TAXA = Taxa3; DIMENSIONS NCHAR=627; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M783] TITLE Sexdentati_28S; LINK TAXA = Taxa3; DIMENSIONS NCHAR=725; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M785] TITLE Xylophilus_28S; LINK TAXA = Taxa5; DIMENSIONS NCHAR=729; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Bursaphelenchus_eggersi 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Bursaphelenchus_hofmanni 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Bursaphelenchus_mucronatus_168_Zusmarshausen_DE 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AAGAGAGTGCAAGAGAACGTGAAACCGGTGTAATGGAAGCGAATGGAGCCGACGTATCTATGTGCGTATTCAGCGGAGTCGTTTCGATGGCCAGTGTCGGGTTTTTAAGGTCTTCTGCAAAGTGTCCGCCCGCGCTTCCGGTTGTCGGCGGTCT--TTGTGCATTTGCGTACGGAGTGCGTCGAGT-GCGTGGTTGCGGCGGACGAACCGC-GCTTAGAGGT---GGTGTTCTTCGCGGAACGCAAAACCTGAGCGTTTCGGCGAGTCCGACTTGCGGCTACGTTGCGCGTTTTTTTGAGGACGGTGGTTGGGTTCGCGTGTCGGGCGTTGTGCTTGATTCCGCTGGCCTTCGTGCACATGTGTACGTGGCTTGTTTTCGGGGTTAGGCG-CGCGTTCGACGTGCTCTCTTCCGTTCGTCTCGACGTCCAGTCGGTGACCCATTCGACCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTTTATGGTATACGCGAGTCATTGGGCTTA----CGAAACCCAAAGGCGTAATGAAAGTGAGATCTTATTGGTTT-TAATGTGATCGGTTGTTGTTTCGACGGCAGCCGAGCAACATTGCCCCGTTTCGAGGACTTGTCCTGTTGCGGAGGTTGAGCGTATGCTATGAGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGAACAGGATGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAAGTCCGAAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCTGATTTTGGTATAGGGGCGCAAGACTAATCGAACCATCGGGGTTGGAATGTTCCTATTGGTCCCGAATAGTTCCCGTAAAATAGTTTGTTCCACTCTTTTTGAGCTGTGTGAATGGAGGGACAGTGACGTTACCCCTAG--ACTGGCACCGGAGAGGTGATGCATTTAGTCAGGCGGGCAGTCATTGGGGATAATTATTGACACAAAATCGAGAGTCATACTGACATAGTTTGTTGACATTTGTACGTTTTTGTTTCTCCGTTGCGGGCATACATTTCGACGAATAAACTCTTTTGACCAGATGGGGAACCTTTACACATTTTGTTTTGGCACCGAGTTAATTATTCCGCTTGGATATAGCAAGACTTATACGGAAAAGAGTTTGGACTGGATGTTAGCATTAGATGGTATGGTGATGCATGTCTAAGTGGAGTAT-TATAAAGCGAAACTGCGAACGGCTCATTACAACAGATATAATTTACTAGTTCTTG--AACCTACATGGATAACTGCGGTAATTCTGGAGCCAA-TACACGCATCAGGCCCGGGGCCTTCGGGTTTCGGGCGCGATTATTGGAGCAAAACCGGTC-TTTGTACTGT-TTGCTAACTCGGGATAATTCTGCATATCGCATGGTCTTTGTGCCGGCGAAGTTTCTTTCAAGTATCTGCTTTATCAACTTTCGTTGGTAGTTTATTGGTCTACCATGGTGTTGACGGGTAACGGAGAATCAGGGTTTGACTCCGGAGAGGGAGCCTTAGAAACGGCTACCATGTCTAAGGATAGCAGCAGGCGCGAAAATTACCCAATATCAAAGCGATGAGGTAGTGACGAGAAATAACAAGATCGTTCTCGATGAGATCGATTATTGGAATGAGTACAATCCAGACAATTTAACGAGTACCTACGAGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCTCGTAATGTATAGAATTATTGTTGCGATTAAAAAGTTCGTAGTTGGATTGCAACGAGTGTATGGGTCCATCTTCGTGGTGCGTACTCAATGCGCTCATTTTGCTTGTTTTTGCGGCGTTCGGCCTCCTTCGCGTGGTGGGCGTTCGTGATGCAAGCAGGATTACTTTGAACGGCTCAAGTGCTTTAAGCAAGTCTTACGACTGAATACCGGTGCATGGAATAATGGAACAAGGTTGTGGCTGAGTTTTATTGGTTTTGTCGGCTGAAACAATGGTTAACAGGAACAGCCGGGGGCATTCGTATCGCTGCGCGAGAGGTGAAATTCGTGGACCGTAGCGAGACGTCCGACAGCGAAGGCATTTGCCAAGAGTGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTCAGAGGTTCGAAGGCGATTAGATACCGCTCTAGTTCTGACCGTAAACGATGCCAACTGTCGATCCGCTCGTGGATTCAATTCATGAGCGGGGAGATTTCCGGAAACGAAAGTTTTTCGGTTTCGGGGGAAGTATGGTTGCAAAGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCTTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAATCTCACCCGGCCAGTACATTGTGAGGATTGACAGACTGACAGCTCTTTCATGATTCGGTGAATGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTCGTG--GATTGATTTGTCTGGTT-ATTCCGATAACGAACGAGACTTTAACTGTTAAATAGTGCGCGGGTTGGCTTTGCGGCTTGCCCGCGAT-CACTTCTTAAAGGAATTTGTGGTGTTTAACCTCAAGAAATTGAGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCGGGGCCGCACGCGTGCTACAATGATGGTAACAGCGTGATTGTCCTTTTCCGCGAGGAATCGGCAAACAGTTGAGATATTATTATGGCTGGAATTGAGTGTTGTAATTTTCTCTCATGAACGAGGAATTCCAAGTAAATGTGAGTCATTAACTTGCATTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTGCCCGGGACTGAGTTACTTCGAGAAAGCTAGGGATCGCCGCAGTTCCTCGATGCCTTTACGGTATCGGCTGTGGTGCGAACTAGTTTGATCGCAGTGGCTTGAACCGGGCAAAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAG 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Bursaphelenchus_tusciae 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AAGAGAGTGCAAGAGAACGTGAAACCGGTGTAATGGAAGCATATGGAGTTGACGTATCTG-GTACGTATTCAGTCGTCGGCG----GTCGTGATTGCCGGGCGTGGTA----TTCCGCAAGGTT--GCCCGTTTGGTATTGTTGCGGTCGTTGATGGTGCATTTGCGTGCGGAGTGCGCCGAGTCGTGTGCTGGTGTCGATCGAAACTG-CTCGAGAGGACATGA-CT--TCG--GTCGTGAAACCTTGTGCG----GTGGAGGTTGG-TTGCCGGTGCGCGGT-----TTCGTGGAAGTG----CGGGT-TTTTCGCGTGCTTGTATGT---CGATTGGGCCGGTTCGTGTT-GTACGCTTGCGTGCGGCGCTTATGGGTTTAGTCG-GTGTGCGGGTGT-GCTCTG---CGCTCTTCTCGGTGTATAGTCAATGACCCATTTGACCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTTTATGGTATACGCGAGTCATTGGGTAT----ACGAAACTCAAAGGCGAAATGAAAGTGAGACCTTACTGGTTT-TAATGTGAACGGCTGGTGTTTCGACGTCGACCGTGCAACATTGCCCCGTTTCGAGGACTTGTCCTGTTGCGGAGGTTGAGCGTATGCTATGAGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGTACAGGATGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAAGTCCGAAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCTGATATTGGTATAGGGGCGCAAGACTAATCGAACCATC Bursaphelenchus_hylobianum AAGAGAGTGCAAGAGAACGTGAAACCGGTGTAATGGAAGCATATGGAGTTGACGTATCTG-GTGCGTATTCAGTTGTAGAGC----GTTGTGATTGCTGTGTATGTTA----TTCCGCAAGGTT--GACTGCGCGGTATTGTTGCGACGTTTTGCGATGCATTTACGTACGGAGTGCGCCGAGTAGCGCGGTGGTGTCAATCGAAGACG-GCTAAGAGGACATGT-CT--TCG--GATGTGAAACCTTGACTG----TTCGAGGTTGG-TTGCTGCTGCGTTAC-----TATGTGGAGGCA----TGGGAACTTTCGCGCGTAGGTGCAT---TGATTTGGTCGGTTTGTGTT-GTACGCTTGCGTGCTGCGCTTATGGGCTTGGTCG-ATGTGTTAGTGT-GCTCTA---TGCTCTTCTCGGTGTATAGTCAATGACCCATTTGACCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTTTATGGTATACGCGAGTCATTGGGCTT----T-TAAACCCAAAGGCGTAATGAAAGTGAGATCTTATTGGTTT-TAATGTGATCGGCTGCTGTTTCGACGGCTACCGTGCAACATTGCCCCGTTTCGAGAACTTGTTCTGTTGCGGAGGTTGAGCGTATGCTATGAGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGAACAGGATGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAAGTCCGAAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCTGATTTTGGTATAGGGGCGCAAGACTAATCGAACCATC Bursaphelenchus_mucronatus_163_JP AAGAGAGTGCAAGAGAACGTGAAACCGGTGTAATGGAAGCGAATGGAGCCGACGTATCTA-GTGCGTATTCAGCCTTCTGGG----CGTACGATTGGGGTTTGTGCAT----TTCCGCAAGGT--GTGCCGGGTCCTATTGTCGTGCGTTCGGTTGGTGCATTTGCGTACGGAGTGCGCCGGGTTGTGTGGTGTTGTCGGACGATGCGC-GTTTAGAGGACCCGGGCT--TCG-GCGCTGGGAACCCTGGGCG---TGCGGAGTTCGG-TTGGCGCTGCGCAGC-----TTTGTGGAGACG----TGGGT-TTTTCGCGTGCTGCGGTGT---CGGCAGGCTCGGTTTGGGTG-GTACACATGTGTGCAGCCCTTATCGGGTGGGTCG-GTGTTGTGGTGT-GCTCTA---CGTTCTTCCCGGTGTTCAGTCGGTGACCCATTCGACCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTTTATGGTATGCGCAAGTCATTGGGTTTG---TCGAAGCCTAAAGGCGTAATGAAAGTGAGACATTACTTGTCT-GAACGTGACTGGGTGCGGCACTCGTGCGGCCCAAGCAACGTTGCCCCGTTTCGAGGACTTGTCCTGATGCGGAGGTTGAGCGTATGCTATGAGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGAACAGGACGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAAGTCCGAAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCTGATTTTGGTATAGGGGCGCAAGACTAATCGAACCATC Bursaphelenchus_mucronatus_164_Hanestad_NOR AAGAGAGTGCAAGAGAACGTGAAACCGGTGTAATGGAAGCGAATGGAGCCGACGTATCTA-GTGCGTATTCAGCCTTCTGGG----CGTGCGATTGGGGTTTGTGCAT----TTCCGCAAGGT--GTGCCTGGCCTTATTGTCGTGCGTTCGGTTGGTGCATTTGCGTACGGAGTGCGCCGGGTTGTGTGGTGTTGTCGGACGATGCGC-GTTTAGAGGACCCGGGCT--TCG-GCGCTGGGAACCCTGGGCG---TGCGGAGTTCGG-TTGGCGCTGCGCAGC-----TTTGTGGAGACG----TGGGT-TTTTCGCGTGCCGCGGTGT---CGACAGGCTCGGTTCGGGTG-GTACACATGTGTGCAGCCCTTATGGGGTCGGTCG-GTGTTGTGGTGT-GCTCTA---CGTTCTTCCCGGTGTTCAGTCGGTGACCCATTCGACCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTTTATGGTATGCGCAAGTCATTGGGTTTG---TCGAAGCCTAAAGGCGTAATGAAAGTGAGACATTACTTGTCT-GAACGTGACTGGGTGCGGCATTCGTGCGGCCCAAGCAACGTTGCCCCGTTTCGAGGACTTGTCCTGATGCGGAGGTTGAGCGTATGCTATGAGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGAACAGGACGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAAGTCCGAAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCTGATTTTGGTATAGGGGCGCAAGACTAATCGAACCATC Bursaphelenchus_mucronatus_165_FN 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AAGAGAGTGCAAGAGAACGTGAAACCGGTGTAATGGAAGCGAATGGAGCCGACGTATCTA-GTGCGTATTCAGCCTTCTGGG----CGTACGATTGGGGTTTGTGCAT----TTCCGCAAGGT--GTGCCGGGTCCTATTGTCGTGCGTTCGGTTGGTGCATTTGCGTACGGAGTGCGCCGGGTTGTGTGGTGTTGTCGGACGATGCGT-GTTTAGAGGACCCGGGCT--TCG-GCGCTGGGAACCCTGGGCG---TGCGGAGTTCGG-TTGGCGCTGCGCAGC-----TTTGTGGAGACG----TGGGT-TTTTCGCGTGCTGCGGTGT---CGGCAGGCTCGGTTTGGGTG-GTACACATGTGTGCAGCCCTTATCGGGTGGGTCG-GTGTTGTGGTGT-GCTCTA---CGTTCTTCCCGGTGTTCAGTCGGTGACCCATTCGACCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTTTATGGTATGCGCAAGTCATTGGGTTTG---TCGAAGCCTAAAGGCGTAATGAAAGTGAGACATTACTTGTCT-GAACGTGACTGGGTGCGGCACTCGTGCGGCCCAAGCAACGTTGCCCCGTTTCGAGGACTTGTCCTGATGCGGAGGTTGAGCGTATGCTATGAGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGAACAGGACGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAAGTCCGAAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCTGATTTTGGTATAGGGGCGCAAGACTAATCGAACCATC Bursaphelenchus_paracorneolus 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AAGAGAGTGCAAGAGAACGTGAAACCGACGTTATGGAAGCATATGGAGTTGACGTATCTG-GTGCGTATTCAGTTGTTGGGC----TTTTCGATTGCTTAGTGTGCTA----TTCCGCAAGGTT--GGCTGCTTTGTATTGTCGAATGGTTTGGCGATGCATTTACGTACGGAGTGCGCCGAGTTGTGCGGTGGTGTCAGTCGACGTTG-GTTGAGAGGACATGA-CT--TCG--GTTGTGAACCCTCGGTTG----GCCTAGGCTGG-TTATTGCTGCGTAAC-----TTCGTGGAGGCA----CGGGT-TTTTCGCGCGGTGCGGCGC---CGATTTGGCTTATTTACCTT-GTACGCATGCGTCCTGGGTTTATCGGTTAGGTCG-GTGTGGTATTGT-GCTCTG---TGCTCTTCTCGGTGTATAGTCAATGACCCATTTGACCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTTTATGGTATACGCAAGTCATTGGGCTT----TCTAAACCCAAAGGCGTAATGAAAGTGAGATCTTATTGGTTT-TAATGTGATCGGTCGTTGTTTCGACGGCGGCCGAGCAACATTGCCCCGTTTCGAGGACTTGTCCTGTTGCGGAGGTTGAGCGTATGCTATGAGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGAACAGGATGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAAGTCCGAAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCTGATTTTGGTATAGGGGCGCAAGACTAATCGAACCATC Bursaphelenchus_seani_174_California_USA 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AAGAGAGTGCAAGAGAACGTGAAACCGGTGTAATGGAAGCGAATGGAGCCGACGTATCTG-GTGTGTATTCAGTCGTGCGGG----TGCGTGATTGCTAGCTCCCACA----TTCCGCAAGGTT--GTGGTGTTGGTATTGTTTGCGTGTCGTGCGATGCATTTGCATACGGAGTGCGCTGAGTCGTGTGGTTTCGTCGATTGACGCCG-TTTAAGAGGACATGG-CT--TTG--GTCGTGAAACCTTGGACG----GTCTAAGTCGG-TTGGAGCTACACGAT-----TTTGTGGGTTCG----TTGTT--TTGCGCGGTTTGTCGTGT---CGATGCCGCCTGTTCGTGAC-GTACACATGTGTGCTGCGCTTATGGGTTGTGTCG-GTGTGGCGGCGT-GCTCGG---CGGCCTTCTCAGTGTATAGTCGGTGACCCATTCGACCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTTTATGGTATGCGCGAGTCATTGGGCTT----T-GAAACCCATAGGCGTAATGAAAGTGAGACCTTATTGGTTT-TAATGTGATCGGTTGTTGTTTCGACGGCTGCCGAGCAACATTGCCCCGTTTCGAAGACTTGTCTTGTTGCGGAGGTTGAGCGTATGCTATGAGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGAACAGGACGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAAGTCCGAAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCTGATTTTGGTATAGGGGCGCAAGACTAATCGAACCATC Bursaphelenchus_sp._ex_Halictidae 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Bursaphelenchus_abruptus 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Bursaphelenchus_hylobianum 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Bursaphelenchus_sexdentati_179_GR 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ATGCATGTCTAAGTGGAGTAT-TATACAGCGAAACTGCGAACGGCTCATTACAACAGATATAATTTACTAGTTCTTG--TTCCTATATGGATAACTGCGGTAATTCTGGAGCCAA-TACATGCATCAAGCCGCGGCCCTTCGGGATCGTGGTGCAATTATTGGAGCAAAACCAGTC-TT-GTACTGT-TTGCTAACTCTGGATAATTCTGCTTATCGCATGGTCTT-GTACCGGCGAAGTTTCTTTCAAGTATCTGCTTTATCAACTATCGTTGGTAGTTTATTGGACTACCATGGTGTTGACGGGTAACGGAGAATCAGGGTTTGACTCCGGAGAGGGAGCCTTAGAAACGGCTACCATGTCTAAGGATAGCAGCAGGCGCGAAAATTACCCAATATCAAAACGATGAGGTAGTGACGAGAAATAACGAGATCGTTCTCTTTGAGGTCGATTATTGGAATGAGTACAATCCAGACATTTTAACGAGTATCTACGAGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCTCGTAATGTATAGAATTATTGTTGCGATTAAAAAGTTCGTAGTTGGATTGTCACGCAGACATGGGTCCACCTTCGTGGTGCGTACTCAATGTTTGCATTTTGTTGGTTTTCGTTTTGT-----------CGTTTC-GGCGACACT-ATGATGCCAGCAGGATTACTTTGAACGGCTCAAGTGCTTAAAGCGAGTCTTATGACTGAATACCGGTGCATGGAATAATGGAACAAGGTTGCGGCCGAGTTTTATTGGTTTTGTCGGCTGAAACAATGGTTAACAGGAACAGCCGGGGGCATTCGTATCGCTGCGCGAGAGGTGAAATTCGTGGACCGTAGCGAGACGCCCGACAGCGAAGGCATTTGCCAAGAGTGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTCAGAGGTTCGAAGGCGATTAGATACCGCCCTAGTTCTGACCGTAAACGATGCCAACTGTCGATCCGCTCTTGGATCTAATTCTTGAGCGGGGAGATTCCCGGAAACGAAAGTTTTTCGGTTTCGGGGGAAGTATGGTTGCAAAGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCTTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAATCTCACCCGGCCAGTACATCGTGAGGATTGACAGACTGACAGCTCTTTCATGATTCGGTGAATGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTCGTG--GATTGATTTGTCTGGTTTATTCCGATAACGAGCGAGACTTTAACTATTAAATAGTGCACTTGTTA--T-TAT----TGCGAGTGAA-CACTTCTTAAAGGAATTTGTGGTTTCCAACCTCAAGAAATTGAGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCGGGGCCGCACGCGTGCTACAATGGTGGTAACAGCGTGATTGTCCTTTTCCGACAGGAATTGGCAAACAGTTGAGATATTATTATGGCTGGAATTGAGTGTTGAAATTTTCTCTCATGAACGAGGAATTCCAAGTAAATGTGAGTCATTAACTTGCATTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTGCCCGGGACTGAGTTACTTCGAGAAAACTAGGGATTGTTGATGTTC---GATGTTT---CGGCATTGTCTTTGATGCGAACTAGTTTAATCGCAGTGGCTTGAACCGGGCAAAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAG 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; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = 18S) = N: 1-1741; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = 18S) = N: 1-1741; END; BEGIN TREES; TITLE Tb6762; LINK TAXA = Taxa5; TRANSLATE 1 Bursaphelenchus_xylophilus_188_Quebec_CAN, 2 Bursaphelenchus_xylophilus_187_New_Brunswick_CAN, 3 Bursaphelenchus_xylophilus_186_JP, 4 Bursaphelenchus_xylophilus_185_CAN, 5 Bursaphelenchus_mucronatus_168_Zusmarshausen_DE, 6 Bursaphelenchus_mucronatus_167_Gruenberg_DE, 7 Bursaphelenchus_mucronatus_166_DE, 8 Bursaphelenchus_mucronatus_165_FIN, 9 Bursaphelenchus_mucronatus_164_Hanestad_NOR, 10 Bursaphelenchus_mucronatus_163_JP, 11 Bursaphelenchus_fraudulentus; TREE Fig._4a = [&R] (((((3,2),1),4),(((8,7),9),((5,10),6))),11); END; BEGIN TREES; TITLE Tb6759; LINK TAXA = Taxa7; TRANSLATE 1 Bursaphelenchus_xylophilus_188_Quebec_CAN, 2 Bursaphelenchus_xylophilus_187_New_Brunswick_CAN, 3 Bursaphelenchus_xylophilus_186_JP, 4 Bursaphelenchus_xylophilus_185_CAN, 5 Bursaphelenchus_tusciae, 6 Bursaphelenchus_sp._ex_Rhynchophorus_palmarum, 7 Bursaphelenchus_sp._ex_Halictidae, 8 Bursaphelenchus_sp._ex_Carpophilus_humeralis, 9 Bursaphelenchus_sexdentati_180_IT, 10 Bursaphelenchus_sexdentati_179_GR, 11 Bursaphelenchus_sexdentati_178_DE, 12 Bursaphelenchus_sexdentati_177_GR, 13 Bursaphelenchus_seani_176_California_USA, 14 Bursaphelenchus_seani_175_California_USA, 15 Bursaphelenchus_seani_174_California_USA, 16 Bursaphelenchus_poligraphi, 17 Bursaphelenchus_paracorneolus, 18 Bursaphelenchus_mucronatus_168_Zusmarshausen_DE, 19 Bursaphelenchus_mucronatus_167_Gruenberg_DE, 20 Bursaphelenchus_mucronatus_166_DE, 21 Bursaphelenchus_mucronatus_165_FIN, 22 Bursaphelenchus_mucronatus_164_Hanestad_NOR, 23 Bursaphelenchus_mucronatus_163_JP, 24 Bursaphelenchus_hylobianum, 25 Bursaphelenchus_hofmanni, 26 Bursaphelenchus_hellenicus, 27 Bursaphelenchus_fungivorus, 28 Bursaphelenchus_fraudulentus_151_Zusmarshausen_DE, 29 Bursaphelenchus_fraudulentus_150_Krasnojarsk_RU, 30 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