#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 20, 2024; 3:26 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Nosratinia S., Shevock J.R., & Mishler B. 2011. Phylogenetic relationships of Yunnanobryon (Musci: Regmatodontaceae). The Bryologist, 114. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S11618] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=237; TAXLABELS Abietinella_abietina Acrocladium_auriculatum Acroporium_pungens Actinothuidium_hookeri Aerobryidium_aureonitens Aerobryum_speciosum Aerolindigia_capillacea Alsia_californica Amblystegium_serpens Andoa_berthelotiana Anomodon_viticulosus Aptychella_proligera Aptychopsis_pyrrophylla Baldwiniella_kealeensis Barbellopsis_trichophora Benitotania_elimbata Bissetia_lingulata Boulaya_mitteni Brachelyma_subulatum Braithwaitea_sulcata Brotherella_recurvans Bryoandersonia_illecebra Bryocrumia_andersonii Bryonorrisia_acutifolia Bryostreimannia_turgida Callicladium_haldanianum Calliergon_cordifolium Calliergonella_cuspidata Calyptothecium_praelongum Camptochaete_arbuscula Campyliadelphus_stellatus Campylophyllum_halleri Caribaeohypnum_polypterum Catagoniopsis_berteroana Catagonium_nitens Chaetomitriopsis_glaucocarpa Chaetomitrium_borneense Chionostomum_rostratum Circulifolium_microdendron Cirriphyllum_cirrosum Claopodium_whippleanum Clastobryophilum_bogoricum Clastobryopsis_planula Clastobryum_tenuirameum Colobodontium_vulpinum Conardia_compacta Cratoneuron_filicinum Cratoneuropsis_relaxa Crosbya_straminea Cryptoleptodon_longisetus Cryptopapillaria_penicillata Ctenidium_molluscum Curvicladium_kurzii Cyathophorum_bulbosum Cyptodon_muelleri Cyptodontopsis_obtusifolia 'Cyrto-hypnum schistocalyx' Dendroalsia_abietina Dendrocryphaea_cuspidata Dendropogonella_rufescens Dichelyma_falcatum Dimerodontium_balansae Dimorphocladon_borneense Dixonia_thamnioides Dolichomitra_cymbifolia Dolichomitriopsis_diversiformis Donnellia_commutata Dozya_japonica Ectropothecium_leptochaeton Elmeriobryum_philippinense Eriodon_conostomus Erythrodontium_longisetum Eulacophyllum_cultelliforme Eurhynchiella_acanthophylla Eurohypnum_leptothallum Fabronia_pusilla Fauriella_tenuis Foreauella_orthothecia Forsstroemia_trichomitria Garovaglia_elegans Gradsteinia_andicola Habrodon_perpusillus Hamatocaulis_vernicosus Handeliobryum_sikkimense Haplohymenium_triste Helodium_blandowii Henicodium_geniculatum Herpetineuron_toccoae Heterophyllium_affine Homalia_trichomanoides Homaliodendron_flabellatum Hookeria_acutifolia Horikawaea_redfearnii Horridohypnum_mexicanum Hydropogon_fontinaloides Hygrohypnum_smithii Hylocomiastrum_pyrenaicum Hylocomiopsis_cylindracarpa Hylocomium_splendens Hymenodon_pilifer Hypnobartlettia_fontana Hypnum_cupressiforme Ischyrodon_lepturus Isocladiella_surcularis Isodrepanium_lentulum Isothecium_myosuroides Jaegerina_scariosa Juratzkaeella_sinensis Lembophyllum_divulsum Leptodictyum_riparium 'Leptopterigynandrum austro-alpinum' Lepyrodontopsis_trichophylla Lescuraea_radicosa Leskeadelphus_bolivianus Leskeella_nervosa Leucodon_sciuroides Leucomium_strumosum Levierella_fabroniacea Limbella_tricosta Lindbergia_brachyptera Lindigia_aciculata Loeskeobryum_brevirostre Macrothamnium_macrocarpum Mahua_enervis Mesochaete_undulata Mesonodon_flavescens Metaneckera_menziesii Meteoridium_remotifolium Meteoriella_soluta Meteorium_illecebrum Mittenothamnium_reptans Muellerobryum_whiteleggei Myurium_hochstetteri Myuroclada_maximowiczii Neckera_pennata Neodicladiella_pendula Neodolichomitra_yunnanensis Neolindbergia_cladomnioides Noguchiodendron_sphaerocarpum Oedicladium_doii Okamuraea_hakoniensis Orthorrhynchium_elegans Orthostichella_pentasticha Orthostichidium_involutifolium Orthostichopsis_tetragona Orthotheciella_varia Orthothecium_chryseum Oxyrrhynchium_rugosipes Palamocladium_leskeoides Palisadula_chrysophylla Papillidiopsis_complanata Paranapiacabaea_paulista Penzigiella_cordata Phyllodon_truncatulus Phyllogonium_fulgens Pilotrichopsis_dentata Pinnatella_piniformis Pireella_angustifolia Plagiothecium_cavifolium Platygyriella_aurea Platyhypnidium_riparioides Platylomella_lescurii Pleuroziopsis_ruthenica Pleurozium_schreberi Porothamnium_arbusculans Porotrichodendron_nitidum Porotrichopsis_flacca Porotrichum_longirostre Potamium_lonchophyllum Pseudocalliergon_angustifolium Pseudocryphaea_domingensis Pseudoleskea_andina Pseudoleskeella_tectorum Pseudoleskeopsis_imbricata Pseudotaxiphyllum_elegans Pseudotrachypus_martinicensis Pseudotrismegistia_perundulata Pterigynandrum_filiforme Pterobryella_praenitens Pterobryopsis_stolonacea Pterogonidium_pulchellum Pterogoniopsis_cylindrica Pterogonium_gracile Ptychodium_plicatum Puiggariopsis_aurifolia Pulchrinodus_inflatus Pylaisia_polyantha Racopilum_cuspidigerum Radulina_borbonica Rauiella_lagoensis Regmatodon_declinatus Renauldia_mexicana Rhacopilopsis_trinitensis Rhaphidostichum_schwaneckeanum Rhizogonium_pennatum Rhynchostegium_serrulatum Rhytidiadelphus_triquetrus Rhytidium_rugosum Rigodiadelphus_robustus Rigodium_toxarion Rozea_pterogonioides Rutenbergia_madagassa Sauloma_tenella Schimperobryum_splendidissimum Schofieldiella_micans_Isolate Schroeterella_zygodonta Schwetschkea_grateloupii Scleropodium_obtusifolium Scorpidium_scorpioides Sematophyllum_demissum Sphaerotheciella_sphaerocarpa Spiridentopsis_longissima Steerecleus_serrulatus Stenocarpidiopsis_salicicola Stereophyllum_radiculosum Struckia_argentata Symphyodon_imbricatifolius Symphysodontella_cylindracea Taiwanobryum_speciosum Taxiphyllopsis_iwatsukii Thamniopsis_incurva Thuidiopsis_furfurosa Toloxis_imponderosa Tomentypnum_falcifolium Trachybryum_megaptilum Trachyloma_planifolium Trachyphyllum_gastrodes Trachypodopsis_serrulata Trachypus_bicolor Tripterocladium_leucocladulum Vesicularia_vesicularis Vittia_pachyloma Warburgiella_leucocytus Warnstorfia_exannulata Weymouthia_mollis Wijkia_extenuata Yunnanobryon_sp. ; END; BEGIN TAXA; TITLE Taxa2; DIMENSIONS NTAX=19; TAXLABELS Bryonorrisia_acutifolia Dimerodontium_balansae Ectropothecium_leptochaeton Foreauella_orthothecia 'Leptopterigynandrum austro-alpinum' Leskeadelphus_bolivianus Leskeella_nervosa Lindbergia_brachyptera Pseudoleskeella_tectorum Pseudoleskeopsis_imbricata Regmatodon_declinatus Regmatodon_filiformis Regmatodon_orthostegius Rhytidium_rugosum Vesicularia_vesicularis Yunnanobryon_rhyacophilum_1 Yunnanobryon_rhyacophilum_2 Yunnanobryon_rhyacophilum_3 Yunnanobryon_rhyacophilum_4 ; END; BEGIN TAXA; TITLE Taxa3; DIMENSIONS NTAX=20; TAXLABELS Bryonorrisia_acutifolia Dimerodontium_balansae Ectropothecium_leptochaeton Foreauella_orthothecia 'Leptopterigynandrum austro-alpinum' Leskeadelphus_bolivianus Leskeella_nervosa Lindbergia_brachyptera Pseudoleskeella_tectorum Pseudoleskeopsis_imbricata Regmatodon_declinatus Regmatodon_filiformis Regmatodon_orthostegius_India Regmatodon_orthostegius_Malawi Rhytidium_rugosum Vesicularia_vesicularis Yunnanobryon_rhyacophilum_1 Yunnanobryon_rhyacophilum_2 Yunnanobryon_rhyacophilum_3 Yunnanobryon_rhyacophilum_4 ; END; BEGIN TAXA; TITLE Taxa4; DIMENSIONS NTAX=237; TAXLABELS Abietinella_abietina_AY907953 Acrocladium_auriculatum_AY306854 Acroporium_pungens_AY908207 Actinothuidium_hookeri_AY908335 Aerobryidium_aureonitens_AY306857 Aerobryum_speciosum_AY306861 Aerolindigia_capillacea_AY908303 Alsia_californica_AY908258 Amblystegium_serpens_AY908237 Andoa_berthelotiana_AY908179 Anomodon_viticulosus_AY908201 Aptychella_proligera_AY908228 Aptychopsis_pyrrophylla_AY908212 Baldwiniella_kealeensis_AY908590 Barbellopsis_trichophora_AY908288 Benitotania_elimbata_AY449661 Bissetia_lingulata_AY908352 Boulaya_mitteni_AY908338 Brachelyma_subulatum_AF306998 Braithwaitea_sulcata_AY524469 Brotherella_recurvans_AY908227 Bryoandersonia_illecebra_AY908317 Bryocrumia_andersonii_AY908196 Bryonorrisia_acutifolia_AY908553 Bryostreimannia_turgida_AY908556 Callicladium_haldanianum_AY908561 Calliergon_cordifolium_AF469844 Calliergonella_cuspidata_AY908183 Calyptothecium_praelongum_AY908594 Camptochaete_arbuscula_AY306934 Campyliadelphus_stellatus_AY908248 Campylophyllum_halleri_AY908252 Caribaeohypnum_polypterum_AY908347 Catagoniopsis_berteroana_AY908200 Catagonium_nitens_AF307003 Chaetomitriopsis_glaucocarpa_AY908603 Chaetomitrium_borneense_AY306880 Chionostomum_rostratum_AY908210 Circulifolium_microdendron_AY908268 Cirriphyllum_cirrosum_AY908310 Claopodium_whippleanum_AY908294 Clastobryophilum_bogoricum_AY908208 Clastobryopsis_planula_AY908229 Clastobryum_tenuirameum_AY908230 Colobodontium_vulpinum_AY908215 Conardia_compacta_AY908568 Cratoneuron_filicinum_AY908250 Cratoneuropsis_relaxa_AY908244 Crosbya_straminea_AY306887 Cryptoleptodon_longisetus_AY908260 Cryptopapillaria_penicillata_AY908292 Ctenidium_molluscum_AY907954 Curvicladium_kurzii_AY908266 Cyathophorum_bulbosum_AY306889 Cyptodon_muelleri_AY908586 Cyptodontopsis_obtusifolia_AY908588 'Cyrto-hypnum schistocalyx AY908336' Dendroalsia_abietina_AY908185 Dendrocryphaea_cuspidata_AY908587 Dendropogonella_rufescens_AY908562 Dichelyma_falcatum_AY908318 Dimerodontium_balansae_AY907952 Dimorphocladon_borneense_AY306898 Dixonia_thamnioides_AY907956 Dolichomitra_cymbifolia_AY908344 Dolichomitriopsis_diversiformis_AY908329 Donnellia_commutata_AY908211 Dozya_japonica_AY908262 Ectropothecium_leptochaeton_AY908558 Elmeriobryum_philippinense_AY908323 Eriodon_conostomus_AY908239 Erythrodontium_longisetum_AY908256 Eulacophyllum_cultelliforme_AY908197 Eurhynchiella_acanthophylla_AY908299 Eurohypnum_leptothallum_AY908203 Fabronia_pusilla_AY908199 Fauriella_tenuis_AY908233 Foreauella_orthothecia_AY908560 Forsstroemia_trichomitria_AM990365 Garovaglia_elegans_AY306915 Gradsteinia_andicola_AY908246 Habrodon_perpusillus_AY908293 Hamatocaulis_vernicosus_AY908251 Handeliobryum_sikkimense_AY908267 Haplohymenium_triste_AY908202 Helodium_blandowii_AY908339 Henicodium_geniculatum_AY908563 Herpetineuron_toccoae_AY908566 Heterophyllium_affine_AY908577 Homalia_trichomanoides_AY908276 Homaliodendron_flabellatum_AY908271 Hookeria_acutifolia_AY306929 Horikawaea_redfearnii_AY908600 Horridohypnum_mexicanum_AY908349 Hydropogon_fontinaloides_AY908216 Hygrohypnum_smithii_AY908620 Hylocomiastrum_pyrenaicum_AY908181 Hylocomiopsis_cylindracarpa_AY908342 Hylocomium_splendens_AY908280 Hymenodon_pilifer_AY908176 Hypnobartlettia_fontana_AY908245 Hypnum_cupressiforme_DQ467883 Ischyrodon_lepturus_AY908591 Isocladiella_surcularis_AY908204 Isodrepanium_lentulum_AY907964 Isothecium_myosuroides_AY306933 Jaegerina_scariosa_AY908601 Juratzkaeella_sinensis_AY908198 Lembophyllum_divulsum_AY306936 Leptodictyum_riparium_AY907967 'Leptopterigynandrum austro-alpinum AY908190' Lepyrodontopsis_trichophylla_AY907965 Lescuraea_radicosa_AY908326 Leskeadelphus_bolivianus_AY907948 Leskeella_nervosa_AY908325 Leucodon_sciuroides_AY908186 Leucomium_strumosum_AY306943 Levierella_fabroniacea_AY907961 Limbella_tricosta_AY908572 Lindbergia_brachyptera_AY907949 Lindigia_aciculata_AY908304 Loeskeobryum_brevirostre_AY908278 Macrothamnium_macrocarpum_AY908182 Mahua_enervis_AY908319 Mesochaete_undulata_AY631154 Mesonodon_flavescens_AY908255 Metaneckera_menziesii_AY908264 Meteoridium_remotifolium_AY306949 Meteoriella_soluta_AY306950 Meteorium_illecebrum_AY908187 Mittenothamnium_reptans_AY908346 Muellerobryum_whiteleggei_AY908602 Myurium_hochstetteri_AY908180 Myuroclada_maximowiczii_AY908309 Neckera_pennata_AY908265 Neodicladiella_pendula_AY908284 Neodolichomitra_yunnanensis_AY908297 Neolindbergia_cladomnioides_AY908194 Noguchiodendron_sphaerocarpum_AY907958 Oedicladium_doii_AY908592 Okamuraea_hakoniensis_AY908311 Orthorrhynchium_elegans_AY908612 Orthostichella_pentasticha_AY907962 Orthostichidium_involutifolium_AY908195 Orthostichopsis_tetragona_AY908192 Orthotheciella_varia_AY908238 Orthothecium_chryseum_AY907966 Oxyrrhynchium_rugosipes_AY908315 Palamocladium_leskeoides_AY908296 Palisadula_chrysophylla_AY908593 Papillidiopsis_complanata_AY908220 Paranapiacabaea_paulista_AY908218 Penzigiella_cordata_AY306972 Phyllodon_truncatulus_AY908604 Phyllogonium_fulgens_AY908193 Pilotrichopsis_dentata_AY908599 Pinnatella_piniformis_AY907963 Pireella_angustifolia_AY908565 Plagiothecium_cavifolium_AY908321 Platygyriella_aurea_AY908575 Platyhypnidium_riparioides_AY908298 Platylomella_lescurii_AY908337 Pleuroziopsis_ruthenica_AY908571 Pleurozium_schreberi_AY908281 Porothamnium_arbusculans_AY908277 Porotrichodendron_nitidum_AY908273 Porotrichopsis_flacca_AY908275 Porotrichum_longirostre_AY908274 Potamium_lonchophyllum_AY908221 Pseudocalliergon_angustifolium_AY908242 Pseudocryphaea_domingensis_AY908188 Pseudoleskea_andina_AY908257 Pseudoleskeella_tectorum_AY907950 Pseudoleskeopsis_imbricata_AY908582 Pseudotaxiphyllum_elegans_AY908578 Pseudotrachypus_martinicensis_AY306982 Pseudotrismegistia_perundulata_AY908618 Pterigynandrum_filiforme_AY908189 Pterobryella_praenitens_AF307002 Pterobryopsis_stolonacea_AY908595 Pterogonidium_pulchellum_AY908232 Pterogoniopsis_cylindrica_AY908213 Pterogonium_gracile_AY907970 Ptychodium_plicatum_AY908327 Puiggariopsis_aurifolia_AY908348 Pulchrinodus_inflatus_AY907975 Pylaisia_polyantha_AY907960 Racopilum_cuspidigerum_AY524477 Radulina_borbonica_AY908223 Rauiella_lagoensis_AY908340 Regmatodon_declinatus_AY908191 Renauldia_mexicana_AY908333 Rhacopilopsis_trinitensis_AY908225 Rhaphidostichum_schwaneckeanum_AY908222 Rhizogonium_pennatum_AY631170 Rhynchostegium_serrulatum_AY908301 Rhytidiadelphus_triquetrus_AY908279 Rhytidium_rugosum_AY907951 Rigodiadelphus_robustus_AY908569 Rigodium_toxarion_AY908331 Rozea_pterogonioides_AY907957 Rutenbergia_madagassa_AY908605 Sauloma_tenella_AY306987 Schimperobryum_splendidissimum_AY306988 Schofieldiella_micans_isolate_AY908235 Schroeterella_zygodonta_AY908209 Schwetschkea_grateloupii_AY908305 Scleropodium_obtusifolium_AY306989 Scorpidium_scorpioides_AY908584 Sematophyllum_demissum_AY908214 Sphaerotheciella_sphaerocarpa_AY908589 Spiridentopsis_longissima_AY908564 Steerecleus_serrulatus_AY908302 Stenocarpidiopsis_salicicola_AY908307 Stereophyllum_radiculosum_DQ467885 Struckia_argentata_AY908320 Symphyodon_imbricatifolius_AY306999 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Dimerodontium_balansae 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Ectropothecium_leptochaeton 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Foreauella_orthothecia 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'Leptopterigynandrum austro-alpinum' 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Rhytidium_rugosum 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Yunnanobryon_rhyacophilum_1 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Yunnanobryon_rhyacophilum_2 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Yunnanobryon_rhyacophilum_3 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Pseudoleskeella_tectorum 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Pseudoleskeopsis_imbricata 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Regmatodon_declinatus 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Regmatodon_filiformis 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Regmatodon_orthostegius 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Rhytidium_rugosum 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Vesicularia_vesicularis 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Yunnanobryon_rhyacophilum_1 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Yunnanobryon_rhyacophilum_2 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Yunnanobryon_rhyacophilum_3 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Yunnanobryon_rhyacophilum_4 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Leptodictyum_riparium_AY908713 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Oxyrrhynchium_rugosipes_AY908514 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Pterigynandrum_filiforme_AY908757 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Yunnanobryon_sp. 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Amblystegium_serpens 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Andoa_berthelotiana 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Anomodon_viticulosus 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Aptychella_proligera 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Aptychopsis_pyrrophylla ??????????????????????GGGAACTTTGCCAGGATTAACTAATAAAACACCCCAGTTAAAATCTAGTTCTAGCAATCAATCAACATCTAATAAAAAAATTTCTCAGTATCGCATTCGTTTGGAAGAAAAACAAAAATTACGTTTTCATTATGGAATAACAGAACGACAATTACTTAATTATGTCCGTATTGCTAGAAAAGCAAAAGGATCCACAGGTGAAATTTTATTACAATTACTTGAAATGCGTTTAGATAATATTATTTTTCGATTAGGTATGGCTCCTACGATTCCTGGAGCAAGACAATTAGTAAATCATAGACATATTTTAGTTAATGATTGTATGGTAGATATACCAAGTTATCGATGTAAACCTCAGGATTTTATTACTATTAAAAACCAACGGAAATCTGAAACTATAATTAATAAAAATATAGAATTTTATCAAAAATCTAAAATACCGAATCATTTAACTTATAATTCTTTAGAAAAAAAAGGATTGATTAATCAAATATTAGATCGTGAATCAATTGATTTAAAAATAAATGAATTATTAGTTGTAGAATATTATTCTCGTCAAGC--------------------TTAATTAAG---AATTAATAA-TATTTT--GCTATAAAAGCTATG-CTCGTCAATCGAGTAGGT-GATTTCGGATTAGCTCTCGGG-ATTATGGGTTGT-TTTACTATCTTCCAAACAGTAGACTTTTCGACTATTTTTGCTCGTGCCAGCGCCTTTTCCGAACCCCATCATTATTTTATTTTTTGCAATATGAGATTTCATGCCATAACTGTTATCTGTATCTTACTTTTCATCGGCGCTGTTGGGAAATCTGCACAAATAGGATTGCATACTCGGTTACCTGATGCAATGGAGGGTTTT--------GAATATCTGAGGGCTCTCATGTGCCAATAGGAGGTACATTATACCAATCTCACTGTATGCCGGAATCGTCGATCAAATGAGAGTCCCCATC----GGAAAAATATCTCATTTTGGCCAATCGGCAGGAAACCTAGA---GAGGAAGGCCAAGCCCACCCAACAAAGTAGAGGCTG-AAGGAGCTC----TATAGGATCCTCAGAGACTGTACGTGAGACCTCTTGTCCG-------AAATGGAATTTATTCTTGAAAAGCGAAGCTGACTAGATTTAACTAAGATAC---GAAGCATTCTTTTGTCGTGAAGATTC-GATCATC-TTTTTTTTAGATTA--TATAGTCTAGATATGCAGGTCTTATGGAATAG---AAGGATCC--G--TATAGGGTT---TGGGCATGTAGAAAACCTTGTATTGAATCAAATACTCCTCATCA-----GT-------TTG----GCTATAAGCTGGAAACG----G-AGAAAAAT---------------------ATATATATTGTTATTTTCCAGCGCGGCCTGATGTTACATCCCAACTTTCCGCCT-------GAGCCCAGCCTTATTGTCATCCTCACTAAAGCGCCGCGCGTTGAAT--------CTACCAGGATGCAGTTTAAAAAAGCTTAAATA-TTTTTTTTGCTTCGC------GAAATAAATATATCTATACTCGCGAAAAGCGTTGGGAGGATGGAGCTG---AGACAGTGTCTCATGCATGAAAGAAGAAAAAC----ATCTTAGTTGTTAGGGACGCAGCATCCGTAAGA----TTTTTGGGAGAGTCTCTATTTCATAAGTGGAAGATACAGTCCCTACTCTTGCTAGGCTCATCGGCTTAT----TACCTAAT-GCTCTAA---AATAGTATTTCTTTG-CCTT----GGGGGA-GCGTAAGAG?????? 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Boulaya_mitteni 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Brachelyma_subulatum 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Brotherella_recurvans 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Callicladium_haldanianum 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Calliergon_cordifolium 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Calliergonella_cuspidata 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Calyptothecium_praelongum 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Chaetomitriopsis_glaucocarpa 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Cratoneuron_filicinum 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Curvicladium_kurzii 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Cyathophorum_bulbosum 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Cyptodon_muelleri 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Cyptodontopsis_obtusifolia 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'Cyrto-hypnum schistocalyx' 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Dendroalsia_abietina 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Dendrocryphaea_cuspidata 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Dimorphocladon_borneense 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Dixonia_thamnioides 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Dolichomitra_cymbifolia 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Dolichomitriopsis_diversiformis GTGTAAGAATAATACGTCGTTTAGGAACTTTACCAGGACTGACTAATAAAACACCCCAGTTAAAATCTAGTTCTATCAATCAATCAACATCTAATAAAAAAATTTCTCAGTATCGCATTCGTTTGGAAGAAAAACAAAAATTACGTTTTCATTATGGAATAACAGAACGACAATTACTTAATTATGTACGTATTGCTAGAAAAGCAAAGGGATCCACAGGTGAAGTTTTATTACAATTACTCGAAATGCGTTTAGATAATGTTATTTTTCGATTAGGTATGGCTCCTACGATTCCTGGAGCAAGACAATTAGTAAATCATAGACATATTTTAGTTAATGATTGTGTAGTAGATATACCAAGTTATCGGTGTAAACCTCAGGATTTTATTACTATAAAAAATCAACGAAAATCTGAGACTATAATTAGTAAAAATATAGAGTTTTATCAAAAATCTAAAATACCAAATCATTTAACTTATAGTTCTTTAGAAAAAAAAGGATTAGTTAATCAAATATTAGATCGTGAATCAATTGGTTTAAAAATAAATGAATTATTAGTTGTAGAATATTATTCTCGTCAAGC--------------------TTAACTAAG---AATTGATAG-TATTTT--GCTATAAAAGCTATG-CTTGTCAATCGAGTAGGT-GATTTCGGATTAGCTCTCGGG-ATTATGGGTTGT-TTTACTATTTTTCAAACAGTAGACTTTTCGACTATTTTTGCTCGTGCCAGCGCCTTTTCCGAACCCCATCATTATTTTATTTTTTGCAATATGAGATTTCATGCCATAACTGTTATTTGTATCTTACTTTTCATCGGCGCTGTTGGGAAATCTGCACAAATAGGATTGCATACTCGGTTACCTGATGCAATGGAGGGTTTTC-------GAACATCTGAGGGCTCTCATGTGCCAAT---AGGTACATTATACCAATCTCACTGTATGCCGGAATCGTCGATCAAATGAGAGTCCCCATC----GGAAAAATATCTCATTTTGGCCAATCGGCAGGAAACCTATA---AAGGAAGGCCAAGCCCACCCAACAAAGTAAAGGCTG-AAGGAGCTC----TATAGGATCCTCAGAGACTGTACGTGAGACCTCTTGTCCG-------AAATGGAATTTATTCTTGAAAAGCGAAGCTGACCAGATTTAACTAAGATAC---GAAGCATTCTTTTGTCGTGAAGATTC-GATCATC-TTTTTTTTAGATTA--TATAGTCTAGATATGCAGGTCTTATGGAATAG---AAGGATCC--G--TATAGGGTT---TGGGCATGTAGAAAACCTTGTATTGAATCAAATACTCCTCATCA-----GT-------TTG----GTTATAAGCTGGAAACG----G-AAAAAAATATATA----------------ATATATATTGTTTTTTTCCAGCGCGGCCTGATGTTACATCCCAACTTTCCGCCT-------GAGCCCAGCCTTATTGTCATCCTCACCAAAGCGCCGCGCGC-------------------------------------------------------------------GAAATATA----TCTATACTCGCGAAAAGCGTTGGGAGGATGGAGCTG---AGACGGTGTCTCATGTATAAAAGAAGAAAAAC----ATCTTAGTTGTTAGGGACGCAGCATCCGTAAGA----TTCTTGGGAGAGTCTCTATTTCATAAGTGGAAGATACAGTCCCTACTCTTGCTAGGCTCATCAGCTTAT----TACCTAAT-GCTCTAA---AATAGTATTTCTTTG-CCTT----ATGGGA-GCGTAGGAGATTA?? Donnellia_commutata 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Dozya_japonica 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Eriodon_conostomus 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Erythrodontium_longisetum 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Eulacophyllum_cultelliforme 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Eurhynchiella_acanthophylla 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Eurohypnum_leptothallum 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Fabronia_pusilla 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Forsstroemia_trichomitria 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Garovaglia_elegans 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Habrodon_perpusillus 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Hamatocaulis_vernicosus 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Helodium_blandowii 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Henicodium_geniculatum 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Heterophyllium_affine 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Homaliodendron_flabellatum 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Hookeria_acutifolia 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Horikawaea_redfearnii 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Hylocomium_splendens 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Hymenodon_pilifer 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Hypnobartlettia_fontana 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Hypnum_cupressiforme 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Isothecium_myosuroides 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Jaegerina_scariosa GTGTAAGAATAATACGTCGTTTAGGAACTTTACCGGGGCTAACTAATAAAACACCCCAGTTAAAATCTAGTTCTATCAATCAATCAACATCTAATAAAAAAATTTCTCAGTATCGCATTCGTTTAGAAGAAAAACAAAAATTACGTTTTCATTATGGAATAACAGAACGACAATTACTTAATTATGTACGTATTGCTAGAAAAGCAAAGGGATCCACAGGTGAAGTTTTATTACAATTACCCGAAATGCGTTTAGATAATGTTATTTTTCGATTAGGTATGGCTCCTACGATTCCTGGAGCAAGACAATTAGTAAATCATAGACATATTTTAGTTAATGATTGTATAGTAGATATACCAAGTTATCGGTGTAAACCTCAGGATTTTATTACTATAAAAAATCAACGAAAATCTGAGACTATAATTAGTAAAAATATAGAGTTTTATCAAAAATCTAAAATACCAAATCATTTAACTTATAATTCTTTAGAAAAAAAAGGATTAGTTAATCAAATATTAGATCGTGAATCAATTGGTTTAAAAATAAATGAATTATTAGTTGTAGAATATTATTCTCGTCAAGC--------------------TTAATTAAG---AATTAATAG-TATTTT--GCTATAAAAGCTATG-CTTGTCAATCGAGTAGGT-GATTTCGGATTAGCTCTCGGG-ATTATGGGTTGT-TTTACTATTTTTCAAACAGTAGACTTTTCGACTATTTTTGCTCGTGCCAGCGCCTTTTCCGAACCCCATCATTATTTTATTTTTTGCAATATGAGATTTCATGCCATAACTGTTATTTGTATCTTACTTTTCATCGGCGCTGTTGGGAAATCTGCACAAATAGGATTGCATACTCGGTTACCTGATGCAATGGAGGGTTTTC-------GAATATCTGAGGGCTCTCATGTGCCAAT---AGGTACATTATACCAATCTCACTGTATGCCGGAATCGTCGATCAAATGAGAGTCCCCATC----GGAAAAATATCTCATTTTGGCCAATCGGCAGGAAACCTATA---AAGGAAGGCCAAGCCCACCCAACAAAGTAAAGGCTG-AAGGAGCTC----TATAGGATCCTCAGAGACTGTACGTGAGACCTCTTGTCCG-------AAATGGAATTTATTCTTGAAAAGCGAAGCTGACCAGATTTAACTAAGATAC---GAAGCATTCTTTTGTCGTGAAGATTC-GATCATC-TTTTTTTTAGATTA--TATAGTCTAGATATGCAGGTCTTATGGAATAG---AAGGATCC--G--TATAGGGTT---TGGGCATGTAGAAAACCTTGTATTGAATCAAATACTCCTCATCA-----GT-------TTG----GTTATAAGCTGGAAACG----G-AAAAAAATATATA----------------ATATATATTGTTTTTTTCCAGCGCGGCCTGATGTTACATCCCAACTTTCCGCCT-------GAGCCCAGCCTTATTGTCATCCTCACTAAAGCGCCGCGCGCTGAAT--------CTACCAGGATGCAGTTTAAAAAAGCTTAACTA-TTTTTTTTGCTTTGC------GAAATATA----TCTATACCCGCGAAAAGCGTTGGGAGGATGGAGCTG---AGACGGTGTCTCATGTATAAAAGAAGAAAAAC----ATCTTAGTTGTTAGGGACGCAGCATCCGTAAGA----TTCTTGGGAGAGTCTCTATTTCATAAGTGGAAGATACAGTCCCTACTCTTGCTAGGCTCATCAGCTTAT----TACCTAAT-GCTCTAA---AATAGTATTTCTTTG-CCTT----ATGGGA-GCGTAAGAGATTATT Juratzkaeella_sinensis ???????????ATACGTCGTTTAGGAACTTTACCAGGACTAACTAATAAAACATCCCAGTTAAAATCTGGTTCTATTACTCAATCAACATCTAATAAAAAAATTTCTCAGTATCGCATTCGTTTAGAAGAAAAACAAAAATTACGTTTTCATTATGGAATAACAGAACGACAATTACTTAATTATGTACGTATTGCTAGAAAAGCAAAAGGATCTACAGGTGAAGTTTTATTACAATTACTCGAAATGCGTTTAGATAATGTTATTTTTCGATTAGGTATGGCTCCTACGATTCCTGGAGCAAGACAATTAGTAAATCATAGACATATTTTAGTTAATGATTGTATAGTAAATATACCAAGTTATCAATGTAAACCTCAGGATTTTATTACTATAAAAAATCAACGAAAATCTGAGACTATAATTAATAAAAATATAGAATTTTATCAAAAATATAAAATACCAAATCATTTAACTTATAGTTCTTTAGAAAAAAAAGGATTAGTTAATCAAATATTAGATCGTGAATCAATTGATTTAAAAATAAATGAATTATTAGTTGTAGAATATTATTCTCGTCAAGC--------------------TTAACTAAA---AATTAATAC-TATTTT--GCTATAAAAGCTATG-CTTGTCAATCGAGTAGGT-GATTTCGGATTAGCTCTCGGG-ATTATGGGTTGT-TTTACTATTTTTCAAACAGTAGACTTTTCGACTATTTTTGCTCGTGCTAGCGCCTTTTCCGAACCCCATCATTATTTTATTTTTTGCAATATGAGATTTCATGCCATAACTGTTATTTGTATCTTACTTTTCATCGGCGCTGTTGGGAAATCTGCACAAATAGGATTGCATACTCGGTTACCTGATGCAATGGAGGGTTTTC-------GAATATCTGAGGGCTCTCATGTGCCAAT---AGGTACATTATACCAATCTCACTGTATGCCGGAATCGTCGATCAAATGAGAGTCCCCATC----GGAAAAATATCTCATTTTGGCCAATCGGCAGGAAACCTATA---AAGGAAGGCCAAGCCCACCCAACAAAGTAAAGGCTG-AAGGAGCTC----TATAGGATCCTCAGAGACTGTACGTGAGACCTCTTGTCCG-------AAATGGAATTTATTCTTGAAAAGCGAAGCTGACCAGATTTAACTAAGATAC---GAAACATTCTTTTGTCGTGAAGATTC-GATCATC-TTTTTTTTAGATTA--TATAGTCTAGATATGCAGGTCTTATGGAATAG---AAGGATCC--G--TATAGGGTT---TGGGCATGTAGAAAACCTTGTATTGAATCAAATACTCTTCATCA-----GT-------TTG----GTTATACGCTGGAGACG----G-AAAAAAAT---------------------ATATATATTGTTTTTTTCCAGCGCGGCCTGATGTTACATCCCAACTTTCCGCCT-------GAGCCCAGCCTTATTGTCATCCTCACCAAAGCGCCGCGCGCTGAAT--------CTACCAGGATGCAGTTTAAAAAAGCTTAAATA-TTTTTTTTGCTTCGC------GAAATATA----TCTATACTCGCGAAAAGCGTTGGGAGGATGGAGCTG---AGACGGTGTCTCATGTATAAAAGAAGAAAAAC----ATCTTAGTTGTTAGGGACGCAACATCCGTAAGA----TTCTTGGGAGAGTCTCTATTTCATAAGTGGAAGATACAGTCCCTATTCTTGCTAGGCTCATCAGCTTAT----TACCTAAT-GCTCTAA---AATAGTATTTCTTTG-CCTT----ATGGGA-GCGTAAGA??????? Lembophyllum_divulsum 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Leptodictyum_riparium 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'Leptopterigynandrum austro-alpinum' GTGTAAGAATAATACGTCGTTTAGGAACTTTACCAGGGCTAACTAATAAAACACCCCAGTTAAAATCTAGTTCTCTCAATCAATCAACATCTAATAAAAAAATTTCTCAGTATCGCATTCGTTTAGAAGAAAAACAAAAATTACGTTTTCATTATGGAATAACAGAACGACAATTACTTAATTATGTACGTATTGCTAGAAAAGCAAAAGGATCCACAGGTGAAGTTTTATTACAATTACTCGAAATGCGTTTAGATAATATTATTTTTCGATTAGGTATGGCTCCTACGATTCCTGGAGCAAGACAATTAGTAAATCATAGACATATTTTAGTTAATGATTGTATAGTAGATATACCAAGTTATCGGTGTAAACCTCAAGATTTTATTACTATAAAAAATCAACAAAAATCTGAGACTATAATTAGTAAAAATATAGAGTTTTATCAAAAATATAAAATACCAAATCATTTAACTTATAGTTCTTTAGAAAAAAAAGGATTAGTTAATCAAATATTAGATCGTGAATCAATTGGTTTAAAAATAAATGAATTATTGGTTGTAGAATATTATTCTCGTCAAGC--------------------TTAACTAAG---AATTAATAG-TATTTT--GCTATAAAAGCTATG-CTTGTCAATCGAGTAGGT-GATTTCGGATTAGCTCTCGGG-ATTATGGGTTGT-TTTACTATTTTTCAAACAGTAGACTTTTCGACTATTTTTGCTCGTGCTAGCGCCTTTTCCGAACCCCATCATTATTTTATTTTTTGCAATATGAGATTTCATGCCATAACTGTTATTTGTATCTTACTTTTCATCGGCGCTGTTGGGAAATCTGCACAAATAGGATTGCATACTCGGTTACCTGATGCAATGGAGGGTTTTC-------GAATATCTGAGGGCTCTCATGTGCCAAT---AGGTACATTATACCAATCTCACTGTATGCCGGAATCGTCGATCAAATGAGAGTCCCCATC----GGAAAAATATCTCATTTTGGCCAATCGGCAGGAAACCTATA---AAGGAAGGCCAAGCCCACCCAACAAAGTAAAGGCTG-AAGGAGCTC----TATAGGATCCTCAGAGACTGTACGTGAGACCTCTTGTCCG-------AAATGGAATTTATTCTTGAAAAGCGAAGCTGACCAGATTTAACTAAGATAC---GAAGCATTCTTTTGTCGTGAAGATTC-GATCATC-TTTTTTTTAGATTA--TATAGTCTAGATATGCAGGTCTTATGGAATAG---AAGGATCC--G--TATAGGGTT---TGGGCATGTAGAAAACCTTGTATTGAATCAAATACTCCTCATCA-----GT-------TTG----GTTATAAGCTGGAAACG----G-AAAAAAAT---------------------ATATATATTGTTTTTTTCCAGCGCGGCCTGATGTTACATCCCAACTTTCCGCCT-------GAGCCCAGCCTTATTGTCATCCTCACCAAAGCGCTGCGCGCTGAAT--------CTACCAGGATGCAGTTTAAAAAAGCTTAAATA-TTTTTTTTGCTTCGC------GAAATATA----TCTATACTCGCGAAAAGCGTTGGGAGGATGGAGCTG---AGACGGTGTCTCATGTATAAAAGAAGAAAAAC----ATCTTAGTTGTTAGGGACGCAGCATCCGTAAGA----TTCTTGGGAGAGTCTCTATTTCATAAGTGGAAGATACAGTCCCTACTCTTGCTAGGCTCATCAGCTTAT----TACCTAAT-GCTCTAA---AATAGTATTTCTTTG-CCTT----ATGGGA-GCGTAAGAGATTATT Lepyrodontopsis_trichophylla GTGTAAAAATAATACGTCGTTTAGGAACTTTACCAGGACTGACTAATAAAATACCCCAGTTAAAATCTAGTTCTATTAATCAATCAACATCTAATAAAAAAATTTCTCAGTATCGCATTCGTTTAGAAGAAAAACAAAAATTACGTTTTCATTATGGAATAACAGAACGACAATTACTTAATTATGTACGTATTGCTAGAAAAGCAAAAGGATCTACAGGTGAAGTTTTATTACA{AG}T{GT}ACTCGAAATGCGTTTAGATAATGTTATTTTTCGATTAGGTATGGCTCCTACGATTCCTGGAGCAAGACAATTAGTAAATCATAGACATATTTTAGTTAATGATTGTATAGTAGATATACCAAGTTATCGGTGTAAACCTCAGGATTTTATTACTATAAAAAATCAACGAAAATCTGAGATTATAATTAGTAAAAATATAGAGTTCTATCAAAAATCTAAAATACCAAATCATTTAACTTATAATTCTTTAGAAAAAAAAGGATTAGTTAATCAAATATTAGATCGTGAATCAATTGATTTAAAAATAAATGAATTATTAGTTGTAGAATATTATTCTCGTCAAGC--------------------TTAACTAAG---AATTAACAG-TATTTT--GCTATAAAAGCTATG-CTTGTCAATCGAGTAGGT-GATTTCGGATTAGCTCTCGGG-ATTATGGGTTGT-TTTACTATTTTTCAAACAGTAGACTTTTCGACTATTTTTGCTCGTGCCAGCGCCTTTTCCGAACCCCATCATTATTTTATTTTTTGCAATATGAGATTTCATGCCATAACTGTTATTTGTATCTTACTCTTCATCGGCGCTGTTGGGAAATCTGCACAAATAGGATTGCATACTCGGTTACCTGATGCAATGGAGGGTTTTC-------GAATATCTGAGGGCTCTCATGTGCCAAT---AGGTACATTATACCAATCTCACTGTATGCCGGAATCGTCGATCAAATGAGAATCCCCATC----GGAAAAATATCTCATTTTGGCCAATCGGCAGGAAACCTATA---AAGGAGGGCCAAGCCCACCCGACGAAGTAAAGGCTG-AAGGAGCTC----TATAGGATCCTCAGAGACTGTACGTGAGACCTCTTGTCCG-------AAATGGAATTTATTCTTGAAAAGCGAAGCTGACCAGATTTAACTAAGATAC---GAAGCATTCTTTTGTCGTGAAGATTC-GATCATC-TTTTTTTTAGATTA--TATAGTCTAGATATGCAGGTCTTATGGAATAG---AAGGATCC--G--TATAGGGTT---TGGGCATGTAGAAAACCTTGTATTGAATCAAATACTCCTCATCA-----GT-------TTG----GTTATAAGCTGGAAACG----G-AAAAAAAT---------------------ATATATATTGTTTTTTTCCAGCGCGGCCTGATGTTACATCCCAACTTTCCGCCT-------GAGCCCAGCCTTATTGTCATCTTCACCAAAGCGCCGCGCGCTGAAT--------CTACCAGGATGCAGTTTAAAAAAGCTTAAATA--TTTTTTCGCTTCGC------GAAATATA----TCTATACTCGCGAAAAGCGTTGGGAGGATGGAGCTG---AGACGGTGTCTCATGTATAAAAGAAGAAAAAC----ATCTTAGTTGTTAGGGACGCAGCATCCGTAAGA----TTCTTGGGAGAGTCTCTATTTCATAAGTGGAAGATACAGTCCCTACTCTTGCTAGGCTCATCAGCTTAT----TACCTAAT-GCTCTAA---AATAGTATTTCTTTG-CCTT----ATGGGA-GCGTAAGAGATTATT Lescuraea_radicosa 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Leskeadelphus_bolivianus 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Leskeella_nervosa 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Leucodon_sciuroides 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Leucomium_strumosum GTGTAAGAATA???CGTCGTTTAGGAACTTTACCAGGACTAACTAATAAAACACCCCAGTTAAAATCTAGTTCTATTAATCAATCAACATCTAATAAAAAAATTTCTCAGTATCGCATTCGTTTAGAAGAAAAACAAAAATTACGTTTTCATTATGGAATAACAGAACGACAATTACTTAATTATGTACGTATTGCTAGAAAAGCAAAAGGATCCACAGGTGAAGTTTTATTACAATTACTCGAAATGCGTTTAGATAATATTATTTTTCGATTAGGTATGGCTCCTACGATTCCTGGAGCAAGACAATTAGTAAATCATAGACATATTTTAGTTAATGATTGTATAGTAGATATACCAAGTTATCGGTGTAAACCTCAGGATTTTATTACTATAAAAAACCAACGAAAATCTGAGGCTATAATTAGTAAAAATATAGAGTTTTATCAAAAATCTAAAATACCAAATCATTTAACTTATAGTTCTTTAGAAAAAAAAGGATTAGTTAATCAAATATTAGATCGTGAATCAATTGGTTTAAAAATAAATGAATTATTAGTTGTAGAATATTATTCTCGTCAAGC--------------------TTAACTAAG---AATTAATAG-TATTTT--GCTATAAAAGCTATG-CTTGTCAATCGAGTAGGT-GATTTCGGATTAGCTCTCGGG-ATTATGGGTTGT-TTTACTATTTTTCAAACAGTAGACTTTTCGACTATTTTTGCTCGTGCTAGCGCCTTTTCCGAACCCCATCATTATTTTATTTTTTGCAACATGAGATTTCATGCCATAACTGTTATTTGTATCTTACTTTTCATCGGCGCTGTTGGGAAATCTGCACAAATAGGATTGCATACTCGGTTACCTGATGCAATGGAGGGTTTTC-------GAATATCTGAGGGCTCTCATGTGCCAAT---AGGTACATTATACCAATCTCACTGTATGCCGGAATCGTCGATCAAATGAGAGTCCCCATC----GGAAAAATATCTCATTTTGGCCAATCGGCAGGAAACCTATA---AAGGAAGGCCAAGCCCACCCAACAAAGTAAAGGCTG-AAGGAGCTC----TATAGGATCCTCAGAGACTGTACGTGAGACCTCTTGTCCG-------AAATGGAATTTATTCTTGAAAAGCGAAGCTGACCAGATTTAACTAAGATAC---GAAGCATTCTTTTGTCGTGAAGATTC-GATCATC-TTTTTTTTAGATTA--TATAGTCTAGATATGCAGGTCTTATGGAATAG---AAGGATCC--G--TATAGGGTT---TGGGCATGTAGAAAACCTTGTATTGAATCAAATACTCCTCATCA-----GT-------TTG----GTTATAAGCTGGAAACG----G-AAAAAAAT---------------------ATATATATTGTTTTTTTCCAGCGCGGCCTGATGTTACATCCCAACTTTCCGCCT-------GAGCCCAGCCTTATTGTCATCCTCACCAAAGCGCCGCGCGCTGAAT--------CTACCAGGATGCAGTTTAAAAAAGCTTAAATA-TTTTTTTTGCTTCGC------GAAATATA----TCTATACTCGCGAAAAGCGTTGGGAGGATGGAGCTG---AGACGGTGTCTCATGTATAAAAGAAGAAAAAC----ATCTTAGTTGTTAGGGACGCAGCATCCGTAAGA----TTCTTGGGAGAGTCTCTATTTCATAAGTGGAAGATACAGTCCCTACTCTTGCTAGGCTCATCAGCTTAT----TACCTAAT-GCTCTAA---AATAGTATTTCTTTG-CCTT----ATGGGA-GCGTAAGAGATTATT Levierella_fabroniacea 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Limbella_tricosta 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Lindbergia_brachyptera 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Loeskeobryum_brevirostre 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Mesochaete_undulata GTGTGAGAATAATACGTCGTTTAGGAACTTTACCAGGACTAACTAATAAAACACCCCAGTTAAAATCTAGTTCTATCAATCAATCAACATCTAATAAAAAAATTTCTCAGTATCGCATTCGTTTGGAGGAAAAACAAAAATTACGGTTTCATTATGGAATAACAGAACGACAATTACTTAATTATGTACGTATTGCTAGAAAAGCAAAAGGATCCACAGGTGAAGTTTTATTACAATTACTCGAAATGCGTTTAGATAACGTTATTTTTCGATTAGGTATGACTCCTACGATTCCTGGAGCAAGACAATTAGTAAATCATAGACATATTTTAGTTAATGATTGTATAGTAGATATACCAAGTTATCGGTGTAAACCTCAGGATTTTATTACTATGAAAAATCAACGAAAATCTGAGGCTATAATTAATAAAAATATAGAATTTTATCAGAAATATAAAATACCAAATCATTTAACTTATAGTTCTTTAGAAAAAAAAGGATTAGTTAATCAAATATTAGATCGTGAATCAATTGGTTTAAAAATAAATGAATTACTAGTTGTAGAATATTATTCTCGTCAAGC--------------------TTAACTAAG---AATTAATAA-TATTTT--GCTATAAAAGCTATG-CTTGTCAATCGAGTAGGT-GATTTCGGATTAGCTCTCGGG-ATTATGGGTTGT-TTTACTATTTTTCAAACAGTAGACTTTTCGACTATTTTTGCTCGTGCCAGCGCCTTTTCCGAACCCCATCATTATTTCATTTTCTGCAATATGAGATTTCATGCCATAACTGTTATTTGTATTTTACTCTTCATCGGCGCTGTTGGGAAATCTGCACAAATAGGATTGCATACTCGGTTACCCGATGCAATGGAGGGTTTTC-------GAATATCTGAGGGCTCTCATGTGCCAAT---AGGTACATTATACCAATCTCACTGTATGCCGGAATCGTCGATCAAATGAGAGTCCCCATC----GGAAAAATATCTCATTTTGGCCAATCGGCAGGAAACCTATA---AGGGAAGGCCAAGCCCACCCAACAAAGTAAAGGCTG-AAGGAGCTC----TATAGGATCCTCAGAGACTGTACGTGAGACCTCTTGTCCG-------AAATGGAATTTATTCTTGAAAAGCGAAGCTGACCAGATTTAACTAAGATAC---GAAGCATTCTTTTGTCGTGAAGATTC-GATCATC-TTTTTTTTAGATTA--TATAGTCTAGATATGCAGGTCTTCTGGAATAG---AAGGATCC--G--TATAGGGTT---TGGGCATGTAGAAAACCTTGTATTGAATCAAATACTCCTCATCA-----GT-------TTG----GTTATAAGCTGGAAACG----G-AAAAAAAT---------------------ATATATATTGTTTTTTTCCAGCGCGGCCTGATGTTACATCCCAACTTTCCGTCT-------GAGCCCAGCCTTATTGTCATCCTCACCAAAGCGCCGCGCGCTGAAT--------CTACCAGGATGCAGTTTAAAAAAGCTTAAATA-TTTTTTTTGCTTCGC------GAAATATA----TCTATACTCGCGAAAAGCGTTGGGAGAATGGAGCTG---AGACAGTGTCTCATGTATAAAAGAAGAAAAAC----ATCTTAGTTGTTAGCGACGCAGCATCCGTAAGA----TTCTTGGGAGAGTCTCTATTTCATAAGTGGAAGATACAGTCCCTACTCTTGCTAGGCTCATCAGCTTAT----TACCCAAT-GCTCTAA---AATAGTATTTCTTTG-CCTT----ATGGGA-GCGTAAGAGATTATT Mesonodon_flavescens GTGTGAAAATAATACGTCGTTTAGGAGCTTTACCAGGACTAACTAATAAAACACCCCAGTTAAAATCTAGTTCTATCAATCAATCAACATCTAATAAAAAAATTTCTCAGTATCGCATTCGTTTAGAAGAAAAACAAAAATTACGTTTTCATTATGGAATAACAGAACGACAATTACTTAATTATGTACGTATTGCTAGAAAAGCAAAAGGGTCAACAGGTGAAGTTTTATTACAATTACTCGAAATGCGTTTAGATAATGTCATTTTTCGATTAGGTATGGCTCCTACAATTCCTGGAGCAAGGCAATTAGTAAATCATAGACATATTTTAGTCAATGATCAGATCGTAGATATACCAAGTTATCAGTGTAAACCCCAGGATTTTATTACTATAAAAGATCGACAAAAATCTCAAGCTATAATTAGTAAAAATATATATTTTTATCAAAAATATAAAATACCAAATCATTTAATTTATAGTTCTTTGGAAAAAAAAGGATTGGTTAATCAAATACTAGATCGTGAATCAATTGGTTTAAAAATAAATGAATTATTAGTTGTAGAATATTATTCTCGTCAGGC--------------------TTAACTAAA---AACTAATAG-TATTTC--GCTATAAAAGCTATG-CTTGTCAATCGAGTA{CG}GT-GATTTCGGATTAGCTCTCGGG-ATTATGGGTTGT-TTTACTATTTTTCAAACAGTAGACTTTTCGACTATTTTTGCTCGTGCCAGCGCCTTTTCCGAACCCCATCATTATTTCATTTTTTGCAAT{AC}TGAGATTTCATGCCATAACTGTTATTTGTATCTTACTTTTCATTGGCGCTGTTGGAAAATCTGCACAAAT{AG}GGATTGCATACTCGGTTACCTGATGCAATGGAGGGTTTTC-------GAATATCCGAGGGCTCTCATGTGCCAAT---AGGTACATTATAACAATCTCACTGTATGCCGGAATCGTCGATCAAATGAGAGTCCCCATC----GGAAAAATATCTCATTTTGACCAATCGGCAGGAAACCTATA---AAGGAAGGCCAAGCCCACCCAACGAAGTAAAGGCTG-AAGGAGCTC----TATAGGATCCTCAGAGACTGTACGTGAGACCTCTTGTTCG-------AAATGGAATTTATTTTTGAAAAGAGAAGCTGGCCAGATTTAACTAAGATAC---GAAGCATTCTTTTGTCGTGAAGATTC-GATCATC-TTTTTTTTAGATTATATATAGTCTAGATATGCAGGTCTTATGGAATAG---AAGGATCC--G--TATAGGGTT---TGGGCATGTAGAAAACCTTGTATTGAATCAAATACTCCTCATCA-----TT-------TTG----GTTATAAGCTGGAAACG----G-AAAACAAT---------------------ATATATATTGTTTTTTTCCAGCGCGGCCTGATGTCACATCCCAACTTTCCGCCT-------GAGCCCAGCCTTATTGTCATCTTCACCAAAGCGCCGCGCGCTGAAT--------CTACCAGGATGCAGTTTAAAAAAGCTTAAATATTTTTTGTTGCTTCGC------AAAATAGA----TATATACTTGCGAAAAGCGTTGGG---ATGGAGCTG---AGACGGTGTCTCATGTATAAAAGAAGAAGAAC----ATCTTAGTTGTTAGGGACGCAGCATCCGTAAGA----TTCTTGGAAGAGTCTCTATTTCATAAGTGGAAGATACAGTCCCTACTCTTGCTAGGCTCATCAGCTTAT----TACCTAAT-GCTCTAA---AATAGTATTTCTTTG-CCTT----ATGGGA-GCGTAAGAGATTATT Metaneckera_menziesii GTGTGAGAATAATACGTCGTTTAGGAACTTTACCAGGATTAACTAATAAAACATCTCAGTTAAAATCTAGTTCTATCAATCAATCAACATCTAATAAAAAAATTTCTCAGTATCGCATTCGTTTGGAAGAAAAACAAAAATTACGTTTTCATTATGGAATAACAGAACGACAATTACTTAATTATGTACGCATTGCTAGAAAAGCAAAAGGATCAACAGGTGAAGTTTTATTACAATTACTTGAAATGCGTTCAGATAATGTTATTTTTCGATTAGGTATGGCTCCTACGATTCCTGGAGCAAGACAATTAGTAAATCATAGACATATTTTAATCAATGATTCTATAGTAGATATACCAAGTTATCGGTGTAAACCTCAGGATTTTATTACTATTAAAAATCAACGAAAATCTGAGACTATAATTAATAAAAATATAGAGTTTTATCAAAAATCTAAAATACCAAATCATTTAACTTATAGTTCTTTAGAAAAAAAAGGATTAGTTAATCAAATACTAGATCGTGAATCAATTGGTTTAAAAATAAATGAATTATTAGTTGTAGAATATTATTCTCGTCAAGC--------------------TTAACTAAA---AATTAATAG-TATTTT--GCTATAAAAGCTATG-CTTGTCAATCGAGTAGGT-GATTTCGGATTAGCTCTCGGG-ATTATGGGTTGT-TTTACTATTTTTCAAACAGTAGACTTTTCGACTATTTTTGCTCGTGCCAGCGCCTTTTCCGAACCCCATCATTATTTTATTTTTTGCAATATGAGATTTCATGCCATAACTGTTATTTGTATCTTACTTTTCATCGGCGCTGTTGGGAAATCTGCACAAATAGGATTGCATACTCGGTTACCTGATGCAATGGAGGGTTTTC-------GAATATCTGAGGGCTCTCATGTGCCAAT---AGGTACATTATACCAATCTCACTGTATGCCGGAATCGTCGATCGAATGAGAGTCCCCATC----GGAAAAATATCTCATTTTGGCCAATCGGCAGGAAACCTATA---AAGGAAGGCCAAGCCCACCCAACAAAGTAAAGGCTG-AAGGAGCTC----TATAGGATCCTCAGAGACTGTACGTGAGACCTCTTGTCCG-------AAATGGAATTTATTCTTGAAAAGCGAAGCTGACCAGATTTCACTAAGATAC---GAAGCATTCTTTTGTCGTGAAGATTC-GATCATC-TTTTTTTTAGATTA--TATAGTCTAGATATGCAGGTCTTATGGAATAG---AAGGATCC--G--TATAGGGTT---TGGGCATGTAGAAAACCTTGTATTGAATCAAATACTCCTCATCA-----GT-------TTG----GTTATAAGCTGGAAACA----G-AAAAAAAT---------------------ATATATATTGTTTTTTTCCAGCGCGGCCTGATGTTACATCCCAACTTTCCGCCT-------GAGCCCAGCCTTATTGTCATCCTCACCAAAGCGCCGCGCGCTGAAT--------CTACCAGGATGCAGTTTAAAAAAGCTTAAATA-TTTTTTTTG--------------AATATA----TCTATACTCGCGAAAAGCGTTGGGAGGATGGAGCTG---AGACGGTGTCTCGTGTATAAAAGAAGAAAAAC----ATCTTAGTTGTTAGGGACGCAGCATCCGTAAGA----TTCTTGGGAGAGTCTCTATTTCATAAGTGGAAGATACAGTCCCTACTCTTGCTAGGCTCATCAGCTTAT----TACCTAAT-GCTCTAA---AATAGTATTTCTTTG-CCTT----ATGGGA-GCGTAAGAGATTATT Meteoridium_remotifolium 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Meteoriella_soluta 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Meteorium_illecebrum ???????????????GTCGTTTAGGAACTTTACCGGGACTGACCAATAAAACACCCCAGTTAAAATCTAGTTCTATCA?TCAATCA?CATCTAATAAAAAAATTTCTCAGTATCG?ATTCGTTTAGAAGAAAAACAAAAATTACGTTTTCATTATGGAATAACAGAACGACAATTACTTAATTATGTACGTATTGCTAGAAAAGCAAAAGGATCCACAGGTGAAGTTTTATTACAATTACTCGAAATGCGTCTAGATAATGTTATTTTTCGATTAGGTATGGCTCCCACGATCCCTGGAGCAAGACAATTAGTAAATCATAGACATATTTTAGTTAATGATTATATAGTAGATATACCAAGTTATCGGTGTAAACCTCAGGATTTTATTACTATAAAAAATCAACAAAAATCTGAGACTATAATTAGTAAAAATATAGAGTTTTATCAAAAATATAAAATACCAAATCATTTAACTTATAGTTCTTTAGAAAAAAAAGGGTTGGTTAATAAAATATTAGATCGTGAATCAATTGGTTTAAAAATAAATGAATTATTAGTTGTAGAATATTATTCTCGTCAAGC--------------------TTAACTAAG---AATTAATAG-TATTTT--GCTATAAAAGCTATG-CTTGTCAATCGAGTAGGT-GATTTCGGATTAGCTCTCGGG-ATTATGGGTTGT-TTTACTATTTTTCAAACAGTAGACTTTTCGACTATTTTTGCTCGTGCCAGCGCCTTTTCCGAACCCCATCATTATTTTATTTTTTGCAATACGAGATTTCATGCCATAACTGTTATTTGTATCTCACTTTTCATCGGCGCTGTTGGGAAATCTGCACAAATAGGATTGCATACTCGGTTACCTGATGCAATGGAGGGTTTTC-------GAATATCTGAGGGCTCTCATGTGCCAAT---AGGTACATTATACCAATCTCACTGTATGCCGGAATCGTCGATCAAATGAGAGTCCCCATC----GGAAAAATATCTCATTTTGGCCAATCGGCAGGAAACCTATA---AAGGAAGGCCAAGCCCACCCAACAAAGTAAAGGCTG-AAGGAGCTC----TATAGGATCCTCAGAGACTGTACGTGAGACCTCTTGTCCG-------AAATGGAATTTATTCTTGAAAAGCGAAGCTGACCAGATTTAACTAAGATAC---GAAGCATTCTTTTGTCGTGAAGATTC-GATCATC-TTTTTTTTAGATTA--TATAGTCTAGATATGCAGGTCTTATGGAATAG---AAGGATCC--G--TATAGGGTT---TGGGCATGTAGAAAACCTTGTATTGAATCAAATACTCCTCATCA-----GT-------TTA----GTTATAAGCTGGAAACG----G-AAAAAAAT---------------------ATATATATTGTTTTTTTCCAGCGCGGCCTGATGTTACATCCCAACTTTCCGCCT-------GAGCCCAGCCTTATTGTCATCCTCACCAAAGCGCCGCGCGCTGAAT--------CTACCAGGATGCAGTTTAAAAAAGCTTAAATA-TTTTTTTTGCTTCGC------GAAATATA----TCTATACTCGCGAAAAGCGTTGGGAGGATGGAGCTG---AGACGGTGTCTCATGTATAAAAGAAGAAAAAC----ATCTTAGTTGTTAGGGACGCAGCATCCGTAAGA----TTCTTGGGAGAGTCTCTATTTCATAAGTGGAAGATACAGTCCCTACTCTTGCTAGGCTCATCAGCTTAT----TACCCAAT-GCTCTAA---AATAGTATTTCTTTG-CCTT----ATGGGA-GCGTAAGAGATTATT Mittenothamnium_reptans 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Myurium_hochstetteri 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Myuroclada_maximowiczii 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Neckera_pennata 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Neodicladiella_pendula 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Neodolichomitra_yunnanensis 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Neolindbergia_cladomnioides 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Noguchiodendron_sphaerocarpum 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Okamuraea_hakoniensis 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Orthostichella_pentasticha 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Platyhypnidium_riparioides 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Platylomella_lescurii 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Pleuroziopsis_ruthenica 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Pleurozium_schreberi 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Porothamnium_arbusculans 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Porotrichodendron_nitidum 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Pseudocalliergon_angustifolium 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Pseudocryphaea_domingensis 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Pseudoleskeopsis_imbricata 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Pterobryella_praenitens 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Racopilum_cuspidigerum 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Radulina_borbonica 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Rauiella_lagoensis 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Renauldia_mexicana 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Rhacopilopsis_trinitensis 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Rhaphidostichum_schwaneckeanum 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Rhytidiadelphus_triquetrus 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Rhytidium_rugosum 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Rigodiadelphus_robustus 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Rigodium_toxarion 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Rozea_pterogonioides 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Rutenbergia_madagassa 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Schimperobryum_splendidissimum 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Schroeterella_zygodonta 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Schwetschkea_grateloupii 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Scleropodium_obtusifolium 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Scorpidium_scorpioides 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Sematophyllum_demissum 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Sphaerotheciella_sphaerocarpa 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Stereophyllum_radiculosum 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Struckia_argentata 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Symphyodon_imbricatifolius 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Symphysodontella_cylindracea 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Taiwanobryum_speciosum 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Taxiphyllopsis_iwatsukii 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Thamniopsis_incurva 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Thuidiopsis_furfurosa 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Tomentypnum_falcifolium 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Trachybryum_megaptilum 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Trachyloma_planifolium 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Trachyphyllum_gastrodes 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Trachypus_bicolor 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Vesicularia_vesicularis 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Warburgiella_leucocytus 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Warnstorfia_exannulata 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GTGTAAGAATAATACGTCGTTTAGGAACTTTACCAGGACTAACTAATAAAACATCCCAGTTAAAATCTAGTTCTATCAATCAATCAACATCTAATAAAAAAATTTCTCAGTATCGTATTCGTTTAGAAGAGAAACAAAAATTACGTTTTCATTATGGAATAACAGAACGACAATTACTTAATTATGTACGTATTGCTAGAAAAGCAAAAGGATCTACAGGTGAAGTTTTATTACAATTACTCGAAATGCGTTTAGATAATGTTATTTTTCGATTAGGTATGGCTCCTACGATTCCTGGAGCAAGACAATTAGTAAATCATAGACATATTTTAGTTAATGATTCTATAGTAGATATACCAAGTTATCGGTGTAAACCTCAGGATTTTATTACTATAAAAAATCAACGAAAATCTGAGACTATAATTAATAAAAATATAGAGTTTTATCAAAAATCTAAAATACCAAATCATTTAACTTATAGTTCTTTAGAAAAAAAAGGATTAGTTAATCAAATATTAGATCGTGAATCAATTGATTTAAAAATAAATGAATTATTAGTTGTAGAATATTATTCTCGTCAAGCTTAATTAAGAATTAATAGTATTTT Regmatodon_orthostegius_Malawi GTGTAAGAATAATACGTCGTTTAGGAACTTTACCAGGACTAACTAATAAAACATCCCAGTTAAAATCTAGTTCTATCAATCAATCAACATCTAATAAAAAAATTTCTCAGTATCGTATTCGTTTAGAAGAGAAACAAAAATTACGTTTTCATTATGGAATAACAGAACGACAATTACTTAATTATGTACGTATTGCTAGAAAAGCAAAAGGATCTACAGGTGAAGTTTTATTACAATTACTCGAAATGCGTTTAGATAATGTTATTTTTCGATTAGGTATGGCTCCTACGATTCCTGGAGCAAGACAATTAGTAAATCATAGACATATTTTAGTTAATGATTCTATAGTAGATATACCAAGTTATCGGTGTAAACCTCAGGATTTTATTACTATAAAAAATCAACGAAAATCTGAGACTATAATTAATAAAAATATAGAGTTTTATCAAAAATCTAAAATACCAAATCATTTAACTTATAGTTCTTTAGAAAAAAAAGGATTAGTTAATCAAATATTAGATCGTGAATCAATTGATTTAAAAATAAATGAATTATTAGTTGTAGAATATTATTCTCGTCAAGCTTAATTAAGAATTAATAGTATTTT Rhytidium_rugosum GTGTAAGAATAATACGTCGTTTAGGAACTTTACCAGGACTAACTAATAAAACACCCCAGTTAAAATCTAGTTCTATCAATCAATCAACATCTAATAAAAAAATTTCTCAGTATCGCATTCGTTTAGAAGAAAAACAAAAATTACGTTTTCATTATGGAATAACAGAACGACAATTACTTAATTATGTACGTATTGCTAGAAAAGCAAAAGGATCCACAGGTGAAGTTTTATTACAATTACTCGAAATGCGTTTAGATAATGTTATTTTTCGATTAGGTATGGCTCCTACAATTCCTGGAGCAAGACAATTAGTAAATCATAGACATATTTTAGTTAATGATTGTATAGTAGATATACCAAGTTATCGGTGTAAACCTCAGGATTTTATTACTATAAAAAATCAACAAAAATCTGAGACTATAATTAATAAAAATATAGAGTTTTATCAAAAATCTAAAATACCAAATCATTTAACTTATAGTTCTTTAGAAAAAAAAGGATTAGTTAATCAAATATTAGATCGTGAATCAATTGATTTAAAAATAAATGAATTATTAGTTGTAGAATATTATTCTCGTCAAGCTTAACTAAGAATTAATAGTATTTT Vesicularia_vesicularis GTGTAAAAATAATACGTCGTTTGGGAACTTTACCAGGACTAACTAATAAAACACCCCAGTTAAAATCTAGTTCTATCAATCAATCAACATCTAATAAAAAAATTTCTCAGTATCGCATTCGTTTAGAAGAAAAACAAAAATTACGTTTTCATTATGGAATAACAGAACGACAATTACTTAATTATATACGTATTGCTAGAAAAGCAAAAGGATCCACAGGTGAAATTTTATTACAATTACTTGAAATGCGTTTAGATAATGTTATTTTTCGATTAGGTATGGCTCCTACAATTGCTGGAGCAAGACAATTAGTAAATCATAGACATATTTTAGTTAATCATTGTATAGTAAATATATCAGGTTATCGGTGTAAACCTCAGGATATTATTACTATAAAAAATCAACAAAAATCTGAGACTATAATTAATAAAAATATAGAGTTTTATCAAAGATCTAAAATACCAAATCATTTAACTTATAGTTCTTTAGAAAAAAAAGGATTAATTAATCAAATATTAGATCGTGAATCAATTGGTTTAAAAATAAATGAATTATTAGTTGTAGAATATTATTCTCGTCAAGCTTAACTAAGAATTAATAGTATTTT Yunnanobryon_rhyacophilum_1 GTGTAAGAATAATACGTCGTTTAGGAACTTTACCAGGACTAACTAATAAAACACCCCAGTTAAAATCTAGTTCTATCAACCAATCAACATCTAATAAAAAAATTTCTCAGTATCGCATTCGTTTAGAAGAAAAACAAAAATTACGTTTTCATTATGGAATAACAGAACGACAATTACTTAATTATGTACGTATTGCTAGAAAAGCAAAAGGATCCACAGGTGAAGTTTTATTACAATTACTCGAAATGCGTTTAGATAATGTTATTTTTCGGTTAGGTATGGCTCCTACGATTCCTGGAGCAAGACAATTAGTAAATCATAGACATATTTTAGTTAATGATTCTATAGTAGATATACCAAGTTATCGGTGTAAACCTCAGGATTTTATTACTATAAAAAATCAACGAAAATCTGAGACTATAATTAATAAAAATATAGAGTTTTATCAAAAATCTAAAATACCAAATCATTTAACTTATAGTTTTTTAGAAAAAAAAGGATTAGTTAATCAAATATTAGATCGTGAATCGATTGATTTAAAAATAAATGAATTATTAGTTGTAGAATATTATTCTCGTCAAGCTTAACTAAAAATTAATAGTATTTT Yunnanobryon_rhyacophilum_2 GTGTAAGAATAATACGTCGTTTAGGAACTTTACCAGGACTAACTAATAAAACACCCCAGTTAAAATCTAGTTCTATCAACCAATCAACATCTAATAAAAAAATTTCTCAGTATCGCATTCGTTTAGAAGAAAAACAAAAATTACGTTTTCATTATGGAATAACAGAACGACAATTACTTAATTATGTACGTATTGCTAGAAAAGCAAAAGGATCCACAGGTGAAGTTTTATTACAATTACTCGAAATGCGTTTAGATAATGTTATTTTTCGGTTAGGTATGGCTCCTACGATTCCTGGAGCAAGACAATTAGTAAATCATAGACATATTTTAGTTAATGATTCTATAGTAGATATACCAAGTTATCGGTGTAAACCTCAGGATTTTATTACTATAAAAAATCAACGAAAATCTGAGACTATAATTAATAAAAATATAGAGTTTTATCAAAAATCTAAAATACCAAATCATTTAACTTATAGTTTTTTAGAAAAAAAAGGATTAGTTAATCAAATATTAGATCGTGAATCGATTGATTTAAAAATAAATGAATTATTAGTTGTAGAATATTATTCTCGTCAAGCTTAACTAAAAATTAATAGTATTTT Yunnanobryon_rhyacophilum_3 GTGTAAGAATAATACGTCGTTTAGGAACTTTACCAGGACTAACTAATAAAACACCCCAGTTAAAATCTAGTTCTATCAACCAATCAACATCTAATAAAAAAATTTCTCAGTATCGCATTCGTTTAGAAGAAAAACAAAAATTACGTTTTCATTATGGAATAACAGAACGACAATTACTTAATTATGTACGTATTGCTAGAAAAGCAAAAGGATCCACAGGTGAAGTTTTATTACAATTACTCGAAATGCGTTTAGATAATGTTATTTTTCGGTTAGGTATGGCTCCTACGATTCCTGGAGCAAGACAATTAGTAAATCATAGACATATTTTAGTTAATGATTCTATAGTAGATATACCAAGTTATCGGTGTAAACCTCAGGATTTTATTACTATAAAAAATCAACGAAAATCTGAGACTATAATTAATAAAAATATAGAGTTTTATCAAAAATCTAAAATACCAAATCATTTAACTTATAGTTTTTTAGAAAAAAAAGGATTAGTTAATCAAATATTAGATCGTGAATCGATTGATTTAAAAATAAATGAATTATTAGTTGTAGAATATTATTCTCGTCAAGCTTAACTAAAAATTAATAGTATTTT Yunnanobryon_rhyacophilum_4 GTGTAAGAATAATACGTCGTTTAGGAACTTTACCAGGACTAACTAATAAAACACCCCAGTTAAAATCTAGTTCTATCAACCAATCAACATCTAATAAAAAAATTTCTCAGTATCGCATTCGTTTAGAAGAAAAACAAAAATTACGTTTTCATTATGGAATAACAGAACGACAATTACTTAATTATGTACGTATTGCTAGAAAAGCAAAAGGATCCACAGGTGAAGTTTTATTACAATTACTCGAAATGCGTTTAGATAATGTTATTTTTCGGTTAGGTATGGCTCCTACGATTCCTGGAGCAAGACAATTAGTAAATCATAGACATATTTTAGTTAATGATTCTATAGTAGATATACCAAGTTATCGGTGTAAACCTCAGGATTTTATTACTATAAAAAATCAACGAAAATCTGAGACTATAATTAATAAAAATATAGAGTTTTATCAAAAATCTAAAATACCAAATCATTTAACTTATAGTTTTTTAGAAAAAAAAGGATTAGTTAATCAAATATTAGATCGTGAATCGATTGATTTAAAAATAAATGAATTATTAGTTGTAGAATATTATTCTCGTCAAGCTTAACTAAAAATTAATAGTATTTT ; END; BEGIN TREES; TITLE TS1_nad5; LINK TAXA = Taxa5; TRANSLATE 1 Abietinella_abietina_AY908386, 2 Acrocladium_auriculatum_AY908747, 3 Acroporium_pungens_AY908539, 4 Actinothuidium_hookeri_AY908399, 5 Aerobryidium_aureonitens_AY908730, 6 Aerobryum_speciosum_AY908498, 7 Aerolindigia_capillacea_AY908511, 8 Alsia_californica_AY908639, 9 Amblystegium_serpens_AY908685, 10 Andoa_berthelotiana_AY908438, 11 Anomodon_viticulosus_FM161241, 12 Aptychella_proligera_AY908474, 13 Aptychopsis_pyrrophylla_AY908476, 14 Baldwiniella_kealeensis_AY908734, 15 Barbellopsis_trichophora_AY908723, 16 Benitotania_elimbata_AY452321, 17 Bissetia_lingulata_AY908448, 18 Boulaya_mitteni_AY908395, 19 Brachelyma_subulatum_AY908492, 20 Braithwaitea_sulcata_AY524524, 21 Brotherella_recurvans_AY908470, 22 Bryoandersonia_illecebra_AY908471, 23 Bryocrumia_andersonii_AY908437, 24 Bryonorrisia_acutifolia_AY908450, 25 Bryostreimannia_turgida_AY908392, 26 Callicladium_haldanianum_AY908760, 27 Calliergon_cordifolium_AY908710, 28 Calliergonella_cuspidata_AY908403, 29 Calyptothecium_praelongum_AY908699, 30 Camptochaete_arbuscula_AY908658, 31 Campyliadelphus_stellatus_AY908417, 32 Campylophyllum_halleri_AY908433, 33 Caribaeohypnum_polypterum_AY908628, 34 Catagoniopsis_berteroana_AY908756, 35 Catagonium_nitens_AY908473, 36 Chaetomitriopsis_glaucocarpa_AY908681, 37 Chaetomitrium_borneense_AY452333, 38 Chionostomum_rostratum_AY908477, 39 Cirriphyllum_cirrosum_AY908524, 40 Claopodium_whippleanum_AY908746, 41 Clastobryophilum_bogoricum_AY908822, 42 Clastobryopsis_planula_AY908550, 43 Clastobryum_tenuirameum_AY908481, 44 Colobodontium_vulpinum_AY908534, 45 Conardia_compacta_AY908634, 46 Cratoneuron_filicinum_AY908425, 47 Cratoneuropsis_relaxa_AY908427, 48 Crosbya_straminea_AY908490, 49 Cryptoleptodon_longisetus_AY908651, 50 Cryptopapillaria_penicillata_AY908717, 51 Ctenidium_molluscum_AY908440, 52 Curvicladium_kurzii_AY908670, 53 Cyathophorum_bulbosum_AY452339, 54 Cyptodon_muelleri_AY908686, 55 Cyptodontopsis_obtusifolia_AY908687, 56 'Cyrto-hypnum schistocalyx AY908396', 57 Dendroalsia_abietina_AY908459, 58 Dendrocryphaea_cuspidata_AY908694, 59 Dendropogonella_rufescens_AY908708, 60 Dichelyma_falcatum_AY908493, 61 Dimerodontium_balansae_AY908409, 62 Dimorphocladon_borneense_AY452348, 63 Dixonia_thamnioides_AY908469, 64 Dolichomitra_cymbifolia_AY908495, 65 Dolichomitriopsis_diversiformis_AY908663, 66 Donnellia_commutata_AY908536, 67 Dozya_japonica_AY908649, 68 Ectropothecium_leptochaeton_AY908405, 69 Elmeriobryum_philippinense_AY908388, 70 Eriodon_conostomus_AY908684, 71 Erythrodontium_longisetum_AY908527, 72 Eulacophyllum_cultelliforme_AY908752, 73 Eurhynchiella_acanthophylla_AY908503, 74 Eurohypnum_leptothallum_AY908443, 75 Fabronia_pusilla_AY908754, 76 Fauriella_tenuis_AY908545, 77 Foreauella_orthothecia_AY908461, 78 Forsstroemia_trichomitria_FM161260, 79 Garovaglia_elegans_AY452356, 80 Gradsteinia_andicola_AY908420, 81 Habrodon_perpusillus_AY908683, 82 Hamatocaulis_vernicosus_AY908434, 83 Handeliobryum_sikkimense_AY908672, 84 Haplohymenium_triste_AY908458, 85 Helodium_blandowii_AY908393, 86 Henicodium_geniculatum_AY908691, 87 Herpetineuron_toccoae_AY908638, 88 Heterophyllium_affine_AY908466, 89 Circulifolium_microdendron_AY908472, 90 Homalia_trichomanoides_AY908673, 91 Homaliodendron_flabellatum_AY908671, 92 Hookeria_acutifolia_AY452362, 93 Horikawaea_redfearnii_AY908704, 94 Horridohypnum_mexicanum_AY908630, 95 Hydropogon_fontinaloides_AY908535, 96 Hygrohypnum_smithii_AY908985, 97 Hylocomiastrum_pyrenaicum_AY908644, 98 Hylocomiopsis_cylindracarpa_AY908394, 99 Hylocomium_splendens_AY908447, 100 Hymenodon_pilifer_AY908778, 101 Hypnobartlettia_fontana_AY908428, 102 Hypnum_cupressiforme_AY908444, 103 Ischyrodon_lepturus_AY908755, 104 Isocladiella_surcularis_AY908467, 105 Isodrepanium_lentulum_AY908530, 106 Isothecium_myosuroides_AY908661, 107 Jaegerina_scariosa_AY908462, 108 Juratzkaeella_sinensis_AY908751, 109 Lembophyllum_divulsum_FM161296, 110 Leptodictyum_riparium_AY908713, 111 'Leptopterigynandrum austro-alpinum AY908744', 112 Lepyrodontopsis_trichophylla_AY908531, 113 Lescuraea_radicosa_AY908737, 114 Leskeadelphus_bolivianus_AY908411, 115 Leskeella_nervosa_AY908414, 116 Leucodon_sciuroides_AY908716, 117 Leucomium_strumosum_AY908488, 118 Levierella_fabroniacea_AY908528, 119 Limbella_tricosta_AY908441, 120 Lindbergia_brachyptera_AY908412, 121 Lindigia_aciculata_AY908512, 122 Loeskeobryum_brevirostre_AY908635, 123 Macrothamnium_macrocarpum_AY908390, 124 Mahua_enervis_AY908761, 125 Mesochaete_undulata_AY631222, 126 Mesonodon_flavescens_AY908529, 127 Metaneckera_menziesii_AY908648, 128 Meteoridium_remotifolium_AY908517, 129 Meteoriella_soluta_AY908637, 130 Meteorium_illecebrum_AY908733, 131 Mittenothamnium_reptans_AY908627, 132 Muellerobryum_whiteleggei_AY908688, 133 Myurium_hochstetteri_AY908439, 134 Myuroclada_maximowiczii_AY908526, 135 Neckera_pennata_AY908652, 136 Neodicladiella_pendula_AY908727, 137 Neodolichomitra_yunnanensis_AY908506, 138 Neolindbergia_cladomnioides_AY908442, 139 Noguchiodendron_sphaerocarpum_AY908464, 140 Oedicladium_doii_AY908738, 141 Okamuraea_hakoniensis_AY908496, 142 Orthorrhynchium_elegans_AY908766, 143 Orthostichella_pentasticha_AY908655, 144 Orthostichidium_involutifolium_AY908700, 145 Orthostichopsis_tetragona_AY908689, 146 Orthotheciella_varia_AY908430, 147 Orthothecium_chryseum_AY908759, 148 Oxyrrhynchium_rugosipes_AY908514, 149 Palamocladium_leskeoides_AY908499, 150 Palisadula_chrysophylla_AY908739, 151 Papillidiopsis_complanata_AY908482, 152 Paranapiacabaea_paulista_AY908480, 153 Penzigiella_cordata_AY908653, 154 Phyllodon_truncatulus_AY908682, 155 Phyllogonium_fulgens_AY908709, 156 Pilotrichopsis_dentata_AY908715, 157 Pinnatella_piniformis_AY908654, 158 Pireella_angustifolia_AY908692, 159 Plagiothecium_cavifolium_AY908763, 160 Platygyriella_aurea_AY908622, 161 Platyhypnidium_riparioides_AY908504, 162 Platylomella_lescurii_AY908402, 163 Pleuroziopsis_ruthenica_AY908647, 164 Pleurozium_schreberi_AY908642, 165 Porothamnium_arbusculans_AY908679, 166 Porotrichodendron_nitidum_AY908678, 167 Porotrichopsis_flacca_AY908676, 168 Porotrichum_longirostre_AY908677, 169 Potamium_lonchophyllum_AY908540, 170 Pseudocalliergon_angustifolium_AY908423, 171 Pseudocryphaea_domingensis_AY908633, 172 Pseudoleskea_andina_AY908696, 173 Pseudoleskeella_tectorum_AY908416, 174 Pseudoleskeopsis_imbricata_AY908410, 175 Pseudotaxiphyllum_elegans_AY908753, 176 Pseudotrachypus_martinicensis_AY908729, 177 Pseudotrismegistia_perundulata_AY908980, 178 Pterigynandrum_filiforme_AY908757, 179 Pterobryella_praenitens_AY908769, 180 Pterobryopsis_stolonacea_AY908701, 181 Pterogonidium_pulchellum_AY908487, 182 Pterogoniopsis_cylindrica_AY908537, 183 Pterogonium_gracile_AY908667, 184 Ptychodium_plicatum_AY908735, 185 Puiggariopsis_aurifolia_AY908626, 186 Pulchrinodus_inflatus_AY908360, 187 Pylaisia_polyantha_AY908408, 188 Racopilum_cuspidigerum_AY524532, 189 Radulina_borbonica_AY908485, 190 Rauiella_lagoensis_AY908400, 191 Regmatodon_declinatus_AY908413, 192 Renauldia_mexicana_AY908666, 193 Rhacopilopsis_trinitensis_AY908543, 194 Rhaphidostichum_schwaneckeanum_AY908484, 195 Rhizogonium_pennatum_AY631233, 196 Rhynchostegium_serrulatum_AY908502, 197 Rhytidiadelphus_triquetrus_AY908636, 198 Rhytidium_rugosum_AY908415, 199 Rigodiadelphus_robustus_AY908736, 200 Rigodium_toxarion_AY908657, 201 Rozea_pterogonioides_AY908544, 202 Rutenbergia_madagassa_AY908632, 203 Sauloma_tenella_AY452384, 204 Schimperobryum_splendidissimum_AY452385, 205 Schofieldiella_micans_isolate_AY908624, 206 Schroeterella_zygodonta_AY908478, 207 Schwetschkea_grateloupii_AY908509, 208 Scleropodium_obtusifolium_AY908525, 209 Scorpidium_scorpioides_AY908435, 210 Sematophyllum_demissum_AY908479, 211 Sphaerotheciella_sphaerocarpa_AY908698, 212 Spiridentopsis_longissima_AY908690, 213 Steerecleus_serrulatus_AY908500, 214 Stenocarpidiopsis_salicicola_AY908508, 215 Stereophyllum_radiculosum_AY908750, 216 Struckia_argentata_AY908762, 217 Symphyodon_imbricatifolius_AY452387, 218 Symphysodontella_cylindracea_AY908707, 219 Taiwanobryum_speciosum_AY908669, 220 Taxiphyllopsis_iwatsukii_AY908432, 221 Thamniopsis_incurva_AY452391, 222 Thuidiopsis_furfurosa_AY908397, 223 Toloxis_imponderosa_AY908732, 224 Tomentypnum_falcifolium_AY908431, 225 Trachybryum_megaptilum_AY908522, 226 Trachyloma_planifolium_AY908445, 227 Trachyphyllum_gastrodes_AY908532, 228 Trachypodopsis_serrulata_AY908720, 229 Trachypus_bicolor_AY908446, 230 Tripterocladium_leucocladulum_AY908662, 231 Vesicularia_vesicularis_AY908406, 232 Vittia_pachyloma_AY908463, 233 Warburgiella_leucocytus_AY908538, 234 Warnstorfia_exannulata_AY908711, 235 Weymouthia_mollis_AY908659, 236 Wijkia_extenuata_AY908542, 237 Yunnanobryon_sp.; TREE TS1_nad5_MP = [&R] ((132,(34,95,(((((9,32,47,71,147,220,224,232,(48,102),(81,171)),33),(83,210)),(1,4,18,26,29,78,86,99,163,188,191,(57,222),(70,124)),(((62,115,175),(192,237),121),(116,174,199)),(72,119,127)),(((6,150,197,(7,23,74,122,129,138,142,149,162,208,214,((20,40,135),(97,209),225))),27),36),(((3,((152,170),(190,195)),(13,183,233,(207,211),((45,153),(39,44),96,67))),(105,178,236)),(89,194)),(((53,84,90,92,140,219),91),(166,(167,168,169))),(((((42,187):2.0,196,126:2.0),101),((21,189),180)),(80,143)),(16,49,205,(93,(118,221))),((8,50,68,79,128),136),((73,109,215),176,164),(5,15,137,177,228),((123,130,198),165),(((37,38),63),155),(31,110,201,235),((30,145),181,94),(28,111,234),(22,(77,182)),(172,203),(141,151),(125,216),(107,230),(76,104),(75,103),(69,231),(54,204),(19,61),(12,43),(11,85),(10,134),229,227,226,223,218,217,213,212,206,202,200,193,185,184,179,173,161,160,159,158,157,156,154,148,146,144,139,133,131,120,117,114,113,112,108,106,100,98,88,87,82,66,65,64,60,59,58,56,55,52,51,46,41,35,25,24,17,14,2))):0.5,186:0.5); TREE TS1_nad5_ML = [&R] ((132:0.002445,((95:0.008474,34:0.003653):0.001186,(((((88:0.002337,(25:0.001233,((((((6:2.0E-6,(((138:2.0E-6,74:2.0E-6):2.0E-6,162:2.0E-6):2.0E-6,(((((7:2.0E-6,(208:2.0E-6,23:2.0E-6):2.0E-6):2.0E-6,122:2.0E-6):2.0E-6,(142:2.0E-6,149:0.001167):2.0E-6):2.0E-6,((((97:2.0E-6,209:2.0E-6):0.002335,(135:0.001167,(20:2.0E-6,40:2.0E-6):2.0E-6):0.001167):2.0E-6,225:2.0E-6):0.001167,129:0.002338):2.0E-6):0.001143,214:0.001165):2.0E-6):0.00124):2.0E-6,197:2.0E-6):2.0E-6,150:0.001161):0.001279,27:0.003535):0.001261,36:0.007188):0.001272,((114:0.002326,(51:0.001162,(131:0.00233,(223:2.0E-6,(229:0.003374,((5:0.002334,(228:2.0E-6,(137:0.001165,177:2.0E-6):2.0E-6):2.0E-6):2.0E-6,15:0.004685):0.00144):0.001147):0.001214):2.0E-6):2.0E-6):0.001217,(((63:0.009537,(37:2.0E-6,38:0.003445):0.008267):0.003474,155:0.001136):0.002404,82:0.003623):0.001145):2.0E-6):2.0E-6):9.28E-4):4.63E-4,217:0.007091):2.0E-6,((52:2.0E-6,(((((((((161:2.0E-6,(((22:0.010826,(182:0.006003,77:0.003475):0.007248):0.002285,((((236:2.0E-6,105:2.0E-6):2.0E-6,178:0.008379):0.003102,((3:0.01187,((170:0.009812,152:0.018756):0.002007,(190:0.031539,195:0.015687):0.002419):0.006546):2.0E-6,((((13:2.0E-6,(207:0.001149,211:0.001757):0.005291):2.0E-6,(((39:0.00471,44:0.008444):0.001064,96:0.005882):0.001542,(67:0.004318,(45:0.004683,153:0.00713):0.002619):0.001174):0.003092):2.0E-6,183:0.00116):2.0E-6,233:0.002315):0.00939):0.005762):0.004906,(194:0.013845,89:0.003915):0.001472):0.004434):2.0E-6,(43:2.0E-6,12:0.001266):0.00632):2.0E-6):0.001455,206:0.001179):1.38E-4,((((66:2.0E-6,(193:0.002328,64:0.003552):2.0E-6):2.0E-6,((107:2.0E-6,230:2.0E-6):0.002327,(201:0.001158,((235:0.001157,((2:0.004746,((167:0.003544,(168:0.001169,169:2.0E-6):2.0E-6):0.002347,166:2.0E-6):0.001164):0.00236,31:0.002317):2.0E-6):2.0E-6,110:2.0E-6):2.0E-6):0.001161):2.0E-6):2.0E-6,((((((8:0.002348,((128:2.0E-6,(79:2.0E-6,50:2.0E-6):2.0E-6):2.0E-6,68:2.0E-6):2.0E-6):0.001172,136:2.0E-6):0.00235,154:2.0E-6):2.0E-6,158:2.0E-6):2.0E-6,144:0.003535):0.001171,(((((140:0.003588,84:0.003539):0.001165,90:0.002371):2.0E-6,92:0.001171):2.0E-6,(219:0.0047,53:2.0E-6):0.001171):0.001135,91:0.005998):0.002399):2.0E-6):2.0E-6,184:0.005844):0.001161):0.001586,((((69:0.001141,231:0.003525):0.004731,((227:0.008223,(54:0.030923,202:0.007487):0.001898):2.0E-6,((216:2.0E-6,125:0.001153):0.011801,(113:0.00833,106:0.00709):0.001131):2.0E-6):0.00116):0.001151,17:0.003523):0.001169,((((157:0.00354,226:0.021538):2.0E-6,148:0.003521):0.001306,((((58:2.0E-6,(60:0.005888,((((111:2.0E-6,234:2.0E-6):2.0E-6,28:2.0E-6):0.001171,((156:0.001176,(204:0.049441,((146:0.001167,(159:0.001167,87:0.004734):2.0E-6):2.0E-6,213:2.0E-6):2.0E-6):0.001163):0.001173,(((56:0.001171,59:0.002346):2.0E-6,(212:2.0E-6,(173:0.001172,55:0.00117):2.0E-6):2.0E-6):0.00117,((139:0.008241,((11:2.0E-6,85:0.003541):0.001306,(((((((16:0.030438,49:0.018283):0.001338,(205:0.011624,((221:0.012714,118:0.020693):0.017235,93:0.010517):0.00476):0.003036):0.009215,((((126:0.013712,196:0.026264):2.0E-6,(101:0.013614,(187:0.009697,42:0.087406):0.011104):0.003256):0.007664,((21:0.008523,189:0.013406):9.9E-4,180:0.005985):0.006636):0.004827,(80:0.058228,143:0.013729):0.005373):0.004373):0.001387,(76:0.007199,104:0.002359):0.002349):2.0E-6,35:0.001168):0.001617,(164:0.003488,(176:0.005897,(73:0.005893,(215:0.007909,109:2.0E-6):2.0E-6):0.00389):2.0E-6):0.001283):0.001568,179:2.0E-6):0.001549):2.0E-6):2.0E-6,117:0.001169):2.0E-6):2.0E-6):2.0E-6):2.0E-6,(61:0.004777,19:0.001116):0.008376):2.0E-6):2.0E-6):2.0E-6,((108:0.004745,218:0.018001):0.001188,(133:0.003523,(94:0.004719,((145:0.014428,30:0.001189):0.002324,181:2.0E-6):0.001165):0.001161):2.0E-6):0.001158):0.001761,(((((192:0.001166,237:0.005971):0.001146,(121:2.0E-6,(175:0.002336,(62:2.0E-6,115:2.0E-6):2.0E-6):0.002332):2.0E-6):0.00115,(116:0.00233,(174:2.0E-6,199:2.0E-6):2.0E-6):0.001162):0.001153,(((210:0.002377,83:0.00113):0.004753,(33:0.002351,((((171:2.0E-6,81:2.0E-6):0.002329,((9:2.0E-6,(147:2.0E-6,71:2.0E-6):2.0E-6):2.0E-6,((102:0.001167,48:2.0E-6):0.002357,232:0.001176):2.0E-6):2.0E-6):0.001165,(220:0.002342,(32:0.002357,47:0.00354):0.001154):2.0E-6):2.0E-6,224:0.00117):0.001174):0.001148):0.00117,((163:0.003507,(((((26:0.001164,78:0.004748):2.0E-6,((70:0.001167,124:2.0E-6):0.001166,18:0.001164):2.0E-6):2.0E-6,1:0.002336):2.0E-6,99:2.0E-6):2.0E-6,(188:2.0E-6,((191:2.0E-6,(4:2.0E-6,(57:0.003553,222:0.002318):0.004694):0.002328):0.002334,86:0.001168):2.0E-6):2.0E-6):2.0E-6):0.001163,29:0.001173):0.001164):2.0E-6):2.0E-6,(119:0.002313,(127:0.001182,72:2.0E-6):2.0E-6):0.003488):0.00114):2.0E-6,((((75:0.002337,103:0.002373):0.002341,(14:0.007082,(185:0.002341,200:0.002353):0.001163):2.0E-6):2.0E-6,41:2.0E-6):2.0E-6,(160:0.011908,112:0.00357):0.003499):0.001159):2.0E-6):2.0E-6,(120:0.007197,65:0.001219):0.001174):2.0E-6):2.0E-6):2.0E-6,(134:2.0E-6,10:0.001162):0.001162):2.0E-6,((130:0.001164,(198:2.0E-6,123:2.0E-6):2.0E-6):0.002337,165:2.0E-6):0.001157):2.0E-6,98:0.001157):2.0E-6,24:0.007088):2.0E-6,(151:0.002322,141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END; BEGIN TREES; TITLE TS2_nad5; LINK TAXA = Taxa2; TRANSLATE 1 Bryonorrisia_acutifolia, 2 Dimerodontium_balansae, 3 Ectropothecium_leptochaeton, 4 Foreauella_orthothecia, 5 'Leptopterigynandrum austro-alpinum', 6 Leskeadelphus_bolivianus, 7 Leskeella_nervosa, 8 Lindbergia_brachyptera, 9 Pseudoleskeella_tectorum, 10 Pseudoleskeopsis_imbricata, 11 Regmatodon_declinatus, 12 Regmatodon_filiformis, 13 Regmatodon_orthostegius, 14 Rhytidium_rugosum, 15 Vesicularia_vesicularis, 16 Yunnanobryon_rhyacophilum_1, 17 Yunnanobryon_rhyacophilum_2, 18 Yunnanobryon_rhyacophilum_3, 19 Yunnanobryon_rhyacophilum_4; TREE TS2_nad5_MP = [&R] (1:6.2,((5:1.0,6:1.0):4.2,(8:3.2,(2:1.0,10:1.0):2.2,(7:1.0,9:1.0,14:1.0):2.2,(11:2.0,(16:1.0,17:1.0,18:1.0,19:1.0):1.0,(12:1.0,13:1.0):1.0):1.2):2.0,(4:2.0,(3:1.0,15:1.0):1.0):3.2):1.0); TREE TS2_nad5_ML = [&R] (1:9.3E-4,((3:0.001847,15:0.001889):0.005704,((5:1.0E-6,6:1.0E-6):0.005658,(4:0.004786,((7:0.001861,(9:1.0E-6,14:1.0E-6):1.0E-6):0.001858,(8:1.0E-6,((2:1.0E-6,10:0.00187):0.001858,(11:9.27E-4,((12:1.0E-6,13:1.0E-6):9.15E-4,(17:1.0E-6,(16:1.0E-6,(18:1.0E-6,19:1.0E-6):1.0E-6):1.0E-6):0.002757):1.0E-6):9.25E-4):1.0E-6):1.0E-6):9.24E-4):9.43E-4):1.0E-6):9.3E-4); END; BEGIN TREES; TITLE TS1_combined_data; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Abietinella_abietina, 2 Acrocladium_auriculatum, 3 Acroporium_pungens, 4 Actinothuidium_hookeri, 5 Aerobryidium_aureonitens, 6 Aerobryum_speciosum, 7 Aerolindigia_capillacea, 8 Alsia_californica, 9 Amblystegium_serpens, 10 Andoa_berthelotiana, 11 Anomodon_viticulosus, 12 Aptychella_proligera, 13 Aptychopsis_pyrrophylla, 14 Baldwiniella_kealeensis, 15 Barbellopsis_trichophora, 16 Benitotania_elimbata, 17 Bissetia_lingulata, 18 Boulaya_mitteni, 19 Brachelyma_subulatum, 20 Braithwaitea_sulcata, 21 Brotherella_recurvans, 22 Bryoandersonia_illecebra, 23 Bryocrumia_andersonii, 24 Bryonorrisia_acutifolia, 25 Bryostreimannia_turgida, 26 Callicladium_haldanianum, 27 Calliergon_cordifolium, 28 Calliergonella_cuspidata, 29 Calyptothecium_praelongum, 30 Camptochaete_arbuscula, 31 Campyliadelphus_stellatus, 32 Campylophyllum_halleri, 33 Caribaeohypnum_polypterum, 34 Catagoniopsis_berteroana, 35 Catagonium_nitens, 36 Chaetomitriopsis_glaucocarpa, 37 Chaetomitrium_borneense, 38 Chionostomum_rostratum, 39 Cirriphyllum_cirrosum, 40 Claopodium_whippleanum, 41 Clastobryophilum_bogoricum, 42 Clastobryopsis_planula, 43 Clastobryum_tenuirameum, 44 Colobodontium_vulpinum, 45 Conardia_compacta, 46 Cratoneuron_filicinum, 47 Cratoneuropsis_relaxa, 48 Crosbya_straminea, 49 Cryptoleptodon_longisetus, 50 Cryptopapillaria_penicillata, 51 Ctenidium_molluscum, 52 Curvicladium_kurzii, 53 Cyathophorum_bulbosum, 54 Cyptodon_muelleri, 55 Cyptodontopsis_obtusifolia, 56 'Cyrto-hypnum schistocalyx', 57 Dendroalsia_abietina, 58 Dendrocryphaea_cuspidata, 59 Dendropogonella_rufescens, 60 Dichelyma_falcatum, 61 Dimerodontium_balansae, 62 Dimorphocladon_borneense, 63 Dixonia_thamnioides, 64 Dolichomitra_cymbifolia, 65 Dolichomitriopsis_diversiformis, 66 Donnellia_commutata, 67 Dozya_japonica, 68 Ectropothecium_leptochaeton, 69 Elmeriobryum_philippinense, 70 Eriodon_conostomus, 71 Erythrodontium_longisetum, 72 Eulacophyllum_cultelliforme, 73 Eurhynchiella_acanthophylla, 74 Eurohypnum_leptothallum, 75 Fabronia_pusilla, 76 Fauriella_tenuis, 77 Foreauella_orthothecia, 78 Forsstroemia_trichomitria, 79 Garovaglia_elegans, 80 Gradsteinia_andicola, 81 Habrodon_perpusillus, 82 Hamatocaulis_vernicosus, 83 Handeliobryum_sikkimense, 84 Haplohymenium_triste, 85 Helodium_blandowii, 86 Henicodium_geniculatum, 87 Herpetineuron_toccoae, 88 Heterophyllium_affine, 89 Circulifolium_microdendron, 90 Homalia_trichomanoides, 91 Homaliodendron_flabellatum, 92 Hookeria_acutifolia, 93 Horikawaea_redfearnii, 94 Horridohypnum_mexicanum, 95 Hydropogon_fontinaloides, 96 Hygrohypnum_smithii, 97 Hylocomiastrum_pyrenaicum, 98 Hylocomiopsis_cylindracarpa, 99 Hylocomium_splendens, 100 Hymenodon_pilifer, 101 Hypnobartlettia_fontana, 102 Hypnum_cupressiforme, 103 Ischyrodon_lepturus, 104 Isocladiella_surcularis, 105 Isodrepanium_lentulum, 106 Isothecium_myosuroides, 107 Jaegerina_scariosa, 108 Juratzkaeella_sinensis, 109 Lembophyllum_divulsum, 110 Leptodictyum_riparium, 111 'Leptopterigynandrum austro-alpinum', 112 Lepyrodontopsis_trichophylla, 113 Lescuraea_radicosa, 114 Leskeadelphus_bolivianus, 115 Leskeella_nervosa, 116 Leucodon_sciuroides, 117 Leucomium_strumosum, 118 Levierella_fabroniacea, 119 Limbella_tricosta, 120 Lindbergia_brachyptera, 121 Lindigia_aciculata, 122 Loeskeobryum_brevirostre, 123 Macrothamnium_macrocarpum, 124 Mahua_enervis, 125 Mesochaete_undulata, 126 Mesonodon_flavescens, 127 Metaneckera_menziesii, 128 Meteoridium_remotifolium, 129 Meteoriella_soluta, 130 Meteorium_illecebrum, 131 Mittenothamnium_reptans, 132 Muellerobryum_whiteleggei, 133 Myurium_hochstetteri, 134 Myuroclada_maximowiczii, 135 Neckera_pennata, 136 Neodicladiella_pendula, 137 Neodolichomitra_yunnanensis, 138 Neolindbergia_cladomnioides, 139 Noguchiodendron_sphaerocarpum, 140 Oedicladium_doii, 141 Okamuraea_hakoniensis, 142 Orthorrhynchium_elegans, 143 Orthostichella_pentasticha, 144 Orthostichidium_involutifolium, 145 Orthostichopsis_tetragona, 146 Orthotheciella_varia, 147 Orthothecium_chryseum, 148 Oxyrrhynchium_rugosipes, 149 Palamocladium_leskeoides, 150 Palisadula_chrysophylla, 151 Papillidiopsis_complanata, 152 Paranapiacabaea_paulista, 153 Penzigiella_cordata, 154 Phyllodon_truncatulus, 155 Phyllogonium_fulgens, 156 Pilotrichopsis_dentata, 157 Pinnatella_piniformis, 158 Pireella_angustifolia, 159 Plagiothecium_cavifolium, 160 Platygyriella_aurea, 161 Platyhypnidium_riparioides, 162 Platylomella_lescurii, 163 Pleuroziopsis_ruthenica, 164 Pleurozium_schreberi, 165 Porothamnium_arbusculans, 166 Porotrichodendron_nitidum, 167 Porotrichopsis_flacca, 168 Porotrichum_longirostre, 169 Potamium_lonchophyllum, 170 Pseudocalliergon_angustifolium, 171 Pseudocryphaea_domingensis, 172 Pseudoleskea_andina, 173 Pseudoleskeella_tectorum, 174 Pseudoleskeopsis_imbricata, 175 Pseudotaxiphyllum_elegans, 176 Pseudotrachypus_martinicensis, 177 Pseudotrismegistia_perundulata, 178 Pterigynandrum_filiforme, 179 Pterobryella_praenitens, 180 Pterobryopsis_stolonacea, 181 Pterogonidium_pulchellum, 182 Pterogoniopsis_cylindrica, 183 Pterogonium_gracile, 184 Ptychodium_plicatum, 185 Puiggariopsis_aurifolia, 186 Pulchrinodus_inflatus, 187 Pylaisia_polyantha, 188 Racopilum_cuspidigerum, 189 Radulina_borbonica, 190 Rauiella_lagoensis, 191 Regmatodon_declinatus, 192 Renauldia_mexicana, 193 Rhacopilopsis_trinitensis, 194 Rhaphidostichum_schwaneckeanum, 195 Rhizogonium_pennatum, 196 Rhynchostegium_serrulatum, 197 Rhytidiadelphus_triquetrus, 198 Rhytidium_rugosum, 199 Rigodiadelphus_robustus, 200 Rigodium_toxarion, 201 Rozea_pterogonioides, 202 Rutenbergia_madagassa, 203 Sauloma_tenella, 204 Schimperobryum_splendidissimum, 205 Schofieldiella_micans_Isolate, 206 Schroeterella_zygodonta, 207 Schwetschkea_grateloupii, 208 Scleropodium_obtusifolium, 209 Scorpidium_scorpioides, 210 Sematophyllum_demissum, 211 Sphaerotheciella_sphaerocarpa, 212 Spiridentopsis_longissima, 213 Steerecleus_serrulatus, 214 Stenocarpidiopsis_salicicola, 215 Stereophyllum_radiculosum, 216 Struckia_argentata, 217 Symphyodon_imbricatifolius, 218 Symphysodontella_cylindracea, 219 Taiwanobryum_speciosum, 220 Taxiphyllopsis_iwatsukii, 221 Thamniopsis_incurva, 222 Thuidiopsis_furfurosa, 223 Toloxis_imponderosa, 224 Tomentypnum_falcifolium, 225 Trachybryum_megaptilum, 226 Trachyloma_planifolium, 227 Trachyphyllum_gastrodes, 228 Trachypodopsis_serrulata, 229 Trachypus_bicolor, 230 Tripterocladium_leucocladulum, 231 Vesicularia_vesicularis, 232 Vittia_pachyloma, 233 Warburgiella_leucocytus, 234 Warnstorfia_exannulata, 235 Weymouthia_mollis, 236 Wijkia_extenuata, 237 Yunnanobryon_sp.; TREE TS1_combined_MP = [&R] (126,((((((1,2,((((3,(13,(39,(((45,96),153),67)),183,(207,211),233)),((152,170),190,195)),((105,236),178)),89,194),((4,(57,222)),163),(((5,15,137,177,228),223),51,131,229),((6,(7,122),(20,40,135,225),23,74,(97,209),129,138,142,149,150,(162,197),208,214),(((123,130),198),165)),(((8,(50,(68,79)),128,136),(((53,(84,90),92,140,219),91),(166,((167,169),168)))),(144,158),154),(((((9,(48,102),71,147,232),(81,171)),32),47),(220,224)),((10,134),52),((11,85),(28,(111,234))),((12,43),(22,(77,182)),44,206),14,17,18,(19,61),(((24,217),(((37,38),63),155)),88),25,26,(27,(141,151)),(29,((69,231),78)),((((30,181),94,108,145,218),157),(133,139)),((31,(110,235),201),66,(107,230),193),33,((34,(132,186)),95),35,(36,((172,203),226)),41,46,((55,173),(56,212),59),58,(60,((87,(146,213),159),156)),(((62,115),121,(174,199)),(192,237)),64,65,(70,124),((72,127),119),(73,109,215),(75,103),(76,104),82,(83,210),86,98,99,100,(106,113),112,(114,185),116,117,120,((125,216),160),148,161,164,175,176,179,184,188,191,200,(202,227)),54),(((16,49),((93,(118,221)),205)),204)),(80,143)),(21,(180,189))),101),(42,187),196); TREE TS1_combined_ML = [&R] (((42:0.138201,187:0.023104):0.012166,(196:0.048872,((((189:0.031198,180:0.025346):0.001271,21:0.021649):0.011803,(((((((125:0.001558,216:0.007367):0.020147,160:0.02332):0.005547,176:0.009001):0.002648,(((76:0.011621,104:0.005796):0.003339,((73:0.007998,(109:0.008036,215:0.008654):2.0E-6):0.009904,35:0.004658):0.001088):0.001186,((148:0.006964,2:0.010479):0.002181,(179:0.004547,(((36:0.017571,(226:0.026794,(203:0.010508,172:0.00425):0.002367):0.005689):0.00379,(((28:0.003443,(234:2.0E-6,111:2.0E-6):0.002265):0.00576,(85:0.007963,11:2.0E-6):0.002682):0.001231,(((60:0.013995,(156:0.00236,(87:0.008076,(159:0.004542,(213:2.0E-6,146:0.005701):0.001134):2.0E-6):0.003401):0.00238):9.54E-4,((133:0.008214,139:0.014011):0.002079,(((94:0.012852,(145:0.020108,(30:0.008755,181:0.003587):0.003868):0.001065):0.001262,(218:0.024794,108:0.015429):0.001254):0.00363,157:0.008098):0.001211):0.002409):0.001188,(((((120:0.010309,(((((184:0.011451,(((31:0.002266,((235:0.003419,110:0.00223):0.00112,201:0.00336):2.0E-6):0.00224,((107:0.003349,230:2.0E-6):0.002237,66:0.003354):2.0E-6):2.0E-6,193:0.009052):0.002314):0.001048,(64:0.006868,((((8:0.00792,(128:0.001121,((68:0.014881,79:0.00231):0.002235,50:0.003513):0.003287):2.0E-6):0.0011,136:0.001145):0.009579,((166:0.002171,(168:0.003355,(167:0.006743,169:2.0E-6):0.00109):0.004576):0.006346,(91:0.00681,(92:0.006713,((140:0.016441,(84:0.013436,90:0.004578):0.002423):2.0E-6,(219:0.010116,53:2.0E-6):0.00111):2.0E-6):0.002209):0.001701):0.00573):0.003148,((158:0.00111,144:0.005681):0.002274,154:0.001127):2.0E-6):0.001122):2.0E-6):0.001121,(((227:0.022541,(206:0.005073,((12:0.012692,43:0.009771):0.018405,((182:0.022546,77:0.014357):0.015455,22:0.02926):0.005223):0.002722):0.002134):0.004381,(202:0.020686,((194:0.022478,89:0.008483):0.001253,((178:0.019982,(105:0.002216,236:0.001081):0.003849):0.004285,(((((183:0.002214,(13:0.001127,(211:0.004519,207:0.004494):0.004542):2.0E-6):0.001034,(((153:0.01081,(96:0.011093,45:0.003662):0.003702):0.005422,67:0.00681):0.003023,39:0.00996):0.001372):0.004042,(233:0.01185,44:0.044203):2.0E-6):0.009531,3:0.021132):0.003739,((170:0.029745,(152:0.025892,195:0.023206):7.87E-4):0.004959,190:0.04972):0.008507):0.014864):0.007955):0.008245):0.002569):2.0E-6,161:0.007965):0.002673):0.001293,25:0.003465):2.0E-6,(((((114:0.004567,185:0.007948):0.002558,(17:0.012881,100:0.008782):0.001166):0.001187,98:0.011814):7.58E-4,((41:0.005637,((165:0.011508,(198:0.003346,(123:0.006356,130:0.003444):0.003822):0.004573):0.003432,(((((142:0.006215,(((40:0.003406,135:0.005603):0.003288,20:0.004532):0.004462,225:2.0E-6):0.004535):0.003372,(97:2.0E-6,209:2.0E-6):0.009047):2.0E-6,((129:0.009917,((122:0.001126,7:0.001093):0.007878,208:0.003329):0.0035):0.001112,149:0.007673):0.002286):0.004523,((((214:0.003475,(162:0.003326,197:0.004492):0.002203):2.0E-6,74:0.002302):0.001157,150:0.00444):0.001133,(138:0.003314,6:0.003329):2.0E-6):0.005873):2.0E-6,23:0.004535):0.005821):0.001072):0.001157,(((51:0.00112,229:0.011313):2.0E-6,131:0.004509):0.001223,((95:0.014281,(34:0.01001,(186:0.005396,132:0.010724):0.003474):0.001282):0.00819,(223:0.004524,((137:0.002209,(228:0.001124,(5:0.005621,177:0.001155):2.0E-6):2.0E-6):2.0E-6,15:0.00668):0.005782):0.003464):2.0E-6):0.001257):2.0E-6):2.0E-6,(52:0.006958,(10:0.001121,134:2.0E-6):0.002301):0.001068):0.001269):2.0E-6):2.0E-6,(((164:0.007891,112:0.018434):2.0E-6,((75:0.004499,103:0.003389):0.003351,14:0.014865):2.0E-6):2.0E-6,(46:0.013915,200:0.005617):0.00114):0.001102):2.0E-6,(((155:0.009506,((37:2.0E-6,38:0.006716):0.009341,63:0.016702):0.007902):0.01283,(24:0.011483,217:0.010358):0.001114):0.001644,88:0.006792):0.001763):2.0E-6,((113:0.011796,106:0.01646):0.008166,((151:0.009157,141:0.007051):0.00936,27:0.008134):9.77E-4):2.0E-6):2.0E-6,(((83:0.006847,210:0.002245):0.005719,(((220:0.011725,224:0.003471):0.002216,(47:0.011687,(32:0.005722,(((((48:2.0E-6,102:0.001119):0.002248,71:0.003496):2.0E-6,147:2.0E-6):2.0E-6,(232:0.004506,9:0.003391):2.0E-6):0.001044,(81:0.002231,171:0.001135):0.003441):0.002247):0.002253):0.003324):0.002284,33:0.006833):0.001068):0.001121,(65:0.006833,(((188:0.003517,(((29:0.006857,((231:0.010652,69:0.003224):0.014989,78:0.016324):0.001429):0.002251,26:0.005626):2.0E-6,((70:0.003392,124:0.003356):0.002252,(86:0.005663,(((163:0.009074,((191:0.01025,4:2.0E-6):0.001117,(222:0.005503,57:0.009155):0.008052):0.002252):0.001087,(99:0.004496,18:0.002221):2.0E-6):2.0E-6,1:0.00456):2.0E-6):0.002228):2.0E-6):2.0E-6):0.001119,(116:0.009062,(175:0.014766,((237:0.01144,192:0.006829):0.00228,((199:2.0E-6,174:0.001123):0.002252,((62:2.0E-6,115:2.0E-6):0.002251,121:0.001125):2.0E-6):0.002262):0.002206):2.0E-6):0.001103):0.001094,(119:0.004448,(72:0.004437,127:0.009199):0.005787):0.005787):0.001096):2.0E-6):0.002183):0.001355):2.0E-6):0.001285):2.0E-6,((82:0.007106,(61:0.013013,19:0.010775):0.015537):0.002391,(117:0.003384,(58:0.004525,((59:0.006844,(56:0.003447,212:0.001141):0.00113):2.0E-6,(55:0.009293,173:0.002415):0.001072):0.004537):2.0E-6):0.001122):2.0E-6):0.001299):2.0E-6):0.002557):2.0E-6):0.00464,(((49:0.049098,16:0.051948):0.009379,(205:0.01975,((118:0.039355,221:0.035634):0.021719,93:0.034548):0.007492):0.007435):0.010611,204:0.095851):0.006851):0.002651,54:0.054772):0.009257,(143:0.030676,80:0.128313):0.013868):0.009591):0.007951,101:0.046984):0.003961):0.001534):0.015828,126:0.015828); END; BEGIN TREES; TITLE TS2_combined_data; LINK TAXA = Taxa2; TRANSLATE 1 Bryonorrisia_acutifolia, 2 Dimerodontium_balansae, 3 Ectropothecium_leptochaeton, 4 Foreauella_orthothecia, 5 'Leptopterigynandrum austro-alpinum', 6 Leskeadelphus_bolivianus, 7 Leskeella_nervosa, 8 Lindbergia_brachyptera, 9 Pseudoleskeella_tectorum, 10 Pseudoleskeopsis_imbricata, 11 Regmatodon_declinatus, 12 Regmatodon_filiformis, 13 Regmatodon_orthostegius, 14 Rhytidium_rugosum, 15 Vesicularia_vesicularis, 16 Yunnanobryon_rhyacophilum_1, 17 Yunnanobryon_rhyacophilum_2, 18 Yunnanobryon_rhyacophilum_3, 19 Yunnanobryon_rhyacophilum_4; TREE TS2_combined_MP = [&R] (1,((((2,6),(((3,15),4),8),(9,14)),(7,10),((11,(12,13)),(16,17,18,19))),5)); TREE TS2_combined_ML = [&R] (1:9.435E-4,(5:0.009531,((7:0.004931,10:0.008167):0.001286,(((11:0.001199,(12:2.0E-6,13:2.0E-6):0.001276):0.002846,((16:2.0E-6,19:2.0E-6):2.0E-6,(17:2.0E-6,18:2.0E-6):2.0E-6):0.005682):0.001224,((9:6.12E-4,14:2.0E-6):0.001225,((2:2.0E-6,6:2.0E-6):0.001225,(8:2.0E-6,(4:0.009294,(3:0.001757,15:0.005809):0.007291):0.00234):6.12E-4):2.0E-6):0.001223):2.0E-6):0.001814):9.435E-4); END; BEGIN TREES; TITLE TS1_rps4; LINK TAXA = Taxa4; TRANSLATE 1 Abietinella_abietina_AY907953, 2 Acrocladium_auriculatum_AY306854, 3 Acroporium_pungens_AY908207, 4 Actinothuidium_hookeri_AY908335, 5 Aerobryidium_aureonitens_AY306857, 6 Aerobryum_speciosum_AY306861, 7 Aerolindigia_capillacea_AY908303, 8 Alsia_californica_AY908258, 9 Amblystegium_serpens_AY908237, 10 Andoa_berthelotiana_AY908179, 11 Anomodon_viticulosus_AY908201, 12 Aptychella_proligera_AY908228, 13 Aptychopsis_pyrrophylla_AY908212, 14 Baldwiniella_kealeensis_AY908590, 15 Barbellopsis_trichophora_AY908288, 16 Benitotania_elimbata_AY449661, 17 Bissetia_lingulata_AY908352, 18 Boulaya_mitteni_AY908338, 19 Brachelyma_subulatum_AF306998, 20 Braithwaitea_sulcata_AY524469, 21 Brotherella_recurvans_AY908227, 22 Bryoandersonia_illecebra_AY908317, 23 Bryocrumia_andersonii_AY908196, 24 Bryonorrisia_acutifolia_AY908553, 25 Bryostreimannia_turgida_AY908556, 26 Callicladium_haldanianum_AY908561, 27 Calliergon_cordifolium_AF469844, 28 Calliergonella_cuspidata_AY908183, 29 Calyptothecium_praelongum_AY908594, 30 Camptochaete_arbuscula_AY306934, 31 Campyliadelphus_stellatus_AY908248, 32 Campylophyllum_halleri_AY908252, 33 Caribaeohypnum_polypterum_AY908347, 34 Catagoniopsis_berteroana_AY908200, 35 Catagonium_nitens_AF307003, 36 Chaetomitriopsis_glaucocarpa_AY908603, 37 Chaetomitrium_borneense_AY306880, 38 Chionostomum_rostratum_AY908210, 39 Cirriphyllum_cirrosum_AY908310, 40 Claopodium_whippleanum_AY908294, 41 Clastobryophilum_bogoricum_AY908208, 42 Clastobryopsis_planula_AY908229, 43 Clastobryum_tenuirameum_AY908230, 44 Colobodontium_vulpinum_AY908215, 45 Conardia_compacta_AY908568, 46 Cratoneuron_filicinum_AY908250, 47 Cratoneuropsis_relaxa_AY908244, 48 Crosbya_straminea_AY306887, 49 Cryptoleptodon_longisetus_AY908260, 50 Cryptopapillaria_penicillata_AY908292, 51 Ctenidium_molluscum_AY907954, 52 Curvicladium_kurzii_AY908266, 53 Cyathophorum_bulbosum_AY306889, 54 Cyptodon_muelleri_AY908586, 55 Cyptodontopsis_obtusifolia_AY908588, 56 'Cyrto-hypnum schistocalyx AY908336', 57 Dendroalsia_abietina_AY908185, 58 Dendrocryphaea_cuspidata_AY908587, 59 Dendropogonella_rufescens_AY908562, 60 Dichelyma_falcatum_AY908318, 61 Dimerodontium_balansae_AY907952, 62 Dimorphocladon_borneense_AY306898, 63 Dixonia_thamnioides_AY907956, 64 Dolichomitra_cymbifolia_AY908344, 65 Dolichomitriopsis_diversiformis_AY908329, 66 Donnellia_commutata_AY908211, 67 Dozya_japonica_AY908262, 68 Ectropothecium_leptochaeton_AY908558, 69 Elmeriobryum_philippinense_AY908323, 70 Eriodon_conostomus_AY908239, 71 Erythrodontium_longisetum_AY908256, 72 Eulacophyllum_cultelliforme_AY908197, 73 Eurhynchiella_acanthophylla_AY908299, 74 Eurohypnum_leptothallum_AY908203, 75 Fabronia_pusilla_AY908199, 76 Fauriella_tenuis_AY908233, 77 Foreauella_orthothecia_AY908560, 78 Forsstroemia_trichomitria_AM990365, 79 Garovaglia_elegans_AY306915, 80 Gradsteinia_andicola_AY908246, 81 Habrodon_perpusillus_AY908293, 82 Hamatocaulis_vernicosus_AY908251, 83 Handeliobryum_sikkimense_AY908267, 84 Haplohymenium_triste_AY908202, 85 Helodium_blandowii_AY908339, 86 Henicodium_geniculatum_AY908563, 87 Herpetineuron_toccoae_AY908566, 88 Heterophyllium_affine_AY908577, 89 Circulifolium_microdendron_AY908268, 90 Homalia_trichomanoides_AY908276, 91 Homaliodendron_flabellatum_AY908271, 92 Hookeria_acutifolia_AY306929, 93 Horikawaea_redfearnii_AY908600, 94 Horridohypnum_mexicanum_AY908349, 95 Hydropogon_fontinaloides_AY908216, 96 Hygrohypnum_smithii_AY908620, 97 Hylocomiastrum_pyrenaicum_AY908181, 98 Hylocomiopsis_cylindracarpa_AY908342, 99 Hylocomium_splendens_AY908280, 100 Hymenodon_pilifer_AY908176, 101 Hypnobartlettia_fontana_AY908245, 102 Hypnum_cupressiforme_DQ467883, 103 Ischyrodon_lepturus_AY908591, 104 Isocladiella_surcularis_AY908204, 105 Isodrepanium_lentulum_AY907964, 106 Isothecium_myosuroides_AY306933, 107 Jaegerina_scariosa_AY908601, 108 Juratzkaeella_sinensis_AY908198, 109 Lembophyllum_divulsum_AY306936, 110 Leptodictyum_riparium_AY907967, 111 'Leptopterigynandrum austro-alpinum AY908190', 112 Lepyrodontopsis_trichophylla_AY907965, 113 Lescuraea_radicosa_AY908326, 114 Leskeadelphus_bolivianus_AY907948, 115 Leskeella_nervosa_AY908325, 116 Leucodon_sciuroides_AY908186, 117 Leucomium_strumosum_AY306943, 118 Levierella_fabroniacea_AY907961, 119 Limbella_tricosta_AY908572, 120 Lindbergia_brachyptera_AY907949, 121 Lindigia_aciculata_AY908304, 122 Loeskeobryum_brevirostre_AY908278, 123 Macrothamnium_macrocarpum_AY908182, 124 Mahua_enervis_AY908319, 125 Mesochaete_undulata_AY631154, 126 Mesonodon_flavescens_AY908255, 127 Metaneckera_menziesii_AY908264, 128 Meteoridium_remotifolium_AY306949, 129 Meteoriella_soluta_AY306950, 130 Meteorium_illecebrum_AY908187, 131 Mittenothamnium_reptans_AY908346, 132 Muellerobryum_whiteleggei_AY908602, 133 Myurium_hochstetteri_AY908180, 134 Myuroclada_maximowiczii_AY908309, 135 Neckera_pennata_AY908265, 136 Neodicladiella_pendula_AY908284, 137 Neodolichomitra_yunnanensis_AY908297, 138 Neolindbergia_cladomnioides_AY908194, 139 Noguchiodendron_sphaerocarpum_AY907958, 140 Oedicladium_doii_AY908592, 141 Okamuraea_hakoniensis_AY908311, 142 Orthorrhynchium_elegans_AY908612, 143 Orthostichella_pentasticha_AY907962, 144 Orthostichidium_involutifolium_AY908195, 145 Orthostichopsis_tetragona_AY908192, 146 Orthotheciella_varia_AY908238, 147 Orthothecium_chryseum_AY907966, 148 Oxyrrhynchium_rugosipes_AY908315, 149 Palamocladium_leskeoides_AY908296, 150 Palisadula_chrysophylla_AY908593, 151 Papillidiopsis_complanata_AY908220, 152 Paranapiacabaea_paulista_AY908218, 153 Penzigiella_cordata_AY306972, 154 Phyllodon_truncatulus_AY908604, 155 Phyllogonium_fulgens_AY908193, 156 Pilotrichopsis_dentata_AY908599, 157 Pinnatella_piniformis_AY907963, 158 Pireella_angustifolia_AY908565, 159 Plagiothecium_cavifolium_AY908321, 160 Platygyriella_aurea_AY908575, 161 Platyhypnidium_riparioides_AY908298, 162 Platylomella_lescurii_AY908337, 163 Pleuroziopsis_ruthenica_AY908571, 164 Pleurozium_schreberi_AY908281, 165 Porothamnium_arbusculans_AY908277, 166 Porotrichodendron_nitidum_AY908273, 167 Porotrichopsis_flacca_AY908275, 168 Porotrichum_longirostre_AY908274, 169 Potamium_lonchophyllum_AY908221, 170 Pseudocalliergon_angustifolium_AY908242, 171 Pseudocryphaea_domingensis_AY908188, 172 Pseudoleskea_andina_AY908257, 173 Pseudoleskeella_tectorum_AY907950, 174 Pseudoleskeopsis_imbricata_AY908582, 175 Pseudotaxiphyllum_elegans_AY908578, 176 Pseudotrachypus_martinicensis_AY306982, 177 Pseudotrismegistia_perundulata_AY908618, 178 Pterigynandrum_filiforme_AY908189, 179 Pterobryella_praenitens_AF307002, 180 Pterobryopsis_stolonacea_AY908595, 181 Pterogonidium_pulchellum_AY908232, 182 Pterogoniopsis_cylindrica_AY908213, 183 Pterogonium_gracile_AY907970, 184 Ptychodium_plicatum_AY908327, 185 Puiggariopsis_aurifolia_AY908348, 186 Pulchrinodus_inflatus_AY907975, 187 Pylaisia_polyantha_AY907960, 188 Racopilum_cuspidigerum_AY524477, 189 Radulina_borbonica_AY908223, 190 Rauiella_lagoensis_AY908340, 191 Regmatodon_declinatus_AY908191, 192 Renauldia_mexicana_AY908333, 193 Rhacopilopsis_trinitensis_AY908225, 194 Rhaphidostichum_schwaneckeanum_AY908222, 195 Rhizogonium_pennatum_AY631170, 196 Rhynchostegium_serrulatum_AY908301, 197 Rhytidiadelphus_triquetrus_AY908279, 198 Rhytidium_rugosum_AY907951, 199 Rigodiadelphus_robustus_AY908569, 200 Rigodium_toxarion_AY908331, 201 Rozea_pterogonioides_AY907957, 202 Rutenbergia_madagassa_AY908605, 203 Sauloma_tenella_AY306987, 204 Schimperobryum_splendidissimum_AY306988, 205 Schofieldiella_micans_isolate_AY908235, 206 Schroeterella_zygodonta_AY908209, 207 Schwetschkea_grateloupii_AY908305, 208 Scleropodium_obtusifolium_AY306989, 209 Scorpidium_scorpioides_AY908584, 210 Sematophyllum_demissum_AY908214, 211 Sphaerotheciella_sphaerocarpa_AY908589, 212 Spiridentopsis_longissima_AY908564, 213 Steerecleus_serrulatus_AY908302, 214 Stenocarpidiopsis_salicicola_AY908307, 215 Stereophyllum_radiculosum_DQ467885, 216 Struckia_argentata_AY908320, 217 Symphyodon_imbricatifolius_AY306999, 218 Symphysodontella_cylindracea_AY908597, 219 Taiwanobryum_speciosum_AY908272, 220 Taxiphyllopsis_iwatsukii_AY908351, 221 Thamniopsis_incurva_AY449668, 222 Thuidiopsis_furfurosa_AY908341, 223 Toloxis_imponderosa_AY908289, 224 Tomentypnum_falcifolium_AY908567, 225 Trachybryum_megaptilum_AY908312, 226 Trachyloma_planifolium_AY631172, 227 Trachyphyllum_gastrodes_AY908236, 228 Trachypodopsis_serrulata_AY307008, 229 Trachypus_bicolor_AY908290, 230 Tripterocladium_leucocladulum_AY908334, 231 Vesicularia_vesicularis_AY908559, 232 Vittia_pachyloma_AY908240, 233 Warburgiella_leucocytus_AY908219, 234 Warnstorfia_exannulata_AY907968, 235 Weymouthia_mollis_AY307013, 236 Wijkia_extenuata_AY908205, 237 Yunnanobryon_sp.; TREE TS1_rps4_MP = [&R] (((((22,44,206,227,(43,12),(182,77)),(89,194,((236,105),(178,(((195,(170,152)),(190,42)),(233,((153,(96,45)),211,207,183,67,39,13,3))))))),(82,(61,19),((196,((187,(126,101)),(189,(180,21)))),(54,((143,80),(204,((118,221,(205,93)),(49,16))))))),((40,(135,(225,20))),(197,162),(209,97),(122,7),214,208,150,149,142,138,129,74,23,6),(112,(((168,(169,167)),166),((219,92),(90,84),140,91,53))),((237,192),((121,(78,(231,69))),199,174,115,62)),(47,(32,((171,81),232,147,102,71,48,9))),((139,133),(157,((108,94),(145,(218,181,30))))),((235,110),(193,107),230,201,66,31),(((215,109,73),35),(104,76),14),(165,(((79,68),50),(136,128,8))),(56,59,212,(173,55)),((151,141),((234,111),28)),(228,177,137,15,5),(155,(63,(38,37))),((226,203,172),36),(198,(130,123)),(119,(127,72)),((216,125),70),(224,(220,64)),(175,(222,57)),(229,131,51),(184,160),(213,146),(158,144),(113,106),(217,24),(134,10),223,210,202,200,188,185,179,176,164,163,161,159,156,154,148,124,120,117,116,114,103,100,99,98,88,87,86,85,83,75,65,60,58,52,46,41,33,29,27,26,25,18,17,11,4,2,1:2.0,191:2.0),132,95,34):0.5,186:0.5); TREE TS1_rps4_ML = [&R] ((132:0.015455,(95:0.013267,(34:0.013454,(52:0.013502,((((78:0.026958,185:0.008664):0.00268,98:0.018857):0.001874,(((51:2.0E-6,(131:0.004437,229:0.011152):2.0E-6):0.002193,(((114:0.008887,223:0.011041):0.002251,((82:0.004491,(61:0.017368,19:0.02088):0.013116):0.005127,(100:0.015583,((41:0.010897,((160:0.027244,(((227:0.022616,((43:0.018924,12:0.023012):0.01994,((182:0.03722,77:0.022019):0.023249,(44:0.029637,22:0.034277):0.008407):2.0E-6):0.008357):0.002527,206:0.00454):0.006103,(((166:0.006317,(168:0.004187,(169:2.0E-6,167:0.006425):0.002118):0.002122):0.001954,(219:0.008548,((((84:0.016927,90:0.004371):0.004753,(53:2.0E-6,91:0.004218):2.0E-6):2.0E-6,140:0.023089):0.002096,92:0.00848):2.0E-6):0.006517):0.00878,((198:0.007892,(123:0.010827,130:0.006148):0.00742):0.007251,(165:0.024344,(((128:0.002153,136:0.002151):2.0E-6,8:0.010916):0.004233,((68:0.029586,79:0.004069):0.004516,50:0.006675):0.002119):0.010378):0.002904):2.0E-6):0.00217):0.004502):0.002106,((23:0.009019,((138:0.006359,6:0.004244):2.0E-6,(((74:0.004232,214:0.00465):2.0E-6,(162:0.006306,197:0.006551):0.004239):0.002122,150:0.004222):0.002091):0.008698):2.0E-6,(((149:0.013902,(129:0.012496,((122:0.002267,7:0.002039):0.015973,208:0.006355):0.008902):0.00218):0.002936,(142:0.012275,(40:0.003071,(135:0.008471,(225:0.006279,20:0.008618):0.006145):0.003396):0.006471):0.003054):0.001962,(209:2.0E-6,97:2.0E-6):0.009029):0.011058):0.004398):2.0E-6):0.002244,184:0.008889):2.0E-6):0.002233):2.0E-6):2.0E-6,(10:2.0E-6,134:2.0E-6):0.004435):2.0E-6):2.0E-6,((164:0.006671,(120:0.004408,((((((((234:2.0E-6,111:2.0E-6):0.004567,28:0.006946):0.008968,(17:0.017815,(((230:2.0E-6,66:0.006617):2.0E-6,(201:0.00446,(31:2.0E-6,(235:0.004644,110:0.004387):0.002262):2.0E-6):0.00222):2.0E-6,(193:0.011321,107:0.004393):0.002227):0.004408):2.0E-6):0.002181,(154:0.002182,((46:0.011432,200:0.004343):0.002234,((75:0.004383,103:0.002188):0.002166,((47:0.016453,((((81:0.004444,171:0.002251):0.004378,9:0.006657):2.0E-6,(((232:0.006537,71:0.006793):2.0E-6,(147:2.0E-6,48:2.0E-6):2.0E-6):2.0E-6,102:2.0E-6):2.0E-6):0.002075,32:0.006686):0.004838):0.00429,((((210:2.0E-6,83:0.011133):0.002171,(33:0.008799,65:0.008646):2.0E-6):2.0E-6,((119:0.004326,(72:0.008606,127:0.016146):0.011721):0.004619,((29:0.013458,(((((175:0.013083,(57:0.011073,222:0.006324):0.006753):0.002257,99:0.008809):2.0E-6,(18:0.002137,163:0.013384):2.0E-6):2.0E-6,4:2.0E-6):2.0E-6,(1:0.002435,191:0.013927):0.001994):0.004346):2.0E-6,(26:0.00895,188:0.007099):2.0E-6):2.0E-6):0.002171):0.002171,((106:0.016421,113:0.009431):0.009299,((88:0.006578,((155:0.017328,(63:0.014964,(37:2.0E-6,38:0.006906):0.00228):0.009366):0.016825,(217:0.006852,24:0.008827):0.004423):0.003332):0.003526,((27:0.0044,((157:0.009261,((((181:0.007414,30:0.011018):0.00507,145:0.009455):0.002456,(94:0.014796,108:0.020127):0.001929):2.0E-6,218:0.014246):0.005055):0.002534,(133:0.006996,139:0.011701):0.004363):0.004915):2.0E-6,(60:0.015891,(156:0.002337,(87:0.006934,(159:0.006903,(213:2.0E-6,146:0.009264):0.002295):2.0E-6):0.004528):0.002231):0.002124):2.0E-6):0.002422):2.0E-6):2.0E-6):2.0E-6):2.0E-6):2.0E-6):2.0E-6):2.0E-6,(224:0.007739,(64:7.69E-4,220:0.018242):0.005237):0.001822):2.0E-6,(((174:0.002238,(((69:0.001809,231:0.017115):0.01692,121:2.0E-6):0.002257,((62:2.0E-6,115:2.0E-6):2.0E-6,199:2.0E-6):2.0E-6):2.0E-6):0.004544,(192:0.011454,237:0.011251):0.002386):0.002138,(25:0.002197,112:0.020725):2.0E-6):0.002184):2.0E-6,((161:0.015519,(89:0.008937,(((236:0.002044,105:0.004195):0.007878,((((152:0.01615,(170:0.038469,195:0.011271):5.48E-4):0.006563,(190:0.03185,42:0.025195):2.0E-6):0.004928,(233:0.017992,(((67:0.006632,((183:2.0E-6,(211:0.002298,3:0.00462):2.0E-6):0.002223,(13:0.002305,207:0.006958):2.0E-6):2.0E-6):0.002205,39:0.006802):2.0E-6,(153:0.007817,(45:2.0E-6,96:0.009224):0.004545):0.006679):0.009554):0.008632):0.01333,178:0.021124):0.003185):0.007585,194:0.017922):2.0E-6):0.011327):2.0E-6,(202:0.020342,(151:0.014154,141:0.009508):0.008608):2.0E-6):0.002174):2.0E-6,((((((((226:0.011205,(203:0.010906,172:0.004594):0.002126):0.009152,(204:0.090745,(221:0.064359,((49:0.064468,16:0.044199):0.015938,(93:0.051403,(118:0.050081,205:0.014155):0.006192):0.007375):2.0E-6):0.007258):0.008785):2.0E-6,(((80:0.141936,143:0.038506):0.016652,(101:0.062393,((21:0.027294,(189:0.033432,180:0.040166):0.002683):0.01014,((126:0.03519,187:0.027035):2.0E-6,196:0.04771):0.003604):0.006668):0.005861):0.008672,54:0.045912):0.006142):0.002019,36:0.01997):0.002376,(((35:0.006861,((73:0.004485,215:0.002269):2.0E-6,109:0.016464):0.00687):0.002059,(76:0.009115,104:0.006856):0.002067):2.0E-6,14:0.011109):0.00217):2.0E-6,179:0.008782):2.0E-6,(148:0.008762,(2:0.011545,176:0.004868):0.001892):2.0E-6):2.0E-6,((58:0.008824,((212:0.002272,56:0.004613):0.00221,((55:0.016394,173:0.002541):0.002073,59:0.00894):2.0E-6):0.006667):2.0E-6,117:0.004395):0.002166):0.002208):2.0E-6):2.0E-6):2.0E-6,((144:0.004363,158:0.002148):0.004422,(85:0.008901,11:2.0E-6):0.005033):2.0E-6):0.002238):0.002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END; BEGIN TREES; TITLE TS2_rps4; LINK TAXA = Taxa3; TRANSLATE 1 Bryonorrisia_acutifolia, 2 Dimerodontium_balansae, 3 Ectropothecium_leptochaeton, 4 Foreauella_orthothecia, 5 'Leptopterigynandrum austro-alpinum', 6 Leskeadelphus_bolivianus, 7 Leskeella_nervosa, 8 Lindbergia_brachyptera, 9 Pseudoleskeella_tectorum, 10 Pseudoleskeopsis_imbricata, 11 Regmatodon_declinatus, 12 Regmatodon_filiformis, 13 Regmatodon_orthostegius_India, 14 Regmatodon_orthostegius_Malawi, 15 Rhytidium_rugosum, 16 Vesicularia_vesicularis, 17 Yunnanobryon_rhyacophilum_1, 18 Yunnanobryon_rhyacophilum_2, 19 Yunnanobryon_rhyacophilum_3, 20 Yunnanobryon_rhyacophilum_4; TREE MP_rps4_TS2 = [&R] (15,(9,(8,((16,3),4)),6,2,((5,1),(7,10),((11,(12,13,14)),(17,18,19,20))))); TREE ML_rps4_TS2 = [&R] ((6:2.0E-6,2:2.0E-6):2.0E-6,((9:0.001691,((((17:2.0E-6,20:2.0E-6):2.0E-6,(18:2.0E-6,19:2.0E-6):2.0E-6):0.008566,(11:0.001613,((12:2.0E-6,14:2.0E-6):2.0E-6,13:2.0E-6):0.001783):0.007018):0.001722,((7:0.005923,10:0.015158):0.004355,(1:0.001659,5:0.015953):0.001666):2.0E-6):0.003384):2.0E-6,((4:0.019342,(16:0.013049,3:0.001463):0.009465):0.003311,8:2.0E-6):0.001706):2.0E-6,15:2.0E-6); END;