#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 26, 2024; 23:27 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Villarreal J., Campos s. L.V., Uribe melendez J., & Goffinet B. 2011. Parallel evolution of endospory within hornworts: Nothoceros renzagliensis (Dendrocerotaceae), sp. nov. Systematic Botany, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S11644] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=26; TAXLABELS Dendroceros_difficilis_JC104 Megaceros_flagellaris_JC102 Megaceros_gracilis_B36 Nothoceros_aenigmaticus_MA118 Nothoceros_aenigmaticus_MA65 Nothoceros_aenigmaticus_Mex240 Nothoceros_canaliculatus_JC113 Nothoceros_cf._aenigmaticus_JC17 Nothoceros_cf._aenigmaticus_JC188 Nothoceros_cf._aenigmaticus_JC40 Nothoceros_cf._aenigmaticus_JC41 Nothoceros_cf._canaliculatus_DC2 Nothoceros_cf._canaliculatus_JC42 Nothoceros_cf._vincentianus_JC23 Nothoceros_cf._vincentianus_JC90 Nothoceros_endiviaefolius_JC25 Nothoceros_endiviaefolius_JC78 Nothoceros_fuegiensis_JC24 Nothoceros_fuegiensis_JC55 Nothoceros_giganteus_JC28 Nothoceros_renzagliensis Nothoceros_superbus_MG3 Nothoceros_vincentianus_JC26 Nothoceros_vincentianus_JC46 Nothoceros_vincentianus_JC80 Phaeomegaceros_fimbriatus_JC73 ; END; BEGIN CHARACTERS; [! 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Nothoceros_canaliculatus_JC113 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Phaeomegaceros_fimbriatus_JC73 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; END; BEGIN SETS; CHARSET Character_Matrix (CHARACTERS = Nothoceros) = 1-1341; CHARSET Character_Matrix3 (CHARACTERS = Nothoceros) = 2702-3774; CHARSET Character_Matrix5 (CHARACTERS = Nothoceros) = 4615-5142; CHARSET Character_Matrix2 (CHARACTERS = Nothoceros) = 1342-2701; CHARSET Character_Matrix4 (CHARACTERS = Nothoceros) = 3775-4614; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * UNTITLED (CHARACTERS = Nothoceros) = N: 1-5142; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = Nothoceros) = N: 1-5142; END; BEGIN TREES; TITLE Villarreal.etal.2011.nrenzagliensis; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Dendroceros_difficilis_JC104, 2 Phaeomegaceros_fimbriatus_JC73, 3 Megaceros_gracilis_B36, 4 Megaceros_flagellaris_JC102, 5 Nothoceros_endiviaefolius_JC78, 6 Nothoceros_endiviaefolius_JC25, 7 Nothoceros_giganteus_JC28, 8 Nothoceros_fuegiensis_JC24, 9 Nothoceros_fuegiensis_JC55, 10 Nothoceros_renzagliensis, 11 Nothoceros_cf._vincentianus_JC23, 12 Nothoceros_cf._vincentianus_JC90, 13 Nothoceros_vincentianus_JC26, 14 Nothoceros_vincentianus_JC46, 15 Nothoceros_vincentianus_JC80, 16 Nothoceros_superbus_MG3, 17 Nothoceros_cf._canaliculatus_DC2, 18 Nothoceros_cf._canaliculatus_JC42, 19 Nothoceros_canaliculatus_JC113, 20 Nothoceros_cf._aenigmaticus_JC17, 21 Nothoceros_cf._aenigmaticus_JC40, 22 Nothoceros_cf._aenigmaticus_JC41, 23 Nothoceros_cf._aenigmaticus_JC188, 24 Nothoceros_aenigmaticus_Mex240, 25 Nothoceros_aenigmaticus_MA65, 26 Nothoceros_aenigmaticus_MA118; TREE MB = [&R] (1:0.0797380705477,(2:0.0285341684813,((10:0.00790695117209,(14:0.0194758959005,(((21:9.14502110877E-4,22:9.85890456616E-4)1.00:0.00261849216754,((24:5.70394511721E-4,(25:3.21785746028E-4,26:0.0011619276747)0.80:7.01970516823E-4)1.00:0.00209562381958,(20:0.00194772864126,23:0.00273764092879)0.58:6.89550926811E-4)1.00:0.00117862303111)1.00:0.00188247733585,(16:0.00877943328519,(19:0.00296972253083,(17:0.00164193039662,18:0.00143516003777)1.00:0.00259984090657)1.00:0.00876343761804)0.98:0.00127219672316,((13:0.00629909804466,15:0.00721865420509)1.00:0.00874966414843,(11:0.00235765742695,12:0.00106017509166)1.00:0.00791583846239)0.67:0.00150861076211)0.97:0.00226343329702)0.99:0.00324107715599)1.00:0.0196060561049,((8:4.88101099878E-4,9:4.39046605933E-4)1.00:0.0157088493501,(7:0.00502279541162,(5:7.98379624486E-4,6:9.95207921342E-4)1.00:0.00941868347961)1.00:0.0047613649039)0.89:0.00327293364044)1.00:0.0315667286968)1.00:0.015904906677,(3:0.0359181852572,4:0.0623744046217)1.00:0.00969961548717); 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