#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 18, 2024; 6:45 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Xu B. 2012. Lespedeza jiangxiensis, sp. nov. (Fabaceae) from China based on molecular, palynological, and morphological evidence. Systematic Botany, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S12018] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=48; TAXLABELS Campylotropis_delavayi Campylotropis_hirtella Campylotropis_macrocarpa Desmodium_heterocarpon Desmodium_microphyllum Kumerowia_stipulacea Kumerowia_striata Lespedeza_angustifolia Lespedeza_bicolor Lespedeza_buergeri Lespedeza_capitata Lespedeza_caraganae_1 Lespedeza_caraganae_2 Lespedeza_chinensis Lespedeza_cuneata Lespedeza_cyrtobotrya Lespedeza_daurica Lespedeza_davidii Lespedeza_dunnii Lespedeza_fasciculiflora Lespedeza_floribunda Lespedeza_fordii Lespedeza_formosa_1 Lespedeza_formosa_2 Lespedeza_forrestii Lespedeza_hirta Lespedeza_hispida Lespedeza_homoloba Lespedeza_inschanica_1 Lespedeza_inschanica_2 Lespedeza_intermedia Lespedeza_jiangxiensis_1 Lespedeza_jiangxiensis_2 Lespedeza_juncea Lespedeza_lichiyuniae_1 Lespedeza_lichiyuniae_2 Lespedeza_maximowiczii Lespedeza_patens Lespedeza_pilosa_1 Lespedeza_pilosa_2 Lespedeza_potaninii Lespedeza_repens Lespedeza_stuevei Lespedeza_tomentosa Lespedeza_violacea Lespedeza_virgata_1 Lespedeza_virgata_2 Lespedeza_virginica ; END; BEGIN CHARACTERS; [! 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Lespedeza_bicolor 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Lespedeza_fasciculiflora 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Lespedeza_fordii 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Lespedeza_hispida 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Lespedeza_lichiyuniae_2 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Lespedeza_maximowiczii 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Lespedeza_patens 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Lespedeza_tomentosa 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Lespedeza_violacea ATACTTTATGGAAAAAGAAAGGATATTGGACAAGATTGAAAGCTTTTTCGTTAGCACAATCTATTTTTACGGGGAATTCAAAAAGCTTTTTTTGTAACAAATACAAACGTTAGAGTAATTTCAATTAACAGGATTCAATGAATATTAA----AAAAAAA--------TAC-TAAACTAATA------TAAATTTAATATCTAA-TAT-------ATATA--GTTAT--------AG-TAT-TAATTTCAGTATA-GTATTAATTT--------ATAATATTTACATTATCTATAT-------TCTAATAAAAAA--------TCCTTTG---AATGTAGTGTTCCATTTTTG--ATTTTGAT------------ATAGAAGTGCGCTTTTTT-------------ATTTTCCACTGAATA-AAAAAAATGGAAATACATTTCTTTATATTCAGAAAATGAAATAAATAAAAAAA-----GAGTCATTTCAAATTACATAACAT------AATAATTGG--------------------------ATTATAA--------TTATGAATTTCTAATATAGA-----------------------ATATAAATTTTTTT--ACATTTA-TAAGACTTCAGAATAAAAAATGTATTTATATTT-------AGAATATAAATATAGATATAGAA-----------------------------------------------TAAAAAGA-AAAGTATTGCAATA-TATAT------------TTCGAATAGATT--CTAATAAAATTCTTTATTTAATGTTTAGTAAACAAATATTTGACTTTAATTTAATTGATTCTTTGAATCTCGACAATTGATTAAAAATGAATTATTATGATTTTGAGTAAGCCGCTAACTTACCAAGTGAGAACTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATTCACAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCCGTTTT-CCGTAAACAAAGAAAGAAACAGAAAGTTATAATCAAAAA----------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTAACAAATGGAGTTGACGACTTTTCCTTTTGCATTAGGAAAGGAATCCTTCCATCAAAA-----TTCTAGGAATGAATCAAGGATAAACCTATGGATAGATA----CTAAAATACTATTTCAATTGATTAATGAAGACGTCAAATCTCCGTTTGTGAGAAAAATATTTCAAAATGAAAGATGTAAATCAA-----TTCCAAGTTTAATAAA---------------GTTGAAGAAAAGACGAAATATTCATTGATCAAATCATTCACTCCATCCTAATCTGATAGATCCTT-TGAGGAACTGATCCATTAGACGAGAACAAAGATAGAGTCCTATTCTACATGTCAATACCGACAACAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTTAGAAATCGTGAGGGTTCAAGTCCCTCTATCCCCAAAGGACCTGTTTAA-----CTTTCTAATTTTTT--CCTATATCTTCTCTATTTTTAATTCATTATTTAT--------------GTTATGTGTTTTATTCTATTTATTCTTTCCCAAAT----------------------------------------------------------------------AAATTG-GAATTTA--TCTTTTTCTTAT-----CCTAATTACAAGTCATAAGTTTTG----ATATATATGTGAAT-----------------GTTAAACACGTATAATTTA-------ATTATAAACATACAAATGAAT----------------------ATCTTATTTTTGAGCAAGGAATCGTCCTCATATGCGTGATTAACAATACAAAATAATAATAATAAAATTAGTACTA---AAACTTACTTACAAATTTTTACTTTTTGTCTTTTT-GGACTTAGTTGACATAGATTCATTGACATATGCTCCAGTAATCTTTTAAAATAAAA-----ATGAGGCTGATGCGTCAAGAATGGTCGGGATAGCTCAGT Lespedeza_virgata_1 ATACTTTATGGAAAAAGAAAGGATATTGGACAAGATTGAAAGCTTTTTCGTTAGCACAATCTATTTTTACGGGGAATTCAAAAAGCTTTTTTTGTAACAAATACAAACGTTAGAGTAATTTCAATTAACAGGATTCAATGAATATT------AAAAAAA--------TAC------TAATA------TAAATTTAATATCTAA-TAT-----ATATATA--GTTAT--------AG-TAT-TAATTTCAGTATA-GTATTAATTT--------ATAATATTTACATTATCTATAT-------TCTAATAAAAAA--------TCCTTTG---AATGTAGTGTTCCATTTTTG--ATTTTGAT------------ATAGAAGTGCGCTTTTT--------------ATTTTCCACTGAATATAAAAAAATGGAAATACATTTCTTTATATTCAGAAAATGAAATAAATAAAAAAA-----GAGTCATTTCAAATTACATAACAT------AATAATTGG--------------------------ATTATAA--------TTATTAATTTATAATATATA-----------------------ATATAAATTTTTTT--ATATTTA-TAAGACTTCAGAATAAAAAATGTATTTATATTT-------AGAATAAGAATATAGATATAGAA-----------------------------------------------TAAAAAGA-AAAGTATTGCAATA-TATATATAT--------TTCAAATAGATT--CTAATAAAATTCTTTATTTAATGTTTAGTAAACAAATATTTGACTTTAATT-----GATTCTTTGAATCTCGACAATTGATTAAAAATGAATTATTATGATTTTGAGTAAGCCGCTAACTTACCAAGTGAGAACTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATTCACAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTGTTTT-CCGTAAACAAAGAAAGAAACAGAAAGTTATAATCAAAAA----------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTAACAAATGGAGTTGACGACTTTTCCTTTTGCATTAGGAAAGGAATCCTTCCATCAAAA-----TTCTAGGAATGAATCAAAGATAAACCTATGGGTATATA----CTGAAATACTATTTCAATTGATTAATGAAGACTTCAAATCTCCGTTTGTGAGAAAAATATTTAAAAATGAAAGATGTAAATCAA-----TTCCAAGTTTAATAAA---------------GTGGAAGAAAAGACGAAATATTCATTGATCAAATCATTCACTCCATCATAATCTGATAGATCCTT-TGAGGAACTGATCCATTAGACGAGAACAAAGATAGAGTCCTATTCTACATGTCAATACCGACAACAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTTAGAAATCGTGAGGGTTCAAGTCCCTCTATCCCCAAAGGACCTGTTTAA-----CTTTCTAATTTTTT---CTATATCTTCTCTATAAATAATTCATTATTTAT-------------------GTGTTTTATTCTATTTATTCTTTCACAAAT----------------------------------------------------------------------AAATTG-GAATTTTTCTCTTTTTCTTAT-----CCTAATTACAAGTCATAAGTTTTG----ATATATATGTGAAT-----------------GTTAAACACGTATAATTTA-------ATTATAAACATACAAATGAAT----------------------ATCTTATTTTTGAGCAAGGAATCGTCCTCATATGCGTGATTAACAATACAAAATAATAATA---TAATTACTACTA---AAACTTACTTACAAATTTTTATTTTTTGTCTTTTT-GGACTTAGTTGACATAGATTCATTGACATATACTCCAGTAATCTTTTAAAATAAAA-----ATGAGGCGGATGCGTCAAGAATGGTCGGGATAGCTCAGT Lespedeza_virgata_2 ATACTTTATGGAAAAAGAAAGGATATTGGACAAGATTGAAAGCTTTTTCGTTAGCACAATCTATTTTTACGGGGAATTCAAAAAGCTTTTTTTGTAACAAATACAAACGTTAGAGTAATTTCAATTAACAGGATTCAATGAATATT------AAAAAAA--------TAC------TAATA------TAAATTTAATATCTAA-TAT-----ATATATA--GTTAT--------AG-TAT-TAATTTCAGTATA-GTATTAATTT--------ATAATATTTACATTATCTATAT-------TCTAATAAAAAA--------TCCTTTG---AATGTAGTGTTCCATTTTTG--ATTTTGAT------------ATAGAAGTGCGCTTTTT--------------ATTTTCCACTGAATATAAAAAAATGGAAATACATTTCTTTATATTCAGAAAATGAAATAAATAAAAAAA-----GAGTCATTTCAAATTACATAACAT------AATAATTGG--------------------------ATTATAA--------TTATTAATTTATAATATATA-----------------------ATATAAATTTTTTT--ATATTTA-TAAGACTTCAGAATAAAAAATGTATTTATATTT-------AGAATAAGAATATAGATATAGAA-----------------------------------------------TAAAAAGA-AAAGTATTGCAATA-TATATATAT--------TTCAAATAGATT--CTAATAAAATTCTTTATTTAATGTTTAGTAAACAAATATTTGACTTTAATT-----GATTCTTTGAATCTCGACAATTGATTTAAAATGAATTATTATGATTTTGAGTAAGCCGCTAACTTACCAAGTGAGAACTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATTCACAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTGTTTT-CCGTAAACAAAGAAAGAAACAGAAAGTTATAATCAAAAA----------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTAACAAATGGAGTTGACGACTTTTCCTTTTGCATTAGGAAAGGAATCCTTCCATCAAAA-----TTCTAGGAATGAATCAAAGATAAACCTATGGGTATATA----CTGAAATACTATTTCAATTGATTAATGAAGACTTCAAATCTCCGTTTGTGAGAAAAATATTTAAAAATGAAAGATGTAAATCAA-----TTCCAAGTTTAATAAA---------------GTGGAAGAAAAGACGAAATATTCATTGATCAAATCATTCACTCCATCATAATCTGATAGATCCTT-TGAGGAACTGATCCATTAGACGAGAACAAAGATAGAGTCCTATTCTACATGTCAATACCGACAACAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTTAGAAATCGTGAGGGTTCAAGTCCCTCTATCCCCAAAGGACCTGTTTAA-----CTTTCTAATTTTTT---CTATATCTTCTCTATAAATAATTCATTATTTAT-------------------GTGTTTTATTCTATTTATTCTTTCACAAAT----------------------------------------------------------------------AAATTG-GAATTTTTCTCTTTTTCTTAT-----CCTAATTACAAGTCATAAGTTTTG----ATATATATGTGAAT-----------------GTTAAACACGTATAATTTA-------ATTATAAACATACAAATGAAT----------------------ATCTTATTTTTGAGCAAGGAATCGTCCTCATATGCGTGATTAACAATACAAAATAATAATA---TAATTACTACTA---AAACTTACTTACAAATTTTTATTTTTTGTCTTTTT-GGACTTAGTTGACATAGATTCATTGACATATACTCCAGTAATCTTTTAAAATAAAA-----ATGAGGCGGATGCGTCAAGAATGGTCGGGATAGCTCAGT Lespedeza_virginica ATACTTTATGGAAAAAGAAAGGATATTGGACAAGATTGAAAGCTTTTTCGTTAGCACAATCTATTTTTACGGGGAATTCAAAAAGCTTTTTTTGTAACAAATACAAACGTTAGAGTAATTTCAATTAACAGGATTCAATGAATATTAA----AAAAAAG--T-----TAC-TAAACTAATA------TAAATTTAATATCTAA-TAT-------ATATA--GTTAT--------AG-TAT-TAATTTCAGTATA-GTATTAATTT--------ATAATATTTACATTATCTATAT-------TCTAATAAAAAA--------TCCTTTG---AATGTAGTGTTCCATTTTTG--ATTTTTAT------------ATAGAAGTGCGCTTTTTT-------------ATTTTCCACTGAATA--AAAAAATGGAAATACATTTCTTTATATTCAGAAAATGAAATAAATAAAAAAA-----GAGTCATTTCAAATTACATAACAT------AATAATTGG--------------------------ATTATAA--------TTATTAATTTCTAATATATA-----------------------ATATAAATTTTTTT--ACATTTA-TAAGACTTCAGAATAAAAAATGTATTTATATTT-------AGAATAAGAATATATATATAGAAGAATAAGAATA-------------------------TAGATATAGAATAAAAAGA-AAAGTATTGCAATA-TATAT------------TTCGAATAGATT--CTAATAAAATTCTTTATTTAATGTTTAGTAAACAAATATTTGACTTTAATT-----GATTCTTTGAATCTCGACAATTGATTAAAAATGAATTATTATGATTTTGAGTAAGCCGCTAACTTACCAAGTGAGAACTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATTCACAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTGTTTT-CCGTAAACAAAGAAAGAAACAGAAAGTTAGAATCAAAAA----------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTAACAAATGGAGTTGACGACTTTTCCTTTTGCATTAGGAAAGGAATCCTTCCATCAAAA-----TTCTAGGAATGAATCAAAGATAAACCTATGGATATATA----CTAAAATACTATTTCAATTGATTAATCAAGACTTCAAATCTCCGTTTGTGAGAAAAATATTTCAAAATGAAAGATGTAAATCAA-----TTCCAAGTTTAATAAA---------------GTTGAAGAAAAGACGAAATATTCATTGATCAAATCATTCACTCCATCATAATCTGATAGATCCTT-TGAGGAACTGATCCATTAGACGAGAACAAAGATAGAGTCCTATTCTACATGTCAATACCGACAACAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTTAGAAATCGTGAGGGTTCAAGTCCCTCTATCCCCAAAGGACCTGTTTAA-----CTTTCTAATTTTTT--CCTATATCTTCTCTATTTTTAATTCATTATTTAT--------------GTTATGTGTTTTATTCTATTTATTCTTTCATAAAT----------------------------------------------------------------------AAATTG-GAATTTA--TCTTTTTCTTAT-----CCTAATTACAAGTCATAAGTTTTG----ATATATATGTGAAT-----------------GTTAAACACGTATAATTTA-------ATTATAAACATACAAATGAAT----------------------ATCTTATTTTTGAGCAAGGAATCGTCCTCATATGCGTGATTAACAATACAAAATAATAATAATATAATTAGTACTA---AACCTTACTTACAAATTTTTACTTTTTGTCTTTTT-GGACTTAGTTGACATAGATTCATTGACATATACTCCAGTAATCTTTTAAAATAAAA-----ATGAGGCTGATGCGTCAAGAATGGTCGGGATAGCTCAGT ; END; BEGIN TREES; TITLE 'One of six MPT from rpL32-trnL and trnL-F analysis'; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Lespedeza_tomentosa, 2 Lespedeza_jiangxiensis_2, 3 Lespedeza_formosa_1, 4 Lespedeza_lichiyuniae_1, 5 Lespedeza_lichiyuniae_2, 6 Lespedeza_cuneata, 7 Lespedeza_floribunda, 8 Lespedeza_virgata_1, 9 Lespedeza_inschanica_2, 10 Lespedeza_juncea, 11 Lespedeza_forrestii, 12 Lespedeza_fordii, 13 Lespedeza_jiangxiensis_1, 14 Lespedeza_pilosa_1, 15 Lespedeza_chinensis, 16 Lespedeza_patens, 17 Lespedeza_maximowiczii, 18 Lespedeza_davidii, 19 Lespedeza_bicolor, 20 Lespedeza_dunnii, 21 Lespedeza_pilosa_2, 22 Lespedeza_fasciculiflora, 23 Lespedeza_formosa_2, 24 Lespedeza_hispida, 25 Lespedeza_potaninii, 26 Lespedeza_cyrtobotrya, 27 Lespedeza_daurica, 28 Lespedeza_inschanica_1, 29 Lespedeza_homoloba, 30 Lespedeza_caraganae_1, 31 Lespedeza_caraganae_2, 32 Lespedeza_buergeri, 33 Lespedeza_virgata_2, 34 Lespedeza_capitata, 35 Lespedeza_angustifolia, 36 Lespedeza_hirta, 37 Lespedeza_intermedia, 38 Lespedeza_violacea, 39 Lespedeza_virginica, 40 Lespedeza_repens, 41 Lespedeza_stuevei, 42 Kumerowia_stipulacea, 43 Kumerowia_striata, 44 Campylotropis_macrocarpa, 45 Campylotropis_delavayi, 46 Campylotropis_hirtella, 47 Desmodium_heterocarpon, 48 Desmodium_microphyllum; TREE PAUP_2 = [&R] (((((((1:0.0,4:0.0,5:0.0,6:0.0,9:0.0,10:0.0,11:1.0,22:0.0,28:0.0):1.0,((2:0.0,13:0.0):2.0,14:0.0,21:0.0):3.0,(((3:0.0,23:0.0):1.0,(17:0.0,(18:0.0,26:0.0,32:0.0):3.0):2.0,19:3.0):2.0,(16:0.0,29:1.0):1.0):1.0,24:0.0,(25:2.0,27:0.0):6.0,(30:0.0,31:0.0):3.0):17.0,(((7:0.0,15:3.0):2.0,20:2.0):1.0,(8:0.0,12:0.0,33:1.0):0.0):15.0):10.0,((34:10.0,((35:1.0,36:1.0):1.0,39:1.0):4.0):4.0,(37:3.0,(38:1.0,40:0.0,41:0.0):1.0):12.0):17.0):23.0,(42:18.0,43:24.0):32.0):96.0,(44:10.0,(45:10.0,46:5.0):7.0):124.0):2.0,47:61.0,48:65.0); END;