#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 25, 2024; 10:34 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Feist M.E., Downie S.R., Magee A.R., & Liu M.R. 2012. Revised generic delimitations for Oxypolis and Ptilimnium (Apiaceae) based on leaf morphology, comparative fruit anatomy, and phylogenetic analysis of nuclear rDNA ITS and cpDNA trnQ and trnK intergenic spacer sequence data. Taxon, 61(2): 402-418. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S12295] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=65; TAXLABELS Atrema_americana_1160 Cynosciadium_digitatum_1571 Cynosciadium_digitatum_1986 Daucosma_laciniata_2912 Daucosma_laciniata_3411 Lilaeopsis_carolinensis_2148 Lilaeopsis_mauritiana_2150 'Lilaeopsis novae-zelandiae 2152' Lilaeopsis_occidentalis_1999 Limnosciadium_pinnatum_1511 Limnosciadium_pinnatum_2395 Limnosciadium_pumilum_3742 Neogoezia_gracilipes_2270 Neogoezia_minor_2274 Oxypolis_canbyi_2744 Oxypolis_canbyi_2747 Oxypolis_canbyi_2751 Oxypolis_canbyi_2937 Oxypolis_fendleri_2350 Oxypolis_fendleri_2368 Oxypolis_filiformis_2371 Oxypolis_filiformis_2713 Oxypolis_filiformis_×_greenmanii_2714 Oxypolis_greenmanii_2941 Oxypolis_occidentalis_1142 Oxypolis_occidentalis_1153 Oxypolis_occidentalis_2755 Oxypolis_occidentalis_2756 Oxypolis_occidentalis_2899 Oxypolis_occidentalis_2928 Oxypolis_occidentalis_3376 Oxypolis_occidentalis_3413 Oxypolis_occidentalis_3417 Oxypolis_occidentalis_3464 Oxypolis_occidentalis_3528 Oxypolis_occidentalis_3532 Oxypolis_rigidior_1927 Oxypolis_rigidior_1998 Oxypolis_rigidior_2003 Oxypolis_ternata_2735 Oxypolis_ternata_2738 Oxypolis_ternata_2940 Perideridia_americana_2033 Perideridia_kelloggii_778 Ptilimnium_ahlesii_2648 Ptilimnium_ahlesii_2969 Ptilimnium_capillaceum_2701 Ptilimnium_capillaceum_2703 Ptilimnium_costatum_1646 Ptilimnium_costatum_1970 Ptilimnium_costatum_2402 Ptilimnium_costatum_2707 Ptilimnium_nodosum_2787 Ptilimnium_nodosum_2900 Ptilimnium_nodosum_2902 Ptilimnium_nodosum_2930 Ptilimnium_nodosum_2931 Ptilimnium_nodosum_2934 Ptilimnium_nodosum_2936 Ptilimnium_nuttallii_2165 Ptilimnium_nuttallii_2617 Ptilimnium_nuttallii_2623 Ptilimnium_texense_1981 Ptilimnium_texense_2905 Trepocarpus_aethusae_1660 ; 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TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M11304] TITLE trnQ_trnK_DNA; LINK TAXA = Taxa2; DIMENSIONS NCHAR=2813; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Lilaeopsis_mauritiana_2150 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Oxypolis_occidentalis_1153 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Oxypolis_occidentalis_3413 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Oxypolis_rigidior_1998 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Trepocarpus_aethusae_1660 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'Lilaeopsis novae-zelandiae 2152' 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Oxypolis_occidentalis_2756 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Oxypolis_occidentalis_3464 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Ptilimnium_capillaceum_2703 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Oxypolis_occidentalis_2755 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Oxypolis_occidentalis_3376 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Oxypolis_rigidior_1927 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Ptilimnium_capillaceum_2703 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END; BEGIN TREES; TITLE trnQ_trnK_indels_consensus; LINK TAXA = Taxa2; TRANSLATE 1 Perideridia_americana_2033, 2 Perideridia_kelloggii_778, 3 Ptilimnium_ahlesii_2648, 4 Ptilimnium_ahlesii_2969, 5 Ptilimnium_capillaceum_2701, 6 Ptilimnium_capillaceum_2703, 7 Ptilimnium_costatum_1646, 8 Ptilimnium_costatum_1970, 9 Ptilimnium_costatum_2402, 10 Ptilimnium_costatum_2707, 11 Ptilimnium_nuttallii_2165, 12 Ptilimnium_nuttallii_2617, 13 Ptilimnium_nuttallii_2623, 14 Ptilimnium_texense_1981, 15 Ptilimnium_texense_2905, 16 Ptilimnium_nodosum_2787, 17 Ptilimnium_nodosum_2900, 18 Ptilimnium_nodosum_2902, 19 Ptilimnium_nodosum_2930, 20 Ptilimnium_nodosum_2931, 21 Ptilimnium_nodosum_2934, 22 Ptilimnium_nodosum_2936, 23 Oxypolis_canbyi_744, 24 Oxypolis_canbyi_2747, 25 Oxypolis_canbyi_2751, 26 Oxypolis_canbyi_2937, 27 Oxypolis_filiformis_2371, 28 Oxypolis_filiformis_2713, 29 Oxypolis_greenmanii_2941, 30 Oxypolis_filiformis_×_greenmanii_2714, 31 Cynosciadium_digitatum_1571, 32 Cynosciadium_digitatum_1986, 33 Limnosciadium_pinnatum_1511, 34 Limnosciadium_pinnatum_2395, 35 Limnosciadium_pumilum_3742, 36 Lilaeopsis_carolinensis_2148, 37 Lilaeopsis_mauritiana_2150, 38 'Lilaeopsis novae-zelandiae 2152', 39 Lilaeopsis_occidentalis_1999, 40 Atrema_americana_1160, 41 Daucosma_laciniata_2912, 42 Daucosma_laciniata_3411, 43 Neogoezia_gracilipes_2270, 44 Neogoezia_minor_2274, 45 Trepocarpus_aethusae_1660, 46 Oxypolis_fendleri_2350, 47 Oxypolis_fendleri_2368, 48 Oxypolis_occidentalis_1142, 49 Oxypolis_occidentalis_1153, 50 Oxypolis_occidentalis_2755, 51 Oxypolis_occidentalis_2756, 52 Oxypolis_occidentalis_2899, 53 Oxypolis_occidentalis_2928, 54 Oxypolis_occidentalis_3376, 55 Oxypolis_occidentalis_3413, 56 Oxypolis_occidentalis_3417, 57 Oxypolis_occidentalis_3464, 58 Oxypolis_occidentalis_3528, 59 Oxypolis_occidentalis_3532, 60 Oxypolis_rigidior_1927, 61 Oxypolis_rigidior_1998, 62 Oxypolis_rigidior_2003, 63 Oxypolis_ternata_2735, 64 Oxypolis_ternata_2738, 65 Oxypolis_ternata_2940; TREE Strict = [&R] ((((((((((((8,7),10,9),((5,3),6,4)),((12,11),13),(15,14)),((((25,24),26,23),28),(30,29,27))),((21,20,17,16),22,19,18)),((34,33),35)),(32,31)),(((37,36),38),39)),((42,41),(45,40)),(44,43)),(((((56,55,53,51,50),58,52),(59,57,54,49,48)),(65,64,63,62,61,60)),(47,46))),(2,1)); TREE MajRule = [&R] ((((((((((((8,7),10,9),((5,3),6,4)),((12,11),13),(15,14)),((((25,24),26,23),28),(30,29,27))),((21,20,17,16),22,19,18)),((34,33),35)),(32,31)),(((37,36),38),39)),((42,41),(45,40)),(44,43)),(((((56,55,53,51,50),58,52),((54,48),59,57,49)),((65,64,63,60),(62,61))),(47,46))),(2,1)); END;