#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on March 29, 2024; 6:08 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Cardoso D.B., Cavalcante de lima H., Schütz rodrigues R., Queiroz L.P., Pennington R., & Lavin M. 2012. The realignment of Acosmium sensu stricto with the Dalbergioid clade (Leguminosae, Papilionoideae) reveals a proneness for independent evolution of radial floral symmetry among early branching papilionoid legumes. Taxon, 61(5): 1057–1073. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S12650] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=104; TAXLABELS Acosmium_cardenasii_JX124414 Acosmium_cardenasii_JX124425 Acosmium_diffusissimum_JX124415 Acosmium_diffusissimum_JX124421 Acosmium_lentiscifolium_JX124416 Acosmium_lentiscifolium_JX124417 Acosmium_lentiscifolium_JX124422 Acosmium_lentiscifolium_JX124427 Adesmia_lanata_AF270863 Adesmia_volckmanii_AF142690 Aeschynomene_americana_AF272086 Aeschynomene_fascicularis_AF142695 Aeschynomene_indica_AF272084 Aeschynomene_pfundii_AF203587 Aeschynomene_purpusii_AF270870 Aeschynomene_rudis_AF270869 Aeschynomene_virginica_AF203586 Amicia_glandulosa_AF203583 Amorpha_fruticosa_AF270861 Andira_galeottiana_AF142681 Apoplanesia_paniculata_AF270860 Arachis_major_AF203597 Arachis_pintoi_AF203596 Arachis_triseminata_AF203599 Brya_ebenus_AF270876 Bryaspis_lupulina_AF272068 Cascaronia_astragalina_AF272072 Centrolobium_sp_AF270883 Chaetocalyx_blanchetiana_AF272070 Chaetocalyx_brasiliensis_AF270866 Chaetocalyx_nigricans_AF203585 Chaetocalyx_scandens_AF270865 Chapmannia_floridana_AF203600 Chapmannia_gracilis_AF203592 Chapmannia_gracilis_AF203593 Chapmannia_prismatica_AF203598 Chapmannia_sericea_AF203591 Cranocarpus_martii_AF270875 Cyclocarpa_stellaris_AF272067 Dalbergia_congestiflora_AF142696 Dalbergia_foliolosa_AF203581 Dalbergia_sissoo_AF203582 Dalbergia_sp_AF203580 Diphysa_americana_AF203574 Diphysa_floribunda_AF203575 Diphysa_ormocarpoides_AF203601 Diphysa_thurberii_AF203576 Dipteryx_alata_AY553717 Discolobium_psoraleifolium_AF270874 Discolobium_pulchellum_AF270873 Etaballia_guianensis_AF272074 Fiebrigiella_gracilis_AF203589 Fiebrigiella_gracilis_AF203590 Fissicalyx_fendleri_AF272063 Geissaspis_descampsii_AF272064 Geoffroea_decorticans_AF270880 Geoffroea_spinosa_AF270879 Grazielodendron_riodocensis_AF270862 Humularia_corbisieri_AF272069 Hymenolobium_mesoamericanum_AY386934 Inocarpus_fagifer_AF270878 Kotschya_ochreata_AF272065 Leptolobium_panamense_AF142684 Machaerium_sp_AF142692 Maraniona_lavinii_AY247263 Myrospermum_frutescens_AF142679 Nissolia_hirsuta_AF270868 Nissolia_schottii_AF270867 Ormocarpopsis_calcicola_AF203568 Ormocarpopsis_itremoensis_AF203567 Ormocarpum_bernierianum_AF203570 Ormocarpum_coeruleum_AF203572 Ormocarpum_keniense_AF203602 Ormocarpum_kirkii_AF203571 Ormocarpum_klainei_AF203603 Ormocarpum_muricatum_AF203569 Ormocarpum_yemenense_AF203573 Paramachaerium_schomburgkii_AF272062 Peltiera_nitida_GU951672 Pictetia_aculeata_AF203577 Pictetia_aculeata_AF203604 Pictetia_angustifolia_AF203579 Pictetia_marginata_AF203578 Platymiscium_sp_AF270871 Platymiscium_stipulare_AF270872 Platypodium_elegans_AF270877 Poecilanthe_parviflora_AF142687 Poiretia_angustifolia_AF270864 Poiretia_punctata_AF272081 Pterocarpus_indicus_AF142691 Pterocarpus_macrocarpus_AF203588 Pterodon_pubescens_AF272095 Ramorinoa_girolae_AF270881 Riedeliella_graciliflora_AF272090 Smithia_ciliata_AF272066 Soemmeringia_semperflorens_AF272088 Stylosanthes_capitata_AF203595 Stylosanthes_hamata_AF203594 Tipuana_tipu_AF270882 Vatairea_sp_nov_AF270859 Weberbauerella_brongniartioides_AF272071 Weberbauerella_brongniartioides_AF272075 Weberbauerella_brongniartioides_AF272077 Zornia_sp_AF203584 ; 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Amicia_glandulosa_AF208902 AATTGGATTGAGCCTTGGTATGGAAACTTACCAAGTGATAA-CTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATAAACAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCCATTTT-------CCGAAAGCAAA---------GAAAG-----GTAAAGAAACTGAGAATAAAAAA----------------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAG--CTGTTCTAACAAA-----TGGAGTT--AACG------ACATTTCCTTT-CTCGTT----------ACGAAAGG----AATCCTT------TCATCGAAATTTCAG-------------------------------------AAAGGATATA---------------------------TG--TATA---------------CAT-CTA------TTTATTTGTACTAAAATAGTATA-TTCAA------------TTGATTAA---TGAA------GA-----CTGCAAA-------TCTCTATTT-----GTGAATC-----CTTAT------------------------ACCACAAACGAAA-------GA--------AAAA------TTCCAAGTTGAA--------GAAAGAATTGAACA---------TTCACTAATCAAATCATTCACTCC--ATCAAA----ATCTGAGAGG---------TCTTTTGAATAA--CTGATTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACCGACAACAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTTAGAAATCGTGA??? 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Anarthrophyllum_cumingii_AY618488 AATTGGATTGAGCCTTGGTATGGAAACTTACCAAGTGATAC-CTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATTGACAATGGGTAATCCTGAGCCAAATCCCGTTTTT-----CGCAAAAACAAA---------GAAAA-----GTTCAGAAAGCGAGAATAAAAA-----------------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAG--CTGTTCTAACAAA-----TGGAGTT--GACG------ACATTTCCTTT-CGCGTTGGGTT-----AGTAAAGG----AATCCTT------TCGTCGAAATTGCGG-------------------------------------AAAGGATCAAGA--------ATAAACG--------------TATATA----------------CA--TATATACCTATATGGAGTGAAATATTAT--TTCAA------------TTGATTAA---TAAA------GA-----CTTAAAA-------TCTCTATTT--------------------------------------------------------------------------------------------GTTGAA--------GCAGGAATTGAATA---------TTCATTGATCAAATCATTCATTCC--ATGATA----ATCTGATAGA---------TCTTTTTAAGAG--CTGATTAATCAGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACCGACAACAATGAAATTTATAGTAAGAGG?????????????????????????????? Andira_galeottiana_AF208893 AATTGGATTGAGCCTTGGTATGGAAACCTACCAAGTGAGAA-CTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATTAACAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTGTTTT-------CCGAAAACAAA---------GAAAA-----GTTCAGAAAGCGAGAATAAAAAAA---------------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAG--CTGTTCTAACAAA-----TGGAGTT--GACG------ACATTTCCTTT-CGCGTT----------AGGAAAGG----AACCCTT------CCATCGAAATTCCAG--------------------------------AAAGGAAAGGATCAAGG--------ATAAACA--------------TATATA------------------------TACGTATATGTACTGAAATACTAT--TTCAA-TTGATTAACAATTGATTAA---TGAA------GA-----CTCCAAA-------TATCTATTT-----GTGAATA-----TTTAT------------------------ATCACAAATGAAA-------GATGTGAATCAAATCAA---TTCCAAGTTGAA--------GAAAGAATCGAATA---------TTCATTGATCAAATCATTCACTCC--ATCATA----GTCTGATAGA---------TCTTTTGAAGAA--CTGATTAATCAGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCCACATGTCAATACCGACAACAATGAAATTTATAGTCAGAGGAAAATCCGTCGACTTTAGAAATCGTGAGG? 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Ateleia_herbertsmithii_AF309840 AATTGGATTGAAACTTGGTATGGAAACCTACCAAGTGAGAA-CTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATTAACAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTGTTTT-------TCGAAAACAAA---------GAAGA-----GTTCAGAAAGCGAGAATAAAAAAA----GGC-TA-----GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAG--CTATTCTAACAAA-----TGGAGTT--GACG------ACATTTTCTTT-CGCGTTAGGAGTT---AGGAAAGA----AATCCTT------CCATCGAAATTCGAG--------------------------------AAAGGAAAGGATCAAGG--------ATAAACA--------------TATATA------------------------TGCGTATATGTACTGAAATACTAT--TTCAG------------TTGATTAA---TGAA------CA-----CTCCAAA-------TCGCTATTT-----TTTAATA-----TTTAT----------------------------------------------------------------TT-CAAGTTGAA--------GAAAGAATCGAATA---------TTCATTGATCAAATCATTCACGCC--ATCATA----GTCTGATAGA---------TCTTTTGAAGAA--CTGATTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTTAATACCGACAACAATGAAATTTATCGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTTAGAAATCGTGAGGG Austrosteenisia_blackii_AF311381 AATTGAATTGAGTCTTGGTATGGAAACTTACCAAGTGAGAA-CTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATTCACAAAGGGCAATCCTGAGCCAAATCCGGTTTT-------CCGAAAACAAA---------GAAAA-----GTTCAGAAAGTGAGAATAAAAAAA---------------GGATAGGTGCAGAGACTCAACGGAAG--CTGTTCTAACAAA-----TGGAGTT--GACG------ACTTTTCCTT--------------------GAAATA----AATCCTT------TCATCAAAATTCTAG------------------------------------GAATGGAGCAAGT--------ATAAACA--------------TATATA--------------TACA------CACATATATGTATTGAAATACTAT--TTCAA------------TTGATTAA---TGAA------GA-----CTCTAAATC-----TCC--A-TTT----GTGAATA-T---TTCTA-------------------------TCACAAATGAAA-------GATGTAAATCAAATCCAA--GTTGAA--------------GAAAAAATGAAATA---------TTCATTGATCAAATCATTCATTTC--ATCATA-GTAGTTCCTTTGA-----------------AGAA--CTGATTAATCAGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACCGACAACAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTTAGAAATCGTGA??? 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Calpurnia_aurea_AF310993 AATTGGATTGAGCCTTGGTATGGAAACTTACCAAGTGATAA-CTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATTAACAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCCGTTTTT-----CGCGAAAACAAA---------GAAAA-----GTTCATAAAGCGAGAATAAAAA-----------------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAG--CTGTTCTAACAAA-----TGGAGTT--TACG------ACATTTCCTTT-CGCATTAGGAAT----AGGAAAGG----AATCCTT------TTATCAAAATTGCGG-------------------------------------AAAGGATCAAGG--------ATAAACG--------------TATATA--TATATACGTATA------------TGTATATGTACTGAAATAGTAT--TTCAA------------TTGATTAA---TGAA------GA-----CTCAAAA-------TCTCTATTT-----TTTTATA-----TTTAT------------------------ATCACAAATGAAA-------GATGTGAATCAAATCATTTTTTCCAAATTGAA--------GAAAGAATGGAATA---------TTCATTGAGCAAATCATTCATTCC--ATCATA----GTCTGATAGA---------TCTTTTGAAGAA--CTGATTAATCAGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTCAATAGCGACAACAATGAAATTTATAGTAAGAGG?????????????????????????????? Carmichaelia_williamsii_AF127000 ????????????CCTTGGTATGGAAACTTACCAAGTGAAAA-CTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATTCACAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTGCTTT-------CCGAAAACAAAAAAA-----TAAAA-----GTTCAGAAAGTGAAAATTAAACAAAAGA-----------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAA---CTGTTCTAACAAA-----TGGAGTT--GACA------ACATTTCCTTT-CTCAGTT-----------G--ATT----AAT------------------------G-------------------------------------AAA--ATTA--C----------AAACT----------------------------------------------TATATTTGTA----AATA---T--TTCGA------------TTC-------------------------------------------------------------------GAT--------------------TTCGATCACAAA--A---------GATGTGAATCAAATAAA---TGCCAACTTGAAGA--------AAAAATGGAATA---------TTCATT-----AATCAGTCACTCC--ACCATA----GTCTGATGTA---------TCTTTTGAAGAA--ATGATTAATCAGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACCGACACCAATGAAATTTTTAGTAAGAGG?????????????????????????????? Cascaronia_astragalina_AF208958 AATTGGATTGAGCCTTGGTATGGAAACTTACCAAGTGAGAA-CTTTCAAATTCAGAGAAACCCCGGAATTAACAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCCGTTTT-------CCGAAAGCAAA-------------------GTTAAGAAAGCGAGAATAAAAAAA---------------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAG--CTGTTCTAACAAA-----TGGAGTT--GACG------ACATTTCCTTT-CGCGTT----------AGGAAGGG----AATCCTT------CCATCGAAATTCTAG--------------------------------AAAGGAAAGGATATA----------------A--AA-AAATATGTATATGTA------TA-----CATACGTATTTA-CGTATTTGTACTGAAATACTAT--TTCAA------------TTGATTAA---TGAA------GA-----CTCCAAA-------TCTCTATTT-----TTGAATC-----TTTAT------------------------ATCACAAATGAAA-------GATGGGAATCAAATCAA---TTCCAAGTTGAA--------GAAAGAATTTAATA---------TTCACTGATCAAATCATTCACTCC--ATCAAA----GTCTGATAGA---------TCTTTTGAAGAA--CTAATTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACCGACAACAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTAAGAAATCGTGAGGG Centrolobium_sclerophyllum_EU401426 AATTGGATTGAGCCTTGGTATGGAAACTTACCAAGTGAGAA-CTTTCAAATTCAGAGAAACCCCGGAATTAACAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCCGTTTT-------CCGAAAGCAAA---------GAAAA-----GTTAAGAAAGCGAGAATAAAAAAA---------------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAG--CTGTTCTAACAAA-----TGGAGTT--GACG------ACATTTCCTTT-CGCGTT----------AGGAAAGG----AATCCTT------CCATCGAAATTCTAG--------------------------------AAAGGAAAGGATATA---------------CA--TATATATATGTATATATA--------------------------CGTATTTGTATTGAAATACTAT--TTCAA------------TTGAGTAA---TGAA------GA-----CTCCA------------CTATTT-----GTTACTC-----TTTAT---ATCACA----------TTTATATCACAAATGACAAATGAAAAATGTGAATCAAATCAA---ATCCAAGTTGAA--------GAAAGAATTGAATA---------TTCACTGATCAAATCATTCACTCC--ATCATA----GTCTGATAGA---------TCTTTTGAAGAA--CTGATTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACCGACAACAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTAATAAATCGTGAGG? Ceratonia_siliqua_AF365075 AATTGGATTGAGCCTTGGTATGGAAACCTACCAAGTGAGAA-CTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATTAACAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTGTTTT-------CCGAAAACCAA---------GAAGA-----GTTCAGAAAGCGCGAATAAAAAAA---------------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAG--CTGTTCTAACAAA-----TGGA-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TACGTACTGAAATACTAT--TTCAA------------TTGATT--------A------GA-----CCCCAAA-------TCTCTATTT-----TTTAATA-----TTTAT------------------------ATGACAAATGAAA-------GATGTGAATCGA--------TTCCAAGTTGAA--------GAAAGAATCGAATA---------TTCATTGATCAAATCATTCACTCC--ATCATA----GTCTGATAGA---------TCTTTTGAAAAA--CTGATTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACCGACAACAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTTAGAAATCGTGAG?? 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Genista_monspessulana_JF338274 AATTGGATTGAGCCTTGGTATGGAAACTTACCAAGCGATAA-TTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATTGACAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCCGTTTTT-----CCCAAAAACAAA---------GAAAA-----GTTCAGAAATCGAAAATAAAAA-----------------GGATAGGTGCAGAGACTCGATGGAAG--CTGTTCTAACAAA-----TGGAATT--GACG------ACATTTCCTTT-CGCGTTGGGTT-----AGGAAAGT----AATCCTT------TCGTCGAAATTGCGG-------------------------------------AAAGGATCAAGA--------ATAAACG--------------TATATA----------------CATATATATACGTATATGTACTGAAATACTAT--TTCAA------------TTGATTAA---TAAAAATAAAGA-----CTGAAAA-------TCTCTATTT--------------------------------------------------------------------------------------------GTTGAA--------GGAGGAATTGAATA---------TTCATTGATCAAATCATTCATTCC--ATGAAA----ATCTGATAGA---------TCTTTTTAAGAG--CTGACTAATCAGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACCGATAACAATGAAATTTATAGTAAGAGGA????????????????????????????? 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Gleditsia_sinensis_AY899686 ???????????????????????????CTACCAAGTGCGAA-CTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATTAACAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTGTTTT-------CCGAAAACCAA---------GAAGA-----GTTCAGAAAGCGAGAATAAAACAA---------------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAG--CTGTTCTAACAAA-----TGGAGTT--GACG------ACATTTCGTTT-CGTT------------AGTAAAGG----AATCCTT------CCATCTAAATTCCAG--------------------------------AAAAGAAAGGATCAAGG--------ATGAACA--------------TATATA------------------------TACGTATACGTACTGAAATACTAT--TTCAA------------TTGATT--------A------GA-----CCCCAAA-------TCTCTATTT-----TTTCATA-----TTTAT------------------------ATGACAAATGAAA-------GATGTGAATCGA--------TTCCAAGTTGAA--------GAAAGAATCGAATA---------TTCATTGATCAAATCATTCACTCC--ATCATA----GTCTGATAGA---------TCTTTTGAAGAA--CTGATTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACCGACAACAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTTAGAAATCGTGAGGG Gliricidia_brenningii_AF529412 AAGTGGATTGAGCCTTGGTATGAAAACTTACCAAGTGAAAA-CTTTCAAACTCAGAGAAACCCTGGAATTCACAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTGCTTT-------CCGAAAATAAA---------CAAAA-----GTTACGGAAGCGAGAATAAAAAAAA--------------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAA---CTGTTCTAACAAA-----TGGAGTT--GACG------ACATTTCTTTT-CGTGATA----------GGAAAGG----AATCCTT------CTATAAAAATTCCCG-------------------------------------AAAGGATCAAGGATAAACATATAAACA----------------TATA-------------TGTTTCTA---TACGTATATGTACTGAAATACTAT--TTCAA------------TTGATTAA---TGAA------GA-----CTTAAATAT-----TCT--AGTTT----GGAAATA-T---TTCTT-------------------------TCCCAAATGAAA-------GATGTGAATCAA--------TTACAAGTTGAAG-------AAAAAAATAGAATA---------TTCATTGATCGAATCATTCACTCC--ATCATA----GTCTGATATA---------TCTTTTGAAGAA--CTAATTAATCAGACGAGAATAAAGATAGAGTCCTATTCTACATGTCAATACCGACACCAATGAAATTTTGAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTTAGAAATCGTGAGGG Glycine_microphylla_EF543429 ?????????????????????GG-AACTTACCAAGTGAGAA-CTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATTCACAAAGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTGTTTT-------CCGAAAACAAA---------GAAAA-----GTTCAGAAAGTGATAATAAAAAAG---------------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAG--CTGTTCTAACAAA-----AGGAGTT--GACG------ATTTTTCCTTTTTGCATTA----------GGAAAAG----AATCCTT------CCGTCAAAATTCCAG------------------------------------GAATGGATCAAAG--------ATAAACA------------------------------------------------TATATATACTGAAATAGTAT--TTCAA------------TTGATTAA---TGAA------GA-------------------TCC--ATTT-----GTGATAA-A---AATAT-------------------------TCACAAATGAAA-------GATGTGAATCAAATCAA---TTCCAAGTTGAA--------GAAAAGATGGAATA---------TTCATTGATCAAATTATTCACTCC--ATCATA----ATCTGAAAAA---------TCCCTTGAAGAA--CTGATCAATCAGACGAGAATAAAGATAGAGTCCTATTCTACATGTCAATCCCGACAACAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGATTTAAGAAATCGTGAGGG Glycyrrhiza_lepidota_AF124238 ???????????GCCTTGGTATGGAAACTTACCAAGTGAAAA-CTTTCAAATTCAGAGAAACCCAGGAATTCATAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTGCTTT-------CCGAAAACAAA---------GAAAA-----GTTCAGAAAGCGAGAATAAAAAAA---------------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAA---ATGTTCTAACAAA-----TGGAGTT--GACG------ACATTTCCTTT-CACAGTA----------AGAAAGG----AATCCGT------CTATCAAAATTCCGG-------------------------------------AAAGGATCAAGG--------AATTTCA--------------------------------------------------------CTGGA--------------------------TTGATTAA---TGAA------GA-----CTCCAAACT-----TCT--ATTT-----GTAAAT--T---TTCTA----TCATAA--------------ATCAGAAATGAAA-------GATGTGAATAAAATCAA---TTACAAGTTGAAGA--------AAAAATGGAATA---------TTCATTGATCAAATCATTCACTCC--ATCATA----GTCTGATGGA---------TCTTTTGAAGAA--CTGATTAATCAGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACCGATACCAATGAAATTTTTAGTAAGAGG?????????????????????????????? Grazielodendron_riodocense_AF208952 ??????????????TTGGTATGGAAACTTACCAAGTGATAA-CTTTCAAATTCAGAGAAACCCCGGAATTAACAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCCGTTTT-------ACGAAAGCAAA---------GAAAA-----GTTAAGAAAGCGAGAATAAAAAAA---------------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAG--CTGTTCTAACAAA-----TGGAGTT--GACG------ACATTTCCTTT-CGCGTT----------AGGAAAGG----AATCCTT------CCATAGAAATTCTAG-------------------------------------AAAGGATATA---------------CG----TATATATGTATATATA--------------------------CGTATTTGTACTGAAATACTAT--TTCAA------------TTGATTAA---TGAA------GA-----CTCCAAA-------TCTCTATTT-----GTGAATC-----TTTAT------------------------ATCACAAATGAAA-------GATGTGAATCAA--------TTCCAAGTTGAA--------GAAAGAATTGAATA---------TTCACTGATCAAATCATTCACTCC--ATCAAA----GTCTGATAGA---------TCTTTTGAAGAA--CTGATTAATCGAACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACCGACAACAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAA-TCCGTC-AC????????????????? 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Guianodendron_praeclarum_JX124443 AATTGGATTGAGCCTTGGTATGGAAACTTACCAAGTGATAA-CTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATTAACAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTGTTTT-------CCGAAAACAAA---------GAAAA--------------GCGAGAATAAAAAAAA--------------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAG--CTGTTCTAACAAA-----TGGAGTT--GACG------ACATTTCCTTT-CGCATT----------AGGAAAGG----AATCCTT------CCATCGAAATTCCGG--------------------------------AAAAGAAAGGATCAAGG--------ATAAACA--------------TATATA------------------------TACGTATATGTACTGAAATATTAT--TTCAA------------TTGATTAA---TGAA------GA-----CTGAAAA-------TCTCTATTT-----GTGAATA-----TTTAT------------------------ATCACAAATAAAA-------GATGTGAATCAAATCAT---TTCCAAGTTGAA--------GAAAGAATTGAATA---------TTCATTGATCAAATCATTCATTCC--ATCAGA----GTCTGATAGA---------TCTTTTGAAGAG--CTGATTAATCAGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTAAATGTCAATACCGACAACAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTTAGAAATCGTGAGGG Gymnocladus_chinensis_EU361814 AATTGGATTGAGCCTTGGTATGGAAACCTACCAAGTGAGAA-CTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATTAACAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTGTTTT-------CCGAAAACCAA---------GAAGA-----GTTCAGAAAGCGAGAATAAAACAA---------------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAG--CTGTTCTAACAAA-----TGGAGTT--GACG------ACATTTCGTTT-CGTT------------AGTAAAGG----AATCCTT------CCATCGAAACTCCAG--------------------------------AAAAGAAAGGATCAAGG--------ATGAACA--------------TATATA----------------------TATACGTATACGTACTGAAATACTAT--TTCAA------------TTGATT--------A------GA-----CCCCAAA---TATATATATATA------TTTCATA-----TTTAT------------------------ATGACAAATGAAA-------GATGTGAATCGA--------TTCCAAGTTGAA--------GAAAGAATCGAATA---------TTCATTGATCAAATCATTGACTCC--ATCATA----GTCTGATAGA---------TCTTTTGAAGAA--CTGATTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACCGACAACAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGA?????????????????? 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Lupinus_argenteus_DQ417088 AATTGGATTGAGCCTTGGTATGGAAACTTACCAAGTGAGAA-CTTTCAAATTCAGAGAAACCTTGGAATTGACAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCCGTTTTTT----CGCAAAAACAAA---------GAAAA-----GTTCAGAAAGCGAAAATAAAAA-----------------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAG--CTGTTCTAACAAA-----CGGAGTT--GACA------ACATTTACTTT-CGCGTTGAGTT-----AGGAAAGG----AATCCTT------TCATCGAAATTTTGT-------------------------------------AAAGGATAAAGA--------ATAAACG--------------TATATA----------------CA--TATATACGTATATTTACTTAAATATTAT--TTCAA------------TTGATTAA---TAAA------GA-----CTGAAAA-------TCTCTATTT--------------------------------------------------------------------------------------------ATTGAA--------GAAGTAGTTGAATA---------TTGATTGATCAAATCATTCATTCC--ATGATA----ATCTGATAGA---------TCTTTTTAAGAG--ATGATTAATCAGACCAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACCGACAACAATGAAATTTAGAGTAAGAGGAAAATCC??????????????????????? 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Paramachaerium_schomburgkii_AF208959 ??????????????TTGGTATGGAAACTTACCAAGTGAGAA-CTTTCAAATTCAGAGAAACCCCGGAATTAACAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCCGTTTT-------CCGAAAGCAAA---------GAAAA-----GTTAAGAAAGCGAGAATAAAAAAA---------------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAG--CTGTTCTAACAAA-----TGGAGTT--GACG------ACATTTCCTTT-CGCGTT----------AGGAAAGG----AATCCTT------CCATCGAAATTCTAG--------------------------------AAAGGAAAGGATATA---------------CA--TATATATATGTATATATA--------------------------CGTATTTGTACTGAAATACTAT--TTCAA------------TTGAGTAA---TGAA------GA-----CTCCAAA-------TCTCTATTT-----GTGACTC-----TTTAT------------------------ATCACAAATGACAAATGAAAAATGTGAATCAAATCAA---TTCCAAGTTGAA--------GAAAGAATTGAATA---------TTCACTGATCAAATCATTCACTCC--ATCATA----GTCTGATAGA---------TCTTTTGAAGAA--CTGATTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACCGACAACAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTAAGAAATCGTGAGGG Peteria_thompsoniae_AF529395 AATTGGATTGAGCCTTGGTATGAAAACTTACCAAGTGAAAA-CTTTCAAACTCAGAGAAACCCTGGAATTCACAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCCGCTTT-------CCGAAAATAAA---------GAAAA-----GTTCCGGAAGCGAGAAAAA--------------------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAA---CTGTTCTAACAAA-----TGGAGTT--GACG------ACATTTCTTTT-CGTGATA----------GGAAAGG----AATCCTT------CTATAAAAATTCCGG-------------------------------------AAAGGATCAAGG--------ATAAACA--------------TATATA-------------TGTTTATA---TACGTATATGTACTGAAATACTAT--TTCAA------------TAGATTAA---TGAA------GA-----CTTAAATATTATATTCT--AGTTT----GTAAATA-T---TTCTT-------------------------TCACAAATGAAA-------GATGGGAATCAAATCAA---TTACAAGTTGAGG-------AAAAAAATCGAATA---------TTCATTGATCAAATCATTCACTCTCCATCATA----GTCTAATAGA---------TCTTTGGAAGAA--CTAATTAATCAGACGAGAATAAAGATAGAGTCCTATTCTACATGTCAATAACGACACTAATGAAATTTTGAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTTAGAAATCGTGAGGG Phylloxylon_spinosa_AF274358 ?????????GAGTCTTGGTATGGAACCTTACCAAGTGAGAA-CTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATTCACAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTATTTT-------CCGAAAACAAA---------GAAAA-----GTTCAGAAAGCGAGAATAAAAAAA---------------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAA--CTGTTCTAACAAATCAAATGGAGTT--GACG------ACATTTCCTTT-CGCGTTA----------GTAAAGGA---AATCCTT-CCATCACATCAAAAATCCAG--------------------------AAAGAAAAAGGAAAGGATCAAGG--------ATAAGCA--------TGTATATATATA--------------------------CGTATATGTACTGAAACATTAT--TTCAA------------TTGATTAA---TGAA------GA-----CTCCCAA-------TCTCTATTT-----GTGAATA-----TTTCT------------------------ATCACAAATGAAA-------GATGTGAATCAAATCAA---TTCCAAGTTGAA--------GAAAAA-TGGAATA---------TTCATTGATCAAATCATTCACTCC--ATCATA----GTCTGATAGA---------TCTTTTGAAGAG--CTGATTAATCAGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCTTTCTACATGTCAAT???????????????????????????????????????????????????????????? Pictetia_aculeata_AF260906 AATTGGATTGAGCCTTGATATGGAAACGTACCAAGTGAGAC-CTTTCAAATTCAGAGAAACCCCGGAATTAACAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCCGTTTT-------CCGA-----AA---------GAAAA-----GTTAAGAAAGCGAGAATAAAAAA----------------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAG--CTGTTCTAACAAA-----TGGAGTT--GACA------ACATTTCCTTT-CGGGTT----------AGGAAAGG----AATCCTT------CCATCGAAATTCTAG--------------------------------AAAGGAAAGGATATA---------------CA------------TATATATA--------------------------CGTATTAGTACTGAAATACTAT--TTCAA------------TCGATTAA---TGAA------GA-----CTCCAAA--------CTCTATTT-----GTGAATT-----TTTAT------------------------ATCACAAATGAAA-------GATGTGAATCAAAACAA---TTCCAAGTTGAA--------GAAAGAATTGAATA---------TTCACTGATCAAATCATTCACTCC--ATCATA----GTCTGATAGA---------TCTTTTGAAAAA--CTGATTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACCGACAACAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTAAGAAATCGTGAGGG Platymiscium_stipulare_EU736036 ????????????????????TGGAAACTTACCAAGTGAGAA-CTTTCAAATTCAGAGAAACCCCGGAATTAACAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTGTTTT-------CCGAAAGCAAA---------GAAAC-----GTTAAGAAAGTGAGAATAAAAAAA---------------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAG--CTGTTCTAACAAC-----TGGAGTT--GACG------ATATTTCCTTTTCGGGTT----------AGGGAAGG----AATCCTT------CCATAGAAATTCTAG--------------------------------AAAGGAAAGGATATA---------------CG----TATATATGGATATATA--------------------------CGTATTTATACTGAA-TACTAT--TTCAA------------TTGATTAA---TGAA------GA-----CTCCTAA-------TCTCTATTT-----GTGAATC-----TTTAT------------------------ATCACAAATAAAA-------GATTTG--------------------------------------------AATA---------TTCACTGATCAAATCATTCACTCC--ATCATA----GTCTGATAGA---------TCTTTTGAAGAA--CTGATTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACCGACAACAATGAAATTTATTG????????????????????????????????????? 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Poiretia_angustifolia_AF208904 AATTGGATTGAGCCTTGGTATGGAAACTTACCAAGTGATAA-CTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATAAACAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCCGTTTT-------CCGAAAGCAAA---------GAAAG-----GTAAAGAAACTGAGAATAAAAAA----------------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAG--CTGTTCTAACAAA-----TGGAGTT--AACG------ACATTTCCTTT-CTCGTT----------ATGAAAGG----AATCCTT------TCATCGAAATTTCAG-------------------------------------AAAGGATA-----------------------------TG--TATATA-------------CATATATA-----CATATTTGTACTAAAATACTATA-TTGAA------------TTGATTAA---TGAA------GA-----CTGCAAA-------TCTCTATTT-----GTGAATG-----CTTAT------------------------ACCACAAATGAAA-------GATGTGAAAAAAAA------TTCCAAGTTGAA--------GAAAGAATTGAATA---------TTCACTGATCAAATCATTGACTCC--ATCAAA----ATCTGAGAGG---------TCTTTTGAATAA--CTGATTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACCGACAACAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTAAGAAATCGTGAGGG Pterocarpus_indicus_AF208953 ?????????????????????GGAAACTTACCAAGTGAGAA--TTTCAAATTCAGAGAAACCCAGGAATTAACAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCCGTTTT-------CCGAAAGCAAA---------GAAAA-----GTTAAGAAAGCGAGAATAAAAAAA---------------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAG--CTGTTCTAACAAA-----TGGAGTT--GACG------ACATTTCCTTT-CGCGTT----------AGGAAAGG----AATCCTT------CCATCGAAATTCTGA--------------------------------AAGGAAAAGGCTATA---------------CATATATATATATGTATATATA--------------------------CGTATTTGTACTGAAATACTAT--TTCAA------------TTGAGTAA---TGAA------GA-----CTCCAAA-------TCTCTATTT-----GTGACTC-----TTTAT------------------------ATCACAAATGACAAATGAAAAATGTGAATCAAATCAA---T-CCAAGTTGAA--------GAAAGAATTGAATA---------TTCACTGATCAAATCATTCACTCC--ATCATA----GTCTGATAGA---------TCTTTTAAAGAA--CTGATTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACCGACCACAATGACATTTA???????????????????????????????????????? Pterodon_pubescens_AF208895 AATTAGATTGAGCCTTGGTATGG-AACCTACCAAGTGAGAA-CTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATTAACAATGGGAAATCCTGAGCCAAATCCTGTTTT-------CCGAAAACAAA---------GAAGA-----GTTCATAAAGCGAGAGTAAAGTAAAAAAGG-ATA-----GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAG--CTGTTCGAACAAA-----CGGAGTT--GACA------ACATTTCTTTT-CGCGTT----------AGGAAAGG----AATCCTT------CCATCGAAATTCCAG--------------------------------AAAGGAAAGGATCAATG--------ATAAATA--------------TATATA----------------------TATACGTATATGTACTGAAATACTAT--TTCAA------------CTGATTAA---TGAA------GA-----CTCCAAAAA-----TCTATATTTTTGAATTGAATA-----TTTAT------------------------ATCACAAATGAAA-------GATGTGAATCAA--------TTCCAAGTTGAA--------GAAAGAATCGAATA---------TTCATTGATCAAATCATTCACTCC--ATCATA----GTCTGATAGA---------TCTTTTGAAGAA--CTGATTAATCAGATGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTTAATACCGACAACAATGAAATTTATAGTAAAAGGCAAATCCGTCGACTTTAGAAATCGTGAGGG Ramorinoa_girolae_AF208957 AATTGGATTGAGCCTTGGTATGGAACCTTACCAAGTGAGAA-CTTTCAAATTCAGAGAAACCCCGGAATTAACAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCCGTTTT-------CCGAAAGCAAG---------GAAAA-----GTTAAGAAAGCGAGAATAAAAAAA---------------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAG--CTGTTCTAACAAA-----TGGAGTT--GACG------ACATTTCCTTT-CGCGTT----------AGGAAAGG----AATCCTT------CCATCGAAATTCTAG--------------------------------AAAGGAAAGGATATA---------------CA--TATATA--TGTATATATA-----------------AGTATT---TGTATTTGTACTGAAATACTAT--TTCAA------------TTGAGTAA---TGAG------GA-----CTCCAAA-------TCTCTATTT-----GTGACTC-----TTTAT------------------------ATCACAAATGACAAATGAAAAATGTGAATCAAATCAA---TTCCAAGTTGAA--------GAAAGAATTGAATA---------TTCACTGATCAAATCATTCACTCC--ATCATA----GTCTGATAGA---------TCTTTTGAAGAA--CTGATTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACCGACAACAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTAAGAAATCGTGAGGG Riedeliella_graciliflora_AF208949 AATTGGATTGAGCCTTGGTATGGAAACTTACCAAGTGAGAA-CTTTCAAATTCAGAGAAACCCCGGAATTAACAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCCGTTTT-------CCGAAAGCAAA---------GAAAA-----GTTAAGAAAGCGAGAATAAAAAAA---------------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAG--CTGTTCTAACAAA-----TGGAGTT--GACG------ACATTTCCTTT-CGCGTT----------AGGAAAGG----AATCCTT------CCATCGAAATTCTAG--------------------------------AAAGGGAA---TA-----------------CA--TA-ATATATGTATA-----------------CATA---------CGTATTTGTACTGAAATACTAT--TTCAA------------TTGATTAA---TGAA------GA-----CTCCAAA-------------TTT-----GTGAATC-----TTTAT------------------------ATCACAAATGAAA-------GATGTGAATCAAATCAA---TTCCAAGTTGAA--------GAAAGAATCGAATA---------TTCAC-----AAATCATTCACTCC--ATCATA----GTCTGATAGA---------TCTTTTGAAGAA--CTGATTAATCAGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACCGACAACAATGAAATTTATAGTAAGAGG?????????????????????????????? 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Stylosanthes_fruticosa_AJ320356 ??????TCGATGCC---------CCACGAACGACCGGCGAACGCGTCCTCAGACAAACCCTGTGCCGGGAACGGCCGGCCGCGCGGCCGGCCGGCCCCCGGCCC------------------------------------------------------AAA-GAACAAAA-CCACGGCGCGGAACGCGC--CAAGGAA-TCCAAAC----GTTATTGTTCTCCCCCGCC-GTCTCCGGAGACGGAGTCCGGT--CGGGG---CGAC-GAGCGAC----CACAAGAG-TACAGAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTTGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCCTTAGGCTGAGGGCACGCCTGCCTGGGTGTCACCAAAAGCCGCCCCC--TCCCCT--------CCCGTCCCGG---GG------CACGGTGAGGGGG---CGAAAGCTGGCCTCCCGGGAGCCCT--CGGCTCGCGGTTGGTTCAAAGAG-ACGGGCTCTTGGTGGGGA-GCAGCA-CCGCGGCG-GATGGTGG---TCGAGTGCGA--ACCTCGTTGCCGGCCGCGCGTC--CTCCTCC---CCCGTTTC-AAGGCCCGGCGACCC--GCGGGCG-----AC-TCCGATCGTCCCGAGC??????????????????? Stylosanthes_linearifolia_AJ320367 ??????TCGATGGC---------CCACGAACGACCGGCGAACGCGTCCTCATACAAACCCTAGGCCGGGTACGGCCGGCGGTTCGC--CGCCGGCCCCCGGCCC------------------------------------------------------AAA-CAACAAAA-CCACGGCGCGGAACGCGC--CAAGGAA-TCCGAAC----GTTATTGTTCTCCCC-GCC-GTCTCCGGAGACGGAGTCCGGC--CGGGG---CGAC-GAGTGAC----CACAAGAG-TATAGAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTTGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCCTTAGGCTGAGGGCACGCCTGCCTGGGTGTCACCAAAAGCCGCCCCC--TCCCCT--------CCCGTCCCGG---GG------CACGGAGAGGGGG---CGAAAGCTGGCCTCCCGGGAGCCCC--TGGCTCGCGGTTGGTTCAAAGAG-ACGGGCTCTTTGTGGGGA-GCAGCA-CCGCGGCG-GATGGTGG---TCGTGTTCGA--ACCTCGCTGCCGGCCGCGCGTT--CTTCTCC---CCCGTCTC-AAGGCCCGGCGACCC--GCGGGCG-----AC-TCGTATCGTCCCTAGC??????????????????? Stylosanthes_macrocephala_AJ320371 ??????TCGATGGC---------CCACGAACGACCGGCGAACGCGTCCTCATACAAACCCTAGGCCGGGTACGGCAGGCCGTCCGC--GGCCGGCGCCCGGCCC------------------------------------------------------AAA-CAACAAAA-CCACGGCGCGGAACGCGC--CAAGGAA-TCCGAAC----GTTATTGTTCTCCCC-GCC-GTCTCCGGAGACGGAGTCCGGC--CGGGG---CGAC-GAGTGAC----AACAAGAG-TATAGAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTTGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCCTTAGGCTGAGGGCACGCCTGCCTGGGTGTCACCAAAAGCCGCCCCC--TCCCCT--------CCCCTCCCGG---GG------CACGGAGAGGGGG---CGAAAGCTGGCCTCCCGGGAGCCCA--TGGCTCGCGGTTGGTTCAAAGAG-ACGGGCTCTTTGTGGGGA-GCAGCA-CCGCGGCG-GATGGTGG---TCGTGTTCGA--ACCTCGCTGCCGGCCGCGCGTT--CTTCTCC---CCCGTTTC-AAGGCCCGGCGACCC--GCGGGCG-----AC-TCGTGTCGTCCCTAGC??????????????????? Stylosanthes_mexicana_AJ320375 ??????TCGATGCC---------CCACGAACGACCGGCGAACGCGTCCTCAGACAAACCCTGTGCCGGGAACGGCCGGCCGCGCGGCCGGCGAGCCCCCGGCCC------------------------------------------------------AAA-CAACAAAA-CCACGGCGCGGAACGCGC--CAAGGAA-TCCAAAC----GTTATTGTTCTCCCCCGCC-GTCTCCGGAGACGGAGTCCGGT--CGGGG---CGAC-GAGCGAA----CACAAGAG-TACAGAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTTGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCCTTAGGCTGAGGGCACGCCTGCCTGGGTGTCACCAAAAGCCGCCCCC--TCCCCT--------CCCGTCCCGG---GG------CACGGAGAGGGGG---CGAAAGCTGGCCTCCCGGGAGCCCT--CGGCTCGCGGTTGGTTCAAAGAG-ACGGGCTCTTGGTGGGGA-GCAGCA-CCGCGGCG-GATGGTGG---TCGAGTGCGA--ACCTCGTTGCCGGCCGCGCGTC--CTCCTCC---CCCGTTTC-AAGGCCCGGCGACCC--GCGGGCG-----AC-TCCGATCGTCCCGAGC??????????????????? Stylosanthes_scabra_AJ320383 ??????TCGATGCC---------CCACGAACGACCGGCGAACGCGTCCTCAGACAAACCCTGTGCCGGGAACGGCCGGCCGCGCGGCCGGCCGGCCCCCGGCCC------------------------------------------------------AAA-CAACAAAA-CCACGGCGCGGAACGCGC--CAAGGAA-TCCAAAC----GTTATTGTTCTCCCCCGCC-GTCTCCGGAGACGGAGTCCGGT--CGGGG---CGAC-GAGCGAC----CACAAGAG-TACAGAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTTGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCCTTAGGCTGAGGGCACGCCTGCCTGGGTGTCACCAAAAGCCGCCCCC--TCCCCT--------CCCGTCCCGG---GG------CACGGTGAGGGGG---CGAAAGCTGGCCTCCCGGGAGCCCT--CGGCTCGCGGTTGGTTCAAAGAG-ACGGGCTCTTGGTGGGGA-GCAGCA-CCGCGGCG-GATGGTGG---TCGAGTGCGA--ACCTCGTTGCCGGCCGCGCGTC--CTCCTCC---CCCGTTTC-AAGGCCCGGCGACCC--GCGGGCG-----AC-TCCGATCGTCCCGAGC??????????????????? Stylosanthes_sericeiceps_AJ320386 ??????TCGATGCC---------CCACGAACGACCGGCGAACGCGTCCTCAGACAAACCCTGTGCCGGGAACGGCCGGCCGCGCGGCCGGCCGGCCCCCGGCCC------------------------------------------------------AAA-GAACAAAA-CCACGGCGCGGAACGCGC--CAAGGAA-TCCAAAC----GTTATTGTTCTCCCCCGCC-GTCTCCGGAGACGGAGTCCGGT--CGGGG---CGAC-GAGCGAC----CACAAGAG-TACAGAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTTGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCCTTAGGCTGAGGGCACGCCTGCCTGGGTGTCACCAAAAGCCGCCCCC--TCCCCT--------CCCGTCCCGG---GG------CGCGGTGAGGGGG---CGAAAGCTGGCCTCCCGGGAGCCCT--CGGCTCGCGGTTGGTTCAAAGAG-ACGGGCTCTTGGTGGGGA-GCAGCA-CCGCGGCG-GATGGTGG---TCGAGTGCGA--ACCTCGTTGCCGGCCGCGCGTC--CTCCTCC---CCCGTTTC-AAGGCCCGGCGACCC--GCGGGCG-----AC-TCCGATCGTCCCGAGC??????????????????? Stylosanthes_subsericea_AJ320388 ??????TCGATGCC---------CCACGAACGACCGGCGAACGCGTCCTCAGACAAACCCTGTGCCGGGAACGGCCGGCCGCGCGGCCGGCCGGCCCCCGGCCC------------------------------------------------------AAA-CAACAAAA-CCACGGCGCGGAACGCGC--CAAGGAA-TCCAAAC----GTTATTGTTCTCCCCCGCC-GTCTGCGGAGACGGAGTCCGGT--CGGGG---CGAC-GAGCGAC----CACAAGAG-TACAGAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTTGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCCTTAGGCTGAGGGCACGCCTGCCTGGGTGTCACCAAAAGCCGCCCCC--TCCCCT--------CCCGTCCCGG---GG------CACGGTGAGGGGG---CGAAAGCTGGCCTCCCGGGAGCCCT--CGGCTCGCGGTTGGTTCAAAGAG-ACGGGCTCTTGGTGGGGA-GCAGCA-CCGCGGCG-GATGGTGG---TCGAGTGCGA--ACCTCGTTGCCGGCCGCGCGTC--CTCCTCC---CCCGTTTC-AAGGCCCGGCGACCC--GCGGGCG-----AC-TCCGATCGTCCCGAGC??????????????????? Stylosanthes_sundaica_AJ320389 ??????TCGATGCC---------CCACGAACGACCGGCGAACGCGTCCTCATACAAACCCTAGGCCGGGTGCGGCCGGCCGTGCGC--GACCGGCCCCCGGGCC------------------------------------------------------AAA-CAACAAAA-CCACGGCGCGGAACGCGC--CAAGGAA-TCCGAAC----GTTATTGTTCTCCCC-GCC-GTCTCCGGAGACGGAGTCCGGC--CGGGG---CGAC-GAGTGAC----CACAAGAG-CATATAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTTGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCCTTAGGCTGAGGGCACGCCTGCCTGGGTGTCACCAAAAGCCGCCCCC--TCCCCT--------CCCGTCCCGG---GG------CACGGAGAGGGGG---CGAAAGCTGGCCTCCCGGGAGCCCC--TGGCTCGCGGTTGGCTCAAAGAG-ACGGGCTCTTGGTGGGGA-GCAGCG-CCGCGGCG-GATGGTGG---TCGAGTTCGA--ACCTCGTTGCCGGCCGCGCGTT--CTTCTCC---CCCGTTTC-AAGGCCCGGCGACCC--TCGGGCG-----AC-TCGTATCGTCCCTAGC??????????????????? Stylosanthes_sympodialis_AJ320391 ??????TCGATGCC---------CCACGAACGACCGGCGAACGCGTCCTCAGACAAACCCTGTGCCGGGAACGGCCGGCCGTGCGC--GACCGGCCCCCGGCCC------------------------------------------------------AAA-CAACAAAA-CCACGGCGCGGAACGCGC--CAAGGAA-TCCAAAC----GTTATTGTTCTCCCC-GCC-GTCTCCGGAGACGGAGTCCGGT--CGGGG---CGAC-GAGCGAC----CACAAGAG-TACAGAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTTGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCCTTAGGCTGAGGGCACGCCTGCCTGGGTGTCACCAAAAGCCGCCCCC--TCCCCT--------CCCGTCCCGG---GG------CACGGTGAGGGGG---CGAAAGCTGGCCTCCCGGGAGCCCT--CGGCTCGCGGCTGGTTCAAAGAG-ACGGGCTCTTGGTGGGGA-GCAGCA-CCGCGGCG-GATGGTGG---TCGAGTGCGA--ACCTCGTTGCCGGCCGCGCGTC--CTCCTCC---CCCGCTTC-AAGGCCCGGCGACCC--GCGGGCG-----AC-TCCGATCGTCCCGAGC??????????????????? Stylosanthes_tuberculata_AJ320392 ??????TCGATGCC---------CCACGAACGACCGGCGAACGCGTCCTCAGACAAACCCTGTGCCGGGAACGGCCGGCCGCGCGGCCGGCCGGCCCCCGGCCC------------------------------------------------------AAA-CAACAAAA-CCACGGCGCGGAACGCGC--CAAGGAA-TCCAAAC----GTTATTGTTCTCCCCCGCC-GTCTCCGGAGACGGAGTCCGGT--CGGGG---CGAC-GAGCGAC----CACAAGAG-TACAGAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTTGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCCTTAGGCTGAGGGCACGCCTGCCTGGGTGTCACCAAAAGCCGCCCCC--TCCCCT--------CCCGTCCCGG---GG------CACGGTGAGGGGG---CGAAAGCTGGCCTCCCGGGAGCCCT--CGGCTCGCGGTTGGTTCAAAGAG-ACGGGCTCTTGGTGGGGA-GCAGCA-CCGCGGCG-GATGGTGG---TCGAGTGCGA--ACCTCGTTGCCGGCCGCGCGTC--CTCCTCC---CCCGTTTC-AAGGCCCGGCGACCC--GCGGGCG-----AC-TCCGATCGTCCCGAGC??????????????????? Stylosanthes_viscosa_AJ320345 ??????TCGATGCC---------CCACGAACGACCGGCGAACGCGTCCTCAGACAAACCCTGTGCCGGGAACGGCCGGCCGCGCGGCCGGCCGGCCCCCGGCCC------------------------------------------------------AAA-CAACAAAA-CCACGGCGCGGAACGCGC--CAAGGAA-TCCAAAC----GTTATTGTTCTCCCCCGCC-GTCTCCGGAGACGGAGTCCGGT--CGGGG---CGAC-GAGCGAC----CACAAGAG-TACAGAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTTGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCCTTAGGCTGAGGGCACGCCTGCCTGGGTGTCACCAAAAGCCGCCCCC--TCCCCT--------CCCGTCCCGG---GG------CACGGTGAGGGGG---CGAAAGCTGGCCTCCCGGGAGCCCT--CGGCTCGCGGTTGGTTCAAAGAG-ACGGGCTCTTGGTGGGGA-GCAGCA-CCGCGGCG-GATGGTGG---TCGAGTGCGA--ACCTCGTTGCCGGCCGCGCGTC--CTCCTCC---CCCGTTTC-AAGGCCCGGCGACCC--GCGGGCG-----AC-TCCGATCGTCCCGAGC??????????????????? Tipuana_tipu_AF189056 TCATTGTCGATGCCTCGCAA---TCCAGTGCGACCCGCGAACTTGTTTTTCCCAC---GC-GGGCAGCCGACGCCGCACGGCATCTCGGCTGTCCCCCATG--CCGGG--ACGGACGCG-C----CTCGTGCGGT-CCCG-------T-CCG--GGCGCAA-CAACAAAC-CCCCGGCGCGGAATGCGC--CAAGGAA-GTCATAA----CTGTCGGGCACGCCCCACC--GGCCCGGAAACGGTGCTCGTT--CGGGCG--GC--GTCGCAAC----ACTC-GAG-TCCAAAATGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTTGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACCAGGCCAAGGGCACGCCTGCCTGGGTGTCACCAATCGTTTCCCC---AAGCCCC------GACGCCTTGC----GG------CACCGGGCGGGG----TGGATGATGGCTTCCCGTGAGCGAG--CGCCTCGCGGCTGGCTGAAAA---TCGGGTTCGTGGTCGAGC-GTAGCG-CCATGACA-GACGGTGG---TTGAGCGCGG--TCTCGA-GGCCAGTCATGCGCG--CCCCTCC---ACCGGTTA-CGGACTCCGTGACCC---CGAGCG-----ACACCG-ATCGCCCGTGATGCGACCTCAGGTCAGGCGG Weberbauerella_brongniartioides_AF189028 TCATTGTTGATGTCTTGATA---TCCAGAGAGACCCGCGAACGCGTTCT--AGTG--CTT-GGGGGAGTTGATGCTTCCTGGCAGGTTGCCTTCCCC---AACTTCCG---GTGCCGGGCCACCCTGCGTGGTCC----------CTCCCGGG---CGCAA-CAACAAA--CCCCGGCGCGGAATGTGC--CAAGGAA-GACGCAA----CTGCAGAGTGCGCCCTGCC--AGCCCGGAAGCGGTGTCTGTC---GGGGT-GGT--GTCGCAAC----ACTC-GAG-TCCAAAATGACTCTCGGCAATGGATATCTCGGCTCTTGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCTGAAGCCATCAGGCTAAGGGCACGCCTGCCTGGGTGTCACCAATCGTTTCCAA-----AACCC-------TAGTGCCTC---CGG-----CCATGGGGCGGGG---AAAAATGCTGGCTTCCCGTGAGCAC---TGCCTTGCGGCTGGCTGAAAAG--TTGGGTTTGTGGTGGAGTTGCGGCA-CTGTGACA-GATGGTGG---TTGAGCAAGT--TCTCGA-TGCCAGCTGTGGGTGCC--C-GTCT--GCC-GCTTCCATACCCAGCGACCC--GTGGGCG-----ACACCG-TTTGCCCATGACGCGACCTCAGGTCAGGCGG ; END; BEGIN TREES; TITLE Figure_5._Strict_Consensus_from_the_ITS_analysis; LINK TAXA = Taxa2; TRANSLATE 1 Dalbergia_nigra_EF451075, 2 Machaerium_hirtum_EF451081, 3 Aeschynomene_fascicularis_AF189025, 4 Aeschynomene_martii_EF451088, 5 Soemmeringia_semperflorens_AF189027, 6 Bryaspis_lupulina_AF204234, 7 Weberbauerella_brongniartioides_AF189028, 8 Diphysa_americana_AF068160, 9 Ormocarpopsis_mandrarensis_AF068147, 10 Peltiera_nitida_GU951673, 11 Ormocarpum_bernierianum_AF189035, 12 Pictetia_angustifolia_AF068171, 13 Acosmium_diffusissimum_JQ955620, 14 Acosmium_diffusissimum_JQ955619, 15 Acosmium_lentiscifolium_JQ955618, 16 Acosmium_cardenasii_JQ955617, 17 Acosmium_lentiscifolium_JQ955621, 18 Platymiscium_filipes_AF189053, 19 Platymiscium_stipulare_AF189054, 20 Platymiscium_speciosum_EU735920, 21 Platymiscium_trinitatis_var_trinitatis_EU735929, 22 Platymiscium_trifoliolatum_EU735924, 23 Platymiscium_pinnatum_var_pinnatum_EU735900, 24 Platymiscium_parviflorum_EU735894, 25 Platymiscium_lasiocarpum_EU735889, 26 Platymiscium_jejunum_EU735888, 27 Platymiscium_hebestachyum_EU735887, 28 Platymiscium_floribundum_var_obtusifolium_EU735885, 29 Platymiscium_filipes_EU735879, 30 Platymiscium_dimorphandrum_EU735875, 31 Platymiscium_darienense_EU735874, 32 Platymiscium_pubescens_subsp_zehntneri_EU735916, 33 Platymiscium_curuense_EU735873, 34 Platymiscium_calyptratum_EU735872, 35 Platymiscium_albertinae_EU735871, 36 Centrolobium_tomentosum_EU401441, 37 Centrolobium_sclerophyllum_EU401440, 38 Centrolobium_robustum_EU401438, 39 Centrolobium_paraense_EU401436, 40 Centrolobium_ochroxylum_EU401434, 41 Centrolobium_microchaete_EU401431, 42 Tipuana_tipu_AF189056, 43 Maraniona_lavinii_EU735855, 44 Pterocarpus_acapulcensis_AF269175, 45 Pterocarpus_macrocarpus_AF269175, 46 Paramachaerium_schomburgkii_AF204237, 47 Ramorinoa_girolae_AF204236, 48 Geoffroea_decorticans_AF189057, 49 Geoffroea_spinosa_EU735854, 50 Discolobium_psoraleifolium_AF189058, 51 Discolobium_pulchellum_AF189059, 52 Cascaronia_astragalina_AF204235, 53 Brya_ebenus_AF068142, 54 Brya_hirsuta_AF203560, 55 Cranocarpus_martii_AF189060, 56 Fissicalyx_fendleri_AF189061, 57 Fiebrigiella_gracilis_AF203541, 58 Chapmannia_prismatica_AF203542, 59 Chapmannia_somalensis_AF203544, 60 Chapmannia_gracilis_AF203546, 61 Chapmannia_tinireana_AF203547, 62 Chapmannia_sericea_AF203548, 63 Stylosanthes_capitata_AF203549, 64 Stylosanthes_sundaica_AJ320389, 65 Stylosanthes_subsericea_AJ320388, 66 Stylosanthes_sympodialis_AJ320391, 67 Stylosanthes_sericeiceps_AJ320386, 68 Stylosanthes_tuberculata_AJ320392, 69 Stylosanthes_scabra_AJ320383, 70 Stylosanthes_mexicana_AJ320375, 71 Stylosanthes_viscosa_AJ320345, 72 Stylosanthes_erecta_AJ320351, 73 Stylosanthes_fruticosa_AJ320356, 74 Stylosanthes_macrocephala_AJ320371, 75 Stylosanthes_linearifolia_AJ320367, 76 Stylosanthes_bracteata_AJ320346, 77 Arachis_pintoi_AF203551, 78 Arachis_major_AF203552, 79 Arachis_batizocoi_AF203553, 80 Arachis_correntina_AF203554, 81 Arachis_magna_AF203555, 82 Arachis_hermannii_AF203556, 83 Arachis_palustris_AF203557, 84 Arachis_villosa_AF203558; TREE Strict = [&R] (((((1,(3,4)),2),((5,6),7)),((8,((9,10),11)),12)),(((13,14),15,16,17),((((((18,21),19),(20,28)),((((22,((24,35),33),25,((26,30),(31,34))),23),27),29)),32),(((((((36,37,38,39),41),40),(43,46)),(42,(44,45))),(47,((48,(50,51)),49))),((52,((56,57),((58,(59,(60,(61,62)))),(((((63,74),(75,76)),64),((65,(67,73),68,69,70,71,72),66)),(77,(78,82),(((79,81),83),(80,84))))))),((53,54),55)))))); END; BEGIN TREES; TITLE Figure_6._Strict_Consensus_from_the_combined_analysis; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Leptolobium_panamense_AF142684, 2 Myrospermum_frutescens_AF142679, 3 Dipteryx_alata_AY553717, 4 Pterodon_pubescens_AF272095, 5 Andira_galeottiana_AF142681, 6 Hymenolobium_mesoamericanum_AY386934, 7 Vatairea_sp_nov_AF270859, 8 Poecilanthe_parviflora_AF142687, 9 Apoplanesia_paniculata_AF270860, 10 Amorpha_fruticosa_AF270861, 11 Adesmia_lanata_AF270863, 12 Adesmia_volckmanii_AF142690, 13 Amicia_glandulosa_AF203583, 14 Zornia_sp_AF203584, 15 Poiretia_angustifolia_AF270864, 16 Poiretia_punctata_AF272081, 17 Chaetocalyx_blanchetiana_AF272070, 18 Chaetocalyx_nigricans_AF203585, 19 Chaetocalyx_scandens_AF270865, 20 Chaetocalyx_brasiliensis_AF270866, 21 Nissolia_schottii_AF270867, 22 Nissolia_hirsuta_AF270868, 23 Ormocarpopsis_itremoensis_AF203567, 24 Ormocarpopsis_calcicola_AF203568, 25 Peltiera_nitida_GU951672, 26 Ormocarpum_muricatum_AF203569, 27 Ormocarpum_bernierianum_AF203570, 28 Ormocarpum_kirkii_AF203571, 29 Ormocarpum_keniense_AF203602, 30 Ormocarpum_klainei_AF203603, 31 Ormocarpum_coeruleum_AF203572, 32 Ormocarpum_yemenense_AF203573, 33 Diphysa_americana_AF203574, 34 Diphysa_floribunda_AF203575, 35 Diphysa_thurberii_AF203576, 36 Diphysa_ormocarpoides_AF203601, 37 Pictetia_aculeata_AF203604, 38 Pictetia_aculeata_AF203577, 39 Pictetia_marginata_AF203578, 40 Pictetia_angustifolia_AF203579, 41 Machaerium_sp_AF142692, 42 Dalbergia_sp_AF203580, 43 Dalbergia_foliolosa_AF203581, 44 Dalbergia_congestiflora_AF142696, 45 Dalbergia_sissoo_AF203582, 46 Weberbauerella_brongniartioides_AF272075, 47 Weberbauerella_brongniartioides_AF272071, 48 Weberbauerella_brongniartioides_AF272077, 49 Aeschynomene_virginica_AF203586, 50 Aeschynomene_pfundii_AF203587, 51 Aeschynomene_indica_AF272084, 52 Aeschynomene_rudis_AF270869, 53 Aeschynomene_americana_AF272086, 54 Aeschynomene_purpusii_AF270870, 55 Aeschynomene_fascicularis_AF142695, 56 Soemmeringia_semperflorens_AF272088, 57 Geissaspis_descampsii_AF272064, 58 Kotschya_ochreata_AF272065, 59 Smithia_ciliata_AF272066, 60 Cyclocarpa_stellaris_AF272067, 61 Bryaspis_lupulina_AF272068, 62 Humularia_corbisieri_AF272069, 63 Platymiscium_sp_AF270871, 64 Platymiscium_stipulare_AF270872, 65 Discolobium_pulchellum_AF270873, 66 Discolobium_psoraleifolium_AF270874, 67 Riedeliella_graciliflora_AF272090, 68 Cranocarpus_martii_AF270875, 69 Brya_ebenus_AF270876, 70 Cascaronia_astragalina_AF272072, 71 Platypodium_elegans_AF270877, 72 Inocarpus_fagifer_AF270878, 73 Geoffroea_spinosa_AF270879, 74 Geoffroea_decorticans_AF270880, 75 Ramorinoa_girolae_AF270881, 76 Tipuana_tipu_AF270882, 77 Centrolobium_sp_AF270883, 78 Paramachaerium_schomburgkii_AF272062, 79 Etaballia_guianensis_AF272074, 80 Pterocarpus_macrocarpus_AF203588, 81 Pterocarpus_indicus_AF142691, 82 Grazielodendron_riodocensis_AF270862, 83 Fissicalyx_fendleri_AF272063, 84 Fiebrigiella_gracilis_AF203589, 85 Fiebrigiella_gracilis_AF203590, 86 Chapmannia_prismatica_AF203598, 87 Chapmannia_floridana_AF203600, 88 Chapmannia_sericea_AF203591, 89 Chapmannia_gracilis_AF203592, 90 Chapmannia_gracilis_AF203593, 91 Stylosanthes_hamata_AF203594, 92 Stylosanthes_capitata_AF203595, 93 Arachis_pintoi_AF203596, 94 Arachis_major_AF203597, 95 Arachis_triseminata_AF203599, 96 Acosmium_cardenasii_JX124414, 97 Acosmium_cardenasii_JX124425, 98 Acosmium_lentiscifolium_JX124427, 99 Acosmium_diffusissimum_JX124415, 100 Acosmium_diffusissimum_JX124421, 101 Acosmium_lentiscifolium_JX124417, 102 Acosmium_lentiscifolium_JX124416, 103 Acosmium_lentiscifolium_JX124422, 104 Maraniona_lavinii_AY247263; TREE Fig._6 = [&R] (((1,8),(5,6),7,((9,10),(((11,12),(((13,14),(15,16)),(17,((18,(19,20)),(21,22))))),(((((23,24,25),((26,29),27,28,30)),(31,32),((33,35),36),34,((37,(39,40)),38)),((41,(54,55)),(((42,44),45),43)),(46,47,48),(((((49,52),51),(56,((57,61),62),58,59,60)),53),50)),((((((63,64),(68,69)),82),((71,(((72,75,77),((78,79),(80,81))),(76,104))),(((96,97),98,(99,100),102,103),101))),((70,(73,74)),((83,(84,85)),(((86,87),(88,(89,90))),((91,92),(93,94,95)))))),((65,66),67)))))),(2,(3,4))); END; BEGIN TREES; TITLE 'Figures 3-4. Strict Consensus from the Acosmium matK analysis'; LINK TAXA = Taxa3; TRANSLATE 1 Acrocarpus_fraxinifolius_EU361843, 2 Ceratonia_siliqua_AY386852, 3 Arcoa_gonavensis_AY386933, 4 Umtiza_listeriana_EU362062, 5 Gymnocladus_chinensis_AY386928, 6 Gleditsia_sinensis_AY386930, 7 Ateleia_herbertsmithii_AY386953, 8 Cyathostegia_mathewsii_HM347482, 9 Bobgunnia_madagascariensis_AY386940, 10 Swartzia_simplex_AF142678, 11 Styphnolobium_japonicum_AY386962, 12 Cladrastis_delavayi_AY386861, 13 Angylocalyx_sp_AY553715, 14 Pickeringia_montana_AY386863, 15 Amburana_cearensis_AY553712, 16 Dipteryx_alata_AY553717, 17 Pterodon_pubescens_AF272095, 18 Myrocarpus_frondosus_AY386925, 19 Myroxylon_balsamum_FJ151488, 20 Holocalyx_balansae_AY553714, 21 Lecointea_peruviana_EU361990, 22 Uribea_tamarindoides_AY553719, 23 Luetzelburgia_auriculata_AY553716, 24 Sweetia_fruticosa_AY386911, 25 Vatairea_macrocarpa_AY386927, 26 Ormosia_colombiana_AY386960, 27 Ormosia_formosana_AF142682, 28 Bowdichia_virgilioides_AY386937, 29 Bowdichia_virgilioides_AY386936, 30 Bowdichia_virgilioides_JX124393, 31 Bowdichia_nitida_JX124419, 32 Bowdichia_nitida_JX124395, 33 Bowdichia_nitida_JX124394, 34 Leptolobium_brachystachyum_JX124407, 35 Leptolobium_brachystachyum_JX124399, 36 Leptolobium_bijugum_JX124404, 37 Leptolobium_bijugum_JX124406, 38 Leptolobium_dasycarpum_JX124408, 39 Leptolobium_elegans_JX124410, 40 Leptolobium_nitens_JX124409, 41 Leptolobium_panamense_AF142684, 42 Leptolobium_parvifolium_JX124411, 43 Leptolobium_sp_nov_JX124412, 44 Leptolobium_sp_nov_JX124423, 45 Leptolobium_tenuifolium_JX124413, 46 Guianodendron_praeclarum_JX124402, 47 Guianodendron_praeclarum_JX124403, 48 Diplotropis_duckei_JX124405, 49 Diplotropis_racemosa_var_racemosa_JX124420, 50 Diplotropis_racemosa_var_rosae_JX124396, 51 Diplotropis_brasiliensis_AY386939, 52 Diplotropis_ferruginea_JX124397, 53 Diplotropis_incexis_JX124401, 54 Diplotropis_aff_incexis_JX124400, 55 Diplotropis_martiusii_AY386938, 56 Diplotropis_purpurea_JX124418, 57 Diplotropis_triloba_JX124398, 58 Poecilanthe_parviflora_AF142687, 59 Cyclolobium_nutans_AF142686, 60 Harpalyce_arborescens_AF142689, 61 Hovea_purpurea_AY386889, 62 Lamprolobium_fruticosum_GQ246159, 63 Tabaroa_caatingicola_GQ246161, 64 Brongniartia_alamosana_AF142688, 65 Templetonia_hookeri_GQ246157, 66 Lupinus_argenteus_AY386956, 67 Spartium_junceum_AY386901, 68 Genista_monspessulana_AY386862, 69 Cytisus_scoparius_AY386902, 70 Calpurnia_aurea_AY386951, 71 Bolusanthus_speciosus_AF142685, 72 Dicraeopetalum_stipulare_GQ246142, 73 Baptisia_australis_AY386900, 74 Thermopsis_rhombifolia_AY386866, 75 Maackia_amurensis_AY386944, 76 Anarthrophyllum_desideratum_AY386923, 77 Sophora_davidii_AY386958, 78 Hymenolobium_mesoamericanum_AY386934, 79 Andira_galeottiana_AF142681, 80 Amorpha_fruticosa_AF270861, 81 Apoplanesia_paniculata_AF270860, 82 Errazurizia_megacarpa_AY391804, 83 Eysenhardtia_orthocarpa_AY386909, 84 Parryella_filifolia_AY391812, 85 Psorothamnus_arborescens_AY391814, 86 Dalea_pulchra_AY386860, 87 Marina_scopa_AY391811, 88 Acosmium_cardenasii_JX124414, 89 Acosmium_cardenasii_JX124425, 90 Acosmium_lentiscifolium_JX124427, 91 Acosmium_diffusissimum_JX124415, 92 Acosmium_diffusissimum_JX124421, 93 Acosmium_lentiscifolium_JX124417, 94 Acosmium_lentiscifolium_JX124416, 95 Acosmium_lentiscifolium_JX124422, 96 Adesmia_lanata_AF270863, 97 Aeschynomene_fascicularis_AF142695, 98 Amicia_glandulosa_AF203583, 99 Arachis_pintoi_AF203596, 100 Brya_ebenus_AF270876, 101 Cascaronia_astragalina_AF272072, 102 Centrolobium_sclerophyllum_EU401416, 103 Chaetocalyx_blanchetiana_AF272070, 104 Chapmannia_gracilis_AF203592, 105 Cranocarpus_martii_AF270875, 106 Dalbergia_congestiflora_AF142696, 107 Diphysa_ormocarpoides_AF203601, 108 Discolobium_psoraleifolium_AF270874, 109 Etaballia_guianensis_AF272074, 110 Fiebrigiella_gracilis_AF203590, 111 Fissicalyx_fendleri_AF272063, 112 Geoffroea_decorticans_AF270880, 113 Grazielodendron_riodocense_AF270862, 114 Inocarpus_fagifer_AF270878, 115 Kotschya_ochreata_AF272065, 116 Machaerium_sp_AF142692, 117 Maraniona_lavinii_AY247263, 118 Nissolia_hirsuta_AF270868, 119 Ormocarpopsis_itremoensis_AF203567, 120 Ormocarpum_yemenense_AF203573, 121 Paramachaerium_schomburgkii_AF272062, 122 Pictetia_aculeata_AF203577, 123 Platymiscium_stipulare_AF270872, 124 Platypodium_elegans_AF270877, 125 Poiretia_angustifolia_AF270864, 126 Pterocarpus_indicus_AF142691, 127 Ramorinoa_girolae_AF270881, 128 Riedeliella_graciliflora_AH009910, 129 Soemmeringia_semperflorens_AF272088, 130 Tipuana_tipu_AF270882, 131 Zornia_sp_AF203584, 132 Weberbauerella_brongniartioides_AF272075, 133 Baphia_nitida_EU361867, 134 Phylloxylon_spinosa_AY650280, 135 Abrus_precatorius_AF142705, 136 Austrosteenisia_blackii_AF142707, 137 Lonchocarpus_lanceolatus_AF142717, 138 Millettia_grandis_AF142724, 139 Glycine_microphylla_EF550008, 140 Robinia_pseudoacacia_AF142728, 141 Peteria_thompsonae_AF547190, 142 Coursetia_glandulosa_AF543852, 143 Sphinctospermum_constrictum_AF547191, 144 Gliricidia_brenningii_AF547199, 145 Glycyrrhiza_lepidota_AY386883, 146 Wisteria_frutescens_AF142731, 147 Carmichaelia_williamsii_AY386873, 148 Oxytropis_lambertii_AY386915, 149 Astragalus_canadensis_AY386875, 150 Cicer_canariense_AF522079, 151 Lathyrus_sativus_AF522086, 152 Trifolium_repens_AF522131; TREE Strict = [&R] ((1,2),((3,(4,(5,6))),((((7,8),(9,10)),(((11,12,14),((20,21,22),((23,25),24),(26,27),(((((28,29,30,31,32,33),((34,35),(36,37)),((38,39,40,(43,44),45),41,42)),(((46,47),((48,50),49)),((51,((52,53,54),57),56),55))),(((66,((67,68),69)),76),70,((71,72),(((73,74),77),75)))),(58,((59,((61,62,65),64)),(60,63)))),(78,79),((((80,84),81,(82,83)),(85,(86,87))),(((((((88,89),90,(91,92),94,95),93),(((99,104),(110,111)),(101,112)),((100,105),123),(((102,127),(((109,126),121),((114,130),117))),124),113),(108,128)),(((97,116),106),((107,119,120,122),(115,129),132))),(96,(((98,131),125),(103,118))))),(133,((134,(((135,(137,138)),136),139)),(((140,((141,142),143)),144),(145,146,((147,(148,149)),(150,(151,152))))))))),(13,(15,(18,19))))),(16,17)))); END; BEGIN TREES; TITLE 'Figures 1-2. Strict Consensus from the Acosmium trnL analysis'; LINK TAXA = Taxa4; TRANSLATE 1 Acrocarpus_fraxinifolius_AY899683, 2 Ceratonia_siliqua_AF365075, 3 Arcoa_gonavensis_AY232787, 4 Umtiza_listeriana_AF365126, 5 Gymnocladus_chinensis_EU361814, 6 Gleditsia_sinensis_AY899686, 7 Ateleia_herbertsmithii_AF309840, 8 Cyathostegia_mathewsii_AF309841, 9 Bobgunnia_madagascariensis_AF309845, 10 Swartzia_simplex_AF309843, 11 Styphnolobium_japonicum_EF466270, 12 Cladrastis_delavayi_AF311370, 13 Angylocalyx_sp_AF311366, 14 Cordyla_madagascariensis_AF309848, 15 Mildbraediodendron_excelsum_AF309847, 16 Xanthocercis_zambesiaca_AF311365, 17 Amburana_cearensis_AF309846, 18 Dipteryx_alata_AF208896, 19 Pterodon_pubescens_AF208895, 20 Taralea_oppositifolia_AF309855, 21 Myrocarpus_frondosus_AF311002, 22 Myroxylon_balsamum_AF309850, 23 Holocalyx_balansae_AF524881, 24 Lecointea_peruviana_AF365039, 25 Uribea_tamarindoides_AF311000, 26 Luetzelburgia_auriculata_AF309834, 27 Sweetia_fruticosa_AF524883, 28 Vatairea_macrocarpa_AF309835, 29 Ormosia_amazonica_AF309484, 30 Ormosia_minor_JX124470, 31 Ormosia_minor_JX124471, 32 Ormosia_smithii_JX124472, 33 Clathrotropis_nitida_JX124468, 34 Bowdichia_virgilioides_AF309486, 35 Bowdichia_virgilioides_JX124429, 36 Bowdichia_virgilioides_JX124430, 37 Bowdichia_nitida_JX124432, 38 Bowdichia_nitida_JX124433, 39 Bowdichia_nitida_JX124431, 40 Leptolobium_bijugum_JX124444, 41 Leptolobium_bijugum_JX124445, 42 Leptolobium_bijugum_JX124446, 43 Leptolobium_brachystachyum_JX124447, 44 Leptolobium_brachystachyum_JX124448, 45 Leptolobium_brachystachyum_JX124449, 46 Leptolobium_dasycarpum_JX124450, 47 Leptolobium_elegans_AF309826, 48 Leptolobium_nitens_JX124451, 49 Leptolobium_nitens_JX124469, 50 Leptolobium_panamense_JX124452, 51 Leptolobium_panamense_AF208891, 52 Leptolobium_parvifolium_JX124453, 53 Leptolobium_sp_nov_JX124454, 54 Leptolobium_sp_nov_JX124455, 55 Leptolobium_tenuifolium_JX124456, 56 Leptolobium_tenuifolium_JX124457, 57 Guianodendron_praeclarum_JX124442, 58 Guianodendron_praeclarum_JX124443, 59 Diplotropis_duckei_JX124473, 60 Diplotropis_racemosa_var_racemosa_JX124435, 61 Diplotropis_racemosa_var_rosae_JX124434, 62 Diplotropis_ferruginea_JX124436, 63 Diplotropis_incexis_JX124440, 64 Diplotropis_incexis_JX124439, 65 Diplotropis_incexis_JX124474, 66 Diplotropis_martiusii_JX124438, 67 Diplotropis_purpurea_JX124441, 68 Diplotropis_triloba_JX124437, 69 Poecilanthe_parviflora_AF208897, 70 Cyclolobium_nutans_AF309857, 71 Lupinus_argenteus_DQ417088, 72 Spartium_junceum_DQ417002, 73 Genista_monspessulana_JF338274, 74 Cytisus_scoparius_JF338224, 75 Ulex_europaeus_AF385427, 76 Calpurnia_aurea_AF310993, 77 Bolusanthus_speciosus_AF310994, 78 Dicraeopetalum_stipulare_AF310995, 79 Baptisia_australis_AF309831, 80 Thermopsis_rhombifolia_AY618487, 81 Maackia_amurensis_AB127033, 82 Anarthrophyllum_cumingii_AY618488, 83 Sophora_davidii_AF309829, 84 Hymenolobium_mesoamericanum_AF309852, 85 Andira_galeottiana_AF208893, 86 Amorpha_fruticosa_AF208899, 87 Apoplanesia_paniculata_AF208898, 88 Acosmium_cardenasii_JX124458, 89 Acosmium_cardenasii_JX124459, 90 Acosmium_cardenasii_JX124460, 91 Acosmium_lentiscifolium_JX124461, 92 Acosmium_diffusissimum_JX124463, 93 Acosmium_diffusissimum_JX124462, 94 Acosmium_diffusissimum_JX124464, 95 Acosmium_lentiscifolium_JX124466, 96 Acosmium_lentiscifolium_JX124465, 97 Acosmium_lentiscifolium_JX124467, 98 Adesmia_lanata_AF208901, 99 Aeschynomene_fascicularis_AF208929, 100 Amicia_glandulosa_AF208902, 101 Arachis_pintoi_AF208946, 102 Brya_ebenus_AF208950, 103 Cascaronia_astragalina_AF208958, 104 Centrolobium_sclerophyllum_EU401426, 105 Chaetocalyx_blanchetiana_AF208905, 106 Chapmannia_gracilis_AF208940, 107 Cranocarpus_martii_AF208951, 108 Dalbergia_congestiflora_AF208924, 109 Diphysa_ormocarpoides_AF208912, 110 Discolobium_psoraleifolium_AF208964, 111 Etaballia_guianensis_AF208960, 112 Fiebrigiella_gracilis_AF208939, 113 Fissicalyx_fendleri_AF208938, 114 Geoffroea_decorticans_AF208962, 115 Grazielodendron_riodocense_AF208952, 116 Inocarpus_fagifer_AF208965, 117 Kotschya_ochreata_AF208935, 118 Nissolia_hirsuta_AF208908, 119 Ormocarpopsis_itremoensis_AF208918, 120 Ormocarpum_yemenense_AF260650, 121 Paramachaerium_schomburgkii_AF208959, 122 Pictetia_aculeata_AF260906, 123 Platymiscium_stipulare_EU736036, 124 Platypodium_elegans_AF208961, 125 Poiretia_angustifolia_AF208904, 126 Pterocarpus_indicus_AF208953, 127 Ramorinoa_girolae_AF208957, 128 Riedeliella_graciliflora_AF208949, 129 Soemmeringia_semperflorens_AF208937, 130 Tipuana_tipu_AF208956, 131 Zornia_sp_AF208903, 132 Weberbauerella_brongniartioides_AF208909, 133 Baphia_nitida_AF365037, 134 Phylloxylon_spinosa_AF274358, 135 Abrus_precatorius_EF543423, 136 Austrosteenisia_blackii_AF311381, 137 Lonchocarpus_lanceolatus_AF311382, 138 Millettia_grandis_AF311377, 139 Glycine_microphylla_EF543429, 140 Robinia_pseudoacacia_AF529391, 141 Peteria_thompsoniae_AF529395, 142 Coursetia_glandulosa_AF529399, 143 Sphinctospermum_constrictum_AF529392, 144 Gliricidia_brenningii_AF529412, 145 Glycyrrhiza_lepidota_AF124238, 146 Wisteria_frutescens_AF124239, 147 Carmichaelia_williamsii_AF127000, 148 Oxytropis_lambertii_AF126991, 149 Astragalus_canadensis_AF126981, 150 Cicer_canariense_AB117650, 151 Lathyrus_sativus_DQ311696, 152 Trifolium_repens_DQ311961; TREE Strict = [&R] ((1,2),((3,(5,6)),4,(((7,8),(9,10)),((11,12),(13,16),(((14,15),(17,21),22),((18,19),20)),(((23,24,25),((26,28),27),(((29,(30,31),32),33),(((((34,35,36,37,38,39),40,(41,42),43,(44,45),46,47,48,49,50,51,52,53,54,55,56),(57,58,(59,60,61)),(62,63,64,65,66,67,68)),(((((71,72,(73,75),74),82),76),(77,78)),(((79,80),81),83))),(69,70))),(86,87),((((88,89,90),91,92,93,94,95,96,97),99,(((101,106),112,113),(103,114)),(102,107),(((104,116,130),(111,127),121,126),124),108,(109,120,122),110,115,(117,129),(119,132),123,128),((98,(105,118)),(100,(125,131)))),((133,((135,(137,138)),(136,139))),134,(((140,(141,142,143)),144),((145,146),((147,(148,149)),(150,151,152)))))),(84,85)))))); END;