#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 18, 2024; 13:54 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Takamatsu S., Braun U., & Limkaisang S. 2004. Phylogenetic relationships and generic affinity of Uncinula septata inferred from nuclear rDNA sequences. Mycoscience, 45. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S1266] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=22; TAXLABELS Arthrocladiella_mougeotii Blumeria_graminis_ex_Bromus Blumeria_graminis_ex_Hordeum Byssoascus_striatosporus Cystotheca_wrightii Erysiphe_friesii Erysiphe_glycines Erysiphe_mori Golovinomyces_orontii Leveillula_taurica Neoerysiphe_galeopsidis Oidium_phyllanthi_ex_P._acidus Oidium_phyllanthi_ex_P._amarus Oidium_phyllanthi_ex_P._reticulatus Phyllactinia_moricola Pleochaeta_shiraiana Podosphaera_longiseta Podosphaera_xanthii Sawadaea_polyfida Typhulochaeta_japonica Uncinula_septata_MUMH197 Uncinula_septata_MUMH585 ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M1315] TITLE 'Parauncinula septata, 18S, 5.8S and 28S rDNA'; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=2723; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Erysiphe_friesii 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Erysiphe_mori 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Golovinomyces_orontii 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Leveillula_taurica 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Oidium_phyllanthi_ex_P._acidus 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Oidium_phyllanthi_ex_P._reticulatus 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Podosphaera_longiseta 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Podosphaera_xanthii 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Sawadaea_polyfida TTGACCTCGGATCAGGTAGGGATACCCGCTGAACTTAAGCATATCAATAAGCGGAGGAAAAGAAACCAACAGGGATTACCTCAGTAACGGCGAGTGAAGCGGTAACAGCTCAAATTTGAAATCTGGCCCCCT-CGGGGCCCGAGTTGTAATTTGTAGAAGATGCTTTGGGT-GTGGGCCCGGCCTAAGTTCCTTGGAACAGGACGTCGTAGAGGGTGAGAATCCCGTATGCGGCTGGTG-CCCTCGCCC--GTGTAAAGCTCTTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCTAAATGGGTGGTAAATTTCATCTAAAGCTAAATATTGGCCAGAGACCGATAGCGAACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTGGCAACCAGACTTGGGCGCTGCTGATCCGCGGGGGTTCTCCCC-CGGGCACTCGGCAGCGCGCAGGCCAGCATCGGTTTGGGTGGCTGGAGAAAGGCTGGTGGAATGTAGCTGCCCTC--GGGCAGTG--TTATAGCCACCGGTGGCATGCAGCCCACCTGGACCGAGGACCGCGC--TTC-GGCTAGGATGCTGGCGTAATGGTTGTCAGCGACCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATCTATGCGAGTGTTTGGGTGTC-AAACCCATGCGCGGAATGAAAGTGAACGCAGGTGAGAGCCCGTCA-GGGTGCATCATCGACCGATCCGGATGTCTTCGGATGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTATAAGCAAGT-TATACCGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATTGTTTATTTGATAGTACCTTACTACTTGGATAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAGCCCCGACTTCGGAAGGGGTGTATTTATTAGATAAAAAACCAATGCCCCTCGGGGCTCCTTGGTGATTCATAATAACTTAACGAATCGCATGGCCTTGTGCCGGCGATGGTTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGTGTATTGGACTACCATGGTTTCAACGGGTAACGGGGAATTAGGGTTCTATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATACTGATACAGGGCTCTTTTGGGTCTTGTAATTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAATTGG-AGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGCCTGGCTGGCCGGTCCGCCTCGCCGCGTGCACTGGTCCGGCCGGGTCTTTCCTCCTGGGGAGCCGCATGCCCTTCACTGGGTGTGTCGGGGAACCAGGACTTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCCTATGCTCGAATACATTAGCATGGAATAATAGAATAGGACGTGTGGTTCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCGCCGTAATGATTAATAGGGATAGTCGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAA-GAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGACTAGGGATCGGGCGATGTTATTTTTTT---GACTCGCTCGGCACCTTACGAGAAATCAAAGTCTTTGGGTTCTGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGAAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTCACCAGGTCCAGACACAATAAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTTTGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATTTGTCTGCTTAATTGCGATAACGAACGAGACCTTAACCTGCTAAATAGCCAGGCTAGCTTAGGCTGGTCGCCGGCTTCTTAGAGGGACTATCGGCTCAAGCCGATGGAAGTTTGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGACAGAGCCAACGAGTTT-CTTCCTTGTTCGAAAGATCTGGGTAATCTTGTTAAACTCTGTCGTGCTGGGGATAGAGCATTGCAATTATTGCTCTTCAACGAGGAATTCCTAGTAAGCGCAAGTCATCAGCTTGCGCTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGAATGGCTAAGTGAGGCTTTCGGACTGGCCCAGGGAGAGTGGCAACGCTCGCCCAGGGCCGGAAAGTTGTCCAAACTTGGTCATTTAGAGGAAGTAAAA-TCGTAAC--------------------------------ATTAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTTAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCCCGGTATTCCGAGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTC Typhulochaeta_japonica 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Uncinula_septata_MUMH197 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Uncinula_septata_MUMH585 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; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = 'Parauncinula septata, 18S, 5.8S and 28S rDNA') = N: 1-2723; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = 'Parauncinula septata, 18S, 5.8S and 28S rDNA') = N: 1-2723; END; BEGIN TREES; TITLE Tb7122; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Byssoascus_striatosporus, 2 Oidium_phyllanthi_ex_P._acidus, 3 Oidium_phyllanthi_ex_P._amarus, 4 Oidium_phyllanthi_ex_P._reticulatus, 5 Uncinula_septata_MUMH585, 6 Uncinula_septata_MUMH197, 7 Blumeria_graminis_ex_Bromus, 8 Blumeria_graminis_ex_Hordeum, 9 Cystotheca_wrightii, 10 Podosphaera_longiseta, 11 Podosphaera_xanthii, 12 Sawadaea_polyfida, 13 Arthrocladiella_mougeotii, 14 Neoerysiphe_galeopsidis, 15 Golovinomyces_orontii, 16 Pleochaeta_shiraiana, 17 Leveillula_taurica, 18 Phyllactinia_moricola, 19 Typhulochaeta_japonica, 20 Erysiphe_mori, 21 Erysiphe_friesii, 22 Erysiphe_glycines; TREE Fig._8 = [&R] ((((((((((22,21),(20,19))Erysipheae,(4,(3,2))Oidium_subgen._Microidium),14),15),13),((18,17),16)Phyllactineae),(((12,9),(11,10))Cystotheceae,(8,7)Blumerieae)),(6,5)Parauncinula),1); END;