#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 23, 2024; 21:56 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Wang Q., Liu W., Liti G., Wang S., & Bai F. 2012. Saccharomyces cerevisiae occurs in surprisingly diverged populations in natural environments remote from human activity. Molecular Ecology, 21(22): 5404-5417. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S12670] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=138; TAXLABELS Saccharomyces_cerevisiae_273614N Saccharomyces_cerevisiae_322134S Saccharomyces_cerevisiae_378604X Saccharomyces_cerevisiae_BC187 Saccharomyces_cerevisiae_BJ01 Saccharomyces_cerevisiae_BJ02 Saccharomyces_cerevisiae_BJ03 Saccharomyces_cerevisiae_BJ04 Saccharomyces_cerevisiae_BJ05 Saccharomyces_cerevisiae_BJ06 Saccharomyces_cerevisiae_BJ07 Saccharomyces_cerevisiae_BJ08 Saccharomyces_cerevisiae_BJ09 Saccharomyces_cerevisiae_BJ10 Saccharomyces_cerevisiae_BJ12 Saccharomyces_cerevisiae_BJ13 Saccharomyces_cerevisiae_BJ14 Saccharomyces_cerevisiae_BJ15 Saccharomyces_cerevisiae_BJ16 Saccharomyces_cerevisiae_BJ17 Saccharomyces_cerevisiae_BJ18 Saccharomyces_cerevisiae_BJ19 Saccharomyces_cerevisiae_BJ20 Saccharomyces_cerevisiae_BJ21 Saccharomyces_cerevisiae_BJ22 Saccharomyces_cerevisiae_BJ23 Saccharomyces_cerevisiae_BJ24 Saccharomyces_cerevisiae_BJ25 Saccharomyces_cerevisiae_BJ26 Saccharomyces_cerevisiae_BJ27 Saccharomyces_cerevisiae_BJ28 Saccharomyces_cerevisiae_DBVPG1106 Saccharomyces_cerevisiae_DBVPG1373 Saccharomyces_cerevisiae_DBVPG1788 Saccharomyces_cerevisiae_DBVPG1853 Saccharomyces_cerevisiae_DBVPG6040 Saccharomyces_cerevisiae_DBVPG6044 Saccharomyces_cerevisiae_DBVPG6765 Saccharomyces_cerevisiae_FJ01 Saccharomyces_cerevisiae_FJ02 Saccharomyces_cerevisiae_FJ03 Saccharomyces_cerevisiae_FJ04 Saccharomyces_cerevisiae_FJ05 Saccharomyces_cerevisiae_FJ06 Saccharomyces_cerevisiae_FJ07 Saccharomyces_cerevisiae_FJ08 Saccharomyces_cerevisiae_FJ09 Saccharomyces_cerevisiae_FJ10 Saccharomyces_cerevisiae_FJ11 Saccharomyces_cerevisiae_FJ12 Saccharomyces_cerevisiae_HLJ01 Saccharomyces_cerevisiae_HLJ02 Saccharomyces_cerevisiae_HLJ03 Saccharomyces_cerevisiae_HN01 Saccharomyces_cerevisiae_HN02 Saccharomyces_cerevisiae_HN03 Saccharomyces_cerevisiae_HN04 Saccharomyces_cerevisiae_HN05 Saccharomyces_cerevisiae_HN06 Saccharomyces_cerevisiae_HN07 Saccharomyces_cerevisiae_HN08 Saccharomyces_cerevisiae_HN09 Saccharomyces_cerevisiae_HN10 Saccharomyces_cerevisiae_HN11 Saccharomyces_cerevisiae_HN12 Saccharomyces_cerevisiae_HN13 Saccharomyces_cerevisiae_HN14 Saccharomyces_cerevisiae_HN15 Saccharomyces_cerevisiae_HN16 Saccharomyces_cerevisiae_HN17 Saccharomyces_cerevisiae_HN18 Saccharomyces_cerevisiae_HN19 Saccharomyces_cerevisiae_JL01 Saccharomyces_cerevisiae_JL02 Saccharomyces_cerevisiae_JL03 Saccharomyces_cerevisiae_JL04 Saccharomyces_cerevisiae_JL05 Saccharomyces_cerevisiae_K11 Saccharomyces_cerevisiae_L_1374 Saccharomyces_cerevisiae_L_1528 Saccharomyces_cerevisiae_NCYC110 Saccharomyces_cerevisiae_NCYC361 Saccharomyces_cerevisiae_NX01 Saccharomyces_cerevisiae_NX02 Saccharomyces_cerevisiae_NX03 'Saccharomyces cerevisiae REF-cere' Saccharomyces_cerevisiae_RM11_1A Saccharomyces_cerevisiae_S288c Saccharomyces_cerevisiae_SD01 Saccharomyces_cerevisiae_SD02 Saccharomyces_cerevisiae_SD03 Saccharomyces_cerevisiae_SD04 Saccharomyces_cerevisiae_SK1 Saccharomyces_cerevisiae_SX01 Saccharomyces_cerevisiae_SX02 Saccharomyces_cerevisiae_SX03 Saccharomyces_cerevisiae_SX04 Saccharomyces_cerevisiae_SX05 Saccharomyces_cerevisiae_SX06 Saccharomyces_cerevisiae_SX07 Saccharomyces_cerevisiae_SX08 Saccharomyces_cerevisiae_SX09 Saccharomyces_cerevisiae_SX10 Saccharomyces_cerevisiae_SX11 Saccharomyces_cerevisiae_UWOPS03_461_4 Saccharomyces_cerevisiae_UWOPS05_217_3 Saccharomyces_cerevisiae_UWOPS05_227_2 Saccharomyces_cerevisiae_UWOPS83_787_3 Saccharomyces_cerevisiae_UWOPS87_2421 Saccharomyces_cerevisiae_W303 Saccharomyces_cerevisiae_XJ01 Saccharomyces_cerevisiae_XJ02 Saccharomyces_cerevisiae_XJ03 Saccharomyces_cerevisiae_XJ04 Saccharomyces_cerevisiae_XJ05 Saccharomyces_cerevisiae_XJ06 Saccharomyces_cerevisiae_XJ07 Saccharomyces_cerevisiae_Y12 Saccharomyces_cerevisiae_Y55 Saccharomyces_cerevisiae_Y9 Saccharomyces_cerevisiae_YIIc17 Saccharomyces_cerevisiae_YJM789 Saccharomyces_cerevisiae_YJM975 Saccharomyces_cerevisiae_YJM978 Saccharomyces_cerevisiae_YJM981 Saccharomyces_cerevisiae_YN01 Saccharomyces_cerevisiae_YN02 Saccharomyces_cerevisiae_YN03 Saccharomyces_cerevisiae_YN04 Saccharomyces_cerevisiae_YN05 Saccharomyces_cerevisiae_YN06 Saccharomyces_cerevisiae_YPS128 Saccharomyces_cerevisiae_YPS606 Saccharomyces_cerevisiae_YS2 Saccharomyces_cerevisiae_YS4 Saccharomyces_cerevisiae_YS9 Saccharomyces_cerevisiae_ZJ01 Saccharomyces_cerevisiae_ZJ02 ; END; BEGIN CHARACTERS; [! 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Saccharomyces_cerevisiae_322134S 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Saccharomyces_cerevisiae_378604X 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Saccharomyces_cerevisiae_BC187 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Saccharomyces_cerevisiae_BJ01 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Saccharomyces_cerevisiae_BJ02 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Saccharomyces_cerevisiae_BJ03 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Saccharomyces_cerevisiae_BJ04 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Saccharomyces_cerevisiae_BJ05 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Saccharomyces_cerevisiae_BJ06 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Saccharomyces_cerevisiae_BJ07 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Saccharomyces_cerevisiae_BJ08 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Saccharomyces_cerevisiae_BJ09 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Saccharomyces_cerevisiae_BJ10 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Saccharomyces_cerevisiae_BJ12 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Saccharomyces_cerevisiae_BJ13 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Saccharomyces_cerevisiae_BJ14 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Saccharomyces_cerevisiae_BJ15 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Saccharomyces_cerevisiae_BJ16 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Saccharomyces_cerevisiae_BJ17 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Saccharomyces_cerevisiae_BJ18 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Saccharomyces_cerevisiae_BJ19 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Saccharomyces_cerevisiae_BJ20 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Saccharomyces_cerevisiae_BJ21 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Saccharomyces_cerevisiae_BJ22 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Saccharomyces_cerevisiae_BJ23 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Saccharomyces_cerevisiae_BJ24 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Saccharomyces_cerevisiae_BJ25 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Saccharomyces_cerevisiae_BJ26 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Saccharomyces_cerevisiae_BJ27 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Saccharomyces_cerevisiae_BJ28 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Saccharomyces_cerevisiae_DBVPG1106 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Saccharomyces_cerevisiae_DBVPG1373 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Saccharomyces_cerevisiae_DBVPG1788 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Saccharomyces_cerevisiae_DBVPG1853 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Saccharomyces_cerevisiae_DBVPG6040 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Saccharomyces_cerevisiae_DBVPG6044 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Saccharomyces_cerevisiae_DBVPG6765 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Saccharomyces_cerevisiae_FJ01 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Saccharomyces_cerevisiae_FJ02 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Saccharomyces_cerevisiae_FJ03 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Saccharomyces_cerevisiae_FJ04 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Saccharomyces_cerevisiae_FJ05 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Saccharomyces_cerevisiae_FJ06 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Saccharomyces_cerevisiae_FJ07 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Saccharomyces_cerevisiae_FJ08 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Saccharomyces_cerevisiae_FJ09 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Saccharomyces_cerevisiae_FJ10 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Saccharomyces_cerevisiae_FJ11 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Saccharomyces_cerevisiae_FJ12 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Saccharomyces_cerevisiae_HLJ01 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Saccharomyces_cerevisiae_HLJ02 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Saccharomyces_cerevisiae_HLJ03 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Saccharomyces_cerevisiae_HN01 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Saccharomyces_cerevisiae_HN02 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Saccharomyces_cerevisiae_HN03 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Saccharomyces_cerevisiae_HN04 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Saccharomyces_cerevisiae_HN05 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Saccharomyces_cerevisiae_HN06 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Saccharomyces_cerevisiae_HN07 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Saccharomyces_cerevisiae_HN08 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Saccharomyces_cerevisiae_HN09 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Saccharomyces_cerevisiae_HN10 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Saccharomyces_cerevisiae_HN11 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Saccharomyces_cerevisiae_HN12 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Saccharomyces_cerevisiae_HN13 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Saccharomyces_cerevisiae_HN14 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Saccharomyces_cerevisiae_HN15 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Saccharomyces_cerevisiae_HN16 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Saccharomyces_cerevisiae_HN17 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Saccharomyces_cerevisiae_HN18 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Saccharomyces_cerevisiae_HN19 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Saccharomyces_cerevisiae_JL01 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Saccharomyces_cerevisiae_JL02 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Saccharomyces_cerevisiae_JL03 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Saccharomyces_cerevisiae_JL04 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Saccharomyces_cerevisiae_JL05 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Saccharomyces_cerevisiae_K11 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Saccharomyces_cerevisiae_L_1374 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Saccharomyces_cerevisiae_L_1528 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Saccharomyces_cerevisiae_NCYC110 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Saccharomyces_cerevisiae_NCYC361 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Saccharomyces_cerevisiae_NX01 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Saccharomyces_cerevisiae_NX02 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Saccharomyces_cerevisiae_NX03 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'Saccharomyces cerevisiae REF-cere' 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Saccharomyces_cerevisiae_RM11_1A 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Saccharomyces_cerevisiae_S288c 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Saccharomyces_cerevisiae_SD01 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Saccharomyces_cerevisiae_SD02 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Saccharomyces_cerevisiae_SD03 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Saccharomyces_cerevisiae_SD04 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Saccharomyces_cerevisiae_SK1 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Saccharomyces_cerevisiae_SX01 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Saccharomyces_cerevisiae_SX02 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Saccharomyces_cerevisiae_SX03 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Saccharomyces_cerevisiae_SX04 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Saccharomyces_cerevisiae_SX05 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Saccharomyces_cerevisiae_SX06 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Saccharomyces_cerevisiae_SX07 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Saccharomyces_cerevisiae_SX08 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Saccharomyces_cerevisiae_SX09 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Saccharomyces_cerevisiae_SX10 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Saccharomyces_cerevisiae_SX11 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Saccharomyces_cerevisiae_UWOPS03_461_4 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Saccharomyces_cerevisiae_UWOPS05_217_3 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Saccharomyces_cerevisiae_UWOPS05_227_2 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Saccharomyces_cerevisiae_UWOPS83_787_3 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Saccharomyces_cerevisiae_UWOPS87_2421 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Saccharomyces_cerevisiae_W303 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Saccharomyces_cerevisiae_XJ01 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Saccharomyces_cerevisiae_XJ02 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Saccharomyces_cerevisiae_XJ03 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Saccharomyces_cerevisiae_XJ04 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Saccharomyces_cerevisiae_XJ05 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Saccharomyces_cerevisiae_XJ06 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Saccharomyces_cerevisiae_XJ07 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Saccharomyces_cerevisiae_Y12 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Saccharomyces_cerevisiae_Y55 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Saccharomyces_cerevisiae_Y9 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Saccharomyces_cerevisiae_YIIc17 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Saccharomyces_cerevisiae_YJM789 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Saccharomyces_cerevisiae_YJM975 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Saccharomyces_cerevisiae_YJM978 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Saccharomyces_cerevisiae_YJM981 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Saccharomyces_cerevisiae_YN01 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Saccharomyces_cerevisiae_YN02 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Saccharomyces_cerevisiae_YN03 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Saccharomyces_cerevisiae_YN04 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Saccharomyces_cerevisiae_YN05 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Saccharomyces_cerevisiae_YN06 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Saccharomyces_cerevisiae_YPS128 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Saccharomyces_cerevisiae_YPS606 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Saccharomyces_cerevisiae_YS2 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Saccharomyces_cerevisiae_YS4 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Saccharomyces_cerevisiae_YS9 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Saccharomyces_cerevisiae_ZJ01 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Saccharomyces_cerevisiae_ZJ02 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; END; BEGIN TREES; TITLE Saccharomyces_cerevisiae_13_gene_result; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Saccharomyces_cerevisiae_SX02, 2 Saccharomyces_cerevisiae_SX05, 3 Saccharomyces_cerevisiae_SX08, 4 Saccharomyces_cerevisiae_SX03, 5 Saccharomyces_cerevisiae_SX04, 6 Saccharomyces_cerevisiae_SX01, 7 Saccharomyces_cerevisiae_SX06, 8 Saccharomyces_cerevisiae_SX07, 9 Saccharomyces_cerevisiae_YN01, 10 Saccharomyces_cerevisiae_YN05, 11 Saccharomyces_cerevisiae_SD03, 12 Saccharomyces_cerevisiae_XJ01, 13 Saccharomyces_cerevisiae_YN04, 14 Saccharomyces_cerevisiae_SX11, 15 Saccharomyces_cerevisiae_XJ06, 16 Saccharomyces_cerevisiae_JL01, 17 Saccharomyces_cerevisiae_JL03, 18 Saccharomyces_cerevisiae_NX01, 19 Saccharomyces_cerevisiae_NX02, 20 Saccharomyces_cerevisiae_L_1374, 21 Saccharomyces_cerevisiae_L_1528, 22 Saccharomyces_cerevisiae_DBVPG1106, 23 Saccharomyces_cerevisiae_RM11_1A, 24 Saccharomyces_cerevisiae_DBVPG6765, 25 Saccharomyces_cerevisiae_DBVPG1373, 26 Saccharomyces_cerevisiae_DBVPG1788, 27 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