#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 24, 2024; 16:57 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Cohen J.I. 2012. Continuous characters in phylogenetic analyses: Patterns of corolla tube length evolution in Lithospermum L. (Boraginaceae). Biological Journal of the Linnean Society, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S12700] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=42; TAXLABELS Buglossoides_arvense Buglossoides_purpurocaerulea Buglossoides_tenuiflora Glandora_diffusa Glandora_oleifolia Lithospermum_calcicola Lithospermum_californicum Lithospermum_calycosum Lithospermum_canescens Lithospermum_caroliniense Lithospermum_cinereum Lithospermum_cobrense Lithospermum_discolor Lithospermum_distichum Lithospermum_erythrorhizon Lithospermum_exsertum Lithospermum_flavum Lithospermum_gayanum Lithospermum_helleri Lithospermum_johnstonii Lithospermum_latifolium Lithospermum_leonotis Lithospermum_macromeria Lithospermum_matamorense Lithospermum_molle Lithospermum_multiflorum Lithospermum_nelsonii Lithospermum_notatum Lithospermum_oblongifolium Lithospermum_obovatum Lithospermum_officinale Lithospermum_parksii Lithospermum_parksii_X_incisum Lithospermum_revolutum Lithospermum_rosei Lithospermum_ruderale Lithospermum_scabrum Lithospermum_strictum Lithospermum_trinervium Lithospermum_tuberosum Lithospermum_tubuliflorum Lithospermum_viride ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M13127] TITLE Corolla_Tube_Lengths; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=4; FORMAT DATATYPE=Continuous MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20] [ . .] Buglossoides_arvense 4.0 9.0 6.5 9.0 Buglossoides_purpurocaerulea 15.0 19.0 17.0 19.0 Buglossoides_tenuiflora 4.0 9.0 6.5 9.0 Glandora_diffusa 16.0 17.0 16.5 17.0 Glandora_oleifolia 17.0 18.0 17.5 18.0 Lithospermum_calcicola 4.0 5.0 4.5 5.0 Lithospermum_californicum 10.0 15.0 12.5 15.0 Lithospermum_calycosum 6.0 13.0 9.5 13.0 Lithospermum_canescens 7.0 8.0 7.5 8.0 Lithospermum_caroliniense 7.0 12.0 9.5 12.0 Lithospermum_cinereum 2.0 2.0 2.0 2.0 Lithospermum_cobrense 5.0 10.0 7.5 10.0 Lithospermum_discolor 7.0 13.0 10.0 13.0 Lithospermum_distichum 3.0 5.0 4.0 5.0 Lithospermum_erythrorhizon 3.0 4.0 3.5 4.0 Lithospermum_exsertum 47.0 60.0 53.5 47.0 Lithospermum_flavum 28.0 45.0 36.5 28.0 Lithospermum_gayanum 3.0 3.0 3.0 3.0 Lithospermum_helleri 6.0 9.0 7.5 9.0 Lithospermum_johnstonii 35.0 53.0 44.0 35.0 Lithospermum_latifolium 3.0 4.0 4.5 4.0 Lithospermum_leonotis 49.0 75.0 62.0 49.0 Lithospermum_macromeria 47.0 70.0 58.5 47.0 Lithospermum_matamorense 1.0 2.0 1.5 2.0 Lithospermum_molle 7.0 9.0 8.0 9.0 Lithospermum_multiflorum 6.0 13.0 9.5 13.0 Lithospermum_nelsonii 11.0 14.0 12.5 14.0 Lithospermum_notatum 35.0 48.0 41.5 35.0 Lithospermum_oblongifolium 20.0 37.0 28.5 20.0 Lithospermum_obovatum 7.0 13.0 10.0 13.0 Lithospermum_officinale 3.0 4.0 3.5 4.0 Lithospermum_parksii 10.0 15.0 12.5 15.0 Lithospermum_parksii_X_incisum 10.0 15.0 12.5 15.0 Lithospermum_revolutum 7.0 9.0 8.0 9.0 Lithospermum_rosei 12.0 16.0 14.0 16.0 Lithospermum_ruderale 9.0 12.0 10.5 12.0 Lithospermum_scabrum 5.0 6.0 5.5 6.0 Lithospermum_strictum 7.0 12.0 9.5 12.0 Lithospermum_trinervium 11.0 16.0 13.5 16.0 Lithospermum_tuberosum 5.0 6.0 5.5 6.0 Lithospermum_tubuliflorum 8.0 13.0 10.5 13.0 Lithospermum_viride 23.0 32.0 27.5 23.0 ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M13128] TITLE 10_cpDNA_region_sequences; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=10118; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1750 1760 1770 1780 1790 1800 1810 1820 1830 1840 1850 1860 1870 1880 1890 1900 1910 1920 1930 1940 1950 1960 1970 1980 1990 2000 2010 2020 2030 2040 2050 2060 2070 2080 2090 2100 2110 2120 2130 2140 2150 2160 2170 2180 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. . . . . . . . . . . . . . . . . ] Buglossoides_arvense 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Glandora_diffusa 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Lithospermum_californicum 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Lithospermum_caroliniense 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Lithospermum_discolor 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Lithospermum_erythrorhizon 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Lithospermum_gayanum 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Lithospermum_johnstonii 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Lithospermum_latifolium 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Lithospermum_leonotis 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Lithospermum_multiflorum 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Lithospermum_nelsonii 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Lithospermum_notatum 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Lithospermum_oblongifolium 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Lithospermum_obovatum 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Lithospermum_officinale 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Lithospermum_ruderale 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Lithospermum_strictum 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Lithospermum_tubuliflorum 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Lithospermum_viride 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; END; BEGIN TREES; TITLE Result_for_corolla_tube_BAYESTRAIT; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Buglossoides_arvense, 2 Buglossoides_purpurocaerulea, 3 Buglossoides_tenuiflora, 4 Glandora_diffusa, 5 Glandora_oleifolia, 6 Lithospermum_calcicola, 7 Lithospermum_californicum, 8 Lithospermum_calycosum, 9 Lithospermum_canescens, 10 Lithospermum_caroliniense, 11 Lithospermum_cinereum, 12 Lithospermum_cobrense, 13 Lithospermum_discolor, 14 Lithospermum_distichum, 15 Lithospermum_erythrorhizon, 16 Lithospermum_exsertum, 17 Lithospermum_flavum, 18 Lithospermum_gayanum, 19 Lithospermum_helleri, 20 Lithospermum_johnstonii, 21 Lithospermum_latifolium, 22 Lithospermum_leonotis, 23 Lithospermum_macromeria, 24 Lithospermum_matamorense, 25 Lithospermum_molle, 26 Lithospermum_multiflorum, 27 Lithospermum_nelsonii, 28 Lithospermum_notatum, 29 Lithospermum_oblongifolium, 30 Lithospermum_obovatum, 31 Lithospermum_officinale, 32 Lithospermum_parksii, 33 Lithospermum_parksii_X_incisum, 34 Lithospermum_revolutum, 35 Lithospermum_rosei, 36 Lithospermum_ruderale, 37 Lithospermum_scabrum, 38 Lithospermum_strictum, 39 Lithospermum_trinervium, 40 Lithospermum_tuberosum, 41 Lithospermum_tubuliflorum, 42 Lithospermum_viride; TREE Tree_A = [&R] 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