#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 26, 2024; 4:51 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Antonin V., Sedlak P., & Tomsovsky M. 2012. Taxonomy and phylogeny of Gymnopus subsect. Levipedes (Basidiomycota, Omphalotaceae). Persoonia, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S13361] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=37; TAXLABELS Gymnopus_alpinus_G69 Gymnopus_aquosus_G3 Gymnopus_aquosus_G30 Gymnopus_aquosus_G6 Gymnopus_confluens_G60 Gymnopus_dryophilus_AFTOL Gymnopus_dryophilus_G1 Gymnopus_dryophilus_G10 Gymnopus_dryophilus_G11 Gymnopus_dryophilus_G12 Gymnopus_dryophilus_G13 Gymnopus_dryophilus_G31 Gymnopus_dryophilus_G4 Gymnopus_dryophilus_G61 Gymnopus_dryophilus_G8 Gymnopus_dryophilus_G9 Gymnopus_dryophilus_G98 Gymnopus_dryophilus_G99 Gymnopus_erythropus_G14 Gymnopus_erythropus_G15 Gymnopus_erythropus_G18 Gymnopus_erythropus_G2 Gymnopus_fagiphilus__G23 Gymnopus_fagiphilus__G27 Gymnopus_fagiphilus_G19 Gymnopus_fagiphilus_G22 Gymnopus_fagiphilus_G24 Gymnopus_hybridus_G26 Gymnopus_hybridus_G58 Gymnopus_inusitatus_G45 'Gymnopus ocior G1N_' Gymnopus_ocior_G29 'Gymnopus ocior G2N_' 'Gymnopus ocior G3N_' Gymnopus_ocior_G46 Gymnopus_ocior_G47 'Gymnopus ocior G4N_' ; END; BEGIN TAXA; TITLE Taxa2; DIMENSIONS NTAX=73; TAXLABELS Gymnopus_aff._aquosus_DQ450003 Gymnopus_alpinus__DQ480101 Gymnopus_alpinus__DQ480102 Gymnopus_alpinus__DQ480114 Gymnopus_alpinus_G69 Gymnopus_aquosus_AY256691 Gymnopus_aquosus_DQ449976 Gymnopus_aquosus_DQ449977 Gymnopus_aquosus_G3 Gymnopus_aquosus_G30 Gymnopus_aquosus_G36 Gymnopus_aquosus_G37 Gymnopus_aquosus_G6 Gymnopus_aquosus_G63 Gymnopus_confluens_G60 Gymnopus_dryophilus__DQ449966 Gymnopus_dryophilus__DQ480098 Gymnopus_dryophilus_DQ241781 Gymnopus_dryophilus_DQ449963 Gymnopus_dryophilus_DQ449964 Gymnopus_dryophilus_G1 Gymnopus_dryophilus_G10 Gymnopus_dryophilus_G11 Gymnopus_dryophilus_G12 Gymnopus_dryophilus_G13 Gymnopus_dryophilus_G31 Gymnopus_dryophilus_G34 Gymnopus_dryophilus_G38 Gymnopus_dryophilus_G4 Gymnopus_dryophilus_G42 Gymnopus_dryophilus_G43 Gymnopus_dryophilus_G44 Gymnopus_dryophilus_G5 Gymnopus_dryophilus_G61 Gymnopus_dryophilus_G64 Gymnopus_dryophilus_G65 Gymnopus_dryophilus_G66 Gymnopus_dryophilus_G67 Gymnopus_dryophilus_G68 Gymnopus_dryophilus_G8 Gymnopus_dryophilus_G9 Gymnopus_dryophilus_G98 Gymnopus_dryophilus_G99 Gymnopus_erythropus_DQ449996 Gymnopus_erythropus_G14 Gymnopus_erythropus_G15 Gymnopus_erythropus_G18 Gymnopus_erythropus_G2 Gymnopus_erythropus_G39 Gymnopus_erythropus_G40 Gymnopus_fagiphilus__G19 Gymnopus_fagiphilus__G22 Gymnopus_fagiphilus__G23 Gymnopus_fagiphilus__G24 Gymnopus_fagiphilus__G27 Gymnopus_fagiphilus__G41 Gymnopus_hybridus_DQ449980 Gymnopus_hybridus_G26 Gymnopus_hybridus_G58 Gymnopus_hybridus_G59 Gymnopus_inusitatus_G45 Gymnopus_inusitatus_G55B Gymnopus_inusitatus_G56B Gymnopus_inusitatus_G57B Gymnopus_ocior_DQ449956 Gymnopus_ocior_G1n Gymnopus_ocior_G29 Gymnopus_ocior_G2n Gymnopus_ocior_G3n Gymnopus_ocior_G46 Gymnopus_ocior_G47 Gymnopus_ocior_G48 Gymnopus_ocior_G4n ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M14338] TITLE Gymnopus_ITS; LINK TAXA = Taxa2; DIMENSIONS NCHAR=773; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Gymnopus_dryophilus_G98 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Gymnopus_inusitatus_G45 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; END; BEGIN TREES; TITLE Gymnopus_ITS_tefa; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Gymnopus_confluens_G60, 2 Gymnopus_inusitatus_G45, 3 Gymnopus_erythropus_G14, 4 Gymnopus_erythropus_G18, 5 Gymnopus_erythropus_G15, 6 Gymnopus_erythropus_G2, 7 'Gymnopus ocior G1N_', 8 'Gymnopus ocior G2N_', 9 'Gymnopus ocior G3N_', 10 'Gymnopus ocior G4N_', 11 Gymnopus_ocior_G29, 12 Gymnopus_ocior_G46, 13 Gymnopus_ocior_G47, 14 Gymnopus_alpinus_G69, 15 Gymnopus_aquosus_G3, 16 Gymnopus_aquosus_G6, 17 Gymnopus_aquosus_G30, 18 Gymnopus_dryophilus_AFTOL, 19 Gymnopus_dryophilus_G1, 20 Gymnopus_dryophilus_G4, 21 Gymnopus_dryophilus_G8, 22 Gymnopus_dryophilus_G9, 23 Gymnopus_dryophilus_G10, 24 Gymnopus_dryophilus_G61, 25 Gymnopus_dryophilus_G98, 26 Gymnopus_dryophilus_G99, 27 Gymnopus_dryophilus_G11, 28 Gymnopus_dryophilus_G12, 29 Gymnopus_dryophilus_G13, 30 Gymnopus_dryophilus_G31, 31 Gymnopus_hybridus_G58, 32 Gymnopus_hybridus_G26, 33 Gymnopus_fagiphilus_G19, 34 Gymnopus_fagiphilus_G22, 35 Gymnopus_fagiphilus__G23, 36 Gymnopus_fagiphilus_G24, 37 Gymnopus_fagiphilus__G27; TREE 'ITS+tefa2' = [&R] 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