#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 26, 2024; 5:06 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Koch H., & Schmid-hempel P. 2013. Diversity and evolutionary patterns of bacterial gut associates of corbiculate bees. Molecular Ecology, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S13472] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=72; TAXLABELS Acetobacter_pasteuria_AB499842 Acetobacter_peroxydans_AJ419836 Acetobacter_pomorum_EU096229 Acetobacteraceae_sp._ex._Caupolicana_HM109591 Acetobacteriaceae_sp._ex._Apis_dorsata_HM108484 Aerococcus_sp._ex._Culex_sp_JN644571 Aerococcus_urinaeequi_AB680259 Aerococcus_viridans_HQ425688 Alpha_proteobacterium_ex._Apis_mellifera_AJ971850 Alpha_proteobacterium_sp._ex._Dactylopius_GQ853368 Alpha_proteobacterium_sp._ex._flower_AB513363 Candidatus_Hepatincola_porcellionum_AY189806 Firmicutes_sp._ex._Bombus_terrestris_HM215048 Gluconobacter_frateuria_AB678443 Gluconobacter_morbifer_EU096234 Gluconobacter_oxydans_EU034639 Klebsiella_oxytoca_AB682268 Lactobacillus_acidophilus_AY773947 Lactobacillus_kefiri_AB429371 Lactobacillus_kunkeei_Y11374 Lactobacillus_lindneri_X95421 Lactobacillus_sakei_GU125609 Lactobacillus_sp._ex._Apis_cerana_HM046576 Lactobacillus_sp._ex._Apis_cerana_HM534779 Lactobacillus_sp._ex._Apis_florea_HM534811 Lactobacillus_sp._ex._Apis_koschevnikovi_HM534764 Lactobacillus_sp._ex._Apis_mellifera_AY370183 Lactobacillus_sp._ex._Apis_mellifera_EF187244 Lactobacillus_sp._ex._Apis_mellifera_EF187245 Lactobacillus_sp._ex._Apis_mellifera_HM112107 Lactobacillus_sp._ex._Apis_mellifera_HM113169 Lactobacillus_sp._ex._Melipona_beecheii_HM534760 Lactobacillus_sp._ex._Melipona_beecheii_HM534763 Lactobacillus_sp._ex._Melipona_beecheii_HM534806 Lactobacillus_sp._ex._Meliponula_bocanandei_HM534762 Lactobacillus_sp._ex._Meliponula_bocandei_HM534813 Lactobacillus_sp._ex._Trigona_sp_HM534761 Lactobacillus_sp._ex._Trigona_sp_HM534814 Lactobacillus_tucceti_NR042194 Leuconostoc_citreum_AB362721 Leuconostoc_pseudomesenteroides_AB326299 Rickettsia_bellii_U11014 Saccharibacter_floricola_NR024819 Sinorhizobium_meliloti_FJ025127 Streptococcus_equinus_AB680295 Streptococcus_sp._ex._human_AM157443 Streptococcus_suis_AF009487 Uncultured_Acetobacteraceae_bacterium_B10.042B9 Uncultured_bacterium_Bacterium_ex._Diadasia_HM112629 Uncultured_bacterium_ex._Apis_mellifera_DQ837625 Unculured_bacterium_ex._Daphnia_magna_JN392909 Yokenella_regensburgei_AB681877 uncultrured_bacterium_ex._Euglossa_imperialis_B10.023_A4 uncultured_bacterium_ex._Anchovi_DQ860016 uncultured_bacterium_ex._Anopheles_EF179826 uncultured_bacterium_ex._Apis_mellifera_EF187239 uncultured_bacterium_ex._Eufrisea_sp_B10.050_A10 uncultured_bacterium_ex._Euglossa_imperialis_B10.022_A3 uncultured_bacterium_ex._Euglossa_imperialis_B10.022_C1 uncultured_bacterium_ex._Eulae_sp_B10.049_A7 uncultured_bacterium_ex._Eulaema_sp_B10.049_A8 uncultured_bacterium_ex._Melipona_panamica_B10.042 uncultured_bacterium_ex._Melipona_panamica_B10.042_F9 uncultured_bacterium_ex._Melipona_panamica_B10.043 uncultured_bacterium_ex._Melipona_panamica_B10.043_A1 uncultured_bacterium_ex._Melipona_panamica_B10.043_B uncultured_bacterium_ex._Melipona_panamica_B10.043_D3 uncultured_bacterium_ex._Meliponula_bocandei_B10.046 uncultured_bacterium_ex._Meliponula_bocandei_B10.046_A4 uncultured_bacterium_ex._Meliponula_bocandei_B10.046_D5 uncultured_bacterium_ex._Meliponula_bocandei_B10.047_A7 uncultured_bacterium_ex._Myrmeleon_DQ068792 ; END; BEGIN TAXA; TITLE Taxa2; DIMENSIONS NTAX=151; TAXLABELS Snodgrassella_acetivorans_ex._Termite_EF212916 Snodgrassella_sp._ex._Alpinobombus_balteatus_08Se079 Snodgrassella_sp._ex._Alpinobombus_balteatus_08Sf048 Snodgrassella_sp._ex._Apis_cerana_I10.050 Snodgrassella_sp._ex._Apis_cerana_I10.051 Snodgrassella_sp._ex._Apis_cerana_I10.052 Snodgrassella_sp._ex._Apis_cerana_I10.053 Snodgrassella_sp._ex._Apis_dorsata_I10.058 Snodgrassella_sp._ex._Apis_dorsata_I10.059 Snodgrassella_sp._ex._Apis_dorsata_I10.060 Snodgrassella_sp._ex._Apis_dorsata_Malaysia_HM108492 Snodgrassella_sp._ex._Apis_mellifera_CH_DQ837617 Snodgrassella_sp._ex._Apis_mellifera_CH_DQ837618 Snodgrassella_sp._ex._Apis_mellifera_CH_DQ837620 Snodgrassella_sp._ex._Apis_mellifera_CH_DQ837621 Snodgrassella_sp._ex._Apis_mellifera_I10.043 Snodgrassella_sp._ex._Apis_mellifera_I10.044 Snodgrassella_sp._ex._Apis_mellifera_I10.045 Snodgrassella_sp._ex._Apis_mellifera_I10.046 Snodgrassella_sp._ex._Apis_mellifera_I10.047 Snodgrassella_sp._ex._Apis_mellifera_RSA_AY370189 Snodgrassella_sp._ex._Apis_mellifera_Thailand_HM008720 Snodgrassella_sp._ex._Apis_mellifera_USA_HM112094 Snodgrassella_sp._ex._Apis_mellifera_USA_HM113226 Snodgrassella_sp._ex._Bombus_lucorum_AR.443 Snodgrassella_sp._ex._Bombus_lucorum_BJ08.238 Snodgrassella_sp._ex._Bombus_patagiatus_AR.450 Snodgrassella_sp._ex._Bombus_patagiatus_AR.451 Snodgrassella_sp._ex._Bombus_sporadicus_08Sf084 Snodgrassella_sp._ex._Bombus_terrestris_09.013Q1 Snodgrassella_sp._ex._Bombus_terrestris_09.013Q2 Snodgrassella_sp._ex._Bombus_terrestris_09.013Q3 Snodgrassella_sp._ex._Bombus_terrestris_09.013Q4 Snodgrassella_sp._ex._Bombus_terrestris_09.018Q1 Snodgrassella_sp._ex._Bombus_terrestris_09.018Q1x Snodgrassella_sp._ex._Bombus_terrestris_09.018Q2 Snodgrassella_sp._ex._Bombus_terrestris_09.018Q3 Snodgrassella_sp._ex._Bombus_terrestris_09.018Q4 Snodgrassella_sp._ex._Bombus_terrestris_09.018Q5 Snodgrassella_sp._ex._Bombus_terrestris_09.018Q7 Snodgrassella_sp._ex._Bombus_terrestris_09.225Q1 Snodgrassella_sp._ex._Bombus_terrestris_09.225Q2 Snodgrassella_sp._ex._Bombus_terrestris_09.350Q1 Snodgrassella_sp._ex._Bombus_terrestris_09.350Q2 Snodgrassella_sp._ex._Bombus_terrestris_B10.055 Snodgrassella_sp._ex._Bombus_terrestris_B10.056 Snodgrassella_sp._ex._Bombus_terrestris_BJ08.026 Snodgrassella_sp._ex._Bombus_terrestris_CH_HM215010 Snodgrassella_sp._ex._Bombus_terrestris_CH_HM215021 Snodgrassella_sp._ex._Bombus_terrestris_D_HM215018 Snodgrassella_sp._ex._Bombus_terrestris_D_HM215019 Snodgrassella_sp._ex._Bombus_terrestris_D_HM215020 Snodgrassella_sp._ex._Bombus_terrestris_D_HM215022 Snodgrassella_sp._ex._Bombus_tunicatus_I08.059 Snodgrassella_sp._ex._Bombus_tunicatus_I08.104 Snodgrassella_sp._ex._Bombus_tunicatus_I10.023 Snodgrassella_sp._ex._Bombus_tunicatus_I10.029 Snodgrassella_sp._ex._Bombus_tunicatus_I10.030 Snodgrassella_sp._ex._Bombus_tunicatus_I10.031 Snodgrassella_sp._ex._Bombus_tunicatus_I10.032 Snodgrassella_sp._ex._Kallobombus_soroeensis_08Sc011 Snodgrassella_sp._ex._Kallobombus_soroeensis_08Sc012 Snodgrassella_sp._ex._Kallobombus_soroeensis_08Sc016 Snodgrassella_sp._ex._Megabombus_hortorum_BJ08.196 Snodgrassella_sp._ex._Megabombus_hortorum_CH_HM215017 Snodgrassella_sp._ex._Melanobombus_festivus_YX.222 Snodgrassella_sp._ex._Melanobombus_festivus_YX.223 Snodgrassella_sp._ex._Melanobombus_friseanus_CHN89 Snodgrassella_sp._ex._Melanobombus_friseanus_CHN90 Snodgrassella_sp._ex._Melanobombus_friseanus_YX.242 Snodgrassella_sp._ex._Melanobombus_friseanus_YX.244 Snodgrassella_sp._ex._Melanobombus_friseanus_YX.246 Snodgrassella_sp._ex._Melanobombus_friseanus_YX.247 Snodgrassella_sp._ex._Melanobombus_lapidarius_BJ07.172 Snodgrassella_sp._ex._Melanobombus_lapidarius_BJ07.290 Snodgrassella_sp._ex._Melanobombus_lapidarius_BJ08.007 Snodgrassella_sp._ex._Melanobombus_lapidarius_BJ08.021 Snodgrassella_sp._ex._Melanobombus_lapidarius_CH_HM215011 Snodgrassella_sp._ex._Melanobombus_lapidarius_D_HM215016 Snodgrassella_sp._ex._Melanobombus_lapidarius_EN88 Snodgrassella_sp._ex._Melanobombus_rufofasciatus_TZ.411 Snodgrassella_sp._ex._Melanobombus_rufofasciatus_TZ.412 Snodgrassella_sp._ex._Mendacibombus_defector_KY08.003 Snodgrassella_sp._ex._Mendacibombus_defector_KY08.007 Snodgrassella_sp._ex._Mendacibombus_defector_KY08.046 Snodgrassella_sp._ex._Mendacibombus_defector_KY08.210 Snodgrassella_sp._ex._Mendacibombus_defector_KY08.211 Snodgrassella_sp._ex._Mendacibombus_defector_KY08.246 Snodgrassella_sp._ex._Orientalibombus_haemorrhoidalis_I08.024 Snodgrassella_sp._ex._Orientalibombus_haemorrhoidalis_I08.030 Snodgrassella_sp._ex._Orientalibombus_haemorrhoidalis_I08.040 Snodgrassella_sp._ex._Orientalibombus_haemorrhoidalis_I10.002 Snodgrassella_sp._ex._Orientalibombus_haemorrhoidalis_I10.003 Snodgrassella_sp._ex._Orientalibombus_haemorrhoidalis_I10.004 Snodgrassella_sp._ex._Orientalibombus_haemorrhoidalis_I10.009 Snodgrassella_sp._ex._Orientalibombus_haemorrhoidalis_I10.010 Snodgrassella_sp._ex._Psithyrus_barbutellus_BJ08.320 Snodgrassella_sp._ex._Psithyrus_bohemicus_BJ08.075 Snodgrassella_sp._ex._Psithyrus_campestris_BJ08.147 Snodgrassella_sp._ex._Psithyrus_campestris_KY08.242 Snodgrassella_sp._ex._Psithyrus_campestris_KY08.252 Snodgrassella_sp._ex._Pyrobombus_flavescens_YX.238 Snodgrassella_sp._ex._Pyrobombus_flavescens_YX.239 Snodgrassella_sp._ex._Pyrobombus_flavescens_YX.240 Snodgrassella_sp._ex._Pyrobombus_flavifrons_U08.618 Snodgrassella_sp._ex._Pyrobombus_hypnorum_BJ08.245 Snodgrassella_sp._ex._Pyrobombus_hypnorum_BJ08.268 Snodgrassella_sp._ex._Pyrobombus_impatiens_HM108516 Snodgrassella_sp._ex._Pyrobombus_jonellus_08Sf050 Snodgrassella_sp._ex._Pyrobombus_jonellus_08Sf052 Snodgrassella_sp._ex._Pyrobombus_jonellus_08Sf053 Snodgrassella_sp._ex._Pyrobombus_jonellus_AK08.288 Snodgrassella_sp._ex._Pyrobombus_jonellus_AK08.299 Snodgrassella_sp._ex._Pyrobombus_melanopygus_U08.253 Snodgrassella_sp._ex._Pyrobombus_melanopygus_U08.350 Snodgrassella_sp._ex._Pyrobombus_mixtus_AK08.423 Snodgrassella_sp._ex._Pyrobombus_mixtus_AK08.589 Snodgrassella_sp._ex._Pyrobombus_mixtus_AK08.590 Snodgrassella_sp._ex._Pyrobombus_mixtus_U08.750 Snodgrassella_sp._ex._Pyrobombus_mixtus_U08.751 Snodgrassella_sp._ex._Pyrobombus_mixtus_U08.850 Snodgrassella_sp._ex._Pyrobombus_vandykei_U08.117 Snodgrassella_sp._ex._Pyrobombus_vosnesenskii_U08.100 Snodgrassella_sp._ex._Sibiricobombus_asiaticus_KY08.134 Snodgrassella_sp._ex._Subterraneobombus_appositus_U08.609 Snodgrassella_sp._ex._Subterraneobombus_appositus_U08.610 Snodgrassella_sp._ex._Subterraneobombus_melanurus_I10.018 Snodgrassella_sp._ex._Subterraneobombus_melanurus_KY08.025 Snodgrassella_sp._ex._Subterraneobombus_melanurus_KY08.030 Snodgrassella_sp._ex._Subterraneobombus_melanurus_KY08.038 Snodgrassella_sp._ex._Thoracobombus_californicus_U08.358 Snodgrassella_sp._ex._Thoracobombus_californicus_U08.600 Snodgrassella_sp._ex._Thoracobombus_californicus_U08.602 Snodgrassella_sp._ex._Thoracobombus_californicus_U08.605 Snodgrassella_sp._ex._Thoracobombus_californicus_U08.764 Snodgrassella_sp._ex._Thoracobombus_californicus_U08.766 Snodgrassella_sp._ex._Thoracobombus_californicus_U08.961 Snodgrassella_sp._ex._Thoracobombus_impetuosus_MG.001 Snodgrassella_sp._ex._Thoracobombus_impetuosus_MG.002 Snodgrassella_sp._ex._Thoracobombus_impetuosus_MG.003 Snodgrassella_sp._ex._Thoracobombus_mesomelas_11.001 Snodgrassella_sp._ex._Thoracobombus_mesomelas_11.002 Snodgrassella_sp._ex._Thoracobombus_pascuorum_11.005 Snodgrassella_sp._ex._Thoracobombus_pascuorum_11.006 Snodgrassella_sp._ex._Thoracobombus_pascuorum_11.007 Snodgrassella_sp._ex._Thoracobombus_pascuorum_CH_HM215013 Snodgrassella_sp._ex._Thoracobombus_pascuorum_D_HM215012 Snodgrassella_sp._ex._Thoracobombus_pascuorum_D_HM215014 Snodgrassella_sp._ex._Thoracobombus_pascuorum_D_HM215015 Snodgrassella_sp._ex._Thoracobombus_remotus_CHN322 Snodgrassella_sp._ex._Thoracobombus_sonorus_HM108734 ; END; BEGIN TAXA; TITLE Taxa3; DIMENSIONS NTAX=171; TAXLABELS Edwardsiella_hoshinae_AB05082 Gammaproteobacterium_sp._ex.__Cinara_sp_FJ655514 Gammaproteobacterium_sp._ex.__Pyrobombus_mixtus_U08.178 Gammaproteobacterium_sp._ex.__Pyrobombus_vosnesenskii_U08.026 Gammaproteobacterium_sp._ex.__Pyrobombus_vosnesenskii_U08.212 Gammaproteobacterium_sp._ex.__Pyrobombus_vosnesenskii_U08.305 Gammaproteobacterium_sp._ex.__Pyrobombus_vosnesenskii_U08.555 Gammaproteobacterium_sp._ex.__Stomaphis_quercus_FJ655516 Gammaproteobacterium_sp._ex._Apis_mellifera_CH_DQ837610 Gammaproteobacterium_sp._ex._Apis_mellifera_CH_DQ837611 Gammaproteobacterium_sp._ex._Apis_mellifera_Sw_EF187250 Gammaproteobacterium_sp._ex._Bombus_terrestris_D_HM215025 Gammaproteobacterium_sp._ex._Megabombus_trifasciatus_I10.016 Gammaproteobacterium_sp._ex._Ploceus_chalcites_EF608532 Gammaproteobacterium_sp._ex._Psithyrus_campestris_BJ08.147 Gammaproteobacterium_sp._ex._Psithyrus_campestris_KY08.242 Gammaproteobacterium_sp._ex._Psithyrus_sp_B10.018 Gammaproteobacterium_sp._ex._Pyrobombus_bifarius_U08.252 Gammaproteobacterium_sp._ex._Pyrobombus_flavescens_YX.238 Gammaproteobacterium_sp._ex._Pyrobombus_flavescens_YX.239 Gammaproteobacterium_sp._ex._Pyrobombus_flavescens_YX.240 Gammaproteobacterium_sp._ex._Pyrobombus_flavifrons_U08.657 Gammaproteobacterium_sp._ex._Pyrobombus_flavifrons_U08.659 Gammaproteobacterium_sp._ex._Pyrobombus_melanopyus_U08.157 Gammaproteobacterium_sp._ex._Pyrobombus_vandykei_U08.137 Gilliamella_sp._ex.__Melanobombus_lapidarius_CH_HM215033 Gilliamella_sp._ex._Alpinobombus_balteatus_08Sf048 Gilliamella_sp._ex._Apis_cerana_I10.050 Gilliamella_sp._ex._Apis_cerana_I10.051 Gilliamella_sp._ex._Apis_cerana_J_JP_AB480768 Gilliamella_sp._ex._Apis_cerana_Thailand_HM046573 Gilliamella_sp._ex._Apis_dorsata_I10.058 Gilliamella_sp._ex._Apis_dorsata_I10.060 Gilliamella_sp._ex._Apis_dorsata_I10.061 Gilliamella_sp._ex._Apis_dorsata_Malaysia_HM108449 Gilliamella_sp._ex._Apis_mellifera_CH_DQ837603 Gilliamella_sp._ex._Apis_mellifera_CH_DQ837608 Gilliamella_sp._ex._Apis_mellifera_I10.043 Gilliamella_sp._ex._Apis_mellifera_I10.044 Gilliamella_sp._ex._Apis_mellifera_I10.045 Gilliamella_sp._ex._Apis_mellifera_I10.047 Gilliamella_sp._ex._Apis_mellifera_RSA_AY370192 Gilliamella_sp._ex._Apis_mellifera_Sw_EF187248 Gilliamella_sp._ex._Apis_mellifera_Sw_EF187249 Gilliamella_sp._ex._Apis_mellifera_Thailand_HM008718 Gilliamella_sp._ex._Apis_mellifera_USA_HM112050 Gilliamella_sp._ex._Apis_mellifera_USA_HM112068 Gilliamella_sp._ex._Apis_mellifera_USA_HM113304 Gilliamella_sp._ex._Bombus_lucorum_AR.443 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Gilliamella_sp._ex._Bombus_terrestris_B10.055 Gilliamella_sp._ex._Bombus_terrestris_B10.056 Gilliamella_sp._ex._Bombus_terrestris_BJ08.011 Gilliamella_sp._ex._Bombus_terrestris_BJ08.026 Gilliamella_sp._ex._Bombus_terrestris_BJ08.033 Gilliamella_sp._ex._Bombus_terrestris_CH_HM215029 Gilliamella_sp._ex._Bombus_terrestris_D_HM215032 Gilliamella_sp._ex._Bombus_terrestris_D_HM215035 Gilliamella_sp._ex._Bombus_tunicatus_I08.059 Gilliamella_sp._ex._Bombus_tunicatus_I08.104 Gilliamella_sp._ex._Bombus_tunicatus_I08.155 Gilliamella_sp._ex._Bombus_tunicatus_I10.029 Gilliamella_sp._ex._Bombus_tunicatus_I10.030 Gilliamella_sp._ex._Bombus_tunicatus_I10.031 Gilliamella_sp._ex._Bombus_tunicatus_I10.032 Gilliamella_sp._ex._Culumanobombus_griseocollis_U08.616 Gilliamella_sp._ex._Kallobombus_soroeensis_08Sc011 Gilliamella_sp._ex._Kallobombus_soroeensis_08Sc012 Gilliamella_sp._ex._Kallobombus_soroeensis_08Sc015 Gilliamella_sp._ex._Kallobombus_soroeensis_08Sc016 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Snodgrassella_sp._ex._Thoracobombus_impetuosus_MG.003 TGGTGGCGAGTGGCGAACGGGTGAGTAATGCATCGGAACGTACCGAGTAATGGGGGATAACTGTCCGAAAGGATGGCTAATACCGCATACGCCCTGAGGGGGAAAGCGGGGGAT-CTAAG-GACCTCGCGTTATTTGAGCGGCCGATGTTGGATTAGCTAGTTGGTGGGGTAAAGGCCTACCAAGGCGACGATCCATAGCGGGTCTGAGAGGATGATCCGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAACTC-CTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATTTTGGACAATGGGGGGAACCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGTCTGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGGACTTTTGTTAGGGAAGAAAAGCTGGGTGCTAATACCATCTAGTGCTGACGGTACCTAAAGAATAAGCACCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGTGCGAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGAGCGCAGACGGTTAAATAAGTCAGATGTGAAATCCCCGAGCTCAACTTGGGACGTGCATTTGAAACTGTGTAACTAGAGTGTGTCAGAGGG-AGGTAGAATTCCACGTGTAGCAGTGAAATGCGTAGAGATGTGGAGGAATACCGATGGCGAA-GGCAGCCTCCTGGGATAACACTGACGTTCATGC-TCGAAAGCGTGGG-TAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCCTAAACGATGACAATTAGCTGTTGGGGTACTAGATGCCTTAGTAGCGAAGCTAACGCGTGAAATTGTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGACCCGCACAAGCGGTGGATGATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATGTACGGAATCTCTTAGAGATAGGAGAGTGCCTTCGGGA{AG}CCGTAACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTCATTAGTTGCCATCATTAAGTTGGGCACTCTAATGAGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTATGACCAGGGCTTCACACGTCATACAATGGTCGGTACAGAGGGTAGCGAAGCCGCGAGGTGAAGCCAATCTCAGAAAGCCGATCGTAGTCCGGATTGCACTCTGCAACTCGAGTGCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCAGGTCAGCATACTGCGGTGAATACGTTCCCGGGTCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGGGATACCAG???????????????????????? Snodgrassella_sp._ex._Thoracobombus_mesomelas_11.001 ????????????????????????????????????????????????????????????????????AAGGATGGCTAATACCGCATACGCCCTGAGGGGGAAAGCGGGGGAT-CTTAT-GACCTCGCGTTATTTGAGCGGCCGATGTTGGATTAGCTAGTTGGTGGGGTAAAGGCCTACCAAGGCGACGATCCATAGCGGGTCTGAGAGGATGATCCGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAACTC-CTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATTTTGGACAATGGGGGAAACCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGTCTGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGGACTTTTGTTAGGGAAGAAAAGCTGGGTGCTAATACCATCTAGTGCTGACGGTACCTAAAGAATAAGCACCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGTGCGAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGAGCGCAGACGGTTAAATAAGTCAGATGTGAAATCCCCGAGCTCAACTTGGGACGTGCATTTGAAACTGTATGACTAGAGTGTGTCAGAGGG-AGGTAGAATTCCACGTGTAGCAGTGAAATGCGTAGAGATGTGGAGGAATACCGATGGCGAA-GGCAGCCTCCTGGGATAACACTGACGTTCATGC-TCGAAAGCGTGGG-TAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCCTAAACGATGACAATTAGCTGTTGGGGTACTAGATGCCTTAGTAGCGAAGCTAACGCGTGAAATTGTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGACCCGCACAAGCGGTGGATGATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATGTACGGAATCTCTTAGAGATAGGAGAGTGCCTTCGGGAACCGTAACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTCATTAGTTGCCATCATTAAGTTGGGCACTCTAATGAGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTATGACCAGGGCTTCACACGTCATACAATGGTCGGTACAGAGGGTAGCGAAGCCGCGAGGTGAAGCCAATCTCAGAAAGCCGATCGTAGTCCGGATTGCACTCTGCAACTCGAGTGCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCAGGTCAGCATACTGCGGTGAATACGTTCCCGGGTCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGGGATACCAGAATTG??????????????????? Snodgrassella_sp._ex._Thoracobombus_mesomelas_11.002 ????????????????????????????????????????????????????????????????????AAGGATGGCTAATACCGCATACGCCCTGAGGGGGAAAGCGGGGGAT-CTTAT-GACCTCGCGTTATTTGAGCGGCCGATGTTGGATTAGCTAGTTGGTGGGGTAAAGGCCTACCAAGGCGACGATCCATAGCGGGTCTGAGAGGATGATCCGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAACTC-CTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATTTTGGACAATGGGGGAAACCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGTCTGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGGACTTTTGTTAGGGAAGAAAAGCTGGGTGCTAATACCACCTAGTGCTGACGGTACCTAAAGAATAAGCACCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGTGCGAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGAGCGCAGACGGTTAAATAAGTCAGATGTGAAATCCCCGAGCTCAACTTGGGACGTGCATTTGAAACTGTATGACTAGAGTGTGTCAGAGGG-AGGTAGAATTCCACGTGTAGCAGTGAAATGCGTAGAGATGTGGAGGAATACCGATGGCGAA-GGCAGCCTCCTGGGATAACACTGACGTTCATGC-TCGAAAGCGTGGG-TAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCCTAAACGATGACAATTAGCTGTTGGGGTACTAGATGCCTTAGTAGCGAAGCTAACGCGTGAAATTGTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGACCCGCACAAGCGGTGGATGATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATGTACGGAATCTCTTAGAGATAGGAGAGTGCCTTCGGGAACCGTAACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTCATTAGTTGCCATCATTAAGTTGGGCACTCTAATGAGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTATGACCAGGGCTTCACACGTCATACAATGGTCGGTACAGAGGGTAGCGAAGCCGCGAGGTGAAGCCAATCTCAGAAAGCCGATCGTAGTCCGGATTGCACTCTGCAACTCGAGTGCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCAGGTCAGCATACTGCGGTGAATACGTTCCCGGGTCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGGGATACCAGAATTGG?????????????????? 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Klebsiella_oxytoca_AB682268 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??????????????????????????????ATACCGCATAAAGTTGAGAGACCAAAGTACGGTTCCGCAAGGACGTGCGCCATTTGATGAACCCATATGGGATTAGCTAGTTGGTGTGGTAAAGGCTCACCAAGGCGACGATCTCTAGCTGGTCTGAGAGGATGACCAGCCACACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGGGGAACCCTGATGCAGCCATGCCGCGTGTATGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGTACTTTCGGTAGTGAGGAAGTTGTGTGTATGAAAAGTGCAT-GCAGTTGACGTTAGCTACAGAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCGAGCGTTAATCGGAATGACTGGGCGTAAAGGGCATGTAGGCGGATAATTAAGTTAGGTGTGAAAGCCCCGGGCTCAACCTGGGAATTGCACTTAAAACTGGTTATCTGGAGTATTGTAGAGGAA-GGTAGAATT-CCACGTGTAGCGG-TGAAATGCGTAGAGATGTGGAGGAATACCGG-TGGCGAAGGCGG-CCTTCTGGACAGATACTGACGCTGAGATGCGAAAGCGTGGGG-AGCAAACAGG-ATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCTGTAAACGATGTCGATTT-GGAGTTTGTTGCCCTGAGTGATGGGCTCCGAAGCTAACGCGATAAATCGACCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTAAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACAGAATCTGGCAGAGATGCTGGAGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCCTTTGTTGCCATCGATTAG-GTCGGGAACTCAAAGGAGACTGCCGTTGATAAAGCGGAGGAAGGTGGGGACGACGTCAAGTCATCATGGCCCTTACGACCAGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGTATACAAAGGGAGGCGACCTCGCGAGAGCAAGCGGACCTCAGAAAGTACGTCTAAGTCCGGATTGGAGTCTGCAACTCGACTCCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGTGAATCAGAATGTCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCG??????????????????? Gilliamella_sp._ex._Apis_cerana_I10.051 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Gilliamella_sp._ex._Melanobombus_lapidarius_EN88 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Gilliamella_sp._ex._Melanobombus_rufofasciatus_TZ.413 GAAGGGGACAACAGTTGGAAACGACTGCTAATACCGTATAATGTCGCGAGACCAAAGCATGGGACTTTCGGGCCATGCGCCATTTGATGAACCCATATGGGATTAGCTAGTAGGTGGGGTAAAGGCTCACCTAGGCGACGATCTCTAGCTGGTCTGAGAGGATGACCAGCCACACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGGGGAACCCTGATGCAGCCATGCCGCGTGTATGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGTACTTTCGGTGATGAGGAAGGCGGTGTATCTAATAGGTGCA-TCGATTGACGTTAATCACAGAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCGAGCGTTAATCGGAATGACTGGGCGTAAAGGGCATGTAGGCGGATAATTAAGTTAGGTGTGAAAGCCCTGGGCTCAACCTAGGAATTGCATTTAAAACTGGTTATCTGGAGTATTGTAGAGGAA-GGTAGAATT-CCACGTGTAGCGG-TGAAATGCGTAGAGATGTGGAGGAATACCGG-TGGCGAAGGCGG-CCTTCTGGACAGATACTGACGCTGAGATGCGAAAGCGTGGGG-AGCAAACAGG-ATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCTGTAAACGATGTCGATTT-GGAGTTTGTTGCCTAGAGTGATGGGCTCCGAAGCTAACGCGATAAATCGACCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTAAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACAGAATCTTGTAGAGATACGAGAGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCCTTTGTTGCCATCGATTCG-GTCGGGAACTCAAAGGAGACTGCCGTTGATAAAGCGGAGGAAGGTGGGGACGACGTCAAGTCATCATGGCCCTTACGACCAGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGTATACAAAGGGAGGCGACCTCGCGAGAGCAAGCGGACCTCATAAAGTACGTCTAAGTCCGGATTGGAGTCTGCAACTCGACTCCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGTGAATCAGAATGTCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGAGAGTGGGT 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Gilliamella_sp._ex._Orientalibombus_haemorrhoidalis_I10.005 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Gilliamella_sp._ex._Psithyrus_fernaldae_AK08.212 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Gilliamella_sp._ex._Subterraneobombus_appositus_U08.609 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Haemophilus_paraphropha_M75076 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Orbus_hercynius_FJ612598 GAAGGGGACAACAGTTGGAAACGACTGCTAATACCGTATAATGTCGCAAGACCAAAGAGTGGGACCTTCGGGCCACTTGCCATTTGATGAACCCATATGGGATTAGCTAGTAGGTGTGGTAAAGGCGCACCTAGGCGACGATCTCTAGCTGGTCTGAGAGGATGACCAGCCACACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGGGAAACCCTGATGCAGCCATGCCGCGTGTATGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGTACTTTCGGTGATGAGGAAGGTATTGGGTCTAATAGGCCTA-ATAATTGACGTTAATTACAGAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCGAGCGTTAATCGGAATGACTGGGCGTAAAGGGCATGTAGGTGGATGATTAAGTTAGGTGTGAAAGCCCCGAGCTCAACTTGGGAATTGCACTTAAAACTGGTCGTCTAGAGTATTGTAGAGGAA-GGTAGAATT-CCACGTGTAGCGG-TGAAATGCGTAGAGATGTGGAGGAATACCGG-TGGCGAAGGCGG-CCTTCTGGACAAATACTGACGCTGAGATGCGAAAGCGTGGGG-AGCAAACAGG-ATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCTGTAAACGATGTCGATAT-GGAGTGTGGGGGCATGACCCTTGGGCTCCGGAGCTAACGCGTTAAATCGACCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAAGTTAAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCATAGAATCTTGCAGAGATGCGAGAGTGCCTTCGGGAGCTATGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCTATCCTTTGTTGCCAGCACGTAATGGTGGGAACTCAAAGGAGACTGCCGTTGATAAAGCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCATCATGGCCCTTACGACCAGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGTATACAAAGGGATGCGAAGGTGCGAACTGGAGCGGACCTCACAAAGTACGTCTAAGTCCGGATTGGAGTCTGCAACTCGACTCCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGTGAATCAGAATGTCACGGTGAATACGTACCCGGGCCTTGTACACACCGCACGTCACACCATGGGAGTAGGT ; END; BEGIN TREES; TITLE Snodgrassella_Bombus_Apis; LINK TAXA = Taxa2; TRANSLATE 1 Snodgrassella_sp._ex._Apis_mellifera_RSA_AY370189, 2 Snodgrassella_sp._ex._Apis_mellifera_CH_DQ837617, 3 Snodgrassella_sp._ex._Apis_mellifera_CH_DQ837618, 4 Snodgrassella_sp._ex._Apis_mellifera_CH_DQ837620, 5 Snodgrassella_sp._ex._Apis_mellifera_CH_DQ837621, 6 Snodgrassella_acetivorans_ex._Termite_EF212916, 7 Snodgrassella_sp._ex._Apis_mellifera_Thailand_HM008720, 8 Snodgrassella_sp._ex._Apis_dorsata_Malaysia_HM108492, 9 Snodgrassella_sp._ex._Pyrobombus_impatiens_HM108516, 10 Snodgrassella_sp._ex._Thoracobombus_sonorus_HM108734, 11 Snodgrassella_sp._ex._Apis_mellifera_USA_HM112094, 12 Snodgrassella_sp._ex._Apis_mellifera_USA_HM113226, 13 Snodgrassella_sp._ex._Bombus_terrestris_CH_HM215010, 14 Snodgrassella_sp._ex._Melanobombus_lapidarius_CH_HM215011, 15 Snodgrassella_sp._ex._Thoracobombus_pascuorum_D_HM215012, 16 Snodgrassella_sp._ex._Thoracobombus_pascuorum_CH_HM215013, 17 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Gilliamella_sp._ex._Thoracobombus_pascuorum_D_HM215024, 161 Gammaproteobacterium_sp._ex._Bombus_terrestris_D_HM215025, 162 Gilliamella_sp._ex._Thoracobombus_pascuorum_CH_HM215026, 163 Gilliamella_sp._ex._Thoracobombus_pascuorum_D_HM215027, 164 Gilliamella_sp._ex._Thoracobombus_pascuorum_D_HM215028, 165 Gilliamella_sp._ex._Bombus_terrestris_CH_HM215029, 166 Gilliamella_sp._ex._Megabombus_hortorum_HM215030, 167 Gilliamella_sp._ex._Melanobombus_lapidarius_HM215031, 168 Gilliamella_sp._ex._Bombus_terrestris_D_HM215032, 169 Gilliamella_sp._ex.__Melanobombus_lapidarius_CH_HM215033, 170 Gilliamella_sp._ex._Bombus_terrestris_D_HM215035, 171 Haemophilus_paraphropha_M75076; TREE PAUP_1 = [&R] (171:0.134552165,(1:0.14481673,((13:0.00114648,14:0.00747234):0.09263145,((11:0.10648404,(12:0.09958052,(10:1.0E-8,(6:0.00145109,7:0.00438773):1.0E-8):0.05977345):0.02666673):0.00246084,((25:1.0E-8,((22:1.0E-8,(20:1.0E-8,21:1.0E-8):0.00141459):0.02477709,((15:1.0E-8,(18:0.00144168,(16:0.00143187,17:1.0E-8):0.00147904):0.00589727):0.02047074,(161:0.02432493,(23:0.00267388,((29:1.0E-8,(27:1.0E-8,28:1.0E-8):1.0E-8):0.0,(19:0.00143034,(31:1.0E-8,(24:1.0E-8,(26:0.00284929,30:0.00142067):1.0E-8):1.0E-8):1.175E-5):0.00140694):0.00133225):4.1908E-4):1.0E-8):0.0042779):0.0):0.06125509,((155:0.04147695,(35:1.0E-8,(37:1.0E-8,(36:0.00963842,(9:1.0E-8,(157:0.00288423,159:0.00143553):0.00142927):0.01225444):0.0):0.0):0.00478986):0.01273192,(((33:0.00457379,34:0.00140983):0.02035514,(76:0.0083396,78:0.00489574):0.01245619):0.04507264,((((40:1.0E-8,158:0.00286652):0.0,(3:0.00421829,(4:0.00453201,153:0.03162184):0.00529119):0.00148086):0.00616505,(2:0.01186104,(154:0.01294642,(5:0.00318207,((8:0.00285933,41:1.0E-8):0.0,(38:1.0E-8,39:0.00294359):0.00279503):0.00549823):1.0E-8):0.00303354):0.00419623):0.00348323,(((141:1.0E-8,143:0.00993006):0.00318682,(142:1.0E-8,(140:1.0E-8,(138:0.00140983,139:1.0E-8):1.0E-8):0.00141935):0.00144941):0.01457254,(((44:1.0E-8,(167:0.00292044,(97:1.0E-8,(77:0.00223621,96:1.0E-8):0.0056084):0.00213037):0.0096043):0.00557217,(50:1.0E-8,(102:0.00151032,((81:0.00165576,83:1.0E-8):0.01258987,(((109:1.0E-8,(110:0.0014858,((105:1.0E-8,106:1.0E-8):0.00141564,(104:1.0E-8,(103:1.0E-8,(107:1.0E-8,108:1.0E-8):0.0):0.0):0.0):0.0):0.00235739):0.00983616,(168:0.00722392,(((84:0.00141409,100:1.0E-8):0.0014147,(88:1.0E-8,89:1.0E-8):1.0E-8):0.0,((85:1.0E-8,86:1.0E-8):1.0E-8,(91:1.0E-8,((90:1.0E-8,93:1.0E-8):0.00141686,(92:0.00284285,(98:1.0E-8,(87:1.0E-8,99:1.0E-8):1.0E-8):1.0E-8):1.0E-8):0.00167857):0.00115544):0.00141579):0.0):0.00778754):0.0050165,(((132:0.00172857,133:0.00173285):0.00795044,(134:0.0026558,(137:0.00319007,(148:0.00404282,(147:1.0E-8,(120:1.0E-8,(119:1.0E-8,(135:1.0E-8,136:0.00141377):0.00141435):1.0E-8):0.00285751):0.00178282):0.00161997):0.0):0.00306336):0.00332432,(112:1.0E-8,((145:0.0014318,160:0.01014097):0.0,(146:1.0E-8,(144:1.0E-8,((151:1.0E-8,164:0.00140665):1.0E-8,(150:1.0E-8,(149:1.0E-8,(162:0.00140846,(152:0.00569087,163:1.0E-8):1.0E-8):6.178E-4):0.0):0.00219075):1.0E-8):1.0E-8):1.0E-8):0.0):0.01185307):0.00334703):0.0015285):0.00281403):0.00492648):0.00658096):0.005689,(69:1.0E-8,(47:1.0E-8,(42:0.00132252,((74:1.0E-8,(43:1.0E-8,(48:1.0E-8,49:1.0E-8):0.00426848):0.0):0.0,(73:1.0E-8,(71:0.00284968,(61:1.0E-8,(((114:0.00140048,(113:1.0E-8,121:1.0E-8):1.0E-8):0.00278094,(115:1.0E-8,(122:1.0E-8,((116:0.00142518,(126:0.00142334,(130:0.00430193,131:0.00140293):0.00159837):0.00128023):0.0,(117:1.0E-8,(129:1.0E-8,(123:1.0E-8,(124:1.0E-8,125:1.0E-8):0.00140827):0.0):0.00281387):1.0E-8):0.0):0.0):0.0029335):0.0072737,(53:1.0E-8,(46:0.00308981,(170:0.00865633,(51:1.0E-8,(63:1.0E-8,(75:1.0E-8,(72:1.0E-8,(62:1.0E-8,(((165:0.00140309,169:0.0071294):1.0E-8,((80:0.00294229,94:1.0E-8):0.0,(79:1.0E-8,(128:0.0014005,(127:1.0E-8,156:0.01197675):7.7718E-4):6.7748E-4):1.0E-8):1.0E-8):1.0E-8,(52:1.0E-8,((70:1.0E-8,166:0.00281604):0.0,((58:1.0E-8,(45:1.0E-8,56:1.0E-8):8.1669E-4):5.8397E-4,((95:0.00143155,(54:1.0E-8,(67:0.00285395,(118:0.00141276,(32:1.0E-8,111:1.0E-8):1.0E-8):1.0E-8):0.0):0.00283937):0.00141047,((64:0.00140552,65:1.0E-8):0.00142747,(57:1.0E-8,((59:1.0E-8,(60:1.0E-8,82:1.0E-8):1.0E-8):1.0E-8,(101:0.00141406,(55:1.0E-8,(66:1.0E-8,68:1.0E-8):1.0E-8):1.0E-8):0.0014094):7.0977E-4):6.8013E-4):0.0014279):0.0):1.0E-8):1.0E-8):1.0E-8):5.9084E-4):0.0):4.792E-5):0.00261529):0.0):0.0):0.0):0.00233955):2.0316E-4):0.0):0.0):1.0E-8):1.0E-8):7.7491E-4):7.755E-4):0.0):0.00273508):0.00744797):0.003716):0.00530083):0.00513705):0.01590406):0.0):0.03418534):0.12049109):0.134552165); END; BEGIN TREES; TITLE Corbiculate_bacteria; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Leuconostoc_pseudomesenteroides_AB326299, 2 Leuconostoc_citreum_AB362721, 3 Lactobacillus_kefiri_AB429371, 4 Acetobacter_pasteuria_AB499842, 5 Alpha_proteobacterium_sp._ex._flower_AB513363, 6 Gluconobacter_frateuria_AB678443, 7 Aerococcus_urinaeequi_AB680259, 8 Streptococcus_equinus_AB680295, 9 Yokenella_regensburgei_AB681877, 10 Klebsiella_oxytoca_AB682268, 11 Streptococcus_suis_AF009487, 12 Acetobacter_peroxydans_AJ419836, 13 Alpha_proteobacterium_ex._Apis_mellifera_AJ971850, 14 Streptococcus_sp._ex._human_AM157443, 15 Candidatus_Hepatincola_porcellionum_AY189806, 16 Lactobacillus_sp._ex._Apis_mellifera_AY370183, 17 Lactobacillus_acidophilus_AY773947, 18 Uncultured_Acetobacteraceae_bacterium_B10.042B9, 19 uncultured_bacterium_ex._Meliponula_bocandei_B10.046, 20 uncultured_bacterium_ex._Myrmeleon_DQ068792, 21 Uncultured_bacterium_ex._Apis_mellifera_DQ837625, 22 uncultured_bacterium_ex._Anchovi_DQ860016, 23 uncultured_bacterium_ex._Anopheles_EF179826, 24 uncultured_bacterium_ex._Apis_mellifera_EF187239, 25 Lactobacillus_sp._ex._Apis_mellifera_EF187244, 26 Lactobacillus_sp._ex._Apis_mellifera_EF187245, 27 Gluconobacter_oxydans_EU034639, 28 Acetobacter_pomorum_EU096229, 29 Gluconobacter_morbifer_EU096234, 30 Sinorhizobium_meliloti_FJ025127, 31 Alpha_proteobacterium_sp._ex._Dactylopius_GQ853368, 32 Lactobacillus_sakei_GU125609, 33 Lactobacillus_sp._ex._Apis_cerana_HM046576, 34 Acetobacteriaceae_sp._ex._Apis_dorsata_HM108484, 35 Acetobacteraceae_sp._ex._Caupolicana_HM109591, 36 Lactobacillus_sp._ex._Apis_mellifera_HM112107, 37 Uncultured_bacterium_Bacterium_ex._Diadasia_HM112629, 38 Lactobacillus_sp._ex._Apis_mellifera_HM113169, 39 Firmicutes_sp._ex._Bombus_terrestris_HM215048, 40 Lactobacillus_sp._ex._Melipona_beecheii_HM534760, 41 Lactobacillus_sp._ex._Trigona_sp_HM534761, 42 Lactobacillus_sp._ex._Meliponula_bocanandei_HM534762, 43 Lactobacillus_sp._ex._Melipona_beecheii_HM534763, 44 Lactobacillus_sp._ex._Apis_koschevnikovi_HM534764, 45 Lactobacillus_sp._ex._Apis_cerana_HM534779, 46 Lactobacillus_sp._ex._Melipona_beecheii_HM534806, 47 Lactobacillus_sp._ex._Apis_florea_HM534811, 48 Lactobacillus_sp._ex._Meliponula_bocandei_HM534813, 49 Lactobacillus_sp._ex._Trigona_sp_HM534814, 50 Aerococcus_viridans_HQ425688, 51 Unculured_bacterium_ex._Daphnia_magna_JN392909, 52 Aerococcus_sp._ex._Culex_sp_JN644571, 53 Saccharibacter_floricola_NR024819, 54 Lactobacillus_tucceti_NR042194, 55 Rickettsia_bellii_U11014, 56 uncultrured_bacterium_ex._Euglossa_imperialis_B10.023_A4, 57 uncultured_bacterium_ex._Eufrisea_sp_B10.050_A10, 58 uncultured_bacterium_ex._Euglossa_imperialis_B10.022_A3, 59 uncultured_bacterium_ex._Euglossa_imperialis_B10.022_C1, 60 uncultured_bacterium_ex._Eulaema_sp_B10.049_A8, 61 uncultured_bacterium_ex._Eulae_sp_B10.049_A7, 62 uncultured_bacterium_ex._Melipona_panamica_B10.042, 63 uncultured_bacterium_ex._Melipona_panamica_B10.042_F9, 64 uncultured_bacterium_ex._Melipona_panamica_B10.043, 65 uncultured_bacterium_ex._Melipona_panamica_B10.043_D3, 66 uncultured_bacterium_ex._Meliponula_bocandei_B10.046_A4, 67 uncultured_bacterium_ex._Meliponula_bocandei_B10.046_D5, 68 uncultured_bacterium_ex._Meliponula_bocandei_B10.047_A7, 69 uncultured_bacterium_ex._Melipona_panamica_B10.043_B, 70 uncultured_bacterium_ex._Melipona_panamica_B10.043_A1, 71 Lactobacillus_lindneri_X95421, 72 Lactobacillus_kunkeei_Y11374; TREE PAUP_1 = [&R] ((10:0.01777431,(23:0.00518294,(9:0.00403317,(20:1.0E-8,60:9.9342E-4):1.0E-8):0.00504571):1.0E-8):0.31787005,((((30:0.18140878,55:0.27594985):0.04787713,(15:0.18873961,(51:0.11799229,(31:0.04376419,(56:0.00116517,58:0.00235133):0.04261427):0.10050865):0.01227143):0.26588865):0.03840854,((18:0.01844478,(66:0.00171548,68:0.00291367):0.01880331):0.06038035,(((12:0.00305373,(4:1.0E-8,28:0.00116736):0.03433576):0.03495925,(5:0.0246183,(29:0.02314676,(6:1.0E-8,27:0.00590794):0.01938854):0.01281559):0.00921087):0.0368096,((65:0.01735091,(34:0.0213233,(13:0.01026425,21:0.00601499):0.00999779):0.01445388):0.00777205,((35:0.01156582,53:0.0228063):0.02269986,(57:0.00735796,(59:0.00436047,61:0.00636505):0.00182735):0.00700431):0.01587115):0.0123706):0.01049381):0.26348441):0.1212834,(((8:0.0311665,11:0.03766315):0.02797316,(22:0.05778162,(14:0.02676279,70:0.02777764):0.05675184):0.02890737):0.10118064,(((1:0.01209978,2:0.02023904):0.05469903,(37:0.03418252,63:0.05108749):0.0231379):0.15896001,((17:0.06760383,((46:0.00493564,69:0.0025372):0.02381117,(16:0.03133704,(39:0.023055,(38:9.5935E-4,45:1.0E-8):0.00647955):0.01063378):0.01576458):0.02391892):0.13390395,((67:0.01758964,(7:1.0E-8,(50:1.0E-8,52:0.00388089):0.00193387):0.04322796):0.12610785,((19:0.05868066,(26:0.0753046,(49:0.02609748,((33:0.01510572,36:0.00307105):0.00285222,(25:0.00202216,(47:0.00280956,48:1.0E-8):0.00102228):0.0):0.04977447):0.00940921):0.018911):0.04552698,(54:0.04297652,(32:0.06267432,((24:1.0E-8,72:1.0E-8):0.08741459,(3:0.04472973,((44:0.03907357,71:0.02981295):0.05944601,(43:0.04306262,(42:0.01702728,(41:0.0039482,(40:0.00459676,(62:0.00543082,64:8.5711E-4):0.00282319):0.0054664):0.0):0.01940073):0.03092746):0.02279172):0.01236996):0.0274062):0.03663958):0.02583428):0.01964455):0.00549174):0.04689686):0.07414289):0.41278575):0.31787005); END;