#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 16, 2024; 11:34 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Lindell J., Méndez-de la cruz F., & Murphy R. 2005. Deep genealogical history without population differentiation: discordance between mtDNA and allozyme divergence in the zebra tailed lizard (Callisaurus draconoides). Molecular Phylogenetics and Evolution, null. 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Callisaurus_draconoides_Isla_San_Fransisco 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Callisaurus_draconoides_Vizcaino_83_km_W_of 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Callisaurus_draconoides_Wadsworth --------------------------------------------------TATTTCTAGCCATACACTACACAGCTGACATTACATCAGCCTTTTCATCCGTCGCTCACATCTGCCGAGATGTACAATATGGCTGACTTATCCGAAATATTCACGCCAACGGAGCCTCCATATTTTTTATTTGTATTTACCTCCACATTGGCCGAGGAATATACTATGGATCTTATATGTTTAAAGAAACATGAAACATTGGAGTAATTTTACTACTATTAGTCATAGCAACAGCATTCGTAGGATATGTCTTACCATGAGGACAAATATCATTTTGAGGAGCAACAGTTATTACTAATTTATTATCAGCTATCCCATACGTAGGAACAACCCTAGTAGAATGAATCTGAGGAGGATTCTCTGTCGACAACGCAACACTAACCCGATTCTTTACCTTTCACTTTCTTCTTCCATTTATTATTATTGGCATCACCATAATACATCTCCTATTTTTGCACGAAACAGGTTCAAACAACCCAACTGGACTATCCTCAAACACAGATAAAGTTCCATTTCACCCATATTTTTCATACAAAGATCTCCTTGGGGCTCTACTACTAATTATTGTTTTACTAACCCTTGCACTATTTTCACCAAATCTACTAGGAGACCCAGAAAACTTTTCACCAGCAAACCCACTAGTAACTCCTCCACACATTAAACCAGAATGATACTTCCTATTTGCCTACGCCATCCTACGATCAATTCCAAACAAATTGGGGGGCGTGCTCGCCTTACTTTTTTCAATCCTCATCCTTATACTAGTCCCAATAATACACACATCAAAACAACGAAGCACCTCCTTCCGACCAATATCTCAAACCATATTTTGACTTTTAATCTCAGACGTACTCATTCTTACATGAATTGGAGGACAACCTGTAGAACACCCATTTATTATTATTGGACAACTTGCCTCAATCATTTACTTCCTTCTATTCTTATTTATCATACCAACAACAGCAATCCTAGAAAACAAGCTCCT----------------------------------------------------A-GGAAATTA-CTACCCCTCAATGATATGCCACAACTAAACCCATCTCCATGGTTTCTTATCTTGCTAATGACATGACTAATACTAATAATTTTTTACCTAAACAAAACCTTAAATATTATACTTCCGAACCCACCAATTAAACAACAATCAGAAAAAAAAGACCAAACACCTTGAACCTGACCATGATACTAAGCTTCTTTGATCAATTTTTAATCCCACAAACCCTAGGTATTCCACTAATTCTAATTGCAATTATTATACCAACACTTATTATCTTAAACTCTTCAAACCGCCTTATTTCAAATCGATTACTTACACTACAAGATTGGGCAATAAAAACCTTTACAAAACAACTTATTTTGCCTATCGGAATTTACGGGCATAAATGAGCATCAATACTTTTAGCCCTCACACTCCTTCTTATGTCATTAAATTTAATAGGACTACTACCATATACATTTACACCAACAACACAACTATCAATAAACATGGCACTAGCAGTACCAATGTGAATAACAACTGTATTAATTGGAATGCGAAATCAACCAACAATATCCCTAGGACACTTACTACCAGAAGGAACTCCAACCCCACTAATTCCAATCCTAATTATTATTGAAACCATTAGTCTATTTATTCGACCACTTGCTCTTGGCGTTCGACTAACCGCTAACCTAACAGCAGGGCACCTATTAATTCAACTAATTTCAACAGCAGCCTTTGTTTTAATACCATCAATAACACTAACAGCAACTGCAGCATTCATCATTCTTATACTA-T-ACCGGACTTGAAATTGCTGTAGCAATAATTCAAGCATATGTCTTTGTTT-ACTACTAAGC-TA------------------- Callisaurus_draconoides_Yuma_Dunes -----------TACTTGGAATTTGCCTAATTATCCAAATCCTAACAGGACTATTTCTAGCCATACACTATACAGCTGACATTACATCAGCCTTTTCATCCGTTGCTCACATCTGCCGAGATGTTCAATATGGCTGACTTATCCGAAATATTCATGCCAACGGAGCCTCCATATTTTTTATCTGTATTTATCTCCACATTGGACGAGGAATATACTATGGATCTTACATGTTTAAAGAAACATGAAACATTGGAGTAATTCTACTACTATTAGTCATAGCAACGGCATTCGTAGGATACGTCTTACCATGAGGACAAATATCATTTTGAGGAGCAACAGTCATTACTAATTTATTATCAGCTATTCCTTACGTAGGAACAACCCTAGTAGAATGAATCTGAGGAGGATTCTCCGTCGACAACGCAACACTTACCCGATTCTTTACCTTTCACTTTCTCCTCCCATTCATTATTATTGGCATCACCATAATACATCTCCTATTTTTACATGAAACAGGTTCAAACAACCCAACTGGACTATCCTCAAACACAGACAAAGTTCCATTTCACCCATATTTTTCATACAAAGACCTCCTTGGAGCCCTACTACTAATCATTGTTCTACTAACCCTTGCACTATTTTCACCAAACCTACTAGGAGACCCAGAAAACTTTTCACCAGCAAACCCACTAGTAATCCTCCCACACATTAAACCAGAATGGTATTTCCTATTTGCCTACGCCATCCTACGATCAATTCCAAACAAATTGGGAG-CGTACTCGCCCTACTTTTCTCAATCCTAATCCTCATACTAGTTCCAATAATACACACATCAAAACAACGAAGCACCTCCTTCCGACCAATATCTCAAACCATATTTTGACTTTTAATCTCAGACGTCCTCATTCTTACATGAATTGGGGGACAACCTGTAGAACACCCATTTATTATTATTGGACAAC-TGCCTCAATCACTTACTTAATTCTATTCTTATTCATTATACCAACAACAGCAATACTAGAGAACAAACTCCTAAAATGA---------------------------------------------AGGGAAATCAACTGCCCCTCAATGATATGCCACAACTAAACCCATCTCCATGGTTTCTTATCTTGCTAATGACATGACTAATACTAATAATTTTTTATCTAAACAAAACCTTAAATATAATGTTTCCAAACCCACCAATTAAACAACAATCAGAAAAAAAAGACCAAACACCTTGAACCTGACCATGATACTAAGCTTCTTTGATCAATTTCTAATCCCACAAACCCTAGGTATTCCACTAATTCTAATTGCAATTATTATACCAACACTTATTATCTTAAGCTCTTCAAACCGACTTATTTCAAATCGATTACTTACACTACAAGATTGGGCAACAAAAACCTTTACAAAACAACTTATTATACCTATCGGAATTCACGGGCATAAATGAGCATCAATACTTTTAGCCCTCACACTCCTTCTTATATCATTAAATTTAATAGGACTACTACCATATACATTTACACCAACAACACAACTGTCAATAAACATGGCACTAGCAGTACCAATGTGAATAACAACTGTACTAATTGGAATGCGAAACCAACCAACAGTATCCCTAGGACACCTACTACCAGAAGGAACTCCAACCCCACTAATTCCAATCCTAATTATTATTGAAACCATTAGTCTATTTATTCGACCACTTGCTCTTGGCGTCCGACTAACCGCTAACCTAACAGCAGGACACCTATTAATTCAACTAATTTCAACAGCGGCCTTTGTTTTAATACCATCAATAACACTAACAGCAACTGCAGCATTCATCATTCTTCTACTACTAACCGGACTTGAAATCGCTGTAGCAATAATTCAAGCATACGT-TTTGTTTT-CTA-T-AGCC-A--TTTA------------- Cophosaurus_texanus 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Holbrookia_maculata 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; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = cytb_and_ATPase) = N: 1-1953; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = cytb_and_ATPase) = N: 1-1953; END; BEGIN TREES; TITLE Tb7304; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Holbrookia_maculata, 2 Cophosaurus_texanus, 3 Callisaurus_draconoides_Mazatlan, 4 Callisaurus_draconoides_Alamos, 5 Callisaurus_draconoides_Bahia_Kino, 6 Callisaurus_draconoides_Isla_Tiburon, 7 Callisaurus_draconoides_Hidalgo_Co, 8 Callisaurus_draconoides_Cabo_San_Lucas_4_mi_E_of, 9 Callisaurus_draconoides_Buena_Vista, 10 Callisaurus_draconoides_San_Pedro_14.8_mi_S_of, 11 Callisaurus_draconoides_La_Paz_43_km_W_of, 12 Callisaurus_draconoides_Isla_San_Fransisco, 13 Callisaurus_draconoides_San_Evaristo, 14 Callisaurus_draconoides_San_Pedro_la_Presa, 15 Callisaurus_draconoides_Isla_San_Jose, 16 Callisaurus_draconoides_Isla_Danzante, 17 Callisaurus_draconoides_Juncalito, 18 Callisaurus_draconoides_Isla_del_Carmen, 19 Callisaurus_draconoides_Isla_Coronados, 20 Callisaurus_draconoides_Loreto_8.3_km_N_of, 21 Callisaurus_draconoides_Loreto_21_km_N_of, 22 Callisaurus_draconoides_Loreto_26.4_mi_N_of, 23 Callisaurus_draconoides_Mulege_14.2_mi_W_of, 24 Callisaurus_draconoides_Isla_San_Marcos, 25 Callisaurus_draconoides_Ramon_a_Santa_Agueda, 26 Callisaurus_draconoides_San_Ignacio_1_mi_SW_of, 27 Callisaurus_draconoides_San_Ignacio, 28 Callisaurus_draconoides_Vizcaino_83_km_W_of, 29 Callisaurus_draconoides_Guerrero_Negro_2_km_S_of_b, 30 Callisaurus_draconoides_Guerrero_Negro_2_km_S_of_a, 31 Callisaurus_draconoides_El_Arco, 32 Callisaurus_draconoides_Isla_Angel_de_la_Guarda, 33 Callisaurus_draconoides_Bahia_de_Los_Angeles, 34 Callisaurus_draconoides_Puente_Las_Viboras, 35 Callisaurus_draconoides_Santa_Inez, 36 Callisaurus_draconoides_Yuma_Dunes, 37 Callisaurus_draconoides_Ocotillo, 38 Callisaurus_draconoides_Desert_Centre, 39 Callisaurus_draconoides_Silver_Lake, 40 Callisaurus_draconoides_Newberry_Peak, 41 Callisaurus_draconoides_Newberry_Springs, 42 Callisaurus_draconoides_Pearblossom_4_mi_N_of, 43 Callisaurus_draconoides_Hawthorne, 44 Callisaurus_draconoides_Wadsworth; TREE Fig._1a = [&R] (((((6,5,4),3),((((44,43),(38,(((((42,(41,40)),39),7),(37,36)),(35,34)))),(33,31)),32)),(((30,29),(((27,24,(25,23),22),((21,20),18)),19)),((((17,16),(15,12)),((14,13),11)),(10,(9,8)))))Callisaurus_draconoides,(2,1)); END;