#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on May 10, 2024; 23:01 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Hyakumachi M., Priyatmojo A., Kubota M., & Fukui H. 2005. New Anastomosis Groups, AG-T and AG-U, of Binucleate Rhizoctonia spp. Causing Root and Stem Rot of Cut-Flower and Miniature Roses. Phytopathology, 95. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S1365] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=42; TAXLABELS Ceratobasidium_sp._AGA_AF354092 'Ceratobasidium sp. AGA AH-1 AB196639' 'Ceratobasidium sp. AGA C-538 AB196640' Ceratobasidium_sp._AGBa_AF354088 'Ceratobasidium sp. AGBa C-484 AB196641' Ceratobasidium_sp._AGBb_AB122144 'Ceratobasidium sp. AGC Ka-1-1 AB196642' Ceratobasidium_sp._AGDI_AF354090 'Ceratobasidium sp. AGDI ST-SDS-1 AB196643' 'Ceratobasidium sp. AGDI W-12 AB196644' Ceratobasidium_sp._AGF_AF354085 'Ceratobasidium sp. AGF AH-6 AB196645' 'Ceratobasidium sp. AGG 1Shi-1299' 'Ceratobasidium sp. AGG 4Wak-600' 'Ceratobasidium sp. AGG AH-9 AB196646' 'Ceratobasidium sp. AGG Su-1 AB196647' Ceratobasidium_sp._AGH_AF354089 'Ceratobasidium sp. AGH STC-10 AB196648' 'Ceratobasidium sp. AGH STC-11 AB196649' Ceratobasidium_sp._AGI_AJ242898 Ceratobasidium_sp._AGI_AJ419932 'Ceratobasidium sp. AGI AV-2 AB196650' 'Ceratobasidium sp. AGI FKO-1-17 AB196651' Ceratobasidium_sp._AGK_AB122145 'Ceratobasidium sp. AGK SH-10 AB196652' Ceratobasidium_sp._AGL_AF354093 'Ceratobasidium sp. AGL FKO-2-26 AB196665' Ceratobasidium_sp._AGO_AF354094 'Ceratobasidium sp. AGP C-578 AB196654' 'Ceratobasidium sp. AGP C-579 AB196655' Ceratobasidium_sp._AGR_AJ427407 Ceratobasidium_sp._AGS_AJ427400 Ceratobasidium_sp._AGS_S5_AB196656 'Ceratobasidium sp. AGT 1Fuk-600' 'Ceratobasidium sp. AGT 2Shi-1999' 'Ceratobasidium sp. AGT 3Iba-1000' 'Ceratobasidium sp. AGT 4OIT-800' 'Ceratobasidium sp. AGT Aic-400 AB196660' 'Ceratobasidium sp. AGU MWR-20 AB196664' 'Ceratobasidium sp. AGU MWR-22 AB196666' 'Ceratobasidium sp. AGU MWR-24 AB196665' Thanatephorus_cucumeris ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M1455] TITLE ITS; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=537; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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AGA AH-1 AB196639' TGTGCACGCCTTCTCTTATTCAATCC-ACACA-CCCCTGTGCACTTGTG-AGACTGGA----------GGCCGT--------------AAAAAGCTTT----CAGTCTGCTAAAT------TCATATACAAACTCATTTAAT-TGAA-CTGAATGTAC-TTGATGTAACGCATCATTAA-ACTAAGTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCTCCTTGGTATTCCTTGGAGCATGCCTGTTTGAGTATCATGAAATTCTCAAAGT--AAACCTTTT-----------GTTAATTCAACTGGC---CTT-GCTTTGGATTTGGAGG---TCTT--GCAGATGTCACAGTCTGCTCCTCTTAAAT?AATTAGCTGGATCTCAGTAT-ACACTTGGTTCCACTCGGCGTGATAAGT-ATCACTCGCTGAGGACACTGT---AAAA-GGTGGCC 'Ceratobasidium sp. AGA C-538 AB196640' TGTGCACGCCTTCTCTTATTCCATCC-ACACA-CCCCTGTGCACTTGTG-AGACTGGA----------GGCCGT--------------AAAAAGCTTT----CAGTCTGCTAAAT------TCATATACAAACTCATTTAAT-TGAA-CTGAATGTAC-TTGATGTAACGCATCATTAA-ACTAAGTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCTCCTTGGTATTCCTTGGAGCATGCCTGTTTGAGTATCATGAAATTCTCAAAGT--AAACCTTTT-----------GTTAATTCAACTGGC---CTT-GCTTTGGATTTGGAGG---TCTT--GCAGATGTCACAGTCTGCTCCTCTTAAAT?AATTAGCTGGATCTCAGTAT-ACACTTGGTTCCACTCGGCGTGATAAGT-ATCACTCGCTGAGGACACTGT---AAAA-GGTGGCC Ceratobasidium_sp._AGBa_AF354088 TGTGCACACCCTTCTCTTTCATCCAC-ACAC--CCCCTGTGCACTTGTG-AGACAGAGGCC----TTTTTTTT-CCTTTAACTAGGAATCAAG---------GTTTCTGTCTATCA-----TCACATAAAATCTAATTTAATTAAAT-CTGAATGTAATTTGATGTAACGCATCT--AATACAAAGTTTCAACAACGGATCTCTTGGC?CTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTATTGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCTCCTTGGTATTCCTTGGAGCATGCCTGTTTGAGTATCATGAAATTATCAAAGC-AAAGTCTTTT-----------GTTAATTCAATT----GGCTTTGCTTTGGACTTGGAGG----TCT--GCAGATCAAAAC-TCTGCTCCTCTTAAATGTATTAGCTGGATCTCCATGA---ACTTGGTTCCACTCGGCGTGATAAGTTATCACTCGCTGAGGACACCCGTA-AAAAAGGTGGCC 'Ceratobasidium sp. AGBa C-484 AB196641' TGTGCACACCCTTCTCTTTCATCCAC-ACAC--CCCCTGTGCACTTGTG-AGACAGAGGCC----TTTTTTTTTCCTTTAACTAGGAATCAAG---------GTTTCTGTCTATCA-----TCACATAAAATCTAATTTAATTAAAT-CTGAATGTAATTTGATGTAACGCATCT--AATACAAAGTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCTCCTTGGTATTCCTCGGAGCATGCCTGTTTGAGTATCATGAAATTCTCAAAGC-AA-GTCTTTT-----------GTTAATTCAATT----GGCTTTGCTTTGGACTTGGAGG----TCT--GCAGATCAAAAC-TCTGCTCCTCTTAAATGTATTAGCTGGATCTCCATGA---ACTTGGTTCCACTCGGCGTGATAAGTTATCACTCGCTGAGGACACCCGTA-AAAAAGGTGGCC Ceratobasidium_sp._AGBb_AB122144 TGTGCACACC-TTCTCTTTCATCCAC-ACACACCCCCTGTGCACTTGTG-AGACGGAGGAGGCATTTTAATTTCCTTTTAACTAGGGAAAGAGAGAGAGGTCGCCTCCGTCTATCG-----TCACATAAAATCTAATTTATTTAAAAACTGAATGTAAATGGATGTAACACATCTTAAATACAAAGTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCTCCTTGGTATTCCTTGGAGCATGCCTGTTTGAGTATCATGAAATTATCAAAGC-AAAGTCTTTTTTTTTGTTGTTGTTAATTCAACTTAAAGTCTGCGCTTTGGATTTGGAGG----TTTT-GCAGATTTAAATTTCTGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTGGATCTCTATGA---ACTTGGTTCCACTCGGCGTGATAAGTTATCACTCGTCGAGGACACCCGTA-AAAAAGGTGGCC 'Ceratobasidium sp. AGC Ka-1-1 AB196642' TGTGCACGCCTTCTCCGTTCATCCAC-ACACA-CC--TGTGCACTTGTG-AGACGG---------AC--TAACCC-----------TTCCGAGGGGATG-CCCCGTCTATT----------?TAC?TAAACTCCAATATATT--AAATTTGAATGTAATCAGATG?AACACAT?ATTGA-ACTAAGTT?CAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAA?AAC?CAGCGAAATGC?ATAAGTAATGTGAATTGCAGAATT?A??GAATCATC?AATCTTTGAACGCACCTTGCGCTCCTTGGTATTCCTCGGAGCATGCCTGTTTGAGTATCATGAAATTCTCAAAAT--AAATCTTTT-----------GTTAATTCAATTGG----TTTCATTTTGGACTTGGGGG----TCT--GCAGATT-AACTTC-TGCTCCTCTTAAATATATTAGCTGGATCTCGGAGA---GGTCGGTTCCACTC??C??G??AA?T-ATC?CTCGC??AGGACACTGT----AAAA?GTGGCC Ceratobasidium_sp._AGDI_AF354090 TGTGCACACCTTCTCT-TTCATCCAC-TCACA-CC--TGTGCACCTGTTTAGACGGTTGAAGGAAAAAGTCTTTC-----------TCGCGAGAGAGAG-GCCGGCTCCTTTTCCCGTCCAATACATAAAATCTTATATATT--TAATCAGAATGTAATCGATGTAAACGCATCTATAA-ACTAAGTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCTCCTTGGTATTCCTCGGAGCACGCCTGTTTGAGTATCATGAAATTCTCAAAGC--AAGTCTTTT-----------GTTAATTCAACTGGC---TTTTGTTTTGGATTTGGAGG----TTTT-GCAGATT-CACGTC-TGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTGGATCTCTATAA---AACCGGTTCCACTCGGCGTGATAAGT-ATCACTCGCTGAGGAC?CTCTTGAAAAAGGGTGGCC 'Ceratobasidium sp. AGDI ST-SDS-1 AB196643' TGTGCACACCTTCTCT-TTCATCCAC-TCACA-CC--TGTGCACCTGTTTAGACGGTCGAAGGAAAAAGTCTTTC-----------TCGCGAGAGAGAG-GCCGGCTCCTTTTCCCGTCCAATACATAAAATCTTATATATT--TAATCAGAATGTAATCGATGTAAACGCATCTATAA-ACTAAGTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCTCCTTGGTATTCCTCGGAGCACGCCTGTTTGAGTATCATGAAATTCTCAAAGC--AAGTCTTTT-----------GTTAATTCAACTGGC---TTTTGTTTTGGATTTGGAGG----TTTT-GCAGATT-CACGTC-TGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTGGATCTCTATAA---AACCGGTTCCACTCGGCGTGATAAGT-ATCACTCGCTGAGGACACTCTTGAAAAAGGGTGGCC 'Ceratobasidium sp. AGDI W-12 AB196644' TGTGCACGCCTTCTCT-TTCATCCAC-ACACA-CC--TGTGCACCTGTTTAGACGGTCGAAGGAAAAAGTCTTTC-----------TCGCGAGAGAGAG-GCTGGCTCCTTTTCC-GTCCAATACATAAAATCTTATATAT?--TAATCAGAATGTAATCGATGTAAACGCATCTATAA-ACTAAGTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCTCCTTGGTATTCCTCGGAGCACGCCTGTTTGAGTATCATGAAATTCTCAAAGC--AAGTCTTTT-----------GTTAATTCAACTGGC---TTTTGTTTTGGATTTGGAGG----TCTT-GCAGATT-CACGTC-TGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTGGATCTCTATAA---AATCGGTTCCACTCGGCGTGATAAGT-ATCACTCGCTGAGGACACTCTTGCAAAAGGGTGGCC Ceratobasidium_sp._AGF_AF354085 TGTGCACACCTTTCTCTTTCATCCAC-ACACA-CC--TGTGCACTTGTG-AGACAGCTT-------GGAGGACTT-----------TATTGGACTCCT---TCTGTCTACTTAAT------CCACACAA-ACTCAATTTATTTTAAA-CTGAATGTAT-TTGATGTAACGCATC--TAATACTAAGTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCTCCTTGGTATTCCTTGGAGC?TGCCTGTTTGAGTATCATGAAATCTTCAAAGTTAAAATCTTTT-----------GTTAACTCAATTGGT--TTCT-ACTTTGGTATTGGAGG---TCTTT-GCAGCTT-CACACC-TGCTCCTCTTTG-TTCATTATCTGGATCTCAGTGTTATGCTTGGTTCCACTCGGCGTGATAAGTTATCTATCGCTGAGGACACT-GTA-AAAA--GTGGCC 'Ceratobasidium sp. AGF AH-6 AB196645' TGTGCACACCTTCTCTTT-CATCCAC-ACACA-CC--TGTGCACCTGTG-AGACAGAGT--------GGGAATTTTAATTT-AATTTAATTGGACCCT----CTGTCTACTTAAT------TCACACAA-ACTCTATTTATTATAAA-ATGAATGTAA-TTGATGTAACGCATC--TAATACTAAGTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCTCCTTGGTATTCCTTGGAGCATGCCTGTTTGAGTATCATGAAATCTTCAAAGT--AAATCTTTT-----------GTTAATTCAACTGGT----TCTACTTTGGTCTTGGAGGT---TATT-GCAGCTT-CACACC-TGCTCCTCTTTG-TGCATTAGCTGGATCTCAGTGTTATGCTTGGTTCCACTCAGCGTGATAAGT-ATCTATCGCTGAGGACACTGTAA-CAGGTGGCC--- 'Ceratobasidium sp. AGG 1Shi-1299' TGTGCACGCCTTCTCTTT-CATCCAC-ACACA-CC--TGTGCACTTGTG-AGACGGA-----------GGG-CTT-----------TAATTAG-TCTT----CCGTCTATTCAA-------CCACACAA-ACTC-ATTGTATTTAAA-CTGAATGTAA-TTGATGTAACGCATCATTAGAACTAAGTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCTCCTTGGTATTCCTTGGAGCATGCCTGTTTGAGTATCATGAAATTCTCAAAGT--AAATCTTTT-----------GTTAATTCAACTGGT----TTTGCTTTGGACTTGGAGG---TCTTT-GCAGATTTCACGTC-TGCTCCTTTTAAATGCATTAGCGGGATCCCGGAAT-AGGCTGGGTTCCCCTGGGCGGGATAAGT-ACCCCTCGCGGAGGCC-------------------- 'Ceratobasidium sp. AGG 4Wak-600' TGTGCACGCCTTCTCTTT-CATCCAC-ACACA-CC--TGTGCACTTGTG-AGACGGA-----------GGG-CTT-----------TAATTAG-TCTT----CCGTCTATTCAA-------CCACACAA-ACTC-ATTGTATTTAAA-CTGAATGTAA-TTGATGTAACGCATCATTAGAACTAAGTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCTCCTTGGTATTCCTTGGAGCATGCCTGTTTGAGTATCATGAAATTCTCAAAGT--AAATCTTTT-----------GTTAATTCAACTGGT----TTTGCTTTGGACTTGGAGG---TCTTT-GCAGATTTCACGTC-TGCTCCTTTTAAATGCATTAGCGGGATCCCGGAAT-AGGCTGGGTTCCCCTGGGCGGGATAAGT-ACCCCTCGCGGAGGCC-------------------- 'Ceratobasidium sp. AGG AH-9 AB196646' TGTGCACGCCTTCTCTTT-CATCCAC-ACACA-CC--TGTGCACTTGTG-AGACGGA-----------GGG-CTT-----------TAATTAG-TCTT----CCGTCTATTCAA-------CCACACAA-ACTC-ATTGTATTTAAA-CTGAATGTAA-TTGATGTAACGCATCATTAGAACTAAGTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCTCCTTGGTATTCCTTGGAGCATGCCTGTTTGAGTATCATGAAATTCTCAAAGT--AAATCTTTT-----------GTTAATTCAACTGGT----TTTGCTTTGGACTTGGAGG---TCTTT-GCAGATTTCACGTC-TGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTGGATCTCAGTAT-ATGCTTGGTTCCACTCGGCGTGATAAGT-ATCACTCGCTGAGGACACTGTAA-AAGGTGGCC--- 'Ceratobasidium sp. AGG Su-1 AB196647' TGTGCACGCCTTCTCTTT-CATCCAC-ACACA-CC--TGTGCACTTGTG-AGACGGA-----------GGG-CTT-----------TAATTAG-TCTT----CCGTCTATTCAA-------CCACACAA-ACTC-ATTGTATTTAAA-CTGAATGTAA-TTGATGTAACGCATCATTAGAACTAAGTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCTCCTTGGTATTCCTTGGAGCATGCCTGTTTGAGTATCATGAAATTCTCAAAGT--AAATCTTTT-----------GTTAATTCAACTGGT----TTTGCTTTGGACTTGGAGG---TCTTT-GCAGATTTCACGTC-TGCTCCTTTTAAATGCATTAGCTGGATCTCAGTAT-ATGCTTGGTTCCACTCGGCGTGATAAGT-ATCACTCGCTGAGGACACTGTAA-AAGGTGGCC--- Ceratobasidium_sp._AGH_AF354089 TGTGCACGCCTTCTCTATTCATCCAC-ACACA-CC--TGTGAACTTGTG-AGACGG---------ATAGTAGTCC-----------CCTCGGGGACGAG-CTCCGTCTGCT----------ATACATAAACTCCAGTAAAT---AAATTTGAATGTCATTTGATGTAACGCATCTATAA-ACTAAGTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCTCCTTGGTATTCCTCGGAGCATGCCTGTTTGAGTATCATGAAATTCTCAAAAT--AAATCTTTT-----------GTTTATTCAATTGG----TTTCATTTTGGACTTGGAGG----TCT--GCAGATT-CACGTC-TGCTCCTCTTAAATTCATTAGCTGGATCTCTATAA---ACTTGGTTCCACTCGGCGTGATAAGT-ATCACTCGCTGAGGACACTGT----AAAAGGTGGCC 'Ceratobasidium sp. AGH STC-10 AB196648' TGTGCACGCCTTCTCTATTCATCCAC-ACACA-CC--TGTGAACTTGTG-AGACGG---------ATAGTAGTCC-----------CCTCGGGGACGAG-CTCCGTCTGCT----------ATACATAAACTCCAGTAAAT---AAATTTGAATGTCATTTGATGTAACGCATCTATAA-ACTAAGTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCTCCTTGGTATTCCTCGGAGCATGCCTGTTTGAGTATCATGAAATTCTCAAAAT--AAATCTTTT-----------GTTTATTCAATTGG----TTTCATTTTGGACTTGGAGG----TCT--GCAGATT-CACGTC-TGCTCCTCTTAAATTCATTAGCTGGATCTCTATAA---ACTTGGTTCCACTCGGCGTGATAAGT-ATCACTCGCTGAGGACACTGT----AAA-GGTGGCC 'Ceratobasidium sp. AGH STC-11 AB196649' TGTGCACCCTTTCTCTATTCATCCAC-ACACA-CC--TGTGAACTTGTG-AGACGG---------ATAGTAGTCC-----------CCTCGGGGACGAG-CTCCGTCTGCT----------ATACATAAACTCCAGTAAAT---AAATTTGAATGTCATTTGATGTAACGCATCTATAA-ACTAAGTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCTCCTTGGTATTCCTCGGAGCATGCCTGTTTGAGTATCATGAAATTCTCAAAAT--AAATCTTTT-----------GTTTATTCAATTGG----TTTCATTTTGGACTTGGAGG----TCT--GCAGATT-CACGTC-TGCTCCTCTTAAATTCATTAGCTGGATCTCTATAA---ACTTGGTTCCACTCGGCGTGATAAGT-ATCACTCGCTGAGGACACTGT----AAAAGGTGGCC Ceratobasidium_sp._AGI_AJ242898 TGTGCACGCCTTCTCTTT-CATCCAC-ACACA-CC--TGTGCACTTGTG-AGACGGA-----------GGG-CTT-----------TAATTAG-TCTT----CCGTCTACTTAA-------TCACACAA-ACTC-ATT-TAATTAAA-TTGAATGTAA-TTGATGTAACGCATCATTAGAACTAAGTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCTCCTTGGTATTCCTTGGAGCATGCCTGTTTGAGTATCATGAAATTCTCAAAGT--AAATCTTTT-----------GTTAATTCAACTGGG----TTTGCTTTGGACTTGGAGG---TCTTT-GCAGATTTCACGTC-TGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTGGATCTCAGTAT-ATGCTTGGTTCCACTCGGCGTGATAAGT-ATCACTCGCTGAGGACACCTTAA-AAAGTGGCC--- Ceratobasidium_sp._AGI_AJ419932 TGTGCACACCTCCTCTATTCATCCAC-ACACA-CC--TGTGAACTTGTG-AGACGG---------ATAGTAGCCC-----------TCCCGGGGGCGAG-GTCCGTCTGCT----------ATACATAAACTCCAGTATAT---AAATTTGAATGTCATTTGATGTAACACATCTATAA-ACTAAGTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCTCCTTGGTATTCCTCGGAGCATGCCTGTTTGAGTATCATGAAATCCTCAAAAT--AAATCTTTT-----------GTTCATTCGATCGA----TTTTATTTTGGACTTGGAGG----TCT--GCAGATT-CACGTC-TGCTCCTCTTAAATTCATTAGCTGGATCTGTATGA---ACTCGGTTCCACTCGGCGTGATAAGT-ATCACTCGCTGAGGACACTGT----AAAAGGTGGCC 'Ceratobasidium sp. AGI AV-2 AB196650' TGTGCACACCTCCTCTATTCATCCAC-ACACA-CC--TGTGAACTTGTG-AGACGG---------ATAGTAGCCC-----------TCTCGGGGGCGAG-GTCCGTCTGCT----------ATACATAAACTCCAGTATAT---AAATTTGAATGTCATTTGATGTAACACATCTATAA-ACTAAGTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCTCCTTGGTATTCCTCGGAGCATGCCTGTTTGAGTATCATGAAATCCTCAAAAT--AAATCTTTT-----------GTTCATTCGATCGA----TTTTATTTTGGACTTGGAGG----TCT--GCAGATT-CACGTC-TGCTCCTCTTAAATTCATTAGCTGGATCTGTATGA---ACTCGGTTCCACTCGGCGTGATAAGT-ATCACTCGCTGAGGACACTGT----AAAAGGTGGCC 'Ceratobasidium sp. AGI FKO-1-17 AB196651' TGTGCACGCCTCCTCTATTCATCCAC-ACACA-CC--TGTGAACTTGTG-AGACGG---------ATAGTAGCCC-----------TTTCGGGGGCGAG-GTCCGTCTGCT----------ATACATAAACTCCAATATAT---AAATTTGAATGTAATTTGATGTAACGCATCTTTAA-ACTAAGTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCTCCTTGGTATTCCTCGGAGCATGCCTGTTTGAGTATCATGAAATCCTCAAAAT--AAATCTTTT-----------GTTCATTCGATTGA----TTTTATTTTGGACTTGGAGG----CCT--GCAGATT-CACGTC-TGCTCCTCTTAAATGTATTAGCTGGATCTCAGTGA---ACTCGGTTCCACTCGGCGTGATAAGT-ATCACTCGCTGAGGACACTGT----AAAAGGTGGCC Ceratobasidium_sp._AGK_AB122145 TGTGCACGCCTTCTCTTTTCATCCAC-ACACA-CCCCTGTGCACTTGTG-AGACTGGA----------GACCGGT-----------AAAAAAAGTCTT----CAGTCTGCTAAAT------CCATATA?AAACCCATTTAAT-TGAA-CTGAATGTAAATTGATGTAACGCATCTTTAA-ACTAAGTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCTCCTTGGTATTCCTTGGAGCATGCCTGTTTGAGTATCATGAAATTCTCAAAGT--AAACCTTTT-----------GTTAATTCAACTGGT---CTTTGCTTTGGATTTGGAGG---CCTTT-GCAGATGTCACAGTCTGCTCCTCTTAAATAAATTAGCTGGATCTCAGTAT-ACACTTGGTTCCACTCGGCGTGATAAGT-ATCACTCGCTGAGGACACTGTTA-AAAA-GGTGGCC 'Ceratobasidium sp. AGK SH-10 AB196652' TGTGCACGCCTTCTCTTTTCATCCAC-ACACA-CCCCTGTGCACTTGTG-AGACTGGA----------GACCGGT-----------AAAAAAAGTCTT----CAGTCTGCTAAAT------CCATATACAAACCCATTTAAT-TGAA-CTGAATGTAAATTGATGTAACGCATCTTTAA-ACTAAGTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCAAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCTCCTTGGTATTCCTTGGAGCATGCCTGTTTGAGTATCATGAAATTCTCAAAGT--AAACCTTTT-----------GTTAATTCAACTGGT---CTTTGCTTTGGATTTGGAGG---CCTTT-GCAGATGTCACAGTCTGCTCCTCTTAAATAAATTAGCTGGATCTCAGTAT-ACACTTGGTTCCACTCGGCGTGATAAGT-ATCACTCGCTGAGGACACTGTTA-AAAA-GGTGGCC Ceratobasidium_sp._AGL_AF354093 TGTGCACGCCTTCTCTTT-CATCCAC-ACACA-CC--TGTGCACTTGTG-AGACGGA-----------GGG-CTT-----------TAATTAG-TCTT----CCGTCTACTTAA-------TCACACAA-ACTC-ATT-TAATTAAA-TTGAATGTAA-TTGATGTAACGCATCATTAGAACTAAGTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCTCCTTGGTATTCCTTGGAGCATGCCTGTTTGAGTATCATGAAATTCTCAAAGT--AAATCTTTT-----------GTTAATTCAACTGG-----TTTGCTTTGGACTTGGAGG---TCTTT-GCAGATTTCACGTC-TGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTGGATCTCAGTAT-ATGCTTGGTTCCACTCGGCGTGATAAGT-ATCACTCGCTGAGGACACCTTAA-AAAGTGGCC--- 'Ceratobasidium sp. AGL FKO-2-26 AB196665' TGTGCACGCCTTCTCTTT-CATCCAC-ACACA-CC--TGTG?ACTTGTG-AGACGGA-----------GGG-CTT-----------TAATTAG-TCTT----CCGTCTACTTAA-------TCACACAA-ACTC-ATT-TAATTAAA-TTGAATG?AA-TTGATGTAACG?ATCATTAGAACTAAGTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCTCCTTGGTATTCCTTGGAGCATGCCTGTTTGAGTATCATGAAATTCTCAAAGT--AAATCTTTT-----------GTTAATTCAACTGG-----TTTGCTTTGGACTTGGAGG---TCTTT-GCAGATTTCACGTC-TGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTGGATCTCAGTAT-ATGCTTGGTTCCACTCGGCGTGATAAGT-ATCACTCGCTGAGGACACCTTAA-AAAGTGGCC--- Ceratobasidium_sp._AGO_AF354094 TGTGCACGCCTTCTCTTT-CATCCAC-ACACA-CC--TGTGCACTTGTG-AGACGGA-----------GGGACTT-----------TAATTAG-TCTT----CCGTCTACTTAA-------TTACACAA-ACTC-ATT-TAATTAAA-TTGAATGTAA-TTGATGTAACGCATCATTAGAACTAAGTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCTCCTTGGTATTCCTTGGAGCATGCCTGTTTGAGTATCATGAAATTCTCAAAGT--AAATCTTTT-----------GTTAATTCAACTGG-----TTTGCTTTGGACTTGGAGG---TCTTT-GCAGATTTCACCTC-TGCTCCTCTTAAATTCATTAGCTGGATCTCAGTAT-ATGCTTGGTTCCACTCGGCGTGATAAGT-ATCACTCGCTGAGGACACTGTAA-AAAGTGGCC--- 'Ceratobasidium sp. AGP C-578 AB196654' ?GGGCCC?CC?T???TTT-C??CC?C-CC?CC-CC--?G?GCCCCTGTG-??GCCG??G-------GCTGGAGTTCTTTATTAATTTATTGAACTCCTAACTCTGTCTACTTAAT------TTACACACCACTCTATTTAATTTAAA-CTGAATGTAA-TTGATGTAACGCATC--TAATACTAAGTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCTCCTTGGTATTCCTTGGAGCATGCCTGTTTGAGTATCATGAAATCTTCAAAGT--A?ACCTTTT-----------GTTAATTCAATTGGT--TCCTTACTTTGGTATTGGAGG---TCTTT-GCAGCTT-CACACC-TGCTCCTCTTTG-TTCATTAGCTGGATCTCAGTGTTATGCTTGGTTCCACTCAGCGTGATAAGT-ATCTATCGCTGAGGACACT-GTA-AAAA-GGTGGCC 'Ceratobasidium sp. AGP C-579 AB196655' TGTGCACACCTTCTCTTT-CATCCACACCACA-CC--TGTGCACTTGTG-AGACAGAT--------GTGGGGACT----------TTATTGGACCCTG---TCTGTCTACTTAAT------CTACATAA-ACTCTATTTAATTTAAA-CTGAATGTAA-TTGATGTAACGCATC--TAATACTAAGTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCTCCTTGGTATTCCTTGGAGCATGCCTGTTTGAGTATCATGAAATCTTCAAAGT--AAACCTTTT-----------GTTAACTCAACTGGT--TCCTTACTTTGGTATTGGAGG---TCTTT-GCAGCTT-CACACC-TGCTCCTCTTTG-TTCATTAGCTGGATCTCAGTGTTATGCTTGGTTCCACTCAGCGTGATAAGT-ATCTATCGCTGAGGACACCCGTA-AAAAAGGTGGCC Ceratobasidium_sp._AGR_AJ427407 TGTGCACACCTTCTCTTT-CATCCAC-ACACA-CC--TGTGAACTTGTG-AGGCAGATTTGCTCTTTGGGGACTTTAACTAGAAACCAATTAG--CTG----CTGTCTACTTAAT------TTACACAA-ACTCTATTTATTTTAAA-ACGAATGTAA-TTGATGTAACGCATC--TAATACTAAGTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCTCCTTGGTATTCCTTGGAGCATGCCTGTTTGAGTATCATGAAATCTTCAAAGT--CAATCTTTT-----------GTTAACTCAATTGGT----TGTGCTTTGGTATTGGAGGTA--TATT-GCAGCTTTCACACCCTGCTCCTCTTTG-TGCATTAGCTGGATCTCGGTGTTATGCTTGGTTCCACTCGGCGTGATAAGTTATCTATCGCTGAGGACACTATTA-AAAATGGTGGCC Ceratobasidium_sp._AGS_AJ427400 TGTGCACGCC-TTCTCTT-CATCCAC-ACAC--CCC-TGTGCACTCGTG-AGACAGAGGCA----TTTGTTTT-CCTTTAATCGGGGAACG-G---------GTCTCTGTCTA-CA-----TCACATAAAATCTAATTTATTTAAAA-CTGAATGTAATT-GATGTAACGCATCT--AATACAAAGTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCTCCTTGGTATTCCTCGGAGCATGCCTGTTTGAGTATCATGAAATTCTCAAAGC-AA-GTCTTTT-----------GTTAATTCGATC----GGCTCTGCTTTGGACTTGGGGG----CTT--GCAGATTCACG--TCTGCTCCTCTTAAATACATTAGCTGGATCTCCCTGA---ACTTGGTTCCACTCGGCGTGATAAGT-ATCACTCGCTGAGGACACCCGTA-AAAAAGGTGGCC Ceratobasidium_sp._AGS_S5_AB196656 TGTGCACGCC-TTCTCTTTCATCCAC-ACAC--CCC-TGTGCACTCGTG-AGACAGAGGCA----TTTGTTTT-CCTTTAATCGGGGAACG-G---------GTCTCTGTCTA-CA-----TCACATAAAATCTAATTTATTTAAAA-CTGAATGTAATT-GATGTAACGCATCT--AATACAAAGTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCTCCTTGGTATTCCTCGGAGCATGCCTGTTTGAGTATCATGAAATTCTCAAAGC-AA-GTCTTTT-----------GTTAATTCGATC----GGCTCTGCTTTGGACTTGGGGG----CTT--GCAGATTCACG--TCTGCTCCTCTTAAATACATTAGCTGGATCTCCCTGA---ACTTGGTTCCACTCGGCGTGATAAGT-ATCACTCGCTGAGGACACCCGTA-AAAAAGGTGGCC 'Ceratobasidium sp. 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AGU MWR-20 AB196664' TGTGCACACCTTCTCTTTTCATCCAC-ACACA-CC--TGTGCACTTGTG-AGACAGACT-------GTGGGGACT----------TTATTGAACCCCG---TCTGTCTACTTAAT------TTACACACCACTCTATTTAATTTAAA-CTGAATGTAA-TTGATGTAACGCATC--TAATACTAAGTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCTCCTTGGTATTCCTTGGAGCATGCCTGTTTGAGTATCATGAAATCTTCAAAGT--AAACCTTTT-----------GTTAATTCAATTGG?--TCCTTACTTTGGTATTGGAGG---TCTTT-GCAGTTT-CACAAC-TGCTCCTCTTTG-TTCATTAGCTGGATCTCAGTGTTATGCTTGGTTCCACTCGGCGTGATAAGT-ATCTATCGCTGAGGACACTTGTA-AAAA-GGTGGCC 'Ceratobasidium sp. AGU MWR-22 AB196666' TGTGCACACCTTCTCTTTTCATCCAC-ACACA-CC--TGTGCACTTGTG-AGACAGACT-------GTGGGGACT----------TTATTGAACCCCG---TCTGTCTACTTAAT------TTACACACCACTCTATTTAATTTAAA-CTGAATGTAA-TTGATGTAACGCATC--TAATACTAAGTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCTCCTTGGTATTCCTTGGAGCATGCCTGTTTGAGTATCATGAAATCTTCAAAGT--AAACCTTTT-----------GTTAATTCAATTGG?--TCCTTACTTTGGTATTGGAGG---TCTTT-GCAGTTT-CACAAC-TGCTCCTCTTTG-TTCATTAGCTGGATCTCAGTGTTATGCTTGGTTCCACTCGGCGTGATAAGT-ATCTATCGCTGAGGACACTTGTA-AAAA-GGTGGCC 'Ceratobasidium sp. AGU MWR-24 AB196665' TGTGCACACCTTCTCTTT-CATCCAC-ACACA-CC--TGTGCACTTGTG-AGACAGACT-------GTGGGGACT----------TTATTGAACCCCG---TCTGTCTACTTAAT------TTACACACCACTCTATTTAATTTAAA-CTGAATGTAA-TTGATGTAACGCATC--TAATACTAAGTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCTCCTTGGTATTCCTTGGAGCATGCCTGTTTGAGTATCATGAAATCTTCAAAGT--AAACCTTTT-----------GTTAATTCAATTGG?--TCCTTACTTTGGTATTGGAGG---TCTTT-GCAGTTT-CACAAC-TGCTCCTCTTTG-TTCATTAGCTGGATCTCAGTGTTATGCTTGGTTCCACTCGGCGTGATAAGT-ATCTATCGCTGAGGACACTTGTA-AAAA-GGTGGCC Thanatephorus_cucumeris TGTGCACACCTTCTCTTT-CATCCATCACACC-CCC-TGTGCACTTGTG-AGACAGCAA-------TAGTTGGTG-------GATTTAATTCCATCCATTTGCTGTCTACTTAAT------TTACACAC-ACTCTACTTAATTTAAA-CTGAATGTAA-TTGATGTAACGCATC--TAATACTAAGTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCTCCTTGGTATTCCTTGGAGCATGCCTGTTTGAGTATCATGAAATCTTCAAAGT--AAACCTTTT-----------GTTAATTCAATTGGTCTTTTTTACTTTGGTTTTGGAGGATCTTATT-GCAGCTT-CACACC-TGCTCCTCTTTG-TGCATTAGCTGGATCTCAGTGTTATGCTTGGTTCCACTCGGCGTGATAAGTTATCTATCGCTGAGGACACCCGTA-AAAAAGGTGGCC ; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = ITS) = N: 1-537; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = ITS) = N: 1-537; END; BEGIN TREES; TITLE Tb7334; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Ceratobasidium_sp._AGA_AF354092, 2 'Ceratobasidium sp. 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AGK SH-10 AB196652', 26 Ceratobasidium_sp._AGL_AF354093, 27 'Ceratobasidium sp. AGL FKO-2-26 AB196665', 28 Ceratobasidium_sp._AGO_AF354094, 29 'Ceratobasidium sp. AGP C-578 AB196654', 30 'Ceratobasidium sp. AGP C-579 AB196655', 31 Ceratobasidium_sp._AGR_AJ427407, 32 Ceratobasidium_sp._AGS_AJ427400, 33 Ceratobasidium_sp._AGS_S5_AB196656, 34 'Ceratobasidium sp. AGT 1Fuk-600', 35 'Ceratobasidium sp. AGT 2Shi-1999', 36 'Ceratobasidium sp. AGT 3Iba-1000', 37 'Ceratobasidium sp. AGT 4OIT-800', 38 'Ceratobasidium sp. AGT Aic-400 AB196660', 39 'Ceratobasidium sp. AGU MWR-20 AB196664', 40 'Ceratobasidium sp. AGU MWR-22 AB196666', 41 'Ceratobasidium sp. AGU MWR-24 AB196665', 42 Thanatephorus_cucumeris; TREE Fig._6 = [&R] (42,((12,31),((11,((30,29),(39,(40,41)))),(((15,(16,(13,14))),(28,(26,(20,27)))),(((6,((4,5),(32,33))),((7,(23,((19,(17,18)),(21,22)))),(10,(8,9)))),((24,25),((3,(1,2)),(36,((34,38),(35,37)))))))))); END;