#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on March 28, 2024; 10:20 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Unmack P.J., Hammer M., Adams M., Johnson J., & Dowling T.E. 2013. The Role of Continental Shelf Width in Determining Freshwater Phylogeographic Patterns in Southeastern Australian Pygmy Perches (Teleostei: Percichthyidae). Molecular Ecology, 22(6): 1683–1699. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S13674] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=37; TAXLABELS Nannoperca_australis.10_Barmah Nannoperca_australis.14_Lachlan Nannoperca_australis.15_Henry Nannoperca_australis.2_Tookayerta Nannoperca_australis.24_Glenelg Nannoperca_australis.27_Wattle_Hill Nannoperca_australis.37_Curdies Nannoperca_australis.38_Gellibrand Nannoperca_australis.39_Kennedy Nannoperca_australis.40_Pirron_Yaloak Nannoperca_australis.41_Mundy Nannoperca_australis.42_Gnarkeet Nannoperca_australis.45_Deanes Nannoperca_australis.48_Thompson.6A Nannoperca_australis.48_Thompson.7 Nannoperca_australis.51_Woori_Yallock Nannoperca_australis.6_Mount_Cole Nannoperca_australis.60_Freshwater Nannoperca_australis.79_Gladstone 'Nannoperca australis.genbank NC_015542.1' Nannoperca_flindersi_72_Maramingo Nannoperca_flindersi_82_Flinders Nannoperca_flindersi.66_Merrimans Nannoperca_flindersi.68_Prospect Nannoperca_flindersi.70_Snowy Nannoperca_flindersi.81_Ansons.1 Nannoperca_flindersi.81_Ansons.2 Nannoperca_obscura.18_Bonney Nannoperca_obscura.28_Surrey Nannoperca_obscura.3_Finniss Nannoperca_obscura.37_Curdies Nannoperca_obscura.50_Deep 'Nannoperca obscura.genbank NC_015545.1' Nannoperca_vittata.Doggerup Nannoperca_vittata.Gingin Nannoperca_vittata.Margaret Nannoperca_vittata.Mitchell ; END; BEGIN TAXA; TITLE Taxa2; DIMENSIONS NTAX=98; TAXLABELS Nannoperca_australis.1_Inman_1 Nannoperca_australis.1_Inman_2 Nannoperca_australis.10_Barmah_3 Nannoperca_australis.10_Barmah_4 Nannoperca_australis.10_Barmah_5 Nannoperca_australis.11_Yea_1 Nannoperca_australis.11_Yea_2 Nannoperca_australis.11_Yea_3 Nannoperca_australis.13_Coppabella_Nau_11 Nannoperca_australis.14_Lachlan Nannoperca_australis.15_Henry Nannoperca_australis.19_Ewens_1 Nannoperca_australis.2_Tookayerta Nannoperca_australis.20_Piccaninnie_2 Nannoperca_australis.23_Wannon_1 Nannoperca_australis.24_Glenelg_1 Nannoperca_australis.24_Glenelg_2 Nannoperca_australis.24_Glenelg_3 Nannoperca_australis.25_Monibeong Nannoperca_australis.26_Bridgewater Nannoperca_australis.27_Wattle_Hill Nannoperca_australis.3_Finniss Nannoperca_australis.30_Shaw_1 Nannoperca_australis.30_Shaw_3 Nannoperca_australis.31_Merri_1 Nannoperca_australis.31_Merri_4 Nannoperca_australis.34_Fiery_1 Nannoperca_australis.34_Fiery_2 Nannoperca_australis.34_Fiery_3 Nannoperca_australis.35_Mount_Emu_5 Nannoperca_australis.36_Trewalla_1 Nannoperca_australis.37_Curdies_3 Nannoperca_australis.37_Curdies_Nau_22 Nannoperca_australis.38_Gellibrand_1 Nannoperca_australis.39_Kennedy_1_Nau_23 Nannoperca_australis.39_Kennedy_3 Nannoperca_australis.39_Kennedy_6 Nannoperca_australis.4_McKenzie Nannoperca_australis.40_Pirron_Yaloak_4 Nannoperca_australis.40_Pirron_Yaloak_Nau_24 Nannoperca_australis.41_Mundy_1 Nannoperca_australis.42_Gnarkeet_1 Nannoperca_australis.43_Woady_Yallock Nannoperca_australis.44_Kuruc_A_Ruc_1 Nannoperca_australis.45_Deanes_1 Nannoperca_australis.45_Deanes_2 Nannoperca_australis.46_Barongarook_1 Nannoperca_australis.48_Thompson_2 Nannoperca_australis.48_Thompson_7 Nannoperca_australis.49_Waurn_Ponds_1 Nannoperca_australis.49_Waurn_Ponds_2 Nannoperca_australis.50_Deep Nannoperca_australis.51_Woori_Yallock Nannoperca_australis.53_Powlett Nannoperca_australis.55_Coalition_1 Nannoperca_australis.57_Berrys_3 Nannoperca_australis.57_Berrys_5 Nannoperca_australis.58_Darby Nannoperca_australis.59_Miranda Nannoperca_australis.6_Mount_Cole Nannoperca_australis.60_Freshwater Nannoperca_australis.62_Billy Nannoperca_australis.7_Wimmera_2b Nannoperca_australis.7_Wimmera_4 Nannoperca_australis.76_Macquarie Nannoperca_australis.79_Gladstone_2 Nannoperca_australis.8_Middle_Nau_9 Nannoperca_australis.80_Icena_1 Nannoperca_australis.9_Jews_Harp_2 Nannoperca_australis.9_Jews_Harp_Nau_10 Nannoperca_flindersi.61_Pebble Nannoperca_flindersi.66_Merrimans_1_Nau_29 Nannoperca_flindersi.66_Merrimans_2 Nannoperca_flindersi.66_Merrimans_3 Nannoperca_flindersi.67_Morwell_2 Nannoperca_flindersi.68_Prospect_1 Nannoperca_flindersi.68_Prospect_3 Nannoperca_flindersi.69_Stony_1 Nannoperca_flindersi.70_Snowy_1 Nannoperca_flindersi.70_Snowy_4 Nannoperca_flindersi.71_Yeerung_1 Nannoperca_flindersi.71_Yeerung_2 Nannoperca_flindersi.72_Maramingo_Nau_30 Nannoperca_flindersi.81_Ansons_Nau_28 Nannoperca_flindersi.82_Flinders_2 Nannoperca_obscura.18_Bonney_1_p Nannoperca_obscura.21_Stokes_Nob_17_o Nannoperca_obscura.28_Surrey_Nob_20_l Nannoperca_obscura.29_Fitzroy_1 Nannoperca_obscura.3_Finniss_2_v Nannoperca_obscura.35_Mount_Emu_Nob_21_m Nannoperca_obscura.37_Curdies_1_e Nannoperca_obscura.42_Gnarkeet_Nob_25_f Nannoperca_obscura.50_Deep_5_a Nannoperca_vittata.Doggerup Nannoperca_vittata.Gingin Nannoperca_vittata.Margaret Nannoperca_vittata.Mitchell ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M15290] TITLE mtDNA_Nannoperca_data; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=5699; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=n GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1750 1760 1770 1780 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. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Nannoperca_australis.10_Barmah 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Nannoperca_australis.14_Lachlan 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Nannoperca_australis.15_Henry 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Nannoperca_australis.2_Tookayerta 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Nannoperca_australis.24_Glenelg 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Nannoperca_australis.27_Wattle_Hill 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Nannoperca_australis.37_Curdies 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Nannoperca_australis.38_Gellibrand 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Nannoperca_australis.39_Kennedy 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Nannoperca_australis.41_Mundy 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Nannoperca_australis.48_Thompson.6A 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Nannoperca_obscura.28_Surrey 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Nannoperca_obscura.3_Finniss 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Nannoperca_vittata.Doggerup 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Nannoperca_vittata.Gingin 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Nannoperca_vittata.Margaret 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Nannoperca_vittata.Mitchell 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Nannoperca_australis.60_Freshwater 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Cytb_Nannoperca_Result; LINK TAXA = Taxa2; TRANSLATE 1 Nannoperca_australis.1_Inman_1, 2 Nannoperca_australis.1_Inman_2, 3 Nannoperca_australis.2_Tookayerta, 4 Nannoperca_australis.3_Finniss, 5 Nannoperca_australis.4_McKenzie, 6 Nannoperca_australis.6_Mount_Cole, 7 Nannoperca_australis.7_Wimmera_2b, 8 Nannoperca_australis.7_Wimmera_4, 9 Nannoperca_australis.8_Middle_Nau_9, 10 Nannoperca_australis.9_Jews_Harp_Nau_10, 11 Nannoperca_australis.9_Jews_Harp_2, 12 Nannoperca_australis.10_Barmah_3, 13 Nannoperca_australis.10_Barmah_4, 14 Nannoperca_australis.10_Barmah_5, 15 Nannoperca_australis.11_Yea_1, 16 Nannoperca_australis.11_Yea_2, 17 Nannoperca_australis.11_Yea_3, 18 Nannoperca_australis.13_Coppabella_Nau_11, 19 Nannoperca_australis.14_Lachlan, 20 Nannoperca_australis.15_Henry, 21 Nannoperca_australis.19_Ewens_1, 22 Nannoperca_australis.20_Piccaninnie_2, 23 Nannoperca_australis.23_Wannon_1, 24 Nannoperca_australis.24_Glenelg_1, 25 Nannoperca_australis.24_Glenelg_2, 26 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