#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on March 29, 2024; 2:33 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Simurda M., Marshall D., & Knox J. 2005. Phylogeography of the narrow endemic, Helenium virginicum (Asteraceae), based upon ITS sequence comparisons. Systematic Botany, null. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S1368] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=25; TAXLABELS Helenium_amarum Helenium_autumnale_AFMO Helenium_autumnale_BSP Helenium_autumnale_FRC Helenium_autumnale_GI Helenium_autumnale_JT Helenium_autumnale_MFA Helenium_autumnale_NG Helenium_autumnale_OO Helenium_autumnale_PFM Helenium_autumnale_POM_4 Helenium_autumnale_SFWV Helenium_autumnale_WL Helenium_autumnale_YPC_2 Helenium_bigelovii Helenium_flexuosum_BL Helenium_flexuosum_CHS Helenium_flexuosum_DC Helenium_flexuosum_PLT Helenium_flexuosum_YPC_2 Helenium_virginicum_FLD Helenium_virginicum_GROT_1 Helenium_virginicum_GROT_3 Helenium_virginicum_GRV Helenium_virginicum_RX ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M1464] TITLE 'Helenium ITS-1 and ITS-2'; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=485; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= :; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Helenium_amarum TCGACCTCTGAATAGCA?AACAACTTGTCAACAAATACATACAACATG{AG}CT{GT}ATCGA{AG}CATC{AT}{AG}{GT}CTTTAGG???TTTGAGACTCGTGAAGCCTTGTCGTCATGTGTTCATGGTTTCCTTGTAAGAGGATCATGGGCATTATGTCGGCACAAGAACAAACATCCGGCACGACATGTGCCAAGGAAATCCCAACTTAAGATGGCTAGTGCAATGATGCCCCGTTTACGGTGTGTGC?ATTTGCATGTGGCTTCTTTGTAATGAATCACAATGCCCCCACCAAACGTCCTATCCAGGGATGTGTGTGGTAGGGG?CGGATATTGGTCTCCTGTGCTTGTTGTGTGGTTGAC?TAAATACGAGTCCCTTCAAGATGGACACATGATTAGTGGTGGTTGATAACACAGTCGTCTTATGTTGTGTGTTATGATCTTGGAGGGATCAACTCTTTGAGCACCCTGTCG?GTTGTCTTATGATGATGCTTCGA Helenium_autumnale_AFMO TCGAAACCTGCATAGCAGAACAACTTGTGAACAAGTACTTA{CT}AACATGGCTTTTCGAGCATCAGGCCTTTGG???TTTGAGACTTGTGAAGCCTTGTCGTCATGTGTTCGTG{AG}TTTCCTTGTAAGAGGATCATGGGCATTATGTCGGCACAAGAACAAACCTCCGGCACGGTATGTGCCAAGGAATTTCAAACTTAAGATGGCTAGTGCAATGATGCCCCGTTTACGGTGTGTGC?ATTTGCATGTTGCTTCTTTGTAATCAATCACAACGCCCCCACCAAACTTCCTATCTAGGGAT?TATGCGGTAGGGGGCGGAGATTGGTCTCCTGTGCTTGTTGTGTGGTTGACCTAAATATGGGTTCCTTCAAGATGGACACATGATTAGTGGTGGTTGATAACACCGTCGTCTCGTGTTGTGTGTTATGATCTTGGAGGGATTAACTCTTTGAGCACCCTGTCGTGTTGTCTTATGATGATGCATCGA Helenium_autumnale_BSP TCG????????????CAGA{AG}???????T{CG}AACAAGTACTTACAACATGGCGTTTCGAGCATCAGGCCTTTGG???TTTGAGACTTGTGAAGCCTTGTCGTCATGTGTTCGTGGTTTCCTTCTAAGAGGATCATGGGCATTATGTCGGCACAAGAACAAACCTCCGGCACGGTATGTGCCAAGGAATTTCAAACTTAAGATGGCTAGTGCAATGATGCCCCGTTTACGGTGTGTGC?ATTTGCATGT{GT}GCTTCTTTGTAATCAATCACAACGCCCCCACCAAACTTCCTATCTAGGGATGTATGCGGTAGGGGGCGGAGATTGGTCTCCTGTGCT{CT}GTTGTGTGGT{AT}GACCTAAATATGGGTTCCTTTAAGATGGACACATGATTAGTGGTGGTTGATAACACA?????C???TGT{GT}GTGTGTTATGATCTTGGAGGGATTAACTCTTTGAGCACCCTGTCGTGTCGTCTTATGATGATGCATCGA Helenium_autumnale_FRC ??????????????????????????????????????????????????????????CATCAGGCCTTTGG???TTTGAGACTTGTGAAGCCTTGTCGTCATGTGTTCGTGGTTTCCTTGTAAGAGGATCATGGGCATTATGTCGGCACAAGAACAAACCTCCGGCACGGTATGTGCCAAGGAATTTCAAACTTAAGATGGCTAGTGCAA{CT}GATGCCCCGTTTACGGTGTGTGC?ATTTGCATGTTGCTTCTTTGTAATCAATCACAACGCCCCCACCAAACTTCCTAT?TA{CG}GGATGTCTCGGGTAGGGGGCGGA?ATTGGTCTCC?GTGCTTG????GTGGTT??CCTAA?TATGGGT{CT}CCTTCA????GGACACA??????GTGGTG???????????????????????TTGTGT???????????GGAGGGATTAAC?????????????????????????????????????????? Helenium_autumnale_GI TCGAAACCTGCATAGCAGAACAACTTGTGAACAAGTACTTACAACATGGCTTTTCGAGCATCAGGCCTTTGG???TTTGAGACTTGTGAAGCCTTGTCGTCATGTGTTCGTGGTTTCCTTGTAAGAGGATCATGGGCATTATGTCGGCACAAGAACAAACCTCCGGCACGGTATGTGCCAAGGAATTTCAAACTTAAGATGGCTAGTGCAATGATGCCCCGTTTACGGTGTGTGC?ATTTGCATGTTGCTTCTTTGTAATCAATCACAACGCCCCCACCAAACTTCCTATCTAGGGATGTATGCGGTAGGGGGCGGAGATTGGTCTCCTGTGCTTGTTGTGTGGTTGACCTAAATATGGGTTCCTTCAAGATGGATACATGATTAGTGGTGGTTGATAACACAGTCGTCTCGTGTTGTGTGTTATGATCTTGGAGGGATTAACTCTTTGAGCACCCTGTCGTGTTGTCTTATGATGATGCATCGA Helenium_autumnale_JT TCGAAACCTGCATAGCAGAACAACTTGTGAACAAGTACTTACAACATGGCTTTTCGAGCATCAGGCCTTTGG???TTTGAGACTTGTGAAGCCTTGTCGTCATGTGTTCGTGGTTTCCTTGTAAGAGGATCATGGGCATTATGTCGGCACAAGAACAAACCTCCGGCACGGTATGTGCCAAGGAATTTCAAACTTAAGATGGCTAGTGCAATGATGCCCCGTTTACGGTGTGTGC?ATTTGCATGTTGCTTCTTTGTAATCAATCACAACGCCCCCACCAAACTTCCTATCTAGGGATGTATGCGGTAGGGGGCGGAGATTGGTCTCCTGTGCTTGTTGTGTGGTTGACCTAAATATGGGTTCCTTCAACATGGACACATGATTAGTGGTGGTTGATAACACAGTCGTCTCGTGTTGTGTGTTATGATCTTGGAGGGATTAACTCTTTGAGCACCCTGTCGTGTTGTCTTATGATGATGCATCGA Helenium_autumnale_MFA TCGAAACCTGCATAGCAGAACAACTTGTGAACAAGTACTTACAACATGGCTTTTCGAGCATCAGGCCTTTGG???TTTGAGACTTGTGAAGCCTTGTCGTCATGTGTTCGTGGTTTCCTTGTAAGAGGATCATGGGCATTATGTCGGCACAAGAACAAACCTCCGGCACGGTATGTGCCAAGGAATTTCAAACTTAAGATGGCTAGTGCAATGATGCCCCGTTTACGGTGTGTGC?ATTTGCATGTTGCTTCTTTGTAATCAATCACAACGCCCCCACCAAACTTCCTATCTAGGGATGTATGCGGTAGGGGGCGGAGATTGGTCTCCTGTGCTTGTTGTGTGGTTGACCTAAATATGGGTTCCTTGAAGATGGACACATGATTAGTGGTGGTTGATAACACAGTCGTCTCGTGTTGTGTGTTATGATCTTGGAGGGATTAACTCTTTGAGCACCCTGTCGTGTTGTCTTATGATGATGCATCGA Helenium_autumnale_NG TCGAAACCTGCATAGCAGAACAACTTGTGAACAAGTACTTACAACATGGCTTTTCGAGCATCAGGCCTTTGG???TTTGAGACTTGTGAAGCCTTGTCGTCATGTGTTCGTGGTTTCCTTGTAAGAGGATCATGGGCATTATGTCGGCACAAGAACAAACCTCCGGCACGGTATGTGCCAAGGAATTTCAAACTTAAGATGGCTAGTGCAATGATGCCCCGTTTACGGTGTGTGC?ATTTGCATGTTGCTTCTTTGTAATCAATCACAACGCCCCCACCAAACTTCCTATCTAGGGATGTATGCGGTAGGGGGCGGAGATTGGTCTCCTGTGCTTGTTGTGTGGTTGACCTAAATATGGGTTCCTTCAAGATGGACACATGATTAGTGGTGGTTGATAACACAGTCGTCTCGTGTTGTGTGTTATGATCTTGGAGGGATTAACTCTTTGAGCACCCTGTCGTGTTGTCTTATGATGATGCATCGA Helenium_autumnale_OO TCGAAACCTGCATAGCAGAACAACTTGTGAACAAGTACTTACAACATGGCTTTTCGAGCATCAGGCCTTTGG???TTTGAGACTTGTGAAGCCTTGTCGTCATGTGTTCGTGGTTTCCTTGTAAGAGGATCATGGGCATTATGTCGGCATAAGAACAAACCTCCGGCACGGTATGTGCCAAGGAATTTCAAACTTAAGATGGCTAGTGCAATGATGCCCCGTTTACGGTGTGTGC?ATTTGCATGTTGCTTCTTTGTAATCAATCACAACGCCCCCACCAAACTTCCTATCTAGGGATGTATGCGGTAAGGGGCGGAGATTGGTCTCCTGTGCTTGTTGTGTGGTTGACCTAAATATGGGTCC{CT}TTCAAGATGGACACATGATTAGTGGTGGTTGATAACACAGTCGTCTCGTGTTGTGTGTTATGATCTTGGAGGGATTAACTCTTTGAGAACCCTGTCGTGTTGTCTTATGATGATGCTTCGA Helenium_autumnale_PFM ???????????????????????????????CA{AG}G{AT}ACTTACAA?ATGGC?????GAGCATCAGGCCTTTGG???TTTGAGACTTGTGAAGCCTTGTCGTCATGTGTTCGTGGTTTCCTTGTAAGAGGATCATGGGCATTATGTCGGCACAAGAACAAACCTCCGGCACGGTATGTGCCAAGGAATTTCAAACTTAAGATGGCTAGTG{CT}AATGATGCCCCGTTTACGGTGTGTGC?ATTTGCATGT{GT}GCTTCTTTGTAATCAATCACAACGCCCCCACCAAATT?CCTATCTAGGGATGTATGCGGTAGGGGGCGGAAATTGGTCTCCTGTGCT?GTTG?GTGGT??ACCTAAATATGGGTTCCTTCAAGATGGACACATGAT{CT}AGTGGTGGTTGATAAC?CA?TCG?C?C?TGTTGTGTGTTATGATCTTGGAGGGATTAACTCTTTGAGCACCCTG???TGTTGTCTTATGATGATGCATCGA Helenium_autumnale_POM_4 TCGAAACCTGCATAGCAGAACAACTTGTGAACAAGTATTTACAACATGGCTTTTCAAGCATCAGACCTTTGG???TTTGAGACTTGTGAAGCCTTGTCGTCATGTGTTCGTGGTTTCCTTGTAAGAGGATCATGGGCATTATGTCGGCATAAGAACAAACCTCCGGCACGGCATGTGCCAAGGAATTTCAAACTTAAGATGGCTAGTGCAATGATGCCCCGTTTACGGTGTGTGCCATTTGCATGT?GCTTCTTTGTAATCAATCACAACGCCCCCACCAAACTTCCTATCTAGGGATGTATGCGGTAAGGGGCGGAGATTGGTCTCCTGTGCTTGTTGTGTA?TTGACCTAAATATGGGTCCTTTCAAGATGGACACATGATTACTGGTGGTTGATAACACAGTCGTCTCGTGTTGTGTGTTATGATCTTGGAGGGATTAACTCTTTGAGAACCCTGTCGTGTTGTCTTATGATGATGCTTCGA Helenium_autumnale_SFWV TCGAAACCT{AG}CATAGCAGAACAACTTGTGAACAAGTACTTACAACATGGCTTTTCGAGCATCAGGCCTTTGG???TTTGAGACTTGTGAAGCCTTGTCGTCATGTGTTCGTGGTTTCCTTGTAAGAGGATCATGGGCATTATGTCGGCACAAGAACAAACCTCCGGCACGGTATGTGCCAAGGAATTTCAAACTTAAGATGGCTAGTGCAATCATGCCCCGTTTACGGTGTGTGC?ATTTGCATGTTGCTTCTTTGTAATCAATCACAACGCCCCCACCAAACTTCCTATCTAGGGATGTATGCGGTAGGGGGCGGAGATTGGTCTCCTGTGCTTGTTGTGTGGTTGACCTAAATATGGGTTCCTTCAACATGGACACATGATTAGTGGTGGTTGATAACACAGTCGTCTCGTGTTGTGTGTTATGATCTTGGAGGGATTAACTCTTTGAGCACCCTGTCGTGTTGTCTTATGATGATGCATCGA Helenium_autumnale_WL ?????????????????????????????????????C?TACAACATGG?TTTT?GAGCATCACGCCTTTGG???TTTGAGACTTGTGAAGCCTTGTCGTCATGTGTTCGTGGTTTCCTTGTAAGAGGATCATGGGCATTATGTCGGCACAAGAACAAACCTCCGGCACGGTATGTGCCAAGGAATTTCAAACTTAAGATGGCTAGTGCAATGATGCCCCGTTTACGGTGTGTGC?ATTTGCATGTTGCTTCTTTG?AATCAATCACAACGCCCCCACCAAACTTCCTATCTAGGGATGTATGCGGTAGGGGGCGGAGATTGGTCTCCTGTGCTTGTTGTGTGG{CT}TGACCTAAATATGGGTTCCTTCAAGATGGACAC?TGATTAGTGGTGGTTGATAACACAGTCGTCTCG?GTTGTGTGTT??GATCTTGGAGGGATTAACTCTTTGA?CACCCTGTC???TTGTCTTA??ATGAT??ATC?A Helenium_autumnale_YPC_2 TCGAAACCTGCATAGCAGAACAACTTGTGAACAAGTACTTACAACATGGCTTTTCGAGCATCAGGCCTTTGG???TTTGAGA{AC}T{AT}GTGAAGCCTTGTCGTCATGTGTTCGTGGTTTCCTTGTAAGAGGATCATGGGCAT{CT}ATGTCGGCACAAGAACAAACCTCCGGCACGGTATGTGCCAAGGAATTTCAAACTTAAGATGGCTAGTGCAATGATGCCCCG{CT}{CT}{GT}ACGG{CT}GTGTGC?AT{CT}{AT}{GT}CATGTTG{CT}T{GT}CTT{CT}GTAATCAATCA{CT}AACGCCCCCACCAAA{AC}TTCCTATCTAGGGATGTATGCGGTAGGGGGCGGAGATTGGTCTCCTGTGCTTGTTGTGTGGT{GT}GACCTAAATATGGGT{GT}CCTTCAAGATGGACACATGATTAGTGGTGGTTGATAACACAG{CT}CGTCTCGTGTTGTGTGTTATGATC{AT}TGGAGGGAT{GT}AACTCTTCGAGCACCC{CT}G{CT}CGTGTTGTCTT{AC}T{GT}A{AT}GA{AT}G{CG}????A Helenium_bigelovii TCGAAACCTGCATAGCAGAACAACTTGTGAACAAGTACTTACAACATGACTTTTCGAGCATCAGGCCTTTGG???TTTGAGACTTGTGAAGCCTTGTCGTCATGTGTTCGTGGTTTCCTTGTAAGAGGATCATGGGCATTATGTCGGCACAAGAACAAACCTCCGGCACGGCATGTGCCAAGGAATTTCAAACTTAAGATGGCTAGTGCAATGATGCCCCGTTTACGGTGTGTGC?ATTTGCATGTTGCTTCTTTGT?ATAAATCACAA{CT}GCCCCCACCAAACTTCCTATCTAGGGATGTATGTGGTAGGGGGCGGAGATTGGTCTCCTGTGCTTGTTGTGTGGTTGACCTAAATATGGGTCCCTTCAAGATGGACACATGATTAGTGGTGGTTGATAACACAGTCGTCT{CT}GTGTTGTGTGTTATGATCTTGGAGGGATTAACTCTTTGAGCACCCTGTCGTGTTGTCTTATGATGA{CT}GCTTCGA Helenium_flexuosum_BL TCGAAACCTGCATAGCAGAACAACTTGTGAACAAGTACTTACAACATGGCTTTTTGAGCATCAGGCCTTTGGTGGTTTGAGACTTGTGAAGCCTTGTCGTCATGTGTTCGTGGTTTCCTTGTAAGAGGATCATGGGCATTATGTCGGCACAAGAACAAACATCCGGCACGGCATGTGCGAAGGAATTTCAAACTTAAGATGGCTAGTGCAATGATGCCCCGTTTACGGTGTGTGC?ATTTGCATGTTGCTTCTTTGTAATCAATCACAACGCCCCCACCAAACATCCTATCTAGGGATGTATGCGGTAGGGGGCGGAGATTGGTCTCCTGTGCTTGTTGTGTGGTTGACCTAAATATGGGTCCCTTCAAGATGGACACATGATTAGTGGTGGTTGATAA?ACAGTCGTCTCGTGTTGTGTGTTATGATCTTGGAGGGATTAACTCTTTGAGCACCCTGTCGTGTTGTCTTATGATGATGC?TCGA Helenium_flexuosum_CHS TCGAAACCTGCATAGC{AC}GAACAACTTGTGAACAAGTACTTACAACATGGCTTTTTGAGCATCAGGCCTTTGGTGGTTTGAGACTTGTGAAGCCTTGTCGTCATGTGTTCGTGGTTTCCTTGTAAGAGGATCATGGGCATTATGTCGGCACAAGAACAAACATCCGGCACGGCATGTGCCAAGGAATTTCAAACTTAAGATGGCTAGTGCAATGATGCCCCGTTTACGGTGTGTGC?ATTTGCATGTTGCTTCTTTGTAATCAATCACAACGCCCCCACCAAACATCCTATCTAGGGATGTATGCGGTAGGGGGCGGAGATAGGTCTCCTGT{CG}CTTGTTGTGTGGTTGACCTAAATATGGGTCCCTTCAAGATGGACACATGATTAGTGGTGGTTGATAACACAGTCGTCTCGTGTTGTGTGTTATGATCTTGGAGGGATT?ACTCTTTGAGCACCCTGTCGTGTTGTCTTATGATGATGCTTCGA Helenium_flexuosum_DC TCGAAACC?GCATAGCAGAACAACTTGTGAACAAGTACTTACAACATGGCTTTTTGAGCATCAGGCCTTTGGTGGTTTGAGACTTGTGAAGCCTTGTCGTCATGTGTTCGTGGTTTCCTTGTAAGAGGATCATGGGCATTATGTCGGCACAAGAACAAACATCCGGCACGGCATGTGCCAAGGAATTTCAAACTTAAGATGGCTAGTGCAATGATGCCCCGTTTACGGTGTGTGC?ATTTGCATGTTGCTTCTTTGTAATCAATCACAACGCCCCCACCAAACATCCTATCTAGGGATGTATGCGGTAGGGGGCGGAGATTGGTCTCCTGTGCTTGTTGTGTGGTTGACCTAAATATGGGTCCCTTCAAGATGGACACATGATTAGTGGTGGTTGATAACACAGTCGTCTCGTGTTGTGTGTTATGATCTTGGAGGGATTAACTCTTTGAGCACCCTGTCGTGTTGTCTTATGATGATGCTTCGA Helenium_flexuosum_PLT TCGAAACCTGCATAGCAGAACAACTTGTGAACAAGTACTTACAACATGGCTTTTTGAGCATCAGGCCTTTGGTGGTTTGAGACTTGTGAAGCCTTGTCGTCATGTGTTCGTGGTTTCCTTGTAAGAGGATCATGGGCATTATGTCGGCACAAGAACAAACATCCGGCACGGCATGTGCCAAGGAATTTCAAACTTAAGATGGCTAGTGCAATGATGCCCCGTTTACGGTGTGTGC?ATTTGCATGTTGCTTCTTTGTAATCAATCACAACGCCCCCACCAAACATCCTATCTAGGGATGTATGCGGTACGGGGCGGAGATTGGTCTCCTGTGCTTGTTGTGTGGTTGACCTAAATATGGGTCCCTTCAAGATGGACACATGATTAGTGGTGGTTGATAACACAGTCGTCTCGTGTTGTGTGTTATGATCTTGGAGGGATTAACTCTTTGAGCACCCTGTCGTGTTGTCTTATGATGATGCTTCGA Helenium_flexuosum_YPC_2 ???AAACCTGCATAGCAGAACAACTTGTGAACAAGTACTTACAACATGGCTTTCTGAGCATCAGGCCTTTGGTGGTTTGAGACTTGTGAAGCCTTGTCGTCATGTGTTCGTGGTTTCCTTGTAAGAGGATCATGGGCATTATGTCGGCACAAGAACAAACATCCGGCACGGCATGTGCCAAGGAATTTCAAACTTAAGATGGCTAGTGCAATGATGCCCCGTTTACGGTGTGTGC?ATTTGCATGTTGCTTCTTTGTAATCAATCACAACGCCCCCACCAAACATCCTATCTAGGGATGTATGCGGTAGGGGGCGGAGATTGGTCTCCTGTGCTTGTTGTGTGGTTGACCTAAATATGGGTCCCTTCAAGATGGACACATGATTAGTGGTGGTTGATAACACAGTCGTCTCGTGT?GTGTGTTATGATCTTGGAGGGATTA?CTCTT?GA?CACCCTGTCGTGTTGTCTTATGATGATGCTTCGA Helenium_virginicum_FLD ?CGAAACC{AC}GCATAGCAGAACAACTTGTGAACAAGTATTTACAACATGGCTTTTCAAGCATCAGACCTTTGG???TTTGAGACTTGTGAAGCCTTGTCGTCATGTGTTCGTGGTTTCCTTGTAAGAGGATCATGGGCATTATGTCGGCATAAGAACAAACCTCCGGCACGGCATGTGCCAAGGAATTTCAAACTTAAGATGGCTAGTGCAATGATGCCCCGTTTACGGTGTGTGCCATTTGCATGTTGCTTCTTTGTAATCAATCACAACGCCCCCACCAAACTTCCTATCTAGGGATGTATGCGGTAAGGGGCGGAGATTGGTCTCCTGTGCTTGTTGTGTAGTTGACCTAAATATGGGTCCTTTCAAGATGGACACATGATTAGTGGTGGTTGATAACACAGTCGTCTCGTGTTGTGTGTTATGATCTTGGAGGGATTAACTCTTTGAGAACCCTGTCGTGTTGTCTTATGATGATGCTTCGA Helenium_virginicum_GROT_1 TCGAAACCTGCATAGCAGAACAACTTGTGAACAAGTATTTACAACATGGCTTTTCAAGCATCAGACCTTTGG???TTTGAGACTTGTGAAGCCTTGTCGTCATGTGTTCGTGGTTTCCTTGTAAGAGGATCATGGGCATTATGTCGGCATAAGAACAAACCTCCGGCACGGCATGTGCCAAGGAATTTCAAACTTAAGATGGCTAGTGCAATGATGCCCCGTTTACGGTGTGTGCCATTTGCATGTTGCTTCTTTGTAATCAATCACAACGCCCCCACCAAACTTCCTATCTAGGGATGTATGCGGTAAGGGGCGGAGATTGGTCTCCTGTGCTTGTTGTGTAGTTGACCTAAATATGGGTCCTTTCAAGATGGACACATGATTAGTGGTGGTTGATAACACAGTCGTCTCGTGTTGTGTGTTATGATCTTGGAGGGATTAACTCTTTGAGAACCCTGTCGTGTTGTCTTATGATGATGCTTCGA Helenium_virginicum_GROT_3 T{AG}GAAACCTGCATAGCAGAACAACTTGTGAACAAGTATTTACAACATGGCTTTTCAAGCATCAGACCTTTGG???TTTGAGACTTGTGAAGCCTTGTCGTCATGTGTTCGTGGTTTCCTTGTAAGAGGATCATGGGCATTATGTCGGCATAAGAACAAACCTCCGGCACGGCATGTGCCAAGGAATTTCAAACTTAAGATGGCTAGTGCAATGATGCCCCGTTTACGGTGTGTGCCATTTGCATGTTGCTTCTTTGTAATCAATCACAACGCCCCCACCAAACTTCCTATCTAGGGATGTATGCGGTAAGGGGCGGAGATTGGTCTCCTGTGCTTGTTGTGTAGTTGACCTAAATATGGGTCCTTTCAAGATGGACACATGATTAGTGGTGGTTGATAACACAGTCGTCTCGTGTTGTGTGTTATGATCTTGGAGGGATTAACTCTTTGAGAACCCTGTCGTGTTGTCTTATGATGATGCTTCGA Helenium_virginicum_GRV TCGAAACCTGCATAGCAGAACAACTTGTGAACAAGTATTTACAACATGGCTTT{GT}CAGGCATCAGACCTTTGG???TTTGAGACTTGTGAAGCCTTGTCGTCATGTGTTCGTGGTTTCCTTGTAAGAGGATCATGGGCATTATGTCGGCATAAGAACAAACCTCCGGCACGGCATGTGCCAAGGAATTTCAAACTTAAGATGGCTAGTGCAATGATGCCCCGTTTACGGTGTGTGCCATT{GT}GCATGTGGCTTCTTTGTAATCAATCACAACGCCCCCACCAAACTTCCTATCTAGGGATGTATGCGGTAAGGGGCGGAGATTGGTCTCCTGTGCTTGTTGTGTAGTTGACCTAAATATGGGTCCTTTCAAGATGGACACATGATTAGTGGTGGTTGATAACACAGTCGTCTCGTGTTGTGTGTTATGATCTTGGAGGGATTAACTCTTTGAGAACCCTGTCGTGTTGTCTTATGATGATG?TTC?? Helenium_virginicum_RX TCGAAACCTGCATAGCAGAACAACTTGTGAACAAGTATTTACAACATGGCTTTTCAAGCATCAGACCTTTGG???TTTGAGACTTGTGAAGCCTTGTCGTCATGTGTTCGTGGTTTCCTTGTAAGAGGATCATGGGCATTATGTCGGCATAAGAACAAACCTCCGGCACGGCATGTGCCAAGGAATTTCAAACTTAAGATGGCTAGTGCAATGATGCCCCGTTTACGGTGTGTGCCATTTGCATGTTGCTTCTTTGTAATCAATCACAACGCCCCCACCAAACTTCCTATCTAGGGATGTATGCGGTAAGGGGCGGAGATTGGTCTCCTGTGCTTGTTGTGTAGTTGACCTAAATATGGGTCCTTTCAAGATGGACACATGATTAGTGGTGGTTGATAACACAGTCGTCTCGTGTTGTGTGTTATGATCTTGGAGGAATTAACTCTTTGAGAACCCTGTCGTGTTGTCTTATGATGATGCT?CGA ; END; BEGIN TREES; TITLE Tb7343; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Helenium_flexuosum_YPC_2, 2 Helenium_flexuosum_DC, 3 Helenium_flexuosum_PLT, 4 Helenium_flexuosum_CHS, 5 Helenium_flexuosum_BL, 6 Helenium_autumnale_AFMO, 7 Helenium_autumnale_GI, 8 Helenium_autumnale_JT, 9 Helenium_autumnale_FRC, 10 Helenium_autumnale_SFWV, 11 Helenium_autumnale_MFA, 12 Helenium_autumnale_PFM, 13 Helenium_autumnale_YPC_2, 14 Helenium_autumnale_BSP, 15 Helenium_autumnale_WL, 16 Helenium_autumnale_NG, 17 Helenium_autumnale_OO, 18 Helenium_autumnale_POM_4, 19 Helenium_virginicum_RX, 20 Helenium_virginicum_GRV, 21 Helenium_virginicum_FLD, 22 Helenium_virginicum_GROT_3, 23 Helenium_virginicum_GROT_1, 24 Helenium_amarum, 25 Helenium_bigelovii; TREE Fig._1 = [&R] (24,(25,((17,(23,22,21,20,19,18)Virginicum_Group),(16,15,14,13,12,11,9,7,6,(10,8))Autumnale_Group)),(5,4,3,2,1)Flexuosum_Group); END; BEGIN TREES; TITLE Tb7345; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Helenium_flexuosum_YPC_2, 2 Helenium_flexuosum_DC, 3 Helenium_flexuosum_PLT, 4 Helenium_flexuosum_CHS, 5 Helenium_flexuosum_BL, 6 Helenium_autumnale_AFMO, 7 Helenium_autumnale_GI, 8 Helenium_autumnale_JT, 9 Helenium_autumnale_FRC, 10 Helenium_autumnale_SFWV, 11 Helenium_autumnale_MFA, 12 Helenium_autumnale_PFM, 13 Helenium_autumnale_YPC_2, 14 Helenium_autumnale_BSP, 15 Helenium_autumnale_WL, 16 Helenium_autumnale_NG, 17 Helenium_autumnale_OO, 18 Helenium_autumnale_POM_4, 19 Helenium_virginicum_RX, 20 Helenium_virginicum_GRV, 21 Helenium_virginicum_FLD, 22 Helenium_virginicum_GROT_3, 23 Helenium_virginicum_GROT_1, 24 Helenium_amarum, 25 Helenium_bigelovii; TREE Fig._3 = [&R] (24,25,(((23,22,21,20,19,18)Virginicum_Group,17),(16,15,14,13,12,11,(10,8),9,7,6)Autumnale_Group),(5,4,3,2,1)Flexuosum_Group); END; BEGIN TREES; TITLE Tb7344; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Helenium_flexuosum_YPC_2, 2 Helenium_flexuosum_DC, 3 Helenium_flexuosum_PLT, 4 Helenium_flexuosum_CHS, 5 Helenium_flexuosum_BL, 6 Helenium_autumnale_AFMO, 7 Helenium_autumnale_GI, 8 Helenium_autumnale_JT, 9 Helenium_autumnale_FRC, 10 Helenium_autumnale_SFWV, 11 Helenium_autumnale_MFA, 12 Helenium_autumnale_PFM, 13 Helenium_autumnale_YPC_2, 14 Helenium_autumnale_BSP, 15 Helenium_autumnale_WL, 16 Helenium_autumnale_NG, 17 Helenium_autumnale_OO, 18 Helenium_autumnale_POM_4, 19 Helenium_virginicum_RX, 20 Helenium_virginicum_GRV, 21 Helenium_virginicum_FLD, 22 Helenium_virginicum_GROT_3, 23 Helenium_virginicum_GROT_1, 24 Helenium_amarum, 25 Helenium_bigelovii; TREE Fig._2 = [&R] (24,25,((((23,22,21,20,19,18)Virginicum_Group,17),(16,15,14,13,12,11,9,7,6,(10,8))Autumnale_Group),(5,4,3,2,1)Flexuosum_Group)); END;