#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 26, 2024; 6:41 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Goetsch L., Eckert A., & Hall B. 2005. The Molecular Systematics of Rhododendron (Ericaceae): A Phylogeny based upon RPB2 Gene Sequences. Systematic Botany, null. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S1370] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=88; TAXLABELS Empetrum_nigrum Menziesia_ciliicalyx Menziesia_ferruginea Rhododendron_adenopodum Rhododendron_afghanicum Rhododendron_albiflorum Rhododendron_albrechtii Rhododendron_anthopogon Rhododendron_asperulum Rhododendron_aureum Rhododendron_baileyi Rhododendron_brachycarpum Rhododendron_calendulaceum Rhododendron_campylogynum Rhododendron_camtschaticum Rhododendron_canadense Rhododendron_canescens Rhododendron_catawbiense Rhododendron_championae Rhododendron_ciliatum Rhododendron_crassiflolium Rhododendron_degronianum Rhododendron_dielsianum Rhododendron_edgeworthii Rhododendron_excellens Rhododendron_ferrugineum Rhododendron_formosanum Rhododendron_forrestii Rhododendron_genestierianum Rhododendron_herzogii Rhododendron_hyperythrum Rhododendron_hypoleucum Rhododendron_impeditum Rhododendron_keiskei Rhododendron_kongboense Rhododendron_konori Rhododendron_lapponicum Rhododendron_leptothrium Rhododendron_lutescens Rhododendron_luteum Rhododendron_macabeanum Rhododendron_macrophyllum Rhododendron_maculiferum Rhododendron_makinoi Rhododendron_mariesii Rhododendron_maximum Rhododendron_mekongense Rhododendron_micranthum Rhododendron_minus Rhododendron_molle Rhododendron_moulmainense Rhododendron_moupinense Rhododendron_mucronulatum Rhododendron_nipponicum Rhododendron_nuttallii Rhododendron_occidentale Rhododendron_orthocladum Rhododendron_ovatum Rhododendron_pachysanthum Rhododendron_pendulum Rhododendron_ponticum Rhododendron_pseudochrysanthum Rhododendron_radians Rhododendron_roxieanum Rhododendron_rubropilosum Rhododendron_santapaui Rhododendron_sargentianum Rhododendron_schlippenbachii Rhododendron_semibarbatum Rhododendron_siderophyllum Rhododendron_smirnowii Rhododendron_sororium Rhododendron_spinuliferum Rhododendron_stamineum Rhododendron_sulfureum Rhododendron_tashiroi Rhododendron_tomentosum Rhododendron_trichanthum Rhododendron_triflorum Rhododendron_tsusiophyllum Rhododendron_ungernii Rhododendron_vaccinioides Rhododendron_vaseyi Rhododendron_veitchianum Rhododendron_virgatum Rhododendron_wadanum Rhododendron_wardii Rhododendron_xanthostephanum ; END; BEGIN CHARACTERS; [! 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GTTCACTAAAGTTTTTATTGGAAAGGTACCGGGATTGGAGTTCTAGATGACGTATCTGACATTTTGAATTTGGATTATACTTTTACAAGCAAGCCCAGTCTAGATACAAGCCGAAGCTAACCAATGTCATCGGTTGTAGTTGGTTT-?????????????????????????????????????????????????????????ACAGTTTGGTGGGCTACATGCAACTTATCAATTAA-??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????AACTGAGCACGTGGTGGGCTGGAGGGTTTTCAGCCTGCATCTGTTTTTT-ATTGTGAAGAAATCTAAAATGAATTCTATTGAGAATTCGAGAATGGTTTATAGACAAAATTC-????????????AAGTTTAGAATGATGCGGC-??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????AGTGGTGTTTTTAATATTATGAGTTATGATGGTGGATATTTTGTTTTAAATTAAAAGGAACCTCTCTAATGGTCATCATTCAATATGAAAGTTCTTAACAATAATCT-???????GTGGAGAATCTACAGATAATGTT-TCCTTGT-AATTTGAGTATTTTATCATGAGCATGATTGGTCATGTAAACGAGATATAGGTTGAAAGACTCAAAACCGATGACGCAGTCAGTTACAGTTGGTT-???TACCAATTAAAACCATTCACATTCACTATTTTTT-GGCAGGGATCTAGTATTAAACAGCCCTATCAACTGGGCTAGCCCAATTCTCCTCCTGCATCTTGTCTCTGATATCATCTTTGTTCTCTTATTTCTTGCCACATTTTAGGTCCTCAAGTGCCAAAGGGGTAATTGCAGCATGTGT-ATATCTTAGGAATATCAATTGAACATTTTGGG-ACAAAGGACAAGCTGCAGTAGCTTGTGTCTTCTTTATTTTGAGATATTATGATCAGGCCAAAAGTCTGCTTGAAGCAGATTGAGGTGGCTTGGGCTGGTTGATTAGTGTCATGGACCCACTCTGGGTCTGACCAAACAGTGCAAGACACCTCAATCAGTTTCAATCCAATCATGTTACGGAAAAAGCTCCACAA-ACAAACACTTTACAATTTCTTCTATATACCGATGTGGAGTGCAGAAATAAAGCTGTGAAATTTGAGATGGGATCTGCCCCGAATCAATTGATAGGTACACCTTAGCTGCCTCATCAGTTATAAACTAGGATTGTAAGAAGAGTTTGTTTCTGTAGTATTACTTCCGCATTCATTCTTCATAGGACTCAC-?GCTCCACCATAATGAACTCAGTTCTGCTGCATTGAATTCTGGCACTTTTCAGTGAAATTTTTGGTTCTAGCATTACTGTTCTT-GAATGGCAG-??GGC-???TCTTATCATCTGAGTATT-TGGTTTTGCCCATCATGAGGATATTTTATGC-???????ATATGCAGGGATCTTCCGGGGTTATGAATTTACAGACAATAAAATGATGGATTTACTTCGTCCATCCTTACCCCATGCATTTGTAATTCAAAATCAACAGGTATTCTGTTATGCTTTGCCTTATAGTGTCCTGGTAGCTGAATGGGATAGTTTTAGGTGGTGGGCGTACTAACTTTGTAACTT-???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TATGTTCTTATATTCT-ATGTTTGTGGGGATAAAGAAATAAGAGAATGAAGAGGCATGACAGAGGGTTAGGACTATAGGAAGAAAAAAAAATCATATA----????TTTCACTTTTTAAGTTGGCTGGTTACCTAAAA-TAGATGAACAAATATGCACACAAAGATTCACTTCCCTTTTGTTTTCTTTCCCTTCAGCATGTTAAAGATTCTAACCGGCAATGGGTCTAGCCATCCAGGGATATTGATACCGAACTTGTTTCCATTGTGCTGTTCCAGGTTGCGCTTGATTATATTGGAAAAAGAGGATCTACTGTGGGTGTCACTAAAGAAAAGAGGATCAGGTGGGTTTATGGGATTCGAAGGA-?TCATCTGTCCCAAAAA-??????GTCTTCTCA-???TAGGCATCTCACAACCACCACCCCAC-????GTAAATGTGAATTTT-??????????????CCCTTA-TGTTTATTGTTAAAGAAATGGCATCGCGTGACTGGGTGATATGTG-?AGAGAG-?GGTTGCTTTT-CGGACACGAGAAA-CCTCAGCTGACTTCATGGTCATATTTGATTTTTTGTTATTTACAAAGAGC-????????????????????????????????????????????????????????????CACATGCTTCTGGCTTTGTAGGTATGCCAAAGAAATTCTTCAAAGAGAAATTGCTTATGCCTTGATCACTTCTCTTTTCAAATTTTTTTTCCCTAACTCAAAAAATACTGATTACCTTACTTCCAATCATTACTCATATTTCTCTTTCCACTCTTTAATAATTTCTCTCTCCAATCATTACCCCTATTTTAAATTATTACCCTATTTCACTTTCCACTCATTATCCCTAAAACCAAACTCAAATTTTTTTCAAAAACACAAGTGTACAAGGCATTAGTTTCCCAAAAAATTTACTGATTGTACTTTCACCAGGTACATCATCCATCGGCTTTTGCTTTGTGCCCTTGGCCGGAGGCCACAAGATGATAGGGATCACTATGCAAATAAGAGACTTGACCTTGCTGGTCCTCTACTTGGAGGCTTGTTCAGAATGGTCCTTTATGTCTATAAATTTT-????TTGGATACTA-TGATGATTTGAAGGCTCCATTCCTGATTGTCATTTATGTTAACTAAAATATTGCAGTTATTCAGAAAGTTAACCAGGGATGTGAGGTCCTATGTTCAGAAGGTCTCCTCTTTTATCATTTTTTTT-?????????CCCTGCATTGTTTTAGCCTTATTGGTGCATCTTTC-A-?????????????GGGGTTATGTAAAGC-????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????AGGGAAGCTGGGGGAGGG-??????CTGCTTTTGGATTTATGCATTTAGATTGCTTGAATTTAGCTT-CAATAATCTGCACCAAACGGGCTCATTACCTTTGTATCATAAGGCTTCTTTTTATTAAAA-TTGTGCAATTCTCATTCATGAACCAGTGTGTTGACAACGGGAAGGATGTTAACTTACAATTTGCTATTAAAGCAAAAACGATAACAAGTGGCCTTAAGTACTCTCTTGCTACTGGGAACTGGGGACAAGCAAATTCAGCTAGCTCAAGAGCTGGAGTTTCGCAGGTTGGGTCATATTCTATGTACTATTCTT------TCTTTCTTTTTTTATATCTTTTTTCATTGATCTACGTGAATCGTTT-????????CAAC-?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????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Rhododendron_adenopodum 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Rhododendron_albiflorum 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Rhododendron_albrechtii 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Rhododendron_aureum 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Rhododendron_calendulaceum 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Rhododendron_camtschaticum 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Rhododendron_catawbiense 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Rhododendron_ciliatum 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Rhododendron_dielsianum 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Rhododendron_edgeworthii 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Rhododendron_excellens 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Rhododendron_formosanum 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Rhododendron_forrestii 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Rhododendron_genestierianum 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Rhododendron_herzogii 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Rhododendron_hyperythrum 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Rhododendron_impeditum 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Rhododendron_keiskei 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Rhododendron_kongboense 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Rhododendron_konori 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Rhododendron_lapponicum 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Rhododendron_leptothrium 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Rhododendron_luteum 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Rhododendron_macabeanum 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Rhododendron_makinoi 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Rhododendron_mariesii 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Rhododendron_maximum 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Rhododendron_minus 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Rhododendron_moupinense 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Rhododendron_nuttallii 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Rhododendron_orthocladum 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Rhododendron_ovatum 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Rhododendron_pachysanthum 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Rhododendron_pendulum 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Rhododendron_radians 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Rhododendron_roxieanum 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Rhododendron_rubropilosum 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Rhododendron_santapaui 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Rhododendron_sargentianum 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Rhododendron_schlippenbachii 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Rhododendron_semibarbatum 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Rhododendron_siderophyllum 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Rhododendron_smirnowii 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Rhododendron_stamineum 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Rhododendron_sulfureum 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Rhododendron_tashiroi 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Rhododendron_triflorum 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Rhododendron_ungernii 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Rhododendron_vaccinioides 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Rhododendron_vaseyi 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Rhododendron_veitchianum 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Rhododendron_virgatum 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Rhododendron_wadanum 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Rhododendron_wardii 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Rhododendron_xanthostephanum 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; END; BEGIN TREES; TITLE Tb7350; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Rhododendron_lapponicum, 2 Rhododendron_ciliatum, 3 Rhododendron_excellens, 4 Rhododendron_nuttallii, 5 Rhododendron_pendulum, 6 Rhododendron_sulfureum, 7 Rhododendron_edgeworthii, 8 Rhododendron_veitchianum, 9 Rhododendron_xanthostephanum, 10 Rhododendron_moupinense, 11 Rhododendron_santapaui, 12 Rhododendron_asperulum, 13 Rhododendron_sororium, 14 Rhododendron_crassiflolium, 15 Rhododendron_konori, 16 Rhododendron_herzogii, 17 Rhododendron_radians, 18 Rhododendron_dielsianum, 19 Rhododendron_baileyi, 20 Rhododendron_impeditum, 21 Rhododendron_minus, 22 Rhododendron_ferrugineum, 23 Rhododendron_mucronulatum, 24 Rhododendron_anthopogon, 25 Rhododendron_kongboense, 26 Rhododendron_sargentianum, 27 Rhododendron_orthocladum, 28 Empetrum_nigrum, 29 Rhododendron_camtschaticum, 30 Rhododendron_albiflorum, 31 Rhododendron_albrechtii, 32 Rhododendron_schlippenbachii, 33 Rhododendron_vaseyi, 34 Menziesia_ciliicalyx, 35 Menziesia_ferruginea, 36 Rhododendron_nipponicum, 37 Rhododendron_semibarbatum, 38 Rhododendron_tsusiophyllum, 39 Rhododendron_leptothrium, 40 Rhododendron_ovatum, 41 Rhododendron_rubropilosum, 42 Rhododendron_mariesii, 43 Rhododendron_wadanum, 44 Rhododendron_tashiroi, 45 Rhododendron_canadense, 46 Rhododendron_molle, 47 Rhododendron_luteum, 48 Rhododendron_calendulaceum, 49 Rhododendron_occidentale, 50 Rhododendron_canescens, 51 Rhododendron_formosanum, 52 Rhododendron_adenopodum, 53 Rhododendron_makinoi, 54 Rhododendron_degronianum, 55 Rhododendron_smirnowii, 56 Rhododendron_maximum, 57 Rhododendron_ponticum, 58 Rhododendron_catawbiense, 59 Rhododendron_hyperythrum, 60 Rhododendron_pachysanthum, 61 Rhododendron_pseudochrysanthum, 62 Rhododendron_ungernii, 63 Rhododendron_maculiferum, 64 Rhododendron_aureum, 65 Rhododendron_macrophyllum, 66 Rhododendron_brachycarpum, 67 Rhododendron_roxieanum, 68 Rhododendron_forrestii, 69 Rhododendron_macabeanum, 70 Rhododendron_wardii, 71 Rhododendron_championae, 72 Rhododendron_moulmainense, 73 Rhododendron_stamineum, 74 Rhododendron_tomentosum, 75 Rhododendron_hypoleucum, 76 Rhododendron_mekongense, 77 Rhododendron_micranthum, 78 Rhododendron_keiskei, 79 Rhododendron_triflorum, 80 Rhododendron_lutescens, 81 Rhododendron_virgatum, 82 Rhododendron_siderophyllum, 83 Rhododendron_afghanicum, 84 Rhododendron_spinuliferum, 85 Rhododendron_trichanthum, 86 Rhododendron_genestierianum, 87 Rhododendron_campylogynum, 88 Rhododendron_vaccinioides; TREE Fig._3 = [&R] (((((((((((((((10,6),9,8),7),5),(((4,3),2),(1,27),(26,25),24)),23),22),(21,(20,19))),(((((((18,15),16),17),14),((13,12),(11,88))),((((84,80),79),78),76),77),((87,(86,83)),((85,82),81)))),(75,74)),((73,71),72))Clade_A,((((((((((((70,63),69,68),67),66,65),64),58),((61,59),60)),(62,57),56),(52,51)),55),(54,53)),(50,49),(((48,47),45),46))Clade_B),(((((((44,42),43),41),38),(37,36)),(40,39)),((((35,34),33),32),(31,30)))Clade_C),29),28); END; BEGIN TREES; TITLE Tb7349; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Rhododendron_lapponicum, 2 Rhododendron_ciliatum, 3 Rhododendron_excellens, 4 Rhododendron_nuttallii, 5 Rhododendron_pendulum, 6 Rhododendron_sulfureum, 7 Rhododendron_edgeworthii, 8 Rhododendron_veitchianum, 9 Rhododendron_xanthostephanum, 10 Rhododendron_moupinense, 11 Rhododendron_santapaui, 12 Rhododendron_asperulum, 13 Rhododendron_sororium, 14 Rhododendron_crassiflolium, 15 Rhododendron_konori, 16 Rhododendron_herzogii, 17 Rhododendron_radians, 18 Rhododendron_dielsianum, 19 Rhododendron_baileyi, 20 Rhododendron_impeditum, 21 Rhododendron_minus, 22 Rhododendron_ferrugineum, 23 Rhododendron_mucronulatum, 24 Rhododendron_anthopogon, 25 Rhododendron_kongboense, 26 Rhododendron_sargentianum, 27 Rhododendron_orthocladum, 28 Empetrum_nigrum, 29 Rhododendron_camtschaticum, 30 Rhododendron_albiflorum, 31 Rhododendron_albrechtii, 32 Rhododendron_schlippenbachii, 33 Rhododendron_vaseyi, 34 Menziesia_ciliicalyx, 35 Menziesia_ferruginea, 36 Rhododendron_nipponicum, 37 Rhododendron_semibarbatum, 38 Rhododendron_tsusiophyllum, 39 Rhododendron_leptothrium, 40 Rhododendron_ovatum, 41 Rhododendron_rubropilosum, 42 Rhododendron_mariesii, 43 Rhododendron_wadanum, 44 Rhododendron_tashiroi, 45 Rhododendron_canadense, 46 Rhododendron_molle, 47 Rhododendron_luteum, 48 Rhododendron_calendulaceum, 49 Rhododendron_occidentale, 50 Rhododendron_canescens, 51 Rhododendron_formosanum, 52 Rhododendron_adenopodum, 53 Rhododendron_makinoi, 54 Rhododendron_degronianum, 55 Rhododendron_smirnowii, 56 Rhododendron_maximum, 57 Rhododendron_ponticum, 58 Rhododendron_catawbiense, 59 Rhododendron_hyperythrum, 60 Rhododendron_pachysanthum, 61 Rhododendron_pseudochrysanthum, 62 Rhododendron_ungernii, 63 Rhododendron_maculiferum, 64 Rhododendron_aureum, 65 Rhododendron_macrophyllum, 66 Rhododendron_brachycarpum, 67 Rhododendron_roxieanum, 68 Rhododendron_forrestii, 69 Rhododendron_macabeanum, 70 Rhododendron_wardii, 71 Rhododendron_championae, 72 Rhododendron_moulmainense, 73 Rhododendron_stamineum, 74 Rhododendron_tomentosum, 75 Rhododendron_hypoleucum, 76 Rhododendron_mekongense, 77 Rhododendron_micranthum, 78 Rhododendron_keiskei, 79 Rhododendron_triflorum, 80 Rhododendron_lutescens, 81 Rhododendron_virgatum, 82 Rhododendron_siderophyllum, 83 Rhododendron_afghanicum, 84 Rhododendron_spinuliferum, 85 Rhododendron_trichanthum, 86 Rhododendron_genestierianum, 87 Rhododendron_campylogynum, 88 Rhododendron_vaccinioides; TREE Fig._2 = [&R] ((((((((((((((10,6),9,8,7),5),(((4,3),2),(1,27),(26,25),24)),23),22),(21,(20,19))),(((((((18,15),16),17),14),((13,12),(11,88))),(((84,80),79),78,76),77),((87,(86,83)),((85,82),81)))),(75,74)),((73,71),72))Clade_A,((((((((((70,63),69,68),67),66,65),64,((61,59),60),58),(62,57),56),(52,51)),55),(54,53)),(50,49),(((48,47),45),46))Clade_B),(((((44,42),43),41),(40,39),38,(37,36)),((((35,34),33),32),(31,30)))Clade_C),29),28); END;