#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 19, 2024; 18:16 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Lecocq T., Dellicour S., Michez D., Lhomme P., Vanderplanck M., Valterová I., Rasplus J., & Rasmont P. 2013. Scent of a break-up: phylogeography and reproductive trait divergences in the red-tailed bumblebee (Bombus lapidarius). BMC Evolutionary Biology, 13: 263. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S14299] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=248; TAXLABELS Bombus_alagesianus_A001TR Bombus_erzurumensis_E001TR Bombus_incertus_I001TR Bombus_lapidarius_L001NW Bombus_lapidarius_L002NW Bombus_lapidarius_L003NW Bombus_lapidarius_L004NW Bombus_lapidarius_L005SW Bombus_lapidarius_L006GOT Bombus_lapidarius_L007GOT Bombus_lapidarius_L008GOT Bombus_lapidarius_L009GOT Bombus_lapidarius_L010GOT Bombus_lapidarius_L011ALA Bombus_lapidarius_L012ALA Bombus_lapidarius_L013ALA Bombus_lapidarius_L014ALA Bombus_lapidarius_L015ALA Bombus_lapidarius_L016NW Bombus_lapidarius_L017NW Bombus_lapidarius_L018NW Bombus_lapidarius_L019SW Bombus_lapidarius_L020BE Bombus_lapidarius_L021BE Bombus_lapidarius_L022BE Bombus_lapidarius_L023FR Bombus_lapidarius_L024BE Bombus_lapidarius_L025DE Bombus_lapidarius_L026DE Bombus_lapidarius_L027DE Bombus_lapidarius_L028DE Bombus_lapidarius_L029DE Bombus_lapidarius_L030PL Bombus_lapidarius_L031PL 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Bombus_lapidarius_L012ALA 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Bombus_lapidarius_L017NW 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Bombus_lapidarius_L027DE 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Bombus_lapidarius_L028DE 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Bombus_lapidarius_L039PL 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Bombus_lapidarius_L050HU 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Bombus_lapidarius_L060SL 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Bombus_lapidarius_L061SL 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Bombus_lapidarius_L071ITN 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Bombus_lapidarius_L072ITN 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Bombus_lapidarius_L081TR 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Bombus_lapidarius_L083TR 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Bombus_lapidarius_L090IR 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Bombus_lapidarius_L096DK 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Bombus_lapidarius_L102FR 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Bombus_lapidarius_L107FR 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Bombus_lapidarius_L118SB 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Bombus_lapidarius_L140PL 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Bombus_lapidarius_L151SK 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Bombus_lapidarius_L159ITS 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Bombus_lapidarius_L164ITN 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Bombus_lapidarius_L174FR 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Bombus_lapidarius_L175ES 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Bombus_lapidarius_L176ES 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Bombus_lapidarius_L180UK 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Bombus_lapidarius_L187ES 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Bombus_lapidarius_L204UA 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Bombus_lapidarius_L220FR 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Bombus_lapidarius_L221FR 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Bombus_lapidarius_L222FR 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Bombus_lapidarius_L226FR 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Bombus_lapidarius_L230IT 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Bombus_lapidarius_L231IT 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Bombus_lapidarius_L232IT 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Bombus_lapidarius_L233IT 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Bombus_lapidarius_L239SC 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Bombus_lapidarius_L244RO 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Bombus_lapidarius_L002NW 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Bombus_lapidarius_L005SW 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Bombus_lapidarius_L008GOT 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Bombus_lapidarius_L011ALA 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Bombus_lapidarius_L014ALA 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Bombus_lapidarius_L017NW 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Bombus_lapidarius_L020BE 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Bombus_lapidarius_L023FR 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Bombus_lapidarius_L026DE 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Bombus_lapidarius_L029DE 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Bombus_lapidarius_L032PL 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Bombus_lapidarius_L035PL 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Bombus_lapidarius_L038PL 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Bombus_lapidarius_L041AT 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Bombus_lapidarius_L044CH 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Bombus_lapidarius_L047CZ 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Bombus_lapidarius_L050HU 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Bombus_lapidarius_L053HU 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Bombus_lapidarius_L056BL 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Bombus_lapidarius_L059BL 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Bombus_lapidarius_L062SL 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Bombus_lapidarius_L065ITS 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Bombus_lapidarius_L068ITS 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Bombus_lapidarius_L077ES 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Bombus_lapidarius_L080TR 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Bombus_lapidarius_L087UK 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Bombus_lapidarius_L097DK 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Bombus_lapidarius_L102FR 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Bombus_lapidarius_L103FR 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Bombus_lapidarius_L106FR 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Bombus_lapidarius_L109FR 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Bombus_lapidarius_L112SB 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Bombus_lapidarius_L115SW 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Bombus_lapidarius_L118SB 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Bombus_lapidarius_L121FR 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Bombus_lapidarius_L124DE 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Bombus_lapidarius_L130NL 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Bombus_lapidarius_L132NL 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Bombus_lapidarius_L133NL 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Bombus_lapidarius_L136DE 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Bombus_lapidarius_L139PL 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Bombus_lapidarius_L142PL 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Bombus_lapidarius_L145PL 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Bombus_lapidarius_L151SK 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Bombus_lapidarius_L154HU 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Bombus_lapidarius_L159ITS 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Bombus_lapidarius_L175ES 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Bombus_lapidarius_L178UK 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Bombus_lapidarius_L181UK 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Bombus_lapidarius_L184ES 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Bombus_lapidarius_L189ES 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Bombus_lapidarius_L192FR 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Bombus_lapidarius_L195SE 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Bombus_lapidarius_L207FR 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Bombus_lapidarius_L218FR 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Bombus_lapidarius_L221FR 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Bombus_lapidarius_L224FR 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Bombus_lapidarius_L227UK 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Bombus_lapidarius_L236SC 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Bombus_lapidarius_L239SC 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Bombus_lapidarius_L242RO 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Bombus_lapidarius_L255RU 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Bombus_sichelii_S002CH 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Bombus_lapidarius_L043CH 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Bombus_lapidarius_L069ITS 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Bombus_lapidarius_L075ES 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Bombus_lapidarius_L154HU 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Bombus_lapidarius_L176ES 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Bombus_lapidarius_L232IT 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Bombus_lapidarius_L047CZ 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Bombus_lapidarius_L050HU 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Bombus_lapidarius_L052HU 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Bombus_lapidarius_L053HU 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Bombus_lapidarius_L055BL 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Bombus_lapidarius_L133NL 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Bombus_lapidarius_L150SK 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Bombus_lapidarius_L187ES 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Bombus_lapidarius_L202UA 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Bombus_lapidarius_L223FR 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Bombus_lapidarius_L238SC 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Bombus_lapidarius_L240SB 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END; BEGIN TREES; TITLE 'ALL_MB_Majority rule 50% consensus based on Bayesian analyses of B. lapidarius COI, Cytb, EF1A, LWRh and PEPCK alignment'; LINK TAXA = Taxa6; TRANSLATE 1 Bombus_alagesianus_A001TR, 2 Bombus_incertus_I001TR, 3 Bombus_lapidarius_L001NW, 4 Bombus_lapidarius_L002NW, 5 Bombus_lapidarius_L003NW, 6 Bombus_lapidarius_L004NW, 7 Bombus_lapidarius_L005SW, 8 Bombus_lapidarius_L006GOT, 9 Bombus_lapidarius_L007GOT, 10 Bombus_lapidarius_L008GOT, 11 Bombus_lapidarius_L009GOT, 12 Bombus_lapidarius_L010GOT, 13 Bombus_lapidarius_L011ALA, 14 Bombus_lapidarius_L012ALA, 15 Bombus_lapidarius_L013ALA, 16 Bombus_lapidarius_L014ALA, 17 Bombus_lapidarius_L015ALA, 18 Bombus_lapidarius_L016NW, 19 Bombus_lapidarius_L017NW, 20 Bombus_lapidarius_L018NW, 21 Bombus_lapidarius_L019SW, 22 Bombus_lapidarius_L020BE, 23 Bombus_lapidarius_L021BE, 24 Bombus_lapidarius_L022BE, 25 Bombus_lapidarius_L023FR, 26 Bombus_lapidarius_L024BE, 27 Bombus_lapidarius_L025DE, 28 Bombus_lapidarius_L026DE, 29 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END; BEGIN TREES; TITLE 'Nucl_MB_Majority rule 50% consensus based on Bayesian analyses of B. lapidariusEF1A, LWRh and PEPCK alignment'; LINK TAXA = Taxa7; TRANSLATE 1 Bombus_alagesianus_A001TR, 2 Bombus_erzurumensis_E001TR, 3 Bombus_incertus_I001TR, 4 Bombus_lapidarius_L001NW, 5 Bombus_lapidarius_L002NW, 6 Bombus_lapidarius_L003NW, 7 Bombus_lapidarius_L004NW, 8 Bombus_lapidarius_L005SW, 9 Bombus_lapidarius_L006GOT, 10 Bombus_lapidarius_L007GOT, 11 Bombus_lapidarius_L008GOT, 12 Bombus_lapidarius_L009GOT, 13 Bombus_lapidarius_L010GOT, 14 Bombus_lapidarius_L011ALA, 15 Bombus_lapidarius_L012ALA, 16 Bombus_lapidarius_L013ALA, 17 Bombus_lapidarius_L014ALA, 18 Bombus_lapidarius_L015ALA, 19 Bombus_lapidarius_L016NW, 20 Bombus_lapidarius_L017NW, 21 Bombus_lapidarius_L018NW, 22 Bombus_lapidarius_L019SW, 23 Bombus_lapidarius_L020BE, 24 Bombus_lapidarius_L021BE, 25 Bombus_lapidarius_L022BE, 26 Bombus_lapidarius_L023FR, 27 Bombus_lapidarius_L024BE, 28 Bombus_lapidarius_L025DE, 29 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END; BEGIN TREES; TITLE 'PEPCK_MB_Majority rule 50% consensus based on Bayesian analyses of B. lapidarius PEPCK alignment'; LINK TAXA = Taxa5; TRANSLATE 1 Bombus_alagesianus_A001TR, 2 Bombus_erzurumensis_E001TR, 3 Bombus_incertus_I001TR, 4 Bombus_lapidarius_L001NW, 5 Bombus_lapidarius_L002NW, 6 Bombus_lapidarius_L003NW, 7 Bombus_lapidarius_L004NW, 8 Bombus_lapidarius_L005NW, 9 Bombus_lapidarius_L006GOT, 10 Bombus_lapidarius_L007GOT, 11 Bombus_lapidarius_L008GOT, 12 Bombus_lapidarius_L009GOT, 13 Bombus_lapidarius_L010GOT, 14 Bombus_lapidarius_L011ALA, 15 Bombus_lapidarius_L012ALA, 16 Bombus_lapidarius_L013ALA, 17 Bombus_lapidarius_L014ALA, 18 Bombus_lapidarius_L015ALA, 19 Bombus_lapidarius_L016NW, 20 Bombus_lapidarius_L017NW, 21 Bombus_lapidarius_L018NW, 22 Bombus_lapidarius_L019SW, 23 Bombus_lapidarius_L020BE, 24 Bombus_lapidarius_L021BE, 25 Bombus_lapidarius_L022BE, 26 Bombus_lapidarius_L023BE, 27 Bombus_lapidarius_L024BE, 28 Bombus_lapidarius_L025DE, 29 Bombus_lapidarius_L026DE, 30 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END; BEGIN TREES; TITLE 'COI_MB_Majority rule 50% consensus based on Bayesian analyses of B. lapidarius COI alignment'; LINK TAXA = Taxa4; TRANSLATE 1 Bombus_alagesianus_A001TR, 2 Bombus_erzurumensis_E001TR, 3 Bombus_erzurumensis_E002TR, 4 Bombus_erzurumensis_E003TR, 5 Bombus_incertus_I001TR, 6 Bombus_lapidarius_L001NW, 7 Bombus_lapidarius_L002NW, 8 Bombus_lapidarius_L003NW, 9 Bombus_lapidarius_L004NW, 10 Bombus_lapidarius_L005SW, 11 Bombus_lapidarius_L006GOT, 12 Bombus_lapidarius_L007GOT, 13 Bombus_lapidarius_L008GOT, 14 Bombus_lapidarius_L009GOT, 15 Bombus_lapidarius_L010GOT, 16 Bombus_lapidarius_L011ALA, 17 Bombus_lapidarius_L012ALA, 18 Bombus_lapidarius_L013ALA, 19 Bombus_lapidarius_L014ALA, 20 Bombus_lapidarius_L015ALA, 21 Bombus_lapidarius_L016NW, 22 Bombus_lapidarius_L017NW, 23 Bombus_lapidarius_L018NW, 24 Bombus_lapidarius_L019SW, 25 Bombus_lapidarius_L020BE, 26 Bombus_lapidarius_L021BE, 27 Bombus_lapidarius_L022BE, 28 Bombus_lapidarius_L023FR, 29 Bombus_lapidarius_L024BE, 30 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