#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 25, 2024; 1:22 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Pfingstl T., Lienhard A., & Jagersbacher-baumann J. 2013. Hidden in the mangrove forest: The cryptic intertidal mite Carinozetes mangrovi sp. n. (Acari, Oribatida, Selenoribatidae). BMC Evolutionary Biology, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S14431] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=23; TAXLABELS 'Carinozetes bermudensis 97_15' 'Carinozetes bermudensis 120_11' 'Carinozetes bermudensis 120_14' 'Carinozetes bermudensis 120_2' 'Carinozetes bermudensis 120_3' 'Carinozetes bermudensis 120_5' 'Carinozetes bermudensis 120_8' 'Carinozetes bermudensis 120_9' 'Carinozetes bermudensis 97_7' 'Carinozetes bermudensis 99_3' 'Carinozetes mangrovi 125_3' 'Carinozetes mangrovi 128_1' 'Carinozetes mangrovi 27_1' 'Carinozetes mangrovi 27_4' 'Carinozetes mangrovi 65_3' 'Carinozetes mangrovi 65_7' 'Carinozetes mangrovi 65_8' 'Carinozetes mangrovi 97_1' 'Carinozetes mangrovi 97_2' 'Carinozetes mangrovi 97_8' 'Fortuynia sp. 5_2' 'Fortuynia sp. 5_1' 'Fortuynia sp. 5_3' ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M17804] TITLE Carinozetes_sequences; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=564; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=- GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] 'Carinozetes bermudensis 97_15' 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GGCCATCCAGAAGTTTACATTCTAATTTTACCAGGGTTTGGTATAATTTCCCATATCATTAGTTTTTACTCAGGTAAAAAAGAACCTTTTGGTTCTCTGGGAATAATTTATGCAATAGTATCAATTGGATTTTTAGGCTTCATTGTGTGAGCTCACCACATATTCACAGTAGGAATAGATGTAGATACTCGAGCCTATTTCACTTCAGCCACAATAATCATCGCTATCCCAACAGGAGTTAAGGTTTTTAGTTGACTAGCAACTATAAATGGTTCTTTCATAAGAATAGATACCCCCATATGCTGAGCTATTGGTTTTGTATTTTTATTTACAGTAGGAGGTCTTACAGGAGTAATTTTAGCTAACTCGTCAATTGATATTGTATTACATGATACTTATTATGTAGTAGCTCACTTTCATTATGTACTTTCTATAGGAGCCGTATTTGCTATTATAGCAGGTGCTACTCACTGGTTACCATTATTATTTAGTATAAATATAAACCCAAAAATTCTAAAAATCCAATTCACATCAATATTTATCGGAGTTAACTTAACTTTTTTT 'Fortuynia sp. 5_3' GGTCATCCAGAAGTTTACATTCTAATTTTACCAGGGTTTGGTATAATTTCCCATATCATTAGTTTTTACTCAGGTAAAAAAGAACCTTTTGGTTCTCTGGGAATAATTTATGCAATAGTATCAATTGGATTTTTAGGCTTCATTGTGTGAGCTCACCACATATTCACAGTAGGAATAGATGTAGATACTCGAGCCTATTTCACTTCAGCCACAATAATCATCGCTATCCCAACAGGAGTTAAGGTTTTTAGTTGACTAGCAACTATAAATGGTTCTTTCATAAGAATAGATACCCCCATATGCTGAGCTATTGGTTTTGTATTTTTATTTACAGTAGGAGGTCTTACAGGAGTAATTTTAGCTAACTCGTCAATTGATATTGTATTACATGATACTTATTATGTAGTAGCTCACTTTCATTATGTACTTTCTATAGGAGCCGTATTTGCTATTATAGCAGGTGCTACTCACTGGTTACCATTATTATTTAGTATAAATATAAACCCAAAAATTCTAAAAATCCAATTCACATCAATATTTATCGGAGTTAACTTAACTTTTTTT ; END; BEGIN TREES; TITLE BIyes; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 'Fortuynia sp. 5_1', 2 'Fortuynia sp. 5_3', 3 'Fortuynia sp. 5_2', 4 'Carinozetes mangrovi 65_3', 5 'Carinozetes mangrovi 65_7', 6 'Carinozetes mangrovi 128_1', 7 'Carinozetes mangrovi 65_8', 8 'Carinozetes mangrovi 27_1', 9 'Carinozetes mangrovi 27_4', 10 'Carinozetes mangrovi 97_1', 11 'Carinozetes mangrovi 97_8', 12 'Carinozetes mangrovi 97_2', 13 'Carinozetes mangrovi 125_3', 14 'Carinozetes bermudensis 120_2', 15 'Carinozetes bermudensis 120_3', 16 'Carinozetes bermudensis 120_5', 17 'Carinozetes bermudensis 97_15', 18 'Carinozetes bermudensis 97_7', 19 'Carinozetes bermudensis 120_14', 20 'Carinozetes bermudensis 120_11', 21 'Carinozetes bermudensis 120_9', 22 'Carinozetes bermudensis 120_8', 23 'Carinozetes bermudensis 99_3'; TREE Fig._3 = [&R] (1:0.0016145,((2:0.001858,3:0.001846)0.49:0.002732,((13:0.005842,((6:0.001904,11:0.001899)0.28:0.001977,(12:0.003716,((8:0.005767,9:0.003955)0.93:0.003824,((4:0.001882,10:0.001885)0.11:0.001884,(5:0.001899,7:0.001895)0.11:0.001909)0.05:0.001897)0.12:0.002205)0.98:0.003787)0.60:0.005019)1.00:0.117877,((21:0.008201,((14:0.001849,20:0.001866)0.20:0.001854,(15:0.001858,19:0.001867)0.20:0.001874)0.96:0.015149)0.39:0.004947,(18:0.002161,((16:0.001812,22:0.001792)0.17:0.001802,(17:0.001808,23:0.001798)0.17:0.001827)0.64:0.003517)0.60:0.005263)1.00:0.104641)1.00:0.288241):0.0016145); END;