#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 19, 2024; 5:35 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Poux C., Chevret P., Huchon D., Jong W., & Douzery E. 2006. Arrival and diversification of caviomorph rodents and platyrrhine primates in South America. Systematic Biology, 55(2): 228-244. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S1453] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=62; TAXLABELS Agouti_paca Anomalurus_sp. Aplodontia_rufa Ateles_sp. Bathyergus_suillus Bos_taurus Bradypus_tridactylus Callithrix_jacchus Castor_canadensis Cavia_porcellus Cebus_apella Ceratomorpha Cercopithecus_solatus Chinchilla_lanigera Cynocephalus_variegatus Cynopterus_sphinx Didelphis_sp. Dinomys_branickii Dipodomys_merriami Dipus_sagitta Dryomys_nitedula Dugong_dugon Echimys_chrysurus Elephantidae Equus_sp. Erethizon_dorsatum Erinaceus_europaeus Felis_catus Glis_glis Hippopotamus_amphibius Homo_sapiens Hylobates_lar Lama_sp. Lemur_catta Lepus_crawshayi Macaca_mulatta Macropus_sp. Manis_sp. Marmota_monax Massoutiera_mzabi Megaderma_lyra Microcebus_murinus Mus_musculus Nycticebus_coucang Ochotona_princeps Octodon_lunatus Orycteropus_afer Oryctolagus_cuniculus Petromus_typicus Physeter_catodon Pithecia_pithecia Procavia_capensis Propithecus_verreauxi Rattus_norvegicus Sus_scrofa Tachyoryctes_sp. Tarsius_bancanus Thomomys_talpoides Thryonomys_swinderianus Tonatia_bidens Trichys_fasciculata Tupaia_sp. ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M987] TITLE IRBP_ADRA2B_vWF; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=3768; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1750 1760 1770 1780 1790 1800 1810 1820 1830 1840 1850 1860 1870 1880 1890 1900 1910 1920 1930 1940 1950 1960 1970 1980 1990 2000 2010 2020 2030 2040 2050 2060 2070 2080 2090 2100 2110 2120 2130 2140 2150 2160 2170 2180 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. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Agouti_paca 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Anomalurus_sp. GCCATTGCGGCGGTCACCACCTTCCTCATCCTCTTCACCATTTTCGGCAACGCGCTGGTCATTCTGGCTGTGTTGACCAGCCACTCGCTGCGCGCACCGCAAAACCTGTTCCTGGTGTCCCTGGCCGCCGCTGACATCCTGGTGGCCACGCTCATCATCCCTTTCTCGCTGGCCAACGAACTGCTGGGCTACTGGTACTTCTGGAGCACGTGGTGCGAGGTATACCTGGCGCTCGACGTGCTCTTCTGTACCTCGTCCATCGTGCACCTGTGCGCCATCAGTCTGGACCGATACTGGGCGGTGAGCCGCGCCCTGGAGTACAACTCCAAGCGCACCCCGCGCCGCATCAAACGCATCATCCTCATTGTGTGGCTCATCGCAGCCGTCATCTCGCTTCCTCCTCTCATCTACAAGGGCGACCAGGGCCCCCAGCCACGCGGGCGCCCCCAATGCAAGCTCAACCAAGAGGCGTGGTACATCTTGGCCTCCAGCATCGGATCTTTCTTTGCTCCCTGCCTCATCATGATCCTCGTCTACCTGCGCATCTACGTGATTGCCAAACGCAGC???AACCGCAGAGGTCCCAGAACCAACGGGCGCCCTGGGCAGGGTGAGTCCAAGCAGTTCCCTCCT???GTCCCTGGG???GGGGCTCCAGCTTCAGCCAAGGTGCCAACCCTATCCTCTCCTCTGTCTTCTGCCGGAGAGGCCAATGGACACCCCAAACCC???CCT????????????GGGGAGAAGGAGGACGGGGAGACCCCTGAAGACCCTGGGGCCAGGGCCTTGCCATCCAGCTGGGCTGCCCTTCCCAACTCAGGCCAGGGCCAGAAGAAG???GGTGCTTGTGGGGC?TCTGCAGAGGAGGAAGCTGAATGTGAACCTCAGGCAGTGCCAGTGTCTCCTGCCTCAGTTTGCAGCCAACCCTTGCAGCAGCCACAGGGGTCCCGGGTGCTGGCTACTCTCCGTGGCCAGGTGCTCCTGGGCAGGCATGTGGGTACTGCA??????GGTGGGCAGTGGTGGCGTCGGCGGGCACAGCTGAGCCGGGAGAAGCGGTTCACCTTTGTGCTGGCTGTGGTCATTGGCGTCTTTGTCCTTTGCTGGTTCCCCTTCTTCTTCAGCTACAGCCTGGGTGCCATCTGCCCACAGCACTGCAAGGTGCCTCATGGCCTCTTCCCAGAGAACCTGATGGGGATGCAGGAGGCCATCGAACAGGCCATGAAGAGCCAGGAGATTCTGGGCGTCTCAGACCCTCAGACGCTGGCCCACGTGCTGACCGTCGGGGTGCAGAGCTCCCTGAATGACCCGCGCCTGGTCATCTCCTATGAGCCCAGTGCCCTCGAG???GCTCCCCGGCAAGCCCTG???GCACTCACCAACCTCACCCAAGAGGAGCTGCTGGCCTGGCTACAGAAAAACATCCGCCATGAGGTCCTGGAGGGCAACGTGGGGTACCTGCGGGTGGATGACCTCCCCGGCCAGGAGGTGCTGAGCAAGCTGGGGGGGTTCCTGGTGGCCCACGTGTGGAGGCAGCTCATGGGCACCTCTGCCCTGGTGCTGGATCTCCGACACTGCACTGGGGGCCACGTCTCTGGTATCCCCTACGTCATCTCCTACCTGCACCCCGGGAACACGGTCCTGCATGTGGACACCATCTATGACCGCCCCTCCAATACCACCAAGGAGATCTGGACCTTGCCTAAGGTCCTGGGAGAGAGGTACAGTGCCGACAAGGATGTGGTGGTCCTCACCAGCAGCCACACCGGCGGGGTGGCCGAGGACATTGCGTACATCCTTAAGCAGATGCGCAGGGCCATTGTGGTGGGCGAGCGGACCGAGGGGGGTGCCCTGGACCTCCAGAAGCTGAGGATAGGCCAGTCTGACTTCTTCCTCACCGTGCCGGTATCCAGGTCCCTAGGGCCCCTGGGTGGGGGCAGCCAGACGTGGGAGGGCAGTGGAGTGCTGCCCTGCGTGGGGACACCAGCTGAGCAGGCCCTGGAGAAGGCGCTGGCCATCCTTACACTGCGCCGTGCCCTGCCAGGGGTTGTCCACCGCCTGCAGGA?GCCCTACAGGACTACTACACACTGGTGGACCGCGTGCCAGCCCTGCTGCACCACCTGGCCAGCATGGACTACTCCACGGTGGTCTCTGAGGAGGACCTGGTCACCAAGCTCAATGCTGGTCTGCAGGCTGTGTCCGAGGACCCCCGGCTCCTGGTGCGGGCTGTCGGGCCCACAGAAACCTCCTCT???GGACCTGAG???ATT???GGAGCTGAGGAACCCCCA???GAGGTTGCCCCT?????????GAGGTGCCCAAGGACGAGGCTGCCCGGAGGGCCCTGGTGGACTCTGTGTTTCAGGTGTCGGTGCTGCCGGGCAACGTGGGCTACCTGCGCTTCGACAGGTTTGCGGATGCCTCTGTGCTCGGGGCGCTGGGCCCTTACGTGCTACGCCAGGTGTGGGAGCCC??????????????????????????????ACAAATGCCCCAGTGAGCCCCACCACTCCGTATGTGGAAGACACCCCAGAGCCACCCCTGCATGATTTCTACTGCAGCAGGCTGCTCGATCTGGTCTTCCTGCTGGATGGCTCCTCCAGGCTGTCCGAGGCTGAGTTCGAGGTTCTCAAGGCTTTCGTGGTGGGCATGATGGAGCGCCTGCACATCTCCCAGAAGCGGATCCGTGTGGCTGTGGTGGAGTACCATGATGGCTCCCATGCGTACATTGAGCTCAAGGCCCGGAAGCGGCCCTCCGAGCTGCGGCGCATCGCCAGCCAGGTGAAGTATGCAGGTAGCCAGGTGGCCTCCACCAGCGAGGTCTTGAAGTACACGCTGTTCCAAATCTTTGGCAAAATCGACCGTCCTGAAGCTTCCCGTATCACGCTGCTCCTGACCGCCAGCCAGGAACCTCCACGGATGGCCCGGAACTTGGTCCGCTATGTCCAGGGCCTGAAGAAGAAGAAG???GTCACTGTGATCCCGGTGGGCATCGGGCCACATGCCAACCTCAAGCAGATCCGCCTCATTGAAAAGCAGGCCCCGGAAAACAAGGCCTTTGTGCTCAGTGGGGTGGACGAGCTAGAACAGCGAAGGGACGAGATCATCAGCTACCTCTGTGACCTGGCCCCTGAACCCCCCGTCCCCACA??????CAG???CGCCCCCATGTGGCACAAATCACT???GTGGGTCCAGGGCTCTTGGAGGTTTCATCCCTGGGT???CCCAGGAGGAGGTCCATGGTTCTGGATGTGGTGTTTGTCCTAGAGGGGTCAGACAAAGTTGGGGAGGCCAATTTCAACAGGAGCAAGGAGTTCATGGAACAGGTGATTCAGCGCATGGATGTGGGCCAAGACAGCATCCACGTCACAGTGCTGCAGTACTCATATATAGTGGCCGAGGAGTACCCCTTCACTAAGGCCCAGTCCAAGGGGGATGTGCTGCAGCAGGTGCGAGAGATCCGTTTCCGGGGCGGCAACAGGACCAACACCGGCCTGGCCCTGCAGTACCTCTCTGAGCACAGCTTCTCTGCCAGCCAGGGGGACCGGGAGCAGGCACCCAACCTGGTTTACATGGTCACGGGAAACCCTGCCTCTGATGAGATCAGGCGGCTGCCTGGAGACATCCAGGTGGTGCCCATTGGAGTGGGCCCTCATGCCAGTGTGCAGGAGCTGGAGAGGATCGGCTGGCCCAATGCCCCCATCATCATCCGGGACTTTGAGGCGCTGCCC Aplodontia_rufa 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Ateles_sp. 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Callithrix_jacchus 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Ceratomorpha 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Dipus_sagitta 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Macropus_sp. 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Massoutiera_mzabi 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Megaderma_lyra 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Microcebus_murinus 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Nycticebus_coucang 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Sus_scrofa GCCATCGCTGCGGTCATCACCTTCCTCATCCTGTTCACTATCTTCGGCAACTCCCTGGTCATCTTGGCTGTGCTGACAAGCCGCTCGCTGCGCGCGCCGCAAAACCTGTTCCTAGTGTCGCTGGCCGCAGCCGACATCCTGGTGGCCACACTCATCATCCCTTTTTCGCTGGCCAATGAGCTGCTGGGCTACTGGTACTTTCGACGCACCTGGTGTGAAGTGTATCTGGCGCTGGACGTGCTTTTCTGCACCTCCTCCATCGTGCACCTGTGTGCCATCAGCCTGGACCGCTACTGGGCAGTGAGCCGCGCGTTGGAGTACAACTCCAAGCGCACCCCGCGGCGCATCAAGTGCATCATCCTCACCGTGTGGCTCATCGCAGCTGTCATCTCGCTGCCGCCTCTTATCTACAAGGGCGACCCGGGTCCCCAGCCCCGGGGGCGCCCTCAATGCAAGCTCAATCAAGAGGCCTGGTACATCCTGGCCTCCAGCATTGGCTCTTTCTTTGCACCCTGCCTTATCATGATCCTTGTTTACCTGCGCATCTACTTGATCGCTAAGCGCAGC???CACCGCAGAGGCCCTAGGGCTAAGGGGGGCCCTGGGAAGGGGGAGTCTAAGCAGCCCCGCCCA???GTCCCTGGG???GAAGTTTCAGCCTCAGCCAAGTTGCCAACCTTGGTCTCTCAACTGGCCACTGCTGGAGAGACCAATGGGTGCTCTCAGCAC???ACT????????????GGGGAGAAGGATGAAGGGGAGACCTCTGAAGACACTGGGACCCCCGCTTTGCCACCCAGCTGGCCTGCCCTTCCCAGCTCGGGCCAGGGTCAGAAGGAA???GGTGTTTGTGGAACATCACCAGAGGAGGAGGCTGAATGTGAGCCTCAGACTTTGCCAGCCTCTCCTGCCTCGGCTTGCAGTCCACCCCTGCAGCAGCCACAGGGTTCCCGGGTGCTGGCAACCCTACGGGGCCAGGTGCTCCTGGGCAGGGGCATGGGCACTTCG??????AGTGGGCAGTGGTGGCGTCGGCGGGCGCAGCTGACCCGGGAGAAGCGGTTCACGTTCGTGCTGGCTGTGGTCATTGGCGTGTTTGTGCTCTGCTGGTTCCCCTTCTTCTTCAGCTATAGCCTGGGTGCCATCTGCCCTCAGCACTGCAAGGTGCCCCATGGCCTATTCCAGGAGGATCTGATGGGGATGCAGGAAGCCATCGAGCAGGCCACCAAGAGTCCTGAGATCTTAGCCATCACCGACCCTCAGACTCTGGCTCATGTGTTGACAGCTGGGGTGCAGAACTCCTTGAACGACCCTCGCCTGATCATCTCCTATGAGCCCAGCACCCTCGAG???GTTACCCCGAAAGCCCCG???GCACTCAGGAACCTCACACTAGAGGAACTCATTGAGGGGCTGCACAATAGTCTCCGCCATGAGGTTCTGGAAGGCAATGTGGGCTACCTGCGGGTGGACGACATCCCAGGCCAGGAGGTGATGAACAAGCTGGGGAGCTTCCTGGTAGTCAACGTCTGGGAAAAGCTAATGGGCACCTCTGCCTTGGTGCTAGACCTCCGGCACTGCACCAGGGGCCACGTTTCTGGCATCCCCTATGTCATCTCCTACCTGCACCCAGGGAACACGGTCCTGCACGTGGACACCATCTATGACCGTCCCTCCAATACGACCACTGAGATCTGGACCCTGCCCGAAGTCCTGGGAGACAGGTACAGTGCGGATAAGGACGTGGTGGTCCTCACCAGCAGCCACACAGGGGGCGTGGCTGAGGACATCGCCTACATCCTCAAACAGATGCGCAGGGCCATTGTGGTCGGCGAGCGAACTGTGGGGGGTGCCCTGGACCTCCAGAAGCTGAGGATAGGCCAGTCCGACTTCTTTCTCACCGTGCCTGTGTCCAGGTCCCTGGGGCCCCTGGGTGAGGGCAGCCAGACATGGGAGGGCAGCGGAGTGCTGCCTTGTGTAGGGACACCAACCGAGCAGGCCCTGGAGAAAGCCCTGGCCATCCTCAAGTTGCGTCGTGCCCTTCCAGGAGTGATCCAGCGCCTACAGGAGGTCCTGCAGGAATACTACACGCTGGTGGACCGTGTGCCAGCCCTTCTGCACCACCTGGCCAGTATGGACCTGTCCTCGGTGGTCTCCGAGGAGGATCTGGTCACTAAGCTCAACGCTGGCCTGCAGGCTGTGTCTGAGGACCCCAGGCTCCTGGTGCAGGTGGTCAAGTCCAAAGAACCCTCTTCT???GAGTCCAAG???GAT???GAAGCTGAGGAACCGCCA???GAGGTGATCCCA?????????GAAGTGCCCGAGGACGAGGCTGCCCGGCGGGCCCTGGTAGACGCTGTGTTCCAGGTGTCTGTGCTTCCAGGCAACGTGGGCTACCTGCGCTTTGACAGTTTTGCTGACCCCTCGGTGCTGGGGGTGCTG?????????????????????????????????GCGGAACCG????????????GTGCCCCCCACAGAAGGCCCGGTCAGCCCCACCACACCCTACGAGGAGGACACGCCAGAGCCGCCGCTGCACGACTTCTTCTGCAGCAAACTTCTGGACCTGGTCTTCCTGCTGGACGGCTCTGATAAGCTGTCCGAGGCCGACTTCGAGGCCCTGAAGGTCTTCGTGGTGGGCATGATGGAACACCTGCACATCTCCCAGAAGCACATCCGCGTGGCGGTGGTGGAGTACCACGACGGCTCCCACGCCTACATCTCGCTCCAGGACCGAAAGCGGCCCTCGGAGCTGCGGCGCATCGCCAGCCAGGTGAAGTACGCGGGCAGGCAGGTGGCTTCCATCAGCCAGGTTTTCAAGTACACGCTCTTCCAAATCTTTGGCAGGGTCGACCGGCCCGAAGCCTCCCGTATAGCCCTGCTGCTCATGGCCAGCCAGGAGCCACGCCGGCTGGCCCAGAACTTGGCCCGCTACCTCCAGGGCCTGAAGAAGAAGAAG???GTCACCGTGATTCCGGTGGGCATCGGACCCCACGTCAGCCTCAAGCAGATCCGCCTCATCGAGAAGCAGGCCCCGGAGAACAAAGCCTTTGTGGTCAGCGGTGTGGACGAGCTGGAGCAGCGCAAGAACGAGATCATCAGCTACCTCTGCGACCTCGCCCCGGAAGTGCCCGCCCCTACG??????CGG???CGCCCCCTAGTGGCCCAAGTCACT???GTGGCGCCTGAGCTCCCCGGGGTTTCAACGCTCGAA???CCCAAGAAGAGA???ATGGTCTTGGATGTGGTGTTTGTGCTGGAAGGGTCCGACAAGGTCGGCGAGGCCAACTTCAACAGGAGCACGGAGTTTGTGGAGGAAGTGATCCGGCGGATGGACGTGGGCCGGGACAGTGTCCACGTCACGGTGCTGCAGTACTCGTACGTGGTGGCCGTGGAGCACTCCTTCAGGGAGGCGCAGTCCAAGGGGGAAGTCCTACAGCGGGTGCGGGAGATCCGCTTCCAGGGTGGCAACAGGACCAACACTGGGCTGGCCCTGCAGTACCTCTCGGAGCACAGCTTCTCAGCCAGCCAGGGGGACCGGGAGGAGGCGCCCAACCTGGTCTACATGGTCACAGGAAACCCTGCCTCGGATGAGATCAAGCGGATGCCGGGAGACATCCAGGTGGTGCCCATCGGGGTGGGCCCCGACGTGGAGATGCAGGAGCTAGAGCGCCTCAGCTGGCCCAATGCCCCCATCTTCATCCAGGACTTT???????????? Tachyoryctes_sp. GCCATCGCAGCGGCCATCACCTTCCTCATCCTCTTCACCATTTTCGGCAACGTGCTGGTCATTCTGGCTGTGTTGACCAGCCGCTCTCTGCGCGCACCTCAAAACCTGTTCCTGGTGTCGCTGGCTGCCGCGGACATCCTAGTGGCCACGCTCATCATCCCTTTTTCTCTGGCCAACGAGCTGCTGGGTTACTGGTACTTCTGGCACACATGGTGCGAGGTCTACCTGGCACTGGACGTGCTCTTCTGTACCTCGTCCATCGTGCACCTGTGTGCCATCAGCCTGGACCGGTACTGGGCAGTGAGCCGGGCGCTAGAGTACAACTCCAAGCGCACCCCACGCCGCATCAAATGCATTATCCTTACCGTGTGGCTCATCTCAGCCATCATCTCTCTGCCACCCCTCATCTACAAGGGTGACCAGCACCCCAAGTCCCACGGGCTCCCCCAGTGCGAGCTCAACCAAGAGGCCTGGTACATCTTGGCTTCCAGCATCGGATCTTTCTTCGCTCCCTGTCTCATCATGATCCTGGTCTACCTGCGCATCTACCTGATCGCTAAACGCAGC???CACCGCAGAGGTCCCAGAGGCAAGCAGCACTCCGGGGAGGGTGAGTCCAAGCAGTCCCGACCA???GTCCCTGGA???GGGGCTCCAGCCTCAGCTAAGGTGCCAACCCTGGCCTCTCCTCTGTCTTCTGTGGGAGAGGCCAATGGCCATCCTAAGCCT???TCT????????????AGGGAGAAGGATGAGGAGGAGACCCCGGAAGAGGTTGGGTCCAAGGCTTTGCCACCTAGTTGGTCTGCCCTTCCCAGCTCAGGCCAGGGCCATAAGAAG???GACGCTGGGGGTGCAACTGAGGAGGGGGACGCTGAATGTGACCCTCAGGCACTGCCAGCATCTCTTGCTTCAGTGTGCAGCCCACCTTTGCAGCAGCCTCAGGGTTCCCGGGTGCTGGCTACCCTCCGGGGCCAGGTGCTCCTGGGCAGAACTGTGGGTGTTGTG??????AGTGGGCAATGGTGGCGCCGCCGGGCACAGCTGAGCAGGGAGAAGAGGTTCACCTTTGTGCTGGCTGTGGTCATCGGTGTCTTTGTACTCTGCTGGTTCCCGTTCTTCTTCAGCTACAGCCTGGGGGCCATCTGCCCACAGCACTGCAAGGTACCACATGGCCTCTTCCCTGAGAACCTGATGGGGATGCAGGCAGCCATCGAGCAGGCCATGAAGAGTCGTGAGATTCTGGGTATCTCAGACCCTCAGACACTGGCCCGTGTGCTGACGGCCGGGATGCAGAGTTCCCTCAATGATCCACGCCTGTTCATCTCCTACGAGCCCAGTACCCTTGAG???GCTCCTCAGCAAGCCCCA???ACGCTCACCAACCTCACTCAAGAAGAACTACTGGCCCAGCTACAGAGGAATATCCATCATGAGGTTCTGGAGGGCAATGTGGGTTACCTACGGGTGGACGACCTCCCGGGCCAGGAGGTGCTGAGTAAGCTGGGGGGGTTCCTGGTGGCCCACGTGTGGACCCAGCTCATGGGAACCTCTGCCTTGGTGCTAGATCTCCGGCACTGTATGGGGGGCCACGTCTCTGGCATCCCCTACGTCATCTCCTACTTGCACCCTGGGAACACCGTCATGCATGTGGATACCATCTACGACCGACCCTCCAATACCACCACGGAGATCTGGACTTTGCCCAAGGTCCTGGGGGAGAGGTACAGTGCTGACAAGGATGTGGTGGTCCTCACCAGTGGCCGCACTGGAGGCGTGGCCGAGGACATCGCCTATATCCTCAAGCAGATGCGCAGGGCCATCGTGGTGGGCGAGCGGACTGAGGGGGGTGCCCTGGATCTCCAGAAGCTGAGGATAGGCCAGTCCAACTTCTTCCTCACAGTGCCAGTCTCCAGGTCCCTGGGACCCCTGGGTGGAGGTGGCCAGACGTGGGAGGGCAGCGGAGTGCTGCCCTGTGTGGGGACACCGTCAGAACAGGCCCTGGAGAAGGCCTTGGCCATTCTCACCCTGCGTCGTGCCCTGCCGGGAGTTGTCCTCCGCCTTCGGGAAGCCCTGCAGGACCACTACACTCTCGTGGACCGTGTCCCCGGCCTTCTCCATCGCCTGGCTAGCATGGACTACTCAGCTGTCGTCTCTGAGGAGGACCTGGTGACAAAGCTCAATGCTGCCTTGCAGGCCGTGTCAGAGGATCCCAGGCTCCTGGTGCGTGCTGTTGAGCCCAGAGAAACCTCCTCT???GGGCCTGAG???ACG???GCACCTGATGACCCCCCA???GAAGCAGCCCCT?????????GAGGTGCCCAAAGATGAAGGTGCGGGAAGAGCCCTTGTGGACTCTGTATTCCAGGTATCGGTGCTGCCAGGCAATGTGGGCTACCTGCGCTTTGACAGGTTTGCTGATGCCTCCGTACTGAAGGCACTGGGCCCTTATGTGCTGCACCAAGTGTGGGACCCCCAAGAACCTAGAGGCCTGGAGGTACCTCCCACAGATGCCCCGGCCATCTCCACTACCCCGTATGTAGAGGACACACCCGAGCCACCACTGCATAGCTTCTATTGCAGTAAGCTGCTGGACCTGGTCTTCTTGCTGGATGGCTCCTCCAGACTGTCCGAGGCTGAGTTTGAAGTACTTAAGACCTTTGTGGTGGGCATGATGGAGAGGCTTCACATCTCTCAGAAGCGCATCCGCGTGGCAGTGGTGGAGTACCACGAAGGGTCGCATGCCTACATCGAGCTCAAGGACCGGAAACGGCCCTCAGAGCTGCGGCACATCACCAGTCGGGTGAAGTATCCCGGCAGCCAGGTGGCCGCTACCAGCCAGGTCTTGAAGTATGTGTTGTTCCAGATCTTTGGAAGAATTGACCGCCCGGAAGCCTCCCGCATCATGCTGCTCCTGACTGCTAGCCACGAGCCA???AAGACGTCCCGGAATTTCCTCCGCTATATCCAGGGCCTGAAGAAGAAGAAG???GTCATTCTGATCCCTGTGGGCATTGGACCGCATGCTGACCTCAAGCAGATCCACCTCATTGAAAAGCAGGCCCCTGAAAACAAGGCCTTTCTGCTCAGTGGGGTGGATGAGCTGGAGCAGCGAAGGGATGAGATAATCAATTACCTCTGTGATCTTGCTCCTGAGGCCCCGGCTCCCAAG??????CAG???CCGCCTCAGGTGGCCCAAGTCACC???ACAGGTCCAGGGCTCTTTGGGGTCTCATCCCCGGGA???CCCAAGAGGAAGTCCCTGGTTCTGGATGTGGTGTTTGTGTTGGAGGGGTCCGACAAGATTGGTGAAGCCAGCTTCAACAGGAGCAAGGAGTTCCTGGAGGAGGTGATCCAGCGCATGGACGTGGGCGGGGGCGGCATCCACATCGCGGTTCTGCAGTACTCGTACATGGTGACCGTGGAGTACACCTTCAACGATGCCCAGTCCAAAAGGGACGTGCTGCAGCAGGTGCGGGAGATGCGTTACCATGGTGGCAACCGGACCAACACGGGGCTGGCTCTTCAGTACCTCTCTGAGCACAGCTTCTCAGCCAGCCAGGGGGACCGGGAAGAGGCACCTAATCTGGTCTACATGGTCACAGGAAACCCTGCCTCTGACGAGATCAGGAGGTTGCCTGGAGACATCCAGGTGGTGCCCATTGGAGTGGGTCCCCATGCCAACATGCAAGAGCTGGAGAGGATCGGCTGGCCCAATGCTCCTATCTTCATCCAAGACTTCGAGATGCTCCCT Tarsius_bancanus 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Thomomys_talpoides 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CHARSET irbp1 (CHARACTERS = IRBP_ADRA2B_vWF) = 1204 1207 1210 1189 1192 1195 1198 1201 1666 1669 1672 1213 1216 1219 1222 1225 1228 1231 1234 1237 1240 1243 1246 1249 1252 1255 1258 1261 1264 1267 1270 1273 1276 1279 1282 1285 1288 1291 1294 1297 1300 1303 1306 1309 1312 1315 1318 1321 1324 1327 1330 1333 1336 1339 1342 1345 1348 1351 1354 1357 1360 1363 1366 1369 1372 1375 1378 1381 1384 1387 1390 1393 1396 1399 1402 1405 1408 1411 1414 1417 1420 1423 1426 1429 1432 1435 1438 1441 1444 1447 1450 1453 1456 1459 1462 1465 1468 1471 1474 1477 1480 1483 1486 1489 1492 1495 1498 1501 1504 1507 1510 1513 1516 1519 1522 1525 1528 1531 1534 1537 1540 1543 1546 1549 1552 1555 1558 1561 1564 1567 1570 1573 1576 1579 1582 1585 1588 1591 1594 1597 1600 1603 1606 1609 1612 1615 1618 1621 1624 1627 1630 1633 1636 1639 1642 1645 1648 1651 1654 1657 1660 1663 2128 2131 2134 1675 1678 1681 1684 1687 1690 1693 1696 1699 1702 1705 1708 1711 1714 1717 1720 1723 1726 1729 1732 1735 1738 1741 1744 1747 1750 1753 1756 1759 1762 1765 1768 1771 1774 1777 1780 1783 1786 1789 1792 1795 1798 1801 1804 1807 1810 1813 1816 1819 1822 1825 1828 1831 1834 1837 1840 1843 1846 1849 1852 1855 1858 1861 1864 1867 1870 1873 1876 1879 1882 1885 1888 1891 1894 1897 1900 1903 1906 1909 1912 1915 1918 1921 1924 1927 1930 1933 1936 1939 1942 1945 1948 1951 1954 1957 1960 1963 1966 1969 1972 1975 1978 1981 1984 1987 1990 1993 1996 1999 2002 2005 2008 2011 2014 2017 2020 2023 2026 2029 2032 2035 2038 2041 2044 2047 2050 2053 2056 2059 2062 2065 2068 2071 2074 2077 2080 2083 2086 2089 2092 2095 2098 2101 2104 2107 2110 2113 2116 2119 2122 2125 2137 2140 2143 2146 2149 2152 2155 2158 2161 2164 2167 2170 2173 2176 2179 2182 2185 2188 2191 2194 2197 2200 2203 2206 2209 2212 2215 2218 2221 2224 2227 2230 2233 2236 2239 2242 2245 2248 2251 2254 2257 2260 2263 2266 2269 2272 2275 2278 2281 2284 2287 2290 2293 2296 2299 2302 2305 2308 2311 2314 2317 2320 2323 2326 2329 2332 2335 2338 2341 2344 2347 2350 2353 2356 2359 2362 2365 2368 2371 2374 2377 2380 2383 2386 2389 2392 2395 2398 2401 2404 2407 2410 2413 2416 2419 2422 2425 2428 2431 2434 2437 2440 2443 2446 2449 2452 2455 2458 2461 2464 2467 2470 2473 2476 2479 2482 2485; CHARSET irbp3 (CHARACTERS = IRBP_ADRA2B_vWF) = 1410 1413 1416 1419 1422 1425 1428 1431 1434 1437 1440 1443 1446 1449 1452 1455 1458 1461 1464 1467 1470 1473 1476 1479 1482 1485 1488 1491 1494 1497 1500 1503 1506 1509 1512 1515 1518 1521 1524 1527 1530 1533 1536 1539 1542 1545 1548 1551 1554 1557 1560 1563 1566 1569 1572 1575 1578 1581 1584 1587 1590 1593 1596 1599 1602 1605 1608 1611 1614 1617 1620 1623 1626 1629 1632 1635 1638 1641 1644 1647 1650 1653 1656 1659 1662 1665 1668 1671 1674 1677 1680 1683 1686 1689 1692 1695 1698 1701 1704 1707 1710 1713 1716 1719 1722 1725 1728 1731 1734 1737 1740 1743 1746 1749 1752 1755 1758 1761 1764 1767 1770 1773 1776 1779 1782 1785 1788 1791 1794 1797 1800 1803 1806 1809 1812 1815 1818 1821 1824 1827 1830 1833 1836 1839 1842 1845 1848 1851 2307 2310 2313 1854 1857 1860 1863 1866 1869 1872 1875 1878 1881 1884 1887 1890 1893 1896 1899 1902 1905 1908 1911 1914 1917 1920 1923 1926 1929 1932 1935 1938 1941 1944 1947 1950 1953 1956 1959 1962 1965 1968 1971 1974 1977 1980 1983 1986 1989 1992 1995 1998 2001 2004 2007 2010 2013 2016 2019 2022 2025 2028 2031 2034 2037 2040 2043 2046 2049 2052 2055 2058 2061 2064 2067 2070 2073 2076 2079 2082 2085 2088 2091 2094 2097 2100 2103 2106 2109 2112 2115 2118 2121 2124 2127 2130 2133 2136 2139 2142 2145 2148 2151 2154 2157 2160 2163 2166 2169 2172 2175 2178 2181 2184 2187 2190 2193 2196 2199 2202 2205 2208 2211 2214 2217 2220 2223 2226 2229 2232 2235 2238 2241 2244 2247 2250 2253 2256 2259 2262 2265 2268 2271 2274 2277 2280 2283 2286 2289 2292 2295 2298 2301 2304 2316 2319 2322 2325 2328 2331 2334 2337 2340 2343 2346 2349 2352 2355 2358 2361 2364 2367 2370 2373 2376 2379 2382 2385 2388 2391 2394 2397 2400 2403 2406 2409 2412 2415 2418 2421 2424 2427 2430 2433 2436 2439 2442 2445 2448 2451 2454 2457 2460 2463 2466 2469 2472 2475 2478 2481 2484 2487 1191 1194 1197 1200 1203 1206 1209 1212 1215 1218 1221 1224 1227 1230 1233 1236 1239 1242 1245 1248 1251 1254 1257 1260 1263 1266 1269 1272 1275 1278 1281 1284 1287 1290 1293 1296 1299 1302 1305 1308 1311 1314 1317 1320 1323 1326 1329 1332 1335 1338 1341 1344 1347 1350 1353 1356 1359 1362 1365 1368 1371 1374 1377 1380 1383 1386 1389 1392 1395 1398 1401 1404 1407; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = IRBP_ADRA2B_vWF) = N: 1-3768; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = IRBP_ADRA2B_vWF) = N: 1-3768; END; BEGIN TREES; TITLE Tb7586; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Macropus_sp., 2 Manis_sp., 3 Elephantidae, 4 Ceratomorpha, 5 Orycteropus_afer, 6 Procavia_capensis, 7 Dugong_dugon, 8 Physeter_catodon, 9 Sus_scrofa, 10 Hippopotamus_amphibius, 11 Lama_sp., 12 Bos_taurus, 13 Equus_sp., 14 Felis_catus, 15 Tonatia_bidens, 16 Megaderma_lyra, 17 Cynopterus_sphinx, 18 Bradypus_tridactylus, 19 Octodon_lunatus, 20 Echimys_chrysurus, 21 Dinomys_branickii, 22 Chinchilla_lanigera, 23 Agouti_paca, 24 Cavia_porcellus, 25 Erethizon_dorsatum, 26 Petromus_typicus, 27 Thryonomys_swinderianus, 28 Bathyergus_suillus, 29 Trichys_fasciculata, 30 Massoutiera_mzabi, 31 Tachyoryctes_sp., 32 Rattus_norvegicus, 33 Mus_musculus, 34 Glis_glis, 35 Dryomys_nitedula, 36 Thomomys_talpoides, 37 Dipodomys_merriami, 38 Dipus_sagitta, 39 Anomalurus_sp., 40 Castor_canadensis, 41 Aplodontia_rufa, 42 Marmota_monax, 43 Oryctolagus_cuniculus, 44 Ochotona_princeps, 45 Lepus_crawshayi, 46 Cynocephalus_variegatus, 47 Tupaia_sp., 48 Homo_sapiens, 49 Hylobates_lar, 50 Macaca_mulatta, 51 Cercopithecus_solatus, 52 Pithecia_pithecia, 53 Cebus_apella, 54 Ateles_sp., 55 Callithrix_jacchus, 56 Tarsius_bancanus, 57 Propithecus_verreauxi, 58 Lemur_catta, 59 Microcebus_murinus, 60 Nycticebus_coucang, 61 Erinaceus_europaeus, 62 Didelphis_sp.; TREE Fig.1 = [&R] (62,((((((61,(((12,(10,8)),9),11)),((14,2),(13,4))),((17,16),15)),(((60,((59,57),58)),(56,((((55,53),52),54),((51,50),(49,48))))),((47,46),(((45,43),44),(((42,41),(35,34)),(((40,(37,36)),(39,(38,((33,32),31)))),(30,(29,((28,(27,26)),((25,(24,23)),((22,21),(20,19)))))))))))),18),(((7,6),3),5)),1); END;