#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on March 29, 2024; 13:34 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Willis S., Farias I., & Orti G. 2013. Multi-Locus Species Tree for the Amazonian Peacock Basses (Cichlidae: Cichla): Emergent phylogenetic signal despite limited nuclear variation. Molecular Phylogenetics and Evolution, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S14549] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=38; TAXLABELS Cichla_intermedia_255 Cichla_intermedia_579 Cichla_jariina_1975 Cichla_jariina_1999 Cichla_kelberi_2189 Cichla_kelberi_2290 Cichla_melaniae_B159 Cichla_melaniae_B160 Cichla_mirianae_1831 Cichla_mirianae_2355 Cichla_monoculus_1678 Cichla_monoculus_1886 Cichla_monoculus_334SI Cichla_monoculus_BM1 Cichla_monoculus_M11 Cichla_ocellaris_1670 Cichla_ocellaris_1672 Cichla_orinocensis_473 Cichla_orinocensis_957 Cichla_orinocensis_Ne145 Cichla_orinocensis_Ne93 Cichla_pinima_1866 Cichla_pinima_2433 Cichla_pinima_2546 Cichla_pinima_B009 Cichla_pinima_B017 Cichla_pinima_B549 Cichla_pinima_CEI3 Cichla_piquiti_2200 Cichla_piquiti_2223 Cichla_pleiozona_BM22 Cichla_pleiozona_BM23 Cichla_temensis_361 Cichla_temensis_474 Cichla_thyrorus_Trom1 Cichla_thyrorus_Trom2 Cichla_vazzoleri_B501 Cichla_vazzoleri_STOr11 ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M18118] TITLE 21_nuclear_genes; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=12469; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Cichla_jariina_1975 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Cichla_jariina_1999 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Cichla_orinocensis_957 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Cichla_orinocensis_Ne145 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Cichla_orinocensis_Ne93 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Cichla_pinima_B009 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Cichla_vazzoleri_STOr11 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