#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 19, 2024; 20:02 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Hambleton S., Nickerson N., & Seifert K. 2005. Leohumicola, a new genus of heat-resistant hyphomycetes. Studies in Mycology, 53: 27-50. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S1457] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=27; TAXLABELS Axenic_ectomycorrhizal_isolate_ARON3062.S_AJ430412 Bisporella_citrina_AF335454 Ectomycorrhizal_isolate_ARONR1158_AJ430414 Ectomycorrhizal_sp._K50B_AY046960 Epacrid_root_endophyte_AP.1_AF099089 Epacrid_root_endophyte_sp._LMK_3.31_AY279185 Epacrid_root_endophyte_sp._LMK_3.32_AY279184 Ericoid_mycorrhizal_sp._Sd1_AY046401 Ericoid_mycorrhizal_sp._Sd9_AF269067 Ericoid_mycorrhizal_sp._Sm5_AY046400 Ericoid_mycorrhizal_sp._Sm8_AY046399 Leohumicola_lenta_DAOM_231149 Leohumicola_minima_CBS_209.74 Leohumicola_sp._DAOM_230084 Leohumicola_sp._DAOM_231148 Leohumicola_terminalis_DAOM_231145 Leohumicola_verrucosa_DAOM_226889_2311143_230085 Leohumicola_verrucosa_DAOM_231141 Leohumicola_verrucosa_DAOM_231142 Leohumicola_verrucosa_DAOM_231144 Leohumicola_verrucosa_DAOM_231147 Mycorrhizal_fungal_sp._pkc07_AY394901_UAMH_10384 Mycorrhizal_sp._UBCS9_AF081442 Neofabraea_malicorticis_AF281386 Uncultured_fungus_isolate_RFLP100_AF461661 Uncultured_fungus_isolate_RFLP102_AF461663 Uncultured_fungus_isolate_RFLP98_AF461659 ; END; BEGIN TAXA; TITLE Taxa2; DIMENSIONS NTAX=84; TAXLABELS Amylocarpus_encephaloides Anguillospora_crassa Ascotricha_chartarum Ascozonus_woolhopensis Blumeria_graminis Botryosphaeria_ribis Bulgaria_inquinans Byssoascus_striatosporus Capronia_mansonii Ceratocystis_fimbriata Chaetomium_elatum Cladonia_sulphurina Coccodinium_bartschii Ctenomyces_serratus Cudonia_confusa Culcitalna_achraspora Cyttaria_darwinii Dothidea_insculpta Emericella_nidulans Erysiphe_orontii Eupenicillium_javanicum Gibberella_pulicaris Glomerella_cingulata Gyromitra_esculenta Halosarpheia_spartinae Holwaya_mucida_subsp_nipponica Humicola_fuscoatra_var_fuscoatra Hypocrea_lutea Hypomyces_chrysospermus Hypoxylon_fragiforme Lecanora_intumescens Leohumicola_minima_DAOM_232587 Leohumicola_sp._DAOM_230084 Leohumicola_verrucosa_DAOM_226889 Leotia_lubrica Leotia_viscosa Leptosphaeria_maculans Meliniomyces_variabilis Microascus_cirrosus Microglossum_viride Monascus_purpureus Monilinia_laxa Morchella_esculenta Muscodor_albus Mycocalicium_albonigrum Myxotrichum_deflexum Nais_inornata Neocudoniella_radicella Neurospora_crassa Onygena_equina Orbilia_auricolor Orbilia_fimicola Peltigera_neopolydactyla Phaeoannellomyces_elegans Phaeonectriella_lignicola Phaeosphaeria_nodorum Phoma_glomerata Plectania_nigrella Podospora_anserina Pseudallescheria_boydii Renispora_flavissima Rhizoscyphus_ericae_UAMH_6735 Rhizoscyphus_ericae_UAMH_8873 Rhytisma_salicinum Saccharomyces_cerevisiae Sarcinomyces_phaeomuriformis Schizosaccharomyces_pombe Sclerotinia_sclerotiorum Scutellinia_scutellata Scytalidium_lignicola Solorina_crocea Sordaria_fimicola Spathularia_flavida Sphinctrina_turbinata Talaromyces_emersonii Thelebolus_stercoreus Thermoascus_crustaceus Thermomyces_lanuginosus Trichocladium_asperum_and_Humicola_grisea_var_grisea Tricladium_splendens Urnula_hiemalis Verpa_bohemica Xylaria_carpophila Zygosaccharomyces_bailii ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M1005] TITLE SSU_rDNA; LINK TAXA = Taxa2; DIMENSIONS NCHAR=1793; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1750 1760 1770 1780 1790 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Amylocarpus_encephaloides ???????????????????AAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATCGTTTATTTGATGGTACC-TTA-CTACTTGG-ATAACC-GTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAG-CCTCGACTTC---GGGAGGGGTGTATTTATTAGATAAAAAACCAATGCCCTCCGGGG-CTCCT-TGGTGATTCATAATAACTTAACGAATCGCATGGCCTTGTGCCGGCGATGGTTCATTCAAAT-TTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGTGGCCTACCATGGTTTCAACGGGTAACGGGGAATTAGGGTTCTATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGATCCGGGGAGGTAGTGACAATAAAT-AC-TGATAC-AGGGCTCTTTTGGGTCTTGTAATTGGAATGAGTACAATTTAAATCTCTTAACGAGGAACAATT-GGAGGGCAAGTCTGGT-GCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAAACTTGGGCCTGGCTGGCCGGT-CCGCT-TCACC-GCGTGCATTGG------TCCGGCCGGGTCTTT--CCTTCTGGGGAGCC--GCATGCCCTTCACTGGGTGTGCT-GGGGAACCAGGACTTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCC--TA-TGCT-CGAATACATTAGCATGGAATAATAGAATAGGA-CGTGTGGTTCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCGCCGTAATGATTAATAGGGACAGTCGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATCTATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAGTGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATC-AGATACCGTCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGACTAGGGATCGGGCGATGTTA--TCTTTTTGACTCGCTCGGCACCTTACGAGAAA-TCAAAGTCTTTGGGTT-CTGGGGGGAGTA-TGG-TCGCAAGGCTGAAACTTAAAGAAATTGACGGAAGGGCACCACCA-GGAGT--GGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTCACCAGGTCCAGACACAATAAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTTTGTGGGTGGTGGTGCATGGCCG-TTCTTAG-TTGGTGGAGTGATTTGTC-TGCTTAATTGCGATAACGAACGAGACCTTAACCTGCTAAA-TAGCCA-GGCTAGCTTTG---GCT-GGTCGCC-GGCTT-CTTAGA-GGGACTATCGGC--TCAAGCCGATGGAAG-TTTGAGGCAATAACAGGTCTGTG-ATGCCC-TTAGA-TGTTCTGGGCCGCACGC-GCGCTACACTGACAGAGCCAACGAGTGT--------------------CCTCCTTGA-CCGAAAGGTCCGGGTAATCTTGTTAAACTCTGTCGTGCTGGGGATAGAGCATTGCAATTATTG???????????????????????????????????????????????-?????????????????????????????????????????????????????????????????????????-??????????????????????????-????????????????????????????????????????????????????????????? Anguillospora_crassa 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Ascotricha_chartarum 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Ascozonus_woolhopensis 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Bulgaria_inquinans 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Byssoascus_striatosporus ------------------GAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATCGTTTATTTGATAGTACC-TTA-CTACTTGG-ATAACC-GTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAA-CCTCGACTTC---GGAAGGGGTGTATTTATTAGATAAAAAACCAATGCCCTTCGGGG-CTCTC-TGGTGATTCATAATAACTTAACGAATCGCATGGCCTTGTGCCGGCGATGGTTCATTCAAAT-TTCTGCCCTATCAACTTTCGATTGTAAGGTCTTGGCTTACAATGGTTTCAACGGGTAACGGGGAATTAGGGTTCTATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACTCGGGGAGGTAGTGACAATAAAT-AC-TGATAC-AGGGCTCTTTTGGGTCTTGTAATTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAATT-GGAGGGCAAGTCTGGT-GCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGCCTGGCTGGCCGGT-CCGCC-TCACC-GCGTGCACTGG------TCCGGCCGGGCCTTT--CCTCCTGGGGAGCC--GCATGCCCTTCACTGGGTGTGTC-GGGGAACCAGGACTTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCC--TA-TGCT-CGAATACATTAGCATGGAATAATAGAATAGGA-CGTGTGGTTCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCGCCGTAATGATTAATAGGGATAGTCGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAGTGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATC-AGATACCGTCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGACTAGGGATCGGGCGATGTTA--TCTTTTTGACTCGCTCGGCACCTTACGAGAAA-TCAAAGTCTTTGGGTT-CTGGGGGGAGTA-TGG-TCGCAAGGCTGAAACTTAAAGAAATTGACGGAAGGGCACCACCA-GGAGT--GGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTCACCAGGTCCAGACACAATAAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTTTGTGGGTGGTGGTGCATGGCCG-TTCTTAG-TTGGTGGAGTGATTTGTC-TGCTTAATTGCGATAACGAACGAGACCTTAACCTGCTAAA-TAGCCA-GGCTAGCTTTG---GCT-GGTCGCC-GGCTT-CTTAGA-GGGACTATCGGC--TCAAGCCGATGGAAG-TTTGAGGCAATAACAGGTCTGTG-ATGCCC-TTAGA-TGTTCTGGGCCGCACGC-GCGCTACACTGACAGAGCCAACGAGTTCA-------------------TCACCTTGT-CCGAAAGGTCTGGGTAATCTTGTTAAACTCTGTCGTGCTGGGGATAGAGCATTGCAATTATTGCTCTTCAACGAGGAATTCCTAGTAAGCGCAAGTCATCAGCTTGCGCT-GATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGAATGGCTCAGTGAGGCTTTCGGAC-TGG-CCTAGGGAGAGTGGCAACACTC-ACCCAGGGCCGGAAAGTTGTCCAAACTTGGTCATTTAGAGGAAGTAAAAGTCGTAACAAGG Capronia_mansonii 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Ceratocystis_fimbriata TAAGCAA-T-TATACAGCGAAACTGCGAATGGCTCATTATATAAGTTATCGTTTATTTGATAGCACC-TTA-CTACTTGG-ATAACC-GTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAA-TCCCGACTTC---GGAAGGGATGTATTTATTAGATTAAAAACCAATG-CCTTCGGG--CTTTC-TGGTGATTCATGATAACTTCTCGAATCGCATGGCCTTGCGCCGGCGATGGTTCATTCAAAT-TTCTTCCCTATCAACTTTCGATGCGAAGGTCTTGTCTTCGCATGGTTACAACGGGTAACGGAGGGTTAGGGCTCGACCCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAATGGCTACCACTTTTAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAAT-AC-TGATAC-AGGGCTCTTATGGGTCTTGTAATCGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAATT-GGAGGGCAAGTCTGGT-GCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGTGGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGCCTGGCTGGCCGGT-CCCCC-TCACC-GGGTGCACTGGT-----TCCGGCCGGGTCTTT--CCCTCTGTGGAACC--GCATGCCCTTCACTGGGTGTGTC-GGGGAAACAGGACTTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGCTCCAGGCAGGCC--TA-TGCT-CGAATAGTACAGCATGGAATAATAGAATAGGA-CGTGTGGTTCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCGCCGTAATGATTAATAGGGACAGTCGGGGGCATCAGTATTCAGCTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATCTGCTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTGATAAG-GAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATC-AGATACCGTCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGACTAGGGATCGGACGATGTTA-TTTTTTTTGACTCGTTCGGCACCTTTCGAGAAA-TCAAAGTGCTTGGGCT-CCAGGGGGAGTA-TGG-TCGCAAGGCTGAAACTTAAAGAAATTGACGGAAGGGCACCACCA-GGGGT--GGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTCACCAGGTCCAGACACAGTGAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTCTGTGGGTGGTGGTGCATGGCCG-TTCTTAG-TTGGTGGAGTGATTTGTC-TGCTTAATTGCGATAACGAACGAGACCTTAACCTGCTAAA-TAGCCC-GTATTGCTTTG---GCA-GTACGCT-GGCTT-CTTAGA-GGGACTATCGGC--TCAAGCCGATGGAAG-TTTGAGGCAATAACAGGTCTGTG-ATGCCC-TTAGA-TGTTCTGGGCCGCACGC-GCGTTACACTGACACAGCCAGCGAGTTT--------------------CTTCCTTGA-CAGAGATGTCCGGGTAATCTTGTTAAACTGTGTCGTGCTGGGGATAGAGCATTGCAATTATTGCTCTTCAACGAGGAATCCCTAGTAAGCGCAAGTCATCAGCTTGCGTT-GATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGGATGGCTCAGTGAGACCTCCGGAC-TGG-CCGAGAGAGGTGGGAAACTACC-CCTCATGGCCGGAAAGCTGTTCAAACTCGGTCATCTAGAGGAAGTAAAA???????????? Chaetomium_elatum TAAGCAA-T-TATACCGCGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATCGTTTATTTGATAGTACC-TTA-CTACATGG-ATAACC-GTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAA-TCCCGACTTC---GGAAGGGATGTATTTATTAGATTAAAAACCAATGCCCTTCGGGG-CTCTC-TGGTGATTCATAATAACTTCTCGAATCGCACGGCCTTGCGCCGGCGATGGTTCATTCAAAT-TTCTGCCCTATCAACTTTCGACGGCTGGGTCTTGGCCAGCCGTGGTGACAACGGGTAACGGAGGGTTAGGGCTCGACCCCGGAGAAGGAGCCTGAGAAACGGCTACTACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAAT-AC-TGATAC-AGGGCTCTTTCGGGTCTTGTAATTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAATT-GGAGGGCAAGTCTGGT-GCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGAGGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGCCTAGCCGGCCGGT-CCGCC-TCACC-GCGTGCACTGG------CTCGGCTGGGTCTTT--CCTTCTGGAGAACC--TCATGCCCTTCACTGGGTGTGAC-GGGGAACCAGGACTTTTACTCTGAACAAATTAGATCGCTTAAAGAAGGCC--TA-TGCT-CGAATACATTAGCATGGAATAATAGAATAGGA-CGTGTGGTTCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCGCCGTAATGATTAATAGGGACAGTCGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAG-GAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATC-AGATACCGTCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGATTAGGGATCGGACGGCGTTA---TTTTTTGACCCGTTCGGCACCTTACGATAAA-TCAAAATGTTTGGGCT-CCTGGGGGAGTA-TGG-TCGCAAGGCTGAAACTTAAAGAAATTGACGGAAGGGCACCACCA-GGGGT--GGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTCACCAGGTCCAGACACGATGAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTTCGTGGGTGGTGGTGCATGGCCG-TTCTTAG-TTGGTGGAGTGATTTGTC-TGCTTAATTGCGATAACGAACGAGACCTTAACCTGCTAAA-TAGCCC-GTATTGCTTTG---GCA-GTACGCT-GGCTT-CTTAGA-GGGACTATCGGC--TCAAGCCGATGGAAG-TTTGAGGCAATAACAGGTCTGTG-ATGCCC-TTAGA-TGTTCTGGGCCGCACGC-GCGCTACACTGACAGAGCCAGCGAGTA---------------------CTCCCTTGG-CCGGAAGGCCCGGGTAATCTTGTTAAACTCTGTCGTGCTGGGGATAGAGCATTGCAATTATTGCTCTTCAACGAGGAATCCCTAGTAAGCGCAAGTCATCAGCTTGCGTT-GATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGAATGGCTCAGTGAGGCTTCCGGAC-TGG-CCCAGAGAGGTCGGCAACGACC-ACTCAGGGCCGGAAAGCTATCCAAACTCGGTCATTTAGAGGAAGTAAAAGTCGTAACAAGG Cladonia_sulphurina TAAGCAA-TCTATACGGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATCGTTTATTTGATAGTACC-TTA-CTACTTGG-ATA-CCTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTTAAAA-CCTCGACTTC---GGAAGGGGTGTATTTATTAGATAAAAAACCAATGCCCTTCGGGG-CTCCT-TGGTGATTCATAATAACTTAACGAATCGCATGGCCTTGAGCCGGCGATGGTTCATTCAAAT-TTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGTATAGAGGACTACCATGGTTTCTACGGGTAACGGGGAATTAGGGTTCTATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAAT-AC-TGATCC-AGGGCTCTTTTGGGTCTTGGAATTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAATT-GGAGGGCAAGTCTGGT-GCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAAACTTGGGCCTGGCTGACCGGT-CCGCC-TCACC-GCGTGCACTGG------CTCGGCCGGGCCTTT--CCTTCTGGGGAACC--GCATGGCCTTCATTGGTCGTGTT-GGGGATCCAGGACTTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCC--TA-TGCT-CGAATACATTAGCATGGAATAATAGAATAGGA-CGTGTGGTTCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCGCCGTAATGATTAATAGGGATAGTCGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAGTGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATC-AGATACCGTCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGACTGGGGATCGGACGGTGTTA--TTATTTTGACCCGTTCGGCACCCTACGAGAAA-TCAAAGTCTTTGGGTT-CTGGGGGGAGTA-TGG-TCGCAAGGCTGAAACTTAAAGATATTGACGGAAGGGCACCACCA-GGCGT--GGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTCACCAGGTCCAGACATAATAAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTTTATGGGTGGTGGTGCATGGCCG-TTCTTAG-TTGGTGGAGTGATTTGTC-TGCTTAATTGCGATAACGAACGAGACCTTAACCTGCTAAA-TAGCCA-GGTCAGCTTTG---GCT-GGCCGCC-GGCTT-CTTAGA-GGGACTATCGGC--TCAAGCCGATGGAAG-TTTGAGGCAATAACAGGTCTGTG-ATGCCC-TTAGA-TGCTCTGGGCCGCACGC-GCGCTACACTGACAGAGACAACGAGTTCA-------------------TCTCCTTGA-CCGGAAGGTTTGGGTAATCTTGTTAAACTCTGTCGTGCTGGGGATAGAGCATTGCAATTATTGCTCTTCAACGAGGAATGCCTAGTAAGCGCGAGTCATCAGCTCGCGTT-GATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGAATGGCTCAGTGAGGCCTTCGGAC-TGG-CCTAGAGAGGTCGGCAACGACC-ACTCCGGGCCGGAAAGTTGGTCAAACTTGGTCATTTAGAGGAAGTAAAAGTCGTAACAAGG Coccodinium_bartschii 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Ctenomyces_serratus 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Cudonia_confusa 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Cyttaria_darwinii 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Erysiphe_orontii 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Eupenicillium_javanicum 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Gibberella_pulicaris 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Halosarpheia_spartinae 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Holwaya_mucida_subsp_nipponica 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Leotia_lubrica 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Leotia_viscosa 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Leptosphaeria_maculans 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Meliniomyces_variabilis 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Microascus_cirrosus 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Microglossum_viride ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????--AATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAA-CCCCGACTTC---GGAAGGGGTGTATTTATTAGATAAAAAACCAGCGCCCTTTGGGG-CTTCT-TGGTGATTCATGATAACTTAACGAATCGCATGGCCTTGTGCCGGCGATGGTTCATTCAAAT-TTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGTGGCCTACCATGGTTTCAACGGGTAACGGGGAATTAGGGTTCGACACCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAAT-AC-TGATAT-TGGGGTCTTTAGGCTCTAATAATTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAATT-GGAGGGCAAGTCTGGT-GCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGCCTGGCTGGCCGGT-CCGCC-TCACC-GCGTGCACTGG------TCCGGCCGGGCCTTT--CCTCCTGGGGAGCC--GCTAGCCCTTCACTGGGTGTGTC-GGGGAGCCAGGACTTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCC--TA-TGCT-CGAATACATTAGCATGGAATAATAG-ATAGGA-CGTGTGGTTCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCGCCGTAATGATTAATAGGGATAGTCGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAGTGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATC-AGATACCGTCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGACTAGGGATCGGGCGATGTTC--TCTTTTTGACTCGCTCGGCACCTTACGAGAAA-TCAAAGTTTTTGGGTT-CTGGGGGGAGTA-TGG-TCGCAAGGCTGAAACTTAAAGAAATTGACGGAAGGGCACCACCA-GGAGT--GGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTCACCAGGTCCAGACACAAAAAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATCTTGTGGGTGGTGGTGCATGGCCG-TTCTTAG-TTGGTGGAGTGATTTGTC-TGCTTAATTGCGATAACGAACGAGACCTTAACCTGCTAAA-TAGCCA-GGCTAGCTTTG---GCT-GGTCGCCCGGCTT-CTTAGA-GGGACTATCGGC--TCAAGCCGATGGAAG-TTTGAGGCAATAACAGGTCTGTG-ATGCCC-TTAGA-TGTTCTGGGCCGCACGC-GCGCTACACTGACAGAGCCAACGAGTTCT-------------------TCACCTTGG-CCGAAAGGTCTGGGTAATCTTGTTAAACTCTGTCGTGCTGGGGATAGAGCATTGCAATTATTGCTCTTCAACGAGGAATTCCTAGTAGGCGCAAGTCATCAGCTTGTGCC-GACTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGAATGGCTCAGTGAGGCCTTCGGAC-TGG-CTCAGGGAGGTCGGCAACGAC--ACCCAGAGCCGGAAAGTTGTTCAA????????????????????????????????????? Monascus_purpureus 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Morchella_esculenta 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Muscodor_albus TAAGCAA-T-TATACAGCGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATCGTTTATTTGATAGTACC-TTA-CTACTTGG-ATAACC-GTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAA-TCCCGACTCA---CGGAGGGATGTATTTATTAGATTAAAAACCAATGCCCCTCGGGG-CTTTC-TGGTGATTCATAATAACTTCACGAATCGCATGGCCTTGCGCCGGCGATGGTTCATTCAAAT-TTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGCAGGGTCTTGGCCTGCCATGGTTACAACGGGTAACGGAGGGTTAGGGCTCGACCCCGGAGAAGGAGCCTGAGAAACGGCTACTACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAAT-AC-TGATAC-AGGGCTCTTTTGGGTCTTGTAATTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAATT-GGAGGGCAAGTCTGGT-GCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGCCTGGCTGGCCGGT-CCGCC-TCACC-GCGTGCACTGG------TTCGGCCGGGCCTTT--CCCTCTGGGGAGCC--CCATGCCTTTCATTAGGTGTGGT-GGGGAACCAGGACTTTTACTGTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCC--TA-TGCT-CGAATACATCAGCATGGAATAATAGAATAGGA-CGTGTGGTTCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCGCCGTAATGATTAATAGGGACAGTCGGGGGTGTCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTCACCAAGGATGTTTTCATTAATCAG-GAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATC-AGATACCGTCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGACTAGGGATCGGGCGGTGTTA--T-TTTTTGACCCGCTCGGCACCTTACGAGAAA-TCAAAGTCTTTGGGTT-CTGGGGGGAGTA-TGG-TCGCAAGGCTGAAACTTAAAGAAATTGACGGAAGGGCACCACCA-GGAGT--GGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTCACCAGGTCCAGACACAATGAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTTTGTGGGTGGTGGTGCATGGCCG-TTCTTAG-TTGGTGGAGTGATTTGTC-TGCTTAATTGCGATAACGAACGAGACCTTAACCTGCTAAA-TAGCCC-CTATTGCTTTG---GCA-GTAGGCT-GGCTT-CTTAGA-GGGACTATCCGC--TCAAGCGGATGGAAG-TTTGAGGCAATAACAGGTCTGTG-ATGCCC-TTAGA-TGTTCTGGGCCGCACGC-GCGTTACACTGACAGGGGCAGCGAGTACT---------------------TCCTTAG-CAGAGATGCTTGGGTAATCTTGTTAAACCCTGTCGTGCTGGGGATAGAGCATTGCAATTATTGCTCTTCAACGAGGAATTCCTAGTAAGCGTAAGTCATCAACTTGCGTT-GATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGAATGGCTCAGTGAGGCTTTCGGAC-TGG-CCCAGGGGAGTCGGCAACGACA-CCCCAGGGCCGGAAAGTTATCCAA------------------------------------- Mycocalicium_albonigrum ???????????????CGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATCGTTTATTTGATAGTACC-TTA-CTACTTGG-ATAACC-GTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAA-CCCCGACTTC---GG-AGGGGTGTATTTATTAGATAAAAAACCAATGCCCTTCGGGG-CTCCT-TGGTGAATCATGATAACTTCACGAATCGCATGGCCTTGCGCCGGCGATGGTTCATTCAAAT-TTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGTGGCCTACCATGGTTTCAACGGGTAACGGGGAATTAGGGTTCTATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCAACACGGGGAGGTAGTGACAATAAAT-AC-T-ATAC-AGGGCTCTTTTGGGTCTTGTAATTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAATT-GGAGGGCAAGTCTGTC-GCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTG-----GCCTGGCCGGT-CC-CC-TCACC-GCGTGCACTGG------TCCG-CCG---CTTT--CCTTCTGG---GCC--GCATGCCCTTCACTGGGTGT-CC-GGGGAACCAGGACTTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCC--TA-TGCT-CGAATACATTAGCATGGAATAATAGAATAGGA-CGTGCGGTTCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCGCCGTAATGATTAATAGGGATAGTCGGGGGCATCAGTATTTAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATTAAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAGTGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATC-AGATACCGTCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGACTAGGGATCGGACGGTGTTG--TTATTTTGACCCGTTCGGCACCTTACGAGAAA-TCAAAGTTTTTGGGTT-CTGGGGGGAGTA-TGG-TCGCAAGGCTGAAACTTAAAGAAATTGACGGAAGGGCACCACAA-GGGGT--GGAGCATGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTCACCGGGTCCGGACAAAATAAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTTTTTGGGTGGTGGTGCATGGCCG-TTCTTAG-TTGGTGGAGTGATTTGTC-TGCTTAATTGCGATAACGAACGAGACCTTAACCTGCTAAA-TAGCCA-GGCTCACTTTT---GTG-GGTCGTC-GGCTT-CTTAGA-GGGACTATCGGC--TCAAGCCGATGGAAG-TTTGAGGCAATAACAGGTCTGTG-ATGCCC-TTAGA-TGTTCCGGGCCGCACGC-GCGCTACACTGACAGAGCCAACGAGTACA-------------------TCACCTTGG-CCGAAAGGTCTGGGTAATCTTGTTAAACTCTGTCGTGCTGGGGATAGAGCATTGCAATTATTGCTCTTCAACGAGGAATGCCTAGTAAGCGCAAGTCATCAGCTTGCGTT-GACTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGAATGGCTAAGTGAGG-CTTCGGAC-TGG-CTCAGGGAGGTCGGCAACGACC-ACC?????????????????????????????????????????????????????????? Myxotrichum_deflexum 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Nais_inornata 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Neocudoniella_radicella 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Neurospora_crassa 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Peltigera_neopolydactyla 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Phaeonectriella_lignicola 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Phaeosphaeria_nodorum 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Phoma_glomerata 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Plectania_nigrella 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Podospora_anserina 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Rhytisma_salicinum 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Saccharomyces_cerevisiae 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Sarcinomyces_phaeomuriformis 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Schizosaccharomyces_pombe 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Spathularia_flavida 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Sphinctrina_turbinata 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Talaromyces_emersonii 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Thermomyces_lanuginosus 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Xylaria_carpophila 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CATTTACAACGCTTAT-GCCCTCATGGGTAAGATCTCCC-ACCCTTGAATACT--ATACCTTTGTTGCTTTGGCGGGCCGCTT--CGGCTACCGGCTCTGGCTGGTAAGTGCCCGCCAAAGGACCCCTAAA-CTC-TGA-ATATTAGTGTCGTCTGAGTACTATATAA-TAGTTAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCGAGGGGCATGCCCGTTCGAGCGTCATTATAACCCCTCAAGCCTAGCTTGGTGTTGGGGCCTGCTGTTACCGGCAGCCCTTAAAATCAGTGGCGGTGCCATCTGGCTCTAAGCGTAGTAATACTTCTCGCTACAGGGTCCCGGTGGATGCTTGCCATCAACCCCTAATTTTCTATGGTTGA Ericoid_mycorrhizal_sp._Sd1_AY046401 ------CAGAGTTCAT-GCCCTTACGGGTA-GATCTCCC-ACCCTTGAATACT--ATACCTTTGTTGCTTTGGCGGGCCGCTT--CGGCTACTGGCTCCGGCTGGTGAGTGCCCGTCAAAGGACTC-CAAAACTC-TGA-ATATTTGT---GTCTGAGTACTATGTAA-TAGTTAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCGAGGGGCATGCCCGTTCGAGCGTCATTATAACCCCTCAAGCCTAGCTTGGTGTTGGGGCCTGCTGTTGCCGGCAGCCCTTAAAATCAGTGGCGGCGCCATCTGGCTCTAAGCGTAGTAATACTTCTCGCTACAGGGTCCCGGTGGATGCCTGCCATCAACCCCTAAATTTCTATGGTTGA Ericoid_mycorrhizal_sp._Sd9_AF269067 CA-TTACAGAGTTCAT-GCCCTTACGGGTA-GATCTCCC-ACCCTTGAATACT--ATACCTTTGTTGCTTTGGCGGGCCGCTT--CGGCTACCGGCTTCGGCTGGTAAGTGCCCGCCAGAGGACCC-TAAA-CTC-TGA-ATGTTAATGTCGTCTGAGTACTATATAA-TAGTTAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCGAGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTATAACCC-TCAAGCCTAGCTTGGTGTTGGGGCCTGCTGTTACCGGCAGCCCTTAAAACTAGTGGCGGTGCCACCTGGCTCTAAGCGTAGTAATACTTCTCGCTATAGAGTCCCGGTGGATGCTTGCCATCAACCCCTAATTTTCTATGGTTGA Ericoid_mycorrhizal_sp._Sm5_AY046400 ------CAGAGTTCAT-GCCCTCACGGGTA-GATCTCCC-ACCCTTGAATATTTTATACCTTTGTTGCTTTGGCGGGCCGCTT--CGGCTACCGGCTTCGGCTGGTGAGTGCCCGCCAGAGGACCC-CAAA-CTC-TGA-ATTATAGTGTCGTCTGAGTACTATAAAA-TAGTTAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCGAGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTATAACCCCTCAAGCTCGGCTTGGTGTTGGGGCCTGCCGC-ACGGGCAGCCCTTAAAATCAGTGGCGGTGCCATCTGGCTCTAAGCGTAGTAATTCTTCTCGCTATAGAGTCCCGGTGGATGCTTGCCATTAACCCCCAATTT-CAATGGTTGA Ericoid_mycorrhizal_sp._Sm8_AY046399 ------CTGAGTTCAT-GCCCTTACAGGTA-GAATCTCC-ACCCTTGAATATTT-ATACCTTTGTTGCTTTGGCGGGCCGCTT--CGGCTGCTGGCTTCGGCTAGTGAGTGCCCGCCAGAGGACCC-CAAAACTCATGAATTTACAGTGTCGTCTGAGTACTATATAA-TAGTTAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCGAGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTATAACCCCTCAAGCTCAGCTTGGTATTGGGGCCTGCCGC-ACCGGCAGCCCTTAAAATCAGTGGCGGTGCCATCTGGCTCTAAGCGTAGTAATTCTTCTCGCTATGGAGTCCTGGTGGATGCTTGCCATCAACCCCTAATTTTCTATGGTTGA Leohumicola_lenta_DAOM_231149 CA-TTACAGAGTTCAT-GCCCTCGCGGGTA-GACCTCCC-ACCCTTGAGTACT--ATACCTTTGTTGCTTTGGCGGGCCGCTT--CGGCTACCGGCTCCTGCTGGTACGTGCCCGCCAGAGGACCC-CAAAGCTC-TTACGTATTAGTGTTGTCCGAGTACTAGATAAATAGTTAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGCATTCCGAGGGGCATGCCCGTTCGAGCGTCATTATAACCC-TCAAGCCTAGCTTGGTGTTGGGGCCTGCTGTGACCGGCAGCCCTGAAAATCAGTGGCGGTGCCCTCTGGCCCTGAGCGTAGTAATACTTCTCGCTACAGGGTCC-GGGAGGTGCCTGCCAGCAACCCCCAACCTTCTCTGGTTGA Leohumicola_minima_CBS_209.74 CA-TTACAGAGTTCAT-GCCCTCACGGGTA-GATCTCCC-ACCCTTGAATACT--ATACCTTTGTTGCTTTGGCGGGCCGCCT--CGGCTACCGGCTCCGGCTGGTAAGTGCCCGCCAAAGGACCC-CAAAACTC-TGA-ATATTAGTGTCGTCTGAGTACTATATAA-TAGTTAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCGAGGGGCATGCCCGTTCGAGCGTCATTATAACCCCTCAAGCCTAGCTTGGTGTTGGGGCCTGCTGTTACCGGCAGCCCTTAAAATCAGTGGCGGTGCCATCTGGCTCTAAGCGTAGTAATACTTCTCGCTACAGGGTCCCGGTGGATGCTTGCCATCAACCCCTAATTTTCTATGGTTGA Leohumicola_sp._DAOM_230084 CA-TTACAGAGTTCAT-ACCCTCACGGGTA-GATCTCCCCACCCTTGAATACT--ATACCATTGTTGCTTTGGCGGGCCGCTT--CGGCTACCGGCTCTAGCTGGTGAGTGCCCGCCAAAGGATCT-CAAAACTC-TGA-ATATTAGTGTCGTCTGAGTACTATATAA-TAGTTAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGCATTCCGAGGGGCATGCCCGTTCGAGCGTCATTATAACCCCTCAAGCCTAGCTTGGTGTTGGGGCCTGCTGTTCGCAGCAGCCCTTAAAACCAGTGGCGGTGCCATCTGGCTCTAAGCGTAGTAATACTTCTCGCTACAGGGTCCTGGTGGATGCTTGCCATCAACCCCTAAATTTCTATGGTTGA Leohumicola_sp._DAOM_231148 CA-TTACAGAGTTCAT-GCCCTCACGGGTA-GATCTCCC-ACCCTTGAATACT--ATACCTTTGTTGCTTTGGTGGGCCGCCT--TGGCTACTGGCTCCGGCTGGTAAGTGCCCGCCAAAGGACCC-CAAAACTC-TGA-ATATTAGTGTCGTCTGAGTACTATATAA-TAGTTAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCGAGGGGCATGCCCGTTCGAGCGTCATTATA-CCCCTCAAGCCTAGCTTGGTGTTGGGCCCTGCTGTTACCGGCAGCCCTTAAAATCAGTGGCGGTGCTATCTGGCTCTAAGCGTAGTAATACTTCTCGCTACAGGGTCCCGGTAGATGCTTGCCATCAACCCCTAATTTTCTATGGTTGA Leohumicola_terminalis_DAOM_231145 CA-TTACAGAGTTCAT-GCCCTCACGGGTA-GATCTCCC-ACCCTTGAATACTT-ATACCTTTGTTGCTTTGGCGGGCCGCTT--CGGCCACTGGCTCCGGCTGGTGAGTGCCCGCCAAAGGATCC-TAAA-CTC-TGA-ATATTAGTGTCGTCTGAGTACTATATAA-TAGTTAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCGAGGGGCATGCCCGTTCGAGCGTCATTATAACCCTTCAAGCTCAGCTTGGTGTTGGGGCCTGCTGTTACCGGCAGCTCTTAAAATCAGTGGCGGTGCCATCTGGCTCTAAGCGTAGTAACACTTCTCGCTACAGGGTCCCGGTGGATGCTTGCTATCAACCCCTTAACTTCTATGGTTGA Leohumicola_verrucosa_DAOM_226889_2311143_230085 CA-TTACAGAGTTCAT-GCCCTCACGGGTA-GATCTCCC-ACCCTTGAATACT--ATACCTTTGTTGCTTTGGTGGGCCGCTT--CGGCTACTGGCTCCGGCTGGTGAGTGCCCGCCAAAGGATCC-CAAAACTC-TGA-ATATTTGTATCGTCTGATTACTATATAA-TAGTTAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCGAGGGGCATGCCCGTTCGAGCGTCATTATAACCCCTCAAGCCCAGCTTGGTGTTGGGGCCTGCTGTTACCGGCAGCCCTTAAAATCAGTGGCGGTGCCATCTGGCTCTAAGCGTAGTAATACTTCTCGCTACAGGGTCCCGGTGGATGCTTGCCATCAACCCCTAAATTTCTATGGTTGA Leohumicola_verrucosa_DAOM_231141 CA-TTACAGAGTTCAT-GCCCTCACGGGTA-GATCTCCC-ACCCTTGAATACT--ATACCTTTGTTGCTTTGGCGGGCCGCTT--TGGCTACTGGCTCCGGCTGGTGAGTGCCCGCCAAAGAATCC-CAAAACTC-TGA-ATATTTGTGTCGTCTGAGTACTATATAA-TAGTTAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCGAGGGGCATGCCCGTTCGAGCGTCATTATAACCCCTCAAGCCCAGCTTGGTGTTGGGGCCTGCTGTTACCGGCAGCCCTTAAAATCAGTGGCGGTGCCATCTGGCTCTAAGCGTAGTAATACTTCTCGCTACAGGGTCCTGGTGGATGCTTGCCATCAACCCCTAAATTTCTATGGTTGA Leohumicola_verrucosa_DAOM_231142 CA-TTACAGAGTTCAT-GCCCTCACGGGTA-GATCTCCC-ACCCTTGAATACT--ATACCTTTGTTGCTTTGGCGGGCCGCTT--CGGCTACTGGCTCCGGCTGGTGAGTGCCCGCCAAAGGATCC-CAAAACTC-TGA-ATATTTGTGTCGTCTGAGTACTATGTAA-TAGTTAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCGAGGGGCATGCCCGTTCGAGCGTCATTATAACCCCTCAAGCCCAGCTTGGTGTTGGGGCCTGCTGTTACCGGCAGCCCTTAAAATCAGTGGCGGTGCCATCTGGCTCTAAGCGTAGTAATACTTCTCGCTACAGGGTCCTGGTGGATGCTTGCCATCAACCCCTAAATTTCTATGGTTGA Leohumicola_verrucosa_DAOM_231144 CA-TTACAGAGTTCAT-GCCCTCACGGGTA-GATCTCCC-ACCCTTGAATACT--ATACCTTTGTTGCTTTGGCGGGCCGCTT--CGGCTACTGGCTCCGGCTGGTGAGTGCCCGCCAAAGGATCC-CAAAACTC-TGA-ATATTTGTATCGTCTGAGTACTATATAA-TAGTTAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCGAGGGGCATGCCCGTTCGAGCGTCATTATAACCCCTCAAGCCCAGCTTGGTGTTGGGGCCTGCTGTTACCGGCAGCCCTTAAAATCAGTGGCGGTGCCATCTGGCTCTAAGCGTAGTAATACTTCTCGCTACAGGGTCCTGGTGGATGCTTGCCATCAACCCCTAAATTTCTATGGTTGA Leohumicola_verrucosa_DAOM_231147 CA-TTACAGAGTTCAT-GCCCTCACGGGTA-GATCTCCC-ACCCTTGAATACT--ATACCTTTGTTGCTTTGGCGGGCCGCTT--CGGCTACTGGCTCCGGCTGGTGAGTGCCCGCCAGAGGATCC-CAAAACTC-TGA-ATATTTGTGTCGTCTGAGTACTATATAA-TAGTTAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCGAGGGGCATGCCCGTTCGAGCGTCATTATAACCCCTCAAGCCCAGCTTGGTGTTGGGGCCTGCTGTTACCGGCAGCCCTTAAAATCAGTGGCGGTGCCATCTGGCTCTAAGCGTAGTAATACTTCTCGCTACAGGGTCCTGGTGGATGCTTGCCATCAACCCCTAAATTTCTATGGTTGA Mycorrhizal_fungal_sp._pkc07_AY394901_UAMH_10384 CA-TTACAGAGTTCAT-GCCCTCACGGGTA-GATCTCCC-ACCCTTGAATACT--ATACCTTTGTTACTTTGGCGGGCCGCTT--TGGCTACTGGCTCCGGCTGGTGAGTGCCCGCCAAAGAATCC-CAAAACTC-TGA-ATATTTGTGTCGTCTGAGTACTATATAA-TAGTTAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCGAGGGGCATGCCCGTTCGAGCGTCATTATAACCCCTCAAGCCTAGCTTGGTGTTGGGGCCTGCTGTTACCGGCAGCCCTTAAAATCAGTGGCGGTGCCATCTGGCTCTAAGCGTAGTAATACTTCTCGCTACAGGGTCCT---------------------------------------- Mycorrhizal_sp._UBCS9_AF081442 CA-TTACAGAGTTCAT-GCCCTCACGGGTA-GATCTCCC-ACCCTTGAATACT--ATACCTTTGTTGCTTTGGCGGGCCGCTT--TGGCTACTGGCTCCGGCTGGTGAGTGCCCGCCAAAGAATCC-CAAAACTC-TGA-ATATTTGTGTCGTCTGAGTACTATATAA-TAGTTAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCGAGGGGCATGCCCGTTCGAGCGTCATTATAACCCCTCAAGCCTAGCTTGGTGTTGGGGCCTGCTGTTACCGGCAGCCCTTAAAATCAGTGGCGGTGCCATCTGGCTCTAAGCGTAGTAATACTTCTCGCTACAGGGTCCTGGT------------------------------------- Neofabraea_malicorticis_AF281386 CA-TTACAGAGTTCAT-GCCCTTCGGGGTA-GATCTCCC-ACCCGTGTTATCAT---ACCATTGTTGCTTTGGCGGGCCCGCC-TCGGCCACCGGCTCCGGCTGGTGAGCGCCCGCCAGAGGACCC-CAAA-CTC-TGA-AATTTAGTGTCGTCTGAGTACTATATAA-TAGTTAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTACAACCC-TCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGCGTCCCCGGCAACGGGGTGCCCTAAAATCAGTGGCGGTGCCGTCTGGCTCTAAGCGTAGTAAATCT-CTCGCTCTGGATGCCCGGTGGAGACTTGCCAGTAACCCCCAATTTTTTAAGGTTGA Uncultured_fungus_isolate_RFLP100_AF461661 CA-TTACAGAGTTCAT-GCCCTTATGGGTA-GATCTCCC-ACCCTTGAGTATT--ATACCTTTGTTGCTTTGGCAGGCCGCTT--CGGCTACTGGCTTCGGCTAGTAAGTGCCTGCCAGAGGACCC-CAAA-CTC-TGA-ATGTTAGTGTCGTCTGAGTACTATATAA-TAGTTAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCAT-ATAAACCCTCAAGCTTAGCTTGGTGTTGGGGCCTGCTGTTAACAGCAGCCCTTAAAAGCAGTGGCGGTGCCGTCTGGCTCTAAGCGTAGTAATTCTTCTCGCTCCAGGGTCCTGGTGGATGCTTGCCAACAACCCCTAATTTTCTATGGTTGA Uncultured_fungus_isolate_RFLP102_AF461663 CA-TTACAGAGTTCAT-GCCCTTATGGGTA-GTTCTCCC-ACCCTTGAGTATT--ATACCTTTGTTGCTTTGGCAGGCCGCTT--CGGCTATTGGCTTCGGCTAGTAAGTGCCTGCCAGAGGACCC-CAAA-CTC-TGA-ATGTTAGTGTCGTCTGAGTACTATATAA-TAGTTAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCAT-ATAAACCCTCAAGCTTA?CTTGGTGTTGGGGCCTGCTGTTAACAGCAGCCCTTAAAAGCAGTGGCGGTGCCGTCTGGCTCTAAGCGTAGTAATTCTTCT??CTCCAGGGTCCTGGTGGATGCTTGCCAACAACCCCTAATTTTCTATGGTTGA Uncultured_fungus_isolate_RFLP98_AF461659 CA-TTACAGAGTTCAT-GCCCTTATGGGTA-GATCTCCC-ACCCTTGAGTATT--ATACCTTTGTTGCTTTGGCAGGCCGCTT--CGGCTACTGGCTTCGGCTAGTAGGTGCCTGCCAGAGGACCC-CAAA-CTC-TGA-ATGTTAGTGTCGTCTGAGTACTATATAA-TAGTTAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCAT-ATAAACCCTCAAGCTTAGCTTGGTGTTGGGACCTGCTGTTAACAGCAGCCCTTAAAAGCAGTGGCGGTGCCGTCTGGCTCTAAGCGTAGTAATTCTTCTCGCTCCAGGGTCCTGGTGGATGCTTGCCAACAACCCCTAATTTTCTATGGTTGA ; END; BEGIN TREES; TITLE Tb7596; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Ericoid_mycorrhizal_sp._Sd9_AF269067, 2 Ectomycorrhizal_sp._K50B_AY046960, 3 Uncultured_fungus_isolate_RFLP100_AF461661, 4 Uncultured_fungus_isolate_RFLP102_AF461663, 5 Uncultured_fungus_isolate_RFLP98_AF461659, 6 Ericoid_mycorrhizal_sp._Sm8_AY046399, 7 Ericoid_mycorrhizal_sp._Sm5_AY046400, 8 Leohumicola_verrucosa_DAOM_231141, 9 Leohumicola_verrucosa_DAOM_231142, 10 Leohumicola_verrucosa_DAOM_231147, 11 Leohumicola_verrucosa_DAOM_231144, 12 Leohumicola_verrucosa_DAOM_226889_2311143_230085, 13 Ericoid_mycorrhizal_sp._Sd1_AY046401, 14 Leohumicola_terminalis_DAOM_231145, 15 Leohumicola_sp._DAOM_230084, 16 Epacrid_root_endophyte_AP.1_AF099089, 17 Leohumicola_sp._DAOM_231148, 18 Epacrid_root_endophyte_sp._LMK_3.31_AY279185, 19 Epacrid_root_endophyte_sp._LMK_3.32_AY279184, 20 Leohumicola_minima_CBS_209.74, 21 Leohumicola_lenta_DAOM_231149, 22 Mycorrhizal_sp._UBCS9_AF081442, 23 Mycorrhizal_fungal_sp._pkc07_AY394901_UAMH_10384, 24 Axenic_ectomycorrhizal_isolate_ARON3062.S_AJ430412, 25 Ectomycorrhizal_isolate_ARONR1158_AJ430414, 26 Bisporella_citrina_AF335454, 27 Neofabraea_malicorticis_AF281386; TREE Fig._4 = [&R] (26,((((((1,2)Leohumicola_tree_Clade_A,(((((((8,(22,23)),9,10,(11,12))Leohumicola_verrucosa,14),13),(15,16)),(17,20),(18,19)),21)Leohumicola_clade),(3,4,5)Leohumicola_tree_Clade_B),(24,25)Leohumicola_tree_Clade_C),6),7),27); END; BEGIN TREES; TITLE Tb7595; LINK TAXA = Taxa2; TRANSLATE 1 Talaromyces_emersonii, 2 Monascus_purpureus, 3 Thermoascus_crustaceus, 4 Emericella_nidulans, 5 Thermomyces_lanuginosus, 6 Eupenicillium_javanicum, 7 Onygena_equina, 8 Renispora_flavissima, 9 Ctenomyces_serratus, 10 Phaeoannellomyces_elegans, 11 Capronia_mansonii, 12 Sarcinomyces_phaeomuriformis, 13 Mycocalicium_albonigrum, 14 Sphinctrina_turbinata, 15 Peltigera_neopolydactyla, 16 Solorina_crocea, 17 Lecanora_intumescens, 18 Cladonia_sulphurina, 19 Phaeosphaeria_nodorum, 20 Leptosphaeria_maculans, 21 Botryosphaeria_ribis, 22 Coccodinium_bartschii, 23 Dothidea_insculpta, 24 Xylaria_carpophila, 25 Ascotricha_chartarum, 26 Hypoxylon_fragiforme, 27 Microascus_cirrosus, 28 Pseudallescheria_boydii, 29 Phaeonectriella_lignicola, 30 Ceratocystis_fimbriata, 31 Hypocrea_lutea, 32 Hypomyces_chrysospermus, 33 Glomerella_cingulata, 34 Gibberella_pulicaris, 35 Chaetomium_elatum, 36 Sordaria_fimicola, 37 Humicola_fuscoatra_var_fuscoatra, 38 Trichocladium_asperum_and_Humicola_grisea_var_grisea, 39 Neurospora_crassa, 40 Podospora_anserina, 41 Phoma_glomerata, 42 Muscodor_albus, 43 Halosarpheia_spartinae, 44 Nais_inornata, 45 Culcitalna_achraspora, 46 Leohumicola_minima_DAOM_232587, 47 Leohumicola_verrucosa_DAOM_226889, 48 Leohumicola_sp._DAOM_230084, 49 Scytalidium_lignicola, 50 Rhizoscyphus_ericae_UAMH_8873, 51 Meliniomyces_variabilis, 52 Rhizoscyphus_ericae_UAMH_6735, 53 Anguillospora_crassa, 54 Tricladium_splendens, 55 Amylocarpus_encephaloides, 56 Blumeria_graminis, 57 Erysiphe_orontii, 58 Cyttaria_darwinii, 59 Sclerotinia_sclerotiorum, 60 Monilinia_laxa, 61 Byssoascus_striatosporus, 62 Myxotrichum_deflexum, 63 Ascozonus_woolhopensis, 64 Thelebolus_stercoreus, 65 Neocudoniella_radicella, 66 Holwaya_mucida_subsp_nipponica, 67 Bulgaria_inquinans, 68 Cudonia_confusa, 69 Spathularia_flavida, 70 Rhytisma_salicinum, 71 Leotia_viscosa, 72 Leotia_lubrica, 73 Microglossum_viride, 74 Morchella_esculenta, 75 Verpa_bohemica, 76 Gyromitra_esculenta, 77 Scutellinia_scutellata, 78 Urnula_hiemalis, 79 Plectania_nigrella, 80 Orbilia_fimicola, 81 Orbilia_auricolor, 82 Saccharomyces_cerevisiae, 83 Zygosaccharomyces_bailii, 84 Schizosaccharomyces_pombe; TREE Fig._3 = [&R] ((82,83),((((((((((1,((2,4),6)),5),3)Eurotiales,((7,8),9)Onygenales)Eurotiomycetes,(10,(11,12))Chaetothyriomycetes),(13,14)Mycocaliciales),((15,16),(17,18))Lecanoromycetes),(((19,41),20),(21,(22,23)))Dothideomycetes),(((((((24,42),25),26)Xylariales,(((((27,28)Microascales,((29,44),(43,45))Halosphaeriales),30),(((31,32),34)Hypocreales,33)),(((35,38),37),((36,39),40))Sordariales))Sordariomycetes,(((((((46,48),47)Leohumicola,(53,54)),((((49,58),((56,57)Erysiphales,(61,62)Myxotrichaceae)),50,52),51)),(55,65)),(59,60)Sclerotiniaceae),(((63,64)Thelebolales,66),67))),((68,69),70)Rhytismatales),((71,72),73)Leotiaceae_Geoglossaceae)Leotiomycetes),((((74,75),76),(77,(78,79))),(80,81))Pezizomycetes),84); END;